$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
باستخدام AAVS1 ZNFs -specific، تم إنشاء السمات التي تميزت تماما HESC / IPSC خطوط الخلايا الرئيسية التي تحتوي على غيروي تسلسل الهدف FRT ووصف 13. حافظت FRT التي تحتوي على خطوط الخلايا الرئيسية تعدد القدرات ووحدة الجينوم بعد العلاج ZFN ومستقر أعربت GFP في التجارب المختبرية والحية. يتم تنفيذ RMCE التي كتبها cotransfection من خطوط الخلايا رئيسية مع FLPe recombinase وناقلات المانحة RMCE (الشكل 1A). ناقلات RMCE تحتوي على تسلسل FRT مماثلة لتلك الموجودة في خط الخلية AAVS1 سيد المرافقة التحوير الشكل 1B تراقب RMCE باستخدام التعبير جوهري TDT أسما:. F3-P CAGGS tdTPH-F بعد ترنسفكأيشن، hPSC تشكيل مجموعات صغيرة من خلايا موزعة بالتساوي على طبقة iDR4 MEF، وtransfected hPSC تعبر عن كلا GFP وكذلك عابر TDT (الشكل 1B، D 2). ويسمح للخلايا لاستعادة ل2-3د بعد ترنسفكأيشن قبل البدء في الاختيار. اختيار إيجابية وبدأت لأول مرة باستخدام جرعة منخفضة من بوروميسين من أجل صالح RMCE الإدراج المانحة. يتم تطبيق بوروميسين بلطف في البداية، لأن الأولي موت الخلايا الضخمة يمكن أن يؤدي إلى الخلايا وحيدة تمر إعادة التركيب، مما يجعلها غير قادرة على البقاء على قيد الحياة العملية. في الأيام التالية، يحتاج تركيز بوروميسين التي ستطرح تدريجي يصل إلى الجرعة المناسبة من أجل السماح للخلايا المؤتلف أن تنمو في مستعمرات صغيرة في حين أن الخلايا nonrecombined يموت تدريجيا.
3-4 د بعد بدء اختيار إيجابية (حوالي D 6 بعد ترنسفكأيشن)، وبدأت اختيار السلبية من أجل اختيار فقط للأحداث إعادة التركيب بوساطة FRT. RMCE يسبب فقدان ثيميدين كيناز (تاكا) الجين الانتحار وحساسية Fialuridine (FIAU). اختيار السلبية تطبيق في هذه المرحلة، التي مجموعات صغيرة من 2-4 GFP - / + TDT (RMCE) الخلاياقادرة على تحمل تركيزات المثلى من FIAU (الشكل 1B، D 6)، ويمنع التكامل عشوائي، لأنه في مثل هذه الأحداث، والجينات تاكا في موضع AAVS1 لا تزال تتأثر. حدوث المتزامن FRT بوساطة والتكامل عشوائي من المستبعد جدا، كما يدل على ذلك عدم وجود أحداث التكامل العشوائية في وقت لاحق خلال توصيف (الشكل 2B).
وRMCE GFP مختلط - / + TDT المستعمرات تستمر في النمو، في حين أصبحت أكثر تجانسا، بحيث كتبها D 9-10 بعد ترنسفكأيشن، وبعض المستعمرات RMCE مختلطة اختيار يست واضحة تماما ويمكن الاطلاع (الشكل 1B). GFP - / + TDT RMCE المستعمرات موجودة فقط عندما يكون كلا المانحة RMCE وFLPe (2: 1) يتم استخدامها، في حين لا يحدث RMCE في غياب FLPe (2: 0). مجموعة كاملة مع FIAU حتى يوم 13-15 بعد ترنسفكأيشن يثير لGFP متجانسة - / + TDT الثقافيهه. RMCE ينتج في المتوسط 12.8 ± 6.8 (ن = 6) مستعمرات بورو R / R FIAU في 15 يوما 13. التدفق الخلوي توصيف خط RMCE ولدت حديثا (المستعمرات RMCE بورو R / R FIAU مجتمعة في السكان الخلية nonclonal) يؤكد أن 100٪ من الخلايا الحاضر RMCE GFP - / + TDT النمط الظاهري (الشكل 2A). عندما تستخدم الجهات المانحة RMCE دون التعبير التأسيسي مراسل الفلورسنت، خط بورو R / R FIAU RMCE hPSC الناتج متجانس GFP -.
PCR توصيف خط RMCE nonclonal يوضح تبادل كاسيت الكامل (أي أثر للكاسيت من خط الخلايا الرئيسية يمكن أن يتم الكشف عن) وأن البرنامج اختيار تستخدم يولد خطوط خالية من التكامل العشوائي (كل من الجهات المانحة RMCE وFLPe، معربا عن ناقلات) (الشكل 2B). وهذه النتائج تثبت مزيدا من الصورةوصمة عار outhern وبالإضافة إلى ذلك، أثبتنا أن خطوط RMCE تبقى المحفزة 13. وهذا يجعل من لم يعد ضروريا لتنفيذ أي تقييم الجينوم على نطاق التكامل عشوائي أو اختبار تعدد القدرات خلال التجارب RMCE الروتينية. وخلاصة القول، وذلك باستخدام هذا البروتوكول، hPSC خطوط الخلايا المعدلة وراثيا في موضع AAVS1 خالية من التكامل عشوائية يمكن أن تتولد بسهولة في 15 د بكفاءة 100٪ ودون الحاجة إلى توصيف واسعة النطاق.

الشكل 1: نظرة عامة تخطيطي RMCE (أ) الجدول الزمني للبرنامج اختيار RMCE. اليسار: خط الخلية الرئيسي (MCL)، بايواء كاسيت يحيط FRT (المثلثات) التي تعبر عن GFP وهيغروميسين-TK (ربط عن طريق 2A الببتيدات الشق الذاتي)، وtransfected من قبل nucleofection (NF) مع ناقل FLPe، معربا عن و متجه RMCE المانحة، ذوي الخوذات البيضاءالتراث الثقافي غير المادي يحتوي على promoterless بوروميسين الجينات المقاومة (الربط متقبل - SA- بورو R) وشريط تجريبي متغير (X). اليمين: خط RMCE الجديد (RMCEL) تم الحصول عليها بعد الانتهاء من التحديد مع بوروميسين (مثلث أحمر) وFIAU (الخط الأزرق). (ب) RMCE باستخدام التأسيسي TDT، معربا عن المانحة ونسب مختلفة من الحمض النووي المانحة وFLPe الحمض النووي (0: 1، 2: 1، 2: 0) رصدها بواسطة المجهر مضان (GFP - مخضر، TDT - مضان أحمر) في مختلف نقاط الوقت. وتمثل على نطاق والحانات 100 ميكرون: D 2 و 6. د 10: تمثل الحانات نطاق 200 ميكرون. الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2: توصيف خطوط RMCE (أ) تحديد RMCE بواسطة التدفق الخلوي. ويرد GFP والتعبير TDT للخط WT، خط الخلية الرئيسي (MCL)، وخط RMCE ولدت حديثا في D 15 بعد nucleofection باستخدام ناقلات التأسيسي TDT-التعبير (CAGGS TDT)، أو الجهات المانحة مع GFP مدفوعا المروج GOOSECOID (GSCp GFP، نهائية الأديم علامة) أو المروج AAT (APOeAATp GFP، الكبدية علامة). (ب) تأكيد RMCE (5 '/ 3 "JA RMCEL)، وغياب (مكل) كاسيت خط الخلية الماجستير (5' / 3" JA مكل)، وعدم وجود تكامل العشوائي (5 '/ 3' / FLPe RI ) بواسطة PCR باستخدام أزواج التمهيدي يصور. الحمض النووي من WT، مكل، خطوط RMCE (1-5) واستخدمت، ناقلات RMCE المانحة (+ RI)، FLPe معربا عن ناقلات، وعدم التحكم قالب (NTC). الرقم معدلة من (Ordovas وآخرون، 2015) 13. يرجى النقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.
ضمن الصفحات = "1"> 
الشكل 3. الجيل من الخط ماستر الخلوي RMCE مناسبة ومقارنة استهداف الجينات مع RMCE في AAVS1 اليسار: يستخدم استهداف الجينات خلايا WT معدلة التي يتم cotransfected مع الجهات المانحة (كاسيت هو موضح في الشكل 1A لتوليد خط الخلايا الرئيسية ، مكل) وZFNs الأمثل محددة. عملية لاستكمال توصيف كامل يستغرق فترة تصل إلى 3 أشهر. يتم تنفيذ RMCE التي كتبها cotransfection المتبرع مع ناقلات FLPe، ويتم إنشاء خط تتميز بشكل كامل في 15 د: الصحيح. استهداف الجينات الكفاءة في AAVS1 هي من الدراسات السابقة 1،2. الرجاء انقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
آيس ">
وسائل الإعلام مكونات التركيز النهائي HESC المتوسطة DMEM-F12، HEPES 80٪ متوسطة استبدال المصل 20٪ L-الجلوتامين 146 ملغ / مل MEM غير الضرورية الأحماض الأمينية الحل (100X) 1X 2-المركابتويثانول 0.1 ملم البنسلين / الستربتوميسين 0.1٪ جمعية جيل المستقبل الأساسية البشري 4 نانوغرام / مل مستنبت iMEF DMEM العليا الجلوكوز الجنين المصل البقري (FBS) 15٪ البنسلين، الستربتوميسين 0.1٪ L-الجلوتامين 200 ملي 4 مم الأمينية MEM غير الضروريةالأحماض الحل (100X) 2X 2-المركابتويثانول 0.1 ملم تصفيح المتوسطة HESC المتوسطة 100٪ ROCK المانع (Y-27632) 10 ميكرومتر
الجدول 1. تكوين وسائل الإعلام.
| فحص | إلى الأمام | عكسي | Amplicon | دورة PCR |
| 5'JA مكل | CACTTTGAGCTCTACTGGCTTC | CGTTACTATGGGAACATACGTCA | 1.1 كيلو بايت | 95 درجة مئوية، 5 '- [95 درجة مئوية، 30' '- 68 درجة مئوية (-0.5 درجة مئوية / دورة) (1)، "30 ''] X15 - [95 درجة مئوية، 30 '' - 58 درجة مئوية، 30 '' - 72 درجة مئوية، 1 '30' '] X25 - 72 درجة مئوية، 5' |
| 3'JA مكل | TAACTGAAACACGGAAGGAG | AAGGCAGCCTGGTAGACA | 1.4 كيلو بايت | 95 درجة مئوية، 5 '- [95 درجة مئوية، 30' '- 68 درجة مئوية (-0.5 درجة مئوية / دورة) (1)،' 30 ''] X15 - [95 درجة مئوية، 30 '' - 58 درجة مئوية، 30 '' - 72 درجة مئوية، 1 '30' '] X25 - 72 درجة مئوية، 5' |
| 5'JA RMCEL | CACTTTGAGCTCTACTGGCTTC | CATGTTAGAAGACTTCCTCTGC | 1.1 كيلو بايت | 95 درجة مئوية، 5 '- [95 درجة مئوية، 30' '- 68 درجة مئوية (-0.5 درجة مئوية / دورة) (1)،' 30 ''] X15 - [95 درجة مئوية، 30 '' - 58 درجة مئوية، 30 '' -72 درجة مئوية، 1 '30' '] X25 - 72 درجة مئوية، 5' |
| 3'JA RMCEL | TTCACTGCATTCTAGTTGTGG | AAGGCAGCCTGGTAGACA | 1.5 كيلو بايت | 95 درجة مئوية، 5 '- [95 درجة مئوية، 30' '- 68 درجة مئوية (-0.5 درجة مئوية / دورة) (1)،' 30 ''] X15 - [95 درجة مئوية، 30 '' - 58 درجة مئوية، 30 '' - 72 درجة مئوية، 1 '30' '] X25 - 72 درجة مئوية، 5' |
| 5'RI المانحين | GTACTTTGGGGTTGTCCAG | TTGTAAAACGACGGCCAG | 0.5 كيلو بايت | 95 درجة مئوية، 5 '- [95 درجة مئوية، 30' '- 60 درجة مئوية، 30' '- 72 درجة مئوية، 30' '] X25 - 72 درجة مئوية، 5' |
| 3'RI المانحين | CCTGAGTTCTAACTTTGGCTC | ACACAGGAAACAGCTATGAC | 0.5 كيلو بايت |
| RI FLPe | CCTAGCTACTTTCATCAATTGTG | GTATGCTTCCTTCAGCACTAC | 0.65 كيلو بايت | 95 درجة مئوية، 5 '- [95 درجة مئوية، 30' '- 60 درجة مئوية، 30' '- 72 درجة مئوية، 30' '] X25 - 72 درجة مئوية، 5' |
الجدول 2. مجموعات التمهيدي تستخدم لPCR التنميط الجيني. معدلة من Ordovas وآخرون، 2015 (13).