مقالة منهجية

فحص الإنزيم القائم على هيدروجيل البوليمر الكروموجينيك: طريقة إنتاجية عالية لفحص الإنزيمات النشطة للكربوهيدرات باستخدام ركائز اصطناعية

يوليو 8, 2025

في هذه المقالة

الملخص

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

المصدر: Schückel، J.، et al. فحص عالي الإنتاجية للإنزيمات المهينة للكربوهيدرات باستخدام مجموعات فحص الركيزة الملونة الجديدة غير القابلة للذوبان. J. Vis. Exp. (2016).

في هذا الفيديو ، نوضح مقايسة عالية الإنتاجية لفحص الإنزيم النشط للكربوهيدرات باستخدام ركائز هيدروجيل بوليمر كروموجينيك غير قابلة للذوبان. يحلل الإنزيم هذه الركائز إلى منتج ملون قابل للذوبان يمكن قياسه عن طريق قياس كثافة لون المنتج.

البروتوكول

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
< p class = "jove_title" >1. تنشيط لوحة مجموعة الفحص

  1. قم بتنشيط لوحة مجموعة الفحص المكونة من 96 بئرا (التي تحتوي على CPH-xylan الأزرق) (قائمة المواد) عن طريق إضافة محلول تنشيط 200 ميكرولتر (تم الحصول عليه باستخدام المجموعة) في كل بئر ، متبوعا بحضانة لمدة 10 دقائق في درجة حرارة الغرفة دون تحريك.
  2. قم بتطبيق الفراغ باستخدام مشعب فراغ (مع وجود كتلة فاصل بالداخل وأي لوحة قياسية شفافة ذات 96 بئرا كلوحة تجميع) لإزالة محلول التنشيط الموجود. من الممكن أيضا استخدام جهاز طرد مركزي عند 2,700 × جم لمدة 10 دقائق لهذه الخطوة بدلا من مشعب التفريغ.
  3. اغسل ركائز CPH بإضافة 100 ميكرولتر من الماء المعقم وقم بتطبيق فراغ (أو قوة طرد مركزي) لإزالة المثبت. كرر هذه الخطوة مرتين أخريين وأصبحت الألواح جاهزة الآن للاستخدام.
< p class = "jove_title" >2. تفاعل الإنزيم

ملاحظة: قم دائما بتضمين المخزن المؤقت وحده كعنصر تحكم سلبي وإذا أمكن تم وصف الإنزيمات مسبقا بأنها عناصر تحكم إيجابية. استخدم عددا مناسبا إحصائيا من التكرارات. ركائز CPH مستقرة بين الرقم الهيدروجيني 3.0 إلى 10.0 ويجب ألا يتجاوز الحجم الإجمالي لمحلول إنزيم الطرف العازلة في كل بئر 180 ميكرولتر. يمكن أيضا استخدام مستخلص النبات أو مرق الاستزراع بدلا من محلول الإنزيم المنقى.

  1. أضف 150 ميكرولتر 100 ملي مولار من أسيتات الصوديوم ، ودرجة الحموضة 4.5 ، و 5 ميكرولتر محلول السليولاز الداخلي (إلى تركيز نهائي قدره 1 وحدة / مل) إلى كل بئر من لوحة مجموعة الفحص.
  2. ضع لوحة المنتج (لوحة بئر شفافة متوافقة مع قارئ اللوحة الميكروتيتر) أسفل لوحة مجموعة الفحص لتجميع أي تسرب محتمل من لوحة التفاعل أثناء الاهتزاز.
  3. احتضان لوحة مجموعة الفحص عند 25 درجة مئوية لمدة 30 دقيقة في شاكر أفقي عند 150 دورة في الدقيقة.
    ملاحظة: يعد خلط التفاعل في لوحة مجموعة الفحص أثناء الحضانة أمرا بالغ الأهمية لتحقيق نتيجة متسقة وقابلة للتكرار. ركائز CPH مستقرة حتى 90 درجة مئوية. يجب زيادة وقت الحضانة حتى 24 ساعة عند اختبار مرق الاستزراع الذي يحتوي على تركيزات إنزيم غير معروفة مع ركائز CPH. لاحظ أن أوقات الحضانة المناسبة تعتمد على نشاط الإنزيم (الإنزيمات) ، ولكن بشكل عام ، إذا لم يكن هناك نشاط يمكن اكتشافه في غضون 24 ساعة ، فمن المحتمل ألا يؤدي الإنزيم إلى تدهور الركيزة المختبرة. يعمل الإنزيم النشط على تحلل السكريات الكروموجينيكية غير القابلة للذوبان في ركيزة CPH إلى السكريات قليلة اللونين القابلة للذوبان ، والتي يمكن رؤيتها على أنها طافية ملونة.
  4. ضع لوحة المنتج النظيفة داخل مشعب التفريغ مع وجود كتلة فاصل بداخلها.
  5. ضع لوحة مجموعة الفحص في الأعلى وقم بتطبيق فراغ (أقصى ضغط سلبي -60 كيلو باسكال). من الممكن أيضا استخدام جهاز طرد مركزي عند 2,700 × جم لمدة 10 دقائق < br / > ملاحظة: المرشح الذي يحتوي على السكريات قليلة السكاريد الملونة كمنتج التفاعل موجود الآن في لوحة المنتج لمزيد من التحليل.
< p class = "jove_title" >3. الكشف والقياس الكمي

  1. تأكد من أن حجم السائل في كل بئر من لوحة المنتج هو نفسه تقريبا عن طريق الفحص البصري.
  2. اقرأ امتصاص لوحة التجميع عند 595 نانومتر ل CPH-xylan الأزرق باستخدام قارئ لوحة.
  3. عند إجراء تحليل البيانات ، اطرح قيم التحكم السلبية للمخزن المؤقت فقط من القيم من الآبار حيث تمت إضافة إنزيم. احسب متوسط القيمة والخطأ المعياري للوسائل (SEM) من الآبار المكررة.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
لم يتم الإعلان عن أي تضارب في المصالح.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة الاسم الشركة رقم فهرسي التعليقات لوحات مجموعة الفحص جليكوسبوت لوحات طقم الفحص المخصصة حل التنشيط جليكوسبوت لتنشيط ركائز CPH 350 مل كتلة فاصل لوحة الاستقبال لمشعب الفراغ شركة بال 5015 كتلة فاصل لوحة مرشح HV متعددة الشاشات 96 بئر ، 0.45 ميكرومتر ، شفافة ، غير معقمة ميليبور MSHVN4510 لوحة الفحص 96 بئر ميكروبليت ، بولي بروبيلين غرينر بيو ون 651201 لوحة التجميع بعد غسل الركائز Nunc MicroWell 96-Well Microplates الترمو: العلمية هاتف: 269620 لوحة المنتج مضخة الحجاب الحاجز MZ 2 NT Vacuubrand 732000 مضخة فراغ تستخدم مع مشعب الفراغ إنفورز HT Ecotron إنفرز HT 4950132 (Buch & Holm) شاكر أفقي سبيكتراماكس M5 الأجهزة الجزيئية 10067-750 (VWR) قارئ امتصاص لوحة 96 جيدا مشعب الفراغ شركة بال 5017 مشعب الفراغ الخلية الداخلية (EGII) (Trichoderma longibrachiatum) ميجازيم إي سيلتر السليولاز [cel] α-الأميليز (Bacillus licheniformis) ميجازيم إي بلام الأميليز [ايمي]

إعادة الطباعة والأذونات

طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه

طلب إذن

الوسوم

مقالات ذات صلة