نحن هنا وصف الإجراء لتثبيط وظيفة الجينات في البعوض ناقلات الأمراض من خلال استخدام الشيتوزان / التدخل النانوية RNA التي يتم تناولها من قبل يرقات.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
مقالة منهجية
* These authors contributed equally
نحن هنا وصف الإجراء لتثبيط وظيفة الجينات في البعوض ناقلات الأمراض من خلال استخدام الشيتوزان / التدخل النانوية RNA التي يتم تناولها من قبل يرقات.
البعوض الحامل للمرض إلحاق المزيد من المعاناة البشرية من أي كائن حي آخر - وتقتل أكثر من مليون شخص كل عام. مشاريع الجينوم البعوض سهلت البحث في جوانب جديدة من البعوض البيولوجيا، بما في ذلك الدراسات الجينية وظيفية في الابتدائي متجه الأفارقة الملاريا الأنوفيلة الغامبية وحمى الضنك والحمى الصفراء ناقلات الزاعجة المصرية. وقد استخدم RNA interference- (RNAi-) بوساطة إسكات الجينات لاستهداف الجينات في المصالح في كل من هذه الأنواع من البعوض ناقلات الأمراض. هنا، نحن تصف الإجراء لإعداد الشيتوزان / التدخل النانوية RNA التي يتم جنبا إلى جنب مع المواد الغذائية وتناولها من قبل يرقات. هذا واضحة من الناحية الفنية، الإنتاجية العالية، ومنهجية غير مكلفة نسبيا، والذي يتوافق مع طويلة RNA المزدوج تقطعت بهم السبل (الرنا المزدوج الجديلة) أو التدخل RNA (سيرنا) جزيئات صغيرة، وقد استخدمت لضربة قاضية ناجحة لعدد من الجينات المختلفة في A. الغامبية وA. الزاعجة المصريةاليرقات. وبعد الوجبات اليرقات، ضربة قاضية، والتي يتم التحقق منها من خلال QRT-PCR أو التهجين في الموقع، يمكن أن تستمر على الأقل خلال مرحلة العذراء في وقت متأخر. قد تكون هذه المنهجية تنطبق على مجموعة متنوعة واسعة من البعوض والحشرات الأخرى، بما في ذلك الآفات الزراعية، وكذلك الكائنات غير نموذج الأخرى. وبالإضافة إلى فائدتها في مختبر أبحاث، في المستقبل، الشيتوزان، وهو بوليمر غير مكلفة، وغير سامة وقابلة للتحلل، يحتمل أن تستخدم في هذا المجال.
البعوض التغذية ناقلات دماء أنوفيلي وAedine أجناس تنقل العوامل المسببة للمرض مسؤولة عن العديد من أسوأ الآفات البشرية. ما يقدر بنحو 3.4 مليار شخص معرضون لخطر الإصابة بالملاريا ل، وهو المسؤول عن أكثر من نصف مليون حالة وفاة سنويا في جميع أنحاء العالم. النتائج الملاريا من العدوى عن طريق المتصورة ليرة سورية. الطفيليات، والتي تنتقل إلى البشر من خلال لدغات البعوض الحامل للجنس الأنوفيليس، بما في ذلك ناقلات الأفارقة الرئيسي الأنوفيلة الغامبية ( http://www.who.int/topics/malaria/en/ ، 2014) 1. الزاعجة المصرية هي البعوض الناقل الرئيسي لفيروس حمى الضنك، والذي يسبب حمى الضنك، وهو مرض حموي غير محدد وهذا هو المرض الأكثر انتشارا والفيروسة المنقولة بالمفصليات كبير في العالم. فيروس حمى الضنك في الوقت الحاضر تهديدا لل> 2.5 مليار شخص في المناطق المدارية، مع inciden سنويم ما يقرب من 50 مليون الحالات مما أدى إلى ~ 24،000 حالة وفاة سنويا ( http://www.cdc.gov/dengue/ ، 2014) 2. وعلى الرغم من تأثير عالمي مدمر من الأمراض التي تنتقل عن طريق البعوض على صحة الإنسان، وسيلة فعالة لمنع وعلاج هذه الأمراض تنعدم. مكافحة البعوض هي حاليا أفضل طريقة للوقاية من الأمراض.
وقد تم الاعتراف الإمكانات لمكافحة الأمراض المنقولة المفصلية التي كتبها التلاعب الجيني للالحشرات ناقلات لأكثر من أربعة عقود 3. سلالات معدلة وراثيا من A. بعوض هندستها لديك امرأة معينة كظوم يطير النمط الظاهري جعلت مؤخرا إمكانية استخدام استراتيجيات المعدلة وراثيا لمكافحة ناقلات الأمراض واقعا 4-6. وقد تحدت هذه التطورات الباحثين من تحديد الأهداف وراثية جديدة لمكافحة النواقل وسائل إضافية من التلاعب وظيفة الجين في البعوض الناقل للمرض. تحوير التعبير الجيني دتنمية خلال شهر، كما كان الحال في البعوض الأنثى يطير 4، قد تعزز توضيح استراتيجيات جديدة لمكافحة ناقلات الأمراض. ومع ذلك، إلى حد كبير بسبب التحديات التقنية، تم التعرف على وظائف عدد قليل جدا من الجينات خلال تطوير A. الغامبية، A. بعوض، أو الأنواع الأخرى من البعوض.
منذ اكتشافه في C. ايليجانس 7، والتدخل RNA (رني)، والتي يتم حفظها في الحيوانات والنباتات، والكائنات الدقيقة، وقد استخدمت على نطاق واسع للدراسات وراثية وظيفية في مجموعة متنوعة واسعة من الكائنات الحية، بما في ذلك الحشرات 8،9. يبدأ مسار رني التي كتبها المقامر الذي يشق طويلة الرنا المزدوج الجديلة في 20-25 الرناوات siRNAs طويلة النوكليوتيدات القصيرة التي تعمل بوصفها تسلسل محدد التدخل RNA. الجينات الصمت الرناوات siRNAs التي هي مكملة في تسلسل من خلال تعزيز دوران النص، انشقاق، وتعطيل الترجمة 9. جزيئات الرنا المزدوج الجديلة طويلة (عادة 300-600 بي بي) أو العرف الرناوات siRNAs استهداف particulaتسلسل ص يمكن استخدامها في مختبر أبحاث لإسكات أي الجينات في المصالح. من خلال إدارة التدخل عندما يتم تسليم RNA، يمكن للباحثين التحكم في الوقت الذي الجينات إسكات يبادر. هذه الميزة مفيدة لأنها يمكن أن تستخدم للتغلب على التحديات مثل الفتك التنموية أو العقم، والتي يمكن أن تعوق إنتاج وصيانة سلالات تحمل طفرات وراثية، وهي عملية مكلفة وكثيفة العمالة التي لا تتوفر في جميع أنواع الحشرات بعد. على الرغم من أن درجة إسكات الجينات التي كتبها رني يمكن أن تختلف من الجينات إلى الجينات، الأنسجة إلى الأنسجة، والحيوان الى الحيوان، ويستخدم على نطاق واسع رني للتحليل وظيفي من الجينات في البعوض والحشرات الأخرى 8،9.
وقد استخدمت ثلاث استراتيجيات التدخل تسليم RNA في البعوض: حقن مكروي، تمرغ / التطبيق الموضعي، والابتلاع. للتعرف على تاريخ مفصل والمقارنة من استخدام هذه التقنيات الثلاث في الحشرات، يرجى الرجوع إلى يو وآخرون 8. Wه وقد استخدمت بنجاح حقن مكروي 10 كوسيلة لتقديم الرناوات siRNAs لاستهداف الجينات التنموية في A. الأجنة بعوض، يرقات، عذارى و11-14. ومع ذلك، تتطلب هذه الاستراتيجية تسليم كثيفة العمالة على حد سواء الإعداد حقن مكروي ويد ماهرة. وعلاوة على ذلك، هو حقن مكروي مرهقة للكائن الحي، وهو عامل التباس، وخاصة عندما سيتم تقييم الظواهر السلوكية. وأخيرا، لا يمكن تمديد تسليم حقن مكروي إلى الميدان لمكافحة النواقل. وكبديل لذلك، تمرغ الكائن في التدخل الحل RNA كما أصبحت وسيلة شعبية للحمل إسكات الجينات، كما أنها مريحة ويتطلب معدات قليلة أو العمل. وقد تم تطبيقها في المقام الأول تمرغ في خط الخلية الحشرات يدرس 8، ولكن في دراسة حديثة، وقد تحقق ضربة قاضية في A. بعوض اليرقات مغمورة في محلول من الرنا المزدوج الجديلة 15، والتي ظهرت الحيوانات أن تناول. ومع ذلك، من أجل دراسة شملت تحليل experimenta متعددةمجموعات لتر أو الظواهر، تمرغ مكلف نوعا ما. لوبيز مارتينيز وآخرون. 16 وصفت الإماهة مدفوعة رني، نهجا جديدا للتدخل تسليم RNA الذي ينطوي على الجفاف في محلول ملحي والإماهة مع قطرة واحدة من المياه التي تحتوي على التدخل RNA. لا تقطع هذا النهج التكاليف المرتبطة الغمر الحيوان كله، ولكن هي أكثر تكلفة من حقن مكروي وربما تكون محدودة في تطبيقه على الأنواع التي يمكن أن يتسامح مع الضغوط الأسموزية العالية. وعلاوة على ذلك، فمن الصعب أن نتصور كيف يمكن تكييفها الغمر أو منهجية الغمر / الإماهة الجفاف لمكافحة ناقلات الأمراض في هذا المجال. لهذه الأسباب، لدراسات ما بعد الجنينية، والتسليم بالتدخل RNA مع الطعام تناولها هو استراتيجية بديلة قابلة للحياة.
على الرغم من أن الاستراتيجيات القائمة على ابتلاع لا تعمل في جميع أنواع الحشرات، وربما أبرزها ذبابة الفاكهة البطن، وقد شجعت تسليم عن طريق الفم بالتدخل RNA مختلطة مع الطعام سي جينlencing في مجموعة متنوعة من الحشرات 8،17، بما في ذلك A. بعوض البالغين 18. وصفنا الشيتوزان بوساطة جسيمات متناهية الصغر رني في A. الغامبية يرقات 19 وطبقت بنجاح هذا النهج للحد من التعبير الجيني في A. بعوض اليرقات 20،21. هنا، ومنهجية لهذا الإجراء رني، الذي ينطوي على entrapping بالتدخل RNA من قبل الشيتوزان البوليمر، هو مفصل. تتشكل الشيتوزان / التدخل النانوية RNA التي كتبها التجميع الذاتي للpolycations مع التدخل RNA من خلال القوى الكهروستاتيكية بين الشحنات الموجبة من المجموعات الأمينية في الشيتوزان والشحنات السالبة التي تحملها مجموعات الفوسفات على العمود الفقري بالتدخل RNA 19. الإجراء الموضح متوافق مع كل من جزيئات الرنا المزدوج الجديلة الطويلة (المشار إليها فيما يلي باسم الرنا المزدوج الجديلة) أو مزدوجة الذين تقطعت بهم السبل سيرنا (المشار إليه فيما بعد سيرنا). يتم خلط التالية التوليف، الشيتوزان / التدخل النانوية RNA مع الطعام اليرقات وتسليمها إلىاليرقات من خلال الابتلاع عن طريق الفم. هذه المنهجية غير مكلفة نسبيا، ويتطلب القليل من المعدات والعمالة 19، وتسهل تحليل الإنتاجية العالية من الظواهر متعددة، بما في ذلك تحليل السلوكيات 20،21. من المحتمل أن هذه المنهجية، التي يمكن تكييفها للدراسات إسكات الجينات في الحشرات الأخرى، بما في ذلك ناقلات الأمراض الأخرى والآفات الزراعية الحشرات، يمكن استخدامها لإسكات الجينات في مجموعة متنوعة من الأنواع الحيوانية الأخرى. وعلاوة على ذلك، الشيتوزان، وهي غير مكلفة، وغير سامة وقابلة للتحلل البوليمر 22، من المحتمل أن تستخدم في الميدان لمكافحة البعوض أنواع محددة.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
1. أنواع البعوض وتربية
2. الرنا المزدوج الجديلة وسيرنا التصميم والإنتاج
3. إعداد الشيتوزان / التدخل RNA النانوية
4. إعداد البعوض الأغذية التي تحتوي على الشيتوزان / التدخل RNA النانوية
5. تغذية يرقات البعوض مع الأغذية التي تحتوي على الشيتوزان / التدخل RNA النانوية
6. التأكيد على إسقاط الموروثة
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
A. الغامبية:
تتشكل جزيئات الشيتوزان / الرنا المزدوج الجديلة بسبب التفاعل الكهربائي بين المجموعات الأمينية من الشيتوزان ومجموعات الفوسفات من الرنا المزدوج الجديلة. كفاءة الرنا المزدوج الجديلة إدماجها النانوية هي عادة فوق 90٪ مقاسا استنزاف الرنا المزدوج الجديلة من الحل. تظهر الصور مجهر القوة الذرية التي الشيتوزان-الرنا المزدوج الجديلة المتوسطات حجم الجسيمات 140 نانومتر في القطر، تترا...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
وقد استخدم / التدخل منهجية جسيمات متناهية الصغر RNA الشيتوزان الموصوفة هنا لاستهداف الجينات بشكل فعال خلال نمو اليرقات في A. الغامبية (أرقام 2 و 3) وA. الزاعجة المصرية (أرقام 4، 5، 6، الجدولين 1 و 2). الشيتوزان النانوية يمكن أن تكون على استعداد مع إما طويلة الرنا المزدوج الجديلة أو سيرنا، وكلاهما قد استخدمت بنجاح في البعوض كما يتضح من نتائج ممثلة الموصوفة هنا. توليف الرنا المزدوج الجديلة هو اقل كلفة من شراء سيرنا، ولكن هو أكثر كث...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ليس لدى المؤلفين ما يكشفون عنه.
دعم التمويل من محطة التجارب الزراعية في كانساس ومركز جينوم المفصليات في ولاية K-State إلى KYZ التطوير الأصلي لإسكات الجينات بوساطة الشيتوزان / dsRNA في A. gambiae19. تم دعم عمل A. gambiae الموصوف هنا جزئيا من خلال R01-AI095842 من المعاهد الوطنية للصحة / NIAID إلى KM. تطوير إسكات الجينات بوساطة الشيتوزان / siRNA في A. aegypti20،21 تم دعمه من قبل جائزة NIH / NIAID R01-AI081795 إلى MDS. محتويات هذه الدراسة هي مسؤولية المؤلفين وحدهم ولا تمثل بالضرورة وجهات النظر الرسمية للمعاهد الوطنية للصحة.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| 0.02 مل ماصة | Rainin | PR20 | لإعادة تعليق الحمض النووي الريبي المتداخل |
| 0.2 مل ماصة | Rainin | PR200 | لإعادة تعليق الحمض النووي الريبي المتداخل وتحضير الحمض النووي الريبي / الجسيمات النانوية المتداخلة |
| 0.5 مل أنبوب متدرج ؛ | Fischer Scientific | 05-408-120 | لنقل الحمض النووي الريبي المعلق |
| 1 مل ماصة | Rainin | PR1000 | لإعادة تعليق الحمض النووي الريبي المتداخل وتحضير الحمض النووي الريبي / الجسيمات النانوية المتداخلة |
| 1.5 مل أنبوب متدرج ؛ | فيشر ساينتواليك | 05-408-046 | لتحضير الحمض النووي الريبي / الجسيمات النانوية المتداخلة |
| 1M أسيتات الصوديوم ، درجة الحموضة 4.5 | TEKnova | S0299 | لتحضير عازلة أسيتات الصوديوم |
| حمض الخليك ، AIRSTAR. ACS ، USP ، FCC درجة | BDH | VWR BDH3092-500MLP | لإعداد عازلة أسيتات الصوديوم |
| Agarose Genetic Technology Grade | MP Biomedicals LLC. | 800668 | لطلاء الحمض النووي الريبي / الجسيمات النانوية المحضرة |
| المحضرة للطرد المركزي | Eppendorf AG | 5415D | إلى الحبيبات المتداخلة في الحمض النووي الريبي / الجسيمات النانوية |
| شيتوسان ، من قشور الجمبري | Sigma-Aldrich | C3646-25G | للاندماج مع الحمض النووي الريبي المتداخل لتحضير الحمض النووي الريبي / الجسيمات النانوية المتداخلة |
| الخميرة | الجافة Universal Food Corp | NA | لإعداد طعام يرقات البعوض مع الحمض النووي الريبي المتداخل / الجسيمات النانوية |
| أداة E-RNAi | مركز أبحاث السرطان الألماني | NA | لتصميم dsRNA ؛ http://www.dkfz.de/signaling/e-rnai3// |
| طعام السمكة الذهبية | Wardley | Goldfish FLAKE FOOD | لإعداد طعام يرقات البعوض مع الحمض النووي الريبي / الجسيمات النانوية المتداخلة |
| حمام مائي ساخن | 51221048 علمي حراري | لتسخين الحمض النووي الريبي / الجسيمات النانوية المتداخلة عند 55o< / sup>C | |
| الجليد | غير قابل للتطبيق | غير قابل للتطبيق | على ذوبان الجليد والريبي المتداخل وتحضير الحمض النووي الريبي / الجسيمات |
| [header] | |||
| دلو الثلج | فيشر Scientific | 02-591-44 | لتخزين الثلج المستخدم أثناء الإجراء مسحوق |
| الكبد | MP Biomedicals LLC. | 900396 | لتغذية يرقات البعوض بعد معالجة الحمض النووي الريبي / الجسيمات النانوية |
| فرن الميكروويف | مجموعة متنوعة من البائعين | غير قابلة للتطبيق | لتحضير محلول الاغاروز 2٪ |
| بتريديش (100 × 15 مم) | غرفة تغذية Fischer Scientific | 875713 | المتداخلة في الحمض النووي الريبي / الجسيمات النانوية |
| لمقياس الأس الهيدروجيني | Mettler Toledo | S220 | لتحضير المخازن المؤقتة |
| شفرة الحلاقة | فيشر ساينتواليك | 12-640 | لتقسيم الحبيبات الحمض النووي الريبي / الجسيمات النانوية المتداخلة للتغذية |
| siRNA | Thermo Scientific / Dharmacon | مخصص | لتحضير siRNA / الجسيمات النانوية |
| كبريتات الصوديوم ، اللامائية (Na 2< / sub>SO4< / sub>) | BDH / موزعة بواسطة VWR | VWR BDH0302-500G | لتحضير محلول كبريتات الصوديوم 50 ملي مولار الذي سيكون فيه الحمض النووي الريبي المتداخل |
| ميزان الحرارة | VWR | 61066-046 | لقياس درجة حرارة الحمام المائي |
| يختار الأسنان | VWR | 470146-908 | للتحريك أثناء تحضير الطعام في الحمض النووي الريبي / الجسيمات النانوية المتداخل وقطع كريات الجل |
| فريزر منخفض للغاية | مجموعة متنوعة من البائعين | غير قابلة للتطبيق | على تخزين حصص الحمض النووي الريبي المتداخلة والحمض النووي الريبي / الجسيمات النانوية المتداخلة عند -80o< / sup>C |
| خلاط دوامة | فيشر Scientific | 02-216-108 | لتحضير ورق الكيتوزان / الحمض النووي الريبي المتداخل |
| NC9798735 | فيشر Scientific | لتقسيم الحبيبات الحمض النووي الريبي / الجسيمات النانوية المتداخلة للتغذية | |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.