Michaelis-Menten constante (Km) de CDNB com GST de fígado equino
A curcumina é um composto natural seguro mesmo após a ingestão em doses mais altas27 que apresentaram propriedades anticancerígenas16. A potência inibitória desta molécula foi demonstrada em GSTs recombinantes humanas19,20. Usando o protocolo descrito, avaliamos o efeito da curcumina na atividade GST usando um pool de isoformas GST do fígado equino. Segundo o fornecedor, a atividade específica desse mix de proteínas é de 25 U/mg. Uma solução de estoque de 0,1 U/mL foi preparada dissolvendo o pó liofilizado na quantidade adequada de água. O ácido ethacúnico foi usado em paralelo como um controle positivo, pois este composto é o inibidor GST mais utilizado em estudos. As etapas na configuração de um ensaio de atividade GST e testes de inibidores são descritas na Figura 1.
O Km deve ser definido para cada reação substrato enzimática, pois o uso da concentração de substrato equivalente a Km garantiria nenhum viés quanto à determinação do modo de inibição28. Seis concentrações diferentes de CDNB, variando de 0,5 mM a 5 mM, foram testadas para medir este parâmetro, utilizando uma concentração fixa de 2,5 mM GSH.
O volume final da reação foi de 200 μL, em uma placa de 96 poços. Um branco específico foi utilizado para cada experimento, utilizando a mesma concentração de CDNB que o teste bem porque a conjugação espontânea de CDNB e GSH poderia ocorrer e poderia aumentar a absorvância. Foi utilizada uma concentração enzimática final de 0,01 unidade/mL para todas as reações, adicionando 20 μL da solução de estoque ao mix de ensaios. A absorção a 340 nm foi registrada a cada minuto durante 10 minutos. A velocidade (em mM/min) da reação foi calculada utilizando-se a Equação 2. Um gráfico de Michaelis-Menten foi plotado da concentração do substrato (mM) contra a velocidade (μM/min)(Figura 2), e o Km da reação foi calculado. O experimento foi repetido até que pelo menos três conjuntos de dados mostraram resultados semelhantes. O Km de CDNB com GST de fígado equino foi medido como 0,26 ± 0,08 mM. Foi utilizada uma concentração de 0,2 mM de CDNB para cada ensaio inibitório utilizando este lote de GSTs.
Nenhuma formação espontânea de metabólito que absorvia a 340 nm foi medida durante experimentos usando curcumina incubada sozinha com GSH e CDNB. O mesmo espaço em branco foi usado para cada concentração inibidora em cada experimento.
Potência inibitória da curcumina em GSTs
A potência inibitória da curcumina foi prevista usando uma simulação de acoplamento em silico com software (por exemplo, AutoDock Vina versão 1.1.2). 29 A energia de ligação livre entre diferentes isoformas GST (ou seja, GSTA1, GSTM1 e GSTP1) e curcumina foi prevista (dados não mostrados). Em seguida, a constante de inibição Ki foi calculada usando a Equação 3.
Equação 3:

onde ∆G é a energia de ligação livre encontrada usando a análise em silico, R é a constante de gás de 1,987 cal*K-1*mol-1, e T é a temperatura durante o experimento, neste caso em Kelvin (298 K).
Com base nos resultados de energia de ligação livre retornados pelo AutoDock Vina, a curcumina é um potente inibidor GST do humano GSTA1, GSTM1 e GSTP1, com valores Ki de 78,1 μM, 78,1 μM e 27,4 μM, respectivamente. Os primeiros ensaios inibitórios foram realizados utilizando-se essas estimativas computacionais Ki, e as concentrações foram ajustadas de acordo com os resultados, se necessário.
Primeiro, o IC50 foi estimado. Essa característica é a concentração do inibidor que reduz a taxa de reação de uma enzima em 50%. Depende, portanto, da concentração enzimática30. Foram preparadas nove concentrações finais do inibidor, variando de 0,39 μM a 100 μM com cada concentração o dobro da anterior. A solução de ensaio foi composta por 20 μL de GSH 2,5 mM, 20 μL de GST de fígado equino em 0,01 U/mL final, 2 μL da solução de curcumina e 148 μL de PBS. O controle foi composto pela mesma solução com o diluente utilizado para curcumina. Esta mistura foi incubada por 15 minutos para iniciar o ensaio enzimático e evitar a degradação da curcumina na solução de ensaio, uma vez que este composto é instável em soluções tampão31. Em seguida, 10 μL de solução CDNB a 4 mM foi adicionado a cada poço, para uma concentração final de 0,2 mM CDNB. A absorvância a 340 nm foi registrada a cada minuto durante 10 minutos, para calcular mudanças na absorvância por minuto. Para calcular o IC50, cada amostra incubada com curcumina foi normalizada ao controle, para dar a porcentagem de atividade. Esses resultados foram analisados utilizando-se o software de plotagem através do cálculo da regressão não linear da concentração logarítmica do inibidor versus a inibição. O IC50 encontrado para curcumina em GST do fígado equino foi de 31,6 ± 3,6 μM(Figura 3A).
O mesmo experimento foi realizado em paralelo utilizando ácido ethacúnico como controle positivo, com concentrações variando de 0,39 a 100 μM, como com curcumina. O IC50 foi encontrado em 6,6 ± 1,1 μM(Figura 3B).
O passo seguinte foi avaliar o modo de inibição da curcumina nessas transferências. Foram testadas quatro concentrações diferentes de curcumina: 0, 7,5, 15 e 30 μM, além de quatro concentrações diferentes de CDNB: 0,2, 0,4, 1 e 1,5 mM. O protocolo era o mesmo do experimento anterior. A velocidade de cada condição foi calculada usando a Equação 2. Uma curva foi traçada para cada concentração inibidora, com a velocidade (em μM/min) contra a concentração de substrato (mM)(Figura 3C). Os Vmax e Km foram determinados com base em cada parcela com GraphPad Prism. O modo de inibição do potencial inibidor foi avaliado de acordo com as mudanças nesses dois parâmetros e a condição diferente dos ensaios. 24 Como Vmax não mudou significativamente entre as condições, mas Km aumentou com as diferentes concentrações inibidoras, a inibição da curcumina de GSTs é competitiva. Este padrão de inibição ocorre quando o inibidor compete com o substrato para o local ativo da enzima. Para medir o Ki de um inibidor competitivo, o GraphPad usa a Equação 4 e a Equação 5, conforme descrito por Copeland et al.32.
Equação 4:

Equação 5:

onde Km obs é a constante de Michaelis-Menten observada, Km é a constante Michaelis-Menten do controle, [I] é a concentração inibidora, Ki é a constante da inibição, Y é a velocidade, e X é a concentração de substrato.
Os cálculos baseiam-se nos mesmos experimentos que a avaliação do modo de inibição. O Ki estimado para a inibição de curcumina de GST do fígado equino foi de 23,2 ± 3,2 μM.

Figura 1: Fluxograma descrevendo os passos dos ensaios enzimáticos e inibidores do GST. Detalhes sobre o procedimento são apresentados na seção de protocolo. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: Enredo michaelis-menten da atividade enzimada GST. O aumento da concentração do substrato CDNB foi utilizado com uma concentração fixa de GSH (2,5 mM) para determinar a atividade GST a partir de uma piscina de GST do fígado equino. O valor de Km para CDNB foi determinado como 0,26 ± 0,08 mM de acordo com a curva do gráfico. Cada ponto de dados no plot representa a média de quatro corridas experimentais diferentes com OD. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: Efeito da curcumina e ácido ethacúnico na atividade enzimátil GST. (A-B) Além de concentrações crescentes de curcumina (A) ou do controle positivo ácido ethacúnico(B),mantendo as mesmas concentrações finais GST (0,01 U/mL), GSH (2,5 mM) e CDNB (0,2 mM) foram utilizadas para calcular o IC50 de ambos os compostos para GST do fígado equino com regressão não linear. IC50 foi determinado como 31,6 ± 3,6 μM para curcumina e 6,6 ± 1,1 μM para ácido ethacúnico. (C) Enredo michaelis-menten de diferentes concentrações de curcumina, testado contra concentrações variadas de substrato CDNB indicando um modo competitivo de inibição. Sem inibidor, Vmax e Km foram medidos como 132,7 ± 4,6 μM e 0,5 ± 0,08 μM, respectivamente. Com 30 μM de curcumina, Vmax e Km foram 130,4 ± 13,1 μM e 1,08 ± 0,39 μM. Os pontos de dados em todos os gráficos(A-C) representam os meios de três diferentes corridas experimentais com SD. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior deste número.