$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1. البروتين التعريفي
ملاحظة: في الخطوات التالية، BL21 القولونية بكتيريا القولونية تحولت مع ناقلات PET-32 التي تحتوي على تسلسل للبروتين العلامة MOG الانصهار (انظر المرجع 5) والشكل (1) تزرع على كثافة عالية ومن ثم يتم يسببها للتعبير عن MOG العلامة البروتين . انظر الشكل 2 لجدول زمني العام - لاحظ أن الأيام وأشار نقاط وقف التقريبية وبديلة في البروتوكول. إذا بدءا من تنقية الحمض النووي للحيوانات الاليفة 32 MOG العلامة ناقلات، وسوف يكون من الضروري لتحويل كيميائيا إلى المختص BL21 E. البكتيريا القولونية باستخدام اختيار الأمبيسلين، كما تم وصفها بشكل جيد 9. التحول الناجح يمكن التأكد من تنقية الحمض النووي من البكتيريا المحدد باستخدام مجموعة تجارية القياسية، تليها الهضم مع تقييد الانزيمات AGE1 وSac1 لإنتاج الفرقة 424 نقطة أساس على هلام الاغاروز 10.
تلقيح 5 مل من عقيم استذابة مرق (LB) مرق (0.1 ملغ الأمبيسلين / مل) مع الأسهم العلامة الجلسرين BL21-MOG واحتضان بين عشية وضحاها في 37 درجة مئوية، 200 دورة في الدقيقة. - وضع اثنين 1 قوارير L مخروطي يحتوي على 500 مل من معقم مرق LB في الحاضنة 37 درجة مئوية في إعداد لليوم التالي.
- إضافة 500 ميكرولتر من 100 ملغ / مل الأمبيسلين إلى كل من قوارير تحتوي على 500 مل LB من الخطوة 1.2 (نهائي تركيز 0.1 ملغ / مل الأمبيسلين). نقل 1 مل من الثقافة بين عشية وضحاها من الخطوة 1.1 إلى كل من اثنين من قوارير من مرق LB. احتضان عند 37 درجة مئوية و 200 دورة في الدقيقة لمدة 5 ساعة أو ما يصل إلى الكثافة البصرية من 0.6.
- تأخذ واحدة 1 مل قسامة من واحدة من قوارير وتحويلها إلى أنبوب الطرد المركزي 1.5 مل منفصل. بيليه الخلايا في 16000 x ج لمدة 1 دقيقة، وإزالة طاف. تسمية أنبوب كما T 0 (قبل الاستقراء) ومن ثم وضع بيليه البكتيرية إلى -20 درجة مئوية الثلاجة لمدة المستقبل الصوديوم دوديسيل هلام كبريتات بولي أكريلاميد الكهربائي (SDS-باغE) التحليل (انظر القسم 8) والشكل (3).
- إضافة 0.5 مل من 1 M الآيزوبروبيل β-D-1-thiogalactopyranoside، الآيزوبروبيل β-D-thiogalactoside (IPTG) إلى كل قارورة الثقافة. احتضان قوارير عند 37 درجة مئوية، 200 دورة في الدقيقة لمدة 4 ساعة، ثم في درجة حرارة الغرفة في 75 دورة في الدقيقة ليلة وضحاها.
2. حصاد MOG العلامة البروتين
ملاحظة: في هذه المرحلة، سيكون قد تنتج البكتيريا كميات كبيرة من MOG العلامة البروتين. حصاد العلامة MOG، وهي lysed البكتيريا لأول مرة في منطقة عازلة تريتون X-100 تليها صوتنة. ثم يتم تحرير MOG العلامة من الهيئات إدراج والتشويه والتحريف مع ايميدازول وغوانيدين، مما أدى إلى حل البروتين الخام التي تحتوي على علامة MOG البروتين.
- تأخذ واحدة 1 مل قسامة من واحدة من الثقافات بين عشية وضحاها من الخطوة 1.5 وتحويلها إلى أنبوب microcentrifuge 1.5 مل. بيليه الخلايا في 16000 x ج لمدة 1 دقيقة، وإزالة طاف. تسمية الحوضالبريد T O / N (بعد الاستقراء) ثم وضع بيليه البكتيرية في الثلاجة -20 درجة مئوية لتحليل صفحة المستقبل SDS (الشكل 3).
- توزيع الثقافات بالتساوي بين 250 مل الزجاجات متوافقة مع ارتفاع سرعة الطرد المركزي وإبقاء هذه على الجليد من هذه النقطة إلى الأمام. بيليه الخلايا البكتيرية في 22000 x ج لمدة 15 دقيقة على 4 درجات مئوية.
- تجاهل طاف. تخزين الكريات البكتيرية عند درجة حرارة -20 درجة مئوية أو انتقل إلى الخطوة 2.4.
- إعداد العازلة تحلل (0.1 ملغ / مل الليزوزيم الدجاجة بيضة، 0.1٪ تريتون-X (ت / ت) في الفوسفات مخزنة المالحة (PBS)) وذلك بإضافة 60 ميكرولتر من تريتون X-100 و 120 ميكرولتر من 50 ملغ / مل الدجاجة بيضة الليزوزيم حل سهم إلى 60 مل من برنامج تلفزيوني.
- و resuspend وتجمع بين كل من الكريات البكتيرية من الخطوة 2.3 في ما مجموعه 30 مل من تحلل العازلة. نقل هذا الكتاب إلى جولة أسفل أنبوب 50 مل قادرة على ارتفاع الطرد المركزي بسرعة. وضع هذا الأنبوب في 30 ° C حمام الماء لمدة 30 دقيقة. خلال فترة الحضانة، ويهز أنبوبمرتين لresuspend الخلايا.
- بعد الحضانة، ونقل أنبوب على الجليد ويصوتن الحل في 20 كيلو هرتز، السعة 70٪، والنبض في 3 ثانية، نبض من 3 ثوان، وخمسة البقول في كل جولة. يصوتن الحل لمدة ستة مجموع الجولات والسماح للحل لتبرد على الجليد في الفترات الفاصلة بين الدورات.
- أجهزة الطرد المركزي الحل في 24000 x ج لمدة 15 دقيقة على 4 درجات مئوية. تجاهل طاف وكرر الخطوات من 2،5-2،7 مرة واحدة. تخزين بيليه في -20 درجة مئوية أو انتقل إلى الخطوة 2.8.
- إعداد العازلة ألف (500 ملي مول كلوريد الصوديوم، و 20 ملي تريس، حمض الهيدروكلوريك، و 5 ملي ايميدازول، ودرجة الحموضة 7.9) وذلك بإضافة 0.8766 غرام من كلوريد الصوديوم، 0.09456 غرام من تريس، حمض الهيدروكلوريك، و0.01021 غرام من ايميدازول إلى دورق 100 مل. إضافة H 2 O حتى يصل إلى حجم 28 مل ثم ضبط درجة الحموضة من الحل إلى 7.9. ثم، ونقل الحل إلى 100 مل تخرج اسطوانة وإضافة H 2 O حتى حجم 30 مل.
- resuspend الكرية من الخطوة 2.7 في 30 مل من العازلة ألف واحتضان هذا الحل في 4 درجة مئوية لمدة 3 ساعات. خلال هذا الوقتتزن من 17.2 غرام من غوانيدين، حمض الهيدروكلوريك.
- يصوتن الحل على الجليد باستخدام نفس الإعدادات كما في الخطوة 2.6. ثم إضافة 17.2 غرام من غوانيدين، حمض الهيدروكلوريك إلى حل. احتضان هذا على الجليد لمدة 1 ساعة لإذابة البروتين العلامة MOG.
- أجهزة الطرد المركزي الحل في 24000 x ج لمدة 30 دقيقة على 4 درجات مئوية. جمع طاف وتخزين طاف في 4 درجات مئوية حتى تنقية البروتين.
3. البروتين تنقية
ملاحظة: في الخطوات التالية سيتم تنقيته من MOG العلامة البروتين من خلال 4 جولات من امتصاص على الراتنج النيكل اتهم (عن طريق صاحب العلامة) وشطف.
- جعل المخازن وبعد:
- إعداد B الاحتياطي (500 ملي مول كلوريد الصوديوم، و 20 ملي تريس، حمض الهيدروكلوريك، 5 ايميدازول ملم، 6 M غوانيدين، حمض الهيدروكلوريك، ودرجة الحموضة 7.9). إضافة 5.844 غرام من كلوريد الصوديوم، 0.6304 غرام من تريس، حمض الهيدروكلوريك، 0.0681 غرام من إميدازول و114.64 ز غوانيدين، حمض الهيدروكلوريك إلى كوب 500 مل. ثم إضافة H 2 O حتى تصل إلى 190 مل وضبط درجة الحموضة إلى 7.9. نقل سولution إلى 250 مل تخرج اسطوانة وإضافة H 2 O حتى حجم 200 مل.
- إعداد عازلة شطف (500 ملي مول كلوريد الصوديوم، و 20 ملي تريس، حمض الهيدروكلوريك، و 0.5 M إميدازول 6 M غوانيدين، حمض الهيدروكلوريك، ودرجة الحموضة 7.9). إضافة 5.844 غرام من كلوريد الصوديوم، 0.6304 غرام من تريس، حمض الهيدروكلوريك، 6.808 غرام من إميدازول و114.64 ز غوانيدين، حمض الهيدروكلوريك إلى 500 مل دورق. إضافة H 2 O حتى تصل إلى 190 مل وضبط درجة الحموضة إلى 7.9. نقل الحل إلى 250 مل تخرج اسطوانة وإضافة H 2 O حتى حجم 200 مل.
- إعداد عازلة قطاع (500 ملي مول كلوريد الصوديوم، و 20 ملي تريس، حمض الهيدروكلوريك، و 100 ملي EDTA، ودرجة الحموضة 7.9). إضافة 5.844 غرام من كلوريد الصوديوم، 0.6304 غرام من تريس، حمض الهيدروكلوريك، 40 مل 500 ملي EDTA إلى 500 مل دورق. إضافة H 2 O حتى تصل إلى 190 مل وضبط درجة الحموضة إلى 7.9. نقل الحل إلى 250 مل تخرج اسطوانة وإضافة H 2 O حتى حجم 200 مل.
- إعداد المسؤول عازلة (0.1 م كبريتات النيكل). إضافة 5.257 غ كبريتات النيكل إلى مل دورق 500 و إضافة H 2 O حتى تصل إلى 190 مل (تنبيه، لا تتعامل مع النيكلتم حل كبريتات خارج غطاء الدخان حتى كبريتات النيكل في H 2 O). مرة واحدة وقد حل كبريتات النيكل، ونقل الحل إلى 250 مل تخرج اسطوانة وإضافة H 2 O حتى يصل حجم 200 مل.
- تقسيم 10 مل من الراتنج النيكل بين اثنين مخروطية 50 مل أنابيب الطرد المركزي قادرة على تحمل قوى الطرد المركزي أكثر من 4،500 x ج (5 مل في كل أنبوب).
- تهمة ويوازن الراتنج النيكل:
- غسل الراتنج وذلك بإضافة 40 مل H 2 O إلى كل أنبوب يحتوي على الراتنج. وضع أنابيب أفقيا على الكرسي الهزاز والسماح لهم تستنهض الهمم لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية. بمجرد الانتهاء، أنابيب الطرد المركزي في 4500 x ج لمدة 8 دقائق في 4 درجات مئوية.
- تجاهل طاف قبل pipetting لتجنب إزعاج بيليه. إضافة 40 مل من العازلة تهمة إلى كل أنبوب. نقل الأنابيب على الكرسي الهزاز والسماح لهم تستنهض الهمم لمدة 15 دقيقة على 4 درجات مئوية. بمجرد الانتهاء، أنابيب الطرد المركزي في 4500 x ج لمدة 8 دقائق في 4 درجات مئوية.
- تجاهل طاف ثم إضافة 40 مل من B العازلة للأنابيب. نقل الأنابيب على الكرسي الهزاز والسماح لهم تستنهض الهمم لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية. بمجرد الانتهاء، أنابيب الطرد المركزي في 4500 x ج لمدة 8 دقائق في 4 درجات مئوية ثم تجاهل supernatants.
- اختياري: خذ 150 ميكرولتر من البروتين بالفاعلات التي تم جمعها في الخطوة 2.11 وتحويلها إلى أنبوب microcentrifuge 1.5 مل. تسمية أنبوب ما قبل الحضانة وتجميد هذا في -20 درجة مئوية لتحليل صفحة المستقبل SDS (الشكل 3، العلامة الخام MOG).
- تنقية العلامة MOG البروتين:
- نقل وحدة التخزين بالكامل من البروتين بالفاعلات من الخطوة 2.11 (~ 40 مل، ناقص عينة صغيرة إزالتها في الخطوة 3.4) إلى الأنبوب الأول (الشكل 2، أنبوب 1) التي تحتوي على الراتنج النيكل من الخطوة 3.3، مزيج، ووضع أفقي على الكرسي الهزاز عند 4 درجة مئوية لمدة 1 ساعة.
- أنبوب الطرد المركزي في 4500 x ج لمدة 8 دقائق في 4 درجات مئوية. الانتهاء مرة واحدة، ونقل طاف للثانيأنبوب (الشكل 2، أنبوب 2) من الراتنج النيكل واحتضان كما هو موضح في الخطوة السابقة. في غضون ذلك، متابعة الخطوات 3-6 أدناه مع أنبوب 1.
- Resuspend والراتنج النيكل في أنبوب 1 في 40 مل من شطف العازلة ووضع أنبوب أفقيا على الكرسي الهزاز في 4 درجات مئوية لمدة 5 دقائق. ثم، الطرد المركزي الأنبوب في 4500 x ج لمدة 8 دقائق في 4 درجات مئوية.
- نقل طاف تحتوي على بروتين مزال العلامة MOG في زجاجة مل 250 المسمى "النقي العلامة MOG البروتين والحفاظ على هذه الزجاجة في 4 درجات مئوية. مع كل خطوة شطف، تجمع طاف الناتجة في هذه الزجاجة.
- إضافة 40 مل من العازلة الشريط إلى الراتنج النيكل ووضع أفقي على الكرسي الهزاز لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية.
- أنبوب الطرد المركزي في 4500 x ج لمدة 8 دقائق في 4 درجات مئوية. تجاهل طاف، ثم إعادة شحن الراتنج النيكل كما هو موضح في الخطوة 3.3.
- بمجرد الانتهاء، المضي قدما في أنبوب الثاني كما هو موضح في الخطوة 3.5. ما مجموعه 4 جولةالصورة من امتصاص البروتين بالفاعلات من الخطوة 2.11 على الراتنج النيكل اتهم وشطف سوف تسترد أكثر من البروتين على الرغم من ذلك، إذا رغبت في ذلك، يمكن استرداد بروتين إضافي في جولات إضافية من امتصاص وشطف.
- مرة واحدة أربعة (أو أكثر) جولات من امتصاص وشطف كاملة، وتخزين البروتين المنقى المجمعة في 4 درجات مئوية خلال الليل. الراتنج النيكل يمكنك خزنها في 40 مل من محلول الإيثانول 20٪ في 4 درجات مئوية حتى الحاجة إليه مرة أخرى.
4. قياس كثافة البروتين
ملاحظة: قبل المضي قدما من الضروري قياس كمية من البروتين النقي العلامة MOG ولدت في القسم 3. سيتم استخدام هذه القيمة لتحديد الحجم النهائي للتركيز هذا البروتين في نهاية البروتوكول. نحن تصف برادفورد الفحص القياسية هنا. يتم تحديد تركيز البروتين المنقى العلامة MOG بمقارنة الامتصاصية الطيفي متسلسل مخففإد MOG العلامة البروتين لمنحنى مستوى الزلال المصل البقري (BSA) بتركيز معلوم.
- جعل 10X العازلة خلات بإضافة 23 مل حامض الخليك الجليدي إلى 8.2 غ خلات الصوديوم في كوب 3 L ثم قم بإضافة 1.9 L من H 2 O بحل خلات الصوديوم. نقل هذا الحل إلى 2 لتر تخرج اسطوانة وإضافة H 2 O حتى يصل حجم 2 L. ثم تخزينه في زجاجة 2 لتر في درجة حرارة الغرفة. جعل 1 مل من العازلة خلات 1X بإضافة 100 ميكرولتر من 10X العازلة خلات إلى 900 ميكرولتر من H 2 O.
- إعداد لوحة 96-جيدا لالتخفيفات بإضافة 30 ميكرولتر من العازلة خلات 1x إلى الآبار G2-8 و 60 ميكرولتر إلى G9. إضافة 48 ميكرولتر من العازلة خلات 1x إلى H2 و H3.
- إعداد التخفيف المتسلسل الأولي للمستوى BSA في الصف G كما يلي: إضافة 216 ميكرولتر من العازلة خلات 1X و 54 ميكرولتر من المتاحة تجاريا 2 ملغ القياسية / مل BSA في G1 جيدا وتخلط جيدا. إضافة 210 ميكرولتر من G1 جيدا ان G2 جيدا، تخلط جيدا،ثم قم بإضافة 180 ميكرولتر من G2 جيدا ان G3 بشكل جيد. إضافة 150 ميكرولتر من G3 جيدا ان G4 جيدا، تخلط جيدا، ويستمر هذا الاتجاه إضافة 30 ميكرولتر أقل على كل بئر لاحقة حتى G8 جيدا. (انظر الجدول رقم 1 لقوائم عوامل التخفيف ما يعادلها).
- إعداد العينات ثلاث نسخ من كل تخفيف من خلال نقل 10 ميكرولتر من G1 جيدا ان الآبار A1 و B1 و C1، و 10 ميكرولتر من G2 جيدا ان الآبار A2، B2، و C2، وهلم جرا. استخدام ماصة الأقنية.
- لإعداد التخفيفات العلامة MOG، إضافة 60 ميكرولتر من تنقية البروتين العلامة MOG من الخطوة 3.6 إلى H1 جيدا. إضافة 12 ميكرولتر من H1 جيدا إلى ما H2، تخلط جيدا، ثم إضافة 12 ميكرولتر من H2 جيدا إلى ما H3، تخلط جيدا (وهذا ينتج عنه تخفيف 1X في H1 و 1/5 التخفيف في H2، و1/25 التخفيف في H3) .
- إعداد العينات ثلاث نسخ للعلامة MOG التخفيفات عن طريق نقل 10 ميكرولتر من الآبار H1-H3 إلى صفوف D، E و F، كما هو موضح في الخطوة 4.4.
- مزيج 2 مل من صبغة البروتين مقايسة التركيز كاشف مع 8 مل من H 2 O. إضافة 200 ميكرولتر من هذا الخليط لجميع الآبار التي تم تحميلها مسبقا في صفوف A، B، C، D، E، F و، وذلك باستخدام ماصة الأقنية، إذا كانت متوفرة. البوب أي فقاعات في الآبار باستخدام إبرة قبل قراءة تركيز البروتين.
- في غضون 10 دقيقة من إضافة كاشف صبغ، وقياس الامتصاصية 595 نيوتن متر من جميع الآبار في صفوف A، B، C، D، E، و F.
- استخدام الصفوف A، B، و C لإنشاء منحنى القياسية حيث المواقف 1-9 تتوافق مع 0.4، 0.35، 0.3، 0.25، 0.2، 0.15، 0.1، 0.05، و0 ملغ / مل BSA. واستنادا إلى هذا المنحنى، وحساب تركيز MOG العلامة البروتين باستخدام التخفيف من العلامة MOG الذي يناسب المنحنى القياسي. عادة، سوف يكون هناك 200-250 ملغ من MOG العلامة البروتين من 1 لتر من ثقافة البكتيرية باستخدام وصف بروتوكول هنا.
ملاحظة: لجعل MOG 1-125 ننطلق من هنا إلى قسم اختياري 7 المدرجة في نهاية البروتوكول. خلاف ذلك، تابع إلى القسم 5.
معشوقة = "jove_title"> 5. غسيل الكلى
ملاحظة: يتم تنفيذ غسيل الكلى لإزالة غوانيدين تدريجيا من محلول يحتوي على النقاء، التشويه والتحريف العلامة MOG للسماح للبروتين لrefold. يجب توخي الحذر خلال هذه الخطوة كما MOG نفسها غير قابلة للذوبان جدا، وعلى الرغم من هذا هو تحسن من وجود علامة thioredoxin، فإنه لا يزال عرضة للخروج من الحل. لذلك، refolding ينبغي أن يقوم تدريجيا وعلى منخفض نسبيا تركيز العلامة MOG.
- قبل البدء في غسيل الكلى، وتمييع المطهرون MOG العلامة البروتين مع العازلة ب (يمكن أن يتم كما هو موضح في الخطوة 3.1 B العازلة) حتى تركيز 0.5 ملغ / مل أو أقل، على أساس كمية من البطاقات MOG المحسوبة في القسم 4.
- قطع ما يقرب من 30 سم من جلد الثعبان غسيل الكلى أنابيب وتأمين نهاية واحدة مع مرقئ تأمين من قبل للطي نهاية جلد الثعبان أكثر من ثلاث مرات، وتحامل على نهاية مطوية مع مرقئ. ملء جلد الثعبان مع مخففةالعلامة MOG البروتين (بين 60 الى 90 مل من MOG العلامة البروتين لكل أنبوب) ثم إزالة فقاعات الهواء من جلد الثعبان من قبل اجبارهم على الخروج من نهاية مفتوحة. وأخيرا، ختم الطرف الآخر من الأنبوب باستخدام مرقئ قفل الثاني.
- كرر الخطوة 5.2 لملء أقسام إضافية من أنابيب غسيل الكلى حتى يتم نقل جميع MOG العلامة البروتين في أنابيب الثعبان غسيل الكلى. تأكد من عدم وجود تسرب.
- جعل خلات 1X مع 4 M غوانيدين وزنها عن طريق 382،12 غرام من غوانيدين، حمض الهيدروكلوريك وإضافة 100 مل من العازلة 10X خلات في الخطوة 4.1 إلى دورق 2 لتر. إضافة 0.5 لتر من H 2 O إلى الكأس والسماح للغوانيدين، حمض الهيدروكلوريك إلى حل. مرة واحدة حله، ونقل الحل إلى 1 لتر تخرج اسطوانة وإضافة H 2 O حتى يصل حجم 1 L. كرر هذه الوصفة لكل 2 snakeskins المطلوبة.
- أداء غسيل الكلى على النحو التالي: ملء دلو كبير (الحد الأدنى 10 لتر) مع 1 لتر من العازلة خلات 1X مع 4 M غوانيدين من الخطوة 5.4. وضع ما يصل رس 2 أجزاء من أنابيب غسيل الكلى تحتوي على العلامة MOG في دلو، مما يترك مجالا لشريط مغناطيسي تدور دون عوائق في القاع. وضع دلو في غرفة C 4 درجات على لوحة تحريك مغناطيسي وتحويلها إلى معدل دوران بطيء (أي ليست عالية، ما يكفي لتحريك السوائل):
ملاحظة: نفذ الخطوات التالية للحد تدريجيا من كمية غوانيدين في المخزن المؤقت. وتعطى مرة ضجة كما الحد الأدنى، ولكن يمكن أن تترك ليلة وضحاها. وغسيل الكلى تأخذ ما لا يقل عن 3 أيام، ولكن يمكن تمديد هذه الفترة اذا شئت. تحقق بانتظام للتأكد من أن أنابيب سليمة وأن الغاية مغلقة بإحكام. - السماح للدلو يجلس ويقلب لمدة 4-5 ساعة.
- إضافة 1 لتر من العازلة خلات 1X (100 مل 10X العازلة خلات و 900 مل من H 2 O) على كل دلو.
- كرر الخطوات من 5.5.1 و 5.5.2 ما مجموعه 3 مرات ليصبح المجموع 4 لتر من العازلة في دلو.
- تجاهل نصف عازلة في دلو وإعادة ملء مع 1 لتر من العازلة خلات 1X (100 مل 10X العازلة خلات و 900 مل من H 2 O، لا غوانيدين) وإعداد أنابيب ويقلب شريط.
- كرر الخطوات من 5.5.1 و 5.5.2 مرة واحدة (أي حتى يكون هناك ما مجموعه 4 لتر من العازلة في دلو).
- وأخيرا، استبدال كامل حجم 4 لتر في وعاء مع 4 لتر من العازلة 1X خلات جديدة والسماح ضجة لمدة 4-5 ساعة. للحصول على أفضل النتائج، القيام بهذه الخطوة في اليوم من تركيز البروتين.
- إزالة بعناية أنابيب غسيل الكلى مع العلامة MOG refolded وتجاهل عازلة دلو.
6. التركيز MOG العلامة البروتين
ملاحظة: في الخطوة الأخيرة، ويتركز refolded MOG العلامة البروتين لتخفيف العمل للتخزين. كما MOG البطاقة هي غير قابلة للذوبان جدا، فإنه لا ينبغي أن يتجاوز 5 ملغ / مل. هذا التركيز هو متساوي المولية تقريبا مع 0.4 ملغ / مل MOG 35-55 الببتيد، والذي يستخدم عادة للحث على EAE في الفئران (مختلطة 1: 1 مع كامل adjuv فرويندالنمل (CFA)). وخلال عملية الاعتقال ليس من غير المألوف لكمية صغيرة من البروتين للخروج من الحل في شكل راسب أبيض. هطول المفرط هو المشكلة، ولكن.
- حساب الحجم النهائي المطلوب لتحقيق تركيز العلامة MOG من 5 ملغ / مل، استنادا إلى القيمة المحسوبة في القسم 4.
- خط مقلاة مع رقائق الألومنيوم وتشمل رقائق الألومنيوم مع البولي ايثيلين جلايكول (PEG) 3350 وPEG 8000 في نسبة 1: 1. وأدرجت PEG 3350 إلى هذا الخليط لأنها يمكن أن تساعد على منع تراكم البروتين خلال التركيز وغير فعال cyropreservative 11.
- وضع أنابيب الثعبان (مع MOG العلامة البروتين داخل) على أعلى من رقائق الألومنيوم، وتغطي مع PEG 8000. ولهذا الاعتصام في درجة حرارة الغرفة والتحقق من حجم بانتظام حتى حجم يساوي أو أقل من الحجم النهائي المقدرة (المحسوبة في الخطوة 6.1)، وسوف يقاس الحجم الفعلي في الخطوة التالية. إذا أصبح عموممشبعة بالماء أثناء عملية الاعتقال، وإنشاء عموم جديدة مع رقائق الألومنيوم وPEG 3350 وPEG 8000.
- غسل خارج snakeskins مع H 2 O ونقل البروتين العلامة MOG لزجاجة منفصلة باستخدام ماصة المصلية. تتبع حجم كما يتم نقل البروتين لضمان وحدة التخزين الصحيح.
- إذا تم تخفيض حجم أقل من الحجم النهائي المقدرة، إضافة عازلة خلات 1X حتى يتم الوصول إلى حجم المطلوب. وإذا كان حجم فوق الحجم النهائي المقدرة، نقل العلامة MOG البروتين مرة أخرى في أنابيب غسيل الكلى ومواصلة تركيز (الخطوات 6،2-6،3).
- توزيع العلامة MOG البروتين بين 1.5 مل أنابيب (0.5 مل لكل أنبوب)، وتخزين الأنابيب عند -80 درجة مئوية لحين الحاجة إليها. للحث على EAE، هذا المزيج حجم 1: 1 مع CFA.
- تشغيل هلام صفحة SDS لتأكيد التعبير عن العلامة MOG البروتين باستخدام عينات أخذت في 1 الخطوات.4، 2.1، 3.4، وتنقية البروتين MOG من الخطوة 6.4.
7. توليد MOG 1-125 من MOG العلامة عن طريق TEV البروتيني (اختياري)
ملاحظة: هذه الخطوة اختيارية وتستمر من نهاية الخطوة 4. إذا كان مطلوبا MOG 1-125 دون أي سمة تسلسل إضافية، ويمكن إزالتها تسلسل العلامة باستخدام TEV البروتيني (الشكل 4). بقدر ما نعلم، ليس هناك نظام التعبير الأخرى قادرة على توليد النقي MOG 1-125. ومع ذلك، تجدر الإشارة إلى أنه من دون العلامة thioredoxin، MOG 1-125 غير قابلة للذوبان للغاية وهذا قد يسبب مشاكل أثناء تنقية ومعالجة، ولهذا السبب إزالة العلامة عند الضرورة القصوى لأسباب التجريبية. مطلوبة عدة خطوات لتوليد النقي MOG 1-125. ومدال MOG العلامة لأول مرة في TEV عازلة البروتيني الانقسام. بعد الهضم مع TEV البروتيني، يتم تقليل حجم للمساعدة في وقت لاحق تنقية الواحدالعائد على السهم، ثم مدال إلى B العازلة، ثم صاحب العلامة التي تحتوي على العلامة تسلسل وإزالتها باستخدام الراتنج النيكل. وأخيرا، وكميا البروتين ويتركز MOG النقي 1-125 إلى التركيز النهائي.
- جعل 1 لتر من العازلة 10X انشقاق TEV (500 ملي تريس، حمض الهيدروكلوريك، و 5 ملي EDTA) وذلك بإضافة 1،861 ز EDTA، 44.4 غرام تريس، حمض الهيدروكلوريك، و 26.5 جم تريس إلى دورق 2 لتر. إضافة H 2 O حتى يصل حجم 990 مل ثم ضبط درجة الحموضة إلى 8 إلى حل EDTA. نقل الحل إلى 1 لتر تخرج اسطوانة وجعل حجم ما يصل الى 1 لتر باستخدام H 2 O.
- تمييع MOG العلامة البروتين من الخطوة 3،6-0،5 ملغ / مل باستخدام B العازلة (المخزن نفسه هو موضح في الخطوة 3.1)، استنادا إلى كمية من البروتين المحسوبة في القسم 4. نقل 120 مل من المخفف البروتين العلامة MOG إلى الثعبان غسيل الكلى أنابيب كما وصفها في خطوات 5،2-5،3. يمكن زيادتها رفع مستوى الصوت ولكن كمية TEV البروتيني اللازمة ليلتصق كل من العلامة MOG البروتين سوف يكون substantial.
- متابعة بروتوكول غسيل الكلى المذكورة في الخطوة 5.5، باستثناء استبدال العازلة 10X خلات مع عازلة انشقاق 10X TEV في الخطوة 7.1.
- نقل العلامة MOG، الآن في TEV عازلة انشقاق، لزجاجة جديدة زجاج 250 مل ورصد زيادة حجم من غسيل الكلى. إضافة 1 ميكرولتر من β-mercapto الإيثانول في كل 2.85 مل من MOG العلامة بروتين يضاف إلى زجاجة. إضافة على الأقل 1 ملغ من TEV البروتيني (الأسهم حل TEV في 5 ملغ / مل) لكل 50 ملغ من MOG العلامة بروتين (يمكن إضافة البروتيني TEV تصل إلى 01:10 TEV: نسبة البروتين MOG)، واحتضان في درجة حرارة الغرفة، محمية من الضوء لمدة 72 ساعة على الأقل.
ملاحظة: في نهاية البروتيني حضانة TEV، ينبغي أن ينظر إلى رواسب بيضاء في الجزء السفلي من زجاجة. - قبل نقل البروتين لأنابيب غسيل الكلى، إضافة غوانيدين، حمض الهيدروكلوريك إلى حل حتى تذوب البروتينات لمنع البروتين يترسب من التمسك زجاجة. نقل 150 ميكرولتر منهذا الحل إلى أنبوب microcentrifuge 1.5 مل وتسمية أنبوب بأنها "MOG مع TEV". تخزين الحل في -20 درجة مئوية لتحليل SDS-PAGE في المستقبل.
- نقل جميع السوائل من الخطوة 7.5 في أنابيب غسيل الكلى كما هو موضح في الخطوات 5،2-5،3. ملء دلو كبير مع 2 لتر من H 2 O ووضع أنبوب غسيل الكلى في دلو. احتضان هذا في 4 درجات مئوية مع ضوء اثارة بين عشية وضحاها. هذه الخطوة مهمة لتخفيف خارج غوانيدين للسماح للتركيز البروتين تحدث بسرعة وتبدأ إزالة EDTA من الحل الذي سوف تتداخل مع تنقية البروتين.
- تركيز البروتين في أنابيب غسيل الكلى كما هو موضح في الخطوات 6،2-6،3 (باستثناء استخدام فقط PEG 8000) بحيث الحجم النهائي من الحل هو ~ 40 مل. غسل أنابيب غسيل الكلى مع H 2 O وإزالة أي PEG المتبقية 8000 لا تزال تعلق على الأنبوب. هذا الانخفاض في حجم يجعل من الممكن لتناسب جميع من البروتين المهضوم إلى أنبوب 50 مل تحتوي على النيكل إعادةالخطيئة، كما هو موضح في الخطوة 3.5.
- Dialyze على البروتين المهضوم إلى B الاحتياطي:
- ملء دلو كبير مع 1 لتر من العازلة ب (29.22 جم كلوريد الصوديوم، 3.152 غرام تريس، حمض الهيدروكلوريك، 0.3405 ز إميدازول 573.18 غرام من غوانيدين، حمض الهيدروكلوريك، ودرجة الحموضة 7.9).
- وضع snakeskins تحتوي على البروتين المهضوم من الخطوة 7.7 في دلو جنبا إلى جنب مع المغناطيس ضجة (كما هو موضح بمزيد من التفصيل في الخطوة 5.5). وضع دلو إلى 4 درجات مئوية غرفة باردة على طبق من ضجة لتعيين ضجة بطيئة والسماح للsnakeskins إلى dialyze لمدة 5 أو أكثر من ساعة.
- تفريغ دلو وإعادة ملء مع 1 لتر آخر من B العازلة وترك هذا الجلوس في غرفة C 4 درجات الباردة على طبق من ضجة لتعيين ضجة بطيئة والسماح للsnakeskins إلى dialyze لمدة 5 أو أكثر من ساعة.
- أداء تنقية MOG 1-125 البروتين كما هو مفصل في الباب 3، مع فارق مهم من شأنها أن تكون ملزمة تسلسل العلامة المشقوق من الراتنج النيكل، وترك MOG 1-125 في الحل. مرة أخرى، سوف 4 جولات من تنقية يكونتجرى على نفس الحجم، ولكن في هذه الحالة كان الهدف هو تحسين نقاء، بدلا من استعادة الكثير من البروتين ممكن. انظر الشكل 4.
- جعل مخازن تنقية البروتين المذكورة في الخطوة 3.1
- توجيه الاتهام كلا أنابيب من الراتنج النيكل كما هو موضح في الخطوة 3.3.
- تنقية MOG 1-125 من مفصل في خطوة 3.5، باستثناء الضروري أن شطافة من الراتنج النيكل التي تحتوي على بطاقة يتم تجاهل بروتوكول (الحفاظ على 150 ميكرولتر من شطافة في أنبوب microcentrifuge 1.5 مل لتحليل SDS-PAGE المستقبل)، في حين يتم الاحتفاظ محلول يحتوي على MOG 1-125 كمنتج نهائي.
- قياس تركيز MOG 1-125 البروتين كما هو موضح في القسم 4:
- إعداد BSA التخفيفات منحنى القياسية كما هو موضح في الخطوات 4.2 و 4.4.
- إعداد التخفيفات من MOG 1-125 كما هو موضح في الخطوات 4.5 و 4.6. بدلا من ذلك، قد يكون من المفيد أن تولد مجموعة أكبرمن التخفيفات (1X، 1/2، 1/4، 1/8 وعلى سبيل المثال). ضبط كميات من العازلة خلات 1X و MOG 1-125 وفقا لذلك.
- أداء برادفورد الفحص كما هو موضح في الخطوات 4،7-4،9 وحساب كمية من MOG 1-125 إنشاؤه. العائد المتوقع هو حوالي 4 ملغ أو أكثر من البروتين.
- Refold MOG 1-125 عن طريق إزالة تدريجية من غوانيدين عبر غسيل الكلى، كما هو موضح في المادة 5.
- التركيز MOG 1-125 البروتين كما هو موضح في القسم 6. التركيز النهائي يجب أن يكون 2.24 ملغ / مل، وهو متساوي المولية إلى 5 ملغ / مل MOG العلامة.
8. SDS-PAGE جل لتأكيد MOG العلامة إنتاج والطهارة
ملاحظة: عينات مأخوذة من الخطوات 1.4، 2.1، 3.4، و 6.4 يتم تحليلها من قبل القياسية SDS-PAGE لتأكيد MOG إنتاج العلامة والنقاء. يجب أن يتم تنفيذ هذه الخطوة بعد تنقية النهائية إما MOG العلامة أو MOG 1-125.
<لى> جعل منطقة عازلة تحميل 2X SDS-PAGE بإضافة 1.576 غرام من تريس، حمض الهيدروكلوريك إلى 2 مل من H 2 O وتعيين الرقم الهيدروجيني إلى 6.8. إضافة 0.4 غرام SDS في حل تريس، حمض الهيدروكلوريك ومن ثم إضافة H 2 O حتى يصل إلى حجم 7 مل. - إضافة 0.2 غرام من برموفينول الأزرق إلى 10 مل من H 2 O ثم إضافة 1 مل من هذا الحل في الخطوة 8.1. أخيرا، إضافة 2 مل من الجلسرين لإنهاء العازلة تحميل 2X SDS-PAGE. عند تخزين هذا الحل، والحفاظ على 4 درجات مئوية، وحمايته من الضوء لمدة تصل إلى 3 أشهر.
- ذوبان الجليد في قسامات المجمدة من البكتيريا من الخطوات 1.4 و 2.1 وكذلك MOG بالفاعلات العلامة البروتين من الخطوات 3.4 و 6.4 في درجة حرارة الغرفة.
- إزالة الأملاح من الحلول التي تم جمعها في الخطوات 3.4 و 6.4 وذلك بإضافة 60 ميكرولتر من كل الأعمدة البروتين تحلية. تنقية البروتينات التالية تعليمات الشركة الصانعة.
- إضافة 20 ميكرولتر من β-mercapto الإيثانول إلى 1 مل من محلول في الخطوة 8.2. إضافة 40 ميكرولتر من هذا إلى البكالوريا اثنينالكريات البكتيرية من الخطوة 8.3 و 60 ميكرولتر من البروتينات المحلاة من الخطوة 8.4 واحتضان هذه على 95 درجة مئوية لمدة 10 دقيقة.
- جعل 1X عازلة تشغيل الصفحة SDS وزنها عن طريق 5 غرام من تريس، 28.8 غرام الجلايسين، و 1 غرام SDS. إضافة هذه إلى كوب 1 لتر وإضافة 500 مل H 2 O حل كل شيء. مرة واحدة حله، ونقل الحل إلى 1 لتر تخرج اسطوانة وملء مع H 2 O حتى يصل حجم 1 L.
- اقامة هلام بولي أكريلاميد 12٪ في جهاز الجل ثم إضافة SDS-PAGE العازلة 1X تشغيل لجهاز هلام مثل أن المخزن المؤقت تشغيل فقط فوق الجزء العلوي من الآبار في هلام. غسل الآبار من هلام قبل pipetting 50 ميكرولتر من العازلة على التوالي في الآبار خمس مرات لكل منهما.
- تحميل 10 ميكرولتر من سلم البروتين في البئر الأول وإضافة 10 ميكرولتر من الحلول المغلي من الخطوة 8.5 لفصل الآبار. تشغيل هلام في 115 فولت لمدة 60 دقيقة.
- إزالة هلام من الجهاز ونقلها إلى وعاء صغير. ملء حساب المشتركINER مع 100 مل من H 2 O النقي ونقل الحاوية إلى منصة دوارة ببطء لمدة 8 دقائق. بعد دقيقة 8، تفريغ المياه وغسل هلام مرتين أكثر مع H 2 O.
- تفريغ H 2 O من الحاوية وإضافة 100 مل من كاشف وصمة عار السريع إلى الحاوية. نسمح لهذا أن يجلس على منصة دوارة ببطء بين عشية وضحاها، وتغطي بورق الألمنيوم.
- تفريغ وصمة عار الكاشف السريع وإضافة حوالي 100 مل من H 2 O إلى الحاوية. نسمح لهذا أن يجلس على منصة دوارة لمدة 8 دقائق. تفريغ H 2 O وتكرار غسل H 2 O مرتين.
- صورة هلام باستخدام تصوير لبقع زرقاء coomassie. ابحث عن النطاق حول 31.86 كيلو دالتون (MOG العلامة بروتين) والفرقة خفوتا في 63.72 كيلو دالتون (MOG العلامة dimers).