يصف هذا البروتوكول كيفية إنشاء خط خلية ذبابة الفاكهة S2 حساس لمثبطات الجزيئات الصغيرة ل kinesin-5. كما تم توضيح استخدام هذه الخلايا في مقايسة تصحيح الأخطاء المستندة إلى الخلية.
مقالة منهجية
يصف هذا البروتوكول كيفية إنشاء خط خلية ذبابة الفاكهة S2 حساس لمثبطات الجزيئات الصغيرة ل kinesin-5. كما تم توضيح استخدام هذه الخلايا في مقايسة تصحيح الأخطاء المستندة إلى الخلية.
Kinetochores هي هياكل كبيرة قائمة على البروتين تتجمع على السنتروميرات أثناء انقسام الخلية وتربط الكروموسومات بالأنابيب الدقيقة المغزل. يتطلب التوزيع الصحيح للمادة الوراثية أن تصبح الحركية الشقيقة على كل كروموسوم ثنائية الاتجاه عن طريق الارتباط بالأنابيب الدقيقة من أقطاب المغزل المتقابلة قبل التقدم إلى الطور. ومع ذلك ، فإن حالات التعلق الخاطئة وغير ثنائية الاتجاه شائعة وتوجد مسارات خلوية لاكتشاف وتصحيح مثل هذه المرفقات أثناء انقسام الخلية. يشار إلى العملية التي يتم من خلالها زعزعة استقرار التفاعلات الحركية والأنابيب الدقيقة غير الصحيحة باسم تصحيح الخطأ. لدراسة تصحيح الخطأ في الخلايا الحية ، يتم إنشاء المرفقات غير الصحيحة عن قصد عن طريق التثبيط الكيميائي لمحرك كينيسين -5 ، مما يؤدي إلى تجميع المغزل أحادي القطب ، ويلاحظ الانتقال من سوء الاتجاه إلى ثنائي الاتجاه بعد غسل المخدرات. يشكل العدد الكبير من الكروموسومات في العديد من أنواع خلايا زراعة الأنسجة النموذجية تحديا في مراقبة أحداث تصحيح الخطأ الفردية. ذبابة الفاكهة تعتبر خلايا S2 موضوعات أفضل لمثل هذه الدراسات لأنها تمتلك ما لا يقل عن 4 أزواج من الكروموسومات. ومع ذلك ، فإن مثبطات كينيسين 5 الجزيئية الصغيرة غير فعالة ضد ذبابة الفاكهة كينيسين -5 (Klp61F). نصف هنا كيفية بناء خط خلية ذبابة الفاكهة الذي يستبدل بشكل فعال Klp61F بكينيسين 5 البشري ، مما يجعل الخلايا حساسة للتثبيط الدوائي للمحرك ومناسبة للاستخدام في مقايسة تصحيح الخطأ القائم على الخلية.
الفصل المتساوي للجينوم خلال انقسام الخلايا يتطلب التفاعل الصحيح بين الحمض النووي والمغزل الأنابيب الدقيقة منسوخة. الأنابيب الدقيقة التفاعل بأنفسهم مع الكروموسومات من خلال مجموعة متكاملة من البروتينات التي تجمع في القسيم المعروفة باسم الحيز الحركي 1. التوزيع الصحيح للكروموزومات يتطلب أن kinetochores الشقيقة وbioriented، التي يرتبط كل أخت مع الأنابيب الدقيقة النابعة من أقطاب المغزل المعاكس. الحيز الحركي أنيبيب (MT كيلوطن) المرفقات التي ليست في التشكل bioriented يتم بسرعة وكفاءة زعزعة استقرار لإتاحة الفرصة لإقامة biorientation في عملية تعرف باسم تصحيح الخطأ. مقايسة تصحيح الخطأ الذي أنشئ في السابق خلايا الثدييات 5 يتطلب تجميع مغزل أحادي باستخدام مثبطات جزيء صغير عكسها ضد Eg5 (كينيسين-5). العلاج من تعاطي المخدرات يولد العديد من المرفقات syntelic الخاطئة التي بوتkinetochores ح شقيقة نعلق على نفس القطب المغزل. وفشل لاحق من هذا الدواء يسمح لرؤية عملية تصحيح الخطأ. ويمكن أن يتم فحص تصحيح الخطأ في وجود مثبطات جزيء صغير أو knockdowns لدراسة مساهمة البروتينات مرشح لتصحيح الخاطئة إرفاق ملفات KT-MT.
القدرة على تصور تصحيح الخطأ في الخلايا الحية هي أداة قوية لمزيد من فهم الآلية الجزيئية تشارك في هذه العملية المعقدة. ومع ذلك، فإن عددا كبيرا من الكروموسومات الموجودة في معظم خطوط الخلايا يشكل تحديا في مراقبة الفردية إرفاق ملفات KT-MT. فإن خلايا ذبابة الفاكهة S2 يكون مثاليا لتطبيق فحص تصحيح الخطأ لأنها تحتوي على عدد قليل من 4 الكروموزومات 6، ولكن مثبطات جزيء صغير من كينيسين 5 مثل S-trityl-L-السيستين (STLC) وmonastrol 7-9 لا تؤثر التجمع المغزل أو كينيسين-5 وظيفة الحركة في خلايا ذبابة الفاكهة. وبالتالي فإننا أجناستيد خط خلية ذبابة الفاكهة S2 معربا عن كينيسين-5 البشري تحت المروج محرض التي تعتبر حساسة لكينيسين-5 مثبطات. يصف هذا البروتوكول كيفية ضربة قاضية للالذاتية ذبابة الفاكهة كينيسين-5 نديد، Klp61F، واستخدام هذا الخط خلية في خلية القاعدة تصحيح الخطأ الفحص.
1. خلايا Transfecting S2
2. RNA التدخل
3. يعيش التصوير خلية
4. تصحيح الخطأ الفحص
مطلوب Klp61F لتشكيل مغزل القطبين. كينيسين-5 البشري، Eg5، يمكن إنقاذ وظيفة Klp61F في خلايا ذبابة الفاكهة S2 (الشكل 1A و D). على إضافة المانع كينيسين-5 (STLC)، ومستويات المرتبط أنيبيب من الانخفاض محرك (1B الشكل وE)، وانهيارات المغزل، مما أدى إلى احتكار (الشكل 1C وF) في الخلايا التي تفتقر الذاتية Klp61F على رني الناجح (فيلم التكميلي 1). ومن الجدير بالذكر أن مغزل القطبين تنهار على إضافة STLC في الخلايا S2 أنسنة لكينيسين-5 النشاط غير مطلوب للحفاظ على الثنائية القطبية المغزل في الخلايا البشرية. قد يكون هذا التناقض المثير للاهتمام نتيجة للاختلافات في تداخل بين القطبين أنيبيب و / أو الاستقرار في النظم نموذج اثنين 14. كينيسين-5 تثبيط (الشكل 2A وE) يمكن ريف rsed عن طريق الغسيل من المخدرات والتعافي من المغزل القطبين يمكن اتباعها مع مرور الوقت. على إزالة المانع (الشكل 2B وF)، وإعادة الزميلة-Eg5-mCherry مع ميكروتثبول بمثابة تجميع المغزل القطبين (الشكل 2C وG)، وخلايا يمكن أن تتطور إلى طور الصعود ثنائي القطب (الشكل 2D و H، فيلم التكميلي 2 ).

الشكل 1. إضافة 1 ميكرومتر STLC يؤدي إلى مغزل أحادي في خلايا ذبابة الفاكهة S2. صور الممثل من الوقت الفاصل بين التصوير من خلية ذبابة الفاكهة S2 معربا عن Eg5-mCherry (AC) وGFP-α تويولين (DF) خلال إضافة 1 ميكرومتر STLC. وأضاف Eg5 المانع في 3 دقائق. مقياس شريط = 5 ميكرون. الطابع الزمني = دقيقة: ثانية. w.jove.com/files/ftp_upload/53594/53594fig1large.jpg "الهدف =" _ فارغة "> الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2. الإصلاحات المغزل بين القطبين على إزالة STLC. صور الممثل من الوقت الفاصل بين التصوير من خلية ذبابة الفاكهة 2 معربا عن Eg5-mCherry (AD) وGFP-α تويولين (EH) خلال تجربة STLC فشل. وجرفت STLC بها في 5 دقائق. A الإصلاحات المغزل القطبين في حدود 1 ساعة من إزالة STLC. مقياس شريط = 5 ميكرون. الطابع الزمني: الحد الأدنى: ثانية الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

ww.jove.com/files/ftp_upload/53594/addin.mov "الهدف =" _ فارغة "> الفيلم التكميلي 1. (انقر بزر الماوس للتحميل). Widefield التصوير مضان من مثال ممثل خلية ذبابة الفاكهة S2 معربا عن Eg5-mCherry ( اليسار) وGFP-α تويولين (يمين). وأضيف 1 ميكرومتر STLC في 2 دقيقة، وأشكال المغزل احتكار في غضون 10 دقيقة بعد إضافة المانع. تم الحصول على الصور كل 1 دقيقة ولعب بمعدل 10 لقطة في الثانية مقياس بار = 5 ميكرون.

الفيلم التكميلي 2. (انقر بزر الماوس الأيمن للتحميل). التصوير Widefield مضان مثالا نموذجيا للخلية ذبابة الفاكهة S2 معربا عن Eg5-mCherry (يسار) وGFP-α تويولين (يمين). تمت إزالة وسائل الإعلام التي تحتوي على 1 ميكرومتر STLC وتشطف في 5 دقائق. A الإصلاحات المغزل القطبين في حدود 1 ساعة لإزالة المانع. تم الحصول على الصور كل 1 دقيقة ولعب بمعدل 10 لقطة في الثانية. مقياس شريط = 5 ميكرون.
تصور تصحيح الخطأ هو أسلوب قيمة لدراسة الخطوات المتبعة في هذه العملية الخلوية الهامة والمعقدة. للقيام بذلك، يتم إنشاء المرفقات الخاطئة باستخدام مثبطات عكسها، ورصدت تصحيح الخطأ على فشل الدواء. وقد تم تطوير هذا الفحص أصلا باستخدام خلايا الثقافة أنسجة الثدييات 5. ومع وجود عدد كبير من kinetochores في العديد من نموذج أنواع خلايا الثدييات يشكل تحديا في مراقبة الأحداث الفردية تصحيح الخطأ. خلايا ذبابة الفاكهة S2 تمتلك عدد قليل من 4 أزواج من kinetochores، مما يجعلها خط الخلية أكثر الأفضل لمراقبة تصحيح الخطأ. ومع ذلك، فإن العيب الرئيسي هو أن العديد من مثبطات غير فعالة في خلايا ذبابة الفاكهة S2. وهكذا، والقدرة على توليد خط خلية ذبابة الفاكهة S2 أنسنة الإنسان معربا عن كينيسين-5 يوفر أداة قيمة لدراسة تصحيح الخطأ.
على الرغم من أن خلايا ذبابة الفاكهة S2 يمكن أن يكونخط الخلية أفضل لدراسة تصحيح الخطأ، والخطوات المتعددة التي ينطوي عليها الحصول على خط الخلية وهدمت الجينات الأساسية تطرح بعض التحديات التي تواجه هذه التقنية. على سبيل المثال، يمكن أن يكون كفاءة ترنسفكأيشن منخفضة جدا. إذا كانت أقل من 20٪ من الخلايا تعبر عن Eg5-mCherry، وينبغي تكرار ترنسفكأيشن كما عملية الاختيار سوف يستغرق وقتا أطول. أيضا، فإن النسبة المئوية للخلايا التعبير عن كل البروتينات الفلورية قد ينخفض مع مرور الوقت. يمكن التغلب على ذلك عن طريق تقسيم الخلايا في وجود Blasticidin S حمض الهيدروكلوريك وهيغروميسين B لتحديد الخلايا معربا عن Eg5-mCherry وGFP-α تويولين، على التوالي. ومن المهم أيضا أن نلاحظ أن الخلايا ذبابة الفاكهة S2 لها orthologues إلى العديد من البروتينات البشرية و. لذا، فمن الأهمية بمكان لتحسين ظروف ضربة قاضية للبروتينات الذاتية. قد تختلف الظروف المثلى ضربة قاضية في كمية الرنا المزدوج الجديلة وطول فترة العلاج. وبالنظر إلى ظهور والتحسن السريع للكريسبر-Cas9 تكنولوجىوفاق 15-17، وتوليد خط خلية ذبابة الفاكهة مع الجين Klp61F استبداله Eg5 البشري يقدم بديلا قويا من شأنه التغلب على القيود المفروضة على ترنسفكأيشن ونهج ضربة قاضية. يوضح عملنا أن ذبابة لالبشري استبدال الجينات يجب أن يكون خيارا قابلا للتطبيق في هذه الحالة على الرغم من الكواشف اللازمة للقيام بذلك في خلايا ذبابة الفاكهة S2 يجري حاليا تطويرها.
ولا يقتصر هذا الإجراء لEg5، ولكن يمكن تطبيقها على دراسة وظيفة البروتينات الأخرى ذات الاهتمام. في حالة استخدام مثبطات التي سبق لها أن أنشئت لتكون فعالة في خلايا ذبابة الفاكهة S2، هذا البروتوكول يمكن تعديلها لدراسة التأثير المباشر لمثبطات في الخلايا الحية دون القلق بشأن آثار الهدف خارج. ويمكن أيضا أن خط الخلية المنتجة باستخدام هذا البروتوكول أن تستخدم في فحص عالية الإنتاجية تحليل لتحديد الأدوية التي تستهدف البروتينات المحتملة التي ينطوي عليها تصحيح الخطأ.
تعلن الكتاب أنه ليس لديهم المصالح المالية المتنافسة.
ونود أن نشكر باتريشيا ادز ورث عن هدية من كينيسين-5 بناء. وأيد هذا العمل من منحة المعاهد الوطنية للصحة (5 R01 GM107026) لTJM والبحوث منحة رقم 5 FY13-205 من مارس من مؤسسة مليم لTJM، وكذلك بدعم من مؤسسة تشارلز H. هود، وشركة، بوسطن، MA. لTJM
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| كاشف تعداء الفعالية | Qiagen | 301425 | |
| Klp61F cDNA | ذبابة الفاكهة مركز الموارد الجينومية | 13690 | اسم الجين LD15641 |
| شنايدر s Media | Invitrogen | 21720-024 | |
| مصل الأبقار الجنيني ، معتمد | Invitrogen | 10082-147 | معطل بالحرارة ، |
| كبريتات النحاس (II) من أصل أمريكي (CuSO4< / sub>) | Sigma | C8027-500G | 500 & nbsp ؛ مخزون mM |
| S-trityl-L-cysteine | Sigma | 164739-5G | 1 مخزون mM في DMSO |
| Blasticidin HCl | Invitrogen | R21001 | 5 مخزون ملغ / مل في 1x PBS |
| Hygromycin B | Invitrogen | 10687010 | |
| T7 نظام إنتاج الحمض النووي الريبي على نطاق | Promega | P1320 | يبلغ تركيز dsRNA التقريبي من كل تفاعل حوالي 5-15 ؛ ومايكرو. ز /& مايكرو ؛ ل |
| Klp61F RNAi F التمهيدي | Invitrogen | TAATACGACTCACTATAGGGTA-TTTGCGCATTATTTTAAAA | |
| Klp61F RNAi R التمهيدي | Invitrogen | TAATACGACTCACTATAGGGAT-ATTGATCATTGAAAC | |
| PCR طقم تنظيف | Mo Bio Laboratories, Inc | 1250 | |
| Concanavalin A | Sigma | C5275 | 0.5 محلول ملغ / مل مصنوع عن طريق الذوبان في 1x PBS. |
| مصل الحمار المسلوق | مختبرات Jackson ImmunoResearch Labs | 017-000-121 | محلول مخزون 5٪ في 1x PHEM buffer ، اجلب المحلول حتى يغلي. مخزنة في 4 ؛ درجة مئوية. |
| تصاعد وسائل الإعلام | 20 mM تريس الرقم الهيدروجيني 8.0, 0.5٪ N< / em> - بروبيل غالات ، 90٪ جلسرين. مخزنة في 4 ؛ درجة مئوية. | ||
| 1x BRB-80 | 80 ملي مولار الأنابيب الرقم الهيدروجيني 6.9; 1 ملي إجتا. 1 ملي مولار MgCl2< / sub> | ||
| مصدر الضوء الأبيض | Lumencor Inc | ||
| ET EGFP مرشح مكعب | Chroma | 49002 | |
| DSRed تصفية مكعب | Chroma | 49005 | |
| الأجسام المضادة NDC80 | مخصص من قبل Maresca Lab | ||
| DM1 & alpha ؛ (مضاد لألفا توبولين) | سيجما | T6199 | |
| الأجسام المضادة المضادة للإصابة بعدوى الجنون | المضادة AbCam | ab10887 |
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن