تصف هذه الورقة رنا مفصلة وفعالة للغاية في بروتوكول التهجين الموضعي وخاصة بالنسبة لمستوى منخفض الجينات مستقبلات رائحة، فضلا عن الجينات الأخرى، في هوائيات الحشرات باستخدام ديجوكسيجينين (ديغ) - الملصقة أو تحقيقات المسمى البيوتين.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
مقالة منهجية
تصف هذه الورقة رنا مفصلة وفعالة للغاية في بروتوكول التهجين الموضعي وخاصة بالنسبة لمستوى منخفض الجينات مستقبلات رائحة، فضلا عن الجينات الأخرى، في هوائيات الحشرات باستخدام ديجوكسيجينين (ديغ) - الملصقة أو تحقيقات المسمى البيوتين.
وقد طورت الحشرات أنظمة استقبال شمية متطورة لتشعر بإشارات كيميائية خارجية. يتم ترانزدوسد هذه الإشارات الكيميائية من قبل الخلايا العصبية مستقبلات الشمية (أورنز) الموجود في هياكل تشبه الشعر، ودعا تشيموسنسيلا، من الهوائيات. على الأغشية أورنس، ويعتقد أن مستقبلات أودورانت (أورس) أن تشارك في ترميز الرائحة. وبالتالي، فإن القدرة على تحديد الجينات المترجمة إلى أورن ضروري للاعتراف أو الجينات، ويوفر أساسا أساسيا لمزيد من الدراسات الوظيفية في الموقع . مستويات التعبير الحمض النووي الريبي من أور أور محددة في هوائيات الحشرات منخفضة جدا، والحفاظ على الأنسجة الحشرية للأنسجة هو التحدي. وبالتالي، فإنه من الصعب توطين أور إلى نوع معين من سنسيلا باستخدام الحمض النووي الريبي في التهجين الموضع . في هذه الورقة، يتم عرض رنا مفصلة وفعالة للغاية في بروتوكول التهجين الموضعي وخاصة بالنسبة منخفضة التعبير أو الجينات من الحشرات. بالإضافة إلى ذلك، أور محددة جين واs التي تم تحديدها عن طريق إجراء مزدوجة اللون الفلورسنت في الموقع التهجين التجارب باستخدام المشترك التعبير عن الجينات مستقبلات، أوركو ، كعلامة.
يتم تغطية هوائيات الحشرات، والتي هي أهم الأجهزة الحسية الكيميائية، مع العديد من الهياكل تشبه الشعر - دعا سنسيلا - التي يتم إدارتها من قبل الخلايا العصبية مستقبلات الشمية (أورنس). على غشاء أورنس الحشرات، يتم التعبير عن مستقبلات أودورانت (أورس)، وهو نوع من البروتين يحتوي على سبعة مجالات الغشاء، مع كورسيبتور (أوركو) لتشكيل هيتيرومر الذي يعمل كقناة أيون الرائحة بوابات 1 ، 2 ، 3 . استجابات مختلفة تستجيب لمجموعات مختلفة من المركبات الكيميائية 4 ، 5 ، 6 .
الجراد ( لوكستا ميغراتوريا ) تعتمد أساسا على العظة حاسة الشم لتحريك السلوكيات الهامة 7 . الجراد الصحراوي الجراد هي العوامل الرئيسية لفهم آليات الشمية الجزيئية. إضفاء الطابع المحلي على الجينات أو الجينات المحددة على الخلايا العصبيةنوع سينسيلوم محددة شكليا من قبل الحمض النووي الريبي في الموقع التهجين (رنا إيش) هو الخطوة الأولى في استكشاف وظيفة أورس.
يستخدم رنا إيش التحقيق المسمى الحمض النووي الريبي التكميلي لقياس وتوطين تسلسل الحمض النووي الريبي معين في قسم من الأنسجة والخلايا أو يتصاعد كله في الموقع ، وتوفير رؤى في العمليات الفسيولوجية والمرض المرضية. وقد استخدمت على نطاق واسع ديغوكيجينين المسمى (ديغ المسمى) وتحقيقات رنا البيوتين المسمى على نطاق واسع في التهجين الحمض النووي الريبي. يمكن إعداد رنا وضع العلامات مع ديغوكيجينين-11-أوتب أو البيوتين 16-أوتب عن طريق النسخ في المختبر مع SP6 و T7 رنا بوليميراز. DIG- والبيوتين المسمى الحمض النووي الريبي تحقيقات لها المزايا التالية: غير المشعة. آمنة؛ مستقرة. حساس للغاية؛ محددة للغاية؛ وسهلة لإنتاج باستخدام ير والنسخ في المختبر . DIG- وبيوتين المسمى رنا تحقيقات يمكن أن يكون الكروموجيني وكشف فلورزنتلي. يمكن الكشف عن تحقيقات رنا المسمى ديغ مع مكافحة ديغوكيجينين القلوين فوسفاتيز (أب) الأجسام المضادة -conjugated التي يمكن تصور إما مع ركائز تشيميلومينسنت حساسة للغاية نيتروبلو كلوريد تيترازوليوم / 5 برومو 4-كلورو 3-إندوليل الفوسفات الملح التولودين (نبت / بسيب) باستخدام المجهر الضوئي أو مع 2 -hydroxy-3-نفتوك أسيد-2'-فنيلانيليد الفوسفات (هنب) إلى جانب 4-كلورو-2-ميثيل بنزينزيونيوم نصف كلوريد الزنك الملح (سريع الأحمر) باستخدام المجهر متحد البؤر. يمكن الكشف عن تحقيقات رنا البيوتين المسمى مع مكافحة البيوتين ستريبتافيدين الفجل الحصان البيروكسيديز (هرب) الأجسام المضادة -conjugated التي يمكن تصور مع فلوريسئين-تيراميدس باستخدام المجهر متحد البؤر. وهكذا، يمكن أن يؤديها ثنائي اللون الفلورسنت في التهجين الموضعي للكشف عن اثنين من الجينات المستهدفة في شريحة واحدة باستخدام DIG- والبيوتين المسمى الحمض النووي الريبي تحقيقات.
وقد استخدمت إيش رنا مع DIG- و / أو تحقيقات البيوتين المسمى بنجاح لتوطين الجينات ذات الصلة حاسة الشم، مثل أور ، مستقبلات المؤلمة، بروتين ملزمة الرائحةوبروتين غشاء الخلايا العصبية الحسية، في هوائيات الحشرات، ولكن ليس على سبيل الحصر، ذبابة الفاكهة ميلانوغاستر ، الأنوفيلة غامبيا ، L. ميغراتوريا والجراد الصحراوي ششيستوسيرا غريغاريا 8 ، 9 ، 10 ، 11 ، 12 ، 13 ، 14 ، 15 ، 16 . ومع ذلك، هناك اثنين من التحديات الكبيرة عند تنفيذ إيش الحمض النووي الريبي ل أورس الحشرات: (1) أو الجينات (باستثناء أوركو ) وأعرب عن مستويات منخفضة وفقط في عدد قليل من الخلايا، مما يجعل الكشف عن إشارة صعبة للغاية، و (2) الحفاظ على الأنسجة الحشرات ل الأنسجة، بحيث يتم الحفاظ على التشكل والضجيج الخلفية منخفضة، يمكن أن يكون تحديا. في هذا البحث ورقة مفصلة وفعالة تصف إيش الحمض النووي الريبي لتوطين أو الجينات في الحشراتيتم عرض هوائيات، بما في ذلك كل من كروموجينيك وتيراميد إشارة التضخيم (تسا) الكشف.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ملاحظة: للحد من تدهور الحمض النووي الريبي، وإعداد الحلول باستخدام الماء المقطر تعقيمها الرطبة (عند 121 درجة مئوية لمدة 60 دقيقة) وأيضا مواد الأوتوكلاف الرطب.
1. إعداد الحمض النووي الريبي إيش التحسس والمسببات تحسس
2. إعداد أقسام البرد
3. تحديد الأقسام
4. التهجين
5. تلطيخ
6 - الملاحظة
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
مع الكشف الكروموجيني، تم تعيين مجموعة فرعية صغيرة من خلايا أنتينال في كل قسم أنتينال الكبار من قبل LmigOR1 ديغ المسمى و LmigOR2 تحقيقات مضادات ( الشكل 3 ). رنا إيش على أقسام متتالية لتوطين LmigOR1 و LmigOR2 أظهرت أن خلايا أنتينال معربا عن الجينتين كانت موجودة في مجموعات أورن معربا عن لميغوركو ، مشيرا إلى أن LmigOR1 المفترض و LmigOR2
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
من الصعب إجراء رنا إيش لتوطين أو جينات في هوائيات الحشرات لأن مستويات التعبير من الجينات أور، باستثناء أوركو ، منخفضة جدا والحفاظ على شرائح نسيجية من هوائيات الحشرات من الصعب جدا. وبالإضافة إلى ذلك، كشف تسا هو أيضا صعبة جدا. ولمعالجة هذه المشاكل، ينبغي اتخاذ التدابير التالية. يتم اختيار الهوائيات من الجراد البالغين حديثا مولات التي لها أنتينال رقيقة وناعمة البشرة، التي تحافظ على مورفولوجيا على الشريحة. يتم تجميد العينات المجمدة في شرائح 12 ميكرون سميكة. وتستخدم حساسات حسا...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
المؤلفين ليس لديهم ما يكشف أو أي تضارب المصالح الأخرى.
ويدعم هذا العمل من منحة من مؤسسة العلوم الطبيعية الوطنية في الصين (No.31472037). إن ذكر الأسماء التجارية أو المنتجات التجارية في هذه المقالة هو فقط لغرض تقديم معلومات محددة ولا يعني التوصية.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| <قوي>المواد < / قوي > | |||
| 2 & مرات ؛ TSINGKETM< / sup> ماستر ميكس | TSINGKE ، الصين | TSE004 | |
| RNase خالية من H2< / sub>O | TIANGEN ، الصين | RT121-02 | |
| REGULAR AGAROSE G-10 | BIOWEST ، إسبانيا | 91622 | |
| المخزن المؤقت | TIANgel Midi ، TIANGEN ، الصين | DP209-02 | |
| مجموعة | تنقية التوازن TIANgel Midi ، TIANGEN، الصين | DP209-02 | |
| محلول غسيل | TIANgel Midi Purification Kit ، TIANGEN ، الصين | DP209-02 | |
| T Vector | Promega ، الولايات المتحدة الأمريكية | A362A | |
| T4 DNA Ligase | Promega ، الولايات المتحدة الأمريكية | M180A | |
| الإشريكية القولونية < / م > DH5 & alpha ؛ | TIANGEN ، الصين | CB101 | |
| Ampicillin | Sigma ، الولايات المتحدة الأمريكية | A-6140 | |
| الأيزوبروبيل بيتا ؛ -D-1-thiogalactopyranoside | Inalco ، الولايات المتحدة الأمريكية | 1758-1400 | |
| 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-&beta ؛ -D-galactopyranoside | SBS Genetech ، الصين | GX1-500 | |
| Nco< / em> I | BioLabs ، نيو إنجلاند | R0193S | |
| Spe< / em> I | BioLabs ، نيو إنجلاند | R0133M | |
| Labeling Kit | روش ، سويسرا | 11175025910 | |
| مجموعة ملصقات الحمض النووي الريبي البيوتين | روش ، سويسرا | 11685597910 | |
| DNase | DIG RNA Labeling Kit ، روش ، سويسرا | 11175025910 | |
| LiCl | Sinopharm ، الصين | 10012718 | |
| الإيثانول | سينوفارم ، الصين | 10009257 | |
| حمض الخليك | شركة بكين للكيماويات ريجنتس ، الصين | 10000292 | |
| Tissue-Tek O.C.T. مركب | ساكورا فينيتيك أوروبا ، زويتيروود ، هولندا | 4583 | |
| شرائح TINA | JIN HAO YANG BIOLOGCAL MANUFACTURE CO. ، LTE ، الصين | FISH0010 | |
| HCl | Sinopharm ، الصين | 80070591 | |
| ميليكس | ميليبور ، الولايات المتحدة الأمريكية | SLGP033RS | |
| توين 20 | أمريسكو ، الولايات المتحدة الأمريكية | 0777-500 مل | |
| نيتروبلو تيترازوليوم كلوريد / 5-برومو -4-كلورو-3-إندوليل فوسفات ملح تولويدين | روش ، سويسرا | 11175041910 | |
| الجلسرين | سينوفارم ، الصين | 10010618 | |
| <قوي>الاسم< / قوي> | <قوي>الشركة | Catalog Number | Comments |
| Solutions | |||
| 1× تريس أسيتات-EDTA | سيجما ، الولايات المتحدة الأمريكية | V900483-1 كجم | 0.04 مول / لتر تريس بیس |
| 1 & مرات ؛ شركة Tris-acetate-EDTA | BEIJING CHEMICAL REGENTS COMPANY ، الصين | 10000292 | 0.12٪ حمض الأسيتيك |
| 1 & مرات ؛ Tris-acetate-EDTA | Sigma ، الولايات المتحدة الأمريكية | 03677 | ملح ثنائي الصوديوم حمض إيثيلين ديامين تترا أسيتيك (EDTA) |
| لوريا بيرتاني (LB) وسط سائل | سينوفارم ، الصين | 10019392 | 10 جم / لتر كلوريد الصوديوم |
| لوريا بيرتاني (LB) وسط سائل | MERCK ، ألمانيا | VM335231 | 10 جم / لتر بيبتون من الكازين (التربتون) |
| لوريا بيرتاني (LB) وسط سائل | MERCK ، ألمانيا | VM361526 | 5 جم / لتر مستخلص الخميرة |
| لوحة الركيزة الصلبة LB | سينوفارم ، الصين | 10019392 | 10 جم / لتر لوحة الركيزة الصلبة NaCl |
| LB | MERCK ، ألمانيا | VM335231 | 10 جم / لتر بيبتون من الكازين (التربتون) لوحة |
| الركيزة الصلبة LB | MERCK ، ألمانيا | VM361526 | 5 جم / لتر مستخلص الخميرة |
| LB لوحة الركيزة الصلبة | WISENT ING ، كندا | 800-010-CG | 15 جم / لتر Agar Bacteriological الصف |
| 10 وأقات. محلول ملحي مخزن بالفوسفات (PBS ، درجة الحموضة 7.1) | سينوفارم ، الصين | 10019392 | 8.5٪ كلوريد الصوديوم |
| 10 مرات ؛ محلول ملحي مخزن بالفوسفات (PBS ، درجة الحموضة 7.1) | سيجما ، الولايات المتحدة الأمريكية | V900041-500 جم | 14 ملي مولار KH2< / sub>PO4< / sub> |
| 10 & times; محلول ملحي مخزن بالفوسفات (PBS ، درجة الحموضة 7.1) | سيجما ، الولايات المتحدة الأمريكية | V900268-500 جم | 80 ملي مولار Na 2< / sub>HPO4< / sub> |
| 10 & times ؛ محلول ملحي مخزنة ثلاثي (TBS ، درجة الحموضة 7.5) | سيجما ، الولايات المتحدة الأمريكية | V900483-1 كجم | 1 م تريس بيس |
| 10 مرات ؛ محلول ملحي ثلاثي مخزن (TBS ، درجة الحموضة 7.5) | سينوفارم ، الصين | 10019392 | 1.5 M NaCl |
| Detection Buffer (DAP) ؛ الكشف عن اللونات درجة الحموضة 9.5 ؛ TSA الكشف عن درجة الحموضة 8.0 | سيجما ، الولايات المتحدة الأمريكية | V900483-1 كجم | 100 ملي مولار |
| المخزن المؤقت للكشف عن قاعدة Tris-Base (DAP) ؛ الكشف عن اللونات درجة الحموضة 9.5 ؛ كشف TSA درجة الحموضة 8.0 | سينوفارم ، الصين | 10019392 | 100 ملي مولار للكشف عن كلوريد الصوديوم |
| (DAP) ؛ الكشف عن اللونات درجة الحموضة 9.5 ؛ كشف TSA درجة الحموضة 8.0 | سيجما ، الولايات المتحدة الأمريكية | V900020-500G | 50 ملي MgCl 2< / sub> & middot ؛ 6H2O |
| 20 & مرات ؛ سترات الصوديوم المالحة (درجة الحموضة 7.0) | سينوفارم ، الصين | 10019392 | 3 M كلوريد الصوديوم |
| 20 مرة. سترات الصوديوم المالحة (درجة الحموضة 7.0) | سيجما ، الولايات المتحدة الأمريكية | V900095-500 جم | 0.3 م Na-Citrate |
| 4٪ محلول بارافورمالديهايد (PFA ، الرقم الهيدروجيني 9.5) | سيجما ، الولايات المتحدة الأمريكية | V900894-100 جم | 4٪ بارافورمالديهايد |
| كربونات الصوديوم العازلة | سيجما ، الولايات المتحدة الأمريكية | V900182-500 جم | 0.1 م NaHCO3< / sub> |
| كربونات الصوديوم العازلة (درجة الحموضة 10.2) | سيجما ، الولايات المتحدة الأمريكية | V900182-500 جم | 80 ملي مولار NaHCO3 |
| كربونات الصوديوم عازلة (درجة الحموضة 10.2) | سيجما ، الولايات المتحدة الأمريكية | S7795-500G | 120 ملي مولار Na 2< / sub>CO3< / sub> |
| محلول فورماميد (درجة الحموضة 10.2) | MPBIO ، الولايات المتحدة الأمريكية | FORMD002 | فورماميد منزوع الأيونات |
| (درجة الحموضة 10.2) | 5 & مرات ؛ عازلة حجب سترات الصوديوم المالحة | ||
| في TBS | Roche ، سويسرا | 11175041910 | 1٪ |
| Blow Blocking Buffer في TBS | AMRESCO ، USA | 0694-500ML | 0.03٪ Triton X-100 |
| Blocking Buffer in TBS | 1 & times; محلول | ||
| الفوسفاتيز القلوي | روش ، سويسرا | 11175041910 | 1.5 وحدة / مل مضاد للفوسفاتيز القلوي المضاد للجسم المضاد المترافق |
| محلول الفوسفاتيز | مانع العازلة في TBS | ||
| محلول الفوسفاتيز القلوي / الفجل الحصاني محلول بيروكسيداز | روش ، سويسرا | 11175041910 | 1.5 وحدة / مل مضاد للديجوكسيجينين الفوسفاتيز القلوي المترافق الجسم المضاد |
| الفوسفاتيز القلوي / محلول بيروكسيداز الفجل الحصان | مجموعة TSA ، بيركين إلمر ، الولايات المتحدة الأمريكية | NEL701A001KT | 1٪ مضاد للبيوتين ستربتافيدين فجل الحصان بيروكسيداز - الجسم المضاد المترافق |
| الفوسفاتيز القلوي / محلول | الحصان مانع المخزن المؤقت في TBS | ||
| Hybridization Buffer | MPBIO ، الولايات المتحدة | الأمريكية FORMD002 | تهجين فورماميد منزوع الأيونات بنسبة 50 |
| العازلة | 2 & مرات ؛ المخزن المؤقت للتهجين الملحي والصوديوم | ||
| سيجما ، الولايات المتحدة الأمريكية | D8906-50G | 10٪ كبريتات ديكستران | |
| التهجين العازلة | invitrogen ، الولايات المتحدة الأمريكية | AM7119 | 20 & micro ؛ جم / مل خميرة t-RNA |
| التهجين العازلة | سيجما ، الولايات المتحدة الأمريكية | D3159-10G | 0.2 مجم / مل الرنجة المنوية الحمض |
| النووي 2-هيدروكسي -3-حمض النفتويك -2'-فينيلانيليد فوسفات / 4-كلورو-2-ميثيل بنزينديازون هيمي كلوريد الزنك الركيزة الملح | روش ، سويسرا | 11758888001 | 1٪ 2-هيدروكسي -3-حمض النفتويك -2 '-فينيلانيليد فوسفات (10 مجم / مل) |
| 2-هيدروكسي -3-حمض النفتويك -2'-فينيلانيليد فوسفات / 4-كلورو-2-ميثيل بنزينديازون هيمي كلوريد الزنك ركيزة ملح | الركيزة روش ، سويسرا | 11758888001 | 1٪ 4-كلورو-2-ميثيل بنزينديازون ملح كلوريد الزنك (25 مجم / مل) |
| 2-هيدروكسي -3-حمض النفتويك -2 '-فينيلانيليد فوسفات / 4-كلورو-2-ميثيل بنزينديازون هيمي كلوريد الزنك ركيزة | ملح الكشف عن إشارة التيراميد العازلة | ||
| مجموعة الركيزة التضخيم | TSA ، Perkin Elmer ، الولايات المتحدة الأمريكية | NEL701A001KT | 2٪ فلورسين-تيراميد |
| التيراميد ركيزة تضخيم | TSA ، Perkin Elmer ، الولايات المتحدة الأمريكية | NEL701A001KT | تضخيم مخفف |
| <قوي>الاسم < / strong> | Company< / strong> | Catalog Number | Comments |
| <قوي> أداة < / قوي> | |||
| تجميد ميكروتوم | لايكا ، نوسلوخ ، ألمانيا | Jung CM300 | |
| الحراري العلمي ، الولايات المتحدة الأمريكية | NANODROP 2000 | ||
| مجهر بصري | أوليمبوس ، طوكيو ، اليابان | IX71مجهر | |
| متحد البؤر | أوليمبوس ، طوكيو ، اليابان | أوليمبوس BX45 مجهر |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.