في هذه المقالة نقدم رقاقة ميكروفلويديك لتحليل خلية واحدة. أنه يسمح للالكمي للبروتينات الخلايا، والإنزيمات، العوامل المساعدة، ورسله الثاني عن طريق فحوصات الفلورسنت أو المناعية.
مقالة منهجية
في هذه المقالة نقدم رقاقة ميكروفلويديك لتحليل خلية واحدة. أنه يسمح للالكمي للبروتينات الخلايا، والإنزيمات، العوامل المساعدة، ورسله الثاني عن طريق فحوصات الفلورسنت أو المناعية.
نقدم جهاز ميكروفلويديك التي تمكن من تحديد كمية الجزيئات الحيوية داخل الخلايا في الخلايا وحيدة متعددة في نفس الوقت. لهذا الغرض، محاصرون الخلايا بشكل سلبي في منتصف microchamber. عند تفعيل طبقة تحكم، يتم عزل الخلية من حجم المحيطة في غرفة صغيرة. ويمكن بعد ذلك يتم تبادلها حجم المحيطة دون التأثير على الخلايا المعزولة. ومع ذلك، عند فتح وإغلاق قصيرة للغرفة، والحل في غرفة يمكن استبدالها في غضون بضع مئات من ميلي ثانية. ويرجع ذلك إلى العودة إلى الوراء من الغرف، والخلايا يمكن أن يتعرض لها حلول مختلفة بالتتابع بطريقة التحكم الى حد كبير، على سبيل المثال للحضانة، والغسيل، وأخيرا، تحلل الخلية. وmicrochambers مغلقة بإحكام تمكين الاحتفاظ المحللة، وتقليل والسيطرة على التخفيف بعد تحلل الخلية. منذ تحلل والتحليل تحدث في نفس المكان، ويتم الاحتفاظ حساسية عالية لأنه لا يوجد مزيد من دilution أو فقدان التحاليل يحدث أثناء النقل. وبالتالي فإن تصميم microchamber يتيح تحليل موثوق بها وقابلة للتكرار من الأرقام نسخة صغيرة جدا من الجزيئات داخل الخلايا (attomoles، zeptomoles) صدر من الخلايا الفردية. علاوة على ذلك، يمكن ترتيب العديد من microchambers في شكل مجموعة، والسماح للتحليل العديد من الخلايا في آن واحد، نظرا إلى أن تستخدم الأجهزة البصرية مناسبة للرصد. وقد استخدمنا بالفعل منصة لإثبات صحة مفهوم الدراسات لتحليل البروتينات داخل الخلايا، والإنزيمات، العوامل المساعدة والمرسلين الثاني بطريقة قابلة للقياس الكمي إما النسبية أو المطلقة.
وقد كشفت العديد من الدراسات في الماضي خلية الى خلية الخلافات بين السكان زنزانة كبيرة 1-3، ولا سيما إشارات العمليات 4، أو مبالغ الجزيئات الحيوية مثل البروتينات داخل الخلايا 5،6، الأيض، والعوامل المساعدة 7،8. وتعتبر هذه التغاير أن يكون أهمية أساسية للتكيف الخلايا والتطور 9، ولكن أيضا أن تلعب دورا رئيسيا في ظهور والعلاج من الأمراض مثل السرطان 10-13. وبالتالي، دراسات على مستوى خلية واحدة هي من الفائدة المرتفعة في الأبحاث البيولوجية والدوائية، وخاصة إذا تكشف هذه الدراسات ردود مختلفة من الخلايا بعد العلاج مع المواد الكيميائية النشطة بيولوجيا.
في السنوات الأخيرة، وقد وضعت العديد من المنصات التحليلية التي تسهل تحليل الخلايا الحية واحدة أو التركيب الكيميائي لمحتوى الخلية. بينما الفلورسنت خلية تنشيط الفرز (FACS) هو الذهب الحادي وANDARD لتحليل الإنتاجية العالية جدا من الخلايا الحية واحدة، وطريقة لا يمكن أن تستخدم لتقدير حجم المركبات داخل الخلايا أو يفرز. وقد وعدت ظهور منصات ميكروفلويديك استراتيجيات تحليلية جديدة لتحديد المواقع، والمعالجة والمراقبة للخلايا واحدة. وتم التوصل إلى علامة فارقة في على microfluidics مع دمج PDMS مرن الصمامات التي حققتها الزلزال وزملاء العمل 14،15. هذه الصمامات هي مفيدة لأنها يمكن عزل مناطق في الرقاقة، مثل فصل ثقافتين 16. علاوة على ذلك، كانت قابلة للتطبيق وخاصة بالنسبة للتحليل خلية واحدة، وبالتالي يساعد على تقليل المشاكل التخفيف تحليلها. قوة هذا النهج للتحليل وحيدة الخلية وقد تجلى مؤخرا من قبل هانسن وزملاء العمل، الذي حلل التعبير الجيني من مئات الخلايا واحد في نفس الوقت 17.
عند استهداف البروتينات ونواتج الأيض، وتحليل أمر صعب جدا نظرا لعدم وجود مناسبةطرق mplification، وعدد كبير من مركبات مختلفة الحاضر، والاختلافات في الطبيعة الكيميائية. علاوة على ذلك، من المتوقع أن تكون موجودة بأعداد نسخة منخفضة في حدود بضع عشرة آلاف الجزيئات الحيوية داخل الخلايا 18 الأكثر، وبالتالي الطريقة التحليلية المستخدمة يجب أن يكون لديك حساسية عالية. فحوصات أكثر قوة مثل المناعية والمناعية انزيم مرتبط (ELISA) يصعب على الاندماج في الأجهزة ميكروفلويديك لأنها تتطلب العديد من الخطوات الغسيل والحضانة وكذلك تجميد السطح.
نظرا لهذه التحديات، فإنه ليس من المستغرب أن تم الإبلاغ سوى أمثلة قليلة حيث تم كميا البروتينات او نواتج على مستوى خلية واحدة. على سبيل المثال، تم الإبلاغ عن دراسات على إفراز مركبات الفلورسنت 19،20. في الآونة الأخيرة، وقدم مع تنفيذ ELISA لتحليل يفرز (nonfluorescent) البروتينات من ثقافة الخلية (الخلايا THP-1) 21 واحد (طمناعية) الخلايا 10. استهداف البروتينات داخل الخلايا، شي وآخرون. تطوير جهاز ميكروفلويديك التي سهلت تحديد البروتينات داخل الخلايا لتحليل مسارات الإشارات في الخلايا السرطانية عن طريق والمناعية 11. ومع ذلك، تم تحديد كميات النسبية فقط من البروتينات، وكان يستخدم أي التضخيم الأنزيمية لزيادة إشارة للبروتينات وفرة منخفضة.
في الآونة الأخيرة، كنا قادرين على الجمع بين محاصرة microdevice وحيدة الخلية مع المقايسات المناعية مضان 8 و 22 (الشكل 1). محاصرون الخلايا بشكل سلبي في الهياكل عقبة microsized، والتي تسمح العرض والصرف (السريع) من العوامل الكيميائية الأخرى المتوسطة ودون أي حركة الخلايا. صمام على شكل حلقة حول كل فخ يمكن عزل الخلية في حجم صغير جدا ("وmicrochamber"). وهذا صمام دفعتها مباشرة بعد إدخال عازلة الخلايا lysing (hypoosmolar)، وقال انهالامتحانات التنافسية الوطنية ومنع الجزيئات داخل الخلايا أو الجزيئات يفرز لنزع فتيل بعيدا. الأهم من ذلك، ونظرا لصغر حجم وحدة التخزين (625 رر) يتم تجنب تخفيف كبير من الجزيئات. علاوة على ذلك، منذ يتم تنفيذ تحلل والتحليل في في نفس الموقف في رقاقة، ليست هناك خسارة من analytes بسبب النقل. تصميم رقاقة الموصوفة هنا تضم 8 صفوف بالتناوب إما 7 أو 8 microchambers، بلغ مجموعها 60 microchambers. ودفعتها في غرف الصفوف، بحيث تنتفي صفة انتقال التلوث على طول الخط.
منصة يمكن استخدامها في تركيبة مع المقايسات مضان فضلا عن المقايسات المناعية (الشكل 1D). لهذا الأخير، أنشأنا بروتوكولات لتجميد الأجسام المضادة، التي تتوافق مع إنتاج رقاقة وعملية التجميع. وبالتالي منصة يفتح الطريق لفحوصات حساسة وموثوقة وقابلة للقياس الكمي على مستوى خلية واحدة. حتى الآن، وقد استخدمنا جهاز لتحليل طالانزيمات ntracellular ويفرز (الكمي النسبي الذي المقايسات الأنزيمية)، العوامل المساعدة داخل الخلايا والبروتينات والجزيئات الصغيرة (الكمي المطلق من قبل المقايسات نقطة النهاية أو ELISA). في ما يلي، ونحن تصف عملية تصنيع رقاقة عن طريق الطباعة الحجرية الناعمة متعدد الطبقات وبروتوكولات لالزخرفة من الأجسام المضادة عن طريق microcontact الطباعة والكيمياء السطح. بالإضافة إلى ذلك، يتم إعطاء بعض الأمثلة على استخدام رقاقة والعمليات.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
1. SU-8 تلفيق ماستر
إعداد كل من القوالب الرئيسية لقنوات (فلويديك والسيطرة، لالخطط وأبعاد انظر الشكل 2) مع بروتوكول التالي ولكن مع أنماط مختلفة قناع. يظهر عملية في الشكل 3A.
2. تصنيع رئيسية لmicrocontact الطباعة
3. تصنيع رقاقة ميكروفلويديك
ويستخدم تصميم الجهاز من طبقتين لهذه التجارب. يتم إعداد الطبقتين على حدة ومستعبدين معا، قبل المستعبدين رقاقة أخيرا على شريحة زجاجية (الشكل 3B). ويصف هذه الخطوة إنتاج PDMS طبقات وختم PDMS لmicrocontact الطباعة.
4. الترابط لزجاج الشرائح
لاستخدام الجهاز لفحوصات الأنزيمية المباشر، فإن الخطوة الوحيدة المطلوبة بعد الترابط هو حجب السطوح. لهذا البروتوكول، انتقل إلى A. ومع ذلك، لاستخدام رقاقة ميكروفلويديك لالمناعية أو ELISAs، يرجى الرجوع إلى بروتوكول B للحد من مواقع الربط فقط على شريحة زجاجية (أي للفحص المجهري TIRF أو SPR). إذا كان هذا التقييد ليست مهمة، تشير إلى A، ولكن استخدام تقارن البيروكسيديز في الخطوة 4.3 وتابع مع الخطوة 4.8في بروتوكول B لخلق سطح ظيفية بالكامل.
قبل تنفيذ بروتوكول A و B: ومن المستحسن لتصفية كل الحلول البروتين المستعملة قبل تعريفهم في رقاقة. الحطام والركام البروتين قد منع وإلا الفخاخ الخلية، مما يؤدي إلى خفض عدد الدوائر التي يمكن استخدامها للتحليل. لهذا الغرض، واستخدام وحدة التكثيف اللابروتيني مرشح لتصفية كل الحلول قبل ادخالها في القنوات.
بروتوكول A (المقايسات الأنزيمية)
بروتوكول B (المناعية)
لمحة كاملة من تعديل السطح من الخطوة 4.7 فصاعدا، يرجى الرجوع إلى الجدول رقم 1.
5. تجارب الخلايا
هو مكتوب البروتوكول بصفة عامة بسبب مجموعة متنوعة من فحوصات ممكن. كمثال ترد الكواشف اللازمة لفحص السمية G6PDH. الخلية محاصرة الكفاءة الأولي من الجهاز هو حوالي 2.5٪، أي سيتم المحاصرين 5 من أصل 200 خلية. إشغال النهائي من الفخاخ الخلية تعتمد بقوة على خط الخلية المستخدمة، وبروتوكول لتعليقخط الخلية والوقت يتم مسح الخلايا من خلال القناة. للخلايا تنمو بصورة طبيعية في التعليق (مثل U937)، والخلايا واحدة يمكن العثور عليها في نحو 75٪ من الغرف بعد بضع دقائق. إما لا شغل غرف أخرى أو المحتلة من قبل اثنين أو أكثر من الخلايا. بشكل عام، وشغل وحيدة الخلية أصغر لخطوط الخلايا الملتصقة. عند استخدام بروتوكول بتوقيف خفيفة بدلا المعروضة هنا، يقلل من نسبة 30٪ إلى حوالي (كلوة الجنين البشري، وخلايا MLT). يمكن تحسين الإشغال وحيدة الخلية عن طريق العلاج التربسين من الخلايا، ولكن هذا قد تغير أيضا نتائج التجارب.
اعتمادا على الجزيء المستهدف، والامتزاز أو الامتصاص لPDMS يمكن أن تؤثر على النتائج. ويمكن تخفيض امتصاص من خلال منع الأسطح مع BSA أو PLL-G-PEG. امتصاص غير المحتمل بالنسبة لمعظم الجزيئات الحيوية ماء، ولكن يجب أن يكون محددا لل(صغيرة) مكونات الخلية محبة للدهون.
بروتوكول A (المقايسات الأنزيمية)
ملاحظة: اختر أي العازلة الذي هو مناسبة للمقايسة، ولكن عارية في الاعتبار أن المنظفات القوية (مثل تريتون، SDS) الخلايا ليز على الفور، وسوف يؤدي إلى فقدان الحليلة خلال افتتاح القاعة.
بروتوكول B (المناعية)
للحصول على وصف قصير من التجارب ELISA الخلية (معدلات التدفق، والوضع غرفة، الخ)، يرجى الرجوع إلى الجدول رقم 1.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
برنامجنا هو قادرا على تحليل مجموعة متنوعة من الخلايا وكذلك جزيئات يفرزها موجودة في أو التي تنتجها الخلايا واحد. هنا، نود أن تقديم دراسات سبيل المثال مختلفة للتأكيد على مجموعة متنوعة من فحوصات ممكن. وسنقدم مثالا للانزيم يفرز (الشكل 5A)، وكذلك انزيم داخل الخلايا (الشكل 5B) والبروتين (أرقام 5C ود). لمزيد من الأمثلة، مثل العوامل المساعدة أو الجزيئات الصغيرة، يرجى الرجوع إلى يير وآخرون (2012) ويير وآخرون (2013).
<...الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
وقد فتحت التكنولوجيا على microfluidics إمكانيات جديدة ورائعة للتحليل وحيدة الخلية. على وجه الخصوص، وإمكانية اعتراض وشل الخلايا بشكل فردي عن طريق أدوات ميكروفلويديك سمحت دراسات منهجية على المدى القصير والطويل على خصائص وحيدة الخلية والاستجابة لها. بالإضافة إلى ذلك، التغليف من الخلايا في microdroplets عالية التردد، ولدت على رقاقة، مكنت الدراسات إفراز خلية واحدة، والتي لا يمكن أن يؤديها مع أجهزة الخلوي التقليدية. النهج microdroplet، ومع ذلك، لديها بعض القيود عندما يطلب الحضانة وغسل ا...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
يعلن الكتاب أنه ليس لديهم مصالح مالية المتنافسة.
والكتاب الامتنان توم روبنسون للقراءة دليل على المخطوطة، C. BÄRTSCHI وH. بنز لبناء نظام مراقبة ضغط مبنية خصيصا. نود أيضا أن نعترف استخدام مركز المجهر الضوئي (LMC)، وكلاهما في ETH زيورخ أول مرفق غرفة نظيفة و. وقد تم تمويل هذا العمل من قبل شركة ميرك سيرونو ومجلس البحوث الأوروبي (ERC) في إطار برنامج الإطار 7 (ERC ابتداء غرانت، المشروع رقم 203428، nμLIPIDs).
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| <قوي> الكواشف: < / قوي> | |||
| اسم | تعليقات رقم كتالوج شركة | الكاشف (اختياري) | |
| SU-8 2015 | MicroChem Corp. (Netwon ، MA) | n.a.1H | |
| ، 1H ، 2H ، 2H - Perfluorodecyl-dimethylchloro-silane | ABCR (كارلسروه ، ألمانيا) | AB103608 | |
| 4-Methylumbelliferyl & beta ؛ -D-N ، N′-diacetylchitobioside hydrate | Sigma Aldrich | M9763 | |
| Acetone | Merck VWR (دارمشتات ، ألمانيا) | 100014 | |
| Avidin | AppliChem (Axon Lab AG) | A-2568 | |
| AZ 1518 | AZ Electronic Materials (فيسبادن ، ألمانيا) | n.a.AZ | |
| 726 المطور | AZ Electronic Materials (فيسبادن ، ألمانيا) | n.a. | |
| ألبومين مصل الأبقار | Sigma Aldrich | A-4503 | |
| ألبومين مصل البقر ، البيوتين | Sigma Aldrich | A-8549 | |
| عازلة تفكك الخلايا | Invitrogen | 13151-014 | |
| Hexamethyldisilazane (HDMS) | Sigma Aldrich | 40215 | |
| حمض الهيدروكلوريك | Fluka | 84422 | |
| Isopropanol | Merck VWR (دارمشتات ، ألمانيا) | 109634 | |
| سداسي هيدرات كلوريد المغنيسيوم | Fluka | 63068 | |
| MR مطور 600 | Microresist technology GmbH (برلين ، ألمانيا) | n.a.PBS | |
| Invitrogen | 10010-031 | ||
| PLL-g-PEG المطعمة | SuSoS ، (Dü بندورف ، سويسرا) | n.a.PLL-g-PEG | |
| البيوتين المطعمة | SuSoS ، (Dü بندورف ، سويسرا) | n.a.كلوريد | |
| البوتاسيوم | فلوكا | 60132 | |
| بروتين G ، البيوتين | سيجما فاين كيماويات | 41624 | |
| رقاقة السيليكون | Si-Mat (Kaufering ، ألمانيا) | n.a.Sylgard | |
| 184 سيليكون المطاط الصناعي كيت (PDMS) | داو كورنينج | 39100000 | |
| تريس (هيدروكسي ميثيل) - أمينوميثان | بيوراد | 1610716 | |
| Tween 20 | Biorad | 1706531 | |
| EQUIPMENT: < / strong> | |||
| اسم المادة | كتالوج | الشركة تعليقات (اختياري) | |
| 0.22 & micro ؛ م PES حقنة مرشح | TRP | 99722 | |
| 1 / 1.5 مم خزعة لكمة | Miltex ، يورك PA | 33-31AA / 33-31A | |
| مرشح خلية Trics 20 & micro ؛ m | Partec | 04-004-2325 | |
| جهاز طرد مركزي Sigma 3-18K | Kuehner | n.a.Hotplate | |
| HP 160 III BM | Sawatec ، ساكس ، سويسرا | n.a.MA-6 | |
| محاذاة قناع | Karl Suess | n.a.Multizoom | |
| AZ100M مجهر | نيكون شركة | نيكون n.a.Photomask | |
| Microlitho ، إسيكس ، المملكة المتحدة | n.a | ||
| منظف البلازما PDC-32G | Harrick | n.a.Spin | |
| Coater Modell WS-400 BZ-6NPP / LITE | Laurell | n.a.Spin | |
| Modules SM 180 BM | Sawatec ، Sax ، سويسرا | n.a.Step | |
| profiler Dektak XT Advanced | Bruker | n.a.مضخة | |
| حقنة و MESYS | Cetoni | n.a. |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن