تكوين البروتين من صمام الصمام التاجي البشري لا يزال غير معروف جزئيا، لأن تحليله معقد من قبل الخلوية منخفضة، وبالتالي من خلال انخفاض البروتين الحيوي. هذا العمل يوفر بروتوكول لاستخراج البروتين بكفاءة لتحليل بروتيوم صمام الصمام التاجي.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
مقالة منهجية
تكوين البروتين من صمام الصمام التاجي البشري لا يزال غير معروف جزئيا، لأن تحليله معقد من قبل الخلوية منخفضة، وبالتالي من خلال انخفاض البروتين الحيوي. هذا العمل يوفر بروتوكول لاستخراج البروتين بكفاءة لتحليل بروتيوم صمام الصمام التاجي.
تحليل بروتيوم الخلوية يمكن أن تساعد على توضيح الآليات الجزيئية الكامنة الأمراض بسبب تطوير التكنولوجيات التي تسمح على نطاق واسع تحديد وكمية من البروتينات الموجودة في النظم البيولوجية المعقدة.المعرفة المكتسبة من نهج البروتين يمكن أن تؤدي إلى فهم أفضل للآليات المسببة للأمراض الكامنة وراء الأمراض، والسماح لتحديد علامات التشخيص والتشخيص الرواية جديدة، ونأمل، من الأهداف العلاجية. ومع ذلك، فإن الصمام التاجي القلب يمثل عينة صعبة للغاية لتحليل البروتين بسبب انخفاض الخلوية في بروتيوغليكان والمصفوفة خارج الخلية المخصب الكولاجين. وهذا يجعل من الصعب استخراج البروتينات لتحليل البروتين العالمي. يصف هذا العمل بروتوكول متوافق مع تحليل البروتين لاحق، مثل البروتينات الكمية و إمونوبلوتينغ. وهذا يمكن أن يسمح للارتباط البيانات قلقز التعبير البروتين مع البيانات على التعبير الكمي مرنا وغير الكمي تحليل المناعية. في الواقع، هذه النهج، عندما يؤديها معا، سيؤدي إلى فهم أكثر شمولا للآليات الجزيئية الكامنة وراء الأمراض، من مرنا إلى ما بعد متعدية تعديل البروتين. وهكذا، يمكن لهذه الطريقة تكون ذات صلة للباحثين المهتمين في دراسة أمراض القلب صمام فيسيوباثولوغي.
وقد غيرت الأدلة الأخيرة فهم أدوار الآليات التنظيمية العديدة التي تحدث بعد التوليف مرنا. في الواقع، عمليات متعدية، ما بعد النسخي، وعمليات بروتين يمكن أن تنظم بروتين وفرة وظيفة. العقيدة - التي تقول أن تركيزات مرنا هي بروكسيات لتلك التي من البروتينات المقابلة، على افتراض أن مستويات النص هي المحدد الرئيسي للوفرة البروتين - وقد تم تنقيح جزئي. في المقام الأول، ومستويات النص تتنبأ جزئيا فقط وفرة البروتين، مما يشير إلى أن أحداث ما بعد النسخي تحدث لتنظيم البروتينات داخل الخلايا 1 ، 2 .
وعلاوة على ذلك، والبروتين....
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
في هذا البروتوكول، يتم جمع قلوب الإنسان خلال إكسبلانتاتيون متعدد الأجسام (وقت نقص التروية الباردة من 4-12 ساعة، يعني 6 ± 2 ح) من الجهات المانحة متعددة الأعضاء استبعادها من زرع الأعضاء لأسباب تقنية أو وظيفية، على الرغم من المعلمات مخطط صدى القلب العادي. يتم إرسالها إلى بنك الأنسجة القلبية الوعائية في ميلانو، مركز مونزينو كارديولوجيك (ميلان، إيطاليا) لمصارف الصمامات الأبهري والرئوي. لا تستخدم المنشورات الخلفية التاجية للأغراض السريرية، لذلك يتم جمعها خلال عزل الصمام الأبهري والرئوي بعد الحصول على موافقة مستنيرة من أقارب المانحين. يتم جمع الأنسجة لزرع والبحوث إلا بعد موافقة الوالدين. على ورقة الموافقة، فإنهم يأذنون (أو لا) استخدام....
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
استخراج و حل البروتينات في العازلة اليوريا هو متوافق مباشرة مع الأساليب البروتينية على أساس إزلكتروفوكوسينغ (ثنائي الأبعاد الكهربائي (2-دي) 11 والتركيز السائل تركيز كهروضوئية (إيف) 12 ) مع إمونوبلوتينغ بعد التخفيف في العازلة ليملي 13 تحتوي على كوكتيل البروتيني مثبط 14 .
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
خطوة واحدة حاسمة من هذا البروتوكول هو استخدام النيتروجين السائل لتجميد العينة والبرد نظام طاحونة. إن استخدام النيتروجين السائل يمنع التدهور البيولوجي ويسمح بالمسحوق الفعال، ولكنه يتطلب تدريبا خاصا للتعامل الآمن.
في هذا البروتوكول يتميز نظام طاحونة لعينة طحن لأن عينات صغيرة من الصعب استرداد من هاون القياسية والمدقات. في هذه الحالة، عينات صغيرة تنتشر على شكل مسحوق ناعم على سطح الهاون، مما يجعل جمع الصعب. ميزة أخرى .......
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
الكتاب ليس لديهم ما يكشف.
وقد دعمت وزارة الصحة الإيطالية هذه الدراسة (أرسي 2013-بيو 15). نشكر باربرا ميشيلي لمساعدتها التقنية الممتازة.
....الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| محلول | 0.9٪ كلوريد الصوديوم | ||
| Eurocollins A | SALF | 30874046 | وسط نقل العضو المتوازن. امزج 400 مل من Eurocollins A مع 100 مل Eurocollins B للحصول على متوسط متوازن Eurocollins |
| Eurocollins B | SALF | 30874022 | وسيط نقل العضو المتوازن. اجمع بين 400 مل من Eurocollins A مع 100 مل Eurocollins B للحصول على عمر Eurocollins متوسط متوازن من Eurocollins |
| Wisconsin | Bridge | RM / N 4081 | متوسط نقل الأعضاء المتوازن هواء |
| التدفق الرأسي | Biohazard Burdinola | Class A تصنيف GMP Dewar | |
| Flask | Thermo Scientific | Nalgene 4150-1000 | |
| نظام المطحنة بالتبريد | OPS التشخيص | CG 08-01 | نظام مطحنة يحتوي على ملاط ومدقات ومفك براغي |
| ملقط | |||
| ملعقة | |||
| مشرط معقم يمكن التخلص منه | Medisafe | MS-10 | |
| مقص | قابل | ||
| للتعقيم | |||
| القابل للتصرف معقمة | Mon& Tex | 3.307.08 | |
| محلول تعقيم بكحول | 70٪ كحول الأيزوبروبيل | ||
| محلول تعقيم ببيروكسيد | 6٪ بيروكسيد الهيدروجين | ||
| ماصة دقيقة ، 1 مل ، مع أطراف | |||
| 15 مل أنابيب الطرد المركزي | VWR international | 9278 | |
| 1.7 مل أنابيب الطرد المركزي | VWR PIER90410 | ||
| عازلة | 8 M اليوريا ، 2 M thiourea ، 4٪ وزن / حجم CHAPS ، 20 ملي تريزما ، 55 ملي ديثيوتريتول | ||
| اليوريا | سيجما ألدريتش | U6504-1KG | لاستخدامها في عازلة اليوريا |
| Thiourea | Sigma aldrich | T8656 | لاستخدامها في عازلة اليوريا |
| CHAPS | Sigma aldrich | C3023-5GR | لاستخدامها في عازلة |
| اليورياDithiotreitol | Sigma aldrich | D0632-5G | لاستخدامها في حقنة اليوريا العازلة |
| 50 مل | PIC | لاستخدامها لتصفية اليوريا عازلة | |
| 0.22 & micro; مرشح | m Millipore | SLGP033RB | لاستخدامه لتصفية اليوريا العازلة |
| PFTE مدقة ، 2 مل | Kartell | 6302 | جزء من خالط Potter-Elvehjem |
| ملاط زجاجي البورسليكات | Kartell | 6102 | جزء من Potter-Elvehjem |
| homogenizer Stirrer | VELP scientifica | Stirrer DLH | لاستخدامها في التجانس بواسطة Potter-Elvehjem |
| فحص البروتين برادفورد | مختبرات Bio-Rad | 5000006 | |
| أنبوب دوار | Pbi International | F205 | |
| رقائق | |||
| الألومنيوم النيتروجين | |||
| صندوق البوليسترين | |||
| للطرد المركزي لأنابيب الطرد المركزي سعة 1.7 مل عند 13,000 × جم | |||
| فريزر -80 درجة ؛ C | |||
| الدقة | |||
| التوازن الأوتوكلاف | للتعقيم | ||
| قفازات التبريد للنيتروجين | |||
| قفازات | |||
| التهوية القسرية المهنية وفرن | للهواء الطبيعي للتعقيم | ||
| كوكتيل مثبط البروتياز | Sigma aldrich | P8340-5ML | 100X محلول |
| ProteoExtract طقم ترسيب البروتين | Calbiochem | 539180 | |
| RapiGest | Waters | 186001861 | |
| Cytoscape | www.cytoscape.org الإصدار 2.7 | منصة برمجية لتحليل الأنطولوجيا الجينية | |
| BiNGO | http://apps.cytoscape.org/apps/bingo | الإصدار 3.0.3 | البرنامج المساعد لتحليل الأنطولوجيا الجينية |
| AlphaB Crystallin / CRYAB الأجسام المضادة | Novus Biologicals | NBP1-97494 | الجسم المضاد أحادي النسيلة للفأر ضد CryAB |
| Septin-11 الجسم المضاد | Novus Biologicals | NBP1-83824 | الجسم المضاد متعدد النسيلة للأرانب ضد septin-11 |
| FHL1 الجسم المضاد | Novus Biologicals | NBP-188745 | الأرانب الأجسام المضادة متعددة النسيلة ضد FHL-1 |
| Dermatopontin الأجسام المضادة | Novus Biologicals | NB110-68135 | أجسام مضادة متعددة النسيلة للأرانب ضد dermatopontin |
| الماعز المضاد للفأر IgG HRP | Sigma aldrich | A4416-0.5ML | جسم مضاد ثانوي للنشاف المناعي |
| مختبرات الماعز المضادة للأرانب IgG HRP | Bio-Rad | 170-5046 | الجسم المضاد الثانوي للنشاف المناعي |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.