مقالة منهجية

تصوير أحادي الجزيء لتصور تجميع مكثفات بروتين الاندماج على ستائر الحمض النووي

يوليو 8, 2025

في هذه المقالة

الملخص

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

المصدر: Zuo، L. et al.، تصوير أحادي الجزيء لمكثفات EWS-FLI1 التي تتجمع على الحمض النووي. (2021)

يصف هذا الفيديو طريقة لتصور تجميع مكثفات بروتين الاندماج على جزيئات الحمض النووي في مواقع محددة باستخدام التصوير أحادي الجزيء. تتشكل هذه المكثفات بسبب تفاعلات LCD-LCD و LCD-DBD ، والتي تسمح بتجنيد بوليميراز الحمض النووي الريبي II وتحسين نسخ الجينات.

البروتوكول

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
فئة

1. تصوير تكوين التكثيف EWS-FLI1 على ستائر الحمض النووي

  1. افتح برنامج التصوير ، وابحث عن مواضع الأنماط المتعرجة 3 × 3 تحت المجال الساطع وقم بتمييزها.
  2. قم بتشغيل التدفق بسرعة 0.2 مل / دقيقة لتلطيخ الحمض النووي بصبغة الحمض النووي مزدوجة الشريطة لمدة 10 دقائق.
  3. تمييع mCherry-EWS-FLI1 مع المخزن المؤقت للتصوير بتركيز 100 نانومتر في 100 ميكرولتر في الأنبوب.
  4. قم بتحميل عينة البروتين عبر الصمام بحقنة زجاجية سعة 100 ميكرولتر ، وقم بتغيير معدل التدفق إلى 0.4 مل / دقيقة.
  5. قم بتشغيل ليزر 488 نانومتر وقم بمسح كل منطقة مسبقا للتحقق من حالة توزيع الحمض النووي ؛ حدد المنطقة التي تتوزع فيها جزيئات الحمض النووي بالتساوي. اضبط طاقة الليزر على 10٪ لليزر 488 نانومتر و 20٪ لليزر 561 نانومتر. استخدم مقياس الطاقة لقياس طاقة الليزر الحقيقية بالقرب من المنشور: 4.5 ميجاوات لليزر 488 نانومتر و 16.0 ميجاوات لليزر 561 نانومتر.
  6. الحصول على الصور
    1. ابدأ في الحصول على الصور على فترات 2 ثانية مع كل من ليزر 488 نانومتر و 561 نانومتر في وقت واحد.
    2. قم بتغيير الصمام من وضع الحقن اليدوي إلى وضع الحقن للسماح للمخزن المؤقت للتصوير بغسل عينة البروتين إلى خلية التدفق بعد 60 ثانية < / > ملاحظه: ستستغرق هذه العملية ~ 30 ثانية ، وسيتم تغطية مجال الرؤية بإشارات mCherry بمجرد وصول بروتينات EWS-FLI1 إلى خلية التدفق.
    3. لإزالة EWS-FLI1 المجاني، استمر في غسل خلية التدفق باستخدام المخزن المؤقت للتصوير لمدة 5 دقائق مع تشغيل ليزر 561 نانومتر فقط. أوقف التدفق واحتضنه عند 37 درجة مئوية لمدة 10 دقائق.
    4. قم بتشغيل التدفق بسرعة 0.4 مل / دقيقة للسماح للحمض النووي بالتمدد ، والحصول على صور على فترات 2 ثانية بين الإطارات المختلفة للحصول على بيانات عالية الإنتاجية لتكوين المكثفات EWS-FLI1.
< p class = "jove_title" >2. تحليل الشدة ل mCherry-EWS-FLI1

  1. قم باستيراد البيانات كتسلسلات صور إلى برنامج ImageJ ، واختر النقاط في 25× مواقع GGAA في مربع 8×8 بكسل ، واحفظ الصورة بتنسيق .tif.
  2. احسب الشدة كمجموع للشدة في مربع 8×8 بكسل ، بما في ذلك النقطة الكاملة ، وقم بإزالة الخلفية عن طريق طرح شدة الخلفية في منطقة من نفس الحجم بالقرب من مربع 8 × 8 بكسل.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
لم يتم الإعلان عن أي تضارب في المصالح.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة الاسم الشركة رقم فهرسي التعليقات 488 نانومتر ليزر الحالة الصلبة بضخ الصمام الثنائي متماسك OBIS488LS 561 نانومتر ليزر الحالة الصلبة بضخ الصمام الثنائي متماسك OBIS561LS نيكون المجهر المقلوب نيكون اكليبس تي PMMA PMMA برايم 95 ب

إعادة الطباعة والأذونات

طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه

طلب إذن

الوسوم

مقالات ذات صلة