كافة البروتوكولات أقرتها "اللجنة الأخلاقية بجامعة جنوب الطبية"-
1. تصميم "إنترون الاصطناعية"
ملاحظة: إنترون الاصطناعية المستخدمة في هذا العمل هي 65 bp في الطول، والتسلسل هو 5 '-جتاجاجتكجاتكجاكجكجتاكتاكتجتاككتكتكتتتتتتتتتجاتاتككتجكاج-3 '.
- مكان Hpa أنا قيد الموقع على طرفي إنترون الاصطناعية بحيث أن Hpa أنا الهضم يمكن الإفراج عن إنترون من البلازميدات (انظر الشكل 1 ألف)-
- مكان الاثنين Xba أنا تقييد مواقع في إنترون حتى أن Xba أنا الهضم يمكن استخدامها لإدراج تسلسل الرنا الصغيرة التعبير.
تأمر - التوليف الكيميائي لكامل طول تسلسل الحمض النووي من إنترون الاصطناعية من شركة تصنيع الحمض النووي. الاصطناعية الحمض النووي التي تم إنشاؤها من الاستنساخ في بلازميد قياسية pUC19.
ملاحظة: العناصر الأساسية من إنترون الاصطناعية تشمل عدة عناصر النوكليوتيدات توافق الآراء، بما في ذلك 5 ' المانحة لصق الموقع (DS) مع تسلسل جواجاجو، تسلسل مصانة فرع نقطة (BPS) مع تسلسل أواكواك، بولي-بيريميدين المسالك (PPT) مع UCUUC(U) تسلسل 10، و 3 '-يقبلون لصق الموقع (عليه السلام) مع تسلسل جواوككوجكاج ( الشكل 1 أ). اثنين Xba أنا أدخلت تقييد مواقع بين DS وبت في الثانية التي يمكن استخدامها لإدراج تسلسل التعبير الصغيرة-الجيش الملكي النيبالي. القدرة على لصق فعالية هذا إنترون الاصطناعي من خلايا الثدييات والبعوض قد أكد سابقا 14-
2. تصميم "الاصطناعية إينترونيك الصغيرة رنا التعبير كاسيت"
ملاحظة: overexpression أو ضربة قاضية لميرنا الذاتية، تم إدراج تسلسل ترميز ميرنا السلائف أو اسفنجة ميرنا بين DS وبت في الثانية. كمثال، اختير ميرنا سلائف ذاتية من عبد اللطيف-البوبيكتوس 7-العال-اسمحوا لبناء ناقلات الأمراض الفيروسية المؤتلف overexpression ميرنا وضربه قاضية. وقد صمم الأسفنج المضادة بعد 7 ليت وفقا للأساليب الموصوفة سابقا 15. نهدم الجينات المستهدفة في يرقات، قمنا بتصميم محددة ميرنا الاصطناعية (أميرنا) أو دبوس الشعر القصير تسلسل الحمض النووي الريبي (شرنا) باستخدام البرمجيات على الإنترنت 16 ، 17؛ كمثال، وحدة فرعية الخامس-ATPase مرناً (لا الانضمام. واختير AY864912) جينات مستهدفة في هذه الدراسة. أميرنا وسوف يشار إليها باسم أميفتب الآخرة. جميع تفاصيل تسلسل من قبل ميرنا والإسفنج، أميرنا، وشرنا موصوفة في تكميلية الجدول 1-
- تأمر التوليف الكيميائي تسلسلات كدنا طول ميرناس السلائف والإسفنج ميرنا، وشرنا مع Xba أنا مواقع التقييد على طرفي من مصنع الحامض النووي.
- بعد تلقي أمر الحمض النووي، تدور هذه الأنابيب التي تحتوي على كتل الحمض النووي في العاشر 10,000-14,000 ز لمدة 1 دقيقة لضمان كافة المجففة الحمض النووي في الجزء السفلي من الأنبوب.
- ريسوسبيند الحمض النووي المجففة في المياه خالية من الدناز لتحقيق تركيز نهائي 10 نانوغرام/ميليلتر.
والخلاصة - العمود الفقري بلازميد الحمض النووي تسلسل مع Xba أنا في 37 درجة مئوية ح 1، وثم ديفوسفوريلاتي في 5 ' ينتهي من العمود الفقري بلازميد خطية مع العجل الفوسفاتيز القلوية المعوية (سياب) وفقا للشركة المصنعة ' بروتوكول s .
- "إلغاء تنشيط سياب" بتدفئة لمدة 60 دقيقة في 65 ° C.
- تشغيل 1.0% [اغروس] هلام وقص العمود الفقري خطية. ثم استخراج الحمض النووي من جل شريحة باستخدام مجموعة أدوات استخراج جل عقب الشركة المصنعة ' تعليمات s-
- ليجاتي بلغة الحمض النووي إلى ليجاسى T4 الحمض النووي باكبونيبي (يو 5/ميليلتر) عند 22 درجة مئوية حاء – 1
- تحويل المنتجات من رد فعل ربط من الخلايا خطوة 2.7 إلى المختصة الإشريكيّة القولونية (كولاي) وطبق على طبق أجار ليسوجيني مرق (رطل) التي تتضمن الأمبيسلّين (بتركيز 100 ميكروغرام/مل).
سلالة
- إجراء التحويل من خلال أسلوب الصدمة الحرارة 18، والاستخدام المناسب كولاي. على سبيل المثال، استخدام سلالة كولاي DH5α الحرارة صدمة التحول.
- بيك مستعمرة واحدة من خطوة 2.8 واحتضان ثقافة 3 مل أثري الأمبيسلّين تحتوي على المتوسط (بتركيز 100 ميكروغرام/مل).
- استخراج بلازميد الحمض النووي من ثقافة البكتيرية باستخدام مجموعة مصغرة الإعدادية عقب الشركة المصنعة ' تعليمات s. إرسال العينة إلى شركة تسلسل الحمض النووي-
ملاحظة: أوفيريكسبريسيون أو ضربة قاضية لميرنا الذاتية، أدرجت في تسلسل ترميز ميرنا السلائف أو اسفنجة ميرنا بينهما Xba أنا المواقع. يجب أن تكون كافة بنيات التعبير أو الأسفنج ميرنا أقصر من 400 شركة بريتيش بتروليوم (10% طول الجينوم الفيروسي) بسبب الحد التغليف من الفيروسات 19.
3. توليد رايادف بناء طريق الاستنساخ على ميرنا أو شرنا "كاسيت التعبير" في "العمود الفقري بلازميد"
ملاحظة: بوكا، استنساخ معدية المكونة من بلازميد بوكا تحتوي على الجينوم آيدف (3,981 nt) 19، يرجى قدم البروفيسور جوناثان كارلسون وقد وصفت سابقا في التفصيل 11. p7NS1-دسريد تعرب عن بروتين غير الهيكلية 1 (NS1)-البروتين الانصهار الأحمر نيون البروتين (دسريد) من المروج p7 وقد تم وصف بالتفصيل في مواضع أخرى 14. سلائف مير-941-1 الخاصة بالإنسان 20 وفي الأسفنج، شرنا مجمعة (كجاكجاكتاتكجتجكاتتكاجاج آتجكاكجاتاجتكجتكج)، كانت أيضا سوبكلونيد إلى آيدف كعنصر سلبي.
- اضطر قبل-ميرنا والإسفنج وشرنا أو كاسيت تعبير أميفتب إلى Hpa أنا الموقع من منطقة الترميز NS1 آيدف في العمود الفقري بلازميد بوكا كما هو موضح في الخطوة البروتوكول 2.4 إلى 2.7.
- تحويل الحمض النووي Stbl3 المختصة كولاي الخلايا وتحديد استنساخ إيجابية كما هو موضح في الخطوة 2.8 إلى 2.10.
- بعد ذلك، استخراج بلازميد رايدف من الخلايا البكتيرية باستخدام مجموعة الإعدادية ماكسي عقب الشركة المصنعة ' تعليمات s-
ملاحظة: ينبغي استخدام الخلايا Stbl3 أو Stbl4 كولاي رايدف الحمض النووي التحول إلى أدنى حد من غير مرغوب فيها ساحة جزئ. الإعدادية ماكسي ينبغي أن تستخدم لاستخراج بلازميد رايدف للحصول على كمية كبيرة من الحمض النووي (> 100 ميكروغرام). قبل إنشاء هذا الفيروس، ينبغي دائماً تحليل سلامة تسلسل بلازميد رايدف ب تسلسل الحمض النووي 21-
4. الخلايا C6/36 ترانسفيكتينج مع رايدف البلازميدات
- خلايا الثقافة C6/36 في روزويل بارك التذكاري المعهد (ربمي) 1640 المتوسطة التي تحتوي على 10% مصل بقرى الجنين (FBS) والبنسلين/ستربتوميسين 1% في حاضنة 28 درجة مئوية.
- في اليوم 0، لوحة الخلايا في عشر قوارير الثقافة 2 25 سم ح 18-20 قبل تعداء عن طريق تقسيم الخلايا المتلاقية 90-95% في تمييع 1:2-
ملاحظة: قبل يوم 1، ينبغي أن تصل الخلايا إلى التقاء 90-95 ٪.
- في اليوم 1، ترانسفيكت الخلايا مع السلسلة من رايدف والبلازميدات 22-
تمييع 10 ميكروغرام الحمض النووي في 600 ميليلتر في المتوسط RPMI 1640 في أنبوب ميكروسينتريفوجي
- وتخلط بلطف. ومن ناحية أخرى، تعد 600 ميليلتر في المتوسط RPMI 1640 و 25 ميليلتر من تعداء كاشف كل تعداء.
- إينكوباتي لمدة 5-10 دقائق في درجة حرارة الغرفة (RT). ثم أضف ميليلتر 625 من خليط كاشف 1640-تعداء إلى خليط الحمض النووي بلازميد 1640.
- احتضان هذا الخليط لمدة 20-30 دقيقة في الرايت قبل تعداء، تغسل الخلايا مرتين مع 2 مل متوسط RPMI 1640.
- الحضانة بعد RT (الخطوة 4.3.3)، إضافة the1640-تعداء كاشف الحمض النووي بلازميد المخلوط إلى قارورة الثقافة 2 25 سم واحتضانها ح 6 في 28 درجة مئوية.
- في حوالي الساعة تعداء ح 6 بعد، إزالة وسائط الإعلام تعداء، تغسل الخلايا مرتين مع 5 مل متوسط RPMI 1640، ثم قم بإضافة المتوسط RPMI 1640 مع 10% FBS.
ملاحظة: يظهر رايدف ارتفاع معدلات الإصابة (95 في المائة) في يرقات Ae. البوبيكتوس؛ بيد أن تجربتنا، في ما يقرب من 50% يرقات المصابة، العدوى كان يقتصر على مواقع الإصابة الأولية (مثلاً، الحليمات الشرج وخلايا الشعر الخشن) دون نشر 23. ولذلك إذا كان هناك حاجة لتصيب اليرقات في أنسجة متعددة، ينبغي أن يكون فيروساً المؤتلف معيبة معربا عن بروتين فلوري المصابة المشترك لتمكين تصور مواقع الإصابة. على سبيل المثال، لإنتاج الفيروس المؤتلف المعيبة معربا عن دسريد، p7NS1-دسريد ينبغي أن يكون المشترك transfected مع بلازميد مساعد داخل الخلايا C6/36 وفقا للإجراء المبين أعلاه (يجب أن تكون نسبة التركز، كوترانسفيكتيون 2:1)-
5. حصاد فيريونس رايدف من Transfected الخلايا C6/36
- حصاد الخلايا بعد تعداء 5 أيام. طرد وتعليق الخلايا في الأطباق بالقطارة، زجاج 5 مل، بيبيتينج صعودا وهبوطاً مع المتوسط الثقافة. نقل كل خلية معلقات لأنابيب 15 مل معقمة.
- تجمد في-80 درجة مئوية، أو في حمام الثلج الجاف/إيثانول لمدة 30 دقيقة وثم ذوبان الجليد في 37 ° دوامة جيم 1 كحد أدنى لتكرار إجراءات التجميد والذوبان 3 مرات.
- الطرد المركزي العينة في 4,800 س ز لمدة 20 دقيقة في °C.Collect 4 المادة طافية وتجاهل بيليه. ثم تمرير المادة طافية من خلال مرشح حقنه المتاح 0.22 ميكرومتر. قاسمة ومخزن virion المنقي النهائي للأرصدة في-80 درجة مئوية.
ملاحظة: تجنب دورات تجميد أذاب المتكررة.
6. تحديد كمية رايدف
المعايير
- تحضير الحمض النووي. لينيريزي جميع رايدف البلازميدات مع Hpa الأول، وتنقية المنتجات هضمها مع مجموعة أدوات استخراج هلام 24-
- بناء المنحنى المعياري الكمية المطلقة وقياس عيار الفيروس وفقا للأساليب الموصوفة سابقا 25-
7. توصيل البعوض
- يغسل 100 1 st الطور يرقات Ae. البوبيكتوس ثلاث مرات استخدام منزوع الماء، وثم قم بنقل اليرقات في كوب يحتوي على 95 مل منزوع الماء. إضافة 5 مل مخزون رايدف (تركيز النهائي من 1.00 × 10 10 نسخ/مل)-
- احتضان 24 ساعة في 28 درجة مئوية، يغسل اليرقات ثلاث مرات باستخدام المياه، ونقل اليرقات ثم العودة إلى اللوحات وتغذية بانتظام.
- رصد مستوى التعبير الجيني المستهدف في اليرقات مع قبكر أو لطخة غربية (الممثل النتائج يبين الشكلان 3 و 4)-
ملاحظة: يمكن استخدام طريقة الكشف عن إشارة الأسفار لعزل اليرقات المصابة أكثر دقة. على سبيل المثال، للكشف عن إشارات الفلورسنت من اليرقات مصاب بالفيروس المؤتلف معربا عن دسريد، اليرقات يمكن وضعها على شريحة تقعر ولاحظ تحت مجهر مقلوب الأسفار كل ح 8 حتى 2 يوما بعد الإصابة. حالما يتم الكشف عن يرقات الفلورسنت، ينبغي أن تفصل في أكواب فردية اختبار البلاستيك للسماح للمراقبة المستمرة اللاحقة. يمكن تعريف اليرقات مع متعددة الأنسجة المصابة باستخدام هذا الأسلوب.