1. بناء سلالات تحتوي على FFL-GFP البلازميد
لهذه الدراسة، خميرة الخباز سلالة BY4741 (MAT لذلك، his3Δ1، leu2Δ0، met15Δ0، ura3Δ0) كانت تستخدم جنبا إلى جنب مع سلالة الحذف HSP104 من جمع خروج المغلوب الخميرة (فتح النظم البيولوجية / الحرارية العلمية). تم تأكيد الحذف باستخدام الأجسام المضادة Hsp104 محددة للتحليل لطخة غربية.
وأعرب عن FFL-GFP من p426MET25-FFL-GFP، التي شيدت من مصدر المستندة إلى LEU2 البلازميد التي تم الحصول عليها من المختبر غلوفر في جامعة تورونتو 17 والتي يمكن الحصول عليها عند الطلب للمؤلفين. يتم التحكم تعبير عن انصهار بروتين GFP البلازميد FFL-من قبل MET25 مروج ميثيونين-كظوم. تحولت البلازميد في كل سلالة باستخدام بروتوكول تم تكييفها من GIETZ وآخرون. آل، 1995:
- أجهزة الطرد المركزي 25 مل س و الخلايا مرحلة دخول في أنبوب مخروطي 50 مل في 4،400 دورة في الدقيقة لمدة 2 دقيقة، ويغسل مع 500 ميكرولتر من ضعف المقطر H 2 0 ([ده 2 O)، وتجاهل الطافي.
- Resuspend الخلايا في 250 ميكرولتر من TE / LiAc (تريس، حمض الهيدروكلوريك 10 ملم، ودرجة الحموضة = 7.5، 1 ملم EDTA، 0.1 M خلات الليثيوم). احتضان عند 30 درجة مئوية دون خلط لمدة 20 دقيقة.
- نقل 50 ميكرولتر من الخلايا المختصة إلى أنبوب جديد جنبا إلى جنب مع 5 مل (50 ميكروغرام) من الحمض النووي الناقل و5 ميكرولتر (0،1-5 ميكروغرام) من الحمض النووي البلازميد. إضافة 300 ميكرولتر من PEG / TE / LiAc (نفس TE / LiAc بالإضافة إلى 40٪ البولي ايثيلين جلايكول) إلى هذا الخليط، والخلايا احتضان عند 30 درجة مئوية لمدة 30 دقيقة أخرى.
- إضافة حجم 1/10 (V / V) DMSO (36 ميكرولتر) إلى هذا الخليط والصدمة الحرارية في 42 درجة مئوية لمدة 6 دقائق.
- أجهزة الطرد المركزي الخليط في 6،000 دورة في الدقيقة لمدة 30 ثانية وإزالة الطافي. Resuspend الخلايا في 100 ميكرولتر من العقيمة DDH 2 0 والخلايا لوحة على وسائل الإعلام كاملة الاصطناعية تفتقر اليوراسيل (SC-URA).
2. تحريض FFL-GFP
NT "هو فعل> FFL-GFP الخلايا مرة واحدة في مرحلة السجل بحيث يتم الغالبية العظمى من البروتين قبل للصدمة الحرارة حديثا لتجنب البروتينات التي تم تجميع عناصره من شفائهم مع مرور الوقت بسبب القصور الخلوية الشيخوخة المرتبطة.
- يوم 1: الخلايا احتضان في 5 مل من SC-URA في 30 ° C الدورية O / N.
- يوم 2: قياس OD 600 والثقافات الطازجة تلقيح في 5 مل من SC-URA OD 600 ~ 0.2.
- احتضان الثقافات مع دوران عند 30 درجة مئوية حتى بلوغهم مرحلة دخول OD 600 ~ 0.8-1.0.
- أجهزة الطرد المركزي الخلايا في أنابيب مخروطية 15 مل في 4،400 دورة في الدقيقة لمدة 3 دقائق، صب الطافي و resuspend الخلية بيليه في 500 ميكرولتر من DDH 2 0؛ حل نقل إلى أنبوب microcentrifuge.
- الطرد المركزي في 6،000 دورة في الدقيقة وتجاهل الطافي.
- Resuspend الخلايا في 5 مل من SC-URA-MET. وينبغي حضنت الخلايا الدورية في هذه الوسائط لمدة 1 ساعة عند 30 درجة مئوية.
- خلايا الطرد المركزي وتكرار غسل في DDH 2 0 وتجاهل الطافي.
- Resuspeالخلايا الثانية في 5 مل سائل الإعلام SC-URA تحتوي على 100 ميكروغرام / مل من سيكلوهيكسيميد لكبح بروتين تعبير، والشروع فورا في الخطوة 3.
3. الأنزيمية FFL-GFP استعادة الفحص
هذا الاختبار هو نهج كمي لتحديد مستويات انزيم نشط في عدد السكان.
- التحضير لهذا الفحص:
- قياس OD 600 لكل عينة.
- إعداد المبلغ اللازم من D-وسيفيرين اللازمة بناء على عدد من العينات والمطلوب عدد من مكررات بالإضافة إلى ما يقرب 1،200 ميكرولتر للأنابيب. تركيز النهائي من D-وسيفيرين هو ~ 23 ميكروغرام لكل 100 ميكرولتر من الخلايا. في البداية يتم حله في الماء بتركيز محلول المخزون من 7.5 ملغ / مل وتخفيفه إلى 455 ميكروغرام / مل في SC قبل التجربة. في الشكل 2، وثلاثة مكررات لتم تحليل كل عينة مما أدى إلى ما مجموعه 2.4 مل من D-وسيفيرين المستخدمة.
- برنامج قارئ لوحة للفلاش وميمقايسة nescence (مقتبس من BIOTEK Gen5 "التلألؤ الفحص فلاش مع حقن"؛ لصكوك أخرى اتبع تعليمات الشركة الصانعة)
- ضبط درجة الحرارة إلى 30 ° C
- تعيين قارئ لوحة لإضافة D-وسيفيرين، يهز، وقراءة كل بئر على حدة.
- قراءة التلألؤ (القراءة نقطة النهاية، 5 ثانية الوقت التكامل، ومستوى الحساسية 180)
- لفحص الانتعاش بين كل هزة القراءة لمدة 5 دقائق، وتأخير 20 دقيقة، ويهز في 5 دقائق إضافية.
- الاستغناء عن 50 ميكرولتر من D-وسيفيرين من حاقن.
- يتم قياس التلألؤ سخن للصدمة مباشرة بعد يتم إضافة خلايا إلى وسائل الإعلام التي تحتوي على سيكلوهيكسيميد لوقف تخليق البروتين.
- نقل 100 ميكرولتر من الخلايا لكل عينة مع العدد المرغوب فيه من يعيد إلى مادة صلبة بيضاء 96 لوحة جيدا.
- وينبغي أن تشمل الضوابط فارغة المياه والخلايا التي تحتوي على ناقلات الفارغة.
- ابدأ القراءة مع جمعية مهندسي البترولcifications المذكورة أعلاه.
- لتفسد شاردة FFL من FFL-GFP، احتضان ثقافة مل 5 في أنبوب الثقافة زجاج في 42 ° C الهز لمدة 25 دقيقة.
- انتعاش فحص قراءات التلألؤ تبدأ على الفور بعد إزالة الخلايا من الحاضنة، والتي حان الوقت نقطة الصفر. مقياس التألق نفسها كما هو موضح أعلاه لأول مرة نقطة وكل 30 دقيقة لمدة 90 دقيقة.
- تطبيع عينات لتسخين للصدمة القيم التلألؤ التي تم تعديلها بناء على OD 600 (تقسيم القيم سخن للصدمة من قبل OD 600).
4. المجهر مضان
هذا الاختبار هو وسيلة شبه كمي لتحديد الانحلالية من المجاميع على مر الزمن في عدد السكان من الخلايا.
- الاستقراء هو نفسه كما هو موضح في القسم 2، والخطوات 1-8 من البروتوكولات.
- تؤخذ النقاط نفس الوقت كما هو موضح أعلاه (القسم 3، الخطوة 4)، ولكن لهيئة التصنيع العسكريroscopy جمع 1 مل من الخلايا في سخن للصدمة وكل نقطة زمنية استرداد، وعينات احتضان الدورية عند 30 درجة مئوية في أنبوب الثقافة.
- التصور:
- أجهزة الطرد المركزي 1 مل من الخلايا في 6،000 دورة في الدقيقة لمدة 30 ثانية وإزالة الطافي.
- Resuspend الخلية بيليه في 2 ميكرولتر من DDH 2 O.
- خلط 2 ميكرولتر من الخلايا زائد 2 ميكرولتر من 2٪ منخفضة ذوبان الاغاروز على الشريحة وإضافة انزلاق الغطاء. من أجل الحصول على طائرة واحدة من الخلايا برفق اضغط الإصبع إلى أسفل في وسط من انزلاق الغطاء وتدوير حتى زلة تغطية من الصعب للتحرك.
- الخلايا هي تصور باستخدام هدف النفط 100X على المجهر الفلورسنت، واستخدام مدينة دبي للإنترنت لتصور الخلايا وتصفية FITC لتصور GFP مضان.
- التقاط صور متعددة لكل سلالة في كل نقطة زمنية لتحديد الكميات. يجب الحقول للحصول على صور تحتوي على 15-30 ~ الخلايا لتحليل ما بعد التجريبية الكمي.
- لحساب النسبة المئوية للخلايا التي تحتوي على المجاميع، عد 50مجموع الخلايا -100 وتقسيم عدد من الخلايا التي تحتوي على المجاميع.
5. الميكروسكوب خلية واحدة
وتستخدم هذه الطريقة لمتابعة الانحلالية من المجاميع الفردية في خلية واحدة على مر الزمن.
- لحث FFL-GFP التعبير كما هو موضح في القسم 2، والخطوات 1-8.
- ما بعد الصدمة الحرارية، والخلايا الطرد المركزي في أنبوب مخروطي 15 مل في 4،400 دورة في الدقيقة لمدة 2 دقيقة.
- غسل الخلايا مع 500 ميكرولتر من المياه وresuspend في 20 ميكرولتر من DDH 2 O.
- لكل سلالة، وقطع جزء مم 5X5 لوحة آغار SC-URA واستخدام السطح الذي كان على اتصال مع طبق بتري، ماصة 4 ميكرولتر من الخلايا وانتشارها في جميع أنحاء سطح أجار مع طرف ماصة. اسمحوا الوقوف لمدة 1 دقيقة ~.
- استخدام ملاقط لوضع القسم مكعب أجار وجها لأسفل على ~ 55 مم أسفل الزجاج طبق رقم 0 واضغط لأسفل برفق.
- التصور:
- انظر الأول إلى الثالث في الطائفةأيون 4.
- مجموعة تنسق لمدة 2-4 نقاط الاتصال لكل سلالة اعتمادا على كثافة الثقافة.
- ضبط الكاميرا لالتقاط الصور مع Z-مكدس مع مجموعة مناسبة (- / + 15 ميكرون مع 0.5-1.0 ميكرون شريحة سمك) كل 5 دقائق لمدة دقيقة 90.