نقدم بروتوكول تخصيب لعزل العاثيات التي تصيب البكتيريا في جنس المفصليات. ينتج عن بروتوكول التخصيب هذا نتائج سريعة وقابلة للتكرار لعزل وتضخيم عاثيات المفصليات من عزلات التربة.
مقالة منهجية
نقدم بروتوكول تخصيب لعزل العاثيات التي تصيب البكتيريا في جنس المفصليات. ينتج عن بروتوكول التخصيب هذا نتائج سريعة وقابلة للتكرار لعزل وتضخيم عاثيات المفصليات من عزلات التربة.
عزل العاثيات من العينات البيئية لعقود من الزمن باستخدام المبادئ التي وضعها رواد علم الأحياء الدقيقة. كانت عزل العاثيات التي تصيب مضيفات المفصليات محدودة ، ربما بسبب انخفاض معدل النجاح للعديد من تقنيات العزل السابقة ، مما أدى إلى وجود مجموعة ممثلة تمثيلا ناقصا من العاثيات المفصلية المتاحة للدراسة. تستخدم تقنية التخصيب الموصوفة هنا ، على عكس العديد من التقنيات الأخرى ، مستخلص مفلتر خال من البكتيريا الملوثة كأساس لمؤشر نمو البكتيريا ، Arthrobactersp. KY3901 ، على وجه التحديد. عن طريق إزالة بكتيريا التربة أولا ، لا يتم إعاقة العاثيات المستهدفة بسبب المنافسة مع بكتيريا التربة الأصلية الموجودة في عينات التربة الأولية. أدت طريقة التخصيب هذه إلى العشرات من العاثيات الفريدة من عدة أنواع مختلفة من التربة ، بل وأنتجت أنواعا مختلفة من العاثيات من نفس عينة التربة المخصبة المعزولة. يمكن توسيع استخدام هذا الإجراء ليشمل معظم الوسائط الهوائية الغنية بالمغذيات لعزل العاثيات في مجموعة متنوعة من البكتيريا المضيفة المثيرة للاهتمام.
في كل مكان من الأنواع الفصلاء في بيئات التربة يقدم عدد كبير وتنوع فاجات قابلة للعزل من هذه الأنواع من البكتيريا المضيف. أعضاء البكتيري للأسرة Acintobacteriaceae هم أبرز لمسارات تقويضي بهم من تدهور مركبات المتمردة مثل الأترازين ومختلف المبيدات الحشرية ومبيدات الأعشاب الأخرى 1،2،3. على الرغم وقد تم ذلك معظم الأبحاث باستخدام سلالات البيئية للالفصلاء، العزلات السريرية لهذا جنس وجدت في الدم والبول، والعيون، والعديد من المصادر البشرية الأخرى عن عرض التجانس النشوء والتطور 4.
في حين أن هناك مجموعة واسعة بدلا من البحث عن البكتيريا الفصلاء، فقط تقرير عدد قليل من الدراسات على فاجات القادرة على إصابة أفراد هذا الجنس المتنوع. على الرغم من المثير للاهتمام، العمل المنجز سابقا على الفصلاء فاجات اللمسات على عدة مواضيع رئيسية متميزة مثل الكتابة التربة <م> الأنواع الفصلاء 5، والاستخدامات الصناعية بهدف الحد من رغوة الضارة في محطات معالجة الحمأة المنشطة 6، والعمل تسليط الضوء على إعادة التركيب محدد الموقع والجينات إنزيم مدمج 7.
وقد استخدمت مختلف البروتوكولات تقنية تخصيب اليورانيوم لتوليد نقية فج يعزل في الأنواع الفصلاء. وتشمل الإجراءات المبكرة حضانات من التربة مع المواد السامة المضافة مثل الأملاح النيكوتين لفترات تزيد على سنة واحدة 8 مما أدى إلى فاجات القادرة على إصابة فقط A. globiformis. يسيل دراسات أجريت باستخدام التربة مع ظهرت العضوية عطوب لإنتاج فاجات اكتشافها عن طريق تقنيات فحص اللوحة، وحذف فترات حضانة طويلة 8. على الرغم من المثير للاهتمام، تم استخدام تقنية تشبه الطلاء المباشر في الماضي مما أدى إلى عدة فاجات في حين لا تزال تواجه نسبة نجاح منخفضة وخاصة من قبل المحققين 5، نقلا عن الدراسات السابقة مع معدلات النجاح منخفضة 8.
وعموما، كانت تقنيات عزل استخدمت في الماضي بارزة لديها فعالية كبيرة في الممارسة على الرغم من جنس الفصلاء تمثل التربة الهوائية الأكثر شيوعا عزل في الطبيعة 4،9،، فان Twest وKropinski 10 طرق لتخصيب الحالية لعزل فاجات من المياه والتربة مقتبس من التقنيات السابقة المستخدمة في تخصيب العزلات البكتيرية البيئية ولكن تقنيات تخصيب هذه أثبتت عدم كفاءة في عزل فاجات الفصلاء. والغرض من هذا الأسلوب هو موضح هنا هو إظهار "دليل على مفهوم" أن أساليب التخصيب في وقت مبكر يمكن تكييفها لباستمرار وبشكل فعال عزل فاجات الفصلاء، والتغلب على التحديات التقنية السابقة المرتبطة عزل فاجات من هذا جنس البكتيريا.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
1. إعداد الخلايا Arthobacter لفج عزل
2. جمع فج من عينات التربة
3. فج عزل
4. فج تنقية
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
لإثبات استنساخ لتحسين تقنية تخصيب للفاجات الفصلاء، استخدمت 30 عينات من التربة مختلفة في أوقات مختلفة وأماكن خلال فصلي الربيع والصيف من عام 2014. ومن بين هذه العينات 30 التربة تم الحصول فاجات الفصلاء فريدة من 22 من عينات التربة التي تم جمعها باستخدام هذا التخصيب الإجراء. أسفرت الإجراء تخصيب القياسية فاجات فريدة من 3 من عينات التربة نفسها. يمكن للعينات تخصيب يكون لها عيار فج عالية جدا التي تحتاج إلى التخفيف الأولي لعزل ويحات أو عيار فج منخفض نسبيا تتطلب حجم أكبر من...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
وعلى الرغم من العديد من المحاولات السابقة لعزل فاجات القادرة على إصابة المضيفين الفصلاء، كان لدينا نجاح يذكر باستخدام إجراءات تخصيب القياسية. طريقة المعمم تخصيب البكتيرية المتقدمة وتكييفها من قبل فان Twest وKropinski 10 إلى إثراء فاجات من العينات البيئية يبقى الأساس بالنسبة لغالبية إجراءات التخصيب. أدلة من دراسات سابقة تشير إلى أن أساليب الطلاء المباشر أنتجت لوحات للكشف عن سلالات الفصلاء ولكن مع معدلات النجاح منخفضة جدا من العزلة 5. مع أسلوب...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
الكتاب تعلن أي المصالح المالية المتنافسة.
تم توفير التمويل لتطوير هذا البروتوكول من قبل اتحاد جنوب شرق ولاية بنسلفانيا للتعليم العالي ووزارة العلوم كابريني كلية. وجاء التمويل ودعم إضافي من جامعة أركاديا وجامعة الطاهرة. نشكر خصوصا الدكتورة كارين Snetselaar في جامعة القديس يوسف لتتكرم أخذ الصور الإلكترون المجهري من فاجات معزولة لدينا. وقدم دعم إضافي من قبل الصيادين معهد هوارد هيوز الطبي التحالف تعليم العلوم فج النهوض علم الجينوم والتطوري العلوم برنامج (SEA-فاجات).
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| مسحوق مرق LB | فيشر | BP9722-2 | من الأفضل طلبها بكميات كبيرة. |
| حبيبات أجار | فيشر | BP1423-2 | من الأفضل طلبها بكميات كبيرة. |
| مرشحات حقنة 0.22 أم | فيشر | 09-719A | |
| 0.22 مرشحات أم بوشنر | فيشر | 430320 | يمكن الحصول على أكثر من 50 مل من السائل عن طريق تبديل أنبوب الاستقبال بعناية. |
| أنابيب إيبندورف | فيشر | 05-408-129 | |
| 5 مل ماصات فردية | فيشر | 13-678-11D | |
| 50 مل أنابيب مخروطية | فيشر | 76002844 | |
| 15 مل أنابيب مخروطية | فيشر | 76002845 | |
| 10 مل ماصات فردية | فيشر | 13-676-10J | |
| 25 مل ماصات فردية | فيشر | 13-676-10 كيلو | |
| ورق الترشيح النوعي Whatman | فيشر | 1001-824 |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن