Thomas Dandekar Department of Bioinformatics University Wuerzburg Biography Publications Institution JoVE Articles Thomas Dandekar has not added a biography. If you are Thomas Dandekar and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications 향해 체계적 이해 Listeria Monocytogenes 감염 시 대사 Frontiers in Microbiology. 2012 | Pubmed ID: 22347216 PlateletWeb: 시스템 생물 학적 분석을 인간의 혈소판에서 네트워크 신호 Blood. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22123846 혈소판에 신호 벌금된 캠프의 Silico 모델링에서 시간 해결: 피드백 루프, Titrated Phosphorylations 및 약리 변조 BMC Systems Biology. 2011 | Pubmed ID: 22034949 Hepatocyte 신호 변환에 Exemplified 부울 모델의 통합 Briefings in Bioinformatics. Oct, 2011 | Pubmed ID: 22016404 황색 포도 상 구 균 생리 적 성장 한계: Proteomics와 외부 대사 산물 데이터에 내장 된 플럭스 계산에서 통찰력 Proteomics. May, 2011 | Pubmed ID: 21472852 개미는 병원 체 및 그 의무 Mutualistic Endosymbiont Camponotus Floridanus의 면역 반응 Insect Biochemistry and Molecular Biology. Aug, 2011 | Pubmed ID: 21440063 신진 대사 및 포도 상 구 균, 포도 상 구 균의 Epidermidis, 인간 세포의 규제 Dimeric Isoquinoline IQ-143의 항생제 및 Cytotoxic 효과 모델링 Genome Biology. 2011 | Pubmed ID: 21418624 대사체학 및 Proteomics 포도 당 기아에 황색 포도 상 구 균의 적응 연구 Molecular BioSystems. Apr, 2011 | Pubmed ID: 21327190 말라리아 기생충 Erythrocytic 복제에 대 한 중요 한 역할을 가진 2 핵 지역화 CDK 같은 Kinases 요소 접합의 인 산화에 관련 Journal of Cellular Biochemistry. May, 2011 | Pubmed ID: 21312235 단일 셀 유전체학 Poribacteria, 후보 문 찍어보세요 해양 스폰지와 관련 된 라이프 스타일을 보여준다 The ISME Journal. Jan, 2011 | Pubmed ID: 20613790 확장 및 가상 심사 Indinavir 유래 1 HIV Protease 억제제 Pharmacophoric-모양 유사성 점수 계산 함수를 사용 하 여 리드 Bioinformation. 2010 | Pubmed ID: 20978602 게놈 넓은 프로브 선택 및 회귀 분석을 기반으로 하는 Enterobacteria의 진단에 높은 처리량 Microarray 기술 BMC Genomics. 2010 | Pubmed ID: 20964857 Listeria Monocytogenes 돌연변이 상영 하 고 모델링 하 여 세포내 대사를 해독 합니다 BMC Genomics. 2010 | Pubmed ID: 20955543 미생물 저항에 대 한 Pharmacogenomic 전략: 혁신에 기소 침 한 밝은에서 Pharmacogenomics. Sep, 2010 | Pubmed ID: 20860457 황색 포도 상 구 균 대령의 Anaerobiosis 응답 프로 파일링에 대 한 Protecs, 포괄적이 고 강력한 스토리지 및 OMICS 데이터 분석 시스템 적용 Proteomics. Aug, 2010 | Pubmed ID: 20662099 쥐 신 경계에 인지질을 포함 하는 Phosphocholine의 질량 분석에 의해 발달 프로 파일링 기본 공간 그라디언트를 보여준다 Journal of Neurochemistry. Aug, 2010 | Pubmed ID: 20524967 세포내 세균 병원 균 및 독성에 대 한 가능한 링크의 탄소 물질 대사 Nature Reviews. Microbiology. Jun, 2010 | Pubmed ID: 20453875 Anhydrobiotic Tardigrade Milnesium Tardigradum Hypsibius Dujardini Richtersius Coronifer에 비해 Transcriptome 조사 BMC Genomics. 2010 | Pubmed ID: 20226016 Tardigrades의 Proteomic 분석: Anhydrobiotic 생물 분자 메커니즘의 더 나은 이해를 향해 PloS One. 2010 | Pubmed ID: 20224743 IronChip 평가 패키지: 사용자 지정 Microarrays의 강력한 분석에 대 한 Perl 모듈 패키지 BMC Bioinformatics. 2010 | Pubmed ID: 20193060 처: R-패키지를 생물 네트워크의 기능 분석에 대 한 Bioinformatics (Oxford, England). Apr, 2010 | Pubmed ID: 20189939 Vasodilator 자극 Phosphoprotein 상호작용 소설 Abelson Interactor 1 인간의 혈소판의 특성 분석: 공동된 계산 및 실험적인 접근 방식 Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. Apr, 2010 | Pubmed ID: 20110575 RNA 이차 구조를 포함 하 여 정확성과 Phylogenetic 나무의 재건에 견고성을 향상 시킵니다 Biology Direct. 2010 | Pubmed ID: 20078867 Tardigrades에서 응답 스트레스: 분자 보호자의 차동 유전자 발현 Cell Stress & Chaperones. Jul, 2010 | Pubmed ID: 19943197 Phylogenetic DNA Microarrays에 간 교 잡 모델링 밀접 한 관련이 종의 감지 능력을 증가 시킵니다 Molecular Ecology Resources. Jan, 2009 | Pubmed ID: 21564570 제인: Prokaryotic Ests와 가변 길이 시퀀스의 효율적인 매핑 관련된 템플릿 게놈에 읽습니다 BMC Bioinformatics. 2009 | Pubmed ID: 19943962 Tardigrade 워크 벤치: 시퀀스와 유사한 고 기능성 단백질 Tardigrades의 RNA 요소 뿐만 아니라 클러스터 스트레스 관련 단백질을 비교 합니다 BMC Genomics. 2009 | Pubmed ID: 19821996 간세포에서 시스템 상태 모델링: 생존, Apoptosis 및 바이러스 감염에 대 한 응답에서 수정 BMC Systems Biology. 2009 | Pubmed ID: 19772631 높은 감쇠 Oncolytic Vaccinia 재조합 형 바이러스 GLV-1 H 68: 비교 Genomic 기능과 F14.5L 비활성화의 기여 Molecular Genetics and Genomics : MGG. Oct, 2009 | Pubmed ID: 19701652 말라리아 기생충 Plasmodium Falciparum P. Berghei 그리고 그들의 포유류 호스트-bioinformatical 분석의 CA/c 1 선택성 Biological Chemistry. Nov, 2009 | Pubmed ID: 19663681 여러 시퀀스 정렬에 큰 종 사이트 종속성을 감지 Nucleic Acids Research. Oct, 2009 | Pubmed ID: 19661281 Bioinformatical 감지 단백질 상호 작용을 분석 하는 접근 Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2009 | Pubmed ID: 19544036 Tardigrades에서 관용의 분자 메커니즘: 보전 및 생물 학적 물질의 안정화에 대 한 새로운 시각 Biotechnology Advances. Jul-Aug, 2009 | Pubmed ID: 19472511 5.8S-28S RRNA 상호 작용 및 HMM 기반 ITS2 주석 Gene. Feb, 2009 | Pubmed ID: 19026726 다양 한 유전자 표현 데이터 집합에 자동된 메타 분석 유전자 기능 및 규제에 대 한 통찰력 수 있습니다 Bioinformatics and Biology Insights. 2008 | Pubmed ID: 19812781 Phagosomal 지질 네트워크 규제 말라 어셈블리를 모델링 합니다 BMC Systems Biology. 2008 | Pubmed ID: 19061496 미생물 감염에 저항 개발에 대 한 Pharmacogenomic 전략에 새로운 트렌드 Pharmacogenomics. Nov, 2008 | Pubmed ID: 19018725 동기식 시각적 분석 고 RNA 순서 및 4sale를 사용 하 여 2 차 구조 정렬의 편집 BMC Research Notes. 2008 | Pubmed ID: 18854023 ProfDistS: (프로필-) 거리 기반 유전자 시퀀스-구조 정렬 Bioinformatics (Oxford, England). Oct, 2008 | Pubmed ID: 18723521 ITS2 데이터 확증 Monophyletic Chlorophycean 마 그룹 (Sphaeropleales) BMC Evolutionary Biology. 2008 | Pubmed ID: 18655698 단백질 단백질 상호 작용 네트워크 기능 모듈을 식별: 통합된 된 정확한 접근 방식 Bioinformatics (Oxford, England). Jul, 2008 | Pubmed ID: 18586718 'Candidatus 파이토플라스마 말리' 식물 병원 성 Mycoplasma의 선형 염색체 BMC Genomics. 2008 | Pubmed ID: 18582369 혈소판 단백질 상호 작용: 구성 요소, 및 인 산화 Groundstate 신호 지도 Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18451328 MCL의 답사 데이터 분석 결과 유전자 식 네트워크 생존 및 예 후 답사 CGH 분석 지원에 연루 BMC Cancer. 2008 | Pubmed ID: 18416826 인간의 이황화 Reductases와 Plasmodium Falciparum에서 자신의 Orthologues Methylene 청색의 상호 작용 Antimicrobial Agents and Chemotherapy. Jan, 2008 | Pubmed ID: 17967916 ITS2 데이터베이스 II: Homology 분자 계통 분류학의 RNA 구조를 모델링 합니다 Nucleic Acids Research. Jan, 2008 | Pubmed ID: 17933769 신호 통로 IPP의 새로운 단백질의 식별에 대 한 인간의 혈소판 기능 고 순도의 사용 Thrombosis Research. 2008 | Pubmed ID: 17931695 활성 마우스 L1s의 Exonization: Transcriptome 진화의 드라이버? BMC Genomics. 2007 | Pubmed ID: 17963496 통합된 네트워크 재구성, 시각화 및 Yanasquare를 사용 하 여 분석 합니다 BMC Bioinformatics. 2007 | Pubmed ID: 17725829 깊은 Metazoan 계통입니다 In Silico Biology. 2007 | Pubmed ID: 17688440 종족을 구별 합니다 RNA (New York, N.Y.). Sep, 2007 | Pubmed ID: 17652131 Mycoplasma 균 염기 대사의 기능 유전체학에 대 한 경로 분석 및 게놈 컨텍스트 방법의 사용 Gene. Jul, 2007 | Pubmed ID: 17467928 Arabidopsis 종양의 유전자 표현과 화합물 프로 파일의 통합된 보기: 게놈 넓은 접근 The Plant Cell. Dec, 2006 | Pubmed ID: 17172353 4SALE-동기 RNA 순서 및 이차 구조 정렬 및 편집을 위한 도구 BMC Bioinformatics. 2006 | Pubmed ID: 17101042 일반적인 Bioinformatic 데이터 형식과 워크플로 시스템에 자신의 응용 프로그램에 대 한 XML 스키마입니다 BMC Bioinformatics. 2006 | Pubmed ID: 17087823 InGeno-통합 된 게놈 및 향상 된 게놈 게놈 비교 Ortholog 뷰어 BMC Bioinformatics. 2006 | Pubmed ID: 17054788 상호 작용 단백질 도메인 모델링 상호 작용 사이트 숨겨진된 마르코프 모델 프로필입니다 Bioinformatics (Oxford, England). Dec, 2006 | Pubmed ID: 17000753 Protists 분류에 중점을 두고 진핵생물의 새로운 더 높은 수준의 분류 탐험을 위한 Java 애플릿 The Journal of Eukaryotic Microbiology. Sep-Oct, 2006 | Pubmed ID: 16968448 Listeria Welshimeri의 전체 게놈 시퀀스 Listeria Monocytogenes에 비해 Listeria Innocua와 게놈 감소의 일반적인 단계를 보여준다 Journal of Bacteriology. Nov, 2006 | Pubmed ID: 16936040 내부 베낀된 스페이서 2 데이터베이스-(뿐만 아니라) 낮은 수준의 Phylogenetic 분석을 위한 웹 서버 Nucleic Acids Research. Jul, 2006 | Pubmed ID: 16845103 레 귤 레이 션 및 세포 주기 철: 인간의 세포 분열의 3'-untranslated 지역에 철 반응 요소 식별 사이클 14A MRNA 세련 된 Microarray 기반 검사 전략에 의해 The Journal of Biological Chemistry. Aug, 2006 | Pubmed ID: 16760464 Lysosomal, Cytoskeletal, 그리고 신진 대사 심장 근육 병 증에서의 변경 Cathepsin L 녹아웃 쥐 FASEB Journal : Official Publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology. Jun, 2006 | Pubmed ID: 16636100 인간의 세포 라인에 거품 바이러스 벡터 통합의 게놈 넓은 매핑 The Journal of General Virology. May, 2006 | Pubmed ID: 16603537 인간의 혈소판의 세이 지 데이터의 분석: Anucleate 셀에서 Transcriptome의 기능 Thrombosis and Haemostasis. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16601835 RIP는 죽음 도메인 구조 상호 작용 TNF 중재 증식과 생존에 연루 Proteins. May, 2006 | Pubmed ID: 16470584 13 C Isotopologue 섭 동 연구의 Listeria Monocytogenes 탄소 물질 대사 및 독성 조정기 Prfa의 변조 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb, 2006 | Pubmed ID: 16461909 Blochmannia Floridanus에서 이전에 보존된 가상 또는 상 단백질 기능 예측 및 분석을 BMC Microbiology. 2006 | Pubmed ID: 16401340 이해 혈소판입니다. Proteomics, 유전체학 및 네트워크 분석에서 약속을 교훈 합니다 Thrombosis and Haemostasis. Nov, 2005 | Pubmed ID: 16363231 B-영국 공군 및 C Raf 신호 Mitogenic 니 캐스케이드의 단순화 된 모델에 조사 Biological Chemistry. Nov, 2005 | Pubmed ID: 16307482 호몰로지 모델링 밝혔다 20000 개 이상의 RRNA 내부 베낀된 스페이서 (ITS2) 2 2 차 구조 RNA (New York, N.Y.). Nov, 2005 | Pubmed ID: 16244129 CBCAnalyzer: Phylogenies 보상 기본 변화 RNA 이차 구조에 따라 유추 In Silico Biology. 2005 | Pubmed ID: 15996120 대사 산물과 통로 유연성입니다 In Silico Biology. 2005 | Pubmed ID: 15972010 야 나-플럭스 모드 분석을 위한 소프트웨어 도구 유전자 발현 및 효소 활동 BMC Bioinformatics. 2005 | Pubmed ID: 15929789 ITS 2, 18S RRNA 유전자 계통 Aplysinidae (Verongida, Demospongiae)의 Journal of Molecular Evolution. Mar, 2005 | Pubmed ID: 15871043 RNAi 및 Rnai의 분석에서 현재 노력 대상 유전자 Briefings in Bioinformatics. Mar, 2005 | Pubmed ID: 15826358 ProfDist: 프로필 거리에 따라 큰 Phylogenetic 나무의 건설을 위한 도구 Bioinformatics (Oxford, England). May, 2005 | Pubmed ID: 15677706 L1Base:에서 활성 라인 1 요소의 예측 기능 주석 Nucleic Acids Research. Jan, 2005 | Pubmed ID: 15608246 의무 세포내 박테리아와 벌레 들은 호스트의 대사 상호 의존성 Microbiology and Molecular Biology Reviews : MMBR. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15590782 단백질 복합물-다재 다능 한 블록 또는 생 화 학적 유물 구축의 공유 구성 요소? BioEssays : News and Reviews in Molecular, Cellular and Developmental Biology. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15551274 프로필 거리를 기반으로 정확 하 고 강력한 유전자 추정: Chlorophyceae (Chlorophyta)의 연구 BMC Evolutionary Biology. Jun, 2004 | Pubmed ID: 15222898 Riboswitch 파인더-riboswitch Rnas의 식별을 위한 도구 Nucleic Acids Research. Jul, 2004 | Pubmed ID: 15215370 미생물 감염에 저항 개발에 대 한 Pharmacogenomic 전략입니다 Pharmacogenomics. Jun, 2004 | Pubmed ID: 15165173 Mycoplasma (Mollicutes) Phosphoglycerate 키 아미노산 시퀀스 데이터 로부터 유추로에 특별 한 참조와 함께 Firmicutes의 계통 International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. May, 2004 | Pubmed ID: 15143038 질소의 산화물 Synthase의 소설 보존된 가족? Trends in Biochemical Sciences. May, 2004 | Pubmed ID: 15130557 아니오 바운드 Myoglobin: 구조 다양 성과 아니 리간드의 역학 Journal of the American Chemical Society. Feb, 2004 | Pubmed ID: 14971914 오픈 소스 단백질 젤 설명서 시스템 프로테옴 분석 Journal of Chemical Information and Computer Sciences. Jan-Feb, 2004 | Pubmed ID: 14741024 질소의 산화물 Synthase의 프로토 타입을 찾아 FEBS Letters. Nov, 2003 | Pubmed ID: 14596904 경로 수의 최소화에 따라 토폴로지 경로 분석에서 대사 산물을 분류 하는 방법 Bio Systems. Aug, 2003 | Pubmed ID: 12941488 향해 시스테인 Endopeptidases의 컴퓨터 기반 분열 사이트 예측 Biological Chemistry. Jun, 2003 | Pubmed ID: 12887057 대사 산물: 손길을 통로 진화에 대 한? Trends in Biochemical Sciences. Jun, 2003 | Pubmed ID: 12826406 소프트웨어 도구 상자 규제 RNA 요소 분석 Nucleic Acids Research. Jul, 2003 | Pubmed ID: 12824342 의심 작은 게놈 Mycoplasma 종에서에서 여러 활동을 가진 효소의 유틸리티: 누락 된 "가정" 뉴 클레 오 시드 Diphosphate 키 니 아 제 유전자 Glycolytic Kinases 하 여 활동의 교체 Omics : a Journal of Integrative Biology. 2002 | Pubmed ID: 12427276 비교 게놈 분석 및 통로 재건입니다 Pharmacogenomics. Mar, 2002 | Pubmed ID: 11972445 다재 다능 한 구조 도메인 분석 서버 프로필 무게 매트릭스를 사용 하 여 Journal of Chemical Information and Computer Sciences. Mar-Apr, 2002 | Pubmed ID: 11911710 결합 된 3 차원 조직은 엔지니어링 Claudia Göttlich*1, Lena C. Müller*1, Meik Kunz*3, Franziska Schmitt1, Heike Walles1,4, Thorsten Walles2, Thomas Dandekar3, Gudrun Dandekar1,4, Sarah L. Nietzer1 1Department of Tissue Engineering and Regenerative Medicine (TERM), University Hospital Wuerzburg, 2Department of Cardiothoracic Surgery, University Hospital Wuerzburg, 3Department of Bioinformatics, University Wuerzburg, 4Translational Center Wuerzburg, Fraunhofer Institute Interfacial Engineering and Biotechnology IGB Bioengineering ITS2 데이터베이스 Benjamin Merget1,2, Christian Koetschan1, Thomas Hackl1, Frank Förster1, Thomas Dandekar1, Tobias Müller1, Jörg Schultz1, Matthias Wolf1 1Department of Bioinformatics, Biocenter, University of Würzburg, 2Institute of Pharmacy and Food Chemistry, University of Würzburg JoVE 3806 Biology
결합 된 3 차원 조직은 엔지니어링 Claudia Göttlich*1, Lena C. Müller*1, Meik Kunz*3, Franziska Schmitt1, Heike Walles1,4, Thorsten Walles2, Thomas Dandekar3, Gudrun Dandekar1,4, Sarah L. Nietzer1 1Department of Tissue Engineering and Regenerative Medicine (TERM), University Hospital Wuerzburg, 2Department of Cardiothoracic Surgery, University Hospital Wuerzburg, 3Department of Bioinformatics, University Wuerzburg, 4Translational Center Wuerzburg, Fraunhofer Institute Interfacial Engineering and Biotechnology IGB Bioengineering
ITS2 데이터베이스 Benjamin Merget1,2, Christian Koetschan1, Thomas Hackl1, Frank Förster1, Thomas Dandekar1, Tobias Müller1, Jörg Schultz1, Matthias Wolf1 1Department of Bioinformatics, Biocenter, University of Würzburg, 2Institute of Pharmacy and Food Chemistry, University of Würzburg JoVE 3806 Biology