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Articles by Misha Pivovarov in JoVE
JoVE General
전체 심장 이미징에 대한 형광 광 프로젝션 Tomography에 대한 출생 정규화
1Center for Systems Biology, Harvard Medical School, 2Center for Systems Biology, MGH - Massachusetts General Hospital, 3Institute for Biological and Medical Imaging, Technical University of Munich and Helmholtz Center Munich
우리는 정확하고 양적 형광 단층 reconstructions를 얻기 위해 몇 군데 샘플의 흡수 특성에 대한 계정 광학 프로젝션 Tomography 위해 태어난 표준 접근 (BnOPT)를하는 것이 좋습니다. 우리는 작은 동물의 기관 내에있는 형광 분자 프로브 분포를 재구성하기 위해 제안된 알고리즘을 사용합니다.
Other articles by Misha Pivovarov on PubMed
MIPortal: 분자 이미징 연구를 위한 대용량 서버
연구 및 임상 의학 소설 분자 도구 도입 관리 시스템 보다 정제 된 정보를 위한 필요를 만들었습니다. 이 문서에서는 디자인과 같은 새로운 정보 플랫폼의 구현: 분자 이미징 포털 (MIPortal). 플랫폼 구성 하 고 보관 하 고, 신속 하 게 액세스 포인트 웹 기반 브라우저를 사용 하 여 대용량 데이터 집합을 검색 하기 위해 만들어졌습니다. Macintosh, Unix, 및 Microsoft Windows 고객 서비스 유형이 다른, 학술 연구 환경에서 구현 된 시스템과 매우 강력 하 고 다재 다능 한로 표시 되었습니다. 또한, 그것은 임상 실험 및 공동 multi-institutional 작은 동물 이미징 연구를 위한 유용한 도구를 역임 했다.
PepBank-펩 티 드의 데이터베이스 데이터 원본 시퀀스 텍스트 마이닝 및 공공 펩 티 드에 기반으로 합니다
펩 티 드는 다양 한 생물 학적 기능을 가진 중요 한 분자 및 생물 의학 사용. 날짜, 거기에 단 하나 존재 하지 않는, 펩 티 드에 대 한 검색 가능한 아카이브 시퀀스 또는 생물 학적 데이터를 관련 된. 오히려, 펩 티 드 시퀀스 여전히 초록 및 전체 길이 기사에서 채굴 또는 조각난된 공개 소스에서 얻을 수 있다.
커뮤니티 투표 및 데이터베이스 기반 텍스트 분류 하 여 생물 의학 데이터베이스에서 탐색을 향상
생물 학적 데이터베이스 및 정보 내용의 폭 기 하 급수적으로 증가 하 고 있습니다. 불행 하 게도, 이러한 소스를 쿼리 하는 능력은 여전히 자주 차선. 여기, 소개 하 고 지역 사회 투표, 데이터베이스 기반 텍스트 분류, 적용 고 시각 분산된 전문 지식을 통합 하는 수단으로 데이터베이스 항목을 자동으로 분류 하 고 효율적으로 검색 합니다.
높은 처리량 전송 광학 투영 단층 저가 그래픽 처리 장치를 사용 하 여
우리는 높은 처리량 전송 광학 투영 단층 촬영 영상에 대 한 실시간 데이터 처리를 위해 그래픽 처리 장치 (GPU)를 사용 하 여를 구현 합니다. GPU를 구현 하 여 우리가 CPU 워크스테이션 구현에 비해 300 배 성능 향상을 가져올 수 있습니다. 높은 처리량 이미징에 대 한 설정에 즉시 복원 얻을 수 있습니다.
하이브리드 애완 동물 광학 이미징 타겟된 프로브를 사용 하 여입니다
Radionuclide 기반 분자 (애완 동물)과 구조적 데이터 [계산 된 x-선 단층 촬영 (CT)] 퓨전 영상 확고 하 게 설립 되었습니다. 여기 우리는 광학 측정 [형광 중재 단층 (FMT)] radionuclide 측정 절묘 한 적합성을 표시 하 고 그 수 수 원활 하 게 통합 된 정보와 시각을 보여줍니다. 우리 프로브 농도 (r(2) > 0.99)에 FMT와 애완 동물 사이 좋은 상관 관계를 보여 생체 나노 입자를 사용 하 여 일반 플랫폼 ((18) F 동위 원소와 멀리 붉은 형광 색소를 포함 하는), 그리고 공간적 신호 분배 (r(2) > 0.85). 동시에 종양 프로 테아, macrophage 콘텐츠 및 integrin 식 측정 암과 다른 이미징 프로브 마우스 모델을 사용 하면 프로브 다채널 생체 조건에서 뚜렷한 종양 위치를 보여 줍니다. 결과 또한 FMT 심사 및 개발 radionuclide 기반 이미징 에이전트의 대리 양식 적임으로 사용할 수 있습니다 것이 좋습니다.
