Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.

Методическая статья

Непосредственное измерение сил в восстановленных активных пучках микротрубочек

1.6K просмотров

⸱

DOI:

10.3791/63819

⸱

10 мая 2022 г.

 ,  , 

* These authors contributed equally

В этой статье

Краткое содержание

Здесь мы представляем протокол восстановления пучков микротрубочек in vitro и непосредственной количественной оценки сил, оказываемых внутри них, с помощью одновременного оптического улавливания и флуоресцентной микроскопии полного внутреннего отражения. Этот анализ позволяет измерять на наноуровневом уровне силы и смещения, генерируемые белковыми ансамблями в активных сетях микротрубочек.

Аннотация

Сети микротрубочек используются в клетках для выполнения широкого круга задач, начиная от действия в качестве треков для переноса пузырьков до работы в качестве специализированных массивов во время митоза для регулирования сегрегации хромосом. Белки, которые взаимодействуют с микротрубочками, включают такие двигатели, как кинезины и динеин, которые могут генерировать активные силы и направленное движение, а также немоторные белки, которые сшивают нити в сети более высокого порядка или регулируют динамику нитей. На сегодняшний день биофизические исследования белков, связанных с микротрубочками, в подавляющем большинстве случаев сосредоточены на роли одиночных моторных белков, необходимых для переноса пузырьков, и был достигнут значительный прогресс в выяснении силообразующих свойств и механохимической регуляции кинезинов и динеинов. Однако для процессов, в которых микротрубочки действуют как груз, так и как путь, например, во время скольжения нити внутри митотического веретена, гораздо меньше понимается о биофизической регуляции ансамблей вовлеченных сшивающих белков. Здесь мы подробно описываем нашу методологию непосредственного зондирования генерации силы и реакции в сшитых минимальных сетях микротрубочек, восстановленных из очищенных микротрубочек и митотических белков. Пары микротрубочек сшиваются интересующими белками, одна микротрубочка иммобилизуется в крышку микроскопа, а вторая микротрубочка управляется оптической ловушкой. Одновременная флуоресцентная микроскопия полного внутреннего отражения позволяет осуществлять многоканальную визуализацию всех компонентов этой сети микротрубочек, поскольку нити раздвигаются для создания силы. Мы также демонстрируем, как эти методы могут быть использованы для зондирования толкающих сил, оказываемых ансамблями кинезин-5, и как вязкие тормозные силы возникают между скользящими парами микротрубочек, сшитыми митотическим MAP PRC1. Эти анализы дают представление о механизмах сборки и функционирования веретена и могут быть более широко адаптированы для изучения плотной сетевой механики микротрубочек в различных контекстах, таких как аксон и дендриты нейронов и полярных эпителиальных клеток.

Введение

Клетки используют сети микротрубочек для выполнения широкого спектра механических задач, начиная от переносапузырьков 1,2,3 до сегрегации хромосом во время митоза 4,5,6. Многие из белков, которые взаимодействуют с микротрубочками, такие как молекулярные моторные белки кинезин и динеин, генерируют силы и регулируются механическими нагрузками. Чтобы лучше понять, как функционируют эти критические молекулы, исследователи использовали одномолекулярные биофизические методы, такие как опти....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Протокол

1. Подготовка микротрубочек

ПРИМЕЧАНИЕ: При использовании меченых GFP сшивающих белков красный (например, родамин) и дальний красный (например, биотинилированный HiLyte647, называемый биотинилированным дальним красным цветом в остальной части текста) органическая флуорофорная маркировка микротрубочек работает хорошо. Минимальные перекрестные помехи между всеми тремя каналами могут быть достигнуты во время визуализации с помощью высококачественного четырехдиапазонного фильтра полной внутренней флуоресценции внутреннего отражения (TIRF).

  1. Подготовка семян микротрубочек GMPCPP
    1. Суспендировать 1 мг немаркированно....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Результаты

Подготовка пучков микротрубочек, пригодных для биофизического анализа, считается успешной при соблюдении нескольких ключевых критериев. Во-первых, визуализация в трех цветах должна выявить две выровненные микротрубочки с концентрацией сшивающего белка, предпочтительно украшающего область перекрытия (рисунок 5B, C и рисунок 6B). В идеале расстояние между перекрывающимся краем и свободным концом микротрубочки родамина должно соста.......

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Обсуждение

Сети микротрубочек используются множеством типов клеток для выполнения широкого круга задач, которые по своей природе являются механическими. Чтобы описать, как клетки функционируют как в здоровом, так и в болезненном состоянии, важно понять, как эти микронные сети организованы и регулируются белками нанометрового размера, которые в совокупности их строят. Биофизические инструменты, такие как оптический пинцет, хорошо подходят для исследования механохимии ключевых белков в этом масштабе. Отражая разнообразие функций сети.......

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Раскрытие информации

Авторам нечего раскрывать.

Благодарности

Авторы хотели бы отметить поддержку со стороны R21 AG067436 (JP и SF), T32 AG057464 (et) и Rensselaer Polytechnic Institute School of Science Startup Funds (sF).

....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
Иттербиевый волоконный лазер мощностью 10 Вт, 1064 нмIPG ФотоникаYLR-10-1064-LP
405/488/561/640 нм Набор четырехполосных лент для приложений TIRFChromaTRF89901v2
6x His Tag Антитело, биотин конъюгатInvitrogen#MA1-21315-BTIN
Ацетон, ВЭЖХ классаFisher Scientific18-608-395
Альфа-казеин из бычьего молокаSigma1002484390
ATPFisher ScientificBP413-25
БензоназаNovagen70746-3
Биотин-PEG-SVA-5000Laysan Bio, Inc.
BL21 (DE3) Rosetta CellsMillipore Sigma71-400-3
CatalaseMP Biomedicals LLC190311
CFI Apo 100X/1.49NA масляный иммерсионный объектив TIRFNikonN/A
ХлорамфениколACROS Organics227920250
Coverslip Mini-Rack, на 8 покровных стеколFisher ScientificC14784
Салфетки деликатныеKimberly-Clark34120
Декстроза безводнаяFisher ScientificBP3501
D-сахарозаFisher ScientificBP220-1
DTTFisher ScientificBP172-25
Погружной термостат Ecoline E100 с ванной 003LAUDA-Brinkmann27709
EDTAFisher ScientificBP118-500
EGTAMillipore Corporation32462-25GM
FIJI / Image Jhttps://fiji.sc/N/A
Матовый микроскоп СлайдыCorning12-553-1075ммx25мм, толщиной 0,9-1,1 мм
ГлюкозооксидазаMP Biomedicals LLC195196тип VII, без добавления кислорода
GMPCPPJena BiosciencesJBS-NU-405SМожет храниться в течение нескольких месяцев при температуре -20 градусов; С и до года при -80 ° C
Стекло с золотой крышкойThermo Scientific3405
HEPESFisher ScientificBP310-500
ИмидазолFisher Scientific03196-500
IPTGFisher ScientificBP1755-10
Лабораторный экскаваторBel-Art999320237190 мм размер пластины
Kanamycin SulfateFischer ScientificBP906-5
KIF5A K439 (aa:1-439)-6HisGilbert Lab, RPIN/Adoi.org/10.1074/jbc.RA118.002182
KimwipeKimberley ClarkZ188956безворсовое масло для тканевых тканей
, тип BCargille16484
Lens TissueThorLabsMC-5
LuNA Запуск лазера (4 канала: 405, 488, 561, 640 нм)NikonN/A
ЛизоцимMP Biomedicals LLC100834
Тетрагидрат ацетата магнияFisher ScientificBP215-500
Microfuge 18Beckman Coulter367160
MPEG-SVA MW-5000Laysan Bio, Inc.
НейтравадинИнвитрогенPI31000
Nikon Ti-E инвертированный микроскопNikonN/ANikon LuN4 Лазер
Ni-NTA СмолаThermo Scientific88221
Олигонуклеотид - CACCTATTCTGAGTTTGCGCGA
GAACTTTCAAAGGC
IDTN/A
Олигонуклеотид - GCCTTTGAAAGTTCTCGCGCAA
ACTCAGAATAGGTG
IDTN/A
Толстостенная поликарбонатная трубка с открытым верхом, 0,2 мл, 7 мм x 22 ммBeckman Coulter343755
ультрацентрифуга Optima-TLXBeckman Coulter361544
паклитакселом (эквивалент таксола)Thermo Fisher ScientificP3456
PIPESACROS Organics172615000
PMSFMillipore7110-5GM
Свиной тубулин, метка биотинаCytoskeleton, Inc.T333P
Свиной тубулин, HiLyte 647 FluorCytoskeleton, Inc.TL670Mс красной маркировкой
Свиной тубулин, RhodamineCytoskeleton, Inc.TL590M
Свиной тубулин, Цитоскелет белка тубулина, Inc.T240
Ацетат калияFisher ScientificBP364-500
Prime 95B sCMOS камерафотометрическийн/д
квадрантный детектор сенсорная головкаThorLabsPDQ80A
Quikchange LightningKit Agilent Technologies210518
бикарбонат натрияFisher ScientificS233-500
Фосфат натрия двухосновной безводныйFisher ScientificBP332-500
Квадратная крышка очковCorning12-553-45018 мм х 18 мм, толщиной 0,13-0,17 мм
Стрептавидин МикросферыPolysciences Inc.24162-1
Superose-6 КолонкаGE Healthcare29-0915--96
TCEPThermo Scientific77720
TLA-100 Ротор с фиксированным угломнаклона Beckman Coulter343840
Ультразвуковой очиститель (ультразвуковая диагност)VevorJPS-08A(DD)304 нержавеющая сталь, частота 40 кГц, мощность 60 Вт
Vectabond APTES растворVector LaboratoriesSP-1800-7
Windex Powerized Стеклоочиститель с аммиаком-DS.C. JohnsonSJN695237
NC0479433NC0107576

Ссылки

  1. Bentley, M., Banker, G. The cellular mechanisms that maintain neuronal polarity. Nature Reviews Neuroscience. 17 (10), 611-622 (2016).
  2. Yang, R., et al. A novel strategy to visualize vesicle-bound kinesins reveals the diversity of kinesin-m....

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Перепечатки и разрешения

Больше статей

Измерение силыоптическая ловушкаTIRF-микроскопиямоторы кинезина-5скольжение микротрубочексшивающие белкимеханика веретена делениясети цитоскелетабелок PRC1