مقالة منهجية

التداخل الحيوي طبقة لقياس حركية البروتين البروتين التفاعلات والآثار تفارغي يجند

DOI:

10.3791/51383

⸱

فبراير 18, 2014

 , 
1Department of Biochemistry and Molecular Biology, SUNY Upstate Medical University

في هذه المقالة

ملخص

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

البروتوكولات هنا وصف المقايسات الحركية للتفاعلات البروتين البروتين مع بيو طبقة التداخل. F-نوع ATP سينسيز، التي تشارك في استقلاب الطاقة الخلوية، يمكن تحول دون الوحيدات ε في البكتيريا. تكيفنا الحيوي طبقة التداخل لدراسة التفاعلات المعقدة للالحفاز مع المثبطة-C محطة مجال ε ل.

الملخص

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

وصفنا استخدام بيو طبقة التداخل لدراسة التفاعلات المثبطة للالوحيدات ε مع مجمع الحفاز كولاي ATP سينسيز. البكتيرية نوع F-ATP سينسيز هو الهدف من المضادات الحيوية الجديدة، وافقت ادارة الاغذية والعقاقير لمكافحة السل المقاوم للأدوية. فهم البكتيريا محددة لصناعة السيارات في تثبيط سينسيز ATP من قبل المجال-C محطة من الوحيدات ε يمكن أن توفر وسيلة جديدة لاستهداف إنزيم لاكتشاف أدوية مضادة للجراثيم. المجال-C محطة من ε تخضع لعملية تغيير متعلق بتكوين دراماتيكية عندما التحولات انزيم بين الدول النشطة وغير النشطة، وبروابط الموقع الحفاز يمكن أن تؤثر على أي من التشكل ε هو السائد. التدابير مقايسة حركية ε في ملزمة / التفكك مع مجمع الحفاز، وبشكل غير مباشر الشرق الأوسط وأفريقياسورس التحول من ربط إنزيم ε من وإلى التشكل المثبطة يبدو nondissociable. إشارة التداخل الحيوي طبقة ليست حساسة بشكل مفرط لتكوين الحل، لذلك يمكن أن تستخدم أيضا لرصد الآثار تفارغي من موقع بروابط الحفاز على التغييرات متعلق بتكوين ε ل.

المقدمة

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

البروتين البروتين التفاعلات مهمة لكثير من العمليات البيولوجية، واستخدمت وسائل بصرية خالية من التسمية مثل السطحية بلازمون الرنين (SPR) في المختبر لدراسة حركية ملزمة والتفكك 1. معظم طرق خالية من التسمية لشل حركة جزيء حيوي واحد على سطح أجهزة الاستشعار واستخدام الإشارات الضوئية للكشف عن شريك ملزم من الحل لأنه يربط مع جزيء حيوي يجمد 1. بينما SPR هو طريقة حساسة للغاية، هو عرضة للتدخل بسبب التغيرات في معامل الانكسار من الحل تتدفق على الاستشعار 2. وإن لم يكن حساسة مثل SPR، بيو طبقة التداخل (BLI) وأقل تأثرا بالتغيرات في تكوين العينة 1،3. يستخدم BLI أجهزة الاستشعار الألياف البصرية التي لها طلاء حيويا الملكية في الطرف. النظام المستخدم هنا (محاذية-RED96) يحتوي على ثمانية طيفي. يضخ الضوء الأبيض إلى صف تحقيقات التي تتحرك على الذراع الروبوتية. أجهزة استشعار الألياف البصرية عاختار البريد من قبل تحقيقات وانتقل الى لوحة 96 جيدا تحتوي على عينات. ويجمد واحدة من الجزيئات المستهدفة على سطح جهاز الاستشعار البيولوجي. ثم يتم نقل أجهزة الاستشعار لآبار تحتوي على الشريك ملزم في الحل. BLI تراقب جمعية الشريك ملزم مع جزيء يجمد، ثم تراقب التفكك بعد تحريك أجهزة الاستشعار لحل دون شريك ملزمة. ملزمة للجزيئات على سطح جهاز الاستشعار البيولوجي يؤدي إلى تغييرات في التدخل البصرية بين موجات الضوء التي تعكس مرة أخرى إلى طيفي من السطح الداخلي والخارجي من واجهة بين أجهزة الاستشعار والحل. هذه التغييرات في التدخل يمكن قياسها كميا، وتستخدم لتحديد معدلات الحركية للملزم والتفكك، على النحو الموجز في الرسوم المتحركة من الشكل 1.

لقد طبقنا BLI لقياس التفاعلات المعقدة بين الحفاز سينسيز ATP البكتيرية والوحيدات ε، والتي يمكن لصناعة السيارات في تثبيط الانزيم. ATP سيnthase هو nanomotor جزءا لا يتجزأ من الغشاء الدوارة التي يحفز التوليف والتحلل من ATP 4. مجمع الحفاز (F 1) يمكن أن تكون معزولة في شكل قابل للذوبان الذي يعمل بمثابة أتباز. الوحيدات ε اثنين من المجالات: المجال N-محطة (الأمراض الاستوائية المهملة) ضروري لتجميع المناسبة واقتران وظيفية للانزيم ولكن لا تتفاعل مباشرة مع مفارز الحفاز؛ المجال C-محطة (CTD) يمكن أن تمنع الانزيم من خلال التفاعل مع مفارز الحفاز متعددة 5،6. هذا التنظيم هو بوساطة ε محددة لsynthases ATP البكتيرية وليس لوحظ في نديد الميتوكوندريا. وقد برزت ATP سينسيز كهدف للأدوية المضادة للبكتيريا، كما هو مبين من قبل ادارة الاغذية والعقاقير الموافقة الأخيرة من bedaquiline لعلاج السل المقاوم للأدوية 7. وبالتالي، واستهداف دور ε في المثبطة لاكتشاف المخدرات يمكن أن يسفر عن مضادات الجراثيم التي لا تمنع ATP سينسيز الميتوكوندريا. مع مجمع الحفاز معزولة (F 1)، εيصبح سهل التفريق الوحيدات. ومع ذلك، مع ε بد أن F 1، يمكن للεCTD الخضوع لتغيير متعلق بتكوين دراماتيكية، وإدراج جزئيا في تجويف المركزي الإنزيم وتكوين دولة المثبطة التي من غير المرجح أن تنأى مباشرة 6،8. نستخدم BLI لقياس حركية F 1 / ε ملزمة والتفكك، وبشكل غير مباشر، لدراسة الآثار تفارغي من موقع الحفاز لبروابط على التشكل وε.

في نظامنا، ε تم اختياره لتجميد على سطح مستشعر منذ إشارة BLI (مثل SPR) حساس للكتلة جزيئات ملزمة على السطح. الوحيدات ε صغير (15 كيلو دالتون ~) نسبة إلى الرئيسية F 1 مجمع (347 كيلو دالتون ~). وبالتالي، فإن أكبر إشارة BLI تنجم عن ربط F 1 إلى ε يجمد. من أجل رصد F 1 التفكك، والتي يمكن أن تكون بطيئة جدا، ε يجب أن يجمد بشدة. هكذا اخترنا أن biotinylate؛ وشل على أجهزة الاستشعار streptavidin المغلفة. البروتينات يمكن المعقدة البيروكسيديز بنسبة (ط) التعديل عشوائية من سطح lysines 9، (ب) رد فعل السيستين الأصلي أو هندسيا فريدا مع البيوتين maleimide كاشف 10 أو (ج) مضيفا راثيا الببتيد البيوتين متقبل معين يتم المعقدة البيروكسيديز خلال إنزيمي في التعبير المجراة من البروتين الموسومة 11. في نظامنا، والمعقدة البيروكسيديز ε باستخدام طريقة (ج) 8. بمجرد يجمد الموسومة البيوتين ε على أجهزة استشعار streptavidin، يمكن BLI قياس ملزمة وتفكك F 1 التي تم المنضب من الوحيدات ε (F 1 (ε)). للتجارب الموصوفة هنا، قد تم القيام به المقايسات الأولية لتحديد كميات معقولة من البروتين البيروكسيديز لشل على أجهزة الاستشعار. هذا يمكن أن تختلف، اعتمادا على الوزن الجزيئي للبروتين وشريك ملزمة لها، ولكن الهدف هو تحديد كمية ضئيلة من البروتين يجمد ريوفر قبعة (ط) مقبولا الإشارة إلى الضوضاء لحركية ملزمة مع تركيز منخفض من الشريك ملزم (K تحت D) و (ب) الحد الأدنى من التشويه من حركية ملزم مع تركيز تشبع بالقرب من الشريك ملزمة. أيضا، قد تختلف العناصر المتفاعلة من biotinylation (ولكن تجنب> 1 مول البيوتين / البروتين مول)، لذلك قد تكون هناك حاجة إلى بعض الفحص الأولي لكل دفعة جديدة من البروتين البيروكسيديز للتأكد من أن إشارة BLI متسقة يمكن أن يتحقق خلال تجميد على streptavidin المغلفة أجهزة الاستشعار.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

البروتوكول

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. برمجة صك BLI الفحص

بدوره على الصك ساعة واحدة على الأقل في وقت مبكر للسماح للمصباح في عملية الاحماء، وهذا أمر ضروري للحد من الضوضاء والانجراف في الإشارات الضوئية أثناء التجربة. ضبط درجة الحرارة المطلوبة من خلال علامة التبويب أداة لprewarm حامل لوحة العينة. ثم إعداد التصميم التجريبي في البرنامج الحصول على البيانات. حدد "جديد حركية التجربة" في علامة التبويب معالج التجربة. هذا يمثل القائمة كلفه مع جميع الخطوات التي يجب أن تكون محددة.

1.1. لوحة تعريف

تعريف الأعمدة ليتم استخدامها على لوحة عينة 96 جيدا. تعيين الأعمدة لاحتواء العازلة، البروتين يجمد أو شريك ملزمة. لكل جمعية جيدا، أدخل تركيز شريك ملزمة لاستخدامها. ملاحظة: تعريف لوحة هو مبين في الشكل 2 لديها خيارات لفحوصات متميزة.

1.2. فحص الوضوح

ontent "> تعريف جميع الخطوات اللازمة لفحص وتشمل هذه (ط) الأساس (عدة)، (ب) جاري التحميل، (ج) جمعية و (iv) التفكك لشريك ملزم، ثم كما هو موضح أدناه، ربط خطوات الفحص الفردية مع أعمدة من الآبار على لوحة عينة عن طريق تحديد الخطوة مقايسة ثم النقر المزدوج على العمود منها. هذه البرامج على أجهزة استشعار يمكن نقلها من عمود واحد من الآبار إلى أخرى أثناء الفحص.

  1. خط الأساس
    تبدأ خطوة أساسية موجزة (≥ 60 ثانية)، مع أجهزة الاستشعار في المخزن فحص (الشكل 2، العمود 1)، لإنشاء إشارات BLI الأولية في لوحة 96 جيدا.
  2. تحميل (شل حركة البروتين البيروكسيديز على أجهزة الاستشعار)
    تعيين أجهزة الاستشعار لآبار التي سوف تحتوي على البروتين البيروكسيديز (الشكل 2، العمود 2). استخدام وظيفة عتبة لتحقيق مستوى محدد سلفا من ملزمة (انظر المقدمة). تعيين الخيار عتبة حتى يتسنى لجميع أجهزة الاستشعار ستكون الخطوةد إلى العمود التالي من الآبار عند أي واحد من أجهزة الاستشعار تصل إلى العتبة.
  3. خط الأساس
    وتشمل خطوة أخرى أساسية في المخزن (الشكل 2، العمود 3؛ عادة> 5 دقائق) ليغسل البروتينات البيروكسيديز nonimmobilized من أجهزة الاستشعار وإنشاء، وإشارات خط الأساس مستقرة جديدة. لفحوصات ملزمة / التفكك الأساسية فقط (كما في الشكل 3)، وتشمل خطوة إضافية الأساس (60 ثانية) مع أجهزة الاستشعار في آبار جديدة من العازلة (الشكل 2، العمود 4) قبل الخطوة الرابطة.
  4. جمعية (الشريك ملزمة للبروتين يجمد)
    لالملزمة / تفارق مقايسة الأساسية (كما في الشكل 3)، حدد مجموعة من تركيزات شريك ملزمة لاستخدامها لمختلف أجهزة الاستشعار / الآبار (الشكل 2، العمود 5). ضبط الوقت خطوة بحيث لا يقل تركيز تشبع من الشريك ملزم ينبغي الاقتراب التوازن إشارة ملزمة. لفحص لاختبار آثار تفارغي من بروابط صغيرة على التفكك من مجمع البروتين البروتين (كما في الشكل 5)، حدد تركيز عال من شريك واحد ملزم (~ 10 أضعاف فوق يقدر K D) للاستخدام في جميع الآبار الجمعيات.
  5. التفكك (الشريك ملزم)
    لالملزمة / تفارق مقايسة الأساسية فقط (كما في الشكل 3)، تعيين أجهزة استشعار للعودة إلى العمود 4 (الشكل 2)، وهو نفس الآبار العازلة المستخدمة لخط الأساس اضافية قبل جمعية. لفحص لاختبار آثار تفارغي من بروابط صغيرة، بدلا من ذلك تعيين أجهزة استشعار للانتقال إلى العمود 6 (الشكل 2)، حيث يمكن أن تحتوي على كل بئر عازلة بالإضافة إلى بروابط تفارغي مختلفة.

1.3. استشعار الواجب

تشير إلى مواقع في علبة الاستشعار التي سوف تحتوي على أجهزة استشعار prewetted للمقايسة. تحديد أي مواقف فارغة منذ التجربة سوف FAIل إذا لم يتم اختيار أجهزة الاستشعار فوق.

1.4. تجربة الاستعراض

تصور جميع الخطوات المخطط لها للتحقق من الأخطاء والعودة الى تصحيحها.

1.5. تشغيل التجربة

أدخل التفاصيل الضرورية، بما في ذلك موقع ملفات البيانات. أدخل درجة الحرارة المطلوبة للتجربة. إذا كانت أجهزة الاستشعار لا تزال تتطلب prewetting، حدد الخيار لتأخير بدء التجربة. أخيرا، مرة واحدة كل إعداد العينات كاملة (الخطوة 2) ويتم تحميل كل من لوحة عينة وصينية الاستشعار في الصك، انقر فوق الزر انتقال لتشغيل الفحص.

2. تحضير العينة

  1. إعداد مقايسة العازلة المناسبة. العازلة المستخدمة في التجارب هو مبين في الأرقام 3 و 5: 20 ملي اجتماعات الأطراف (3 - (N-Morpholino) حمض propanesulfonic)، تريس (تريس (هيدروكسي) الميثان الأمينية) (المضافة لضبط درجة الحموضة إلى 8.0)، 50 ملي بوكل. وتشمل BSA (ألبومين المصل البقري، الدهنية حمض الحرة، 0.5ملغ / مل النهائي) في المخزن المؤقت لجميع خطوات الفحص وللجميع التخفيفات من البروتين البيروكسيديز أو شريك ملزمة للحد ملزمة غير محدد من البروتينات إلى أجهزة الاستشعار.
  2. يخفف من البروتين البيروكسيديز (ε) في المنطقة العازلة مقايسة إلى التركيز المناسب (انظر المقدمة).
  3. تحضير التخفيفات الشريك ملزم (F 1 (ε)) في المخزن فحص (انظر مناقشة لمجموعة من تركيزات لاستخدام).
  4. Prewet أجهزة الاستشعار streptavidin المغلفة لمدة 10 دقيقة على الأقل لإزالة طلاء واقية السكروز. إزالة رف المحتوية على الاستشعار من درج أجهزة الاستشعار وإدراج لوحة 96 جيدا في الجزء السفلي من الدرج، وانزلاق زاوية واحدة من لوحة إلى الشق توجيههم على الدرج. للعمود من أجهزة الاستشعار لاستخدامها، إضافة 200 ميكرولتر من العازلة الفحص لكل بئر في هذا العمود من لوحة 96 جيدا. العودة رف من أجهزة الاستشعار لعلبة في الاتجاه الصحيح (مع علامات التبويب في فتحات).
  5. كما تم تعيينها خلال البرمجة في الخطوة 1، وملء الآبار سو لوحة عينة مع العازلة مقايسة أو التخفيفات المناسبة من البروتين، كما في الشكل 2. تجنب إدخال فقاعات، لأنها يمكن أن تسبب الضوضاء في إشارة الضوئية. تشمل واحدة أو أكثر الآبار التي حذفت إشارة إما (ط) المعقدة البيروكسيديز البروتين أو (ب) شريك ملزمة.
  6. فتح باب الصك وتضاف علبة استشعار على خشبة المسرح (يسار)، مع علامات التبويب علبة لإدراجها في فتحات المرحلة. إدراج لوحة العينة في حامل لوحة (يمين)، تأكد من أن لوحة مسطحة ويجلس في الاتجاه الصحيح، كما هو مبين على حامل لوحة. يغلق الباب ويبدأ الفحص من البرنامج الحصول على البيانات (الخطوة 1.5).

3. معالجة المعلومات

  1. بعد تشغيل الفحص، افتح البرنامج تحليل البيانات وتحميل المجلد الذي يحتوي على البيانات. انقر على "معالجة" التبويب لرؤية قائمة تدريجي تجهيز (في اليسار) والبيانات الخام الحركية، مع كل أجهزة الاستشعار (ه) تعيين لون مختلفة (انظرالشكل 3).
  2. تحت عنوان "اختيار البيانات"، انقر فوق الزر "الاستشعار التحديد". على "نموذج لوحة الخريطة"، بتعيين الآبار لل1 أو 2 أجهزة استشعار مراقبة (G، H في مقايسة من الشكل 3)، والآبار المرجعية. في القائمة التحميل، حدد المربع "الطرح" وحدد "مرجع ويلز" لطرح إشارة مرجعية (واحد أو متوسط) من كل إشارة استشعار الآخر.
  3. محاذاة كل أثر لY = 0 باستخدام "محاذاة المحور Y" خطوة. حدد "الأساس" كخطوة المحاذاة (وهذا يجري على خط الأساس الأخيرة قبل جمعية خطوة). ل "المدى الزمني"، أدخل ثانية 10 مشاركة من هذا الأساس (أي 50-60 ثانية لخط الأساس 60 ثانية، كما في الشكل 3).
  4. ضع علامة في المربع "إنتر خطوة تصحيح" لتقليل نوبات إشارة بين الخطوات النقابية والتفكك. حدد محاذاة إلى خط الأساس أو التفكك.
  5. حدد Savitzky-غولي وظيفة التصفية في معظم الحالات، وانقر فوق "بيانات عملية!" والمضي قدما. تفقد البصرالبيانات المعالجة النهائية (أقل اللوحة اليمنى). مع المقايسات المعدة للتحليل بيانات عالمية (كما في الشكل 4)، إذا تبين آثار إشارة تحولا كبيرا بين جمعية والخطوات التفكك، تغيير التحديد من التفكك أو خط الأساس ل"تصحيح المشتركة بين خطوة" واعادة معالجة البيانات قبل الشروع في البيانات التحليل.

4. تحليل البيانات

انقر على "تحليل" التبويب في تحليل البيانات للبدء. ملاحظة: الخطوات المثال أدناه هي لأغراض التحليل العالمي للمنحنيات متعددة الملزمة / التفكك (كما في الشكل 3).

  1. ل"خطوة إلى تحليل"، واختيار جمعية والتفكك. ل "الموديل"، حدد 1:1. ملاحظة: هي الخيارات الأخرى المتاحة محدودة.
  2. ل "تركيب"، اختر العالمية (كامل). ل "المجموعة حسب" اختيار اللون (كما في الرسم البياني). حدد "R ماكس غير المرتبطة بواسطة الاستشعار" للسماح المناسب مستقلة عن R ماكس (ردا على إشارة تشبع القصوى الملزمة للتكافؤtner للبروتين يجمد). ملاحظة: نحن نفعل ذلك بالنسبة لمعظم المقايسات، وأجهزة الاستشعار تختلف قليلا في كمية البروتين يجمد (انظر الشكل 3، تحميل).
  3. على الطاولة هو مبين، تأكد من كل آثار استشعار ليتم تحليلها لها نفس اللون، بحيث سيتم تحليلها كمجموعة العالمية. إذا لزم الأمر، حدد جهاز استشعار واحد أو أكثر يتتبع حذف من المناسب العالمية: تحت عمود "تضمين"، انقر بزر الماوس الأيمن على جهاز استشعار الموقف المطلوب وحدد "استبعاد ويلز".
  4. انقر على زر "منحنيات صالح!" لبدء تحليل الانحدار غير الخطية. دراسة نتائج المناسب، والتي تشمل (ط) تراكب من منحنيات الانحدار مع آثار بيانات الاستشعار (كما في الشكل 4)، (ب) قطع من مخلفات المناسب، و (iii) جدول مع القيم المعلمة العزم (ثوابت المعدل، R كحد أقصى، K D) وإحصاءات (الأخطاء المعيارية للمعلمات، تشي التربيعية، R 2).
  5. تحت عنوان "تصدير البيانات"، لإنقاذ نتائج المناسب بالنقر على "تصدير الجدول إلى ملف CSV". للالعنبهينج أو مزيد من التحليل للبيانات / منحنيات تركيبها مع البرامج الأخرى، انقر فوق "تصدير نتائج تركيب" لحفظ البيانات كل أجهزة الاستشعار ومنحنى المجهزة في ملف نصي.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

النتائج

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

في الوقت الحقيقي ملزمة ويتم عرض حركية تفارق BLI في الشكل 3. وقد تم هذه التجربة مع العازلة مقايسة في تكوين الجمعيات والتفكك. وقد بدأت هذه التجربة مع خطوة أساسية 10 دقيقة منذ أجهزة الاستشعار قد prewet فقط لفترة وجيزة. المقبل، تم تحميل ε المعقدة البيروكسيديز على أجهزة الاستشعار. وقعت لا تفارق كشفها من ε في جميع الخطوات المتبقية كما يرى من منحنى المرجعية (G) الذي كان وأضاف لا شريك ملزمة. وكان جهاز استشعار الإشارة الثانية (H) خالية من البروتين يجمد وأظهرت انخفاض غير مح...

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المناقشة

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

الأدوات المتاحة حاليا لBLI تسمح إنتاجية كبيرة والمرونة في المقايسات للتفاعلات الجزيئية البيولوجية. يتم الاستغناء عينات حل مختلف في الآبار لوحة microtiter الأسود، ومجموعة من أجهزة الاستشعار BLI موازية مبرمجة لتتحرك ذهابا وإيابا بين أعمدة من الآبار على طبق من ذهب. وأثار العينات التي تهز المدارية في جميع أنحاء الفحص. النظام المستخدم هنا يحتوي على 8 أجهزة الاستشعار ويستخدم لوحة عينة 96 جيدا، ولكن يستخدم نظام آخر 16 أجهزة الاستشعار وصفيحة عينة 384 جيدا. وبالتالي، والتفاعل بين جزيء حيوي...

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

يعلن الكتاب أن لديهم أي تضارب في المصالح.

شكر وتقدير

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

نشكر FortéBio لتقديم الرسومات المستخدمة في الشكل 1. وأيد هذا العمل من قبل المعاهد الوطنية للصحة منح GM083088 إلى TMD

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة
الاسمالشركةرقم فهرسيالتعليقات
Octet-RED96Pall / Fort & eacute; Bio30-5048
مصل الأبقار الألبومينSigmaA6003-10Gمستشعر حيوي خال من الأحماض الدهنية
/ StreptavidinPall / Fort & eacute ؛ Bio18-5019صينية من 96 مستشعرا
لوحة ميكروتيترGreiner Bio-one655209أسود ، برنامج الحصول على بيانات البولي بروبلين
Pall / Fort & eacute ؛ الإصدارالحيوي 6.4الإصدارات الأحدث المتاحة
برنامج تحليل البياناتPall / Fort & eacute. الإصدار الحيوي6.4الإصدارات الأحدث المتاحة

المراجع

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Nirschl, M., Reuter, F., Voros, J. Review of Transducer Principles for Label-Free Biomolecular Interaction Analysis. Biosensors. 1, 70-92 (2011).
  2. Homola, J. Present and future of surface plasmon resonance biosensors. Anal. Bioanal. Chem. 377, 528-539 (2003).
  3. Piehler, J., Brecht, A., Gauglitz, G. Affinity Detection of Low Molecular Weight Analytes. Anal. Chem. 68, 139-143 (1996).
  4. Duncan, T. M. The Enzymes. Energy Coupling and Molecular Motors Vol. Hackney, D. D., Tamanoi, F. XXIII, Elsevier Academic Press. 203-275 (2004).
  5. Feniouk, B. A., Suzuki, T., Yoshida, M. The role of subunit ε in the catalysis and regulation of FOF1-ATP synthase. Biochim. Biophys. Acta. 1757, 326-338 (2006).
  6. Cingolani, G., Duncan, T. M. Structure of the ATP synthase catalytic complex (F1) from Escherichia coli in an autoinhibited conformation. Nat. Struc. Mol. Biol. 18, 701-707 (2011).
  7. Mirsaeidi, M. After 40 years, new medicine for combating TB. Int. J. Mycobacteriol. 2, 1-2 (2013).
  8. Shah, N. B., Hutcheon, M. L., Haarer, B. K., Duncan, T. M. F1-ATPase of Escherichia coli: The ϵ-inhibited state forms after ATP hydrolysis, is distinct from the ADP-inhibited state, and responds dynamically to catalytic site ligands. J. Biol. Chem. 288, 9383-9395 (2013).
  9. Burgess, T. L., Ross, S. L., Qian, Y. -x, Brankow, D., Hu, S. Biosynthetic Processing of neu Differentiation Factor: glycosylation, trafficking, and regulated cleavage from the cell surface. J. Biol. Chem. 270, 19188-19196 (1995).
  10. Loo, T. W., Clarke, D. M. Membrane Topology of a Cysteine-less Mutant of Human P-glycoprotein. J. Biol. Chem. 270, 843-848 (1995).
  11. Tsao, K. -L., DeBarbieri, B., Michel, H., Waugh, D. S. A versatile plasmid expression vector for the production of biotinylated proteins by site-specific, enzymatic modification in Escherichia coli. Gene. 169, 59-64 (1996).
  12. Dayne, D. BioLayer Interferometry (BLI) - How Does it Work?. FortéBio newsletter In Interactions. 5, 8-9 (2012).
  13. Wartchow, C., et al. Biosensor-based small molecule fragment screening with biolayer interferometry. J. Comput. Aided Mol. Des. 25, 669-676 (2011).
  14. Abdiche, Y., Malashock, D., Pinkerton, A., Pons, J. Determining kinetics and affinities of protein interactions using a parallel real-time label-free biosensor, the Octet. Anal. Biochem. 377, 209-217 (2008).

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

إعادة الطباعة والأذونات

طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه

طلب إذن

الوسوم

ATP SynthaseSubunit EpsilonBinding KineticsDissociation KineticsStreptavidin BiosensorsReal time Binding

مقالات ذات صلة