يصف هذا البروتوكول كيفية استخدام الكمي في الوقت الحقيقي PCR (QRT-PCR) للكشف عن مرنا محددة الخلايا السرطانية تمثل ورم خبيث في الأنسجة الماوس الرئة.
مقالة منهجية
يصف هذا البروتوكول كيفية استخدام الكمي في الوقت الحقيقي PCR (QRT-PCR) للكشف عن مرنا محددة الخلايا السرطانية تمثل ورم خبيث في الأنسجة الماوس الرئة.
المرض المنتشر هو انتشار الخلايا السرطانية الخبيثة من موقع السرطان الأساسي لجهاز بعيد وهو السبب الرئيسي لسرطان الوفيات المرتبطة 1. وتشمل المواقع المشتركة للانتشار النقيلي الرئة، العقدة الليمفاوية والمخ، والعظام 2. الآليات التي تدفع الانبثاث هي مناطق مكثفة لأبحاث السرطان. ونتيجة لذلك، المقايسات فعالة لقياس العبء المنتشر في مواقع بعيدة الانبثاث هي مفيدة لأبحاث السرطان. تقييم الانبثاث الرئة في نماذج ورم الثدي تتم عادة عن طريق الملاحظة النوعية الإجمالية للأنسجة الرئة بعد تشريح. الأساليب الكمية لتقييم ورم خبيث تقتصر حاليا لخارج الحي وتقنيات التصوير مقرها الجسم الحي والتي تتطلب المعلمات التي يحددها المستخدم. العديد من هذه التقنيات هي في مستوى الحي كله وليس على المستوى الخلوي 3-6. على الرغم من أن وسائل التصوير الجديدة استخدام متعدد الفوتون المجهر قادرة على تقييم metastasis على المستوى الخلوي 7، هذه الإجراءات أنيقة للغاية هي أكثر ملاءمة لتقييم آليات نشر بدلا من التقييم الكمي للعبء النقيلي. هنا، يتم تقديم طريقة بسيطة في المختبر لتقييم كمي لورم خبيث. باستخدام كمية الوقت الحقيقي PCR (QRT-PCR)، ويمكن الكشف عن مرنا الخلايا السرطانية معين داخل أنسجة الرئة الماوس.
ويقترح تحليل QRT-PCR كوسيلة لتقييم الورم ورم خبيث. ويقترح هذا الأسلوب كبديل للمستخدمين الذين يرغبون في تقييم ورم خبيث ولكن قد لا يكون الحصول على معدات معينة مثل في الجسم الحي معدات التصوير أو مضان المجسام قادرة. وتقدم يتبع مناقشة الأساليب المستخدمة عادة من قبل مظاهرة لكيف يمكن استخدام تحليل QRT-PCR إما منفصلة أو كوسيلة مصاحب لتقييم ورم خبيث. هذا الإجراء لديه القدرة على تقديم تحليل كمي لعبء النقيلي.
الطرق المعيارية لتحليل الإجمالي، بما في ذلك التصور من الرئتين تحت stereomicroscope وكذلك باجتزاء المسلسل تليها الهيماتوكسيلين ويوزين (H & E) تلطيخ من أنسجة الرئة، وقابلة للقياس الكمي ولكن تعتمد بشكل كبير على المستخدم تعريف المعلمات لحساب 2-5. عند تقييم الرئتين بأكملها باستخدام stereomicroscope، الانبثاث السطح الكبيرة فقط هي VISIبليه ويتطلب تحليل المحقق أن لديهم معرفة معقولة من الرئة التركيب التشريحي لتحديد ما يشكل آفة المتنقل. وضع العلامات الفلورية من الخلايا السرطانية مع علامة مثل GFP واستخدام stereomicroscope الذي يحتوي مكعب الضوء مع ماكسيما المناسب الإثارة / الانبعاثات (على سبيل المثال قرب 470/510 نانومتر لGFP) يساعد في هذه العملية، ولكن فقط العقيدات الورم سطح قابلة للكشف . بالإضافة إلى ذلك، مضان من تلوث الدم، وهو أمر واضح تحت نفس المعلمات كما GFP، قد يؤدي إلى هوية مزورة من الآفات النقيلي المحتملة.
باجتزاء في الرئة تليها H & E تلطيخ لتصور الانبثاث الرئة هو طريقة مفيدة لتقييم micrometastases والعمليات المجهرية الأخرى بما في ذلك تسلل الخلايا المناعية ولكن غالبا ما يتطلب استخدام أنسجة الرئة بالكامل لتضمين البارافين، باجتزاء، والإجراءات تلطيخ. ولذلك، الإجراءات النهائية ليست مثالية تتبع هذا methoد. على الرغم من أن قياس الكمي، هذا الإجراء يتطلب المحقق لتقييم عدد كبير من أقسام الرئة الملون لكل حيوان للتأكد من أن التحليل يمثل هيكل 3D كامل من الرئة. ونتيجة لذلك، وهذا النوع من الفحص هو مضيعة للوقت، يمكن أن يؤدي إلى احتساب الخطأ، وتحليل يعتمد بشكل كبير على محقق تقدير.
العديد من تقنيات التصوير في الجسم الحي (مثل التصوير بالرنين المغناطيسي، PET، SPECT) وتستخدم حاليا لإجراء اختبار أو العمليات البيولوجية في نماذج القوارض التجريبية 8. في الجسم الحي التصوير إضاءة الحيوية هو أسلوب شائع استخدامها للحصول على رأي الإجمالي من ورم خبيث 9. يتم تطبيق هذه التقنية بشكل عام لتقييم وجود نشاط luciferase المراسل بسبب تراكم الخلايا السرطانية، والتي صممت لاحتواء عنصر استجابة luciferase المراسل، الموجودة في أجهزة معينة مثل الغدة الثديية بعد زرع الخلايا السرطانية والرئة على الانبثاث عفوية 1وبفعل 0 التصور النشاط luciferase المراسل عن وجود الركيزة وسيفيرين (D-وسيفيرين). luciferase المراسل يحفز نزع الكربوكسيل التأكسدي من D-وسيفيرين إلى oxyluciferin توليد تلألؤ بيولوجي. في حين بالمعلومات، وهذه الطريقة محدودة بسبب العديد من العوامل بما في ذلك استقرار الركيزة (أي قصيرة العمر النصفي)، التوزيع المناسب للالركيزة التي تعتمد على كيفية تسليمها إلى حيوانات التجارب، وانخفاض الحساسية للكشف عن 9. A الفضل الاساسي لهذه التقنية هي أنها غير الغازية، لا يمكن أن يؤديها على الحيوانات الحية، ويمكن أن يؤدي إلى الكشف عن النقائل الخلايا السرطانية في الأجهزة المتعددة التي ربما لم تحصد عادة في تشريح 9،10.
وأحد الجوانب الإيجابية للفي الجسم الحي تقنيات التصوير هو أن أنسجة الرئة ودون أن يمسها السماح للإجراءات الثانوية مثل البارافين التضمين أو المعروضة هنا، تحليل QRT-PCR. ومع ذلك، لأن QRT-PCR هو theoreticaLLY مقياسا أكثر حساسية من الكشف والتقييم الإجمالي قد لا تكشف عن انخفاض أعداد الخلايا السرطانية موجودة في الرئة. وإن كان مفيدا، وتقنيات التصوير المذكورة أعلاه يمكن أن تكون بديلا أو تستكمل مع أسلوب QRT-PCR توصف حاليا. QRT-PCR لديه القدرة على توفير قدر حساسية مرنا المستمدة من ورم داخل الرئة.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
بروتوكول يتبع المبادئ التوجيهية والمعايير رعاية الحيوان من كلية الطب بجامعة ولاية كارولينا الجنوبية (MUSC) ورعاية الحيوان المؤسسية واللجنة الاستخدام (IACUC).
1. الرئة تشريح
2. عزل الحمض النووي الريبي
ملاحظة: بالنسبة لتحليل تمثيلي، تم عزل الحمض النووي الريبي باستخدام طقم عزل الحمض النووي الريبي (انظر قائمة المواد). في حين يستخدم التحليل الحالي المنتج مصنع واحد محدد، وتتوفر من عدة بائعين السمعة مجموعة متنوعة من مجموعات العزلة. بالإضافة إلى ذلك، غير طقم-أساليب الطرد المركزي مقرها هي أيضا خيار. [كدنا يجب إعداده من عينة السيطرة RNA إيجابية، مثل خط خلية أو البلازميد، لتحليل منحنى القياسية. بدلا من ذلك، يمكن شراء تحكم إيجابية محددة لتحقيق مجموعة التمهيدي (انظر قائمة المواد).
3. ستراند الأولى التجميعي
ملاحظة: بالنسبة لتحليل تمثيلي، تم إجراء الناسخ العكسي (RT) رد فعل Fأوال ستراند [كدنا عدة التوليف مصممة لQRT-PCR (انظر قائمة المواد).
4. في الوقت الحقيقي PCR
ملاحظة: بالنسبة لتحليل تمثيلي، وكان يستخدم SYBR الأخضر. ومع ذلك، يمكن أن تكون بديلا أي الأسلوب المفضل في السلطة التقديرية للمستخدم.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ما وراء الوقت المستغرق لأداء التلقيح الأولي من الخلايا السرطانية في حيوانات التجارب وإذا المنفذ، والابتدائي في تحليل الورم الجسم الحي، وحصاد الأنسجة والعزلة RNA، وتحليل QRT-PCR هو إجراء 1-2 يوم (الشكل 1) .
مثال على التحليل الإجمالي هو التصوير إضاءة الحيوية لتقييم الخلايا السرطانية داخل أنسجة الرئة. هنا، تم إجراء ا...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
يصف هذا البروتوكول استخدام QRT-PCR لتقييم الثديية ورم خبيث الخلايا السرطانية إلى الرئة باستخدام نموذج طعم أجنبي الماوس. ومن المسلم به أن التقنيات الأخرى، بما في ذلك التصوير إضاءة الحيوية، متاحة وفعالة للكشف عن ورم خبيث الرغم من وجود قيمهم والقيود أيضا. البيانات المقدمة توحي بأن QRT-PCR يوفر تدبيرا فعالا لكشف مرنا المستمدة من ورم داخل أنسجة الرئة لتحديد الكميات من إجمالي ورم خبيث. يقترح هذا التحليل QRT-PCR يوفر طريقة الثانوي التي يمكن أن تكمل أو أن يقوم بدلا من هذه التقنيات التصوير...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
لا يعملون ESY وMAA التي كتبها FirstString البحوث وشركة لا يحملون أي مصلحة مالية في الشركة. قدمت FirstString أبحاث شركة البيانات التصوير luciferase المراسل الذي قدم في هذه المخطوطة. GSG هو الرئيس والرئيس التنفيذي لشركة أبحاث FirstString. CLG هو موظف للبحوث FirstString. GSG وCLG ديك خيارات الأسهم الصادرة عن أبحاث FirstString.
يتم اعتماد مختبر يه بواسطة تمويل البحوث من الجمعية الأمريكية للسرطان المؤسسية منحة بحثية (IRG-97-219-14) منحت لمركز هولينغ السرطان في MUSC، من خلال تمويل البحوث من منحة وزارة الدفاع (W81XWH-11-2- 0229) في MUSC، وجائزة من القلق مؤسسة (لESY).
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| 2-mercaptoethanol | Fisher | BP176-100 | |
| DNAse | Thermo Scientific | EN0521 | |
| GeneJet RNA Isolation | Kit Thermo Scientific | K0732 | |
| iScript Reverse Transcription Supermix ل QRT-PCR | Bio-Rad | 1708841 | |
| iTaq Universal SYBR Green Supermix ؛ | بيو راد | 172-5121 | |
| اختبار PrimePCR SYBR الأخضر: ERBB2 ، Human ؛ | بيو راد | 100-25636 | |
| قالب PrimePCR لمقايسة SYBR الخضراء: ERBB2 ، Human ؛ | بيو راد | 100-25716 | |
| تسلسل التمهيدي | ل-ATGGTGAAGGTCGGTGTGAACG Rev-CGCTCCTGGAAGATGGTGATGG |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن