$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1. إعداد الشتلات
- تعقيم البذور.
- تحضير محلول التعقيم عن طريق إضافة 500 ميكرولتر NaClO (الكلور المتاحة: 5.0٪) و 1 ميكرولتر 10٪ تريتون X-100-500 ميكرولتر الماء المعقم.
- مكان كاليفورنيا 10 المعدلة وراثيا A. thaliana البذور تحمل GFP-PATROL1 8 في أنبوب 1.5 مل.
- إضافة 1 مل 70٪ محلول الإيثانول، ومزيج جيد من قبل قلب خمس مرات. يترك لمدة 1 دقيقة.
- مراقبة البذور تنزل الى قاع الأنبوب. في نظيفة مجلس الوزراء تدفق الصفحي، وإزالة بلطف الايثانول 70٪ باستخدام micropipette، وإضافة 1 مل من محلول التعقيم. مزيج جيد من قبل قلب خمس مرات ويترك لمدة 5 دقائق.
- تغسل البذور. لا تزال تعمل تحت ظروف معقمة على مقاعد البدلاء النظيفة، وإزالة بلطف الحل باستخدام micropipette، وإضافة 1 مل من الماء المعقم. كرر هذه خمس مرات. يمكن تخزين البذور المعقمة في الماء المعقم عند 4 درجة مئوية لمدة 2 أيام.
- هكذاث البذور المعقمة على 0.5٪ جيلان-عزز اللثة 1/2 Murashige وسكوغ لوحة المتوسطة (درجة الحموضة 5.8) 9. الشريط غطاء على لوحة باستخدام طبقتين من الشريط الجراحية.
- احتضان لوحة في الظلام في 4 درجة مئوية مع غرفة التخزين البارد، O / N.
- نقل لوحة في غرفة النمو وضعت في 23.5 درجة مئوية مع / 12 ساعة دورة ضوء الظلام لمدة 12 ساعة باستخدام 100 ميكرومول م -2 ثانية -1 أضواء بيضاء، واحتضان لمدة 7 أيام. الشتلات مع النبتات من حوالي 1 مم طويل ويمكن بعد ذلك أن تحصد.
2. السماء قطرة تركيب النبتة العينات
ملاحظة: ثمة عامل مهم في إعداد العينات للمراقبة VAEM هو تجنب إدراج فقاعات الهواء بين العينة وغطاء زجاجي. فقاعات يقلل كثيرا من جودة الصورة من خلال التسبب في VAEM الاختلافات في معامل الانكسار. وهناك طريقة بسيطة، والتي طالبنا 'قطرة السماء "تصاعد مستمر، ويمكن استخدامها لتجنب الفقاعاتبين A. النبتات thaliana وغطاء زجاجي. ينبغي أن يتم ذلك مباشرة قبل المراقبة.
- ضع 30 ميكرولتر من العازلة القاعدية [5 ملي 2- (N -morpholino) -ethanesulfonic حمض تريس (MES-تريس) في درجة الحموضة 6.5، 50 ملي بوكل، 100 ميكرومتر CaCl 2] في وسط شريحة زجاجية (الحجم: 76 × 26 مم، سمك: 1،0-1،2 مم).
- إزالة فلقة من الشتلات القديمة لمدة 7 أيام باستخدام مقص تشريح. تعويم فلقة مع الجانب المراقبة تواجه حتى على قطرة القاعدية العازلة (الشكل 1، الخطوة 1).
- ضع 30 ميكرولتر من العازلة القاعدية في وسط غطاء زجاجي (الحجم: 18 × 18 مم، سماكة: 0،12-0،17 مم) (الشكل 1 الخطوة 2). تحويل الزجاج غطاء رأسا على عقب بلطف. والتوتر السطحي منع انخفاض عازلة من السقوط. عقد غطاء زجاجي مع ملاقط على حافة واحدة. ضع حافة المعاكس على شريحة زجاجية بحيث انخفاض عازلة تقريبا فوق فلقة.
- مع حافة غطاء زجاجي لا يزال على الشريحة، والاستمرار في الضغط على الحافة المقابلة مع ملاقط، وضبط الموقف من الانخفاض عازلة تحت غطاء زجاجي بحيث تكون مباشرة فوق العينة فلقة (الشكل 1، الخطوة 3). ترك من الزجاج غطاء. جبل انخفاض على عينة مما أدى إلى إعداد دون فقاعات الهواء.
- تمحو عازلة الزائد باستخدام أنسجة خالية من الوبر. مراقبة إعداد فورا (راجع الخطوة 3).
ملاحظة: ليست هناك حاجة لختم العينات.
3. VAEM مراقبة واكتساب السينما
ملاحظة: نظام المجهر TIRF 9 المستخدمة في هذه الدراسة يوصف على النحو التالي: تم تجهيز مجهر مقلوب مع وحدة TIRF وعدسة موضوعية TIRF مع الفتحة العددية 1.49. من أجل السيطرة الآلية لزاوية دخول الليزر، يتم استخدام مربع عنصر التحكم. بروتين الفلورية الخضراء (GFP) هو متحمس مع 488 نانومتر ضخ بصريا ليزر أشباه الموصلات، وروقال انه تم الكشف عن مضان من خلال 510-550 نانومتر الفرقة تمرير فلتر لمنع تألق ذاتي من البلاستيدات الخضراء. القيمة القصوى المقاسة من انتاج الألياف السلطة هي 13،0-13،5 ميغاواط. للكشف، إلكترون تتضاعف الجهاز المسؤول عن جانب (EM-CCD) نظام الكاميرا رئيس وحدة تغير الكاميرا التكبير C-جبل تستخدم.
- معايرة معدات الاختبار والتركيز وفقا لتعليمات الشركة الصانعة.
ملاحظة: هذه الخطوة الحاسمة لملاحظات VAEM دقيقة. فمن المستحسن أن فحوص دورية للإجراءات تعديل مسار الليزر، ومناسبة لالمجهر، يتم تنفيذها. - تحديد الموقف المركزي مضيئة مع موضوعي مسار الضوء خالية من العدسة على سقف الغرفة المجهري. بمناسبة موقعا مركزيا، ووضع ختم دائرة الملونة على السقف (الشكل 2، الخطوة 1، 2).
- إلقاء الضوء على السقف مع العدسة الشيئية (الشكل 2 الخطوة 3، 4). نقل طlluminated المنطقة إلى موقف وسط (الشكل 2، الخطوة 5). تركيز الليزر (الشكل 2، الخطوة 6). صقل موقف ليزر مركز لمركز (الشكل 2، الخطوة 7).
- وضع العينة على مرحلة المجهر وتحديد خلايا للمراقبة باستخدام إضاءة حقل مشرق.
- تأكد من أن بروتين فلوري يمكن ملاحظة في الخلايا، وتحديد موقف ض -axis على سطح الخلية باستخدام epifluorescence إضاءة (الشكل 3A).
- أداء الملاحظات VAEM.
- تركنوا زاوية دخول شعاع الليزر تدريجيا مع مربع وحدة تحكم. وفي الوقت نفسه، رصد صورة حية بعناية. في البداية، سوف يكون واضحا للصورة (الشكل 3B).
- كما يزيد زاوية الليزر، فإن الصورة VAEM تصبح أقل واضح، في نهاية المطاف إنتاج صورة واضحة (الشكل 3C وD). في هذه المرحلة، ووقف increaالغناء زاوية الليزر. في حالة فقدان إشارة مضان، تنخفض إلى زاوية الضحلة.
- صقل زاوية دخول ليزر للحصول على أفضل صورة. صقل موقف ض -axis يمكن أيضا تحسين الصورة. إذا لزم الأمر، وضبط المعلمات البصرية (قوة الليزر، والطول الموجي ومجموعة فلتر) والمعلمات صورة الاستشعار [حجم الصورة، وقت التعرض، كسب، التحويل الرقمي وبضرب الإلكترون (EM) أرباح].
ملاحظة: في حالة المعدات المجهر TIRF المذكورة أعلاه، المعلمات التمثيلية هي على النحو التالي. التكبير من عدسة عادل امام الكاميرا: 2X. انتاج الليزر: 1،0 ميغاواط. حجم الصورة: 512 × 512 بكسل. وقت التعرض: 100 مللي ثانية. كسب: 5 ×؛ التحويل الرقمي: 11 ميغاهرتز؛ وEM مكاسب: 100.
- الحصول على الفيلم باعتباره TIFF ملف صورة متعددة الصفحات باستخدام برنامج المجهر التجاري. هنا، والفيلم هو من النقاط المسمى GFP امض على سطح خلايا الثغور.
ملاحظة: التمثيلية شروط الحصول على الصور هي كما فلأدنى مستوياته. الوضع الاستحواذ: تيار لذاكرة الوصول العشوائي؛ عدد الإطارات: 600؛ وحجم متعدد الصفحات ملف TIFF: ~ 302 MB.
4. تحليل مخطاط التموج لالكمي لالمسمى GFP دوت الإقامة الوقت عن طريق فيجي البرمجيات
- تثبيت فيجي ('فيجي هو فقط يماغيج') برنامج 10 باستخدام إرشادات المؤلفين (http://fiji.sc/Fiji).
- تشغيل فيجي وفتح ملف TIFF متعددة الصفحات المكتسبة باستخدام القائمة فيجي "ملف المفتوحة".
- وضع خط على موقع مصلحة، وذلك باستخدام أداة فيجي شريط القوائم "خط مستقيم أداة التحديد". اختياريا، واستخدام "مقطع الخط أداة التحديد" أو "حر الخط أداة التحديد". في النتائج المعروضة هنا، وضعت خط مستقيم من 100 بكسل (الموافق 8،0 ميكرون) على خلية تابعة الشكل (4A).
- تقديم صورة مخطاط التموج باستخدام القائمة فيجي "صورة-الأكوام-الديناميكي Reslice "(http://fiji.sc/Dynamic_Reslice) (الشكل 4B). اختياريا، "الوجه عموديا" و "استدارة 90 درجة" في إطار خانة الاختيار متاحة (لا تستخدم في النتائج المقدمة هنا). وX- و y-axis في الصورة مخطاط التموج تشير إلى موقف خط (100 بكسل المقابلة لكما 8.0 ميكرون)، ووقت رصد (600 بكسل الموافق 60 ثانية)، على التوالي. إذا كانت الصورة مخطاط التموج ليست مرضية، وموقف ونوع (على التوالي، مجزأة ومرفوعة) من خط على الصورة متعدد الصفحات قد تغيرت. كما التغييرات الخط، صورة مخطاط التموج يتغير بشكل حيوي. حفظ صورة مخطاط التموج كملف TIFF باستخدام القائمة فيجي "ملف-حفظ باسم-المشاجرة".
- قياس طول النقطة في اتجاه محور الزمن.
- لأداء الحد من الضوضاء، وتطبيق فلتر التمويه على الصور مخطاط التموج باستخدام القائمة فيجي "عملية-فلاتر التمويه الضبابي". و"سيغما (رادالناهية) "المعلمة غير الانضباطي (يستخدم 1 بكسل دائرة نصف قطرها عن النتائج المقدمة).
- الجزء المناطق إشارة من العتبة، وذلك باستخدام القائمة فيجي "صورة-ضبط-عتبة".
ملاحظة: هناك العديد من الخوارزميات العتبة للاختيار من بينها. في النتائج المقدمة، تم اختيار خوارزمية "الين" (الشكل 4C). - الاستعداد لقياس الوقت (ص) -axis طول النقطة باستخدام القائمة "القياسات تحليل-مجموعة". التحقق من "المستطيل إحاطة" في "مجموعة قياسات" النافذة. من الناحية المثالية ينبغي أن تكون مجموعة منطقة صغيرة قدر الإمكان، على أن تستبعد الضوضاء. هنا، تم تعيين الحد الأدنى من المنطقة في 50 بكسل. قياس الوقت (ص) -axis طول النقطة باستخدام القائمة "تحليل-تحليل الجزيئات". للحصول على القيم نتيجة وإثبات مصداقية المناطق القياس، والتحقق من "عرض النتائج" و "إضافة إلى مدير </ م> "صناديق.
- القيم في العمود "الطول" هي الوقت (ص) -axis أطوال لسائل قياس (الشكل 4D). حفظ القيم باستخدام القائمة جدول نتائج "ملف-حفظ باسم" وحساب ومعالجة بيانات من فترات صورة النقطة باستخدام الحزمة الإحصائية و / أو برنامج جداول البيانات (الشكل 4E).