Method Article

تقنية المصفوفة الدقيقة للببتيد لتنميط خصوصية الأجسام المضادة

July 8th, 2025

In This Article

Abstract

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
< p class = "jove_content" >المصدر: Cornett، E. M. ، et al. تحليل خصوصية الأجسام المضادة للهيستون باستخدام المصفوفات الدقيقة للببتيد. J. Vis. Exp. (2017).

يوضح هذا الفيديو تقنية تطبق تقنية المصفوفات الدقيقة للببتيد لتعريف خصوصية الأجسام المضادة التي تتعرف على التعديلات اللاحقة للترجمة (PTMs) على ببتيدات الهيستون. يتم التعامل مع شريحة المصفوفة الدقيقة التي تحتوي على ببتيدات هيستون مترافقة بالفلوروفور مع مجموعات PTM المعروفة بالأجسام المضادة المستهدفة الخاصة ب PTM. تساعد هذه العملية في تحديد خصوصية الجسم المضاد للهدف وتفاعله المتبادل المحتمل مع PTMs غير المستهدفة.

Protocol

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

p class = "jove_title" >1. تصميم شريحة المصفوفة وتخطيط لوحة المصدر

  1. تحت عنوان "تخطيط تخطيط شريحة" على واجهة ArrayNinja ، انقر فوق الرابط الذي يتوافق مع طابعة المصفوفة الدقيقة المستخدمة.
    ملاحظه: تمت برمجة ArrayNinja لتقليد الحركة الروبوتية لطابعتين شائعة الاستخدام من المصفوفات الدقيقة (انظر الجدول 1). يمكن تكوين التوافق مع المصفوفات الأخرى عند الطلب.
  2. انقر داخل مربع الحوار "تحميل اللوحة" ، واكتب "فارغ" ، وانقر فوق "إدخال". انظر الشكل 1 للحصول على لقطة شاشة لوحدة تصميم ArrayNinja.
  3. اضبط قطر البقعة على 275 ميكرومتر والتباعد الموضعي إلى 375 ميكرومتر. اضبط الإعدادات المتبقية (كتل اللوحة/صف ....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Results

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

p class = "jove_content" fo: keep-together.within-page = "1" >figure-results-1
الشكل 1: وحدة تصميم ArrayNinja. يتم عرض لقطة شاشة لوحدة تصميم ArrayNinja في الخط المنقط. تعرض لوحة التحكم (أعلى) جميع المعلمات التي يمكن تغييرها على طابعة المصفوفة الدقيقة. أثناء ضبط هذه المعلمات ، يتم تحديث الصورة الكرتونية لتخطيط الشريحة (أسفل اليسار) في الوقت الفعلي. بعد تعيين التخطيط، يمكن للمستخدم تمرير الماوس فوق النقاط الفردية لإدخال معرفات الميزات الفريدة. يقوم ArrayNinja من إدخال .......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Disclosures

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
لم يتم الإعلان عن أي تضارب في المصالح.

Materials

List of materials used in this article Name Company Catalog Number Comments المخزن المؤقت للطباعة ArrayIt PPB جيش صرب البوسنه أومني بيور 2390 دولار شرائح مجهر زجاجي مطلي بالستربتافيدين غرينر بيو ون 439003-25 لوحة بولي بروبيلين 384 بئر غرينر بيو ون 784201 البيوتين والفلورسين سيغما 53608 اتصل بطابعة المصفوفات الدقيقة أوشون 2470 طابعة Aushon 2470 Microarray اتصل بطابعة المصفوفات الدقيقة آلات الجينات أومني جريد 100 طابعة OmniGrid Microarray برنامج تلفزيوني إنفيتروجين 14190 المخزن المؤقت للحجب ArrayIt SBB قلم الشمع الكارهة للماء مختبرات ناقلات إتش-4000 ImmEdge مسعور حاجز PAP القلم حشية السيليكون جريس بيو لاب 622511 وعاء التهجين الترمو: العلمية 267061 أو وعاء مماثل الجسم المضاد الثانوي المترافق بصبغة الفلورسنت تقنيات الحياة أ -21244 أليكسا فلور 647 (مضاد للأرانب) الجسم المضاد الثانوي المترافق بصبغة الفلورسنت تقنيات الحياة أ -21235 أليكسا فلور 647 (مضاد للماوس) طابعة الشمع ArrayIt إم إس آي 48 توين 20 أومني بيور 9490 ماسح ضوئي Microarray Innopsys InnoScan 1100AL أو ماسح ضوئي مكافئ للمصفوفات الدقيقة EipTitan هيستون الببتيد Microarray Epicypher 112001 AbSurance Pro Histone Peptide Microarray ميليبور 16668 مصفوفة ببتيد هيستون معدلة الفكرة النشطة 13001 هيستون كود الببتيد المصفوفات الدقيقة جي بي تي His_MA_01 شمع رويال أوك جلف واكس لطابعة الشمع غرفة تهجين الشرائح Microarray المرطب VWR 97000-284 غرفة غسيل منزلقة مجهر عالي الإنتاجية ArrayIt HTW جهاز الطرد المركزي المنزلق المجهر VWR 93000-204 الأجسام المضادة 1 أبكام 8898 الأجسام المضادة 2 ميليبور 07-473 ببتيد هيستون البيوتينيل إبي سايفر 12-2001 مثال الببتيد. تتوفر ببتيدات مماثلة مع تعديلات مختلفة من عدة مصادر تجارية. إيمجماجيك https://www.imagemagick.org/script/index.php ArrayNinja https://rothbartlab.vai.org/tools/

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

Peptide MicroarrayAntibody SpecificityHistone PeptidesPost Translational ModificationsFluorescence DetectionMicroarray ScannerHybridization BufferSecondary AntibodiesBlocking BufferWax Imprinter

Related Articles