Applications pour les panneaux d'éclairage Microplate-Compatible open Source

Résumé

Microplate Assistive Pipetting Light Emitter (M.A.P.L.E.) est un dispositif piloté par ordinateur qui éclaire systématiquement les puits de microtiter pour fournir des conseils pour la préparation manuelle des microplaques.  M.A.P.L.E. améliore l'exactitude de la préparation des microplaques tout en automatisant la tenue des dossiers de données.  En outre, il peut aider à examiner la qualité des microplaques ou aider à la détection des erreurs.

Résumé

Les microplaques sont couramment utilisées dans l'environnement de laboratoire moderne pour une grande variété de tâches à la fois dans les opérations de laboratoire à petite échelle benchtop ainsi que à grande échelle à haut débit de dépistage (HTS) campagnes. Bien que l'automatisation en laboratoire ait considérablement accru l'utilité des microplaques, il reste des cas où l'instrumentation basée sur l'automatisation n'est pas faisable, rentable ou compatible avec les besoins de formatage des microplaques. Dans ces cas, les microplaques doivent être préparées manuellement. Les manipulations manuelles de microplaques sont problématiques, car un certain nombre de difficultés peuvent survenir en ce qui concerne le suivi précis des opérations d'échantillons, la tenue des données et l'inspection du contrôle de la qualité (QC) pour les artefacts de puits ou les erreurs de mise en forme. À mesure que les densités de puits microplaques augmentent (c.-à-d. 96 puits, 384 puits, 1536 puits), le risque d'introduire des erreurs augmente également considérablement.  De plus, pour les petites opérations de laboratoire sur le banc, il est nécessaire d'améliorer la facilité et l'exactitude de la manipulation des échantillons de façon rentable. Ici, nous décrivons un système qui agit comme un guide semi-automatisé de pipetting appelé microplate Assistive Pipetting Light Emitter (M.A.P.L.E.).  M.A.P.L.E. a de multiples utilisations pour soutenir la cueillette des composés et la préparation des microplaques pour le développement d'analyses dans le dépistage à haut débit ou les opérations de laboratoire benchtop, ainsi que QC / assurance de la qualité (QA) évaluation diagnostique de microplaque qualité ou la visualisation d'erreurs de formatage bien.

Introduction

Comme récemment publié¹, le laboratoire d'identification des plombs à Scripps Research² a développé et publié un panneau d'éclairage open-source pour la préparation de microplaques appelé microplate Assistive Pipetting Light Emitter (M.A. P.L.E.). La préparation manuelle des microplaques, qu'elles soient faites pour la gestion des composés ou les besoins de bio-analyse, peut être sujette à des erreurs humaines qui augmentent considérablement ainsi que la densité de la microplaque augmente. En outre, la tenue de dossiers et l'enregistrement des données du contenu/format des microplaques sont également sujets à des erreurs....

Protocole

1. Préparation semi-automatisée du transfert d'échantillon « plaque à plaque »

1. Générez un fichier CSV comme indiqué dans la figure 1 contenant des plaques de source et de destination à l'aide d'une application d'édition de feuilles de calcul. Le fichier CSV qui est généré doit avoir les colonnes d'en-tête suivantes dans l'ordre indiqué : Code-barres Source; Code-barres De destination; Source-bien; Dest-well; Transfert-volume.
2. Sous les colonnes d'en-tête, assurez-vous d'inclure une rangée dans le fichier CSV pour chaque opération de tuyauterie souhaitée (c.-à-d. transfert d'échantillons) avec les informations suivantes ....

Résultats

La plate-forme M.A.P.L.E. est capable d'éclairer les puits dans des microplates de 96 et 384 puits de diverses façons configurables par l'utilisateur, permettant un contrôle simple et indépendant de l'intensité des couleurs et de la lumière dans chaque puits. En aidant à réduire les possibilités d'erreur dans les opérations manuelles de tuyauterie, M.A.P.L.E. aide les utilisateurs à préparer des microplaques avec une confiance accrue que chaque puits contient le contenu désiré. Le transfert d'échantillons entre les plaqu.......

Discussion

En publiant M.A.P.L.E. comme une plate-forme open-source, nous avons introduit un outil de laboratoire qui fournit l'utilité, mais peut également être facilement étendu pour répondre aux besoins évolutifs de l'utilisateur final. La préparation d'échantillons de microplaques Benchtop est une tâche commune qui est effectuée dans une grande variété d'environnements de laboratoire et cette tâche peut être manifestement améliorée avec une technologie telle que M.A.P.L.E.

La plate-forme M.A.P.L.E. a.......

Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article

Nom	Entreprise	Numéro de catalogue	Commentaires
		de	96 ou 384 puits
Microplaque Pipette assistée Émetteur de lumière	Open source		https://github.com/pierrebaillargeon/Microplate-Assistive-Pipetting-Light-Emitter
Pipettor			https://www.jove.com/science-education/5033/an-introduction-to-the-micropipettor
Spectromètre	Ocean Optics	USB-650 Marée

Microplaque https://en.wikipedia.org/wiki/Microplate Rouge