يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية

مقالة منهجية

تحويل الزرد الفتاكة Penetrance متحولة الهيكل العظمى بذرية اختبار

7.5K مشاهدة

⸱

DOI:

10.3791/56200

⸱

سبتمبر 1, 2017

 , 

في هذه المقالة

ملخص

والهدف من هذا البروتوكول لتغيير بينيترانسي لقاتله تعمل متحولة الهيكل العظمى في الزرد بالانتقاء الوراثي. طفرات قاتلة لا يمكن أن ينمو إلى مرحلة البلوغ، وولدت أنفسهم، ولذلك يصف هذا البروتوكول وسيلة لتتبع وتحديد penetrance عبر أجيال متعددة من ذرية الاختبار.

الملخص

وغالباً ما تعمل متحولة الزرد الاختراق غير كامل، يظهر فقط في بعض طفرات. تعمل المثيرة للاهتمام التي تظهر غير متسق يمكن أن يكون من الصعب على الدراسة، ويمكن أن يؤدي إلى التباس النتائج. بروتوكول الموصوفة هنا نموذج تربية مباشرة الزيادة والنقصان penetrance في طفرات مميتة الزرد الهيكل العظمى. لأنه لا يمكن بشكل انتقائي ولدت طفرات مميتة مباشرة، وتستخدم الاستراتيجية الكلاسيكية الوراثي لاختبار ذرية. ويشمل هذا الأسلوب أيضا بروتوكولات الزرد التنميط كومبيتيتيفي اليل محددة بكر (الصناعية) والمصبوغة الزرد اليرقات الغضاريف والعظام. تطبيق استراتيجية تربية الموصوفة هنا يمكن أن تزيد في بينيترانسي النمط الظاهري الهيكل العظمى للاهتمام تمكين المزيد من النتائج استنساخه في تطبيقات المتلقين للمعلومات. وباﻹضافة إلى ذلك، تناقص penetrance متحولة من خلال هذه الاستراتيجية الوراثي يمكن أن تكشف عن العمليات الإنمائية الأكثر حاسمة تتطلب وظيفة الجينات المتحولة. بينما على وجه التحديد يعتبر الهيكل العظمى هنا، فإننا نقترح أن هذه المنهجية ستكون مفيدة لجميع خطوط متحولة الزرد.

المقدمة

الزرد نظام نموذج قوي لفهم التنمية الهيكل العظمى. مع سلالات متحولة الزرد، يمكن فك علماء البيولوجيا وظيفة الجينات أثناء سكيليتوجينيسيس. ومع ذلك، يمكن أن يقدم الزرد تعمل متحولة الهيكل العظمى مع متغير بينيترانسي1،2،3،4 التي يمكن أن تعيق تحليلات الخلقية والوراثية. والغرض من هذا الأسلوب ثلاثة إضعاف. أولاً، توليد خطوط متحولة الزرد التي تنتج دائماً تعمل شديدة تمكن الدراسات الإنمائية المتلقين للمعلومات مثل تسجيل الوقت الفاصل بين5 وزرع6. يمكن أن تكون شلت هذه الأنواع من الدراسات بمحاولة دراسة تعمل فقط الم....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

البروتوكول

وأنجزت جميع التجارب المبينة في هذا البروتوكول وفقا والامتثال من جامعة كولورادو وجامعة "ولاية أوريغون رعاية الحيوان المؤسسية" واستخدام اللجان (إياكوك)-

1-إعداد "الأوراق المالية غير محددة ابتداء من"

  1. تحديد الناقلين متخالف من اليل طافرة من اهتمام زعنفة مقطع 11 والتنميط بمخزون حيوانات كامل-الأخوة بأسلوب الاختيار، مثل الصناعية 12 ، ، من 13 14. وأجرى هذا البروتوكول مع سلالة mef2ca b1086 الزرد.
  2. التنميط الصناعية
    ملاحظة: تم تصميم الإشعال اليل محددة للصناعية بالشركة ....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

النتائج

هذا البروتوكول أسلوب تربية طويلة الأمد مفيدة لفهم الزرد طفرات الهيكل العظمى (الشكل 1). تربية انتقائية عن طريق اختبار ذرية ينبغي أن تسفر عن تحول في بينيترانسي عموما كل التنازلي والتصاعدي في بضعة أجيال (الشكل 2). في عملنا السابق، قاد جولتين من الوراثي penetrance متوسط الانخفاض من 17% إلى 3%1. وبالمثل، في خط تصاعدي، نحن تحول penetrance متوسط أعلى من 63% إلى 93% في ثلاثة أجيال. إذا بعد أربع جولات من الوراثي لم.......

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المناقشة

الوراثي، يكشف عن الخفايا وظيفة الجينات

التحول تعمل متحولة أن تكون أكثر أو أقل حدة بالانتقاء الوراثي طريقة مباشرة لاكتساب رؤى جديدة في وظيفة الجينات. بالمقارنة مع الأساليب القياسية لتربية غير محددة، يمكن أن تسفر عن البروتوكول المعروضة هنا فهم كثير أكثر اكتمالا لتعمل المسخ. على وجه التحديد، عن طريق توليد سلالات شديدة، اتساع نطاق كامل من تعمل متحولة قد تكشف عن، بما في ذلك بعض أن ينتبه مع الأرصدة غير محددة. وهكذا، يمكن اكتشاف أدوار إنمائية جديدة للجينات قيد الدراسة. وفي المقابل، ت.......

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

الكتاب ليس لها علاقة بالكشف عن.

شكر وتقدير

ونود أن أشكر كيميل تشاك للتوجيه ووكر Macie لعملها في إتقان وصمة عار الهيكل العظمى، ووكر تشارلين ودوود جون للحصول على مساعدة في وضع هذه الاستراتيجية تربية أولمان بوني لمشورة مفيدة الزرد. وأيد هذا العمل DE024190 K99/R00 إلى جتن.

....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة
الاسمالشركةرقم فهرسيالتعليقات
بارافورمالدهايد ، حبيبات ، صلبةشركة تيد بيلا.18501Pelleted PFA هو بديل أكثر أمانا لمسحوق
PFA كلوريد المغنيسيوم ،Acros Organicsالصلبة 223210010
10x PBS ، AqueousFisherBP3994
190 دليل على الإيثانول
Alcian Blue ، AnatechLtd الصلبة.867يجب أن يكون من Anatech
Alizarin Red ، صلبSigmaA5533-25G
Glycerol ، سائلفيشرBP229 1
بيروكسيد الهيدروجين ، سائلفيشرBP263500
هيدروكسيد البوتاسيوم ،   الصلبةفيشرP250 500
StepOnePlus في الوقت الحقيقي آلة PCRالأنظمة الحيويةالتطبيقية
لوحة تفاعل بصرية سريعة من MicroAmp بسعة 96 بئر مع الباركود (0.1 مل)الأنظمة الحيوية التطبيقية4346906
ختم Microseal 'B'BioRadMSB1001
KASP Master Mix ، High ROXLGCKBS-1016-022
https://www.lgcgroup.com/products/kasp-genotyping-chemistry/#.WOPX41UrKUk KASP حسب التصميم Primer MixLGCKBS-2100-100
تريس حمض الهيدروكلوريك ، فيشر الصلبBP153 500
كلوريد البوتاسيوم ، صلبفيشرBP366 500
توين -20 ، سائلفيشرBP337 100
Nonidet P40ThermoFisher28324
Tricaine-SWestern Chemicals
Proteinase KFisherBP1700 100
T100 Thermal CyclerBioRad1861096
Drop Pasteur Pipets Fisher13-678-30
NanodropThermoFisherلقياس كمية الحمض النووي

المراجع

  1. Nichols, J. T., et al. Ligament versus bone cell identity in the zebrafish hyoid skeleton is regulated by mef2ca. Development. 143 (23), 4430-4440 (2016).
  2. Sheehan-Rooney, K., Swartz, M. E., Zhao, F., Liu, D., Eberhart, J. K.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

إعادة الطباعة والأذونات

استكشف المزيد من المقالات

نفاذية طفرات سمكة الزيبرااستراتيجية اختبار النسلبروتوكول التنميط الجيني بتقنية KASPصبغ أحمر ألشيانطفرات الهيكل العظمي المميتةطريقة التربية الانتقائيةتحليل الغضاريف والعظامفهم السلسلة المظهريةسلالات ذات نفاذية عالية ومنخفضةصيانة خطوط سمكة الزيبرا