$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1. تقدمي وصفها من قبل المشبكي RGC المدخلات
ملاحظة: تم استعراض جميع التجارب التي تنطوي على استخدام الحيوانات وتشرف عليها لجنة رعاية الحيوان واستخدام المؤسسية (IACUC) وفقا لجميع المبادئ التوجيهية المعاهد الوطنية للصحة.
- تعقيم الميدان والصكوك.
- تخدير الفأر مع 4٪ isoflurane والمجلد في غرفة تحريض زجاجي (هذا المجلد٪ isoflurane ويعمل لالفئران حديثي الولادة والكبار). مراقبة الفئران عن كثب لتجنب الإفراط في التخدير. تنبيه: تجنب استنشاق الغاز مع إجلاء النفايات فراغ.
- بعد 1-3 دقائق، (سوف الفئران الأكبر سنا تتطلب وقتا أقل) ضمان تحقيق المستوى المناسب من التخدير بواسطة معسر الذيل (ينبغي مراعاة أي رد فعل) ومراقبة معدل التنفس (يجب أن يكون معدل بطيئة وثابتة).
- وضع الماوس تحت المجهر ستيريو على جانب ومكان مخروط الأنف لتسليم 3-4 المجلد٪ isoflurane وعلى خطم (حديثي الولادة <يوم ما بعد الولادة 10 (P10) ~ 4 مج٪؛> P10 ~ 3 المجلد٪).
- فضح الصلبة. للحقن من حديثي الولادة قبل فتح العين، واستخدام زوج من مقص الربيع صغيرة لفتح الجفن وسحب الجلد لفضح الصلبة. لالفئران الأكبر سنا، واستخدام الأصابع لسحب الجلد المحيطة بالعين لفضح الصلبة. تنبيه: في حديثي الولادة، وأحيانا أخرى قطع عمودي على زاوية العين أمر ضروري. اتخاذ الحيطة والحذر عند قطع زاوية الجفن كما أن هناك وعاء دموي أنه إذا قطع، وسوف تنزف بشكل مفرط.
- استخدام معقم 30.5 G إبرة لثقب ثقب صغير في جانب العين في السطر حيث يبدأ الصلبة. الحرص على تجنب إتلاف العدسة عن طريق إدخال إبرة فقط بعيدا بما فيه الكفاية أن شطبة يذهب الى العين.
- السماح للزجاجي في التدفق من حفرة واستخدام ذات الرؤوس القطن المعقم قضيب لامتصاص السائل.
- مرة واحدة توقف زجاجي المتدفقة من الحفرة، اضافة الى وجود إبرة حادة العضوية تعلق على حقنة هاميلتون مسبقة مع تقدمي تتبع صبغفي حفرة. تنبيه: أدخل الإبرة ببطء لتجنب ثقب الجانب الآخر من العين أو إتلاف العدسة.
- حقن ببطء صبغ في العين. عادة، يتم استخدام بكتيريا الكوليرا الوحيدات β مترافق لاليكسا 594، 647، 488 أو (CTB-594، CTB-647، أو CTB-488، 5-6 ميكروغرام / ميكرولتر) إلى anterogradely المدخلات RGC التتبع. لحديثي الولادة (≤ P10) 1-2 ميكرولتر كافية وبالنسبة للفئران> P10 ~ 3 ميكرولتر كافية. ملاحظة: الأصباغ اليكسا هي خاصة مقاومة للتدهور الليزوزومية
- ترك الإبرة في ثقب لبضع ثوان ثم إزالة ببطء.
- استخدام القطن يميل قضيب لامتصاص السوائل الزائدة ومنع الصبغة من تسرب.
- تنطبق على كمية صغيرة من مرهم مضاد حيوي للعين. إذا تم فتح العين جراحيا، إعادة برفق الجفون معا.
- إذا حقن كلتا العينين، كرر الإجراء على العين الأخرى.
- بعد الحقن (ق)، وترك الماوس تحت مصباح الحرارة أو على وسادة الحرارة حتى يبدأ في التعافي من anesthESIA.
- العودة الماوس إلى قفص المنزل نظيفة ومراقبة للتأكد من أنها هي مستيقظا تماما قبل أن تعود إلى المستعمرة.
2. تحضير الأنسجة للتصوير
ويستخدم هذا البروتوكول إعداد الأنسجة لمراسل الفئران التي وصفت في البالعات مع علامات الفلورسنت (على سبيل المثال، CX3CR1-EGFP عن الخلايا الدبقية الصغيرة). إذا كان خط مراسل ليست متاحة، ويمكن للمحقق immunostain أقسام الأنسجة (انظر مناقشة).
- ~ 24 ساعة بعد الحقن، والتضحية الماوس وتشريح الدماغ.
- إسقاط إصلاح الدماغ في أنبوب فالكون مليئة بارافورمالدهيد 4٪ (PFA) بين عشية وضحاها في 4 درجات مئوية. تنبيه: PFA سامة. تجنب استنشاق وتعرض الجلد باستخدام في غطاء الدخان أو على طاولة اسفل وارتداء معدات الوقاية الشخصية. ملاحظات: يمكن أن تكون أقصر التثبيت (≥ 4 ساعة). بالإضافة إلى ذلك، بدلا من تثبيت قطرة، 4٪ PFA نضح يمكن استخدامها تليها الإصلاح 2-24 قطرة ساعة. ومع ذلك، مقارنة يرويد لإسقاط العقول حديثي الولادة والكبار ثابتة كشف أي اختلاف في جودة الصورة أو الكمي.
- شطف 3X الدماغ في الفوسفات مخزنة المالحة (PBS).
- صب الدماغ وPFA إلى وزن القارب فارغة.
- استخدام ملعقة لنقل المخ إلى أخرى تزن قارب مليئة برنامج تلفزيوني.
- غسل الدماغ مرتين أكثر في برنامج تلفزيوني (نقل الدماغ لاثنين من أكثر تزن زوارق مليئة PBS).
- نقل الدماغ إلى أنبوب فالكون مليئة حل السكروز 30٪. ترك الدماغ في السكروز في 4 درجات مئوية حتى يغرق الدماغ إلى أسفل الأنبوب (24-48 ساعة).
- مرة واحدة المصارف الدماغ، وإعداد الدماغ لباجتزاء. الخطوات التالية هي إعداد 40 ميكرومتر أقسام العائمة باستخدام مشراح انزلاق مع مرحلة تجميد (ناظم البرد يمكن أن تستخدم أيضا).
- استخدام شفرة حلاقة لإزالة أجزاء من الدماغ غير مطلوبة (للdLGN، وإزالة أجزاء منقاري والذيلية من الدماغ).
- تجميد الصدريةفي رقائق الألومنيوم على أكثر من الثلج الجاف. خلال هذا الوقت، وتجميد المرحلة مشراح وملء كل بئر من 24 لوحة جيدا مع 0.5 مل من 0.1 M العازلة الفوسفات (PB).
- جبل الدماغ المجمدة (يجب أن تظهر مبهمة) على المسرح التجمد.
- تنطبق على كمية صغيرة من درجة الحرارة المثلى القطع مجمع (أكتوبر) إلى خشبة المسرح.
- عندما يبدأ تشغيل OCT لتجميد، يكمن في الدماغ في أكتوبر نهاية الدماغ التي من شأنها أن تقطع ينبغي مواجهة (على سبيل المثال، لdLGN، تواجه الجانب الذيلية متابعة).
- تغطي الدماغ وأكتوبر مع جدا سحقت ناعما الثلج الجاف.
- ترك الثلج الجاف على الدماغ / أكتوبر ل~ 30 ثانية.
- استخدام فرشاة طلاء كبيرة لإزالة الثلج الجاف. ينبغي تجميد الدماغ وأكتوبر إلى المرحلة.
- تبدأ من خلال باجتزاء الأنسجة حتى يتم الوصول إلى المنطقة ذات الاهتمام (ROI).
- مرة واحدة يتم الوصول إلى العائد على الاستثمار، واستخدام فرشاة صغيرة لإزالة الطلاء مقاطع من النصل ونقلها إلى بلات 24 جيدالبريد تحتوي على 0.1 M PB (الخطوة 2.5.2). الحفاظ على فرشاة الطلاء الرطب عن طريق تبليل ذلك في 0.1 م PB قبل ازالة اجزاء من النصل. ملاحظة: أقسام يمكن أن تترك في 0.1 م PB بين عشية وضحاها في 4 درجات مئوية.
- مرة واحدة وقد تم جمع أقسام، تصور وضع العلامات تقدمي تحت المجهر الفلورسنت تشريح واختيار المقاطع التي تحتوي على العائد على الاستثمار.
- جبل أقسام على شريحة بفرشاة الطلاء الصغيرة.
- تطبيق مجموعة صغيرة من 0.1 M PB إلى شريحة المجهر مشحونة.
- نقل قسم الأنسجة إلى تجمع من PB.
- استخدام PB وفرشاة الطلاء لتوجيه ونشر الأنسجة.
- استخدام Kimwipe إلى ذبالة قبالة PB الزائدة. الحرص على تجنب فتل قبالة الباب.
- السماح لهواء جاف تماما.
- تطبيق قطرة صغيرة من تصاعد المتوسطة إلى كل قسم وجبل ساترة على رأس (22 × 50 مم، رقم 1.5).
- ختم حواف الشريحة مع طلاء الأظافر وتخزينها في -20 درجة مئوية حتى جلسة التصوير. ملاحظة: على الرغم من أن التصوير معفي الأسبوع من إعداد وينصح، والشرائح يمكن الحفاظ في -20 درجة مئوية لعدة أسابيع قبل التصوير.
3. التصوير الأنسجة
يتم الحصول على جميع الصور على قرص الغزل المجهر متحد البؤر (UltraView فوكس الغزل القرص المجهر متحد البؤر مجهزة ليزر الصمام الثنائي (405 نانومتر، 445 نانومتر، 488 نانومتر، 514 نانومتر، 561 نانومتر، و 640 نانومتر)). ويمكن أيضا أن الصور يتم الحصول على أي المجهر مع القدرة على اكتساب عالية الدقة ض المداخن (على سبيل المثال، المسح الضوئي ليزر متحد البؤر المجهر، المجهر المجهر epifluorescent تليها deconvolution، الخ). حجم الإطار هو عادة 1،000 خ 1،000 بكسل.
- البحث عن العائد على الاستثمار في 10X التكبير والحصول على صورة. لتصوير الخلايا الدبقية الصغيرة في النظام retinogeniculate، والعائد على الاستثمار هو الأكثر أقسام dLGN وسطي.
- التحول إلى أعلى التكبير (60X هدف خطة آبو، NA = 1.4، ويستخدم عادة).
- الحصول على الحقل الأول نظر تحتوي على البالعات باستخدام 0.2 ميكرون ض خطوةق.
- الحصول على 15-19 الحقول التي تحتوي على أكثر البالعات لكل حيوان.
4. إعداد الصور للالكمي (يماغيج)
- مفتوحة ض المكدس في ImageJ.
- انتقل إلى القائمة صورة، حدد اللون والقنوات سبليت.
- طرح الخلفية من قناة (ق) التي تحتوي على مواد اجتاحت.
- حدد الإطار القناة التي تحتوي على مواد اجتاحت (على سبيل المثال، قبل المشبكي المدخلات).
- انتقل إلى القائمة وحدد خلفية عملية طرح. استخدام المتداول الكرة دائرة نصف قطرها 10 بكسل لتتبع تقدمي المدخلات قبل المشبكي في dLGN. ملاحظة: يتم تحديد نصف قطر الكرة المتداول تجريبيا. ومع ذلك، ينبغي أن يكون بصفة عامة كبيرة مثل نصف قطر أكبر كائن في الصورة التي ليست جزءا من الخلفية.
- سلس القناة التي تحتوي على بلعمية.
- حدد الإطار الذي يحتوي على قناة بلعمية (على سبيل المثال، الخلايا الدبقية الصغيرة).
- انتقل إلى القائمة عملية وقانون حالة الطوارئإلخ فلاتر، يعني. استخدام مرشح متوسط 1.5 (هذا ينعم على الصورة لجعل السطح في خطوات لاحقة).
- طرح الخلفية من القناة التي تحتوي على بلعمية.
- حدد الإطار الذي يحتوي على قناة بلعمية (على سبيل المثال، الخلايا الدبقية الصغيرة).
- انتقل إلى القائمة عملية، حدد خلفية طرح (إعدادات سوف تحتاج إلى أن تحدد تجريبيا). استخدام المتداول من نصف قطر الكرة 50 بكسل لالخلايا الدبقية الصغيرة-EGFP إيجابية.
- دمج القنوات عن طريق الذهاب إلى قائمة صورة واختيار اللون، قنوات دمج.
- ROI المحاصيل التي تحتوي على بلعمية من ملف دمج (وهذا يجعل السطح تقديم أسرع، راجع الخطوة 5).
- رسم مربع حول العائد على الاستثمار باستخدام أداة مستطيلة التحديدات في شريط الأدوات.
- اذهب إلى قائمة صورة وحدد المحاصيل.
- تقسيم القنوات مرة أخرى (راجع الخطوة 4.2).
- حفظ كل قناة كملف TIFF تلقاء نفسها.
5. إعداد صورة للالكميفي Imaris
- مفتوحة Imaris وتأكد من أن يتم تحديد رمز حجم الصوت في القائمة اليسرى العليا (الشكل 2).
- فتح القناة الأولى من الصورة التي تم اقتصاصها (أي من القنوات يمكن فتح الأولى، فقط أن تكون متسقة).
- إضافة قناة أخرى (ق). انتقل إلى القائمة تحرير، حدد إضافة قنوات وحدد القناة التالية في الملف. (كرر هذه الخطوة أي قنوات المتبقية). ملاحظة: لتغيير لون، انتقل إلى عرض نافذة التعديل وانقر على اسم القناة (الشكل 3A). وهذا إحضار مربع الحوار لضبط اللون. إذا كانت نافذة العرض التعديل غير مرئية، انتقل إلى القائمة تحرير واختر عرض التعديل.
- ضبط القيم بكسل. انتقل إلى القائمة تحرير واختر خصائص الصورة. في هذا الإطار، وضبط خ، ذ، ض والقيم بكسل (هذه القيم تعتمد على المجهر، والهدف، وكاميرا، واكتساب ض خطوة ويمكن العثور عليها في البرمجيات المستخدمة لاكتساب صورة).
- سوف الخطوة 5.5 يؤدي إلى غايةالصورة الصغيرة. لتغيير حجم، انقر على أيقونة صالح في أسفل الزاوية اليمنى (الشكل 2).
- في نافذة العرض التكيف، وضبط السطوع والتباين لكل قناة باستخدام مثلثات اليسار والوسط.
6. 3 الأبعاد (3D) جعل سطح بلعمية
- في شريط الأدوات العلوي، تأكد من تحديد وضع فق (الشكل 3C).
- في نافذة العرض التعديل، قم بإلغاء جميع القنوات باستثناء قناة بلعمية. وهذا إخراجها من مجال الرؤية.
- انقر فوق رمز التقديم السطح (الشكل 2).
- سيتم عرض إطار خلق في أسفل اليسار (الشكل 4A)، تأكد من القطاع ROI لم يتم التحقق منه في هذا الإطار الأول. انقر على الزر الأزرق قدما في الأسفل.
- ضبط تجانس.
- في الإطار التالي، واختيار القناة بلعمية من القائمة المنسدلة (الشكل 4B). هذا يضبطكمية التفاصيل التي سيتم ظهرت وينبغي أن تحدد تجريبيا (وعادة ما تستخدم 0.1 ميكرون لتجانس الخلايا الدبقية الصغيرة).
- حدد مستوى العتبة المطلقة.
- انقر على الزر الأزرق قدما في الأسفل.
- عتبة الصورة.
- انقر على الرسم البياني واسحب حتى يتم ظهرت الصورة بشكل مناسب (الشكل 4C). يتم تحديد هذا تجريبيا عن طريق تناوب الصورة لضمان السطوح الرمادية مضافين على الصورة الفلورسنت هي تمثيل سطح دقيقة. ملاحظات: لتدوير، حدد تنقل في القائمة مؤشر على الجانب الأيمن العلوي من الشاشة (الشكل 3B)، انقر فوق وعقد لتدوير الصورة. للعودة إلى التوجه الصورة الأصلية، اختر المنشأ أسفل اليسار من القائمة عرض.
- انقر على الزر الأزرق قدما في الأسفل.
- في الإطار التالي، هناك خيار لتصفية أي السطوح حسب الحجم، الخ إلا صورة صاخبة جدا، لا تصفية وحذفمرشحات ذ التي تظهر تلقائيا. انقر على السهم الأخضر في أسفل لإنهاء السطح مما يجعل بلعمية. وهناك مجموعة جديدة من علامات التبويب تظهر (الشكل 5)
- إذا لزم الأمر، حذف أي الأسطح التي ليست جزءا من بلعمية من الفائدة.
- تأكد من أن يتم تحديد الخيار في اختيار القائمة مؤشر (الشكل 3B).
- انقر على أي سطح المراد حذفه بحيث يتحول إلى اللون الأصفر. لحذف أسطح متعددة، انقر على السطوح أثناء الضغط باستمرار على زر التحكم.
- انقر فوق حذف ضمن علامة التبويب قلم رصاص.
- اختيار ودمج جميع الأسطح من بلعمية في سطح واحد.
- انقر على القمع (أي علامة التبويب تصفية؛ الشكل 5C).
- انقر فوق إضافة.
- اختيار أي مرشح، اسحب الرسم البياني لأقصى اليسار (يجب أن تكون جميع الأسطح الصفراء).
- العودة إلى علامة التبويب قلم رصاص وانقر توحيد.
- انتقل إلى علامة التبويب الرسم البياني (الشكل 5A ) وانقر على التفاصيل وتحديد أية معلمات لعرضه. حدد حجم (الشكل 5D). لعرض معلمات متعددة، انتقل إلى رمز مفتاح في الجزء السفلي الأيسر (الشكل 2) وحدد المعلمات لتسجيل.
- تسجيل حجم بلعمية وحفظ الملف قبل المتابعة.
7. 3D التقديم سطح اجتاحت المواد
- إنشاء قناة جديدة للمواد التي تم اجتاحت من قبل بلعمية.
- بينما يتم تحديد السطح بلعمية، انقر فوق علامة التبويب قلم رصاص.
- انقر قناع جميع.
- في الحوار الذي يظهر، حدد القناة المقابلة لمادة اجتاحت (على سبيل المثال، تتبع تقدمي المدخلات قبل المشبكي؛ الشكل 5B).
- تحقق قناة مكررة قبل تطبيق قناع واضغط زر موافق.
- سوف تظهر قناة جديدة في نافذة العرض التعديل الذي يحتوي فقط على المواد التي تم اجتاحت وداخلبلعمية.
- سطح تجعل القناة التي تحتوي على مجموع المادة واجتاحت nonengulfed.
- قم بإلغاء جميع القنوات في نافذة العرض التعديل باستثناء القناة إلى أن ظهرت وإلغاء السطح إنشاؤها لبلعمية.
- انقر على أيقونة سطح تقديم مرة أخرى (راجع الخطوة 6.3) وإنشاء سطح للقناة باستخدام نفس الخطوات كما هو موضح في بلعمية (الخطوات 6،4 حتي 6،11). ملاحظات: تأكد من تحديد القناة الصحيحة قبل تجانس ومستوى العتبة (الخطوة 6.5؛ الشكل 4B). جعل علما قيمة العتبة (انظر الخطوة 6.6؛ الشكل 4C). كما يمكن الحصول على هذه القيمة بعد تقديم السطح كاملة (علامة التبويب العصا؛ الشكل 5A).
- تسجيل الصوت من مجموع المواد اجتاحت وغير اجتاحت وحفظ الملف قبل المتابعة.
- سطح تقديم المواد اجتاحت (المواد داخل بلعمية).
- تصور مضان فقطقناة جديدة من المواد اجتاحت (راجع الخطوة 7.2.1).
- اتبع نفس الخطوات المذكورة أعلاه (الخطوات 7،2-7،3). ملاحظات: تأكد من تحديد القناة الصحيحة من القائمة المنسدلة قبل تجانس (اختيار القناة الجديدة التي تم إنشاؤها في الخطوة 7.1). في إطار عتبة، يدويا إدخال قيمة العتبة التي تم تعيينها لتقديم مجموع المواد اجتاحت وغير اجتاحت (راجع الخطوة 7.2.2).
- تسجيل حجم المواد اجتاحت وحفظ الملف قبل المتابعة.
8. احسب الحجم الكلي للمجال الرؤية
- إنشاء سطح جديد لأية قناة.
- في إطار مستوى العتبة (الخطوة 6.6)، حرك الرسم البياني على طول الطريق إلى اليسار بحيث يتم ظهرت الحقل بأكمله.
- الانتهاء من السطح الحقل بأكمله وتسجيل حجم (الخطوات 6،7 حتي 6،11).
- حفظ الملف.
9. حساب كمية المواد المبتلعة
- حساب كثافةمجموع اجتاحت وغير اجتاحت القنوات المواد باستخدام الخوارزمية التالية:
حجم إجمالي اجتاحت وغير اجتاحت المواد (الخطوة 7.3) / حجم الحقل (الخطوة 8). - حساب الإحاطة٪ لكل خلية باستخدام الخوارزمية التالية:
(حجم اجتاحت المواد (الخطوة 7.5) / الحجم الإجمالي للبلعمية (الخطوة 6.11)) × 100
ملاحظات: لمراعاة الاختلافات في حجم الخلية، ويتم تطبيع البيانات إلى إجمالي حجم بلعمية. إذا الأرقام من الخطوة 9.1 تختلف اختلافا كبيرا عبر الحقول، قد يكون من الضروري لتطبيع البيانات من الخطوة 9.2 إلى 9.1 في الحساب.