مقالة منهجية

تقنية قياس تداخل الطبقة الحيوية للكشف عن التفاعلات بين Ligand و Analyte

يوليو 8, 2025

في هذه المقالة

الملخص

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

المصدر: Desai, M., et al. تطبيق قياس تداخل الطبقة الحيوية (BLI) لدراسة تفاعلات البروتين والبروتين في النسخ. J. Vis. Exp. (2019)

في هذا الفيديو ، نوضح تقنية قياس تداخل الطبقة الحيوية (BLI) للكشف عن التفاعلات بين الجزيئات بين الروابط والتحليلات المستهدفة في الوقت الفعلي. يقيس BLI التغيرات في نمط تداخل الضوء الأبيض المنعكس عن طبقة من الروابط المجمدة على سطح المستشعر الحيوي أثناء تفاعلها مع التحليلات في المحلول.

البروتوكول

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
< p class = "jove_title" >1. ترطيب المستشعر الحيوي وإعداد الفحص

  1. قم بتشغيل آلة BLItz.
  2. تأكد من توصيل الجهاز بالكمبيوتر من خلال منفذ إخراج بيانات USB في الجزء الخلفي من الجهاز.
  3. على الكمبيوتر ، افتح البرنامج المرتبط (على سبيل المثال ، BLItz Pro) ، وانقر فوق Advanced Kinetics على الجانب الأيسر من الشاشة.
  4. في البرنامج ، اكتب جميع المعلومات المناسبة حول التجربة (بما في ذلك اسم التجربة والوصف ومعرف العينة وتركيز البروتين) تحت كل عنوان على حدة.
  5. انقر فوق Biosensor Type واختر Ni-NTA من القائمة المنسدلة.
    1. ضمن عنوان إعدادات التشغيل، تحقق من تعيين Shaker على تمكين.
    2. ضمن عنوان قائمة نوع الخطوة، تحقق من وجود 5 عناصر مدرجة: الأساس الأولي، والتحميل، والخط الأساس، والاقتران، والتفكك.
      ملاحظه: يمكن تغيير مدة كل خطوة من الافتراضي حسب الحاجة. للحصول على أفضل النتائج ، استخدم ما لا يقل عن 30 ثانية لخط الأساس الأولي وخط الأساس. و 120 ثانية للارتباط والانفصال. تعتمد مدة خطوة التحميل (التي تتراوح من 120 إلى 240 ثانية) على تركيز الترابط وتقارب علامة His-epitope على الترابط إلى المستشعر الحيوي Ni-NTA.
  6. قم بإزالة المستشعر الحيوي Ni-NTA المرطب من أنبوب PCR وتثبيته على حامل المستشعر الحيوي على الجهاز عن طريق تحريك الجزء العريض من المستشعر الحيوي على الحامل.
    ملاحظه: لا تدع المستشعر الحيوي يجف أثناء التجربة.
  7. ضع أنبوب طرد مركزي أسود سعة 0.5 مل في حامل أنبوب الماكينة وقم بإدخال 400 ميكرولتر من المخزن المؤقت BLI فيه.
  8. تحقق من وضع شريط تمرير الجهاز بحيث يكون حامل الأنبوب أمام السهم الأسود على الجهاز.
  9. أغلق غطاء الجهاز بحيث يصبح طرف المستشعر الحيوي مغمورا في المخزن المؤقت في أنبوب الطرد المركزي الدقيق.
  10. انقر فوق التالي على البرنامج لبدء تسجيل خط الأساس الأولي.
< p class = "jove_title" >2. تحميل الترابط على المستشعر الحيوي

  1. بعد انتهاء التسجيل من خطوة خط الأساس الأولي ، افتح غطاء الجهاز.
  2. حرك شريط التمرير إلى اليمين بحيث يكون حامل الإسقاط (بدلا من حامل الأنبوب) أمام السهم الأسود.
  3. ماصة 4 ميكرولتر من ترابط His-tagged المسبب للغسيل على حامل السقوط وأغلق غطاء الماكينة.
    ملاحظة: قد يختلف التركيز الأمثل للترابط المراد استخدامه لكل بروتين. عادة ما يكون التركيز بين 1.0 إلى 2.0 مجم / مل كافيا لتشبع NTA عند طرف المستشعر الحيوي في 240 ثانية.
  4. في البرنامج، انقر فوق التالي لبدء التحميل.

3. غسل الترابط الإضافي

  1. بعد انتهاء خطوة التحميل من التسجيل، افتح غطاء الجهاز.
  2. حرك شريط التمرير إلى اليسار بحيث يكون حامل الأنبوب موجودا مرة أخرى أمام السهم الأسود.
  3. أغلق غطاء الماكينة وتأكد من غمر طرف المستشعر الحيوي في المخزن المؤقت BLI للأنبوب الموجود في حامل الأنبوب.
  4. انقر فوق التالي مرة أخرى على البرنامج لبدء تسجيل خط الأساس.
< p class = "jove_title" >4. ارتباط التحليل بالليجند

  1. بعد انتهاء خطوة Baseline من التسجيل، افتح غطاء الجهاز.
  2. قم بإزالة حامل القطرات ونظفه عن طريق إخراج أي بروتين وشطفه بالماء منزوع الأيونات المزدوج (ddH2O) لمدة 5 مرات.
    1. استخدم مناديل مناديل لتنظيف سطح حامل القطرات بعد الغسيل.
  3. أعد تركيب حامل السقوط مرة أخرى على الجهاز.
  4. حرك شريط التمرير الموجود على الجهاز إلى اليمين بحيث يكون حامل الإسقاط موجودا مرة أخرى أمام السهم الأسود.
  5. ماصة 4 ميكرولتر من مادة تحليلية مكسورة بالكلى على حامل السقوط وأغلق غطاء الماكينة.
  6. في البرنامج، انقر فوق التالي لبدء الاقتران.
< p class = "jove_title" >5. تفكك التحليل عن الترابط

  1. بعد الانتهاء من خطوة الاقتران ، افتح غطاء الجهاز.
  2. حرك شريط التمرير الموجود على الجهاز إلى اليمين بحيث يكون حامل الأنبوب موجودا مرة أخرى أمام السهم الأسود.
  3. في البرنامج، انقر فوق التالي لبدء التفكك.
  4. بعد انتهاء خطوة التفكيك من التسجيل ، افتح غطاء الجهاز.
  5. قم بإزالة حامل السقوط وحامل الأنبوب.
  6. اشطف كلاهما باستخدام ddH2O جيدا لغسل أي بروتين.
  7. قم بإزالة المستشعر الحيوي وتخلص منه بأمان.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
لم يتم الإعلان عن أي تضارب في المصالح.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة الاسم الشركة رقم فهرسي التعليقات آلة BLItz فورتي بيو 45-5000 جهاز تراجع وقراءة صينية المستشعر الحيوي Ni-NTA فورتي بيو 18-5101 مستشعرات حيوية Ni-NTA جاهزة للاستخدام للبروتينات التي تحمل علامة poly-His حامل السقوط فورتي بيو 45-5004 جهاز أنابيب PCR (0.2 مل) توماس العلمية CLS6571 أدوات بلاستيكية أنابيب الطرد المركزي الدقيقة (أسود) ثيرمو فيشر العلمي 03-391-166 أدوات بلاستيكية كيمويبس ثيرمو فيشر العلمي 06-666 أ أدوات بلاستيكية DTT ثيرمو فيشر العلمي R0861 كيميائي EDTA MilliporeSigma E6758 كيميائي مغنكلوريد2 MilliporeSigma M8266 كيميائي كلوريد الصوديوم MilliporeSigma S9888 كيميائي تريس حمض الهيدروكلوريك جولد بيو T095100 مخزن مؤقت

إعادة الطباعة والأذونات

طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه

طلب إذن

الوسوم

Ni NTA BLI BLItz Advanced Kinetics

مقالات ذات صلة