يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية

مقالة منهجية

بروتوكول محسن لاستخراج البروتينات من صمام ميترال الإنسان

12.6K مشاهدة

⸱

DOI:

10.3791/55762

⸱

يونيو 14, 2017

في هذه المقالة

ملخص

تكوين البروتين من صمام الصمام التاجي البشري لا يزال غير معروف جزئيا، لأن تحليله معقد من قبل الخلوية منخفضة، وبالتالي من خلال انخفاض البروتين الحيوي. هذا العمل يوفر بروتوكول لاستخراج البروتين بكفاءة لتحليل بروتيوم صمام الصمام التاجي.

الملخص

تحليل بروتيوم الخلوية يمكن أن تساعد على توضيح الآليات الجزيئية الكامنة الأمراض بسبب تطوير التكنولوجيات التي تسمح على نطاق واسع تحديد وكمية من البروتينات الموجودة في النظم البيولوجية المعقدة.المعرفة المكتسبة من نهج البروتين يمكن أن تؤدي إلى فهم أفضل للآليات المسببة للأمراض الكامنة وراء الأمراض، والسماح لتحديد علامات التشخيص والتشخيص الرواية جديدة، ونأمل، من الأهداف العلاجية. ومع ذلك، فإن الصمام التاجي القلب يمثل عينة صعبة للغاية لتحليل البروتين بسبب انخفاض الخلوية في بروتيوغليكان والمصفوفة خارج الخلية المخصب الكولاجين. وهذا يجعل من الصعب استخراج البروتينات لتحليل البروتين العالمي. يصف هذا العمل بروتوكول متوافق مع تحليل البروتين لاحق، مثل البروتينات الكمية و إمونوبلوتينغ. وهذا يمكن أن يسمح للارتباط البيانات قلقز التعبير البروتين مع البيانات على التعبير الكمي مرنا وغير الكمي تحليل المناعية. في الواقع، هذه النهج، عندما يؤديها معا، سيؤدي إلى فهم أكثر شمولا للآليات الجزيئية الكامنة وراء الأمراض، من مرنا إلى ما بعد متعدية تعديل البروتين. وهكذا، يمكن لهذه الطريقة تكون ذات صلة للباحثين المهتمين في دراسة أمراض القلب صمام فيسيوباثولوغي.

المقدمة

وقد غيرت الأدلة الأخيرة فهم أدوار الآليات التنظيمية العديدة التي تحدث بعد التوليف مرنا. في الواقع، عمليات متعدية، ما بعد النسخي، وعمليات بروتين يمكن أن تنظم بروتين وفرة وظيفة. العقيدة - التي تقول أن تركيزات مرنا هي بروكسيات لتلك التي من البروتينات المقابلة، على افتراض أن مستويات النص هي المحدد الرئيسي للوفرة البروتين - وقد تم تنقيح جزئي. في المقام الأول، ومستويات النص تتنبأ جزئيا فقط وفرة البروتين، مما يشير إلى أن أحداث ما بعد النسخي تحدث لتنظيم البروتينات داخل الخلايا 1 ، 2 .

وعلاوة على ذلك، والبروتين....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

البروتوكول

في هذا البروتوكول، يتم جمع قلوب الإنسان خلال إكسبلانتاتيون متعدد الأجسام (وقت نقص التروية الباردة من 4-12 ساعة، يعني 6 ± 2 ح) من الجهات المانحة متعددة الأعضاء استبعادها من زرع الأعضاء لأسباب تقنية أو وظيفية، على الرغم من المعلمات مخطط صدى القلب العادي. يتم إرسالها إلى بنك الأنسجة القلبية الوعائية في ميلانو، مركز مونزينو كارديولوجيك (ميلان، إيطاليا) لمصارف الصمامات الأبهري والرئوي. لا تستخدم المنشورات الخلفية التاجية للأغراض السريرية، لذلك يتم جمعها خلال عزل الصمام الأبهري والرئوي بعد الحصول على موافقة مستنيرة من أقارب المانحين. يتم جمع الأنسجة لزرع والبحوث إلا بعد موافقة الوالدين. على ورقة الموافقة، فإنهم يأذنون (أو لا) استخدام....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

النتائج

استخراج و حل البروتينات في العازلة اليوريا هو متوافق مباشرة مع الأساليب البروتينية على أساس إزلكتروفوكوسينغ (ثنائي الأبعاد الكهربائي (2-دي) 11 والتركيز السائل تركيز كهروضوئية (إيف) 12 ) مع إمونوبلوتينغ بعد التخفيف في العازلة ليملي 13 تحتوي على كوكتيل البروتيني مثبط 14 .

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المناقشة

خطوة واحدة حاسمة من هذا البروتوكول هو استخدام النيتروجين السائل لتجميد العينة والبرد نظام طاحونة. إن استخدام النيتروجين السائل يمنع التدهور البيولوجي ويسمح بالمسحوق الفعال، ولكنه يتطلب تدريبا خاصا للتعامل الآمن.

في هذا البروتوكول يتميز نظام طاحونة لعينة طحن لأن عينات صغيرة من الصعب استرداد من هاون القياسية والمدقات. في هذه الحالة، عينات صغيرة تنتشر على شكل مسحوق ناعم على سطح الهاون، مما يجعل جمع الصعب. ميزة أخرى .......

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

الكتاب ليس لديهم ما يكشف.

شكر وتقدير

وقد دعمت وزارة الصحة الإيطالية هذه الدراسة (أرسي 2013-بيو 15). نشكر باربرا ميشيلي لمساعدتها التقنية الممتازة.

....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة
الاسمالشركةرقم فهرسيالتعليقات
محلول0.9٪ كلوريد الصوديوم
Eurocollins ASALF30874046وسط نقل العضو المتوازن. امزج 400 مل من Eurocollins A مع 100 مل Eurocollins B للحصول على متوسط متوازن Eurocollins
Eurocollins BSALF30874022وسيط نقل العضو المتوازن. اجمع بين 400 مل من Eurocollins A مع 100 مل Eurocollins B للحصول على عمر Eurocollins متوسط متوازن من Eurocollins
WisconsinBridgeRM / N 4081متوسط نقل الأعضاء المتوازن هواء
التدفق الرأسيBiohazard BurdinolaClass A تصنيف GMP Dewar
FlaskThermo ScientificNalgene 4150-1000
نظام المطحنة بالتبريدOPS التشخيصCG 08-01نظام مطحنة يحتوي على ملاط ومدقات ومفك براغي
ملقط
ملعقة
مشرط معقم يمكن التخلص منهMedisafeMS-10
مقصقابل
للتعقيم
القابل للتصرف معقمةMon& Tex3.307.08
محلول تعقيم بكحول70٪ كحول الأيزوبروبيل
محلول تعقيم ببيروكسيد6٪ بيروكسيد الهيدروجين
ماصة دقيقة ، 1 مل ، مع أطراف
15 مل أنابيب الطرد المركزيVWR international9278
1.7 مل أنابيب الطرد المركزيVWR PIER90410
عازلة8 M اليوريا ، 2 M thiourea ، 4٪ وزن / حجم CHAPS ، 20 ملي تريزما ، 55 ملي ديثيوتريتول
اليورياسيجما ألدريتشU6504-1KGلاستخدامها في عازلة اليوريا
ThioureaSigma aldrichT8656لاستخدامها في عازلة اليوريا
CHAPSSigma aldrichC3023-5GRلاستخدامها في عازلة
اليورياDithiotreitolSigma aldrichD0632-5Gلاستخدامها في حقنة اليوريا العازلة
50 ملPICلاستخدامها لتصفية اليوريا عازلة
0.22 & micro; مرشحm MilliporeSLGP033RBلاستخدامه لتصفية اليوريا العازلة
PFTE مدقة ، 2 ملKartell6302جزء من خالط Potter-Elvehjem
ملاط زجاجي البورسليكاتKartell6102جزء من Potter-Elvehjem
homogenizer StirrerVELP scientificaStirrer DLHلاستخدامها في التجانس بواسطة Potter-Elvehjem
فحص البروتين برادفوردمختبرات Bio-Rad5000006
أنبوب دوارPbi InternationalF205
رقائق
الألومنيوم النيتروجين
صندوق البوليسترين
للطرد المركزي لأنابيب الطرد المركزي سعة 1.7 مل عند 13,000 × جم
فريزر -80 درجة ؛ C
الدقة
التوازن الأوتوكلافللتعقيم
قفازات التبريد للنيتروجين
قفازات
التهوية القسرية المهنية وفرنللهواء الطبيعي للتعقيم
كوكتيل مثبط البروتيازSigma aldrichP8340-5ML100X محلول
ProteoExtract طقم ترسيب البروتينCalbiochem539180
RapiGestWaters186001861
Cytoscapewww.cytoscape.org الإصدار 2.7منصة برمجية لتحليل الأنطولوجيا الجينية
BiNGOhttp://apps.cytoscape.org/apps/bingoالإصدار 3.0.3البرنامج المساعد لتحليل الأنطولوجيا الجينية
AlphaB Crystallin / CRYAB الأجسام المضادةNovus BiologicalsNBP1-97494الجسم المضاد أحادي النسيلة للفأر ضد CryAB
Septin-11 الجسم المضادNovus BiologicalsNBP1-83824الجسم المضاد متعدد النسيلة للأرانب ضد septin-11
FHL1 الجسم المضادNovus BiologicalsNBP-188745الأرانب الأجسام المضادة متعددة النسيلة ضد FHL-1
Dermatopontin الأجسام المضادةNovus BiologicalsNB110-68135أجسام مضادة متعددة النسيلة للأرانب ضد dermatopontin
الماعز المضاد للفأر IgG HRPSigma aldrichA4416-0.5MLجسم مضاد ثانوي للنشاف المناعي
مختبرات الماعز المضادة للأرانب IgG HRPBio-Rad170-5046الجسم المضاد الثانوي للنشاف المناعي
ملحي من الفولاذ المقاوم للصدأمن الفولاذ المقاوم للصدأ من الفولاذ المقاوم للصدأ للتعقيم قابل الأيزوبروبيل الهيدروجين الدولي اليوريا السائل الثلجي جهاز طرد مركزي للثلج الجافالسائل الحمل الحراري

المراجع

  1. Vogel, C., Marcotte, E. M. Insights into the regulation of protein abundance from proteomic and transcriptomic analyses. Nat Rev Genet. 13 (4), 227-232 (2012).
  2. de Sousa Abreu, R., Penalva, L. O., Marcotte, E. M., Vogel, C. Global signatures of protein and mRNA expressio....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

إعادة الطباعة والأذونات

الوسوم

استخلاص البروتينالتحليل البروتينيمنظم اليورياالطحن بالنيتروجين السائلمقايسة برادفوردالفصل الكهربائي ثنائي الأبعادمطيافية الكتلة الكروماتوغرافية السائلةتحليل الوجود الجينيأمراض صمامات القلب