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Identifying Targets of Human microRNAs with the LightSwitch Luciferase Assay System using 3'UTR-reporter Constructs and a microRNA Mimic in Adherent Cells

MicroRNAs (miRNAs) are important regulators of gene expression and play a role in many biological processes.  More than 700 human miRNAs have been ...

SwitchGear Genomics

&#x5BF9;&#x5DF2;&#x5B8C;&#x6210;&#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x5168;&#x957F; cDNA &#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x5BF9;&#x9F50;&#x65B9;&#x5F0F;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E86;&#x4E00;&#x4E2A;&#x72EC;&#x7279;&#x7684;&#x673A;&#x4F1A;&#xFF0C;&#x7814;&#x7A76;&#x6574;&#x4E2A;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x5206;&#x5E03;&#x3002;&#x901A;&#x8FC7;&#x5206;&#x6790; 23,752 &#x57FA;&#x56E0;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x8DDD;&#x79BB;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x627E;&#x51FA;&#x4E00;&#x7C7B;&#x7684; divergently &#x8F6C;&#x5F55;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x6210;&#x5BF9;&#xFF0C;&#x5360; 10%&#x4EE5;&#x4E0A;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x4E0D;&#x8D85;&#x8FC7; 1000&#x5E74;&#x4E2A;&#x78B1;&#x57FA;&#x5206;&#x9694;&#x5176;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8D77;&#x59CB;&#x4F4D;&#x70B9;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x8FD9;&#x9879;&#x53CC;&#x5411;&#x5B89;&#x6392;&#x5DF2;&#x5728;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x548C;&#x5176;&#x4ED6;&#x7269;&#x79CD;&#x4E2D;&#x524D;&#x9762;&#x6240;&#x8FF0;&#xFF0C;&#x53CC;&#x5411;&#x57FA;&#x56E0;&#x5BF9;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x4E2D;&#x7684;&#x53D1;&#x75C5;&#x7387;&#x663E;&#x8457;&#x7684;&#x548C;&#x6240;&#x6709;&#xFF0C;&#x4F46;&#x51E0;&#x4E2A;&#x53CC;&#x5411;&#x57FA;&#x56E0;&#x8C03;&#x63A7;&#x7684;&#x673A;&#x5236;&#x662F;&#x672A;&#x77E5;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x5DE5;&#x4F5C;&#x8868;&#x660E;&#x8BB8;&#x591A;&#x53CC;&#x5411;&#x6210;&#x5BF9;&#x7684;&#x6210;&#x7EE9;&#x5355; coexpressed&#xFF0C;&#x4F46;&#x6709;&#x4E9B;&#x662F; antiregulated&#x3002;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x8868;&#x660E;&#x8BB8;&#x591A;&#x4E4B;&#x95F4;&#x4E24;&#x4E2A;&#x53CC;&#x5411;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x6BB5;&#x542F;&#x52A8;&#x8F6C;&#x5F55;&#x5728;&#x4E24;&#x4E2A;&#x65B9;&#x5411;&#xFF0C;&#x5305;&#x542B;&#x5171;&#x4EAB;&#x7684;&#x5143;&#x7D20;&#x6765;&#x89C4;&#x7BA1;&#x8FD9;&#x4E24;&#x4E2A;&#x57FA;&#x56E0;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8FD8;&#x663E;&#x793A;&#x53CC;&#x5411;&#x5B89;&#x6392;&#x5E38;&#x5E38;&#x5B88;&#x6052;&#x9F20;&#x6807; orthologs &#x4E4B;&#x95F4;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E;&#x4E00;&#x9879;&#x53CC;&#x5411;&#x7684;&#x5B89;&#x6392;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E86;&#x5927;&#x91CF;&#x7684;&#x54FA;&#x4E73;&#x52A8;&#x7269;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8C03;&#x63A7;&#x7684;&#x72EC;&#x7279;&#x673A;&#x5236;&#x3002;

&#x4E30;&#x5BCC;&#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x4E2D;&#x7684;&#x53CC;&#x5411;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x5242;&#x3002;

The alignment of full-length human cDNA sequences to the finished sequence of the human genome provides a unique opportunity to study the distribution of genes throughout the genome. By analyzing the distances between 23,752 genes, we identified a class of divergently transcribed gene pairs, representing more than 10% of the genes in the genome, whose transcription start sites are separated by less than 1000 base pairs. Although this bidirectional arrangement has been previously described in humans and other species, the prevalence of bidirectional gene pairs in the human genome is striking, and the mechanisms of regulation of all but a few bidirectional genes are unknown. Our work shows that the transcripts of many bidirectional pairs are coexpressed, but some are antiregulated. Further, we show that many of the promoter segments between two bidirectional genes initiate transcription in both directions and contain shared elements that regulate both genes. We also show that the bidirectional arrangement is often conserved among mouse orthologs. These findings demonstrate that a bidirectional arrangement provides a unique mechanism of regulation for a significant number of mammalian genes.

An abundance of bidirectional promoters in the human genome.

L&#x26;#39;alignement de la pleine longueur de l&#x26;#39;homme des s&#xE9;quences d&#x26;#39;ADNc &#xE0; la s&#xE9;quence finie du g&#xE9;nome humain offre une occasion unique d&#x26;#39;&#xE9;tudier la distribution des g&#xE8;nes dans le g&#xE9;nome. En analysant les distances entre 23,752 g&#xE8;nes, nous avons identifi&#xE9; une classe de paires de g&#xE8;nes transcrits de mani&#xE8;re divergente, ce qui repr&#xE9;sente plus de 10% des g&#xE8;nes dans le g&#xE9;nome, dont la transcription des sites de d&#xE9;but sont s&#xE9;par&#xE9;s par moins de 1000 paires de bases. Bien que cet arrangement bidirectionnel a d&#xE9;j&#xE0; &#xE9;t&#xE9; d&#xE9;crit chez l&#x26;#39;homme et d&#x26;#39;autres esp&#xE8;ces, la pr&#xE9;valence de paires de g&#xE8;nes bidirectionnels dans le g&#xE9;nome humain est frappante, et les m&#xE9;canismes de r&#xE9;gulation de tous, mais quelques g&#xE8;nes bidirectionnels sont inconnus. Notre travail montre que les transcriptions de nombreuses paires bidirectionnelles sont co-exprim&#xE9;es, mais certains sont antiregulated. En outre, nous montrons que la plupart des segments du promoteur entre deux g&#xE8;nes bidirectionnels initier la transcription dans les deux sens et contenir des &#xE9;l&#xE9;ments communs qui r&#xE9;gissent les deux g&#xE8;nes. Nous montrons aussi que l&#x26;#39;arrangement est souvent bidirectionnelle conserv&#xE9;e parmi les souris orthologues. Ces r&#xE9;sultats d&#xE9;montrent qu&#x26;#39;un arrangement bidirectionnel fournit un m&#xE9;canisme unique de r&#xE9;gulation pour un nombre important de g&#xE8;nes de mammif&#xE8;res.

Une abondance de promoteurs bidirectionnels dans le g&#xE9;nome humain

Eine F&#xFC;lle von bidirektionalen Promotoren im menschlichen Genom.

L&#39;allineamento delle sequenze del cDNA umano full-length per la sequenza del genoma umano finita fornisce un&#39;opportunit&agrave; unica per studiare la distribuzione dei geni in tutto il genoma. Analizzando le distanze tra 23.752 geni, abbiamo identificato una classe di coppie divergently trascritto del gene, che rappresentano oltre il 10% dei geni nel genoma, cui siti di inizio trascrizione sono separati da meno di 1000 paia di basi. Anche se questa disposizione bidirezionale &egrave; stata descritta in precedenza in esseri umani e altre specie, la prevalenza di coppie gene bidirezionale nel genoma umano &egrave; sorprendente, e i meccanismi di regolazione dei geni bidirezionale tutti ma alcuni sono sconosciuti. Il nostro lavoro dimostra che le trascrizioni di molte coppie bidirezionali sono coespressi, ma alcuni sono antiregulated. Ulteriormente, ci mostrano che molti dei segmenti tra due geni bidirezionale promotore di avviare la trascrizione in entrambe le direzioni e contengono elementi condivisi che regolano entrambi i geni. Ci mostra anche che la disposizione bidirezionale &egrave; spesso conservata tra i orthologs del mouse. Queste scoperte dimostrano che una disposizione bidirezionale fornisce un unico meccanismo di regolazione per un numero significativo di geni dei mammiferi.

Un&#39;abbondanza dei promotori bidirezionale nel genoma umano.

&#x30D2;&#x30C8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x5B8C;&#x6210;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3078;&#x306E;&#x5B8C;&#x5168;&#x9577;&#x30D2;&#x30C8;cDNA&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x30A2;&#x30E9;&#x30A4;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306F;&#x3001;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5168;&#x4F53;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x5206;&#x5E03;&#x3092;&#x7814;&#x7A76;&#x3059;&#x308B;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x6A5F;&#x4F1A;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002; 23752&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x9593;&#x306E;&#x8DDD;&#x96E2;&#x3092;&#x5206;&#x6790;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x8EE2;&#x5199;&#x958B;&#x59CB;&#x90E8;&#x4F4D;1000&#x672A;&#x6E80;&#x306E;&#x5869;&#x57FA;&#x5BFE;&#x3067;&#x533A;&#x5207;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;10&#xFF05;&#x4EE5;&#x4E0A;&#x3092;&#x8868;&#x3059;divergently&#x8EE2;&#x5199;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30DA;&#x30A2;&#x306E;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x3092;&#x540C;&#x5B9A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x53CC;&#x65B9;&#x5411;&#x306E;&#x914D;&#x7F6E;&#x306F;&#x4EE5;&#x524D;&#x306B;&#x3001;&#x4EBA;&#x9593;&#x3068;&#x4ED6;&#x306E;&#x7A2E;&#x306B;&#x8A18;&#x8F09;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304C;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x53CC;&#x65B9;&#x5411;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30DA;&#x30A2;&#x306E;&#x6709;&#x75C5;&#x7387;&#x306F;&#x9855;&#x8457;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x3001;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x898F;&#x5236;&#x304C;&#x3001;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x53CC;&#x65B9;&#x5411;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x306F;&#x4E0D;&#x660E;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306E;&#x4ED5;&#x4E8B;&#x306F;&#x3001;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x53CC;&#x65B9;&#x5411;&#x30DA;&#x30A2;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x7269;&#x306F;&#x5171;&#x767A;&#x73FE;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x4E00;&#x90E8;&#x306F;antiregulated&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;2&#x3064;&#x200B;&#x200B;&#x306E;&#x53CC;&#x65B9;&#x5411;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x9593;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x30BB;&#x30B0;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x591A;&#x304F;&#x306F;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x65B9;&#x5411;&#x306B;&#x8EE2;&#x5199;&#x3092;&#x958B;&#x59CB;&#x3057;&#x3001;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3059;&#x308B;&#x306E;&#x5171;&#x6709;&#x8981;&#x7D20;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x53CC;&#x65B9;&#x5411;&#x306E;&#x914D;&#x7F6E;&#x304C;&#x983B;&#x7E41;&#x306B;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x306E;&#x30AA;&#x30EB;&#x30BD;&#x30ED;&#x30B0;&#x9593;&#x3067;&#x4FDD;&#x5B58;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x77E5;&#x898B;&#x306F;&#x3001;&#x53CC;&#x65B9;&#x5411;&#x306E;&#x914D;&#x5217;&#x306F;&#x54FA;&#x4E73;&#x52D5;&#x7269;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x304B;&#x306A;&#x308A;&#x306E;&#x6570;&#x898F;&#x5236;&#x306E;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;

&#x30D2;&#x30C8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x53CC;&#x65B9;&#x5411;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x8C4A;&#x5BCC;

&#xC644;&#xC131; &#xB41C; &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC804;&#xCCB4; &#xAE38;&#xC774; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; Cdna&#xC758; &#xB9DE;&#xCDA4; &#xAC8C;&#xB188; &#xC804;&#xCCB4; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBD84;&#xD3EC;&#xB97C; &#xACF5;&#xBD80; &#xD558;&#xB294; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; &#xAE30;&#xD68C;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. 23,752 &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC0AC;&#xC774;&#xC758; &#xAC70;&#xB9AC;&#xB97C; &#xBD84;&#xC11D; &#xD558; &#xC5EC; &#xB204;&#xAD6C;&#xC758; &#xC804;&#xC0AC; &#xC2DC;&#xC791; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; &#xBBF8;&#xB9CC; 1000 &#xC790;&#xB8CC; &#xC30D; &#xAD6C;&#xBD84; &#xD558;&#xB294; &#xAC8C;&#xB188;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; 10%&#xB97C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; divergently &#xBCA0;&#xB080;&#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC30D;&#xC758; &#xD074;&#xB798;&#xC2A4;&#xB97C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC591;&#xBC29;&#xD5A5; &#xC815;&#xB82C; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xC778;&#xAC04;&#xACFC; &#xB2E4;&#xB978; &#xC885;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC124;&#xBA85; &#xD558;&#xACE0;&#xC788;&#xB2E4;, &#xBE44;&#xB85D; &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188;&#xC5D0; &#xC591;&#xBC29;&#xD5A5; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC30D;&#xC758; &#xC720;&#xD589;, &#xC0BC;&#xC9C4; &#xBC0F; &#xBAA8;&#xB4E0; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xBA87; &#xAC00;&#xC9C0; &#xC591;&#xBC29;&#xD5A5; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC870;&#xC808; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xC54C; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC77C; &#xB9CE;&#xC740; &#xC591;&#xBC29;&#xD5A5; &#xC30D;&#xC758; &#xC131;&#xC801;&#xD45C;&#xB294; coexpressed &#xC774;&#xC9C0;&#xB9CC; antiregulated&#xB294; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC900;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, &#xC6B0;&#xB9AC; &#xC0AC;&#xC774; &#xB450; &#xAC1C;&#xC758; &#xC591;&#xBC29;&#xD5A5; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD504;&#xB85C;&#xBAA8;&#xD130; &#xC138;&#xADF8;&#xBA3C;&#xD2B8;&#xC758; &#xB9CE;&#xC740; &#xC591;&#xBC29;&#xD5A5;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC804;&#xC0AC;&#xB97C; &#xC2DC;&#xC791; &#xD558; &#xACE0; &#xB450; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xC870;&#xC808; &#xD558;&#xB294; &#xACF5;&#xC720; &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568;&#xD560; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xB610;&#xD55C; &#xC591;&#xBC29;&#xD5A5; &#xBC30;&#xC5F4;&#xC744; &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4; orthologs &#xAC00;&#xC6B4;&#xB370; &#xBCF4;&#xC874; &#xC790;&#xC8FC; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xACB0;&#xACFC; &#xC591;&#xBC29;&#xD5A5; &#xBC30;&#xCE58; &#xD3EC;&#xC720;&#xB958; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC0C1;&#xB2F9;&#xC218;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xADDC;&#xC81C;&#xC758; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558;&#xB294; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188;&#xC758; &#xC591;&#xBC29;&#xD5A5; &#xD504;&#xB85C;&#xBAA8;&#xD130;&#xC758; &#xD48D;&#xC694;&#xB85C; &#xC6C0;.

El alineamiento de secuencias de larga duraci&#xF3;n de cDNA humanos al final de la secuencia del genoma humano ofrece una oportunidad &#xFA;nica para estudiar la distribuci&#xF3;n de los genes en el genoma. Mediante el an&#xE1;lisis de las distancias entre los 23,752 genes, hemos identificado una clase de pares de genes transcritos divergente, lo que representa m&#xE1;s del 10% de los genes en el genoma, cuya transcripci&#xF3;n sitios de inicio est&#xE1;n separados por menos de 1000 pares de bases. A pesar de este acuerdo bidireccional se ha descrito anteriormente en los seres humanos y otras especies, la prevalencia de los pares de genes bidireccionales en el genoma humano es sorprendente, y los mecanismos de regulaci&#xF3;n de todos, pero unos pocos genes bidireccionales son desconocidos. Nuestro trabajo muestra que las transcripciones de muchos pares bidireccionales se coexpresan, pero algunos son antiregulated. Adem&#xE1;s, nos muestran que muchos de los segmentos del promotor bidireccional entre dos genes iniciar la transcripci&#xF3;n en ambas direcciones y contienen elementos comunes que regulan los genes. Tambi&#xE9;n muestran que la disposici&#xF3;n bidireccional a menudo se conservan entre rat&#xF3;n orthologs. Estos hallazgos demuestran que un acuerdo bidireccional proporciona un mecanismo &#xFA;nico de regulaci&#xF3;n para un n&#xFA;mero significativo de genes de mam&#xED;feros.

Una abundancia de promotores bidireccionales en el Genoma Humano

&#x5347;&#x9AD8;&#x7684;&#x8840;&#x6D46; C-&#x53CD;&#x5E94;&#x86CB;&#x767D; (CRP) &#x708E;&#x75C7;&#x654F;&#x611F;&#x6807;&#x8BB0;&#xFF0C;&#x5DF2;&#x6210;&#x4E3A;&#x672A;&#x6765;&#x5FC3;&#x8840;&#x7BA1;&#x75BE;&#x75C5;&#x548C;&#x4EE3;&#x8C22;&#x5F02;&#x5E38;&#x663E;&#x7136;&#x5065;&#x5EB7;&#x7537;&#x6027;&#x548C;&#x5973;&#x6027;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x9884;&#x6D4B;&#x6307;&#x6807;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x6574;&#x4E2A;&#x6DB5;&#x76D6; CRP &#x57FA;&#x56E0;&#x4F4D;&#x70B9;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x533A;&#x57DF;&#x6267;&#x884C;&#x5E38;&#x89C1;&#x7684;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x53D8;&#x5F02;&#x7684;&#x6709;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x7684;&#x8C03;&#x67E5;&#x3002;&#x5E38;&#x89C1;&#x5355;&#x6838;&#x82F7;&#x9178;&#x591A;&#x6001;&#x6027; (SNPs) &#x786E;&#x5B9A;&#xFF0C;CRP &#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x7684;&#x51E0;&#x4E2A;&#x662F;&#x4E0E;&#x6B27;&#x6D32;&#x88D4;&#x548C;&#x975E;&#x88D4;&#x7F8E;&#x56FD;&#x5E74;&#x8F7B;&#x6210;&#x4EBA;&#x5FC3;&#x8840;&#x7BA1;&#x98CE;&#x9669;&#x7684;&#x5927;&#x578B;&#x961F;&#x5217;&#x7814;&#x7A76; CRP &#x6C34;&#x5E73;&#x5BC6;&#x5207;&#x76F8;&#x5173;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8FD8;&#x8868;&#x660E;&#x8FD9;&#x4E9B; SNPs &#x4F53;&#x5916;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x91CD;&#x8981;&#x6027;&#x3002;

C-&#x53CD;&#x5E94;&#x86CB;&#x767D; (CRP) &#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x533A;&#x57DF;&#x5185;&#x7684;&#x591A;&#x6001;&#x6027;&#x662F;&#x8840;&#x6D46; CRP &#x6C34;&#x5E73;&#x4E0E;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;

Elevated plasma levels of C-reactive protein (CRP), an inflammation-sensitive marker, have emerged as an important predictor of future cardiovascular disease and metabolic abnormalities in apparently healthy men and women. Here, we performed a systematic survey of common nucleotide variation across the genomic region encompassing the CRP gene locus. Of the common single-nucleotide polymorphisms (SNPs) identified, several in the CRP promoter region are strongly associated with CRP levels in a large cohort study of cardiovascular risk in European American and African American young adults. We also demonstrate the functional importance of these SNPs in vitro.

Polymorphisms within the C-reactive protein (CRP) promoter region are associated with plasma CRP levels.

Plasmatiques &eacute;lev&eacute;s de prot&eacute;ine C - r&eacute;active (CRP), un marqueur d&#39;inflammation sensibles, sont apparus comme un pr&eacute;dicteur important de futures maladies cardiovasculaires et des anomalies m&eacute;taboliques dans les femmes et les hommes apparemment en bonne sant&eacute;. Ici, nous avons r&eacute;alis&eacute; une &eacute;tude syst&eacute;matique des variation de nucl&eacute;otides commune dans toute la r&eacute;gion g&eacute;nomique qui englobe le locus du g&egrave;ne CRP. Les polymorphismes de mononucl&eacute;otidiques communs (SNP) est identifi&eacute;s, plusieurs dans la r&eacute;gion promotrice de CRP sont fortement associ&eacute;es &agrave; des niveaux de CRP dans une &eacute;tude de cohorte importante du risque cardiovasculaire chez les adultes jeunes Am&eacute;ricains europ&eacute;ens et afro-am&eacute;ricains. Nous d&eacute;montrons l&#39;importance fonctionnelle de ces SNP in vitro.

Polymorphismes au sein de la r&eacute;gion promotrice de prot&eacute;ine C - r&eacute;active (CRP) sont associ&eacute;s aux taux plasmatiques CRP.

Polymorphismen innerhalb des C-reaktiven Proteins (CRP)-Promotorregion mit Plasma-CRP in Verbindung gebracht.

Livelli plasmatici elevati di proteina C - reattiva (CRP), un marker di infiammazione-sensibili, sono emerse come un importante predittore di future malattie cardiovascolari e anomalie metaboliche apparentemente sani uomini e donne. Qui, abbiamo eseguito un&#39;indagine sistematica di variazione nucleotidica comuni in tutta la regione genomica che comprende il locus del gene CRP. I comune singolo nucleotide polimorfismi (SNPs) identificati, diversi nella regione del promotore di CRP sono fortemente associati con livelli di CRP in uno studio di coorte grande del rischio cardiovascolare in giovani adulti europei americani e afro-americano. Abbiamo anche dimostrare l&#39;importanza funzionale di questi SNPs in vitro.

Polimorfismi all&#39;interno della regione del promotore di proteina C - reattiva (CRP) sono associati con i livelli plasmatici di CRP.

&#x6607;&#x683C;&#x3057;&#x305F;&#x8840;&#x4E2D; C &#x53CD;&#x5FDC;&#x6027;&#x86CB;&#x767D; &#xFF08;CRP&#xFF09; &#x306F;&#x3001;&#x708E;&#x75C7;&#x306B;&#x654F;&#x611F;&#x306A;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x306F;&#x3001;&#x5C06;&#x6765;&#x306E;&#x5FC3;&#x8840;&#x7BA1;&#x75BE;&#x60A3;&#x3084;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x7570;&#x5E38;&#x306E;&#x3069;&#x3046;&#x3084;&#x3089;&#x5065;&#x5EB7;&#x306A;&#x7537;&#x6027;&#x3068;&#x5973;&#x6027;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x4E88;&#x6E2C;&#x56E0;&#x5B50;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x6D6E;&#x4E0A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;CRP &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5EA7;&#x3092;&#x5305;&#x542B;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x9818;&#x57DF;&#x3092;&#x8D8A;&#x3048;&#x3066;&#x5171;&#x901A;&#x5869;&#x57FA;&#x914D;&#x5217;&#x5909;&#x7570;&#x306E;&#x7CFB;&#x7D71;&#x5316;&#x8ABF;&#x67FB;&#x3092;&#x5B9F;&#x884C;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x8B58;&#x5225;&#x3001;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306A;&#x5358;&#x4E00;&#x30CC;&#x30AF;&#x30EC;&#x30AA;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x591A;&#x5F62;&#x306E; &#xFF08;SNPs&#xFF09;&#x3001;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B; CRP &#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x9818;&#x57DF;&#x3067;&#x5F37;&#x304F;&#x30E8;&#x30FC;&#x30ED;&#x30C3;&#x30D1; &#x30A2;&#x30E1;&#x30EA;&#x30AB;&#x3068;&#x30A2;&#x30D5;&#x30EA;&#x30AB;&#x7CFB;&#x30A2;&#x30E1;&#x30EA;&#x30AB;&#x4EBA;&#x306E;&#x82E5;&#x3044;&#x6210;&#x4EBA;&#x306E;&#x5FC3;&#x8840;&#x7BA1;&#x30EA;&#x30B9;&#x30AF;&#x306E;&#x5927;&#x898F;&#x6A21;&#x30B3;&#x30DB;&#x30FC;&#x30C8;&#x7814;&#x7A76;&#x306E; crp &#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E; SNPs &#x3092; in vitro &#x3067;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x6027;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

C &#x53CD;&#x5FDC;&#x6027;&#x86CB;&#x767D; (CRP) &#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x9818;&#x57DF;&#x5185;&#x306E;&#x591A;&#x5F62;&#x306F;&#x30D7;&#x30E9;&#x30BA;&#x30DE; CRP &#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3068;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

C-&#xBC18;&#xC751;&#xC131; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; (CRP), &#xC5FC;&#xC99D;&#xC5D0; &#xBBFC;&#xAC10;&#xD55C; &#xB9C8;&#xCEE4; &#xC218;&#xC900;&#xC758; &#xB192;&#xC740; &#xD50C;&#xB77C;&#xC988;&#xB9C8; &#xBBF8;&#xB798;&#xC758; &#xC2EC;&#xC7A5; &#xD608;&#xAD00; &#xC9C8;&#xD658;&#xACFC; &#xB300;&#xC0AC; &#xC774;&#xC0C1; &#xBD84;&#xBA85;&#xD788; &#xAC74;&#xAC15; &#xD55C; &#xB0A8;&#xC790;&#xC640; &#xC5EC;&#xC790;&#xC758; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC608;&#xC5B8;&#xC790;&#xB85C; &#xB4F1;&#xC7A5; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; CRP &#xC9C4; &#xB85C;&#xCEE4; &#xC2A4;&#xB97C; &#xD3EC;&#xAD04; &#xD558;&#xB294; genomic &#xC9C0;&#xC5ED;&#xC5D0; &#xAC78;&#xCCD0; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xB274;&#xD074;&#xB808;&#xC624;&#xD2F0;&#xB4DC; &#xC720;&#xC0AC;&#xC758; &#xCCB4;&#xACC4;&#xC801;&#xC778; &#xC870;&#xC0AC;&#xB97C; &#xC218;&#xD589;. &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xB2E8;&#xC77C; &#xB274;&#xD074;&#xB808;&#xC624;&#xD2F0;&#xB4DC; polymorphisms (Snp) &#xC2DD;&#xBCC4;&#xC758; CRP &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xC9C0;&#xAD6C;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xBA87;&#xBA87; &#xC720;&#xB7FD; &#xBBF8;&#xAD6D;&#xC778;&#xACFC; &#xC544;&#xD504;&#xB9AC;&#xCE74;&#xACC4; &#xBBF8;&#xAD6D;&#xC778; &#xC80A;&#xC740; &#xC131;&#xC778;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC2EC;&#xD608; &#xAD00; &#xC704;&#xD5D8;&#xC758; &#xB300;&#xD615; &#xCF54; &#xD638;&#xD2B8; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; CRP &#xC218;&#xC900;&#xACFC; &#xAC15;&#xB825; &#xD558; &#xAC8C; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xB610;&#xD55C; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; Snp &#xCCB4; &#xC678;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801; &#xC911;&#xC694;&#xC131;&#xC744; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;.

C-&#xBC18;&#xC751;&#xC131; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; (CRP) &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xC9C0;&#xC5ED; &#xB0B4; polymorphisms &#xD50C;&#xB77C;&#xC988;&#xB9C8; CRP &#xC218;&#xCE58;&#xC640; &#xAD00;&#xB828;&#xC774; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Los niveles plasm&aacute;ticos elevados de prote&iacute;na C reactiva (CRP), un marcador de inflamaci&oacute;n-sensibles, han surgido como un importante predictor de futuras enfermedades cardiovasculares y las anormalidades metab&oacute;licas en hombres aparentemente sanos y las mujeres. Aqu&iacute;, se realiz&oacute; un estudio sistem&aacute;tico de la variaci&oacute;n de nucle&oacute;tido com&uacute;n en toda la regi&oacute;n gen&oacute;mica que abarca el lugar geom&eacute;trico del gene del CRP. De los com&uacute;n solo-polimorfismos de nucle&oacute;tido (SNPs) identificados, varios en la regi&oacute;n del promotor de CRP son fuertemente asociados con los niveles de CRP en un estudio de cohorte grande de riesgo cardiovascular en adultos jovenes americano europeo y afroamericanos. Tambi&eacute;n demostramos la importancia funcional de estos SNPs in vitro.

Polimorfismos en la regi&oacute;n del promotor de prote&iacute;na C reactiva (PCR) se asocian con los niveles plasm&aacute;ticos de CRP.

&#x5728;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8D77;&#x59CB;&#x7684;&#x8C03;&#x63A7;&#x662F;&#x5168;&#x7403;&#x57FA;&#x56E0;&#x8C03;&#x63A7;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x91CD;&#x8981;&#x7EC4;&#x6210;&#x90E8;&#x5206;&#xFF0C;&#x4F46;&#x76EE;&#x524D;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x5BA3;&#x4F20;&#x5458;&#x5B8C;&#x6574;&#x76EE;&#x5F55;&#x4E0D;&#x5B58;&#x5728;&#x3002;&#x4E3A;&#x4E86;&#x786E;&#x5B9A;&#x7BA1;&#x5236;&#x5730;&#x533A;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x5C55;&#x56DB;&#x4E2A;&#x8BA1;&#x7B97;&#x65B9;&#x6CD5;&#x96C6;&#x6210; 129 &#x6570;&#x636E;&#x96C6;&#x7684;&#x7F16;&#x7801;&#x5168;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x6C89;&#x6DC0;&#x3002;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x96C6;&#x4F53;&#x9884;&#x8A00; 1393&#x5E74;&#x5730;&#x533A;&#x3002;&#x5927;&#x7EA6; 47%&#x7684;&#x5730;&#x533A;&#x662F;&#x72EC;&#x6709;&#x7684;&#x4E00;&#x79CD;&#x65B9;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x56E0;&#x4E3A;&#x6BCF;&#x4E00;&#x79CD;&#x65B9;&#x6CD5;&#x4F7F;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x5047;&#x8BBE;&#x6570;&#x636E;&#x3002;&#x603B;&#x4F53;&#x800C;&#x8A00;&#xFF0C;&#x9884;&#x6D4B;&#x533A;&#x57DF;&#x503E;&#x5411;&#x4E8E;&#x672C;&#x5730;&#x5316;&#x4EE5;&#x9AD8;&#x4FDD;&#x5B88;&#x6838;&#x7CD6;&#x6838;&#x9178;&#x6211;&#x8FC7;&#x654F;&#xFF0C;&#x548C;&#x79EF;&#x6781;&#x8F6C;&#x5F55;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x4E2D;&#x7684;&#x5730;&#x533A;&#x3002;&#x6709;&#x8DA3;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;&#x5927;&#x90E8;&#x5206;&#x533A;&#x57DF;&#x7684;&#x91CD;&#x53E0;&#x4E0E;&#x9644;&#x52A0;&#x8BF4;&#x660E; 3&#39;-&#x5F02;&#x5E38;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x8868;&#x660E;&#x5176;&#x4E2D;&#x4E00;&#x4E9B;&#x53EF;&#x80FD;&#x8C03;&#x8282;&#x53CD;&#x4E49;&#x8F6C;&#x5F55;&#x3002;&#x9884;&#x6D4B;&#x7684;&#x5730;&#x533A;&#x591A;&#x6570; &gt; 2 kb &#x4ECE; 5&#39; &#x7AEF;&#x7684;&#x5148;&#x524D;&#x6CE8;&#x660E;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x6269;&#x589E;&#xFF0C;&#x56E0;&#x6B64;&#x662F;&#x5C0F;&#x8BF4;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x65B0;&#x578B;&#x533A;&#x57DF;&#x53EF;&#x89C4;&#x7BA1; unannotated &#x8A8A;&#x672C;&#x6216;&#x53EF;&#x80FD;&#x4EE3;&#x8868;&#x5DF2;&#x77E5;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x65B0;&#x66FF;&#x4EE3;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8D77;&#x59CB;&#x4F4D;&#x70B9;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5728;&#x56DB;&#x4E2A;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x884C;&#x4F7F;&#x7528;&#x77AC;&#x65F6;&#x8F6C;&#x67D3;&#x5316;&#x9A8C;&#x548C; 25%&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D;&#x81F3;&#x5C11;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684;&#x884C;&#x4E2D;&#x663E;&#x793A;&#x4E0A;&#x8FF0;&#x80CC;&#x666F;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x6D3B;&#x6027;&#x6D4B;&#x8BD5; 163 &#x8FD9;&#x7C7B;&#x533A;&#x57DF;&#x7684;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x6D3B;&#x6027;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8FD8;&#x5BF9; 62 &#x65B0;&#x578B;&#x533A;&#x57DF;&#xFF0C;&#x6267;&#x884C; 5&#39;-&#x7ADE;&#x8D5B;&#x5B9E;&#x9A8C;&#xFF0C;76%&#x7684;&#x533A;&#x57DF;&#x4E0E; 5&#39;-&#x672B;&#x7AEF;&#x7684;&#x81F3;&#x5C11;&#x4E24;&#x4E2A;&#x79CD;&#x65CF;&#x4EA7;&#x54C1;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E;&#x81F3;&#x5C11; 35%&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x529F;&#x80FD;&#x66F4;&#x5F3A;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x6BD4;&#x76EE;&#x524D;&#x6CE8;&#x660E;&#x3002;

&#x7EFC;&#x5408;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x6570;&#x636E;&#x96C6;&#x63ED;&#x793A;&#x4E86;&#x8BB8;&#x591A;&#x65B0;&#x578B;&#x5BA3;&#x4F20;&#x5458; 1%&#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x4E2D;&#x3002;

The regulation of transcriptional initiation in the human genome is a critical component of global gene regulation, but a complete catalog of human promoters currently does not exist. In order to identify regulatory regions, we developed four computational methods to integrate 129 sets of ENCODE-wide chromatin immunoprecipitation data. They collectively predicted 1393 regions. Roughly 47% of the regions were unique to one method, as each method makes different assumptions about the data. Overall, predicted regions tend to localize to highly conserved, DNase I hypersensitive, and actively transcribed regions in the genome. Interestingly, a significant portion of the regions overlaps with annotated 3'-UTRs, suggesting that some of them might regulate anti-sense transcription. The majority of the predicted regions are >2 kb away from the 5'-ends of previously annotated human cDNAs and hence are novel. These novel regions may regulate unannotated transcripts or may represent new alternative transcription start sites of known genes. We tested 163 such regions for promoter activity in four cell lines using transient transfection assays, and 25% of them showed transcriptional activity above background in at least one cell line. We also performed 5'-RACE experiments on 62 novel regions, and 76% of the regions were associated with the 5'-ends of at least two RACE products. Our results suggest that there are at least 35% more functional promoters in the human genome than currently annotated.

Integrated analysis of experimental data sets reveals many novel promoters in 1% of the human genome.

Le r&#xE8;glement de l&#x26;#39;initiation de la transcription dans le g&#xE9;nome humain est une composante essentielle de la r&#xE9;gulation g&#xE9;nique globale, mais un catalogue complet des promoteurs de l&#x26;#39;homme n&#x26;#39;existe pas actuellement. Afin d&#x26;#39;identifier les r&#xE9;gions r&#xE9;gulatrices, nous avons d&#xE9;velopp&#xE9; quatre m&#xE9;thodes de calcul pour int&#xE9;grer les 129 ensembles de donn&#xE9;es &#xE0; l&#x26;#39;&#xE9;chelle ENCODE immunopr&#xE9;cipitation de la chromatine. Ils collectivement pr&#xE9;dit 1393 r&#xE9;gions. Environ 47% des r&#xE9;gions &#xE9;taient uniques &#xE0; une m&#xE9;thode, comme chaque m&#xE9;thode fait des hypoth&#xE8;ses diff&#xE9;rentes sur les donn&#xE9;es. Dans l&#x26;#39;ensemble, pr&#xE9;dit r&#xE9;gions ont tendance &#xE0; se localiser au niveau hautement conserv&#xE9;, DNase I hypersensible, et les r&#xE9;gions activement transcrites dans le g&#xE9;nome. Fait int&#xE9;ressant, une partie importante des chevauchements avec les r&#xE9;gions 3&#x26;#39;-UTR annot&#xE9;, ce qui sugg&#xE8;re que certains d&#x26;#39;entre eux pourraient r&#xE9;guler la transcription anti-sens. La majorit&#xE9; des r&#xE9;gions pr&#xE9;dites sont plus de 2 ko &#xE0; l&#x26;#39;&#xE9;cart des extr&#xE9;mit&#xE9;s 5 &#x26;#39;pr&#xE9;c&#xE9;demment comment&#xE9;es ADNc humains et, partant, sont nouveaux. Ces r&#xE9;gions peuvent r&#xE9;glementer de nouvelles transcriptions annot&#xE9;es ou peut repr&#xE9;senter de nouveaux sites alternatifs d&#xE9;part de la transcription de g&#xE8;nes connus. Nous avons test&#xE9; 163 de ces r&#xE9;gions pour l&#x26;#39;activit&#xE9; de promoteur dans quatre lign&#xE9;es cellulaires en utilisant des exp&#xE9;riences de transfection transitoire, et 25% d&#x26;#39;entre eux ont montr&#xE9; une activit&#xE9; transcriptionnelle dessus du fond au moins une lign&#xE9;e cellulaire. Nous avons &#xE9;galement effectu&#xE9; 5&#x26;#39;-RACE exp&#xE9;riences sur 62 r&#xE9;gions nouvelles, et 76% des r&#xE9;gions ont &#xE9;t&#xE9; associ&#xE9;es &#xE0; des extr&#xE9;mit&#xE9;s 5 &#x26;#39;au moins deux produits RACE. Nos r&#xE9;sultats sugg&#xE8;rent qu&#x26;#39;il ya au moins 35% des promoteurs les plus fonctionnels dans le g&#xE9;nome humain qu&#x26;#39;&#xE0; l&#x26;#39;heure actuelle annot&#xE9;.

Analyse int&#xE9;gr&#xE9;e des ensembles de donn&#xE9;es exp&#xE9;rimentales r&#xE9;v&#xE8;le de nouveaux promoteurs Beaucoup de 1% du g&#xE9;nome humain

Die Verordnung &uuml;ber die transkriptionelle Einleitung in das menschliche Genom ist eine wichtige Komponente der globalen Genregulation, aber ein Gesamtverzeichnis der menschlichen Veranstalter derzeit nicht vorhanden. Um regelnde Regionen zu identifizieren, entwickelten wir vier Berechnungsmethoden 129 Datens&auml;tzen ENCODE-weite Chromatin Immunopr&auml;zipitation zu integrieren. Sie prognostizierten Kollektiv 1393 Regionen. Etwa waren 47 % der Regionen einzigartig f&uuml;r eine Methode, die, wie jede Methode unterschiedliche Annahmen bez&uuml;glich der Daten macht. Insgesamt prognostiziert Regionen tendenziell lokalisieren zu stark konserviert, DNase I &uuml;berempfindlich und aktiv transkribierten Regionen im Genom. Interessanterweise &uuml;berschneidet sich ein erheblicher Teil der Regionen mit kommentierten 3&#39;-UTRs, was darauf hindeutet, dass einige von ihnen Anti-Sense Transkription regulieren k&ouml;nnte. Die Mehrheit der vorhergesagten Regionen sind &gt; 2KB Weg von den 5&#39;-Enden der zuvor menschlichen cDNAs versehen und somit sind Roman. Diese neuartigen Regionen k&ouml;nnen die Regeln den Abschriften oder m&ouml;glicherweise neue alternative Transkription Start Websites von bekannten Genen darstellen. Wir haben 163 solche Regionen f&uuml;r Projekttr&auml;ger Aktivit&auml;t in vier Zelllinien mit transiente Transfektion Assays und 25 % von ihnen zeigte transkriptionelle Aktivit&auml;t &uuml;ber Hintergrund in mindestens einer Zelllinie getestet. Wir auch 5&#39;-RACE-Experimente mit 62 Roman Regionen durchgef&uuml;hrt, und 76 % der Regionen waren die 5&#39;-Enden der mindestens zwei Rennen Produkte zugeordnet. Unsere Ergebnisse legen nahe, da&szlig; es mindestens 35 % funktioneller Promotoren im menschlichen Genom als derzeit versehen.

Integrierte Analyse von experimentellen Daten-Sets zeigt viele neuartige Projekttr&auml;ger in 1 % des menschlichen Genoms.

La regolazione di transcriptional iniziazione nel genoma umano &egrave; un componente fondamentale di regolazione genica globale, ma non esiste un catalogo completo di umani promotori attualmente. Al fine di identificare le aree normative, abbiamo sviluppato quattro metodi computazionali per integrare 129 insiemi di dati di immunoprecipitazione della cromatina ENCODE-livello. Essi previsti collettivamente 1393 regioni. Circa 47% delle regioni erano uniche per un metodo, come ogni metodo rende diverse ipotesi sui dati. Nel complesso, predetto regioni tendono a localizzare a altamente conservate, dnasi I ipersensibili e attivamente trascritti regioni del genoma. &Egrave; interessante notare che, una parte significativa delle regioni si sovrappone con annotato 3&#39;-UTRs, suggerendo che alcuni di loro potrebbe regolare la trascrizione anti-senso. &Egrave; la maggior parte delle regioni previste &amp;gt; 2 kb dalla 5&#39;-estremit&agrave; di precedentemente annotata cDNAs umana e quindi sono romanzo. Queste regioni romanzo possono disciplinare le trascrizioni non annotate o possono rappresentare nuovi siti di inizio alternativi trascrizione dei geni noti. Abbiamo testato 163 tali regioni per attivit&agrave; di promotore in quattro linee cellulari utilizzando dosaggi di trasfezione transiente e 25% di loro ha mostrato attivit&agrave; transcriptional sopra sfondo in almeno una linea cellulare. Abbiamo anche effettuato 5&#39;--RACE esperimenti su 62 regioni romanzo e 76% delle regioni sono stati associati con la 5&#39; estremit&agrave; di almeno due prodotti di gara. I nostri risultati suggeriscono che ci sono almeno il 35% pi&ugrave; funzionale promotori nel genoma umano che attualmente annotato.

Analisi integrata dei set di dati sperimentali rivelano molti promotori romanzo nell&#39;1% del genoma umano.

&#x30D2;&#x30C8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x8EE2;&#x5199;&#x958B;&#x59CB;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306F;&#x3001;&#x30B0;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D0;&#x30EB;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x5236;&#x5FA1;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x3067;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x30AB;&#x30BF;&#x30ED;&#x30B0;&#x306F;&#x3001;&#x73FE;&#x5728;&#x5B58;&#x5728;&#x3057;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x9818;&#x57DF;&#x3092;&#x540C;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;ENCODE&#x5168;&#x4F53;&#x306E;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x514D;&#x75AB;&#x6C88;&#x964D;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;129&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x7D71;&#x5408;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;4&#x3064;&#x306E;&#x8A08;&#x7B97;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3092;&#x958B;&#x767A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5F7C;&#x3089;&#x306F;&#x7DCF;&#x79F0;&#x3057;&#x3066;1393&#x5E74;&#x306E;&#x5730;&#x57DF;&#x3092;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5404;&#x30E1;&#x30BD;&#x30C3;&#x30C9;&#x306F;&#x3001;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x4EEE;&#x5B9A;&#x3092;&#x884C;&#x3046;&#x3068;&#x5730;&#x57DF;&#x306E;&#x7D04;47&#xFF05;&#x304C;&#x3001;&#x4E00;&#x3064;&#x306E;&#x65B9;&#x6CD5;&#x306B;&#x56FA;&#x6709;&#x3067;&#x3042;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x5168;&#x4F53;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x5730;&#x57DF;&#x306F;&#x3001;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x306B;&#x4FDD;&#x5B58;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x30ED;&#x30FC;&#x30AB;&#x30E9;&#x30A4;&#x30BA;&#x3059;&#x308B;&#x50BE;&#x5411;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x306E;DNase I&#x9AD8;&#x611F;&#x53D7;&#x6027;&#x3001;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306B;&#x7A4D;&#x6975;&#x7684;&#x306B;&#x8EE2;&#x5199;&#x9818;&#x57DF;&#x3068;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x8208;&#x5473;&#x6DF1;&#x3044;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3001;&#x6CE8;&#x91C8;&#x4ED8;&#x304D;&#x306E;3&#x26;#39;-UTRs&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x9818;&#x57DF;&#x3068;&#x91CD;&#x306A;&#x3063;&#x3066;&#x304B;&#x306A;&#x308A;&#x306E;&#x90E8;&#x5206;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306F;&#x3001;&#x30A2;&#x30F3;&#x30C1;&#x30BB;&#x30F3;&#x30B9;&#x8EE2;&#x5199;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x4E88;&#x6E2C;&#x5730;&#x57DF;&#x306E;&#x5927;&#x534A;&#x306F;&#x3001;&#x4EE5;&#x524D;&#x306E;&#x6CE8;&#x91C8;&#x4ED8;&#x304D;&#x30D2;&#x30C8;cDNA&#x306E;5&#x26;#39;-&#x672B;&#x7AEF;&#x304B;&#x3089;&#x26;gt; 2 kb&#x96E2;&#x308C;&#x3066;&#x304A;&#x308A;&#x3001;&#x5F93;&#x3063;&#x3066;&#x65B0;&#x898F;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x5C0F;&#x8AAC;&#x306E;&#x9818;&#x57DF;&#x306F;unannotated&#x8EE2;&#x5199;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3057;&#x305F;&#x308A;&#x3001;&#x65E2;&#x77E5;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x4EE3;&#x66FF;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x958B;&#x59CB;&#x90E8;&#x4F4D;&#x3092;&#x8868;&#x3059;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x4E00;&#x904E;&#x6027;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30D5;&#x30A7;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x30A2;&#x30C3;&#x30BB;&#x30A4;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;4&#x3064;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x682A;&#x3067;&#x306F;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x6D3B;&#x6027;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;163&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x9818;&#x57DF;&#x3092;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x3057;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x306E;25&#xFF05;&#x304C;&#x5C11;&#x306A;&#x304F;&#x3068;&#x3082;1&#x3064;&#x306E;&#x30BB;&#x30EB;&#x30E9;&#x30A4;&#x30F3;&#x3067;&#x30D0;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B0;&#x30E9;&#x30A6;&#x30F3;&#x30C9;&#x4E0A;&#x306B;&#x8EE2;&#x5199;&#x6D3B;&#x6027;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3001;62&#x306E;&#x65B0;&#x898F;&#x9818;&#x57DF;&#x306B;5&#x26;#39;-RACE&#x5B9F;&#x9A13;&#x3092;&#x884C;&#x3044;&#x3001;&#x5730;&#x57DF;&#x306E;76&#xFF05;&#x306F;&#x3001;&#x5C11;&#x306A;&#x304F;&#x3068;&#x3082;&#x4E8C;&#x3064;&#x306E;RACE&#x7523;&#x7269;&#x306E;5 &#x26;#39;&#x672B;&#x7AEF;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x73FE;&#x5728;&#x306E;&#x6CE8;&#x91C8;&#x3092;&#x4ED8;&#x3051;&#x308B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x5C11;&#x306A;&#x304F;&#x3068;&#x3082;35&#xFF05;&#x4EE5;&#x4E0A;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;

&#x5B9F;&#x9A13;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x7D71;&#x5408;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;1&#xFF05;&#x3067;&#x3001;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x65B0;&#x898F;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;

&#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188; transcriptional &#xAC1C;&#xC2DC;&#xC758; &#xADDC;&#xC81C; &#xAE00;&#xB85C;&#xBC8C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC870;&#xC808;&#xC758; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C; &#xC774;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xD604;&#xC7AC; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC758; &#xC804;&#xCCB4; &#xCE74;&#xD0C8;&#xB85C;&#xADF8;&#xB97C; &#xC874;&#xC7AC; &#xD558;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADDC;&#xC81C; &#xC601;&#xC5ED;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4;, &#xC6B0;&#xB9AC; 129 &#xC778;&#xCF54;&#xB529; &#xC804;&#xCCB4; chromatin immunoprecipitation &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC138;&#xD2B8;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD569; &#xD558; 4 &#xACC4;&#xC0B0; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xAC1C;&#xBC1C;. &#xADF8;&#xB4E4;&#xC740; &#xC9D1;&#xB2E8;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; 1393 &#xC601;&#xC5ED;&#xC744; &#xC608;&#xCE21; &#xD588;&#xB2E4;. &#xB300;&#xB7B5; &#xAC01; &#xBC29;&#xBC95;&#xC5D0;&#xC11C;&#xB294; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xB2E4;&#xB978; &#xAC00;&#xC815; &#xC601;&#xC5ED;&#xC758; 47% &#xD55C; &#xBC29;&#xBC95; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC804;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C;, &#xACE0;&#xB3C4;&#xB85C; &#xBCF4;&#xC874;, Dnase&#xB97C; &#xC9C0;&#xC5ED;&#xD654; &#xD558;&#xB294; &#xACBD;&#xD5A5;&#xC774; &#xC601;&#xC5ED; &#xC608;&#xCE21; &#xACFC;&#xBBFC;, &#xB098; &#xD558; &#xACE0; &#xAC8C;&#xB188;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC801;&#xADF9;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xBCA0;&#xB080;&#xB41C; &#xC601;&#xC5ED;. &#xD765;&#xBBF8;&#xB86D;&#xAC8C;&#xB3C4;, &#xC9C0;&#xC5ED;&#xC758; &#xC0C1;&#xB2F9; &#xBD80;&#xBD84; &#xC911;&#xCCA9; &#xC8FC;&#xC11D;&#xB41C; 3&#39;-Utr, &#xC81C;&#xC548; &#xD558;&#xB294; &#xADF8;&#xB4E4; &#xC911; &#xC77C;&#xBD80; anti-sense &#xC804;&#xC0AC; &#xC870;&#xC808; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC608;&#xCE21; &#xB41C; &#xC601;&#xC5ED;&#xC758; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC740; &amp;gt;&#xC758; 5&#39;-&#xB05D;&#xC5D0;&#xC11C; 2 kb &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; cDNAs &#xC8FC;&#xC11D;&#xC774; &#xACE0; &#xADF8;&#xB7EC;&#xBBC0;&#xB85C; &#xC18C;&#xC124;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC18C;&#xC124; &#xC601;&#xC5ED; unannotated &#xB179;&#xCDE8; &#xB85D;&#xC744; &#xC870;&#xC808; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xB610;&#xB294; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xB300;&#xC548; &#xC804;&#xC0AC; &#xC2DC;&#xC791; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xB97C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0BC; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xACFC;&#xB3C4; transfection &#xBD84;&#xC11D; &#xC2E4;&#xD5D8; &#xBC0F; &#xBC30;&#xACBD; &#xC704;&#xC5D0; transcriptional &#xD65C;&#xB3D9; &#xD558;&#xB098; &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; &#xC140; &#xB77C;&#xC778;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC900; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; 25%&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; 4 &#xAC1C;&#xC758; &#xC140; &#xB77C;&#xC778;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; 163 &#xC601;&#xC5ED;&#xC744; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xB610;&#xD55C; 62 &#xC18C;&#xC124; &#xC601;&#xC5ED;&#xC5D0; 5&#39;-&#xACBD;&#xC8FC; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC744; &#xC218;&#xD589; &#xD558; &#xACE0; &#xC9C0;&#xC5ED; 76 %2 &#xAC1C; &#xC774;&#xC0C1; &#xC778;&#xC885; &#xC81C;&#xD488;&#xC758; 5&#39;-&#xB05D;&#xACFC; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; 35% &#xC774;&#xC0C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC81C;&#xC548; &#xD604;&#xC7AC; &#xC8FC;&#xC11D; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188;&#xC5D0; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;.

&#xD1B5;&#xD569;&#xB41C; &#xBD84;&#xC11D; &#xC2E4;&#xD5D8; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC138;&#xD2B8;&#xC758; &#xB9CE;&#xC740; &#xC18C;&#xC124; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC744; &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188;&#xC758; 1%&#xB97C; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC900;&#xB2E4;.

La regulaci&#xF3;n de la iniciaci&#xF3;n de la transcripci&#xF3;n en el genoma humano es un componente cr&#xED;tico de la regulaci&#xF3;n g&#xE9;nica global, sino un cat&#xE1;logo completo de los promotores humanos en la actualidad no existe. Con el fin de identificar las regiones reguladoras, hemos desarrollado cuatro m&#xE9;todos de c&#xE1;lculo para integrar 129 conjuntos de ENCODE datos de toda la inmunoprecipitaci&#xF3;n de cromatina. Ellos colectivamente predicho 1393 regiones. Aproximadamente el 47% de las regiones eran exclusivas de un m&#xE9;todo, ya que cada m&#xE9;todo tiene diferentes hip&#xF3;tesis acerca de los datos. En general, predijo regiones tienden a localizar a muy conservadas, DNasa I hipersensible, y las regiones transcritas activamente en el genoma. Curiosamente, una parte significativa de las superposiciones regiones con anotada 3&#x26;#39;-UTRs, lo que sugiere que algunos de ellos podr&#xED;a regular la transcripci&#xF3;n anti-sentido. La mayor&#xED;a de las regiones pronosticados son m&#xE1;s de 2 kb de distancia de los extremos 5 &#x26;#39;de ADNc humanos anteriormente comentados y por lo tanto son nuevos. Estas nuevas regiones podr&#xE1;n regular las transcripciones no anotadas o puede representar nuevas alternativas de sitios de inicio de transcripci&#xF3;n de genes conocidos. Hemos probado 163 de esas regiones para la actividad promotora en cuatro l&#xED;neas celulares mediante ensayos de transfecci&#xF3;n transitoria, y el 25% de ellos mostr&#xF3; que la actividad transcripcional por encima de fondo en la l&#xED;nea celular al menos una. Tambi&#xE9;n se realiz&#xF3; 5&#x26;#39;-RACE experimentos en 62 nuevas regiones, y el 76% de las regiones se asociaron con los extremos 5 &#x26;#39;de al menos dos productos RACE. Nuestros resultados sugieren que existen al menos 35% de los promotores m&#xE1;s funcionales en el genoma humano que en la actualidad anotada.

An&#xE1;lisis integrado de conjuntos de datos experimentales revela que muchos promotores novedosos en el 1% del genoma humano

&#x6211;&#x4EEC;&#x62A5;&#x544A;&#x7684;&#x751F;&#x6210;&#x548C;&#x5206;&#x6790;&#x529F;&#x80FD;&#x6570;&#x636E;&#x4ECE;&#x591A;&#x4E2A;&#x4E0D;&#x540C;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x5BF9;&#x76EE;&#x6807; 1%&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7684;&#x6267;&#x884C;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x7F16;&#x7801;&#x9879;&#x76EE;&#x7684;&#x8BD5;&#x70B9;&#x9636;&#x6BB5;&#x7684;&#x4E00;&#x90E8;&#x5206;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6570;&#x636E;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x96C6;&#x6210;&#x548C;&#x9644;&#x6709;&#x4E00;&#x7CFB;&#x5217;&#x8FDB;&#x5316;&#x548C;&#x8BA1;&#x7B97;&#x5206;&#x6790;&#x3002;&#x5728;&#x4E00;&#x8D77;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x63A8;&#x8FDB;&#x5173;&#x4E8E;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x51E0;&#x4E2A;&#x4E3B;&#x8981;&#x9886;&#x57DF;&#x7684;&#x96C6;&#x4F53;&#x77E5;&#x8BC6;&#x3002;&#x7B2C;&#x4E00;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4EE4;&#x4EBA;&#x4FE1;&#x670D;&#x7684;&#x8BC1;&#x636E;&#x5F31;&#x8005;&#x8F6C;&#x5F55;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x6837;&#x53EF;&#x4EE5;&#x5728;&#x4E3B;&#x8BB0;&#x5F55;&#x8A8A;&#x672C;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x975E;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7F16;&#x7801;&#x7684;&#x8A8A;&#x672C;&#xFF0C;&#x548C;&#x90A3;&#x4E9B;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x76F8;&#x4E92;&#x91CD;&#x53E0;&#x4E2D;&#x627E;&#x5230;&#x5176;&#x57FA;&#x5730;&#x7684;&#x5927;&#x90E8;&#x5206;&#x3002;&#x7B2C;&#x4E8C;&#xFF0C;&#x6709;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x5730;&#x5BA1;&#x67E5;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x542F;&#x52A8;&#x7AD9;&#x70B9;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x5176;&#x5177;&#x4F53;&#x7684;&#x8C03;&#x63A7;&#x5E8F;&#x5217;&#x548C;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x7684;&#x53EF;&#x8BBF;&#x95EE;&#x6027;&#x548C;&#x7EC4;&#x86CB;&#x767D;&#x4FEE;&#x9970;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x5173;&#x7CFB;&#x4EA7;&#x751F;&#x4E86;&#x8F6C;&#x5F55;&#x7684;&#x65B0;&#x8BA4;&#x8BC6;&#x3002;&#x7B2C;&#x4E09;&#xFF0C;&#x4E00;&#x4E2A;&#x66F4;&#x5B8C;&#x5584;&#x7684;&#x89C6;&#x56FE;&#x7684;&#x67D3;&#x8272;&#x8D28;&#x7ED3;&#x6784;&#x5DF2;&#x7ECF;&#x5F62;&#x6210;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC; DNA &#x590D;&#x5236;&#x548C;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8C03;&#x63A7;&#x53CA;&#x5176;&#x76F8;&#x4E92;&#x5173;&#x7CFB;&#x3002;&#x6700;&#x540E;&#xFF0C;&#x6574;&#x5408;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x65B0;&#x6765;&#x6E90;&#x7684;&#x4FE1;&#x606F;&#xFF0C;&#x7279;&#x522B;&#x662F;&#x5BF9;&#x54FA;&#x4E73;&#x52A8;&#x7269;&#x8FDB;&#x5316;&#x57FA;&#x4E8E;&#x9664;&#x7684;&#x5185;&#x7269;&#x79CD;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x6BD4;&#x8F83;&#xFF0C;&#x4EA7;&#x751F;&#x4E86;&#x5173;&#x4E8E;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x666F;&#x89C2;&#x7684;&#x65B0;&#x673A;&#x68B0;&#x548C;&#x8FDB;&#x5316;&#x7684;&#x89C1;&#x89E3;&#x3002;&#x5728;&#x4E00;&#x8D77;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7814;&#x7A76;&#x5B9A;&#x4E49;&#x8DEF;&#x5F84;&#x7684;&#x66F4;&#x5168;&#x9762;&#x7684;&#x8868;&#x5F81;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x8FFD;&#x6C42;&#x3002;

&#x9274;&#x5B9A;&#x548C;&#x5206;&#x6790; 1%&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6240;&#x7F16;&#x7801;&#x7684;&#x8BD5;&#x70B9;&#x9879;&#x76EE;&#x4E2D;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x5143;&#x4EF6;&#x3002;

We report the generation and analysis of functional data from multiple, diverse experiments performed on a targeted 1% of the human genome as part of the pilot phase of the ENCODE Project. These data have been further integrated and augmented by a number of evolutionary and computational analyses. Together, our results advance the collective knowledge about human genome function in several major areas. First, our studies provide convincing evidence that the genome is pervasively transcribed, such that the majority of its bases can be found in primary transcripts, including non-protein-coding transcripts, and those that extensively overlap one another. Second, systematic examination of transcriptional regulation has yielded new understanding about transcription start sites, including their relationship to specific regulatory sequences and features of chromatin accessibility and histone modification. Third, a more sophisticated view of chromatin structure has emerged, including its inter-relationship with DNA replication and transcriptional regulation. Finally, integration of these new sources of information, in particular with respect to mammalian evolution based on inter- and intra-species sequence comparisons, has yielded new mechanistic and evolutionary insights concerning the functional landscape of the human genome. Together, these studies are defining a path for pursuit of a more comprehensive characterization of human genome function.

Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project.

Nous rapportons la g&#xE9;n&#xE9;ration et l&#x26;#39;analyse des donn&#xE9;es fonctionnelles &#xE0; partir de plusieurs exp&#xE9;riences diverses effectu&#xE9;es sur une approche cibl&#xE9;e de 1% du g&#xE9;nome humain dans le cadre de la phase pilote du projet ENCODE. Ces donn&#xE9;es ont &#xE9;t&#xE9; davantage int&#xE9;gr&#xE9;es et compl&#xE9;t&#xE9;es par un certain nombre d&#x26;#39;analyses de l&#x26;#39;&#xE9;volution et de calcul. Ensemble, nos r&#xE9;sultats progresser la connaissance collective sur la fonction du g&#xE9;nome humain dans plusieurs domaines importants. Tout d&#x26;#39;abord, nos &#xE9;tudes fournissent des preuves convaincantes que le g&#xE9;nome est omnipr&#xE9;sente transcrit, de telle sorte que la majorit&#xE9; de ses bases peuvent &#xEA;tre trouv&#xE9;s dans transcrits primaires, y compris les non-transcrits codant pour des prot&#xE9;ines, et ceux qui beaucoup se chevauchent les uns les autres. Deuxi&#xE8;mement, l&#x26;#39;examen syst&#xE9;matique de la r&#xE9;gulation transcriptionnelle a donn&#xE9; une nouvelle compr&#xE9;hension sur les sites de d&#xE9;but de transcription, y compris leur relation &#xE0; des s&#xE9;quences r&#xE9;gulatrices sp&#xE9;cifiques et les caract&#xE9;ristiques d&#x26;#39;accessibilit&#xE9; de la chromatine et la modification des histones. Troisi&#xE8;mement, une vision plus sophistiqu&#xE9;e de structure de la chromatine a &#xE9;merg&#xE9;, y compris son inter-relation avec la r&#xE9;plication de l&#x26;#39;ADN et la r&#xE9;gulation transcriptionnelle. Enfin, l&#x26;#39;int&#xE9;gration de ces nouvelles sources d&#x26;#39;information, en particulier en ce qui concerne l&#x26;#39;&#xE9;volution des mammif&#xE8;res sur la base inter-et intra-comparaisons de s&#xE9;quences d&#x26;#39;esp&#xE8;ces, a donn&#xE9; m&#xE9;caniste nouvelle et des id&#xE9;es &#xE9;volutionnistes concernant le paysage fonctionnelle du g&#xE9;nome humain. Ensemble, ces &#xE9;tudes sont d&#xE9;finissant un chemin pour la poursuite d&#x26;#39;une caract&#xE9;risation plus compl&#xE8;te de la fonction du g&#xE9;nome humain.

Identification et analyse des &#xE9;l&#xE9;ments fonctionnels dans 1% du g&#xE9;nome humain par le projet pilote ENCODE

Wir berichten, die Erstellung und Analyse von funktionalen Daten aus mehreren unterschiedlichen Experimente durchgef&uuml;hrt auf einem gezielten 1 % des menschlichen Genoms im Rahmen der Pilotphase des Projektes ENCODE. Diese Daten wurden weiter integriert und erg&auml;nzt durch eine Reihe von evolution&auml;ren und computergest&uuml;tzte Analysen. Unsere Ergebnisse voraus zusammen, das kollektive Wissen &uuml;ber menschliche Genom-Funktion in einigen wichtigen Bereichen. Unsere Studien geben Sie zuerst &uuml;berzeugenden Beweis, dass das Genom durchdringend transkribiert wird, so dass die meisten ihrer Grundlagen kann, in prim&auml;ren Abschriften gefunden werden, einschlie&szlig;lich nicht-Protein-kodierenden Abschriften und solche, die weitgehend &uuml;berlappen. Zweite, systematische Untersuchung der Transkriptionsregulation hat neues Verst&auml;ndnis &uuml;ber Transkription Start-Websites, einschlie&szlig;lich ihrer Beziehung zu bestimmten regulatorische Sequenzen des Chromatin-Zug&auml;nglichkeit und Histon-&Auml;nderung ergeben. Drittens eine anspruchsvollere Ansicht von Chromatin Struktur hat sich entwickelt, einschlie&szlig;lich ihrer Wechselwirkung mit der DNA-Replikation und transkriptionelle Regulation. Schlie&szlig;lich f&uuml;hrte Integration dieser neuen Quellen von Informationen, insbesondere in Bezug auf S&auml;ugetier-Entwicklung basierend auf inter - und Intra-Spezies Sequenz vergleichen, mechanistischen und evolution&auml;re Erkenntnisse &uuml;ber die funktionale Landschaft des menschlichen Genoms. Zusammen sind diese Studien einen Pfad f&uuml;r die Aus&uuml;bung der eine umfassendere Charakterisierung des menschlichen Genoms Funktion definieren.

Ermittlung und Analyse der Funktionselemente in 1 % des menschlichen Genoms durch das ENCODE-Pilotprojekt.

Riportiamo la generazione e l&#39;analisi dei dati funzionali da multipli, diversi esperimenti effettuati su un bersaglio 1% del genoma umano come parte della fase pilota del progetto ENCODE. Questi dati sono stati ulteriormente integrati e arricchiti da una serie di analisi evolutive e computazionali. Insieme, i nostri risultati avanzano la conoscenza collettiva sulla funzione del genoma umano in diverse aree principali. In primo luogo, i nostri studi forniscono prove convincenti che il genoma &egrave; pervasively trascritto, tale che la maggior parte delle sue basi pu&ograve; essere trovata in trascrizioni primarie, comprese le trascrizioni di non-proteina-codificazione e quelli che ampiamente si sovrappongano. Secondo esame sistematico della regolazione trascrizionale ha portato nuova comprensione su trascrizione inizio siti, tra cui il loro rapporto a specifiche sequenze regolatrici e funzionalit&agrave; di modifica di accessibilit&agrave; e dell&#39;istone di cromatina. In terzo luogo, una pi&ugrave; sofisticata vista della cromatina struttura emersa, compresa la sua interrelazione con la replicazione del DNA e regolazione trascrizionale. Infine, integrazione di queste nuove fonti di informazione, in particolare per quanto riguarda l&#39;evoluzione dei mammiferi, basato sul confronto di sequenza inter - e intra-specie, ha fruttato nuove intuizioni meccanicistici ed evolutivi riguardante il paesaggio funzionale del genoma umano. Insieme, questi studi sono definendo un percorso per la ricerca di una pi&ugrave; completa caratterizzazione della funzione del genoma umano.

Identificazione e analisi degli elementi funzionali in 1% del genoma umano dal progetto pilota ENCODE.

&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;ENCODE&#x30D7;&#x30ED;&#x30B8;&#x30A7;&#x30AF;&#x30C8;&#x306E;&#x30D1;&#x30A4;&#x30ED;&#x30C3;&#x30C8;&#x30D5;&#x30A7;&#x30FC;&#x30BA;&#x306E;&#x4E00;&#x74B0;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x76EE;&#x6A19;1&#xFF05;&#x5B9F;&#x884C;&#x306F;&#x3001;&#x8907;&#x6570;&#x306E;&#x591A;&#x69D8;&#x306A;&#x5B9F;&#x9A13;&#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x306A;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;&#x751F;&#x6210;&#x3068;&#x5206;&#x6790;&#x3092;&#x5831;&#x544A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;&#x3001;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x7D71;&#x5408;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x9032;&#x5316;&#x3001;&#x8A08;&#x7B97;&#x5206;&#x6790;&#x306E;&#x6570;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5F37;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x4E00;&#x7DD2;&#x306B;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x5206;&#x91CE;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30D2;&#x30C8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x306E;&#x77E5;&#x8B58;&#x3092;&#x9032;&#x3081;&#x308B;&#x3002;&#x6700;&#x521D;&#x306B;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x3001;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306F;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x62E0;&#x70B9;&#x306E;&#x5927;&#x534A;&#x306F;&#x975E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x8EE2;&#x5199;&#x3057;&#x3001;&#x5E83;&#x7BC4;&#x56F2;&#x306B;&#x4E92;&#x3044;&#x306B;&#x91CD;&#x306A;&#x308B;&#x3082;&#x306E;&#x3082;&#x542B;&#x3081;&#x3066;&#x4E00;&#x6B21;&#x8EE2;&#x5199;&#x7523;&#x7269;&#x3067;&#x767A;&#x898B;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x666E;&#x904D;&#x7684;&#x306B;&#x8EE2;&#x5199;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x8AAC;&#x5F97;&#x529B;&#x306E;&#x3042;&#x308B;&#x8A3C;&#x62E0;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x8EE2;&#x5199;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x7B2C;&#x4E8C;&#x306B;&#x3001;&#x4F53;&#x7CFB;&#x7684;&#x306A;&#x691C;&#x67FB;&#x306F;&#x3001;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x30A2;&#x30AF;&#x30BB;&#x30B7;&#x30D3;&#x30EA;&#x30C6;&#x30A3;&#x3068;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30F3;&#x4FEE;&#x98FE;&#x306E;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x914D;&#x5217;&#x3068;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3068;&#x306E;&#x95A2;&#x4FC2;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x8EE2;&#x5199;&#x958B;&#x59CB;&#x90E8;&#x4F4D;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x65B0;&#x305F;&#x306A;&#x7406;&#x89E3;&#x3092;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x7B2C;&#x4E09;&#x306B;&#x3001;&#x30AF;&#x30ED;&#x30DE;&#x30C1;&#x30F3;&#x69CB;&#x9020;&#x306E;&#x3088;&#x308A;&#x6D17;&#x7DF4;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30D3;&#x30E5;&#x30FC;&#x3067;&#x306F;&#x3001;DNA&#x8907;&#x88FD;&#x3068;&#x8EE2;&#x5199;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3068;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x95A2;&#x4FC2;&#x3092;&#x542B;&#x3081;&#x3066;&#x3001;&#x6D6E;&#x4E0A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x6700;&#x5F8C;&#x306B;&#x3001;&#x9593;&#x5185;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x7A2E;&#x306E;&#x914D;&#x5217;&#x6BD4;&#x8F03;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x3001;&#x54FA;&#x4E73;&#x985E;&#x306E;&#x9032;&#x5316;&#x306B;&#x95A2;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x60C5;&#x5831;&#x306E;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x60C5;&#x5831;&#x6E90;&#x306E;&#x7D71;&#x5408;&#x306F;&#x3001;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x6A5F;&#x5E8F;&#x3068;&#x30D2;&#x30C8;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x666F;&#x89B3;&#x306B;&#x95A2;&#x3059;&#x308B;&#x9032;&#x5316;&#x306E;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x304C;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x4E00;&#x7DD2;&#x306B;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x6A5F;&#x80FD;&#x306E;&#x3088;&#x308A;&#x5305;&#x62EC;&#x7684;&#x306A;&#x7279;&#x6027;&#x3092;&#x8FFD;&#x6C42;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30D1;&#x30B9;&#x3092;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x3001;ENCODE&#x30D1;&#x30A4;&#x30ED;&#x30C3;&#x30C8;&#x30D7;&#x30ED;&#x30B8;&#x30A7;&#x30AF;&#x30C8;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x30D2;&#x30C8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;1&#xFF05;&#x306E;&#x6A5F;&#x80FD;&#x8981;&#x7D20;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x3068;&#x89E3;&#x6790;

&#xC6B0;&#xB9AC; &#xC138;&#xB300;&#xC758; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xAE30;&#xB2A5; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xBD84;&#xC11D; &#xBCF4;&#xACE0; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC2E4;&#xD5D8; &#xB300;&#xC0C1; 1% &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188;&#xC758; ENCODE &#xD504;&#xB85C;&#xC81D;&#xD2B8;&#xC758; &#xD30C;&#xC77C;&#xB7FF; &#xB2E8;&#xACC4;&#xC758; &#xC77C;&#xD658;&#xC73C;&#xB85C; &#xC218;&#xD589; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xB354; &#xD1B5;&#xD569; &#xACE0; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC9C4;&#xD654; &#xBC0F; &#xC804;&#xC0B0; &#xBD84;&#xC11D; &#xD558; &#xC5EC; &#xC99D;&#xAC15; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD568;&#xAED8;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; &#xBA87; &#xAC00;&#xC9C0; &#xC8FC;&#xC694; &#xC601;&#xC5ED;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC9D1;&#xB2E8;&#xC801; &#xC9C0;&#xC2DD; &#xC0AC;&#xC804;. &#xCCAB;&#xC9F8;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB294; &#xADF8; &#xAE30;&#xC9C0;&#xC758; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84; &#xAE30;&#xBCF8; &#xC0AC;&#xBCF8;, &#xC0AC;&#xBCF8; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xCF54;&#xB529; &#xB4F1; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD558; &#xAC8C; &#xC11C;&#xB85C; &#xACB9;&#xCE58;&#xB294; &#xADF8;&#xC5D0; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xAC8C;&#xB188; pervasively &#xBCF5;&#xC0AC;&#xD560; &#xC218; &#xC124;&#xB4DD;&#xB825; &#xC788;&#xB294; &#xC99D;&#xAC70;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Transcriptional &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xC158;&#xC758; &#xB450; &#xBC88;&#xC9F8;, &#xCCB4;&#xACC4;&#xC801;&#xC778; &#xC2DC;&#xD5D8; &#xC804;&#xC0AC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC774;&#xD574; &#xC2DC;&#xC791; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;, &#xD2B9;&#xC815; &#xADDC;&#xC81C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBC0F; chromatin &#xC811;&#xADFC;&#xC131; &#xBC0F; &#xD788;&#xC2A4;&#xD1A4; &#xC218;&#xC815; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xAD00;&#xACC4;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; &#xAD74;&#xBCF5; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC14B;&#xC9F8;, &#xBCF4;&#xB2E4; &#xC815;&#xAD50;&#xD55C; &#xBCF4;&#xAE30; chromatin&#xC758; &#xAD6C;&#xC870; &#xB098;&#xC654;&#xB2E4;, DNA &#xBCF5;&#xC81C;&#xC640; transcriptional &#xADDC;&#xC81C;&#xB294; &#xC778;&#xD14C;&#xB974;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC;. &#xB9C8;&#xC9C0;&#xB9C9;&#xC73C;&#xB85C;, &#xD1B5;&#xD569; &#xC815;&#xBCF4;, &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC18C;&#xC2A4; &#xD2B9;&#xD788; &#xD3EC;&#xC720;&#xB958; &#xC9C4;&#xD654; &#xC778;&#xD14C;&#xB974;-&#xB0B4;&#xBD80;-&#xC885; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBE44;&#xAD50; &#xACB0;&#xACFC;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C;, &#xAD00;&#xB828; &#xC788;&#xB2E4; &#xB098;&#xC654;&#xACE0; &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC801;&#xC778; &#xD48D;&#xACBD;&#xC5D0; &#xAD00;&#xD55C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xAE30;&#xACC4;&#xC640; &#xC9C4;&#xD654; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;. &#xD568;&#xAED8;, &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB294; &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188; &#xAE30;&#xB2A5; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xD3EC;&#xAD04;&#xC801;&#xC778; &#xD2B9;&#xC131;&#xD654;&#xC758; &#xCD94;&#xAD6C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xACBD;&#xB85C; &#xC815;&#xC758; &#xD558; &#xACE0; &#xC788;&#xB2E4;.

&#xC2DD;&#xBCC4; &#xBC0F; &#xC778;&#xCF54;&#xB529; &#xD30C;&#xC77C;&#xB7FF; &#xD504;&#xB85C;&#xC81D;&#xD2B8;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188;&#xC758; 1%&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5; &#xC694;&#xC18C; &#xBD84;&#xC11D;.

Se presenta la generaci&#xF3;n y an&#xE1;lisis de datos funcionales a partir de experimentos m&#xFA;ltiples y diversas realizadas en un espec&#xED;fico el 1% del genoma humano como parte de la fase piloto del proyecto ENCODE. Estos datos se han integrado en mayor medida y aumentada por una serie de an&#xE1;lisis evolutivos y computacional. En conjunto, nuestros resultados avanzar en el conocimiento colectivo acerca de la funci&#xF3;n del genoma humano en varias &#xE1;reas importantes. En primer lugar, nuestros estudios proporcionan evidencia convincente de que el genoma es transcrito penetrante, de tal manera que la mayor&#xED;a de sus bases se pueden encontrar en las transcripciones primarias, incluyendo no codificantes de prote&#xED;nas transcripciones, y las que ampliamente se solapan entre s&#xED;. El segundo examen, sistem&#xE1;tica de la regulaci&#xF3;n transcripcional ha dado una nueva comprensi&#xF3;n sobre los sitios de inicio de transcripci&#xF3;n, incluyendo su relaci&#xF3;n con secuencias reguladoras espec&#xED;ficas y las caracter&#xED;sticas de accesibilidad de la cromatina y la modificaci&#xF3;n de las histonas. En tercer lugar, una visi&#xF3;n m&#xE1;s sofisticada de la estructura de la cromatina se ha convertido, incluida su interrelaci&#xF3;n con la replicaci&#xF3;n del ADN y la regulaci&#xF3;n transcripcional. Por &#xFA;ltimo, la integraci&#xF3;n de estas nuevas fuentes de informaci&#xF3;n, en particular con respecto a la evoluci&#xF3;n de los mam&#xED;feros sobre la base de comparaciones inter e intra-especie de secuencia, ha dado nueva mec&#xE1;nica y puntos de vista sobre la evoluci&#xF3;n del paisaje funcional del genoma humano. En conjunto, estos estudios est&#xE1;n definiendo una trayectoria para la b&#xFA;squeda de una caracterizaci&#xF3;n m&#xE1;s completa de la funci&#xF3;n del genoma humano.

Identificaci&#xF3;n y an&#xE1;lisis de los elementos funcionales en el 1% del genoma humano por el proyecto piloto ENCODE

Mesenchymal stem (MS) cells are excellent candidates for cell-based therapeutic strategies to regenerate injured tissue. Although human MS cells can be isolated from bone marrow and directed to differentiate by means of an osteogenic pathway, the regulation of cell-fate determination is not well understood. Recent reports identify critical roles for microRNAs (miRNAs), regulators of gene expression either by inhibiting the translation or by stimulating the degradation of target mRNAs.

Functional profiling reveals critical role for miRNA in differentiation of human mesenchymal stem cells.

Cellules souches m&eacute;senchymateuses (MS) sont d&#39;excellents candidats pour les strat&eacute;gies th&eacute;rapeutiques &agrave; base de cellules pour r&eacute;g&eacute;n&eacute;rer les tissus l&eacute;s&eacute;s. Bien que les cellules humaines de MS peuvent &ecirc;tre isol&eacute;s de la moelle osseuse et r&eacute;alis&eacute;s pour diff&eacute;rencier au moyen d&#39;une voie ost&eacute;og&eacute;nique, la r&eacute;gulation de la d&eacute;termination du sort de la cellule n&#39;est pas bien comprise. Des rapports r&eacute;cents identifient un r&ocirc;le crucial pour les microARN (miARN), r&eacute;gulateurs de l&#39;expression g&eacute;nique par inhibition de la traduction ou en stimulant la d&eacute;gradation des ARNm cible.

Profilage fonctionnel r&eacute;v&egrave;le le r&ocirc;le critique de miRNA dans la diff&eacute;renciation des cellules souches m&eacute;senchymateuses humaines.

Mesenchymale Stammzellen (MS) sind ausgezeichnete Kandidaten f&uuml;r zellbasierte Therapiestrategien, verletzte Gewebe zu regenerieren. Obgleich menschliche MS-Zellen aus dem Knochenmark isoliert und k&ouml;nnen gerichtet, mittels einem osteogenen Weg zu unterscheiden, ist die Regelung der Zelle-Schicksal Bestimmung nicht gut verstanden. J&uuml;ngste Berichte identifizieren kritische Rollen f&uuml;r MicroRNAs (MiRNAs), Regler der Genexpression durch Hemmung der &Uuml;bersetzung oder durch die Stimulierung der Verschlechterung der Ziel-mRNAs.

Funktionale Profilerstellung zeigt kritische Rolle f&uuml;r MiRNA in Differenzierung humaner mesenchymaler Stammzellen.

Cellule staminali mesenchimali (MS) sono ottimi candidati per strategie terapeutiche basate sulle cellule per rigenerare il tessuto danneggiato. Sebbene le cellule umane di MS possono essere isolate da midollo osseo e diretto a differenziare attraverso un percorso osteogeniche, il regolamento di determinazione di destino delle cellule non &egrave; ben chiaro. I rapporti recenti identificano ruoli critici per microRNA (miRNAs), regolatori dell&#39;espressione genica inibendo la traduzione o stimolando la degradazione del mRNA bersaglio.

Profilazione funzionale rivela il ruolo critico di miRNA nel differenziamento di cellule staminali mesenchimali umane.

(MS) &#x9AA8;&#x9AD3;&#x95F4;&#x5145;&#x8D28;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x662F;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4E3A;&#x57FA;&#x7840;&#x7684;&#x6CBB;&#x7597;&#x7B56;&#x7565;&#x4F18;&#x79C0;&#x5019;&#x9009;&#xFF0C;&#x635F;&#x4F24;&#x7684;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x7684;&#x518D;&#x751F;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x53EF;&#x4EE5;&#x4ECE;&#x9AA8;&#x9AD3;&#x5206;&#x79BB;&#x548C;&#x5B9A;&#x5411;&#x5206;&#x5316;&#x6210;&#x9AA8;&#x7684;&#x9014;&#x5F84;&#x901A;&#x8FC7; MS &#x7EC6;&#x80DE;&#xFF0C;&#x8C03;&#x8282;&#x7EC6;&#x80DE;&#x547D;&#x8FD0;&#x51B3;&#x5B9A;&#x7684;&#x4E0D;&#x662F;&#x5F88;&#x4E86;&#x89E3;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#x7684;&#x62A5;&#x544A;&#x786E;&#x5B9A; Microrna &#xFF08;Mirna&#xFF09;&#xFF0C;&#x76D1;&#x7BA1;&#x8005;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6291;&#x5236;&#x7FFB;&#x8BD1;&#x6216;&#x523A;&#x6FC0;&#x7684;&#x76EE;&#x6807;&#x57FA;&#x56E0;&#x9000;&#x5316;&#x7684;&#x5173;&#x952E;&#x89D2;&#x8272;&#x3002;

&#x529F;&#x80FD;&#x5206;&#x6790;&#x63ED;&#x793A;&#x4E86;&#x7C73;&#x5C14;&#x4EBA;&#x9AA8;&#x9AD3;&#x95F4;&#x5145;&#x8D28;&#x5E72;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5206;&#x5316;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x7684;&#x5173;&#x952E;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;

(MS) &#x9593;&#x8449;&#x7CFB;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE;&#x306F;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x305F;&#x6CBB;&#x7642;&#x6226;&#x7565;&#x8CA0;&#x50B7;&#x3057;&#x305F;&#x7D44;&#x7E54;&#x3092;&#x518D;&#x751F;&#x3055;&#x305B;&#x308B;&#x512A;&#x308C;&#x305F;&#x5019;&#x88DC;&#x3067;&#x3059;&#x3002;MS &#x306E;&#x3072;&#x3068;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x9AA8;&#x9AC4;&#x304B;&#x3089;&#x5206;&#x96E2;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x306F;&#x9AA8;&#x5F62;&#x6210;&#x7CFB;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x533A;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x76E3;&#x7763;&#x304C;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x904B;&#x547D;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306F;&#x3088;&#x304F;&#x7406;&#x89E3;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#x306E;&#x30EC;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#x306F;&#x3001;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; Rna &#xFF08;Mirna&#xFF09;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3001;&#x7FFB;&#x8A33;&#x3092;&#x963B;&#x5BB3;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8; Mrna &#x306E;&#x5206;&#x89E3;&#x523A;&#x6FC0;&#x306E;&#x30EC;&#x30AE;&#x30E5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x6A5F;&#x80FD;&#x7684;&#x306A;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E; miRNA &#x30D2;&#x30C8;&#x9593;&#x8449;&#x7CFB;&#x5E79;&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x5206;&#x5316;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

(MS) &#xC911;&#xAC04; &#xC5FD; &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC;&#xB294; &#xC190;&#xC0C1;&#xB41C; &#xC870;&#xC9C1;&#xC744; &#xC7AC;&#xC0DD; &#xD558; &#xC140; &#xAE30;&#xBC18; &#xCE58;&#xB8CC; &#xC804;&#xB7B5;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xC6B0;&#xC218;&#xD55C; &#xD6C4;&#xBCF4;&#xC790;. &#xC778;&#xAC04;&#xC758; MS &#xC138;&#xD3EC;&#xB97C; &#xACE8; &#xC218;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBD84;&#xB9AC; &#xD558; &#xACE0; osteogenic &#xD1B5;&#xB85C; &#xD1B5;&#xD574; &#xCC28;&#xBCC4;&#xD654; &#xD558;&#xB294; &#xAC10;&#xB3C5; &#xC218; &#xC788;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xC138;&#xD3EC; &#xC6B4;&#xBA85; &#xACB0;&#xC815;&#xC758; &#xADDC;&#xC81C; &#xC798; &#xC774;&#xD574; &#xB418;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xCD5C;&#xADFC; &#xBCF4;&#xACE0;&#xC11C;&#xB294; microRNAs (miRNAs)&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; &#xC5B5;&#xC81C;&#xB97C; &#xBC88;&#xC5ED; &#xD558;&#xAC70;&#xB098; &#xB300;&#xC0C1; Mrnas&#xC758; &#xC800;&#xD558;&#xB97C; &#xC790;&#xADF9; &#xD558; &#xC5EC; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xD130;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xAE30;&#xB2A5;&#xC131; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xC778;&#xAC04; &#xC911;&#xAC04; &#xC5FD; &#xC904;&#xAE30; &#xC138;&#xD3EC;&#xC758; &#xBD84;&#xD654;&#xC5D0; Mirna&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xACC4;&#xC2DC; &#xD55C;&#xB2E4;.

Las c&eacute;lulas madre mesenquimales (MS) son excelentes candidatos para estrategias terap&eacute;uticas basadas en c&eacute;lulas para regenerar el tejido lesionado. Aunque las c&eacute;lulas humanas de MS pueden ser aisladas de m&eacute;dula &oacute;sea y dirigidas a diferenciar por medio de un camino osteog&eacute;nico, la regulaci&oacute;n de la determinaci&oacute;n del destino celular no se entiende bien. Informes recientes identifican roles cr&iacute;ticos para microRNAs (miRNAs), reguladores de la expresi&oacute;n g&eacute;nica mediante la inhibici&oacute;n de la traducci&oacute;n o estimulando la degradaci&oacute;n de los mRNAs de destino.

Perfiles funcionales revela el papel crucial para miRNA en la diferenciaci&oacute;n de c&eacute;lulas madre mesenquimales humanas.

&#x6C27;&#x7684;&#x53EF;&#x7528;&#x6027;&#x53D6;&#x51B3;&#x4E8E;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4EE3;&#x8C22;&#x548C;&#x6C27;&#x7A33;&#x6001;&#x7684;&#x4E3B;&#x8981;&#x76D1;&#x7BA1;&#x673A;&#x6784;&#x662F;&#x4F4E;&#x6C27;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x56E0;&#x5B50;-1 (HIF-1&#xFF09;&#xFF0C;&#x7F3A;&#x6C27;&#x7EC6;&#x80DE;&#x548C;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x6027;&#x7684;&#x6052;&#x4E45;&#x7B54;&#x590D;&#x4E2D;&#x53D1;&#x6325;&#x91CD;&#x8981;&#x4F5C;&#x7528;&#x7684;&#x9AD8;&#x4FDD;&#x5B88;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50;&#x3002;HIF-1 &#x662F; heterodimeric &#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50;&#x7EC4;&#x6210;&#x7684;&#x4F4E;&#x6C27;&#x8BF1;&#x5BFC; HIF-1alpha &#x548C;&#x4E00;&#x8868;&#x793A; HIF-1beta&#x3002;&#x5728;&#x7F3A;&#x6C27;&#x6761;&#x4EF6;&#x4E0B;&#xFF0C;&#x4E24;&#x4E2A;&#x4E9A;&#x57FA; dimerize&#x3001; &#x5141;&#x8BB8;&#x5411;&#x5B83;&#x5728;&#x6B64;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x5230;&#x4F4E;&#x6C27;&#x53CD;&#x5E94;&#x5143;&#x4EF6; &#xFF08;HREs&#xFF09; &#x548C;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x7275;&#x8FDE;&#x5728;&#x8840;&#x7BA1;&#x751F;&#x6210;&#x4E2D;&#x7684;&#x76EE;&#x6807;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x6838; HIF-1 &#x590D;&#x6742;&#x6613;&#x4F4D;&#xFF0C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x751F;&#x957F;&#x548C;&#x751F;&#x5B58;&#x3002;HIF-1 &#x901A;&#x8DEF;&#x662F;&#x57FA;&#x672C;&#x6B63;&#x5E38;&#x7684;&#x589E;&#x957F;&#x548C;&#x53D1;&#x5C55;&#xFF0C;&#x5E76;&#x53C2;&#x4E0E;&#x764C;&#x75C7;&#x3001; &#x708E;&#x75C7;&#x3001; &#x548C;&#x7F3A;&#x8840;&#x7684;&#x75C5;&#x7406;&#x751F;&#x7406;&#x5B66;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x6709;&#x76F8;&#x5F53;&#x5927;&#x7684;&#x5174;&#x8DA3;&#xFF0C;&#x5728;&#x786E;&#x5B9A;&#x8C03;&#x5236; HIF-1 &#x4FE1;&#x53F7;&#x8F6C;&#x5BFC;&#x901A;&#x8DEF;&#x7684;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x3002;&#x4E3A;&#x4E86;&#x8BC4;&#x4F30;&#x523A;&#x6FC0; HIF-1 &#x4FE1;&#x53F7;&#x8F6C;&#x5BFC;&#x901A;&#x8DEF;&#x73AF;&#x5883;&#x5316;&#x5B66;&#x54C1;&#x7684;&#x80FD;&#x529B;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x7504;&#x522B; 1408&#x5E74;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x7684;&#x5B9A;&#x91CF;&#x9AD8;&#x901A;&#x91CF;&#x7B5B;&#x9009; &#xFF08;qHTS&#xFF09; &#x683C;&#x5F0F;&#x4F7F;&#x7528;&#x4E00;&#x79CD;&#x57FA;&#x4E8E;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x7684; &beta;-&#x5185;&#x9170;&#x80FA;&#x9176;&#x6765;&#x5230;&#x8BB0;&#x8005;&#x57FA;&#x56E0;&#x68C0;&#x6D4B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x56FD;&#x5BB6;&#x6BD2;&#x7406;&#x5B66;&#x9879;&#x76EE;&#x96C6;&#x5408;&#x3002;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x5341;&#x4E8C;&#x4E2A;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x7684;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x662F;&#x5728;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x7684;&#x8840;&#x7BA1;&#x5185;&#x76AE;&#x751F;&#x957F;&#x56E0;&#x5B50;&#xFF0C;&#x5DF2;&#x77E5;&#x7684;&#x7F3A;&#x6C27;&#x9776;&#x57FA;&#x56E0;&#xFF0C;&#x786E;&#x8BC1;&#x68C0;&#x6D4B;&#x548C;&#x786E;&#x8BA4;&#x7684;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x8FDB;&#x884C;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x4ED6;&#x4EEC;&#x6A21;&#x4EFF;&#x51CF;&#x5C11;&#x6C27;&#x73AF;&#x5883;&#x5BF9;&#x4F4E;&#x6C27;&#x8C03;&#x8282;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x6D3B;&#x6027;&#x7684;&#x5F71;&#x54CD;&#x7684;&#x80FD;&#x529B;&#x3002;&#x57FA;&#x4E8E;&#x6B64;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x7B56;&#x7565;&#xFF0C;&#x4E09;&#x79CD;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x94B4;&#x786B;&#x9178; (&#x4E03;&#x6C34;) iodochlorohydroxyquinoline o-&#x83F2;&#x7F57;&#x5549;&#xFF09; &#x88AB;&#x786E;&#x8BA4;&#x4E3A;&#x7F3A;&#x6C27; mimetics&#xFF0C;&#x800C;&#x4E24;&#x4E2A;&#x5316;&#x5408;&#x7269; (7-&#x4E8C;&#x4E59;&#x6C28;&#x57FA;-4-methylcoumarin &#x548C; 7,12-dimethylbenz(a)anthracence) &#x53D1;&#x73B0; HIF-1 &#x4E0E;&#x7F3A;&#x6C27;&#x4ECE;&#x4E0D;&#x540C;&#x7684;&#x65B9;&#x5F0F;&#x8FDB;&#x884C;&#x4EA4;&#x4E92;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7ED3;&#x679C;&#x8868;&#x660E; qHTS &#x8F85;&#x52A9;&#x68C0;&#x6D4B; HIF-1alpha &#x8BF1;&#x5BFC;&#x5242;&#x7684;&#x9274;&#x5B9A;&#x548C;&#x533A;&#x522B;&#x57FA;&#x4E8E;&#x53CA;&#x5176;&#x6A21;&#x5F0F;&#x7684;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x7F3A;&#x6C27;&#x9776;&#x57FA;&#x56E0;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x5242;&#x7ED3;&#x5408;&#x7684;&#x6709;&#x6548;&#x6027;&#x3002;HIF 1alpha &#x6FC0;&#x6D3B;&#x6D3B;&#x52A8;&#x5728;&#x57FA;&#x4E8E;&#x7EC6;&#x80DE;&#x68C0;&#x5B9A;&#x73AF;&#x5883;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x7684;&#x9274;&#x5B9A;&#x53EF;&#x80FD;&#x662F;&#x6709;&#x7528;&#x7684;&#x8F7B;&#x91CD;&#x7F13;&#x6025;&#x8FDB;&#x884C;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x7684;&#x6D4B;&#x8BD5;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x7F3A;&#x6C27;&#x53CD;&#x5E94;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x5242;&#x5728;&#x4F53;&#x5185;&#x7684;&#x5316;&#x5B66;&#x7269;&#x8D28;&#x3002;

&#x8BF1;&#x5BFC; HIF 1alpha &#x6D3B;&#x6027;&#x7684;&#x5316;&#x5B66;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x7684;&#x6807;&#x8BC6;&#x3002;

Cellular metabolism depends on the availability of oxygen and the major regulator of oxygen homeostasis is hypoxia-inducible factor 1 (HIF-1), a highly conserved transcription factor that plays an essential role in cellular and systemic homeostatic responses to hypoxia. HIF-1 is a heterodimeric transcription factor composed of hypoxia-inducible HIF-1alpha and constitutively expressed HIF-1beta. Under hypoxic conditions, the two subunits dimerize, allowing translocation of the HIF-1 complex to the nucleus where it binds to hypoxia-response elements (HREs) and activates expression of target genes implicated in angiogenesis, cell growth, and survival. The HIF-1 pathway is essential to normal growth and development, and is involved in the pathophysiology of cancer, inflammation, and ischemia. Thus, there is considerable interest in identifying compounds that modulate the HIF-1 signaling pathway. To assess the ability of environmental chemicals to stimulate the HIF-1 signaling pathway, we screened a National Toxicology Program collection of 1408 compounds using a cell-based beta-lactamase HRE reporter gene assay in a quantitative high-throughput screening (qHTS) format. Twelve active compounds were identified. These compounds were tested in a confirmatory assay for induction of vascular endothelial growth factor, a known hypoxia target gene, and confirmed compounds were further tested for their ability to mimic the effect of a reduced-oxygen environment on hypoxia-regulated promoter activity. Based on this testing strategy, three compounds (o-phenanthroline, iodochlorohydroxyquinoline, cobalt sulfate heptahydrate) were confirmed as hypoxia mimetics, whereas two compounds (7-diethylamino-4-methylcoumarin and 7,12-dimethylbenz(a)anthracence) were found to interact with HIF-1 in a manner different from hypoxia. These results demonstrate the effectiveness of qHTS in combination with secondary assays for identification of HIF-1alpha inducers and for distinguishing among inducers based on their pattern of activated hypoxic target genes. Identification of environmental compounds having HIF-1alpha activation activity in cell-based assays may be useful for prioritizing chemicals for further testing as hypoxia-response inducers in vivo.

Identification of chemical compounds that induce HIF-1alpha activity.

M&eacute;tabolisme cellulaire d&eacute;pend de la disponibilit&eacute; de l&#39;oxyg&egrave;ne et le principal r&eacute;gulateur de l&#39;hom&eacute;ostasie de l&#39;oxyg&egrave;ne est hypoxia-inducible factor 1 (HIF-1), un facteur de transcription hautement conserv&eacute;e qui joue un r&ocirc;le essentiel dans les r&eacute;ponses hom&eacute;ostasiques cellulaires et syst&eacute;miques &agrave; l&#39;hypoxie. HIF-1 est un facteur de transcription h&eacute;t&eacute;rodim&eacute;rique compos&eacute; de hypoxia-inducible HIF-1alpha et exprim&eacute; constitutivement HIF-1beta. Dans des conditions hypoxiques, deux sous-unit&eacute;s dim&eacute;riser, permettant la translocation du complexe HIF-1 vers le noyau o&ugrave; il se lie &agrave; des &eacute;l&eacute;ments de r&eacute;ponse au hypoxie (HREs) et active l&#39;expression de g&egrave;nes cibles impliqu&eacute;s dans l&#39;angiogen&egrave;se, cellulaire, croissance et survie. La voie de l&#39;HIF-1 est essentielle au d&eacute;veloppement et &agrave; la croissance normale et est impliqu&eacute;e dans la physiopathologie du cancer, l&#39;inflammation et l&#39;isch&eacute;mie. Il y a donc un int&eacute;r&ecirc;t consid&eacute;rable dans l&#39;identification de compos&eacute;s qui modulent la voie de signalisation de HIF-1. Pour &eacute;valuer la capacit&eacute; des produits chimiques environnementaux afin de stimuler la voie de signalisation de HIF-1, nous avons projet&eacute; une collection du National Toxicology Program de 1408 compos&eacute;s utilisant un test de g&eacute;nique sur les cellules b&ecirc;ta-lactamase EDH journaliste dans un format de projection (qHTS) haut d&eacute;bit quantitatif. Douze compos&eacute;s actifs ont &eacute;t&eacute; identifi&eacute;s. Ces compos&eacute;s ont &eacute;t&eacute; test&eacute;s dans un test de confirmation pour l&#39;induction de facteur de croissance endoth&eacute;lial vasculaire, un g&egrave;ne cible connue de l&#39;hypoxie, et compos&eacute;s confirm&eacute;s ont &eacute;t&eacute; test&eacute;s davantage pour leur capacit&eacute; &agrave; imiter l&#39;effet d&#39;un environnement r&eacute;duit l&#39;oxyg&egrave;ne sur l&#39;activit&eacute; de promoteur r&eacute;glement&eacute;es par hypoxie. Bas&eacute; sur cette strat&eacute;gie de test, trois compos&eacute;s (o-ph&eacute;nanthroline, iodochlorohydroxyquinoline, heptahydrate de sulfate de cobalt) ont &eacute;t&eacute; confirm&eacute;s comme mim&eacute;tiques de l&#39;hypoxie, tandis que les deux compos&eacute;s (7-di&eacute;thylamino-4-m&eacute;thylcoumarine et 7,12-dimethylbenz(a)anthracence) ont &eacute;t&eacute; trouv&eacute;s pour interagir avec l&#39;HIF-1 d&#39;une mani&egrave;re diff&eacute;rente de l&#39;hypoxie. Ces r&eacute;sultats d&eacute;montrent l&#39;efficacit&eacute; de le qHTS en combinaison avec des analyses secondaires pour l&#39;identification des inducteurs de l&#39;HIF-1alpha et pour distinguer entre elles les inducteurs, compte tenus de leur structure de g&egrave;nes cibles hypoxique activ&eacute;s. Identification des compos&eacute;s environnementaux ayant l&#39;activit&eacute; d&#39;activation HIF-1alpha dans des analyses cellulaires peut &ecirc;tre utile pour hi&eacute;rarchiser les produits chimiques &agrave; d&#39;autres essais comme inducteurs d&#39;hypoxie-r&eacute;ponse in vivo.

Identification de compos&eacute;s chimiques qui induisent l&#39;HIF-1alpha activit&eacute;.

Zellul&auml;ren Stoffwechsel h&auml;ngt von der Verf&uuml;gbarkeit von Sauerstoff und die wichtigen Regulator des Sauerstoff-Hom&ouml;ostase ist Hypoxie-durch Induktion Faktor 1 (HIF-1), ein stark konservierten Transkriptionsfaktor, der eine wesentliche in zellul&auml;ren und systemischen hom&ouml;ostatische Reaktionen auf Hypoxie Rolle. HIF-1 ist ein Transkriptionsfaktor Complex bestehend aus Hypoxie-durch Induktion HIF-1alpha und konstitutiv HIF-1beta ausgedr&uuml;ckt. Unter Hypoxie Bedingungen, die zwei Untereinheiten Mitgliedern bilden, erm&ouml;glicht Translokation des HIF-1-Komplexes in den Zellkern, wo es zur Hypoxie-Response-Elemente (HREs) bindet und aktiviert Ausdruck Zielgene Angiogenesis in Verbindung gebracht, Zelle Wachstum und &uuml;berleben. Die HIF-1-Pathway ist wesentlich f&uuml;r normales Wachstum und Entwicklung und engagiert sich in der Pathophysiologie von Krebs, Entz&uuml;ndungen und Isch&auml;mie. So gibt es gro&szlig;es Interesse bei der Identifizierung von Verbindungen, die die HIF-1-Signalweg zu modulieren. Um die F&auml;higkeit von Umweltchemikalien, stimulieren die HIF-1-Signalweg zu beurteilen, sehen wir eine National Toxicology Program-Sammlung von 1408 Verbindungen unter Verwendung eine zellbasierte Beta-Lactamase HRE Reporter-gen-Probe in einem quantitativen Hochdurchsatz-screening (qHTS) Format. Zw&ouml;lf aktive Verbindungen wurden identifiziert. Diese Verbindungen wurden in eine best&auml;tigende Test zur Induktion von vascular endothelial Growth Factor, ein bekannter Hypoxie-Ziel-gen getestet und best&auml;tigte Verbindungen weiter getestet f&uuml;r ihre F&auml;higkeit, die Wirkung einer reduziert-Sauerstoff-Umgebung mit Hypoxie-regulierten Promotor-Aktivit&auml;t zu imitieren. Auf der Grundlage dieser Teststrategie, drei Verbindungen (o-Phenanthrolin, Iodochlorohydroxyquinoline, Kobalt Sulfat Heptahydrat) best&auml;tigt Hypoxie Mimetics, w&auml;hrend zwei Verbindungen (7-Diethylamino-4-Methylcumarin und 7,12-dimethylbenz(a)anthracence) gefunden wurden, mit HIF-1 auf eine Hypoxie andere Weise interagieren. Diese Ergebnisse belegen die Wirksamkeit der qHTS in Kombination mit sekund&auml;ren Assays f&uuml;r die Identifizierung des HIF-1alpha Induktoren und f&uuml;r die Unterscheidung zwischen Induktoren, die Grundlage ihrer Muster aktivierte Hypoxie Zielgene. Ermittlung der &ouml;kologischen Verbindungen mit HIF-1alpha Aktivierung Aktivit&auml;t in zellbasierte Assays n&uuml;tzlich f&uuml;r die Priorisierung von Chemikalien f&uuml;r die weitere Tests als Hypoxie / Antwort-Induktoren in-vivo.

Identifizierung von chemischen Verbindungen, die HIF-1alpha-Aktivit&auml;t ausl&ouml;sen.

Metabolismo cellulare dipende dalla disponibilit&agrave; di ossigeno e il regolatore principale dell&#39;omeostasi dell&#39;ossigeno &egrave; hypoxia-inducible factor 1 (HIF-1), un fattore di trascrizione altamente conservato che gioca un ruolo essenziale nel cellulare e sistemiche risposte omeostatiche all&#39;ipossia. HIF-1 &egrave; un fattore di trascrizione eterotrimerico composto hypoxia-inducible HIF-1alpha e costitutivamente espresso HIF-1beta. Nelle circostanze hypoxic, le due subunit&agrave; dimerize, permettendo la traslocazione del complesso nel nucleo dove si lega a ipossia-response elements (HREs) e attiva l&#39;espressione di geni bersaglio coinvolti nell&#39;angiogenesi HIF-1, cellulare crescita e sopravvivenza. Il pathway di HIF-1 &egrave; essenziale per lo sviluppo e la crescita normale ed &egrave; coinvolto nella fisiopatologia del cancro, infiammazione e ischemia. Cos&igrave;, c&#39;&egrave; notevole interesse nell&#39;identificare composti che modulano la via di segnalazione di HIF-1. Per valutare la capacit&agrave; di stimolare la via di segnalazione di HIF-1 prodotti chimici ambientali, abbiamo proiettato una collezione del National Toxicology Program di 1408 composti utilizzando un dosaggio di beta-lattamasi cell-based HRE reporter gene in quantitativi high-throughput screening (qHTS) formato. Sono stati identificati dodici composti attivi. Questi composti sono stati testati in un&#39;analisi di conferma per l&#39;induzione del fattore di crescita endoteliale vascolare, un gene bersaglio noti ipossia, e confermati composti pi&ugrave; ulteriormente sono stati testati per la loro capacit&agrave; di imitare l&#39;effetto di un ambiente di ossigeno ridotto sull&#39;attivit&agrave; del promotore ipossia-regolato. Su questa strategia di test, tre composti (o-fenantrolina, iodochlorohydroxyquinoline, cobalto solfato eptaidrato) sono stati confermati come ipossia mimetico, considerando che i due composti (7-dietilammino-4-methylcoumarin e 7,12-dimethylbenz(a)anthracence) sono stati trovati ad per interagire con HIF-1 in un modo differente da ipossia. Questi risultati dimostrano l&#39;efficacia di qHTS in combinazione con dosaggi secondarie per l&#39;identificazione di induttori di HIF-1alpha e per distinguere tra induttori basati sulla loro pattern di geni bersaglio ipossica attivato. Identificazione dei composti ambientale avente HIF-1alpha attivazione attivit&agrave; nelle analisi cell-based pu&ograve; essere utile per priorit&agrave; di sostanze chimiche per ulteriori test come induttori di ipossia-risposta in vivo.

Identificazione di composti chimici che inducono attivit&agrave; di HIF-1alpha.

&#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x3092;&#x9178;&#x7D20;&#x306E;&#x7A7A;&#x5BA4;&#x3057;&#x3001;&#x9178;&#x7D20;&#x306E;&#x6052;&#x5E38;&#x6027;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x30EC;&#x30AE;&#x30E5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x4F4E;&#x9178;&#x7D20;&#x8A98;&#x5C0E;&#x56E0;&#x5B50; 1 (HIF 1&#xFF09;&#x3001;&#x4F4E;&#x9178;&#x7D20;&#x7D30;&#x80DE;&#x3068;&#x5168;&#x8EAB;&#x6027;&#x6052;&#x5E38;&#x6027;&#x53CD;&#x5FDC;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x679C;&#x305F;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x7BC0;&#x7D04;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x8981;&#x56E0;&#x3067;&#x3059;&#x3002;HIF 1 &#x30D8;&#x30C6;&#x30ED;&#x30C0;&#x30A4;&#x30DE;&#x30FC;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50;&#x306E;&#x4F4E;&#x9178;&#x7D20;&#x8A98;&#x5C0E; hif-1 &#x3067;&#x69CB;&#x6210;&#x304A;&#x3088;&#x3073; HIF-1 &beta; &#x767A;&#x73FE;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x4F4E;&#x9178;&#x7D20;&#x6761;&#x4EF6;&#x4E0B;&#x3067;&#x3001;2 &#x3064;&#x306E;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x884C;&#x3063;&#x305F;&#x3001;HIF 1 &#x8907;&#x96D1;&#x305D;&#x308C;&#x4F4E;&#x9178;&#x7D20;&#x5FDC;&#x7B54;&#x8981;&#x7D20; (HREs) &#x3092;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x3057;&#x3001;&#x8840;&#x7BA1;&#x65B0;&#x751F;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x6A19;&#x7684;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x6838;&#x3078;&#x306E;&#x8EE2;&#x6D41;&#x3092;&#x8A31;&#x53EF;&#x3059;&#x308B;&#x3001;&#x30BB;&#x30EB;&#x6210;&#x9577;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x5B58;&#x7D9A;&#x3002;HIF 1 &#x7D4C;&#x8DEF;&#x306F;&#x6B63;&#x5E38;&#x306A;&#x6210;&#x9577;&#x3068;&#x767A;&#x5C55;&#x306B;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x3001;&#x764C;&#x3001;&#x708E;&#x75C7;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x865A;&#x8840;&#x306E;&#x75C5;&#x614B;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;HIF 1 &#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3059;&#x308B;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x304B;&#x306A;&#x308A;&#x306E;&#x95A2;&#x5FC3;&#x3067;&#x3059;&#x3002;HIF 1 &#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3092;&#x523A;&#x6FC0;&#x3059;&#x308B;&#x74B0;&#x5883;&#x5316;&#x5B66;&#x7269;&#x8CEA;&#x306E;&#x80FD;&#x529B;&#x3092;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x56FD;&#x5BB6;&#x6BD2;&#x6027;&#x30D7;&#x30ED;&#x30B0;&#x30E9;&#x30E0; &#x30B3;&#x30EC;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3092;&#x5B9A;&#x91CF;&#x7684;&#x9AD8;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8; &#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30FC;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0; (qHTS) &#x5F62;&#x5F0F;&#x3067;&#x30BB;&#x30EB; &#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E; &beta;-&#x30E9;&#x30AF;&#x30BF;&#x30DE;&#x30FC;&#x30BC; HRE &#x30EC;&#x30DD;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30A2;&#x30C3;&#x30BB;&#x30A4;&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x305F; 1408&#x5E74;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x306E;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30FC;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x3002;&#x5341;&#x4E8C;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x304C;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x306F;&#x3001;&#x8840;&#x7BA1;&#x5185;&#x76AE;&#x5897;&#x6B96;&#x56E0;&#x5B50;&#x3001;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x4F4E;&#x9178;&#x7D20;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x8A98;&#x5C0E;&#x306E;&#x78BA;&#x8A3C;&#x306E;&#x30A2;&#x30C3;&#x30BB;&#x30A4;&#x3067;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x306F;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x80FD;&#x529B;&#x306E;&#x4F4E;&#x9178;&#x7D20;&#x898F;&#x5236;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x6D3B;&#x6027;&#x306E;&#x6E1B;&#x5C11;&#x9178;&#x7D20;&#x74B0;&#x5883;&#x306E;&#x52B9;&#x679C;&#x3092;&#x6A21;&#x5023;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;2 &#x3064;&#x306E;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x306B;&#x5BFE;&#x3057;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x306E;&#x6226;&#x7565;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x304D;&#x306E; 3 &#x3064;&#x306E;&#x5316;&#x5408;&#x7269; (o-&#x30D5;&#x30A7;&#x30CA;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30EA;&#x30F3;, iodochlorohydroxyquinoline, &#x30B3;&#x30D0;&#x30EB;&#x30C8;&#x786B;&#x9178;&#x4E03;&#x6C34;&#x548C;&#x7269;&#xFF09; &#x304C;&#x4F4E;&#x9178;&#x7D20;&#x30DF;&#x30E1;&#x30C6;&#x30A3;&#x30AF;&#x30B9;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x306B;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3055;&#x308C;&#x305F; &#xFF08;7 &#x30B8;&#x30A8;&#x30C1;&#x30EB;&#x30A2;&#x30DF;&#x30CE; 4 methylcoumarin &#x3068; 7,12-dimethylbenz(a)anthracence) &#x3044;&#x305F;&#x767A;&#x898B; HIF-1 &#x3068;&#x4F4E;&#x9178;&#x7D20;&#x304B;&#x3089;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3067;&#x5BFE;&#x8A71;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F; qHTS &#x306E;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x3067;&#x30BB;&#x30AB;&#x30F3;&#x30C0;&#x30EA; &#x30A2;&#x30C3;&#x30BB;&#x30A4;&#x3001;hif-1 &#x8A98;&#x5C0E;&#x7269;&#x8CEA;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x3068;&#x305D;&#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x9178;&#x7D20;&#x6A19;&#x7684;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C7;&#x30E5;&#x30FC;&#x30B5;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x533A;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6709;&#x52B9;&#x6027;&#x3092;&#x793A;&#x3059;.&#x7D30;&#x80DE;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x304F;&#x8A66;&#x91D1;&#x3067;&#x3001;hif-1 &#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x80FD;&#x3092;&#x6709;&#x3059;&#x308B;&#x74B0;&#x5883;&#x306E;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x306F;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x751F;&#x4F53;&#x5185;&#x306E;&#x4F4E;&#x9178;&#x7D20;&#x5FDC;&#x7B54;&#x8A98;&#x5C0E;&#x7269;&#x8CEA;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x306E;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x5316;&#x5B66;&#x7269;&#x8CEA;&#x3092;&#x512A;&#x5148;&#x9806;&#x4F4D;&#x4ED8;&#x3051;&#x306B;&#x5F79;&#x306B;&#x7ACB;&#x3064;&#x304B;&#x3082;&#x3057;&#x308C;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;

Hif-1 &#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x3092;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3059;&#x308B;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;

&#xC138;&#xD3EC; &#xC2E0;&#xC9C4; &#xB300;&#xC0AC; &#xC0B0;&#xC18C;&#xC758; &#xAC00;&#xC6A9;&#xC131;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C; &#xB2EC;&#xB77C; &#xC9D1;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xBC0F; &#xC0B0;&#xC18C; &#xD56D;&#xC0C1;&#xC131;&#xC758; &#xC8FC;&#xC694; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xD130;&#xB294; hypoxia&#xC744; &#xC720;&#xB3C4;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xC694;&#xC778; 1 (HIF 1) &#xACE0;&#xB3C4;&#xB85C; &#xBCF4;&#xC874;&#xB41C; &#xC804;&#xC0AC; &#xC694;&#xC18C;&#xB294; &#xC138;&#xD3EC;&#xC640; &#xC870;&#xC9C1;&#xC758; &#xD56D;&#xC0C1;&#xC131; &#xC751;&#xB2F5; hypoxia&#xC5D0;&#xC11C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD544;&#xC218;&#xC801;&#xC778; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xD55C;&#xB2E4;. HIF 1 heterodimeric &#xC804;&#xC0AC; &#xC778;&#xC790; hypoxia&#xC744; &#xC720;&#xB3C4;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; HIF 1alpha&#xC758; &#xAD6C;&#xC131; &#xC774;&#xBA70; constitutively HIF 1beta&#xC744; &#xD45C;&#xD604;. Hypoxic &#xC870;&#xAC74; &#xD558;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB450; &#xAC1C;&#xC758; &#xC18C; &#xB2E8;&#xC704; dimerize, &#xD575; hypoxia-&#xC751;&#xB2F5; &#xC694;&#xC18C; (HREs)&#xC5D0; &#xACB0;&#xC18D; &#xD558; &#xACE0; &#xC2E0;&#xC0DD;&#xC5D0; &#xC5F0;&#xB8E8; &#xB300;&#xC0C1; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xD45C;&#xD604;&#xC744; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xD558;&#xB294; &#xC5B4;&#xB514;&#xC5D0; HIF 1 &#xB2E8;&#xC9C0;&#xC758; &#xC804; &#xC218;, &#xC138;&#xD3EC; &#xC131;&#xC7A5;&#xACFC; &#xC0DD;&#xC874;. HIF 1 &#xD1B5;&#xB85C; &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; &#xC131;&#xC7A5;&#xACFC; &#xAC1C;&#xBC1C;&#xC5D0; &#xD544;&#xC218;&#xC801; &#xC774;&#xBA70;, &#xC554;, &#xC5FC;&#xC99D;, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xAD6D; &#xC18C; &#xBE48; &#xD608;&#xC758; &#xC774;&#xC0C1;&#xC5D0; &#xAD00;&#xC5EC;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, HIF 1 &#xC2E0;&#xD638; &#xD1B5;&#xB85C; &#xBCC0;&#xC870; &#xD558;&#xB294; &#xD654;&#xD569;&#xBB3C;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0C1;&#xB2F9;&#xD55C; &#xAD00;&#xC2EC;&#xC774;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. HIF 1 &#xC2E0;&#xD638; &#xD1B5;&#xB85C; &#xC790;&#xADF9; &#xD558;&#xB294; &#xD658;&#xACBD; &#xD654;&#xD559; &#xBB3C;&#xC9C8;&#xC758; &#xB2A5;&#xB825;&#xC744; &#xD3C9;&#xAC00; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xC6B0;&#xB9AC; &#xAD6D;&#xAC00; &#xB3C5;&#xBB3C;&#xD559; &#xD504;&#xB85C;&#xADF8;&#xB7A8; &#xCEEC;&#xB809;&#xC158; 1408 &#xD654;&#xD569;&#xBB3C; &#xB77D; &#xD0C0; &#xB9C8; &#xC140; &#xAE30;&#xBC18; &#xBCA0;&#xD0C0;-&#xC81C; HRE &#xCDE8;&#xC7AC; &#xC6D0; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBD84;&#xC11D; &#xACB0;&#xACFC; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC591;&#xC801; &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9; (qHTS) &#xC0C1;&#xC601; &#xD615;&#xC2DD;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0C1;&#xC601;. 12 &#xAC1C;&#xC758; &#xD65C;&#xC131; &#xD654;&#xD569;&#xBB3C; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xD608;&#xAD00; &#xB0B4; &#xD53C; &#xC131;&#xC7A5; &#xC778;&#xC790;, &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; hypoxia &#xB300;&#xC0C1; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC720;&#xB3C4; &#xB300; &#xD55C; &#xD655;&#xC2E4; &#xD55C; &#xBD84;&#xC11D; &#xACB0;&#xACFC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xD654;&#xD569;&#xBB3C; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xD558; &#xACE0; &#xD655;&#xC778; &#xB41C; &#xD654;&#xD569;&#xBB3C; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; hypoxia &#xADDC;&#xC81C; &#xD65C;&#xB3D9;&#xC5D0; &#xAC10;&#xC18C; &#xC0B0;&#xC18C; &#xD658;&#xACBD; &#xD6A8;&#xACFC; &#xBAA8;&#xBC29; &#xD558;&#xB294; &#xB2A5;&#xB825;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB97C; &#xCD94;&#xAC00; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8; &#xC804;&#xB7B5;&#xC744; &#xBC14;&#xD0D5;&#xC73C;&#xB85C;, &#xC138; &#xAC00;&#xC9C0; &#xD654;&#xD569;&#xBB3C; (o-phenanthroline, iodochlorohydroxyquinoline, &#xCF54;&#xBC1C;&#xD2B8; &#xD669;&#xC0B0; heptahydrate) &#xD655;&#xC778; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4; hypoxia mimetics&#xB85C; &#xBC18;&#xBA74; &#xB450; &#xD654;&#xD569;&#xBB3C; (7-diethylamino-4-methylcoumarin &#xBC0F; 7,12-dimethylbenz(a)anthracence) HIF 1&#xC640; hypoxia&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2E4;&#xB978; &#xBC29;&#xC2DD;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774; &#xACB0;&#xACFC; HIF 1alpha inducers&#xC758; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xBC0F; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; hypoxic &#xB300;&#xC0C1; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xD328;&#xD134;&#xC744; &#xAE30;&#xBC18;&#xC73C;&#xB85C; &#xD558;&#xB294; inducers &#xC0AC;&#xC774;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAD6C;&#xBCC4;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; 2 &#xCC28; &#xBD84;&#xC11D; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xACFC; &#xD568;&#xAED8;&#xC5D0;&#xC11C; Qhts&#xC758; &#xD6A8;&#xACFC; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC138;&#xD3EC; &#xAE30;&#xBC18; &#xBD84;&#xC11D; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC5D0;&#xC11C; HIF 1alpha &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xD65C;&#xB3D9; &#xB370; &#xD658;&#xACBD; &#xD654;&#xD569;&#xBB3C; hypoxia-&#xC751;&#xB2F5; inducers &#xC0DD;&#xCCB4; &#xC870;&#xAC74;&#xC73C;&#xB85C; &#xCD94;&#xAC00; &#xD14C;&#xC2A4;&#xD2B8;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD654;&#xD559; &#xBB3C;&#xC9C8;&#xC744; &#xC6B0;&#xC120; &#xC21C;&#xC704;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC720;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

HIF 1alpha &#xD65C;&#xB3D9;&#xC744; &#xC720;&#xBC1C; &#xD558;&#xB294; &#xD654;&#xD569;&#xBB3C;&#xC758; &#xC2DD;&#xBCC4;.

Metabolismo celular depende de la disponibilidad de ox&iacute;geno y el principal regulador de la homeostasis de ox&iacute;geno es inducible por la hipoxia factor 1 (HIF-1), un factor de transcripci&oacute;n altamente conservado que juega un papel esencial en las respuestas homeost&aacute;ticas celulares y sist&eacute;micas a la hipoxia. HIF-1 es un factor de transcripci&oacute;n heterodim&eacute;ricos compuesta por inducible por la hipoxia HIF-1alfa y constitutivamente HIF-1beta. Bajo condiciones hip&oacute;xicas, las dos subunidades dimerizan, permitiendo el desplazamiento del complejo HIF-1 al n&uacute;cleo donde se une a elementos de respuesta a la hipoxia (HREs) y activa la expresi&oacute;n de genes diana implicados en la angiog&eacute;nesis, la c&eacute;lula crecimiento y supervivencia. La v&iacute;a de HIF-1 es esencial para el crecimiento y desarrollo normales y participa en la fisiopatolog&iacute;a de la isquemia, inflamaci&oacute;n y c&aacute;ncer. As&iacute;, hay un gran inter&eacute;s en la identificaci&oacute;n de compuestos que modulan la v&iacute;a de se&ntilde;alizaci&oacute;n de HIF-1. Para evaluar la capacidad de estimular la v&iacute;a de se&ntilde;alizaci&oacute;n de HIF-1 de qu&iacute;micos ambientales, defendimos una colecci&oacute;n del programa nacional de Toxicolog&iacute;a de compuestos de 1408 mediante un ensayo de gene basadas en c&eacute;lulas beta-lactamasa HRE reportero en un formato de proyecci&oacute;n (qHTS) de alto rendimiento cuantitativo. Se identificaron doce compuestos activos. Estos compuestos fueron probados en un ensayo de confirmaci&oacute;n para la inducci&oacute;n del factor de crecimiento endotelial vascular, un gen de destino conocido hipoxia, y confirmados compuestos fueron probados m&aacute;s por su habilidad para imitar el efecto de un entorno de ox&iacute;geno reducido sobre la actividad del promotor regulados por hipoxia. Partiendo de esta estrategia de pruebas, tres compuestos (o-fenantrolina, iodochlorohydroxyquinoline, sulfato de cobalto heptahidratado) fueron confirmados como an&aacute;logos de la hipoxia, mientras que dos compuestos (7-dietilamino-4-methylcoumarin y 7,12-dimethylbenz(a)anthracence) fueron encontrados para interactuar con HIF-1 de una manera diferente de hipoxia. Estos resultados demuestran la eficacia de la qHTS en combinaci&oacute;n con ensayos de secundarios para la identificaci&oacute;n de los inductores de HIF-1alfa y para distinguir entre inductores basados en su patr&oacute;n de genes diana hip&oacute;xico activado. Identificaci&oacute;n de compuestos ambientales con HIF-1alfa activaci&oacute;n actividad en ensayos celulares puede ser &uacute;til para dar prioridad a productos qu&iacute;micos para pruebas adicionales como inductores de la respuesta a la hipoxia en vivo.

Identificaci&oacute;n de compuestos qu&iacute;micos que inducen la actividad de HIF-1alfa.

Microrna &#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x76D1;&#x7BA1;&#x673A;&#x6784;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x548C;&#x5E38;&#x7528;&#x94FE;&#x63A5;&#x5230;&#x53D1;&#x5C55;&#x3001; &#x5206;&#x5316;&#x548C;&#x764C;&#x75C7;&#x7B49;&#x75BE;&#x75C5;&#x3002;&#x4E3A;&#x4E86;&#x66F4;&#x597D;&#x5730;&#x4E86;&#x89E3;&#x5176;&#x5404;&#x79CD;&#x751F;&#x7269;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x7684;&#x89D2;&#x8272;&#xFF0C;&#x6709;&#x9488;&#x5BF9;&#x6027;&#x7684; Microrna &#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x9274;&#x5B9A;&#x6709;&#x5FC5;&#x8981;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x9884;&#x6D4B;&#x5DE5;&#x5177;&#x5DF2;&#x7ECF;&#x5927;&#x5927;&#x5E2E;&#x52A9;&#x5B8C;&#x6210;&#x8FD9;&#x9879;&#x4EFB;&#x52A1;&#xFF0C;&#x6700;&#x7EC8;&#x9700;&#x8981;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x76EE;&#x6807;&#x641C;&#x7D22;&#x548C;&#x9A8C;&#x8BC1;&#x7684;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x96C7;&#x4E86;&#x4E24;&#x4E2A;&#x72EC;&#x7ACB;&#x4F46;&#x76F8;&#x4E92;&#x8865;&#x5145;&#x7684;&#x9AD8;&#x541E;&#x5410;&#x91CF;&#x529E;&#x6CD5;&#x8981;&#x6620;&#x5C04; mRNAs &#x53D7;&#x7275;&#x8FDE;&#x8C03;&#x63A7;&#x7684;&#x8102;&#x80AA;&#x9178;&#x548C;&#x80C6;&#x56FA;&#x9187;&#x7684;&#x4EE3;&#x8C22;&#x3001; C &#x578B;&#x809D;&#x708E;&#x611F;&#x67D3;&#x4E0E;&#x809D;&#x7EC6;&#x80DE;&#x764C;&#x809D;&#x7279;&#x5F02;&#x6027; microRNA miR-122&#xFF0C;&#x4E00;&#x5927;&#x5957;&#x3002;&#x8367;&#x5149;&#x7D20;&#x9176;&#x57FA;&#x4E8E;&#x8BB0;&#x8005;&#x7684;&#x7B5B;&#x9009;&#x548C;&#x730E;&#x67AA;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7684;&#x7ED3;&#x5408;&#x5BFC;&#x81F4; 260 &#x86CB;&#x767D;&#x663E;&#x8457;&#x4E0B;&#x8C03;&#x54CD;&#x5E94; miR-122 &#x4E2D;&#x7684;&#x81F3;&#x5C11;&#x4E00;&#x79CD;&#x65B9;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x5176;&#x4E2D; 113 &#x5305;&#x542B;&#x9884;&#x6D4B;&#x7684; miR-122 &#x76EE;&#x6807;&#x7AD9;&#x70B9;&#x7684;&#x6807;&#x8BC6;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4E0E;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5468;&#x671F;&#x3001; &#x5206;&#x5316;&#x3001; &#x589E;&#x6B96;&#x548C;&#x51CB;&#x4EA1;&#x76F8;&#x5173;&#x7684;&#x529F;&#x80FD;&#x7684;&#x4E30;&#x5BCC;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B; miR-122-&#x654F;&#x611F;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x4E4B;&#x95F4;&#x6211;&#x4EEC;&#x627E;&#x51FA;&#x4E00;&#x5927;&#x7FA4;&#x8054;&#x7CFB;&#x7D27;&#x5BC6;&#x7684;&#x809D;&#x4EE3;&#x8C22;&#x3001; &#x75BE;&#x75C5;&#x548C;&#x809D;&#x7EC6;&#x80DE;&#x764C;&#x3002;&#x5176;&#x4ED6;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x5BA1;&#x67E5;&#x7684;&#x5177;&#x6709;&#x7EA6;&#x675F;&#x529B;&#x7684;&#x56FE;&#x6848;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x548C;&#x5E73;&#x53F7;&#x7A7A;&#x95F4;&#x7AD9; 122 &#x548C;&#x76EE;&#x6807;&#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x5171;&#x8BC6;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x6D1E;&#x5BDF; miR-122 &#x529F;&#x80FD;&#x3002;

&#x4E24;&#x5C42;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x7528;&#x4EE5;&#x786E;&#x5B9A;&#x764C;&#x75C7;&#x548C;&#x809D;&#x810F;&#x75BE;&#x75C5;&#x76F8;&#x5173;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684; miR-122 &#x53D7;&#x89C4;&#x7BA1;&#x7684;&#x7F51;&#x7EDC;&#x3002;

MicroRNAs function as important regulators of gene expression and are commonly linked to development, differentiation, and diseases such as cancer. To better understand their roles in various biological processes, identification of genes targeted by microRNAs is necessary. Although prediction tools have significantly helped with this task, experimental approaches are ultimately required for extensive target search and validation. We employed two independent yet complementary high throughput approaches to map a large set of mRNAs regulated by miR-122, a liver-specific microRNA implicated in regulation of fatty acid and cholesterol metabolism, hepatitis C infection, and hepatocellular carcinoma. The combination of luciferase reporter-based screening and shotgun proteomics resulted in the identification of 260 proteins significantly down-regulated in response to miR-122 in at least one method, 113 of which contain predicted miR-122 target sites. These proteins are enriched for functions associated with the cell cycle, differentiation, proliferation, and apoptosis. Among these miR-122-sensitive proteins, we identified a large group with strong connections to liver metabolism, diseases, and hepatocellular carcinoma. Additional analyses, including examination of consensus binding motifs for both miR-122 and target sequences, provide further insight into miR-122 function.

Two-tiered approach identifies a network of cancer and liver disease-related genes regulated by miR-122.

Les microARN fonctionner comme d&#x26;#39;importants r&#xE9;gulateurs de l&#x26;#39;expression g&#xE9;nique et sont g&#xE9;n&#xE9;ralement li&#xE9;s au d&#xE9;veloppement, la diff&#xE9;renciation, et les maladies comme le cancer. Afin de mieux comprendre leurs r&#xF4;les dans divers processus biologiques, l&#x26;#39;identification des g&#xE8;nes cibl&#xE9;s par les microARN est n&#xE9;cessaire. Bien que les outils de pr&#xE9;diction ont consid&#xE9;rablement aid&#xE9; dans cette t&#xE2;che, des approches exp&#xE9;rimentales sont finalement n&#xE9;cessaires pour la recherche cible vaste et la validation. Nous avons utilis&#xE9; deux ind&#xE9;pendants mais compl&#xE9;mentaires des approches &#xE0; haut d&#xE9;bit pour cartographier un vaste ensemble d&#x26;#39;ARNm r&#xE9;gie par le miR-122, un microARN sp&#xE9;cifiques du foie impliqu&#xE9;e dans la r&#xE9;gulation de l&#x26;#39;acide gras et le m&#xE9;tabolisme du cholest&#xE9;rol, l&#x26;#39;h&#xE9;patite C, et le carcinome h&#xE9;patocellulaire. La combinaison de la lucif&#xE9;rase reporter sur le d&#xE9;pistage et la prot&#xE9;omique de fusil de chasse abouti &#xE0; l&#x26;#39;identification de 260 prot&#xE9;ines significativement r&#xE9;gul&#xE9;e &#xE0; la baisse en r&#xE9;ponse &#xE0; miR-122 dans au moins une m&#xE9;thode, 113 d&#x26;#39;entre eux contiennent pr&#xE9;dit le miR-122 sites cibles. Ces prot&#xE9;ines sont enrichies en fonctions associ&#xE9;es au cycle cellulaire, la diff&#xE9;renciation, la prolif&#xE9;ration et l&#x26;#39;apoptose. Parmi ces prot&#xE9;ines miR-122-sensibles, nous avons identifi&#xE9; un grand groupe et des liens solides avec le m&#xE9;tabolisme du foie, des maladies, et le carcinome h&#xE9;patocellulaire. Des analyses suppl&#xE9;mentaires, y compris l&#x26;#39;examen des motifs consensus de liaison &#xE0; la fois pour le miR-122 et des s&#xE9;quences cibles, apportent un &#xE9;clairage compl&#xE9;mentaire miR-122 fonction.

Deux niveaux d&#x26;#39;approche identifie un r&#xE9;seau de cancer du foie et des maladies li&#xE9;es g&#xE8;nes r&#xE9;gul&#xE9;s par le miR-122

MicroRNAs fungieren als wichtige Regulatoren der Genexpression und h&auml;ufig mit der Entwicklung, Differenzierung und Krankheiten wie Krebs verkn&uuml;pft sind. Um ihre Rollen in verschiedenen biologischen Prozesse besser zu verstehen, ist die Identifizierung von Genen, die gezielt durch MicroRNAs notwendig. Obwohl Vorhersage Werkzeuge wesentlich dabei geholfen hat, sind experimentelle Ans&auml;tze letztlich f&uuml;r umfangreiche deiner Suche und Validierung erforderlich. Wir besch&auml;ftigt zwei unabh&auml;ngige noch erg&auml;nzende Hochdurchsatz-Ans&auml;tze zuordnen eine gro&szlig;e Gruppe von mRNAs reguliert durch MiR-122, eine Leber-spezifische MicroRNA Regelung der Fetts&auml;uren und Cholesterin-Stoffwechsel, Hepatitis-C-Infektion und Hepatozellul&auml;res Karzinom in Verbindung gebracht. Die Kombination von Luciferase Reporter-basierten Screening und Schrotflinte Proteomics f&uuml;hrte bei der Identifizierung von 260 Proteine deutlich unten-geregelt, als Reaktion auf MiR-122 in mindestens eine Methode, die 113 die vorhergesagten MiR-122-Ziel-Sites enthalten. Diese Proteine sind f&uuml;r Funktionen im Zusammenhang mit der Zellzyklus, Differenzierung, Proliferation und Apoptose bereichert. Unter diese MiR-122-Sensitive-Proteine haben wir eine gro&szlig;e Gruppe mit starken Verbindungen zu Leber, Stoffwechsel, Krankheiten und Hepatozellul&auml;res Karzinom identifiziert. Zus&auml;tzliche Analysen, einschlie&szlig;lich der Pr&uuml;fung der Konsens verbindliche Motive f&uuml;r sowohl Ziel als auch MiR-122-Sequenzen, einen weiteren Einblick in MiR-122-Funktion.

Zweistufige Ansatz bezeichnet ein Netzwerk und Leberversagen Krankheitsbezogene Gene reguliert durch MiR-122.

MicroRNA come importanti regolatori dell&#39;espressione genica e &egrave; comunemente legati allo sviluppo, differenziazione e malattie come il cancro. Per comprendere meglio i loro ruoli in vari processi biologici, identificazione dei geni bersagliato di microRNA &egrave; necessaria. Sebbene strumenti di previsione hanno contribuito in modo significativo con questo compito, approcci sperimentali sono in ultima analisi necessari per la convalida e ricerca estesa destinazione. Abbiamo impiegato due approcci complementari ma indipendenti ad alto rendimento per mappare un grande insieme dei mRNAs regolata da miR-122, un fegato specifici microRNA implicato nella regolazione di acidi grassi e metabolismo del colesterolo, infezione da epatite C e carcinoma epatocellulare. La combinazione di luciferase reporter-based screening e shotgun proteomics portato nell&#39;identificazione di 260 proteine significativamente gi&ugrave;-regolato in risposta a miR-122 in almeno un metodo, 113 delle quali contengono siti predetto obiettivo miR-122. Queste proteine sono arricchite di funzioni connesse con il ciclo cellulare, differenziazione, proliferazione e apoptosi. Tra queste proteine miR-122-sensibili, abbiamo identificato un gruppo di grandi dimensioni con forti connessioni per carcinoma epatocellulare, malattie e metabolismo epatico. Analisi supplementari, compreso l&#39;esame del consenso vincolante motivi per sequenze miR-122 e di destinazione, forniscono ulteriore funzione miR-122.

Approccio a due livelli identifica una rete di fegato e cancro geni correlati a malattie regolata da miR-122.

microRNA&#x306F;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x56E0;&#x5B50;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3057;&#x3001;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306B;&#x958B;&#x767A;&#x3001;&#x5206;&#x5316;&#x3001;&#x764C;&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x75BE;&#x60A3;&#x306B;&#x30EA;&#x30F3;&#x30AF;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x512A;&#x308C;&#x305F;&#x69D8;&#x3005;&#x306A;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x7406;&#x89E3;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;RNA&#x306E;&#x6A19;&#x7684;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x304C;&#x5FC5;&#x8981;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x4E88;&#x6E2C;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x304C;&#x5927;&#x5E45;&#x306B;&#x3053;&#x306E;&#x4F5C;&#x696D;&#x3092;&#x624B;&#x4F1D;&#x3063;&#x3066;&#x304D;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3001;&#x5B9F;&#x9A13;&#x7684;&#x306A;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306F;&#x3001;&#x6700;&#x7D42;&#x7684;&#x306B;&#x5927;&#x898F;&#x6A21;&#x306A;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x63A2;&#x7D22;&#x3084;&#x691C;&#x8A3C;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x3068;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;miR-122&#x3001;&#x8102;&#x80AA;&#x9178;&#x3084;&#x30B3;&#x30EC;&#x30B9;&#x30C6;&#x30ED;&#x30FC;&#x30EB;&#x306E;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x3001;C&#x578B;&#x809D;&#x708E;&#x611F;&#x67D3;&#x3001;&#x809D;&#x7D30;&#x80DE;&#x764C;&#x306E;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x809D;&#x81D3;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;RNA&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x8ABF;&#x7BC0;mRNA&#x306E;&#x5927;&#x898F;&#x6A21;&#x306A;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;2&#x3064;&#x306E;&#x72EC;&#x7ACB;&#x3057;&#x305F;&#x307E;&#x3060;&#x76F8;&#x88DC;&#x7684;&#x306A;&#x30CF;&#x30A4;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x306A;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3092;&#x63A1;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30EB;&#x30B7;&#x30D5;&#x30A7;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x30EC;&#x30DD;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30FC;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x3068;&#x30B7;&#x30E7;&#x30C3;&#x30C8;&#x30AC;&#x30F3;&#x30D7;&#x30ED;&#x30C6;&#x30AA;&#x30DF;&#x30AF;&#x30B9;&#x306E;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x306F;&#x3001;miR-122&#x306E;&#x6A19;&#x7684;&#x90E8;&#x4F4D;&#x4E88;&#x6E2C;&#x542B;&#x3080;113&#x305D;&#x306E;&#x3046;&#x3061;&#x306E;&#x5C11;&#x306A;&#x304F;&#x3068;&#x3082;&#x4E00;&#x3064;&#x306E;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3067;&#x306E;miR-122&#x306B;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3057;&#x3066;&#x3001;260&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x304C;&#x5927;&#x5E45;&#x306B;&#x30C0;&#x30A6;&#x30F3;&#x30EC;&#x30AE;&#x30E5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30C8;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306F;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x5468;&#x671F;&#x3001;&#x5206;&#x5316;&#x3001;&#x5897;&#x6B96;&#x3001;&#x30A2;&#x30DD;&#x30C8;&#x30FC;&#x30B7;&#x30B9;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x6A5F;&#x80FD;&#x304C;&#x6FC3;&#x7E2E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;miR-122-&#x611F;&#x53D7;&#x6027;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x306E;&#x4E2D;&#x3067;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x809D;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x3001;&#x75BE;&#x60A3;&#x3001;&#x809D;&#x7D30;&#x80DE;&#x764C;&#x3078;&#x306E;&#x5F37;&#x3044;&#x30B3;&#x30CD;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x5927;&#x898F;&#x6A21;&#x306A;&#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x3092;&#x540C;&#x5B9A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x306E;miR-122&#x3068;&#x30BF;&#x30FC;&#x30B2;&#x30C3;&#x30C8;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30BB;&#x30F3;&#x30B5;&#x30B9;&#x7D50;&#x5408;&#x30E2;&#x30C1;&#x30FC;&#x30D5;&#x306E;&#x691C;&#x67FB;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x8FFD;&#x52A0;&#x306E;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x3001;&#x306E;miR-122&#x306E;&#x95A2;&#x6570;&#x306B;&#x3055;&#x3089;&#x306A;&#x308B;&#x6D1E;&#x5BDF;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x4E8C;&#x6BB5;&#x968E;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x306F;&#x3001;miR-122&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x898F;&#x5236;&#x304C;&#x3093;&#x3068;&#x809D;&#x75BE;&#x60A3;&#x95A2;&#x9023;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x307E;&#x3059;

MicroRNAs &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC758; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xD130;&#xB85C; &#xC11C; &#xC791;&#xB3D9; &#xD558; &#xACE0; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xBC1C;&#xC804;, &#xCC28;&#xBCC4;&#xD654;, &#xC554; &#xB4F1; &#xC9C8;&#xBCD1;&#xC5D0; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xD559;&#xC801; &#xACFC;&#xC815;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xB354; &#xC798; &#xC774;&#xD574; &#xD558;&#xAE30; Micrornas&#xC758; &#xB300;&#xC0C1; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xC740; &#xD544;&#xC694; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC608;&#xCE21; &#xB3C4;&#xAD6C;&#xAC00;&#xC774; &#xC791;&#xC5C5;&#xC5D0; &#xB3C4;&#xC6C0;&#xC774; &#xD06C;&#xAC8C;, &#xBE44;&#xB85D; &#xC2E4;&#xD5D8;&#xC801; &#xC811;&#xADFC;&#xC740; &#xAD81;&#xADF9;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xB300;&#xC0C1; &#xAC80;&#xC0C9; &#xBC0F; &#xC720;&#xD6A8;&#xC131; &#xAC80;&#xC0AC;&#xC5D0; &#xD544;&#xC694;&#xD55C;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xACE0;&#xC6A9; mRNAs &#xBBF8;&#xB974;-122, &#xC9C0;&#xBC29;&#xC0B0; &#xBC0F; &#xCF5C;&#xB808;&#xC2A4;&#xD14C;&#xB864; &#xB300;&#xC0AC;, C &#xD615; &#xAC04;&#xC5FC; &#xAC10;&#xC5FC; &#xBC0F; &#xAC04;&#xC138;&#xD3EC; &#xC554; &#xC885; &#xADDC;&#xC81C;&#xC5D0; &#xC5F0;&#xB8E8; &#xAC04; &#xD2B9;&#xC815; Microrna&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xADDC;&#xC81C;&#xC758; &#xD070; &#xC9D1;&#xD569;&#xC5D0; &#xB9E4;&#xD551;&#xD560; &#xB450; &#xAC00;&#xC9C0; &#xB3C5;&#xB9BD;&#xC801;&#xC778; &#xC544;&#xC9C1; &#xBCF4;&#xC644; &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9; &#xBC29;&#xBC95;. &#xB8E8;&#xC2DC;&#xD398;&#xB77C;&#xC544;&#xC81C; &#xAE30;&#xC790; &#xAE30;&#xBC18; &#xAC80;&#xC0AC; &#xBC0F; &#xC0F7;&#xAC74; proteomics &#xC870;&#xD569; 260 &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xD06C;&#xAC8C; &#xB2E4;&#xC6B4; &#xBBF8;&#xB974;-122 &#xD558;&#xB098; &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; &#xBC29;&#xBC95;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC5D0;&#xC11C; &#xADDC;&#xC81C;&#xB294; 113 &#xD3EC;&#xD568; &#xC608;&#xCE21;&#xB41C; &#xBBF8;&#xB974;-122 &#xB300;&#xC0C1; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC758; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xADC0;&#xCC29;&#xB418; &#xC5C8; &#xB2E4;. &#xC774; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC740; &#xC138;&#xD3EC; &#xC8FC;&#xAE30;, &#xBD84;&#xD654;, &#xC99D;&#xC2DD;, &#xBC0F; apoptosis&#xC640; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD48D;&#xBD80;&#xD55C;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; &#xBBF8;&#xB974; 122 &#xBBFC;&#xAC10;&#xD55C; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xAC00;&#xC6B4;&#xB370; &#xC6B0;&#xB9AC; &#xAC04; &#xB300;&#xC0AC;, &#xC9C8;&#xBCD1;, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xAC04;&#xC138;&#xD3EC; &#xC554; &#xC885;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAC15;&#xD55C; &#xC5F0;&#xACB0; &#xD070; &#xADF8;&#xB8F9;&#xC744; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBBF8;&#xB974;-122 &#xBC0F; &#xB300;&#xC0C1; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBAA8;&#xD2F0;&#xBE0C;&#xB97C; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xD558;&#xB294; &#xD569;&#xC758;&#xC758; &#xAC80;&#xC0AC;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xC5EC; &#xCD94;&#xAC00; &#xBD84;&#xC11D; &#xBBF8;&#xB974;-122 &#xD568;&#xC218; &#xCD94;&#xAC00; &#xD1B5;&#xCC30;&#xB825;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

2 &#xACC4;&#xCE35; &#xC811;&#xADFC; &#xC554; &#xBC0F; &#xAC04; &#xC9C8;&#xD658; &#xAD00;&#xB828; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xBBF8;&#xB974;-122&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xADDC;&#xC81C; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C;&#xB97C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Los microARNs funcionar como importantes reguladores de la expresi&#xF3;n g&#xE9;nica y se vinculan con el desarrollo, la diferenciaci&#xF3;n, y enfermedades como el c&#xE1;ncer. Para entender mejor su papel en diversos procesos biol&#xF3;gicos, la identificaci&#xF3;n de genes diana microARN es necesario. Aunque las herramientas de predicci&#xF3;n han contribuido significativamente a esta tarea, los enfoques experimentales se requiere en &#xFA;ltima instancia para la b&#xFA;squeda de objetivos y la validaci&#xF3;n amplia. Se emplearon dos enfoques de alto rendimiento independientes pero complementarios para trazar un amplio conjunto de mRNAs regulados por miR-122, un microARN h&#xED;gado espec&#xED;ficos implicados en la regulaci&#xF3;n de &#xE1;cidos grasos y el metabolismo del colesterol, la infecci&#xF3;n por hepatitis C, y el carcinoma hepatocelular. La combinaci&#xF3;n de luciferase reportero basado en la detecci&#xF3;n y la prote&#xF3;mica de escopeta como resultado la identificaci&#xF3;n de 260 prote&#xED;nas significativamente las reguladas en respuesta a la miR-122 en al menos un m&#xE9;todo, 113 de los cuales contienen predijo miR-122 sitios de destino. Estas prote&#xED;nas se enriquecen de las funciones asociadas con el ciclo celular, la diferenciaci&#xF3;n, proliferaci&#xF3;n y apoptosis. Entre estas prote&#xED;nas miR-122-sensibles, hemos identificado un gran grupo con fuertes conexiones con el metabolismo del h&#xED;gado, enfermedades, y el carcinoma hepatocelular. Los an&#xE1;lisis adicionales, incluyendo el examen de los motivos consenso de uni&#xF3;n tanto para el miR-122 y secuencias diana, proporcionan una mayor comprensi&#xF3;n de la funci&#xF3;n de miR-122.

Article	Year
An abundance of bidirectional promoters in the human genome. Genome research\| PubMed ID: 14707170	2004
Polymorphisms within the C-reactive protein (CRP) promoter region are associated with plasma CRP levels. American journal of human genetics\| PubMed ID: 15897982	2005
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Functional profiling reveals critical role for miRNA in differentiation of human mesenchymal stem cells. PloS one\| PubMed ID: 19440384	2009
Identification of chemical compounds that induce HIF-1alpha activity. Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology\| PubMed ID: 19502547	2009
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Shelley Force Aldred

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