1. إعداد فيروسات الرجعية بانشاء ترميز TCR Hemichain الاهتمام
- خطي ناقلات PMX للسماح لإدخال جين TCR في الخطوات اللاحقة. هضم البلازميد مع EcoRI ونوتي أنزيمات التقييد عند 37 درجة مئوية لمدة 3 ساعات (الجدول 1) 8.
- تنفيذ الكهربائي من البلازميد هضمها على 1.2٪ agarose هلام. المكوس الفرقة من حوالي 4500 زوج قاعدي (بت في الثانية)، وأزل في 30 ميكرولتر الماء المعقم باستخدام المتاحة تجاريا مجموعات استخراج الهلام 9.
- تصميم 5 "و 3" التمهيدي لجين TCR من الفائدة التي تكود أيضا 15-20 نقطة أساس تداخل الموقع الهضم EcoRI ونوتي ناقلات PMX على التوالي 8.
- تضخيم TCR الجينات مع الاشعال. تنفيذ الكهربائي من المنتج PCR والفرقة أزل ما يقرب من 1000 بت في الثانية كما هو موضح في الخطوة 1.2.
- استنساخ TCR الجينات في ناقلات يهضم عن طريق الجمع بين كل جزء خطي مع البلازميد المتاحة تجارياسيد التجمع كاشف المزيج ويحتضنها عند 50 درجة مئوية لمدة 1 ساعة.
ملاحظة: يرجى الرجوع إلى بروتوكول الشركة المصنعة لوحدات التخزين النسبية لكل عنصر. ويستند هذا الأسلوب التجمع على تقنية الموضحة في الأصل من قبل جيبسون وآخرون. 10. - (اختياري) الجين علامة TCR بمناسبة خلايا transduced مع شكل اقتطاع من العصبية البشرية عامل النمو مستقبلات (ΔNGFR، والأحماض الأمينية 1-277) 11 مفصولة فورين الموقع الانقسام، رابط، سيرين جليكاين، و2A تسلسل 12،13. الاشعال تصميم تسلسل ترميز تداخل نهايات جزء وتجميع البلازميد كما هو موضح في الخطوات 1،3-1،5.
ملاحظة: يمكن العثور على هذه المتتاليات في المراجع 11-13. - تحويل E. المختصة كيميائيا القولونية مع البلازميد تجميعها بعد بروتوكول الشركة المصنعة 14. البذور تتحول البكتيريا على لوحات أجار (20 ملغ / مل استذابة مرق (LB)، و 15 ملغ / مل أجار، و 1 ميكروغرام / مل الأمبيسلين)، واحتضان عند 37 درجة مئوية لمدة 18 ساعة.
- ثقافة مستعمرة بكتيريا واحدة في 50 مل من LB المتوسطة (20 ملغ / مل LB و 1 ميكروغرام / مل الأمبيسلين) لمدة 16 ساعة في حاضنة تهتز عند 37 درجة مئوية و 200 طلقة في الدقيقة.
- تنقية البلازميدات باستخدام مجموعات midiprep المتاحة تجاريا بعد بروتوكول الشركة الصانعة. تمييع البلازميد تركيز حوالي 1 ميكروغرام / ميكرولتر.
ملاحظة: يعتمد بروتوكول تنقية البلازميد على قلوية طريقة استخراج 15.
2. توليد مستقرة تغليف خط الخلية
ملاحظة: خلايا كل 293GPG وPG13 هي ملتصقة. خلايا الثقافة في Dulbecco لتعديل النسر متوسطة (DMEM) تستكمل مع 10٪ مصل العجل الجنين (FCS) و 50 ميكروغرام / مل الجنتاميسين. ثقافة الخلايا 293GPG مع 1 ميكروغرام / مل التتراسيكلين قبل ترنسفكأيشن. احتضان الخلايا عند 37 درجة مئوية مع 5٪ CO 2 بين جميع الخطوات.
- خلايا التعبئة والتغليف Transfect 293GPG 16 المستزرعة في قارورة T75 مع ناقلات hemichain ترميز حصلت عليه في الخطوة 1.9، باليودنانوغرام المتاحة تجاريا كاشف ترنسفكأيشن بعد بروتوكول الشركة المصنعة 1 7. ملاحظة: خلايا Transfect 293GPG في 50-60٪ confluency.
- نضح المتوسطة ل293GPG الخلايا وإضافة 10 مل من الطازجة DMEM المتوسطة 1 آخر يوم ترنسفكأيشن.
- إنتاج محصول عابر الفيروس من خلايا 293GPG transfected بعد 2 أيام خطوة 2.2 عن طريق نقل مستنبت إلى حقنة ومرورا 0.45 ميكرون فلتر.
ملاحظة: فيروس يمكن استخدامها على الفور أو تخزينها في -80 درجة مئوية لاستخدامها في المستقبل. - ثقافة 1 × 10 5 PG13 الخلايا في T25 القارورة. عد الخلايا باستخدام عدادة الكريات. بعد يوم واحد، مستنبت نضح وإضافة 1.5 مل من فيروس المستمدة 293GPG-من الخطوة 2.3 و 1.5 مل DMEM المتوسطة، جنبا إلى جنب مع 8 ميكروغرام / مل من polybrene.
- تغيير المتوسطة كما هو موضح في الخطوة 2.4 مرة واحدة يوميا لمدة 4 أيام، لإقامة مستقر خط PG13 خلية التعبئة والتغليف إنتاج الفيروس الارتجاعي ترميز hemichain TCR من الفائدة.
- نضح المتوسطة واستبدالمع المتوسطة DMEM جديدة للخطوط الخلايا PG13 24 ساعة بعد الإصابة الماضي لثقافة أخرى.
ملاحظة: تجميد أو ثقافة فرعية الخلايا عن طريق فصل مع 0.05٪ حل التربسين-EDTA. - لإنتاج الفيروس من خطوط الخلايا PG13 transduced والثقافة 2 × 10 6 الخلايا في T75 قارورة مع 10 مل DMEM المتوسطة، وفيروس الحصاد كما هو موضح في الخطوة 2.3 ثلاثة أيام بعد البذر الخلايا.
ملاحظة: فيروس هو الأفضل استخدامها على الفور ولكن يمكن تخزينها في -80 درجة مئوية لمدة تصل إلى شهرين.
3. تفعيل وتنبيغ من خلايا T الإنسان
ملاحظة: يتم الحصول على عينات البشرية واستخدامها وفقا للبروتوكولات وافقت لجنة الأخلاقيات المؤسسية. الخلايا البشرية الثقافة الابتدائية في معهد روزويل بارك التذكاري (RPMI) متوسطة تستكمل مع المصل البشري 10٪ بدلا من FCS و 50 ميكروغرام / مل الجنتاميسين. احتضان الخلايا عند 37 درجة مئوية مع 5٪ CO 2 بين جميع الخطوات.
- عزل الطرفية خلايا الدم وحيدات النوى الإنسان (PBMC) من خلال الكثافةالفصل الانحدار بعد بروتوكول الشركة المصنعة 18.
- تنشيط خلايا T للحث على الانتشار اللازمة لعدوى فيروسات. ثقافة 2 × 10 7 PBMC طازجة أو إذابة لكل بئر في لوحة 6 جيدا، في 5 مل من المتوسط RPMI مع 100 وحدة دولية / مل المؤتلف الإنسان انترلوكين 2 (rhIL-2) و 50 نانوغرام / مل من مكافحة CD3 الأجسام المضادة وحيدة النسيلة (OKT3 استنساخ).
- ثلاثة أيام وظيفة في التحفيز، وجمع خلايا تي من قبل pipetting وأجهزة الطرد المركزي في 350 x ج لمدة 4 دقائق. تجاهل طاف والبذور 0.5-1 × 10 6 خلايا تي لكل بئر في 24 لوحة جيدا معلق في 1 مل من فيروس PG13 من الخطوة 2.7 و 1 مل من المتوسط RPMI تستكمل مع 200 وحدة دولية / مل من rhIL-2. لوحة أجهزة الطرد المركزي في 1000 x ج و 32 درجة مئوية لمدة 1 ساعة.
- بعد 24 ساعة، وجمع خلايا تي من قبل pipetting وأجهزة الطرد المركزي في 350 x ج لمدة 4 دقائق. تجاهل الخلايا وطاف resuspend في 1 مل من فيروس PG13 من الخطوة 2.7 و 1 مل من المتوسط RPMI تستكمل مع 200 وحدة دولية / مل من rhIL-2. كرر هذه الخطوة ليصبح المجموع 6 تصيبالأيونات.
ملاحظة: يجب أن يكون الأمثل عدد من العدوى حسب عيار من الفيروسات التي تنتجها التعبئة والتغليف خط الخلية. إذا لزم الأمر، مرور الخلايا التائية عن طريق إزالة 20-30٪ من الخلايا كل يوم لمنع فرط. - 24 ساعة بعد الإصابة الماضي، وجمع خلايا تي من قبل pipetting وأجهزة الطرد المركزي في 350 x ج لمدة 4 دقائق. تجاهل طاف و resuspend الخلايا في المتوسط RPMI مع 100 وحدة دولية / مل من rhIL-2 لمزيد من الثقافة.
- بعد 2-3 أيام خطوة 3.5، خلايا وصمة عار T مع متعدد القسيمات HLA عند 4 درجة مئوية لمدة 30 دقيقة، ثم CD3 المضادة البشرية ومستقبل مساعد الاجسام المضادة (MABS) في 4 درجة مئوية لمدة 15 دقيقة. تحليل التدفق الخلوي. استخدام متعدد القسيمات لا صلة لها بالموضوع و / أو خلايا untransduced والضوابط السلبية (الشكل 1-3) 19.
- إذا كان hemichain تتمحور قدم هو سلسلة TCRα وتحليل استخدام Vβ من دي نوفو متعدد القسيمات خلايا إيجابية باستخدام المتاحة تجاريا لوحة الأجسام المضادة Vβ محددة من قبل التدفق الخلوي 20.
4. الاستنساخ دي نوفو TCR مكافحة hemichains
- فرز دي نوفو متعدد القسيمات السكان الإيجابي في الخطوة 3.6 بواسطة بمساعدة تدفق فرز الخلايا.
- عزل الحمض النووي الريبي من خلايا تي فرز باستخدام حمض guanidinium ثيوسيانات الفينول كلوروفورم استخراج طريقة 21،2 2.
ملاحظة: يمكن تخزين الحمض النووي الريبي في -80 درجة مئوية، ولكن ينبغي أن تستخدم لتوليد كدنا] في أقرب وقت ممكن. - تجميع مكتبة كدنا] من الحمض النووي الريبي المستخرج باستخدام المتاحة تجاريا عكس مجموعات الناسخ-PCR بعد بروتوكول الشركة المصنعة 23،24.
- إذا استنساخ TCRβ مكافحة السلاسل وتصميم Vβ الجينات وTCRβ المنطقة الثابتة الاشعال محددة، كما هو محدد في الخطوة 3.7، واستنساخ كامل طول TCRβ الجينات كما هو موضح في الخطوات 1،3-1،9. راجع الخطوة 4.5 إذا مكافحة السلسلة TCRα، ومواصلة ذلك إلى الخطوة 5.1.
- تجاريا والأجسام المضادة Vα محددة المتاحة محدودة، لا يمكن بالتالي Vα استخدام الجيناتيحددها التدفق الخلوي. استنساخ TCRα مكافحة سلاسل عبر التضخيم 5'-السريع لغايات كدنا] (سباق) 25، وذلك باستخدام المتاحة تجاريا 5 "مجموعات RACE 6.
- تجميع 5 "سباق كدنا] متوافق من الحمض النووي الريبي المستخرج في الخطوة 4.2 بعد بروتوكول الشركة الصانعة.
- أداء 1 ش جولة PCR كما هو موضح في الجدول رقم (2).
- تنفيذ الكهربائي من المنتج PCR وأزل عصابة من حوالي 1100 نقطة أساس، كما هو موضح في الخطوة 1.2.
- أداء 2 الثانية PCR الجولة كما هو موضح في الجدول رقم 3، وذلك باستخدام 1 ش جولة المنتج PCR كقالب.
ملاحظة: تم تصميم تسلسل التمهيدي المبينة في الجدول 3 لاستنساخ في EcoRI ونوتي هضمها ناقلات PMX. - تنفيذ الكهربائي من المنتج PCR وأزل عصابة من حوالي 1000 نقطة أساس، كما هو موضح في الخطوة 1.2.
- الجينات استنساخ TCRα إلى EcoRI ونوتي هضمها ناقلات PMX وبوريالبلازميدات السنة المالية كما هو موضح في الخطوات 1،5-1،9.
النسخ TCR 5. إعادة تشكيل رواية مستضد محددة
ملاحظة: الثقافة Jurkat 76 الخلايا وخطوط الخلايا اللاحقة في RPMI المتوسطة تستكمل مع 10٪ FCS و 50 ميكروغرام / مل الجنتاميسين. احتضان الخلايا عند 37 درجة مئوية مع 5٪ CO 2 بين جميع الخطوات.
- تنبيغ Jurkat 76 خلايا 26 (أو ما يعادلها TCR - / - البشري خط خلية T) مع hemichain TCR تركز على استخدام فيروس 293GPG المنتجة في الخطوة 2.3. لJurkat 76، البذور 5 × 10 4 خلايا لكل بئر في 24 لوحة جيدا مع 1 مل من الفيروسات و1 مل من RPMI المتوسطة. لوحة أجهزة الطرد المركزي في 1000 x ج و 32 درجة مئوية لمدة 1 ساعة.
- 24 ساعة بعد الإصابة، وجمع hemichain transduced Jurkat 76 خلايا من قبل pipetting وأجهزة الطرد المركزي في 350 x ج لمدة 4 دقائق. تجاهل وطاف resuspend في المتوسط RPMI جديدة لمزيد من الثقافة.
- تنقية الخلايا transduced إذا كان hemichain هو جزيئيا الموسومة بعد 2-3 أيام خطوة 5.2، بواسطة وصمة عارجي مع fluorophore مترافق مكافحة NGFR ماب يليه تدفق المساعدة أو الخلايا المغناطيسية بمساعدة الفرز (اختياري) 27.
- الخطوات التالية 2،1-2،3، إنتاج 293GPG فيروس ترميز TCR مكافحة سلسلة مستنسخة من الخطوات 4.4 أو 4.5.
- لإعادة تماما TCR، تنبيغ خط الخلايا التائية معربا عن ستابلي hemichain TCR مركزية ولدت في الخطوات 5،1-5،3 باستخدام فيروس من الخطوة 5.4. أداء تنبيغ كما هو موضح في الخطوات 5،1-5،2.
- تنقية CD3 + transfectants استخدام الألغام المضادة للCD3 المغناطيسي بمساعدة فرز الخلايا بعد بروتوكول الشركة المصنعة، بعد 2-3 أيام خطوة 5.5 27.
- للتحقق من صحة مستضد خصوصية، وصمة عار على transfectants معربا عن TCRs clonotypic تتألف من hemichain TCR تتمحور إرفاقها مع مختلف مكافحة سلاسل، مع مكافحة CD3 و / أو MABS مستقبل مساعد، ومتعدد القسيمات HLA، 3-5 آخر أيام تنقية CD3. تحليل الخلايا عن طريق التدفق الخلوي (الشكل 4-5) 19.