1. VNP (CPMV، BMV، PVX، وTMV) الدعوة
- تعيين غرفة النباتات الداخلية إلى 15 ساعة تتحكم اليوم (100٪ ضوء، 25 ° C والرطوبة 65٪) و 9 ساعة من الليل (ضوء 0٪، 22 ° C والرطوبة 60٪).
- تطعيم النباتات وفقا لجدول زمني في الجدول 1.
| CPMV | PVX، TMV، وBMV |
| اليوم 0: بذور اللوبيا النبات 3 / وعاء. | اليوم 0: زيوت نباتية ~ 30 N. بذور benthamiana / وعاء. تسميد مرة في الأسبوع مع ملعقة الأسمدة 1/5 L المياه. |
| يوم 14: إعادة عاء N. benthamiana في 1 مصنع / وعاء. |
| يوم 10: تصيب الأوراق يترك الأولية مع CPMV (5 μg/50 ميكرولتر / نبات) عن طريق التلقيح الميكانيكي باستخدام ضوء الغبار من ساموري. | يوم 28: تصيب ثلاثة إلى Fإيف يترك مع PVX، TMV، أو BMV (5 μg/50 ميكرولتر / نبات) عن طريق التلقيح الميكانيكي باستخدام ضوء الغبار من ساموري. |
| أوراق الحصاد وتخزينها في -80 درجة مئوية.: 20 يوما | أوراق الحصاد وتخزينها في -80 درجة مئوية.: 42 يوما |
الجدول 1. الجدول الزمني لزراعة واصابة، وحصاد الأوراق.
ملاحظة: ويتجلى فقط CPMV نشر كمثال على ذلك.
2. VNP (CPMV، BMV، PVX، وTMV) تنقية
ملاحظة: تتم جميع خطوات على الجليد أو من عند 4 ° C.
- 100 غرام من التجانس أوراق المجمدة في الخلاط القياسية باستخدام 2 مجلدات من العازلة الباردة (انظر الجدول 2). تصفية من خلال طبقات من القماش القطني 2-3.
- لPVX، وضبط درجة الحموضة إلى 6.5 باستخدام حمض الهيدروكلوريك 1 M. إضافة 0.2٪ (W / V) حمض الاسكوربيك و 0.2٪ (W / V) سلفي الصوديومالشركة المصرية للاتصالات.
- أجهزة الطرد المركزي الخام جناسة المصنع في 5500 x ج لمدة 20 دقيقة. جمع طاف.
- لBMV، طبقة 25 مل من طاف أكثر من 5 مل من 10٪ (W / V) حل السكروز. أجهزة الطرد المركزي في 9000 x ج لمدة ساعة الكريات و resuspend 3 في حل CSCL 38.5٪ (W / V). مزيج من الهز لمدة 5 ساعة، ثم تابع مع الخطوة 2.12.
- استخراج المواد النباتية عن طريق إضافة كميات من 0،7 1:1 (V / V) كلوروفورم :1-بيوتانول. يحرك الخليط لمدة 30-60 دقيقة.
- أجهزة الطرد المركزي في 5500 XG حل لمدة 20 دقيقة. جمع المرحلة العليا مائي.
- إضافة كلوريد الصوديوم إلى 0.2 M و 8٪ (W / V) PEG (MW 8،000). لTMV، أيضا إضافة 1٪ (V / V) تريتون X-100. يحرك المزيج لمدة 1 ساعة على الأقل، ثم ترك الجلوس لمدة لا تقل عن 1 ساعة.
- أجهزة الطرد المركزي الحل على 15،000 XG لمدة 15 دقيقة. إعادة تعليق بيليه في 10 مل من العازلة. لPVX، إضافة β-0.1٪ واليوريا المركابتويثانول إلى 0.5 M.
- أجهزة الطرد المركزي في 8000 x ج لمدة 30 دقيقة وجمع طاف.
- نابذة فائقة السرعة طاف في 160،000 XG لمدة 3 ساعة. إعادة تعليق بيليه في 5 مل يا العازلةvernight.
- إعداد التدرج السكروز 10-40٪ باستخدام كميات متساوية من 10٪، 20٪، 30٪، 40٪ والسكروز في المخزن المؤقت (أثقل الأول). تسمح التدرج لتتوازن بين عشية وضحاها في درجة حرارة الغرفة.
- نابذة فائقة السرعة معلق بيليه خلال التدرج في السكروز 100،000 XG لمدة 2 ساعة (24 ساعة لBMV).
- جمع ضوء الفرقة والتشتت dialyze ضد العازلة.
- تميز VNPs (أدناه) وتخزينها في 4 درجات مئوية. على المدى الطويل تخزين، تخزين على -80 درجة مئوية.
| CPMV وTMV | 0،1 فوسفات البوتاسيوم M العازلة (درجة الحموضة 7.0) 38.5 مم KH 2 PO 4 61،5 ملي K 2 HPO 4 |
| PVX | 0.5 م العازلة بورات (الرقم الهيدروجيني 7.8) 0،5 حمض البوريك M ضبط درجة الحموضة مع هيدروكسيد الصوديوم |
| BMV | مؤسسة النقد العربي السعودي العازلة (درجة الحموضة 4.5) 250 خلات الصوديوم ملي 10 ملم MgCl 2 β-2 مم المركابتويثانول (إضافة جديدة) |
الجدول 2. المخازن المؤقتة وصفات لكل VNP.
ملاحظة: ويتجلى فقط CPMV نشر كمثال على ذلك.
3. VNP (CPMV، BMV، PVX، وTMV) توصيف
- أداء التحليل الطيفي للأشعة فوق البنفسجية / المرئية لتحديد تركيز VNPs.
- قياس الامتصاصية من 2 ميكرولتر من العينة باستخدام الطيف NanoDrop.
- تحديد تركيز الجسيمات والأصباغ باستخدام قانون بير لامبرت (A = εcl، حيث A هي الامتصاص، هو ε معامل الانقراض، ج هو التركيز، وL هو طول المسار). طول المسار هو 0.1 سم لNanoDrop.
معاملات الانقراض VNP محددة هي:
CPMV: 8.1 سم -1 ملغ -1 مل (في 260 نانومتر)
PVX: 2.97 سم -1 ملغ -1 مل (في 260 نانومتر)
TMV: 3.0 سم -1 ملغ -1 مل (في 260 نانومتر)
BMV: 5.15 سم -1 ملغ -1 مل (في 260 نانومتر)
- تحليل جزيئات من الحجم الاستبعاد اللوني السائل سريع البروتين (FPLC).
- باستخدام Superose-6 المساحة استبعاد العمود ومستكشف AKTA، تحميل 50-100 ميكروغرام من VNPs في 200 ميكرولتر من 0.1 M الفوسفات العازلة البوتاسيوم (الرقم الهيدروجيني 7.0).
- تعيين إلى 260 نانومتر للكشف عن (الحمض النووي)، 280 نانومتر (البروتين)، والطول الموجي الإثارة في أي الأصباغ المرفقة.
- تشغيل بمعدل تدفق 0.5 مل / دقيقة لمدة 72 دقيقة.
- الملف الشخصى شطف وA260: A280 نانومتر إلى ما إذا كان إعداد VNP هو محض وما إذا الجسيمات وتجميعها سليمة.
وA260 التالية: 280 النسب تشير إلى إعداد VNP النقي:
CPMV: 1.8 ± 0.1
PVX: 1.2 ± 0.1
TMV:1.1 ± 0.1
BMV: 1.7 ± 0.1
- أداء يبدل طبيعة (ما قبل الصب NuPAGE) مكرر تريس بولكرلميد هلام الانحدار 4-12٪ الكهربائي لتحليل نقاء إعداد وتصريف البروتينات إلى معطف الفردية.
- أضف 3 مل من عينة العازلة 4X LDS إلى 10 ميكروغرام من الجزيئات في 9 ميكرولتر من العازلة الفوسفات البوتاسيوم. إضافة أكثر 1 ميكرولتر من العازلة عينة LDS 4X و 3 ميكرولتر من المركابتويثانول-β لBMV للحد من عدد كبير من السندات ثاني كبريتيد.
- احتضان في كتلة الحرارة لمدة 5 دقائق عند 100 ° C.
- تحميل عينات على هلام SDS ل.
- تشغيل العينات في 200 V ل1 ساعة في اجتماعات الأطراف 1X تشغيل المخزن المؤقت.
- توثيق هلام تحت ضوء الأشعة فوق البنفسجية لتصور البروتينات الفلورية معطف.
- لغير الفلورسنت البروتين، وصمة عار مع الأزرق Coomassie (0.25٪ (W / V) Coomassie بريليانت الأزرق R-250، وحامض الخليك 30٪ (V / V) الميثانول، و 10٪ (V / V)) لمدة 1 ساعة.
- يزيل اللون مع الميثانول 30٪، حمض الخليك 10٪ بين عشية وضحاها. تشانجنرال الكتريك الحل إذا لزم الأمر.
- توثيق هلام تحت الضوء الأبيض.
- تحليل سلامة الجزيئات بواسطة المجهر الإلكتروني انتقال (TEM).
- تخفيف العينات إلى 0،1-1 ملغ / مل في 20 ميكرولتر من المياه DI.
- وضع 20 قطرات ميكرولتر من العينات على Parafilm.
- تغطية قطرات مع شبكة TEM والسماح الجلوس لمدة 2 دقيقة. الفتيل من الحل الزائدة على الشبكة مع ورقة الترشيح.
- غسل الشبكة عن طريق وضع على قطرة ماء ثم فتل DI الجافة.
- وصمة عار على الشبكة عن طريق وضع بنسبة 20 ميكرولتر من 2٪ (W / V) خلات اليورانيل لمدة 2 دقيقة. الفتيل قبالة الزائدة وصمة عار مع ورق الترشيح.
- غسل الشبكة مرة أخرى في الماء.
- مراقبة الشبكة تحت الميكروسكوب الالكترونى النافذ.
4. اقتران الكيميائي للVNPs مع PEG وFluorophores وتنقية، وتوصيف
- لإجراء العمليات الحسابية لردود الفعل أدناه، كتلة مولية من VNPs هي:
CPMV: 5.6× 10 6 ز / مول
PVX: 35 × 10 6 ز / مول
TMV: 41 × 10 6 ز / مول
BMV: 4.6 × 10 6 ز / مول - المتقارن الأصباغ وPEG لlysines سطح CPMV وPVX باستخدام خطوة واحدة N-هيدروكسي succinimide رد فعل اقتران: 2500 إضافة حكمه المولي (جميع التجاوزات المولي المولي تشير إلى فائض في VNP) من فلور اليكسا استر succinimidyl 647 و 4،500 من شبه NHS- PEG (MW 5،000) الذائبة في DMSO لCPMV في 0.1 M البوتاسيوم العازلة الفوسفات. عند العمل مع PVX، إضافة الزائدة 10000 ضرس NHS صباغة وNHS PEG-. ضبط كميات العازلة وDMSO بحيث تركيز النهائي من CPMV وPVX هو 2 ملغ / مل DMSO والمحتوى هو 10٪ من إجمالي حجم رد الفعل. احتضان خليط التفاعل بين عشية وضحاها في درجة حرارة الغرفة بعيدا عن الضوء. CPMV وPVX تضم 300 و1270 lysines عنونة، على التوالي. (ويشار إلى القارئ إلى المراجع التالية لمزيد من القراءة علىالتعديل الكيميائي للCPMV وPVX: 13-15).
- والأصباغ المتقارن PEG لtyrosines من TMV من اقتران الديازونيوم تليها النحاس (I)-حفز أزيد-الكاين الاضافه الحلقيه.
- إعداد الملح الديازونيوم (الكاين) عن طريق خلط 400 ميكرولتر من 0.3 M حمض مونوهيدرات ف تولوين، 25 ميكرولتر من النتريت 3،0 الصوديوم M، و 75 ميكرولتر من المقطر 0.68 M 3 ethynylaniline الذائبة في الأسيتونيتريل في C ° 4 ل 1 ساعة.
- إضافة 3.3 مل من بورات العازلة، ودرجة الحموضة 8.8، يحتوي على 100 ملي كلوريد الصوديوم إلى 1.25 مل من TMV (20 ملغ / مل محلول المخزون).
- الرد على TMV مع 450 ميكرولتر من محلول الديازونيوم (الكاين) الملح في حمام الثلج لمدة 3 ساعة إضافة إلى ربط الكاين التعامل مع TMV من اقتران الديازونيوم. سوف تتحول إلى الحل اللون البني الفاتح. TMV و2140 tyrosines المتاحة للاقتران.
- تنقية المنتج النهائي باستخدام وسادة السكروز كما هو موضح في الخطوة 4.4.
- إرفاق أزيد الوظائف اليكسا فلور 647 وPEG-أزيد (MW 5،000) النقيبز النحاس (I)-حفز أزيد-الكاين الاضافه الحلقيه (CuAAC). إضافة 2 حكمه صبغة وPEG-أزيد في معطف البروتين واحتضان مع كبريتات النحاس 1 ملم 4، 2 AMG ملم، و 2 مم أسكوربات الصوديوم في درجة حرارة الغرفة لمدة 15 دقيقة. ضبط مستوى الصوت العازلة مثل أن تركيز النهائي من رد فعل TMV هو 2 ملغ / مل. (ويشار إلى القارئ إلى المراجع التالية لمزيد من القراءة على التعديل الكيميائي للTMV: 16،17).
- المتقارن الأصباغ لlysines وPEG لcysteines من BMV السيستين متحولة (cBMV):
- إضافة حكمه المولي من 2000 استر ولاية أوريغون 488 الأخضر succinimidyl الذائبة في DMSO لcBMV في 0.1 M TNKM العازلة (50 ملي تريس قاعدة، 50 مم كلوريد الصوديوم، و 10 ملي بوكل، 5 ملم MgCl 2، ودرجة الحموضة 7.4). ضبط كميات العازلة وDMSO بحيث تركيز النهائي من BMV هو 1 ملغ / مل DMSO والمحتوى هو 10٪ من إجمالي حجم رد الفعل. احتضان خليط التفاعل بين عشية وضحاها في 4 درجات مئوية بعيدا عن الضوء.
- تنقية الجزيئات باستخدام centriمرشحات الفطريات والطفيليات كما هو موضح في الخطوة 4.4.
- إضافة 2000 الزائد من المولي PEG-maleimide (MW 2،000) باستخدام نفس ظروف التفاعل كما كان من قبل واحتضان الخليط لمدة 2 ساعة رد فعل عند 4 ° C. cBMV عنده 180 lysines رد الفعل وcysteines. (ويشار إلى القارئ إلى المراجع التالية لمزيد من القراءة على التعديل الكيميائي للBMV: 18).
- تنقية: تمرير الحل من خلال وسادة السكروز 40٪ (W / V) في مقابل 2.5 XG 160000 ساعة. إعادة حل بيليه في المخزن المؤقت. بدلا من ذلك، dialyze ضد العازلة المناسبة باستخدام 10 كيلو دالتون مرشحات تدور قطع.
- توصيف: يتم تحليل VNPs مضاد للفيروسات وfluorescently المسمى التي تستخدم الأساليب المذكورة أعلاه: UV / مرئية التحليل الطيفي، SDS الكهربائي للهلام، FPLC، وTEM (لا يظهر، ومع ذلك، تشير إلى أرقام 6 و 7).
5. الاستهداف الورم والتصوير باستخدام نموذج طعم أجنبي ماوس
- ثقافة HT-29 سرطان القولون خلايا الإنسان في المتوسط RPMI تستكمل مع 5٪ FBS C 1٪ البنسلين الستربتوميسين، و 1٪ الجلوتامين L-عند 37 درجة، في 5٪ CO 2 باستخدام 175 الثقافة الخلية 2 القوارير.
- غسل الخلايا مرتين مع PBS معقمة والحصاد من قبل تفرخ مع 5 مل من التربسين EDTA-C ° 37 في لمدة 5 دقائق. إبطال نشاط التربسين مع 5 مل من المتوسط RPMI. جمع الخلايا بواسطة الطرد المركزي في 500 x ج لمدة 5 دقائق. في 4 درجات مئوية و resuspend RPMI في جديدة على 5x10 المتوسطة cells/50 6 ميكرولتر (تحديد إجمالي عدد خلايا باستخدام عدادة الكريات التريبان الأزرق وأ). الاختلاط مع حجم مساو من matrigel قبل الحقن (منع جميع الحلول والكواشف عقيمة).
- شراء ستة أسابيع من العمر NCR نو / نو الفئران والمحافظة عليها على نظام غذائي البرسيم مجانا لمدة 2 اسابيع. [ملاحظة: جميع الإجراءات الحيوان يجب أن يكون وافق IACUC] تحفز الأعضاء المستمدة من الحيوانات الورم عن طريق الحقن تحت الجلد من 5x10 6 cells/100 ميكرولتر / ورم في جنباته (2 الأورام / الماوس) باستخدام مقياس 18 1/2 العقيمةإبرة. رصد الحيوانات بانتظام. قياس حجم الورم باستخدام الفرجار والسماح للأورام لتنمو إلى حجم متوسط 20 مم 3 (في غضون الأيام ال 12 المقبلة). تعيين الفئران إلى مجموعتين بشكل عشوائي مختلفة: PBS وVNP (ن = 3 حيوانات / مجموعة / الوقت نقطة). باستخدام مقياس 1 مل 28 حقنة الأنسولين، عن طريق الوريد إدارة ميكرولتر الوريد ذيل 100 حقن معقمة PBS أو 10 VNP صياغة ملغم / كغم.
ملاحظة: لن تجارب زراعة الأنسجة والدراسات مع الحيوانات الحية أن تظهر. التدريب العملي على مظاهرة سوف يكون مقصورا على معالجة الأنسجة والحصول على البيانات. للإشارة على الورم HT-29 نموذج طعم أجنبي، وعلى القارئ الرجوع إلى المرجع 19
وتستخدم ثلاث تقنيات لتقييم الورم صاروخ موجه من VNPs:
- مضان التصوير باستخدام نظام تصوير مايسترو: الفئران النحر في نقاط زمنية مختلفة (2، 24، و 72 ساعة) باستخدام CO 2الغاز. تشريح الحيوانات والمكوس جميع الأجهزة الرئيسية (الدماغ والقلب والرئتين والطحال والكلى والكبد) مع الأورام على الجناحين، ضع الأنسجة على parafilm، وتحليل الصك مع التصوير مضان باستخدام الإثارة الصفراء والمرشحات الانبعاثات (800 مللي التعرض) للكشف عن وجود إشارات الفلورسنت في الأنسجة (المستمدة من A647 إلى تسمية مترافق VNPs). حفظ الصور وتحليل شدة الفلورسنت باستخدام يماغيج 1.44o البرمجيات ( http://imagej.nih.gov/ij ). مقارنة نمط من امتصاص VNPs في الأورام مع الأنسجة الرئيسية الأخرى مع مرور الوقت.
- بعد التصوير، وقطع كل الأنسجة في نصف ونصف في تضمين مجمع أكتوبر للتحليل البرد باجتزاء ومتحد البؤر. جمع النصف الآخر في مرحلة ما قبل وزنه البرد قوارير وتجمد على الفور لهم باستخدام السائل N 2. المحل في -80 درجة مئوية حتى على استعداد لمزيد من المعالجة.
- مضان الكمي: إعادةالحبل الأنسجة الأوزان. ذوبان الجليد الأنسجة المجمدة في درجة حرارة الغرفة ووضعها في أنابيب منفصلة 50 مل فالكون يحتوي على 1 مل من برنامج تلفزيوني. باستخدام الخالط الأنسجة محمول وتجانس الأنسجة لمدة 2-3 دقيقة في PBS ثم نقل إلى أنابيب جناسة microfuge. أجهزة الطرد المركزي في الخليط لمدة 10 دقيقة في 13000 XG لإزالة غير المتجانس الأنسجة.
- الماصة 100 ميكرولتر من طاف من الأنسجة من كل مجموعة (PBS VNP وتركيبات / نقاط زمنية) في لوحة سوداء UV 384 أيضا. تقييم كثافة مضان (م ت / م الأطوال الموجية 600/665) باستخدام قارئ لوحة. تطبيع القيم التي تم الحصول عليها من قبل الفلورسنت الأوزان الأنسجة.
- المناعية: إعداد البرد مشراح أقسام (10 ميكرون) وتخزينها في -20 درجة C. وصمة عار أقسام الأنسجة لنوى الخلايا (دابي) وعلامة الخلية البطانية (FITC التي تحمل علامات الماوس المضادة للأجسام المضادة CD31). تنفيذ التحليل المجهري متحد البؤر لتعيين توطين الأوعية الدموية داخل الورم و-OF-VNP fluorescently المسمىق.
ملاحظة: لن يتم هذا الإجراء أثبت، وتظهر بيانات تمثيلية في الشكل 8. للإشارة على والطرق المناعية تلطيخ وصفها، وعلى القارئ الرجوع إلى المرجع 19