The Journal of Visualized Experiments (JoVE) is a peer reviewed, PubMed-indexed video journal. Our mission is to increase the productivity of scientific research.
The JoVE video player is compatible with HTML5 and Adobe Flash. Older browsers that do not support HTML5 and the H.264 video codec will still use a Flash-based video player. We recommend downloading the newest version of Flash here, but we support all versions 10 and above.
Unable to load video. Please check your Internet connection and reload this page. If the problem continues, please let us know and we'll try to help.
An unexpected error occurred. Please check your Internet connection and reload this page. If the problem continues, please let us know and we'll try to help.
Hall, L., Jude, K. P., Clark, S. L., Wengenack, N. L. Antimicrobial Susceptibility Testing of Mycobacterium Tuberculosis Complex for First and Second Line Drugs by Broth Dilution in a Microtiter Plate Format. J. Vis. Exp. (52), e3094, doi:10.3791/3094 (2011).
איתור מהיר של עמידות מיקרוביאלית חשוב במאמץ לשלוט על הגידול עמידים Mycobacterium tuberculosis (MTB). בדיקות רגישות Antimicrobial (AST) של MTB באופן מסורתי בוצעו בשיטה אגר פרופורציה או על ידי בדיקות macrobroth על מכשיר כמו BACTEC (בקטון דיקינסון, ניצוצות, MD), VersaTREK (TREK אבחון, קליבלנד, OH) או BacT / התראה (bioMérieux, הייזלווד, MO). שיטת שיעור אגר, בעוד נחשב סטנדרטי "זהב" של AST, הוא עבודה אינטנסיבית ודורשת חישוב התנגדות על ידי ביצוע ספירת המושבה על אגר סמים המכילים לעומת אגר נקי מסמים. אם יש ≥ צמיחה של 1% על מדיום המכיל את התרופה לעומת בינוני התרופה ללא תשלום, האורגניזם נחשב עמידות לתרופה זו. שיטות macrobroth דורשות מכשור לשבור נקודת מבחן ("קריטי") ריכוזי התרופה עבור תרופות הקו הראשון (isoniazid, ethambutol, rifampin ו pyrazinamide). השיטה המתוארת כאן זמין מסחרית בתבנית 96 microtiter גם צלחת [MYCOTB (TREK באבחון)] והוא מכיל ריכוז גדל והולך של 12 antimicrobials משמש לטיפול בשחפת כולל שני הראשונים (isoniazid, rifampin, ethambutol) תרופות הקו השני (amikacin, cycloserine, ethionamide, kanamycin, moxifloxacin, ofloxacin, para-aminosalicylic חומצה, rifabutin, וסטרפטומיצין). Pyrazinamide, תרופה השורה הראשונה, לא נכלל הצלחת microtiter בשל הצורך שלה התנאים מבחן חומצי. היתרונות של מערכת microtiter לכלול הן קלות להגדיר להפוך מהר יותר סביב זמן (14 ימים), לעומת שיעור אגר המסורתיים (21 ימים). בנוסף, הצלחת ניתן להגדיר מ inoculum מוכן שימוש או מרק או בינוני מוצק. מאז הפורמט צלחת microtiter הוא חדש מאז MTB מציב אתגרים ייחודיים בטיחות במעבדה, פרוטוקול זה יתאר כיצד בבטחה ההתקנה, דגירה ולקרוא את הצלחת microtiter.
כל מעבדה זקוקה כדי לבצע הערכת סיכונים תוך שיתוף פעולה עם קצין בטיחות ביולוגית המוסדיים שלהם כדי לקבוע את הרמה המתאימה biosafety להכנת inoculum ועל pipetting של inoculum לתוך הצלחת. במעבדה שלנו, אנו מנצלים רמת biosafety 3 מעבדה (BSL3) נוהלי עד צלחות microtiter הם מחוסן, וחתום בחותמת דבק פלסטי. הצלחות אלה ממוקמות ואז בתוך שקית ניילון, אשר חתום גם חום. דגירה ופרשנות קריאה הצלחת microtiter מתנהל 2 רמת biosafety מעבדה (BSL2).
1. תיוג של חומרים
לייבל דם צלחת אגר, שלושה מידלברוק 7H10 צלחות, מידלברוק 7H9 מרק, מלח tween שפופרת זכוכית חרוז וצלחת AST microtiter עם מזהים המתאים (למשל, שם החולה, מספר רשומה רפואית) ב BSL2.
תווית אגר דם 7H10 מצופה כמו "לבדוק את טוהר". ספירות תקופתיות של המושבה inoculum מומלץ לוודא כי ריכוז מתאים של אורגניזמים משמש הבדיקה. ספירת המושבה לבצע כאשר צריך לעבור שתי צלחות 7H10 שכותרתו עם "לספור 1 / 1 המושבה" ו "לספור 1 / 50 המושבה".
2. טכנולוג ההכנות להיכנס BSL3
ציוד מגן אישי מתאים יש צורך לעבוד BSL3 וכולל מוצק מול חלוק, כיסוי ראש, כפפות, כיסויי נעליים, ומכשיר הנשמה. כל מוסד צריך להקים תוכנית להגנה על דרכי הנשימה שלהם בשיתוף פעולה עם קצין היגיינה תעשייתי במוסד שלהם. במעבדה שלנו, יש לנו כמה הנשמה זמין, כולל מופעל טיהור הנשמה אוויר (PAPRs) והתאים-HEPA מסונן, חצי פנים מסכת N95.
3. הכנת הארון בטיחות ביולוגית
ב BSL3, להכין את ארון הבטיחות הביולוגית (BSC) על ידי חיטוי את פני השטח הנחת מגבת נייר ספוגה כ 6 אינץ' חיטוי מהלוח פתח האוורור.
הנח מיכל פסולת בצד שמאל, ו nephlometer vortexer קטן בצד ימין.
לולאות inoculating, pipetors וטיפים ממוקמים ליד מגבת נייר.
המקום מתלה עם האורגניזם (במרק או בינוני מוצק) ורמת 0.5 מק 'פרלנד על מגבת נייר.
4. כיול nephelometer
מניחים שפופרת זכוכית מלוחים tween חרוז nephelometer ולהגדיר את המכשיר לאפס באמצעות ריק מלוחים tween.
מניחים את תקן 0.5 מק 'פרלנד ב nephelometer ו לכייל בהתאם להוראות היצרן.
5. הכנת Inoculum
עבודה, מושבות BSC לגרד ממדיום מוצק באמצעות לולאה סטרילי לתוך שכותרתו כראוי מלוחים צינור tween חרוז זכוכית עד ≥ 0.5 מק 'פרלנד רגיל מתקבל.
ראייה לבדוק את המדגם, ולהשוות את תקן מק 'פרלנד.
וורטקס מדגם עבור 30-60 שניות.
אפשר inoculum להתיישב במשך 15 דקות (הגדרת טיימר).
6. הרכבה של הצלחת microtiter
התאם את inoculum עם מרק tween מלוחים באמצעות nephelometer מכויל על מק 'פרלנד 0.5 צעדים 4.1 ו 4.2. זה חייב להסתיים תוך 30 דקות (לפי מפרט היצרן).
השתמש pipetter 200 μL ו אירוסול ארוך עמיד pipet קצה להסיר 100 μL של inoculum מ rd 1 / 3 העליון של צינור מלוחים tween חרוז. לחסן את התבשיל 7H9 מידלברוק. לאט לאט מערבולת מרק 7H9 מחוסן למשך 20 שניות.
הסר את צלחת microtiter AST מהחבילה של היצרן. אין להשתמש אם יבוש הוא כחול או אם חבילת נייר פגום.
הכן צינורית 1:50 דילול לשימוש מאוחר יותר בהכנת דילול 01:50 על ידי pipetting 50 μL של מים סטריליים לתוך צינור סטרילי.
בזהירות לצקת את המרק inoculum 7H9 לתוך שוקת. למניעת יצירת אירוסולים.
מניחים את צלחת microtiter AST עם התווית פונה אליך.
השתמש pipetter 12 ערוצים להוסיף 100 μL של inoculum אל היטב כל אחד.
הכן דילולים עבור מונה המושבה:
דילול 1 / 1 מוכן משליטת חיובי היטב (H12) על ידי פסים 1 לולאה μl על הצלחת 7H10 שכותרתו "01/01".
דילול 1 / 50 הוא הוכן על ידי inoculating לולאה 1 μl משליטת חיובי היטב (H12) ו מתערבל אותו לתוך הצינור עם 50 μl של צינור מים מוכן לעיל. 1 Streak μL של דילול זו הצלחת שכותרתו "1 / 50".
לחסן את הצלחות טוהר מן השוקת על ידי pipetting 50 μL על אגר דם שכותרתו הולם צלחת 7H10 ותגרום לבידוד.
מקוםחותם דבק על הצלחת microtiter AST. לחץ בחוזקה על כל היטב כדי להבטיח איטום הולם באמצעות גב לבן של החותם. הימנע קמטים.
לחטא את הצלחת microtiter ידי מנגב אותו עם מגבת נייר ספוגה בחומר חיטוי tuberculocidal ו microtiter צלחת מקום בתוך שקית פלסטיק עם קרוב חותם חום או קלטת.
שקית הניילון משמשת מיכל המשני על מנת להבטיח כי כל מרק הוא הכיל לא אמורה להיות דליפה או לשפוך הצלחת העיקרית.
7. חיטוי של חומרים ארון בטיחות ביולוגית
כדי למנוע ייצור אירוסולים, למקום אחר שוקת על גבי השוקת מחוסן לפני הצבת אותו בעדינות לתוך המיכל וזורקים.
לחטא את כל החומרים כולל nephlometer, vortexer, צלחות, צינורות, וכו 'על ידי וניגבתי חיטוי tuberculocidal ולחכות את הזמן המתאים כדי להבטיח חיטוי על פי הוראות היצרן לפני הסרת מן BSC. לדוגמה, Prospray, חיטוי tuberculocidal אנו משתמשים, דורש 15 דקות כדי להרוג mycobacteria.
מניחים את מיכל להשליך בשקית Biohazard חותם ולפני מעוקר.
8. דגירה
צלחות צריך להיות מודגרות עם התקשורת למטה יש להיזהר כדי למנוע שפיכת כל נוזל או התזה.
דגירה את הצלחת microtiter AST צלחת, 7H10 ו צלחות אגר דם 35-37 מעלות צלזיוס עם חממה CO 2 עם 5-10% 5-10% CO 2 במעבדה BSL2.
במעבדה שלנו, זה מקובל, כי הצלחת היטב אטום בתוך שקית ניילון סגורה.
לא יותר מ 2 צלחות microtiter AST צריך להערם בחממה על פי הוראות היצרן.
9. נציג תוצאות
פרשנות של תוצאות:
אטום AST צלחות microtiter ניתן לקרוא באופן ידני באמצעות מראה כעזר או עם קורא צלחת אוטומטי כגון Vizion (TREK באבחון). הצלחות ניתן לבחון בהקדם 7 ימים לאחר חיסון. בדוק את בקרת צמיחה בארות בעמדות H11 ו H12 כדי לקבוע אם הם חיובי (כלומר, יש הפקדה של תאים בתחתית הבאר). אם הפקד בארות צמיחה לא חיובית, reincubate את הצלחת לבחון מחדש מעת לעת (למשל, יום 10, יום 14) עד בקרת בארות הצמיחה הן חיוביות.
מירור נכתב:
המקום אטום צלחת AST microtiter לבמה;
לקריאה מלאה בארות צמיחה לאחר 7 ימים של דגירה, אם זה שלילי, reincubate צלחת AST microtiter;
אם פקדי צמיחה מקובלים, ולאחר מכן קרא את התרופה המכילים בארות. עבור לכל תרופה, הרשומה דילול הראשונה אין צמיחה על ידי השוואת בארות התרופה עם שליטה הצמיחה.
צמיחה מופיעה עכירות או הפקדה של תאים בתחתית באר.
כלי קריאה: בצע את ההוראות יצרני; את ההוראות להלן דוגמה לאופן הקריאה ייעשה עם פלטפורמת Vizion:
כניסה פנימה
השתמש "MYCOTB" תוכנה AST צלחת.
מניחים צלחת עם ברקוד אטומה מול המשתמש. צמיחה מופיעה עכירות או הפקדה של תאים בתחתית באר.
קראו שולטת צמיחה, אם זה שלילי, reincubate צלחת AST microtiter, אם חיובי לקרוא את הצלחת על ידי נגיעה במסך עם טוב הראשון של כל תרופה שאינה להראות צמיחה.
קראו צלחות טוהר. צלחת אגר דם לא צריך להראות צמיחה לאחר 48 שעות את הצלחת טוהר 7H10 צריך צמיחה ומחוברות סוג של אורגניזם אחד. אם מזוהמים, המבחן microtiter AST צריך להיות חזר מתרבות טהור.
חישוב ספירת המושבה משליטת חיובי גם באמצעות הטבלה שלהלן:
הרוזן המושבה מפתח
מושבות # מנה על צלחת שכותרתו "01/01"
מושבות # מנה על צלחת שכותרתו "1 / 50"
Inoculum הרוזן המושבה (CFU / mL)
<50
0
<5 X 10 4
50-100
0-2
5 X אוקטובר 04-01 X 10 5
> 100
≤ 10
1 X אוקטובר 05-05 X 10 5
> 100
> 10
> 5 X 10 5
אולי יש נגרר עם חומצה פארה-aminosalicylic כמה זנים של Mycobacterium tuberculoאחותי. זה יכול להתפרש על ידי הסתכלות כל הבארות, כי יש כדוריות ושימוש הבאר הראשונה כי יש גלולה בגודל זהה דילול הבאה כנקודת סיום. ההתנגדות היא נדירה עם התרופה הזו.
דוגמה צלחת microtiter AST אשר שולטת צמיחה חיובית מוצג באיור 1 ו MIC נקודת קצה (מיקרוגרם / מ"ל) עבור כל תרופה היא הקיפה. מחקר שנערך במעבדה שלנו ציינו כי שיטת צלחת AST microtiter שווה את השיטה אגר תקן הזהב שיעור לבדיקות הרגישות של שחפת Mycobacterium. דיווח מהיר יותר של תוצאות הושג עם צלחת microtiter microtiter AST לעומת השיטה המסורתית פרופורציה אגר עם הפרשנות הסופית צלחת microtiter AST ו - פרופורציה שיטה אגר ב 14 ו 21 ימים, respectively.The צלחת AST microtiter יש את היתרון של הבדיקה הראשונה קו תרופות second בו זמנית אשר יכול לעזור למנוע עיכובים מופרזת עם זנים עמידים. צלחת microtiter AST הוא גם הרבה יותר קל להגדיר מאשר לקרוא APM ושניהם מראה ידנית ומערכת חצי אוטומטי כגון VIZION ניתן להשתמש כדי לקרוא את הצלחות. הזמינות של ערך MIC עבור בדיקות סמים TB התנגדות עשוי לספק מידע חדש בעל ערך לרופאים יחסית לערך ריכוז המסורתית קריטי, במיוחד עבור אלה מבודד עם רגישות "גבולי".
Wengenack, N., Hall, L., Labombardi, V., and Parrish, N. Evaluation of the New Sensititre (MYCOTB) MIC Plate for the Susceptibility Testing of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) to First and Second Line Drugs. Sept. 12, 2010. Abstract 2450. Presented at 50th Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Boston, MA.
Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories (BMBL) 5th Edition; HHS Publication No. (CDC) 21-112 Revised December 2009. U.S. Department of Health and Human Services Centers for Disease and Preventions. National Institutes of Health.
Morcillo, N., Imperiale, B., Digiulio, B. Evaluation of MGIT 960 and the colorimetric-based method for tuberculosis drug susceptibility testing. Int J Tuberc Lung Dis14, 1169-75 (2010).
Bemer, P., Bodmer, T., Munzinger, J., Perrin, M., Vincent, V., and Drugeon, H. Multicenter Evaluation of the MB/BACT System for Susceptibility Testing of Mycobacterium tuberculosis. J Clin Microbiol 42, 1030-1034 (2004).
SENSITITRE MYCOTB Susceptibility Plate: For Mycobacterium Susceptibility Testing. Product Insert. TREK Diagnostic Systems. Cleveland OH. MYCOTB-V1.5 November (2010).
CLSI. Susceptiblity Testing of Mycobacteria, Nocardia, and Other Aerobic Actinomycetes; Approved Standard. Document M24-A. (ISBN 1-56238-500-3). CLSI, 940 West Valley Road, Suite 1400, Wayne, Pennsylvania, (2003).
Sullivan, N., Sotos, J., Anhalt, K., and Allen, S. Preliminary results from a new TREK Sensititre Mycobacterium tuberculosis MIC plate (MYCOTB). C-151 presented at 110th American Society for Microbiology, Annual Meeting, Abstract C-151, San Diego, CA.
Parrish, N.M., Carroll, K.C. The Role of the Clinical Mycobacteriology Laboratory in the Diagnosis and Management of Tuberculosis in Low Prevalance Settings. J Clin Microbiol, Epub ahead of print (2010).
Kam, K.M., Sloutsky, A., Yip, C.W., Bulled, N., Zingol, M., Espinal, M., and Kim, S.J. Determination of critical concentrations of second-line anti-tuberculosis drugs with clinical and microbiological relevance. Int J Tubercl Lung Dis14, 282-8 (2010).
Woods, G.L., Warren, N.G., and Inderlied, C.B. Susceptibility Test Methods: Mycobacteria, Nocardia, and Other Actinomycetes. In: Manual of Clinical Microbiology, 9th Ed; Eds: PR Murray, EJ Barron, JH Jorgensen, ML Landry, MA Pfaller. ASM Press, Washington DC, 1223-1247 (2007).
Bergmann, J.S., and Woods, G.L. Evaluation of the ESP Culture System II for Testing Susceptibilities of Mycobacterium tuberculosis Isolates to Four Primary Antituberculosis Drugs. J Clin Microbiol36, 2940-2943 (1998).
1
ReplyPosted by: irma contreras guerreroOctober 19, 2011, 1:25 PM