مقالة منهجية
Stromules ، أو "الأنابيب المملوءة بالسدى" ، هي امتدادات أنبوبية ضيقة من سطح البلاستيدات الخضراء يتم ملاحظتها عالميا في الخلايا النباتية ولكن وظائفها تظل غامضة. إلى جانب الاهتمام المتزايد بدور البلاستيدات الخضراء في تنسيق استجابات النبات للإجهاد ، زاد الاهتمام باللحوم وعلاقتها بديناميكيات إشارات البلاستيدات الخضراء في السنوات الأخيرة ، مدعوما بالتقدم في المجهر الفلوري والبروتين الفلوروفوري الذي يسمح بالتصور السريع والدقيق لديناميكيات الستروم. هنا ، نقدم بروتوكولات مفصلة لفحص تردد اللحمة في البلاستيدات الخضراء للبشرة في Nicotiana benthamiana ، وهو نظام نموذجي ممتاز للتحقيق في بيولوجيا الستيروم الخضراء. نقدم أيضا طرقا لتصور البلاستيدات الخضراء في المختبر عن طريق استخراج البلاستيدات الخضراء من الأوراق. أخيرا ، نحدد استراتيجيات أخذ العينات والأساليب الإحصائية لتحليل الاختلافات في ترددات اللحمة استجابة للمنبهات ، مثل الإجهاد البيئي أو العلاجات الكيميائية أو إسكات الجينات. يمكن للباحثين استخدام هذه البروتوكولات كنقطة انطلاق لتطوير طرق جديدة للتجارب المبتكرة لاستكشاف كيف ولماذا تصنع البلاستيدات الخضراء اللحوم.
البلاستيدات الخضراء هي عضيات ديناميكية في الخلايا النباتية المسؤولة عن عملية التمثيل الضوئي ومجموعة من عمليات التمثيل الغذائي الأخرى. تمارس مسارات الإشارات من البلاستيدات الخضراء أيضا تأثيرا كبيرا على فسيولوجيا النبات وتطوره ، وتنسيق استجابات النبات للإجهاد البيئي ومسببات الأمراض وحتى شكلالأوراق 1-6. في الآونة الأخيرة ، اكتسب علماء الأحياء اهتماما بجانب غير مفهوم جيدا من بنية البلاستيدات الخضراء: اللحمات ، وهي أنابيب رقيقة جدا مملوءة بالسدى تمتد من سطح البلاستيدات الخضراء7.
تظل الوظائف البيولوجية للسدومات غير معروفة ، على الرغم من أنه من المعروف أن تردد اللحمة يختلف استجابة للمنبهات البيئية7-9 ، وقد تكون اللحمات قادرة على نقل جزيئات الإشارات بين العضيات6. جميع أنواع البلاستيدات (ليس فقط البلاستيدات الخضراء الضوئية ، ولكن أيضا البلاستيدات الخضراء الشفافة ، والأميلوبلاست المملوءة بالنشا ، والبلاستيدات المصطبغة ، على سبيل المثال لا الحصر من البلاستيدات) تصنع اللحمات ، وتوجد اللحمات في جميع أنواع النباتات البرية التي تم فحصها حتى الآن. يمكن أن تمتد اللحمات وتتراجع ديناميكيا ، وتظهر أو تختفي في غضون ثوان ، أو يمكن أن تظل ثابتة نسبيا لفترات طويلة. تتمثل إحدى العقبات الرئيسية التي تواجه علماء الأحياء اللحمية في أن اللحمات غالبا ما تتم دراستها باستخدام طرق وأنسجة وأنواع مختلفة بشكل كبير ، مما يجعل المقارنات عبر أدبيات بيولوجيا اللحمة صعبة. من الآن فصاعدا ، ستكون الممارسات القياسية والأوصاف الشاملة للأنظمة التجريبية المستخدمة لدراسة الستروم الخضراء، حاسمة لاكتشاف وظيفة هذه السمات المنتشرة في كل مكان لمورفولوجيا البلاستيدات الخضراء.
هنا نصف طرق تصور تكوين اللحمة في البلاستيدات الخضراء للبشرة لأوراق Nicotiana benthamiana. في الميزوفيل ، يتم تعبئة البلاستيدات الخضراء بكثافة في خلايا كبيرة ثلاثية الأبعاد ، مما يجعل من الصعب تصور اللحمات بدقة وسرعة عن طريق الفحص المجهري متحد البؤر. على النقيض من ذلك ، تكون خلايا البشرة مسطحة نسبيا ، وتحتوي على عدد أقل من البلاستيدات الخضراء ، وتوجد على سطح الورقة ، مما يسمح بتصور سهل وسريع للسترومول. N. benthamiana هو نظام نموذجي مثالي لهذه التجارب لأنه ، على عكس العديد من الأنواع النباتية ، فإن جميع الخلايا الموجودة في بشرة N. benthamiana تصنع البلاستيدات الخضراء10. في بشرة معظم النباتات ، بما في ذلك نبات الأرابيدوبسيس ثاليانا ، تحتوي خلايا واقية الفم فقط على بلاستيدات خضراء ، بينما تحتوي خلايا البشرة الأخرى على "بلاستيدات بيضاء" ، وبلاستيدات شفافة وغير متبلورة نسبيا وغير ضوئية9،11،12. وبالتالي ، في حين أن مجال رؤية واحد ل A. thaliana البشرة قد يظهر فقط حفنة من البلاستيدات الخضراء في زوج من الخلايا الحارسة ، فإن مجال رؤية N. benthamiana البشرة سيشمل العشرات أو حتى المئات من البلاستيدات الخضراء. ومع ذلك ، يمكن تعديل جميع الطرق الموضحة هنا للتحقيق في أسئلة أخرى في بيولوجيا stromule. على سبيل المثال ، استخدمنا نفس النهج لدراسة اللحوم leucoplast من A. thaliana9.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ملاحظة: للحصول على هذا البروتوكول، ونحن ركزت على معايرة التردد stromule في البشرة من N. يترك benthamiana. وقد تم إنشاء العديد من خطوط المعدلة وراثيا مستقرة والتي يمكن استخدامها لهذا الغرض، بما في ذلك 35S المحترفين: FNRtp: EGFP 13 و NRIP1: فندق Cerulean 6. كل من هذه الخطوط تظهر التعبير القوي من fluorophores في سدى بلاستيدات الخضراء من الأوراق نمت في ظل مجموعة واسعة من الظروف. بدلا من ذلك، fluorophores المستهدفة بلاستيدات الخضراء ويمكن التعبير عن عابر في N. benthamiana باستخدام الأجرعية التحولات 13. وهذا هو أقل مثالية من خطوط المعدلة وراثيا، منذ تسلل الأجرعية تحفز بعض الردود الدفاع القاعدية في N. benthamiana والتفاعل مع الأجرعية يمكن أن يغير تردد stromule في ورقة 14، ويحتمل أن تعقيد تفسير النتائج. وأخيرا، لتصور تشكيل stromule في المختبر،يمكن استخراجها البلاستيدات الخضراء من أي من الأنواع النباتية، وذلك باستخدام إما fluorophores المرمزة وراثيا أو صبغة الفلورسنت، كما هو موضح في المادة 5 أدناه. 9،15
ملاحظة: طرق تفصيلية لزراعة النباتات وقد وصفت سابقا 16 لفترة وجيزة، وتنمو N. النباتات benthamiana في 4 "قدور مليئة أي مزيج التربة المهنية التي توفر الصرف الجيد. تغطية الشتلات مع قبة من البلاستيك واضحة ل14/10 الأيام الأولى لتوفير بيئة رطبة للإنبات. إضافة أي مزيج الأسمدة القياسية التالية تعليمات الشركة الصانعة إلى 14- النباتات يوما من العمر. نباتات تنمو في ظل الضوء الأبيض، وذلك باستخدام ~ 100 مكرومول الفوتونات م -2 ثانية -1 شدة الضوء. محطات المياه بشكل منتظم.
1. إعداد العينات ورقة عن التصور
تتأثر ديناميات Stromule التي كتبها جرح 8، لذلك ينبغي إجراء إعداد الأنسجة مباشرة قبل تصور stromule ملاحظة:الصورة بواسطة المجهر مضان متحد البؤر. من الناحية المثالية، ينبغي تصور عينة مع 15 دقيقة بعد إزالة من المصنع.
2. تصور Stromules مع متحد البؤر مضان المجهر
تجهيز 3. صورة
4. تصميم التجارب وأخذ العينات
ملاحظة: Stromule تردد متغير بدرجة كبيرة بين الأوراق، ولكن تشير العديد من التقارير أن هناك اختلاف بسيط في وتيرة stromule ضمن indiviالمزدوج ورقة 9،17.
5. استخراج البلاستيدات الخضراء سليمة لتصور Stromule حيوية
ملاحظة: عدة طرقوقد استخدمت لعزل البلاستيدات الخضراء من الأوراق، بما في ذلك بروتوكول مختلف قليلا في دراسة حديثة حول تشكيل stromule في المختبر 15. بروتوكول المفصلة أدناه يستخدم طريقة بسيطة نسبيا والتي لا تسفر عينات بلاستيدات الخضراء النقية كيميائيا، ولكنه بدلا من ذلك عزل كمية كبيرة من سليمة، البلاستيدات الخضراء صحية 9،18.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
وقد استخدم هذا البروتوكول لتصور تردد stromule في النهار والليل في النبتات من N. الشباب الشتلات benthamiana. تم دمج شرائح من كومة Z- في صورة واحدة (الشكل 1A). لأغراض البصرية، كانت تلك الصورة ثم غير المشبعة ومقلوب بحيث يظهر سدى الأسود (الشكل 1B). وصفت البلاستيدات الخضراء إما عدم وجود stromules (النجمة الخضراء) أو وجود stromule واحد على الأقل (أرجواني النجمة). من البلاستيدات الخضراء البشرة 8...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
عند التحقيق stromules، يجب النظر في ثلاثة عوامل هامة من خلال: (أ) التلاعب في الأنسجة النباتية يجب أن تبقى إلى أدنى حد ممكن، (ب) يجب أن يبقى النظام التجريبي متسقة، و (ج) استراتيجيات أخذ العينات يجب أن يتم التخطيط بعناية ل ضمان قوية، ويتم تحليل البيانات استنساخه.
Stromules دينامية ملحوظة: يمكن أن يمتد ويتقلص بسرعة أمام عينيه مراقب تحت المجهر. وعلاوة على ذلك، تردد stromule يختلف اختلافا كبيرا في استجابة لمجموعة واسع...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ليس لدى المؤلفين ما يكشفون عنه.
J.O.B. و A.M.R. تم دعمهما من خلال زمالات ما قبل الدكتوراه من المؤسسة الوطنية للعلوم.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| هيبس | سيجما ألدريتش | H3375 | |
| هيدروكسيد الصوديوم | فيشر Scientific | S320-1 | |
| سوربيتول | سيجما ألدريتش | S1876 | |
| EDTA | فيشر التكنولوجيا الحيوية | BP121 | |
| MnCl2< / sub> | سيجما ألدريتش | 221279 | |
| MgCl2< / sub> | سيجما ألدريتش | M0250 | |
| KCl | Sigma-Aldrich | P3911 | |
| NaCl | Sigma-Aldrich | S9625 | |
| مجهر متحد البؤر بالمسح الضوئي بالليزر ؛ | Carl Zeiss Inc | نموذج: LSM710 | |
| ثنائي أسيتات الكربوكسي فلورسين (CFDA) | سيجما ألدريتش | 21879 ؛ | |
| ثنائي ميثيل سلفوكسيد (DMSO) EMD | MX1458-6 | ||
| خلاط Waring | Waring ؛ | الموديل: 31BL92 | |
| فيجي | fiji.sc | برنامج مفتوح المصدر لتحليل الصور البيولوجية |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن