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Artículo de método

Avanzadas técnicas de Microscopía Confocal para estudiar las interacciones proteína-proteína y cinética en las lesiones del ADN

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DOI:

10.3791/55999

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12 de noviembre de 2017

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* These authors contributed equally

En este artículo

Resumen

Microirradiation láser es una herramienta útil para estudios de reparación del ADN en las células vivas. Se muestra un enfoque metodológico para el uso de láseres de rayos UVA para inducir varias lesiones del ADN. Hemos optimizado un método para microirradiation local que mantiene el ciclo normal de la célula; así, las células irradiadas proceden a través de mitosis.

Resumen

Microirradiation local con láser representa una herramienta útil para estudios de procesos relacionados con la reparación de DNA en células vivas. Aquí, describimos un enfoque metodológico para el análisis de la cinética de la proteína en las lesiones del ADN sobre interacciones proteína-proteína o tiempo en localmente microirradiated cromatina. También nos enseña a reconocer las fases individuales del ciclo celular utilizando el sistema celular Fucci para estudiar la cinética de la proteína dependiente de ciclo celular en las lesiones del ADN. Una descripción metodológica de la utilización de dos láseres UV (355 nanómetro y 405 nm) inducir diferentes tipos de daño de la DNA también se presenta. Sólo el microirradiated de las células por el láser de 405 nm diodo procedió normalmente a través de la mitosis y se desprovisto de dímeros de pirimidina ciclobutano (CPDs). También mostramos cómo las células de microirradiated pueden ser fijo en un momento dado para llevar a cabo la inmunodetección de proteínas endógenas de interés. Para los estudios de reparación de ADN, además se describe el uso de métodos biofísicos como FRAP (recuperación de fluorescencia Tras Fotoblanqueo) FLIM (vida proyección de imagen de microscopía de fluorescencia) en las células con que se producen espontáneamente focos de daño de ADN. También se muestra una aplicación de FLIM-FRET (energía de resonancia de la fluorescencia transferencia) en los estudios experimentales de las interacciones proteína-proteína.

Introducción

Daños en el ADN conduce a la aparición de las lesiones del ADN de dímeros de pirimidina ciclobutano (CPDs), 8-oxo-7,8-dihydro-2'-deoxyguanosine y sola o doble cadena rompe1,2. Los rayos γ son la forma de radiaciones ionizantes con la más alta energía y alta penetrancia, así esta fuente de radiación es ampliamente utilizada en radioterapia3. Por otro lado, experimentalmente inducida por daño en el ADN causada por lásers imitadores naturales la exposición Ultravioleta a los rayos UV. Microirradiation UVA, como un método microscópico, representa una herramienta experimental para el estudio....

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Protocolo

1. cultivo de líneas celulares

  1. líneas de células HeLa
    Nota: las células del carcinoma cervical HeLa uso: ya sea células HeLa expresando estable histona H2B etiquetadas con GFP o Fucci HeLa células expresando RFP Cdt1 en el G1 y fases iniciales de S y GFP-geminin en las fases S/G2-M ( figura 1).
    1. Para el cultivo de todas las líneas de células HeLa, utilizar Dulbecco ' s modificado Eagle ' medio de s (DMEM) suplementado con 10% suero fetal bovino y antibióticos apropiados a 37 ° C en una atmósfera humidificada con 5% CO 2. Reemplazar el medio 2 - 3 veces por semana.
    2. Qui....

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Resultados

Utilizando microscopía confocal avanzada, se observó una acumulación de proteínas 53BP1 y PCNA mCherry mCherry etiquetadas en las lesiones del ADN. Se realizaron análisis por microirradiation local de las células vivas. Para reconocer los patrones de distribución nuclear de proteínas relacionadas con la reparación de ADN en cada ciclo celular fases, hemos utilizado el sistema celular Fucci, por la que es posible determinar la G1, S temprano, y las fases G2 de la célula (

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Discusión

Técnicas de microscopía representan herramientas básicas en laboratorios de investigación. Aquí, una breve descripción de los métodos utilizados para el estudio de reclutamiento de la proteína y se presenta la cinética en las lesiones del ADN. Destaca especialmente la experiencia experimental en el campo de la microirradiation local de las células vivas, y discutimos el estudio de la cinética de la proteína por interacción proteína-proteína y FRAP en las lesiones del ADN por blanqueo de aceptador traste.......

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Divulgaciones

Los autores declaran que no hay ningún conflicto de intereses.

Agradecimientos

Este trabajo fue financiado por la Agencia de donación de la República Checa, proyecto P302-12-G157. Los experimentos también fueron apoyados por la CZ09 de programa de investigación Checa-Noruega, que es supervisado por los fondos noruegos y por el Ministerio de educación, juventud y deporte de la República Checa (número: 7F14369).

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
células fuertes
HeLaATCCCCL-2TM
ES-D3 [D3]ATCCCRL-11632TM
HeLa -Fucci célulashttp://ruo.mbl.co.jp/bio/e/product/flprotein/fucci.html
DMEMPAN-BiotechP03-0710
DMEM alta glucosaSigma-AldrichD6429-500ML
Suero fetal bovino (FBS)HyCloneSV30180.03
ES CellFBS Gibco16141-079
Aminoácidos no esenciales (NEAA)Gibco11140-035
mLIF (factor inhibidor de la leucemia en ratones)Merck MilliporeESG1107
MTG (1-tioglicerol)Sigma-AldrichM6145-25ML
Solución de Penicilina-EstreptomicinaBioseraXC-A4122/100
Tripsina - EDTABioseraXC-T1717/100diluido con 1 × PBS en proporción 1:6
Placas de cultivo celular NunclonSigma-AldrichP7866cultivo de mESCs células D3
µ-Plato 35m+A15:I35m Grid-500Ibidi GmbH81166placa microscópica
0,2% GelatinaSigma-AldrichG1890-100Gdiluida en agua destilada y autoclave
NombreEmpresaNúmero de catálogoComments
Cell transfection
GFP-p53 plásmidoAddgene12091
mCherry-PCNA plásmidogeneroso regalo de Cristina Cardoso, Technische Universitä t Darmstadt
mCherry-53BP1 plásmidoAddgene19835
MetafecetenoBiontex Laboratories GmbHT020– 2.0
10 y veces; PBSThermo Fisher ScientificAM9625para uso en transfección 1 y veces; PBS diluido en agua libre de nucleasas
5-bromo-2'-desoxi-uridinaSigma-Aldrich11296736001
NameCompanyNúmero de catálogoComments
>Confocal Microscopcopy
Leica TCS SP5Microscopio Leica Microsystems
Leica TCS SP8Leica Microsystems
Láser de luz blancaLeica Microsystems
Láser de 355 nmCoherent Inc.potencia del láser 80 mW
Láser de 405 nm PotenciaLeica Microsystems50 mW
NombreCompanyNúmero de catálogoComentarios
>Immunofluorescence staining
CoverslipVWR International Ltd631-1580
4% paraformaldehídoAffymetrix19943 1 LT
Triton X100MP Biomedicals2194854
Saponina de corteza de quillajaSigma-AldrichS4521
BSASigma-AldrichA2153
53BP1Abcamab21083anticuerpo
primarioAlexaFluore 647Thermo Fisher ScientificA27040anticuerpo secundario
VectashieldVector Laboratories LtdH-1000medio de montaje
Microscopio del láser de

Referencias

  1. Cadet, J., Mouret, S., Ravanat, J. L., Douki, T. Photoinduced damage to cellular DNA: direct and photosensitized reactions. Photochem Photobiol. 88 (5), 1048-1065 (2012).
  2. Cooke, M. S., et al. Immunochemical detection of UV-induced DNA damage and repair.

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