هنا، نقدم بروتوكول لعزل إندوسيمبيونتس من الذبابة البيضاء بيميسيا تاباسي من خلال تشريح والترشيح. بعد التضخيم، عينات الحمض النووي هي مناسبة لتسلسل لاحق ودراسة التبادلية بين إندوسيمبيونتس والذبابة البيضاء.
مقالة منهجية
هنا، نقدم بروتوكول لعزل إندوسيمبيونتس من الذبابة البيضاء بيميسيا تاباسي من خلال تشريح والترشيح. بعد التضخيم، عينات الحمض النووي هي مناسبة لتسلسل لاحق ودراسة التبادلية بين إندوسيمبيونتس والذبابة البيضاء.
تشكل الارتباطات البكتيرية علاقة حميمة مع مضيفيها وتقدم مزايا للمضيفين في معظم الحالات. المعلومات الجينومية أمر بالغ الأهمية لدراسة وظائف وتطور سيمبيونتس البكتيريا في مضيفهم. كما لا يمكن استزراع معظم التعاطف في المختبر ، وأساليب لعزل كمية كافية من البكتيريا لتسلسل الجينوم هي مهمة جدا. في الذبابة البيضاء بيميسيا تاباسي، تم تحديد عدد من إندوسيمبيونتس ويتوقع أن تكون ذات أهمية في تطوير وتكاثر الآفات من خلال نهج متعددة. ومع ذلك، فإن الآلية التي تقوم عليها الجمعيات لا تزال غير معروفة إلى حد كبير. والعقبة تأتي جزئيا من حقيقة أن إندوسيمبيونتس في الذبابة البيضاء، ومعظمهم من ضبط النفس في البكتيريا، من الصعب فصل من الخلايا المضيفة. نحن هنا تقرير بروتوكول خطوة بخطوة لتحديد واستخراج وتنقية إندوسيمبيونتس من الذبابة البيضاء B. تاباسي أساسا عن طريق تشريحعلى والترشيح. عينات إندوسيمبيونت أعدت من قبل هذه الطريقة، على الرغم من أن لا يزال خليط من الأنواع إندوسيمبيونت مختلفة، هي مناسبة لتسلسل الجينوم لاحق وتحليل الأدوار المحتملة لل إندوسيمبيونتس في B. تاباسي. ويمكن أيضا أن تستخدم هذه الطريقة لعزل إندوسيمبيونتس من الحشرات الأخرى.
البكتيريا التي تشكل علاقة تكافلية حميمة مع المضيفين النسبية منتشرة على نطاق واسع في المفصليات 1 . وقد ثبت أن إندوسيمبيونتس تؤثر على جوانب المضيفين، مثل استقلاب التغذية، والاستنساخ، والاستجابات للضغوط البيئية 2 ، 3 ، 4 وما إلى ذلك ، في كل مرحلة تنموية تقريبا 5 . ومع ذلك، فإن الآلية التي تقوم عليها الجمعيات لا تزال غير معروفة إلى حد كبير. علم الجينوم هو من الأولوية والأهمية عند دراسة الوظائف والأدوار المحتملة للبكتيريا. ويمكن الاستدلال على بعض المعلومات الأساسية، أي الحالة التصنيفية، والجينات الوظيفية، ومسارات الأيض، ونظم الإفراز، من تسلسل الجينوم، الذي يلقي الضوء على الأدوار المحتملة للروابط في التعايش. مع تطور تسلسل الإنتاجية العالية، وقد تم تسلسل عدد كبير من الجينومات البكتيرية ثإيث وظائف متنوعة كشفت 6 .
إندوسيمبيونتس هي ذات أهمية حيوية في هيميبتيرانز، مثل المن 7 ، البق 8 ، بسيلدس 9 ، بلانثوبرز البني 10 و السيكادا 11 . على سبيل المثال، وقد أثبتت بوكنيرا في المن، باعتبارها التعاطف الملزم، للمشاركة في الحيوي الحيوي الأحماض الأمينية، جنبا إلى جنب مع الجينات من الجينوم المن 12 . وعلاوة على ذلك، يتم الكشف عن تنظيم النسخي بوكنيرا أيضا 13 . في بسيلديس ، كارسونيلا هو تسلسل وتصنيف أصغر الجينوم البكتيري وجدت من أي وقت مضى 14 . وتستند كل هذه السمات المميزة لل إندوسيمبيونتس وتستدل من تسلسل الجينوم. لأن هذه إندوسيمبيونتس لا يمكن أن تكون مثقف في المختبر ، وقد طبقت عدة نهج لعزل البكتيريا الكافية لمقترضةuencing. في المن، يتم استخراج إندوسيمبيونتس من خلال الطرد المركزي والترشيح، وتخضع لمزيد من التحليل الجيني و ترانسكريبتوميك 5 . في بنهوبرز البني، يتم تسلسل إندوسيمبيونتس جنبا إلى جنب مع الجينوم الحشرة كلها 10 .
الذبابة البيضاء B. تاباسي هو مجمع الأنواع التي تحتوي على أكثر من 35 الأنواع المورفولوجية التي لا يمكن تمييزها (الأنواع الخفية)، من بينها، غزو نوعين الغازية في جميع أنحاء العالم وتسبب ضررا هائلا للإنتاج الزراعي 15 . وتجدر الإشارة إلى أن إندوسيمبيونتس ضمن الأنواع B. تاباسي أظهرت أهمية في تطوير الآفات 16 . حتى الآن، تم تحديد ثمانية إندوسيمبيونتس في الذبابة البيضاء، بما في ذلك التعاطف الملزم، كانديداتوس بورتيرا أيروديداروم، وسبعة تعاطف ثانوي هاميلتونيلا ، ريكيتسيا ، أرسينوفونوس ، كاردينيم ، < إم> ولباشيا، فريتشيا و هيميبتيريفيلوس المعرفة 17 ، 18 .
على عكس هيميبتيرانز وصفها سابقا، الذبابة البيضاء B. تاباسي هو حشرة صغيرة للغاية فقط 1 ملم في الطول. تقتصر معظم إندوسيمبيونتس إلى البكتيريا 19 (الخلايا المتخصصة التي تحتوي على سيمبيونتس، التي تشكل كذلك البكتيريا في B. تاباسي). وبالإضافة إلى ذلك، هذه إندوسيمبيونتس لا يمكن أن تكون مثقف في المختبر . الطريقة الوحيدة للحصول على إندوسيمبيونتس من B. تاباسي هو تشريح البكتيريا خارج. ومع ذلك، هناك صعوبة في تشريح. أولا، البكتيريا الهشة ترتبط دائما مع أنسجة أخرى من الذبابة البيضاء، والتي من الصعب فصل. ثانيا، حجم صغير من الذبابة البيضاء يحد من عزل ما يكفي من البكتيريا. ثالثا، إندوسيمبيونتس الكتلة في البكتيريا، مما يجعل من تعقيد للغاية للحصول على نوع واحد من البكتيريا.
أس = "jove_content"> هنا، نحن الإبلاغ عن بروتوكول بسيط وغير مكلف لعزل إندوسيمبيونتس الذبابة البيضاء لتسلسل ميتاجينوم لاحق. من خلال التشريح، والتنقية والتضخيم، ويمكن الحصول على الحمض النووي كافية إندوسيمبيونت ويمكن تأكيد أنواع البكتيريا. بروتوكول وصفها يمكن استخدامها على نحو مماثل في المفصليات الأخرى.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
1. الذبابة البيضاء وتربية الأنواع الخفي
2. إندوسيمبيونت تحديد والتعريب
3. انتقال المجهر الإلكتروني (تيم)
4. الذبابة البيضاء بكتيريوم تشريح وتنقية
5. التضخيم من جينوميس إندوسيمبيونت
6. إندوسيمبيونت ميتاجينوم التسلسل
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
وقد أخذت أنواع الشرق الأوسط آسيا الصغرى 1 (MEAM1) من مجمع B. تاباسي كمثال هنا للتوصيف. ويظهر الشكل رقم 1 قطن لتربية ويتفليز وعدة مراحل تنموية للبيض الأبيض، بما في ذلك نبات القطن والذبابة البيضاء للكبار وحوريات الذبابة البيضاء الأولى والثانية والرابعة (تبدو الحورية الثالثة المستقيمة مشابهة للحوري الرابع من الحورية ). كان من الواضح أن الحورية 4th إنستار هو أكبر من الحو...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
نظرا لأنه لا يمكن استزراع التعايش الداخلي داخل الذباب الأبيض في المختبر ، فإن تشريح وتجميع الخلايا الجراثيمية هو طريقة فعالة للحصول على مادة وراثية كافية من التعايش الداخلي. قبل التشريح ، يجب تأكيد أنواع الذبابة البيضاء والتعايش الداخلي المعني. الذبابة البيضاء B. tabaci هي مجموعة من الأنواع بها أكثر من 35 نوعا لا يمكن تمييزها شكليا وقد تحتوي الأنواع الخفية المختلفة على تعايش داخلي مختلف. يتم إيواء بورتيرا بشكل موحد باعتباره متعايشا إلزاميا22 ، ويختلف المتعايشون الثانويون...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
الكتاب ليس لديهم ما يكشف.
وقدم الدعم المالي لهذه الدراسة من قبل البرنامج الوطني للبحوث والتنمية الرئيسية (2016YFC1200601) والمؤسسة الوطنية للعلوم الطبيعية في الصين (31390421).
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| Taq< / em> بوليميراز الحمض النووي | Takara | R001A | بما في ذلك rTaq ، 10 & مرات ؛ مجموعة استخراج الحمض النووي للجل العازلة و dNTP |
| Qiagen | 28704 | ||
| نظام تسلسل عينة الحمض | النووي ABI | ABI-3730XL | |
| Microtome | Leica | EM UC7 | |
| المجهر الإلكتروني لنقل | هيتاشي | H-7650 TEM | |
| مجهر ستيريو | Zeiss | Stemi 2000-C | |
| 20 & mu ؛ L microloader | Eppendorf | F2771951 | |
| حامل الفلتر | Millipore | SX0001300 | |
| مرشح غشاء | Millipore | SMWP001300 | 5.0 & m SMWP |
| REPLI-g مجموعة صغيرة فائقة السرعة | Qiagen | 150033 | طقم تضخيم الحمض النووي |
| NanoDrop | Thermo Scientific | NanoDrop 2000 | |
| كيوبت مقياس الفلور | الحراري فيشر العلمي | Q33216 | |
| جهاز تسلسل الجينوم | Illumina | Hiseq 2000 |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن