RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ar
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
هذا البروتوكول تفاصيل طريقة لعزل الحويصلات خارج الخلية (المركبات الكهربائية)، والجسيمات غشائي صغيرة أطلق سراحهم من الخلايا، من اقل من 10 عينات مصل ميكرولتر. هذا النهج تلتف الحاجة إلى تنبيذ فائق، لا يتطلب سوى بضع دقائق من الوقت الفحص، وتمكن من عزل المركبات الكهربائية من عينات من وحدات التخزين محدودة.
الحويصلات خارج الخلية (المركبات الكهربائية)، والجسيمات غشائي المفرج عنهم من أنواع مختلفة من الخلايا، عقد إمكانات كبيرة للتطبيقات السريرية. أنها تحتوي على حمض النووي والبروتين البضائع ويتم الاعتراف بشكل متزايد كوسيلة للتواصل بين الخلايا التي يستخدمها كلا حقيقي النواة والخلايا بدائيات النوى. ولكن نظرا لصغر حجمها، والبروتوكولات الحالية لعزل المركبات الكهربائية وغالبا ما تكون مضيعة للوقت، مرهقة، وتتطلب كميات عينة كبيرة ومعدات باهظة الثمن، مثل نابذة فائقة السرعة. لمعالجة هذه القيود، قمنا بتطوير منصة immunoaffinity الورقية لفصل مجموعات فرعية من المركبات الكهربائية التي هي سهلة وفعالة، ويتطلب كميات عينة منخفضة تصل إلى 10 ميكرولتر. عينات بيولوجية يمكن pipetted مباشرة على مناطق رقة الاختبار التي تم تعديلها كيميائيا مع جزيئات القبض التي لديها قابلية عالية لعلامات محددة سطح EV. ونحن تحقق من صحة الفحص باستخدام المجهر الإلكتروني (SEM)، الورقية انزيم مرتبط immunosorbenر المقايسات (P-ELISA)، وتحليل Transcriptome على. ستمكن هذه الأجهزة الورقية دراسة المركبات الكهربائية في العيادة وإعداد البحوث للمساعدة في دفع فهمنا من وظائف EV في الصحة والمرض.
الحويصلات خارج الخلية (EVs) هي جزيئات غشائية غير متجانسة يتراوح حجمها من 40 نانومتر إلى 5,000 نانومتر ويتم إطلاقها بنشاط بواسطة العديد من أنواع الخلايا عبر طرق التكوين الحيويالمختلفة من 1 إلى 9. تحتوي على مجموعات فرعية فريدة ومختارة من الحمض النووي والحمض النووي الريبي والبروتينات وعلامات السطح من الخلايا الأبوية. إن مشاركتهم في مجموعة متنوعة من العمليات الخلوية ، مثل الاتصال بين الخلايا10 ، وتعديل المناعة11 ، وتكوين الأوعيةالدموية 12 ، والورم الخبيث12 ، والمقاومةالكيميائية 13 ، وتطور أمراض العيون9 ، معترف بها بشكل متزايد وقد أثارت اهتماما كبيرا بفائدتها في تطبيقات التشخيص والتنبؤات والعلاجية والبيولوجيا الأساسية.
يمكن تصنيف < p class = 'jove_content'>EVs بشكل كلاسيكي على أنها أجسام خارجية ، وحويصلات دقيقة ، وأجسام موت الخلايا المبرمج ، والأورام ، والجسيمات الخارجية ، والجسيمات الدقيقة ، والجسيمات عن بعد ، وجسيمات البروستاتوزيم ، وجسيمات القلب ، والمركبات ، وما إلى ذلك ، بناء على نشأتها الحيوية أو أصلها الخلوي. على سبيل المثال ، تتشكل الإكسوسومات في أجسام متعددة الحويصلات ، بينما تتولد الحويصلات الدقيقة عن طريق التبرعم مباشرة من غشاء البلازما والحويصلات موت الخلايا المبرمج من الخلايا المبرمجة أو النخرية. ومع ذلك ، لا تزال التسمية قيد التحسين ، ويرجع ذلك جزئيا إلى الافتقار إلى الفهم الشامل وتوصيف المركبات الكهربائية. تم تطوير عدة طرق لتنقية المركبات الكهربائية ، بما في ذلك الطرد المركزيالفائق 14 ، والترشيحالفائق 15 ، والخرز المغناطيسي16 ، وهطول الأمطار البوليمرية17-19 ، وتقنيات الموائعالدقيقة 20-22. يتضمن الإجراء الأكثر شيوعا لتنقية المركبات الكهربائية سلسلة من أجهزة الطرد المركزي و / أو الترشيح لإزالة الحطام الكبير والملوثات الخلوية الأخرى ، متبوعا بعملية طرد مركزي فائق نهائية عالية السرعة ، وهي عملية باهظة الثمن ومملة وغير محددة14،23،24. لسوء الحظ ، لم يتم تلبية الحاجة التكنولوجية لعزل سريع وموثوق للمركبات الكهربائية بنقاء وكفاءة مرضيين.لقد قمنا بتطوير جهاز تقارب مناعي ورقي يوفر طريقة بسيطة وموفرة للوقت والتكلفة ولكنها فعالة لعزل وتوصيف مجموعات فرعية من المركباتالكهربائية 22. يمكن ترتيب ورق السليلوز المقطوع في شكل محدد وتصفيحه باستخدام لوحين بلاستيكيين مع فتحات مسجلة. على عكس الإستراتيجية العامة لتحديد حدود السوائل في الأجهزة الورقية عن طريق طباعة الشمع أو البوليمرات الكارهة للماء25-27 ، فإن أنماط الورق الرقائقي هذه مقاومة للعديد من السوائل العضوية ، بما في ذلك الإيثانول. يتم تعديل مناطق الاختبار الورقية كيميائيا لتوفير تغطية مستقرة وكثيفة لجزيئات الالتقاط (على سبيل المثال ، الأجسام المضادة الخاصة بالهدف) التي لها تقارب كبير مع علامات سطحية محددة في المجموعات الفرعية للمركبات الكهربائية. يمكن سحب العينات البيولوجية مباشرة على مناطق اختبار الورق، ويتم الاحتفاظ بالمركبات الكهربائية المنقاة بعد خطوات الشطف. يمكن إجراء توصيف المركبات الكهربائية المعزولة عن طريق SEM و ELISA والتحليل النسخي.
ويرد المخطط العام لإجراء عملية في الشكل 1. عن طريق الممارسات الأخلاقية، فإننا جمع عينات الدم من الأصحاء، والحصول على عينات الخلط المائي من المرضى من خلال تايتشونغ مستشفى المحاربين القدماء العام (TCVGH)، تايتشونغ، تايوان تحت افق IRB البروتوكولات ( IRB TCVGH رقم CF11213-1).
1. تصنيع أجهزة ورقة
2. المصل ومائي فكاهة جمع العينات وتجهيز
3. عزل خارج الخلية الحويصلات
4. المصب الفحص مثال 1: Electromicrographs الضوئي
5. المصب الفحص مثال 2: ELISA الورقية
6. المصب الفحص مثال 3: عزل الحمض النووي الريبي
قدرة الجهاز رقة لعزل مجموعات فرعية من المركبات الكهربائية تعتمد بكفاءة عند التحقق حساس ونوعي لها من علامات سطح EV. ويتحقق تعديل مستقر للألياف ورقية مع جزيئات التقاط باستخدام أفيدين-البيوتين الكيمياء كما هو موضح في أماكن أخرى 28-30. ويتم تقييم فعالية تصريف المواد الكيميائية وذلك من طريقة physisorption باستخدام قراءات القائم على مضان. يتم إعداد مناطق اختبار الورقة التالية الخطوة بروتوكول 1) باستثناء جزيء التقاط يتم استبدال مع جزيئات البيوتين 20 ميكروغرام / مل fluorophore R-فيكوإيريترين مترافق (PE-البيوتين) في الخطوة 1.3. ثم يتم شطفها المناطق رقة الاختبار مع PBS لإزالة جزيئات PE البيوتين غير منضم. في المقابل، 10 ميكرولتر 20 ميكروغرام / مل PE-البيوتين في برنامج تلفزيوني يحتوي على 1٪ (ث / ت) BSA وبنسبة 0.09٪ (ث / ت) ورصدت أزيد الصوديوم مباشرة على منطقة الاختبار ورقة لمدة 3 × 10 دقيقة، تليها PBS شطف لإجراء physisorption من-PE البيوتين جزيئات الصبغة. كيميائياأجهزة رقة معدلة ("ورقة + crosslinker + صبغ") جنبا إلى جنب مع الأجهزة رقة غير المجهزة ("ورقة")، وأجهزة رقة معدلة مع نفس البروتوكول دون تطبيق الجزيئات-PE البيوتين ("ورقة + crosslinker") والأجهزة الورق مع physisorbed يتم حفظ جزيئات البيوتين PE-("physisorbed صبغ") يتم فحص باستخدام نظام صورة الرقم القياسي ل540-560 نانومتر الإثارة، 575 الانبعاث نانومتر طويلة تمرير، والبيانات في شكل ملفات 16-بت وتحليلها باستخدام برنامج يماغيج. كما هو مبين في الشكل 2A، وكثافة مضان من مناطق اختبار بواسطة طريقة الاقتران الكيميائية أعدت أعلى بكثير بالمقارنة مع مناطق اختبار ورقة المغلفة جسديا (ع القيمة <0.0005، ن = 5، اختبار t الطالب). واسر من المركبات الكهربائية هو أيضا محددة كما يتضح في الشكل 2B، C، حيث يتم الاحتفاظ القليلة المركبات الكهربائية على الجهاز ورقة عندما يتم استبدال جزيئات أسر حل PBS.
المركبات الكهربائية غير متجانسة في سيZES، محتويات محددة، وطرق نشوء حيوي. لربط لهم، وأجهزة رقة المغلفة مع اثنين من جزيئات مختلفة التقاط EV، والأجسام المضادة لمكافحة CD63 وannexin V، تم إعداد. وأثرى CD63، وهو عضو في الأسرة tetraspanin (والذي يتضمن CD9، CD63، CD81 CD82 والجزيئات) على EV غشاء 31، وannexin V لديه تقارب قوي لفسفاتيديل (PS) 32،33. تبين أن يتم إطلاق المركبات الكهربائية جوهري خلال موت الخلايا المبرمج في وقت مبكر أو في ظل ظروف الإجهاد، والتي تفقد فيها عملية العادي خلية التماثل فوسفورية، مما يؤدي إلى زيادة التعرض للPS على النشرة الخارجية للغشاء EV. تحليلات من الصور SEM تبين أن حجم التوزيعات من CD63 + المركبات الكهربائية وPS + المركبات الكهربائية مختلفة، بأقطار يعني من 80 و 43 نانومتر، على التوالي (الشكل 3) يستخدم. وثنائي الطرف اختبار t الطالب لتحديد الإحصائية ف القيمة (ص القيمة <0.0001). والمثير للدهشة، تظهر CD63 + المركبات الكهربائية مستدير وأكبر من PS + المركبات الكهربائية في المتوسط، والذي البيولوجية تبقى أهمية إلى توضيح.
RNA من المركبات الكهربائية القبض على الجهاز ورقة يمكن استخراج. وأظهرت التحليلات مع bioanalyzer ملامح الشاملة مماثلة لمجموع الرنا المستخرجة من CD63 + وPS + المركبات الكهربائية (الشكل 4A). مقارنة مع كميات من الحمض النووي الريبي المستخرج باستخدام تقنيات ميكروفلويديك وتنبيذ فائق، على التوالي حوالي مرتين وتم استخراج 39 مرات أكثر الرنا لكل وحدة حجم من عينة مصل الدم باستخدام جهاز الورق، وإن كان ذلك باستخدام حجم العينة أصغر (الجدول 1). P-ELISA يمكن القيام بها للكشف عن السيارات الكهربائية. وتستخدم مضادة للCD9 الأجسام المضادة الأولية والثانوية الضد HRP-مترافق في هذه الدراسة. الشكل 4B يعرض التغيرات في القيمة الرمادية التي تنتجها رد فعل الأنزيمية من HRP للأجهزة رقة تطبيقها مع 10 ميكرولتر PBS، 50٪ مصل (مخفف مع PBS)، أو 100 مصل٪، على التوالي. قيمة الرمادية يزيد خطيا ضمن مجموعة من عينات المصل اختبارها.
> أجهزة ورقة هي مفيدة خصوصا عندما كمية عينة محدودة مثل في حالة من الخلط المائي، وعندما فقط <200 ميكرولتر / العين يمكن جمعها. وغالبا ما يحتاج عينات متعددة وتجمع معا إذا طرق عزل أخرى، على سبيل المثال، تنبيذ فائق، والمراد استخدامها. المركبات الكهربائية من المرضى عينات الخلط المائي معزولة مع أجهزة رقة المغلفة مع أضداد CD63 يمكن أن يرى في الصور SEM أظهرت كما في الشكل (5).

يتم قطع الشكل 1. الإجراء تصنيع وتشغيل المقايسات الورقية التي تهدف إلى عزل وتوصيف الحويصلات خارج الخلية. (A) تصفية الورق في الشكل المطلوب ومغلفة. يتم تعديل (B) على سطح الورق مع العلاج وجيزة من البلازما الأكسجين وكان رد فعل مع trimethoxysilane 3-mercaptopropyl، N </ م> -γ-maleimidobutyryloxy succinimide استر، وNeutrAvidin، في هذا النظام. الجزيئات المعقدة البيروكسيديز القبض، على سبيل المثال، والأجسام المضادة، ويمكن بعد ذلك ثبتوا عبر تقارب قوي بين البيوتين والجزيئات NeutrAvidin. (C) Biosamples يمكن أن تكون ماصة على الجهاز ورقة بين functionalized. الحويصلات خارج الخلية يمكن أن تكون معزولة. (D) المقايسات المصب، مثل SEM، Transcriptome على، وELISA (كما هو موضح)، لا يمكن أن يؤديها. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2. الحويصلات خارج الخلية (المركبات الكهربائية) يمكن التقاطها على أجهزة رقة بين functionalized مع خصوصية وحساسية جيدة. ويجمد للغاية (A) جزيئات البيوتين Fluorescently المسمى على ورقةالجهاز عن طريق عملية الاقتران الكيميائية ("ورقة + crosslinker + صبغ") وعلى النقيض من الامتزاز الفيزيائي ("physisorbed صبغ"). ورقة غير المجهزة ("ورقة") والجزيئات الاقتران ("ورقة + crosslinker") تساهم قليلا لشدة مضان. (ب) SEM صورة تمثيلية تظهر بعض المركبات الكهربائية يتم التقاطها على الجهاز ورقة غير تحديدا عندما يتم استبدال جزيئات أسر PBS تحتوي على 1٪ (ث / ت) BSA. يتم الاحتفاظ (C) العديد من المركبات الكهربائية على الأجهزة رقة المغلفة مع الأجسام المضادة لمكافحة CD63. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 3. المجموعات الفرعية من الحويصلات خارج الخلية (المركبات الكهربائية) يمكن أن يكون حجم التوزيعات المختلفة. (A)و (ب) هي صور SEM تمثيلية من المركبات الكهربائية استولت على أجهزة رقة المغلفة مع الأجسام المضادة لمكافحة CD63 والجزيئات annexin V، على التوالي. (C) CD63 + المركبات الكهربائية تبدو أكبر من PS + المركبات الكهربائية تحت الظروف التجريبية المستخدمة في هذه الدراسة (ع القيمة <0.0001، ن = 124 و 203، اختبار t الطالب). الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 4. Transcriptome على التكرير والتسويق وELISA المقايسات. (A) البيانات Bioanalyzer تبين شدة (المحور الصادي، في وحدات التعسفي) وحجم (محور س، في النيوكليوتيدات (NT)) توزيعات fluorescently المسمى الحمض النووي الريبي مجموع المستخرج من المركبات الكهربائية استولت على مكافحة CD63 المغلفة V-الأضداد أو annexin أوراق الترشيح. ذروة المهاجرة في ~ 25 يمثل الإقليم الشمالي معيار داخلي. (ب) التغيرات في القيمة رمادي ينتج عن تفاعل الأنزيمي من الفجل البيروكسيديز (HRP) في مقايسة P-ELISA لأجهزة رقة تطبيقها مع 10 عينات ميكرولتر من برنامج تلفزيوني، 50٪ مصل (مخفف مع PBS) و 100 عينات٪ مصل. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 5. الحويصلات خارج الخلية (المركبات الكهربائية) في عينات الخلط المائي يمكن التقاطها على ورق الترشيح بين functionalized دون تجميع العينة. الصور SEM من CD63 + معزولة المركبات الكهربائية في عينات الخلط المائي من المرضى الذين يعانون من (A) المرتبطة بالعمر الضمور البقعي، (B) البقعي السكري وذمة، و (C) اعتلال وعائي المشيمية polypoidal، على التوالي.تحميل / 52722 / 52722fig5highres.jpg "الهدف =" _ فارغة "> الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.
| طريقة العزلة | القبض على جزيء | المجلد المصل. (ميكرولتر) | متوسط الحمض النووي الريبي المستخرج (نانوغرام) | متوسط استخراج الحمض النووي الريبي / مصل (جزء من الغرام / ميكرولتر) | نسبة متوسط RNA / مصل | المرجع |
| جهاز ميكروفلويديك | CD63 مكافحة الإنسان | 400 | 4.14 | 10.4 | 20 | 20 |
| جهاز الورق | CD63 مكافحة الإنسان | 72 | 1.49 ± 0.08 | 20.7 | 39 | 22 |
| جهاز الورق | annexin V | 72 | 0.99 ± 0.26 | 13.8 | 26 | 22 |
| تنبيذ فائق | - | 2،000 | 1.06 ± 0.64 | 0.53 | 1 | |
| مصل الدم | - | 72 | 1.23 ± 0.58 | 17 | 32 | 22 |
الجدول 1. مجموع الحمض النووي الريبي المستخرج من عينات الدم من المتطوعين الأصحاء تحليلها مع bioanalyzer (ن = 4 لجميع الظروف).
تعلن المؤلفين أنه ليس لديهم المصالح المالية المتنافسة.
هذا البروتوكول تفاصيل طريقة لعزل الحويصلات خارج الخلية (المركبات الكهربائية)، والجسيمات غشائي صغيرة أطلق سراحهم من الخلايا، من اقل من 10 عينات مصل ميكرولتر. هذا النهج تلتف الحاجة إلى تنبيذ فائق، لا يتطلب سوى بضع دقائق من الوقت الفحص، وتمكن من عزل المركبات الكهربائية من عينات من وحدات التخزين محدودة.
وأيد هذا العمل في جزء من المجلس الوطني للعلوم تايوان grants- NSC 99-2320-B-007-005-MY2 (CC) وNSC 101-2628-E-007-011-MY3 (CMC)، والمحاربين القدامى عامة المستشفيات ونظام جامعة تايوان برنامج البحوث المشتركة (CC).
| ورقة الكروماتوغرافيا | GE علوم الحياة للرعاية الصحية | 3001-861 | Whatman & reg; ورق السليلوز من الدرجة 1 |
| (3-Mercaptopropyl) Trimethoxysilane | Sigma Aldrich | 175617 | تتفاعل هذه المادة الكيميائية مع الماء والرطوبة ويجب وضعها داخل كيس قفازات مملوء بالنيتروجين. تجنب ملامسة العين والجلد. لا تتنفس الأبخرة أو تستنشق الأبخرة. |
| الإيثانول | فيشر العلمي | BP2818 | المطلق ، 200 دليل ، درجة البيولوجيا الجزيئية |
| ألبومين مصل الأبقار (BSA) | BioShop Canada Inc. | ALB001 | غالبا ما يشار إليه باسم كسر كوهن V. |
| N< / em> - 947 ؛ -maleimidobutyryloxy succinimide ester (GMBS) | Pierce Biotechnology | 22309 | GMBS عبارة عن رابط متشابك من أمين إلى سلفهيدريل. GMBS حساس للرطوبة. |
| يحتوي Avidin | Pierce Biotechnology | 31000 | NeutrAvidin على 4 مواقع ربط للبيوتين وقيمة pI هي 6.3 ، وهو أكثر حيادية من الفأر الأصلي avidin |
| Biotinylated المضاد للإنسان المضاد ل CD63 | Ancell | 215-030 | استنساخ AHN16.1 / 46-4-5 |
| ملحق البيوتينيل V BD | Biosciences | 556418 | Annxin V لديه تقارب عال للفوسفاتيديل سيرين (PS) |
| المضاد الأولي ل CD9 والثانوي نظام الأجسام المضادة | Biosciences | EXOAB-CD9A-1 | الجسم المضاد الثانوي هو أنابيب فصل المصل المترافق ببيروكسيديز |
| الفجل الحار BD Biosciences | 367991 | منشط الجلطة والجل لفصل المصل | |
| Annexin V ملزمة | عازلة BD Biosciences | 556454 | 10x ؛ تخفيفها إلى 1x قبل الاستخدام. |
| مجموعة كاشف الركيزة TMB | BD Biosciences | 555214 | تحتوي المجموعة على بيروكسيد الهيدروجين و 3،3 '، 5،5'-tetramethylbenzidine (TMB) |
| [header] | |||
| طقم عزل الحمض النووي الريبي | Life Technologies | AM1560 | طقم عزل الحمض النووي الريبي MirVana |
| عزل الحمض النووي الريبي القائم على Polyvinylpyrrolidone | Life Technologies | AM9690 | يحتوي مساعد عزل الحمض النووي الريبي النباتي على بولي فينيل بيروليدون (PVP) الذي يرتبط بالسكريات. |
| مجموعة تنظيف الحمض النووي الريبي | Qiagen Inc. | تم | تصميم مجموعة تنظيف الحمض النووي الريبي 74004 MinElute لتنقية ما يصل إلى 45   ؛ مو ز الحمض النووي الريبي. |
| غرفة البلازما | مارس إنسترومنتس | PX-250 | |
| مجهر إلكتروني ماسح | هيتاشي المحدودة. | تم التقاط الماسح الضوئي لسطح المكتبS-4300 | |
| Hewlett-Packard | Photosmart B110 | صور ملونة 8 بت. يمكن أيضا استخدام الكاميرات والهواتف الذكية. | |
| نظام تسجيل الصور | J& تم التقاط صور H Technology Co | GeneSys G: BOX Chemi-XX8 | 16 بت. يمكن أيضا استخدام مجاهر Fluroscence. |