Влияние кишечной микробиоты и их метаболитов на физиологию и поведение хозяина было широко исследовано в этом десятилетии. Многочисленные исследования показали, что метаболиты, полученные из кишечной микробиоты, модулируют физиологические функции, опосредованные мозгом, через сложные пути кишечник-мозг у хозяина. Короткоцепочечные жирные кислоты (SCFA) являются основными метаболитами бактерий, образующимися во время ферментации пищевых волокон микробиомом кишечника. Секретируемые SCFA из кишечника могут действовать в нескольких местах на периферии, влияя на иммунные, эндокринные и нейронные реакции из-за обширного распределения рецепторов SCFA. Поэтому трудно дифференцировать центральные и периферические эффекты SCFA посредством перорального и внутрибрюшинного введения SCFA. В этой статье представлен основанный на видео метод опроса функциональной роли SCFA в мозге с помощью направляющей канюли у свободно движущихся мышей. Количество и тип SCFA в мозге можно регулировать, контролируя объем и скорость инфузии. Этот метод может предоставить ученым способ оценить роль метаболитов, полученных из кишечника, в мозге.