ملاحظة: لقياس pHi في النسب منتدى التعاون الأمني، حساب نسبة كثافة fluorescence فلورين إلى مشري في التابعة، والهيدروكربونات المشبعة بالفلور، والخلايا جريب في الظروف الفسيولوجية، وتحويل القيم pHi مع معيار النسب منحنيات المعايرة لكل خلية اكتب 7. وتجري تجارب التصوير الأولى، ويعيش لقياس كثافة fluorescence فلورين ومشري في تشريح في المخزن مؤقت الذي يحتوي على ناكو 3، الذي يحاكي الظروف الفسيولوجية 1 ، جيرماريا 7-المنحنيات القياسية التالية، ويتم إنشاؤها بواسطة قياس كثافة fluorescence فلورين ومشري في غ +-ك + المخزن المؤقت الذي يحتوي على نيجيريسين ionophore الحرة، تعديل لقيم الأس الهيدروجيني مختلفة اثنين، 6.5 و 7.5. حضور نيجيريسين، اكويليبراتيس pHi مع الرقم الهيدروجيني للمخزن المؤقت عبر غشاء البلازما، مما تسبب في pHi لتتناسب مع درجة الحموضة خارج الخلية. وأخيراً، تستخدم المنحنيات القياسية لتحويل فلورين إلى نسب مشري على القيم المقدرة pHi.
1. المرحلة التمهيدية: "التحضير قبل قياس" pHi في فيفو
ملاحظة: لقياس pHi في فيفو، يجب أن يعبر عنه التحوير mCherry::pHluorin في الخلية نوع من الفائدة. وفيما يلي بعض الطرق الشائعة لتوليد فلورين المعدلة وراثيا الذباب في النسب منتدى التعاون الأمني. توليد استنساخ mCherry::pHluorin مفيد بشكل خاص لتحديد التابعة، التي تقع على الحافة الأمامية استنساخ منتدى التعاون الأمني. الأنسجة mCherry::pHluorin محددة التعبير مفيد لقياس pHi عبر الأنسجة كامل، وهو أيضا أكثر ملاءمة عند الجمع بين التعبير [رني] أو التحوير.
- جيل فلورين المعدلة وراثيا الذباب
- mCherry::pHluorin المسمى منتدى التعاون الأمني عبر استنساخ
- جعل mCherry::pHluorin منتدى التعاون الأمني استنساخ، UAS-mCherry::pHluorin 1 إلى flipout Gal4 قانون الأوراق المالية أو غيرها الأسهم مع Gal4 إيندوسيبلي حزب العمل الفيجي/FRT.
- جعل هياتشوك استنساخ إيندوسيبلي، هياتشوك F1s الكبار لمدة يومين بعد اكلوسيون في قنينة فارغة ح 1 في حمام مائي 37 درجة مئوية، أربع مرات تقريبا كل 12 حاء
- لضمان النمو الطبيعي والمعدلات القصوى لتكون البويضات خلال هذه الفترة، الحفاظ على الذباب بتوفير الخميرة الرطبة العذبة (أجزاء متساوية تقريبا جاف بيكر ' s الخميرة والماء) يوميا لمدة 6 أيام على الأقل بعد استنساخ التعريفي.
- الأنسجة محددة mCherry::pHluorin التعبير
- عبور UAS-mCherry::pHluorin 1 جريب خلية محددة السائق، ذ 1 ث *؛ ف {جوب} 10930/سيو (معرف بلومينغتون: 7023).
- جمع 3 أيام بعد بدء الذباب اكلوسينج، ووضعها في قارورة تحتوي على الخميرة الرطبة، على الأقل 24 ساعة قبل التشريح.
- مما يجعل الحلول
ملاحظة: من المهم إعداد المخازن المؤقتة التالية في يوم التجربة لأن تركيزات الأس الهيدروجيني والمذاب في المخزن المؤقت يمكن أن تتغير بمرور الوقت.
- تحضير بيكربونات، نيجيريسين، وتشريح المخازن المؤقتة. إضافة المكونات بالترتيب المسرودة لتجنب تشكيل رواسب (انظر الجدول 1 و الجدول 2 و الجدول 3)-
2. المحاكمة: قياس pHi في "النسب منتدى التعاون الأمني"
ملاحظة: التشريح، المتصاعدة، وتصوير الخطوات للمخزن المؤقت بيكربونات والشرطين المخزن المؤقت نيجيريسين لايف قد تحتاج إلى إجراء مرتين: مرة واحدة لتحديد المجهر إعدادات ومرة ثانية لجمع البيانات التجريبية. انظر في القسم 2-2 أدناه للحصول على مزيد من المعلومات.
- تشريح وتركيب
ملاحظة: للمواد المطلوبة للقيام بهذه الخطوة يرجى الرجوع إلى الشكل 1 و الجدول للمواد. للدوائر 3D التركيب المطبوعة، ويتم توفير ملفات الطابعة ثلاثية الأبعاد تكميلية ملف 1 و 2 ملف إضافي.
- تشريح:
- تحضير تركيب الدوائر بتطبيق طبقة رقيقة من فراغ الشحوم إلى جانب تملق 3D طباعة الدائرة المتصاعدة. وضع هذا الجانب على ساترة 22 × 40 مم لختم ساترة إلى الدائرة المتصاعدة.
- تشريح المبيض من الإناث الذباب الكبار في 500 ميليلتر تشريح العازلة (العازلة بيكربونات أو نيجيريسين، الجدول 3)
- تخدير الذباب 3-4 استخدام غاز CO 2 ونقل الذباب على منصة يطير perfused مع شركة 2 الغاز-
- تلتقط الطيران أنيسثيتيزيد مع الملقط ومكان في وسائط الإعلام التشريح.
- قرصه الصدر ذبابة مع فورسيب واحد، بينما تشيد على الطرف في البطن حتى يتم كشفها في المبيضين.
- بعد فصل المبايض من الأجهزة الأخرى، ندف أربا أوفاريوليس استخدام إبر الحقن 1/2 22. منفصلة بعناية عضلة غمد من المبايض وأوفاريوليس الفردية منفصلة من مجموعة أوفاريوليس. أسلوب فعال لعزل غمد العضلات باستخدام إبرة حقنه واحدة لعقد مجموعة أوفاريوليس في مكان في نهايته الأمامية، والسكتة الدماغية نزولا على طول واحد أوفاريوليس-
- احتضان المبايض تشريح في وسائل الإعلام تشريح لمدة 10 دقائق بالضبط قبل الشروع في خطوة متصاعدة حتى لا يكون هناك ما يكفي من الوقت لأي الخلايا لحجته تماما مع الرقم الهيدروجيني لوسائط الإعلام تشريح نيجيريسين.
ملاحظة: تأكد من أن تتم إزالة غمد العضلات من أوفاريوليس. غمد العضلات قد تخفف إشارة الأسفار، مما يجعل من الصعب تحديد خلايا فردية باستخدام كونكانافيلين-A، وقد تسبب أوفاريوليس للتحرك تلقائياً أثناء تصوير حية.
- تصاعد
- وضع قطره صغيرة من الوسائط التشريح إلى ساترة زجاجية داخل الدائرة المتصاعدة.
- نقل فصل استخدام الملقط أوفاريوليس.
- فصل الدوائر البيض مرحلة لاحقة من جيرماريا المرتبطة بدوائر البيض المرحلة السابقة، وفي محاولة لضمان أن جيرماريا تشريح وضع في مركز لإسقاط وسائل الإعلام التشريح.
- إضافة نقطتين صغيرة من طلاء الأظافر على طرفي نقيض من ساترة ملم 12 جولة وأتركها في الهواء الجاف لحوالي 10 س.
فصل ساترة - مكان الجولة على قطره من تشريح الوسائط التي تحتوي على جيرماريا أن تواجه هذا الجانب مع طلاء الأظافر والاتصال بوسائط الإعلام تشريح. اضغط لأسفل على الأجزاء من الحافة مع طلاء الأظافر تسطيح وتأمين جيرماريا في الموقف. نوصي باستخدام طلاء الأظافر كبار السن نظراً لأنها مسحات أقل على سطح ساترة كما أنه يجري تأمين في مكان-
- ملء الدائرة المتصاعدة مع وسائل الإعلام تشريح إضافية. يمكن استخدام حالة المخزن المؤقت المحدد يحتوي على صبغ كونكانافالين A لملء الدائرة.
ملاحظة: الوقت الإجمالي المستغرق تشريح وتركيب ينبغي أن لا تتجاوز 15 دقيقة. وهذا مهم للتقليل إلى أدنى حد من آثار الضرر الأنسجة والخلية الموت.
- تصوير مباشر:
ملاحظة: في هذه الخطوة، الأولى جمع الصور من الشرط بيكربونات والشرطين نيجيريسين لتحديد إعدادات مناسبة مجهر؛ وضبط إعدادات المجهر عند الاقتضاء، ومن ثم جمع الصور للبيانات التجريبية. استخدام مجهر [كنفوكل] قادرة على تصوير في 3 قنوات: التجارة والنقل (الانبعاثات 475 الإثارة/509)، متشيري (575 الانبعاثات الإثارة/610)، واستعملنا (633 الإثارة/647 الانبعاث).
ملاحظة: تعيين "إعدادات المجهر": سوف يمكن تحديدها كمياً كثافة بكسل للصور التي تم جمعها لتحديد تقديرات pHi، ولذلك فمن المهم أن قيم الكثافة للإشارات في كل مجموعة صورة منخفضة جداً لا مشبعة. يتم تعريف نطاق كثافات الذي يمكن التقاطه في صورة بعمق بت الصورة. في كثير من الحالات، يتم إنشاء صور 8-بت بشكل افتراضي، ولكن نوصي بالحصول البيانات كالصور 16-بت، والتي لديها مجموعة ديناميكية أوسع نطاقا. من المهم ضمان مصغراً الحديث المتبادل بين القنوات الفلورسنت، وحيث يجب ضبط الإعدادات حتى الطيف الانبعاثات التي يتم جمعها من كل فلوروفوري لا يتراكب. لاختبار هذه الإعدادات، تأخذ صورة عينة باستخدام الطيف الإثارة للتجارة والنقل وجمع في طيف انبعاث مشري و العكس بالعكس. إذا تم تعديل الإعدادات بشكل صحيح، ينبغي أن تكون هناك أي إشارة في أي من الحالتين. تعيين إعدادات المجهر (أي الجهد على المسح الليزر [كنفوكل], إعدادات حجم القوة والثقب الليزر) حيث تكون كثافة بكسل من الإشارة في جميع صورة ثلاث مجموعات داخل النطاق الديناميكي لملف الصورة. لكل تجاربنا، استخدمنا ليزر ضوء أبيض المسح مجهر [كنفوكل] مع هدف 40 x للحصول على الصور 16-بت في تنسيق × 1,024 1,024، بينما نحن الأمثل كسب الجهد لكل تجربة حسب الحاجة. على سبيل المثال، في تجربة واحدة، حددنا كسب الجهد للتجارة والنقل، مشري، واستعملنا 37.8 في المائة و 72.9 في المائة و 260 في المائة، على التوالي.
- صورة أوفاريوليس في المخزن المؤقت لتشريح نيجيريسين على درجة الحموضة 6.5، وضبط الإعدادات بكثافة بكسل الصور فلورين ومشري منخفضة، ولكن لا تقل حدود الكشف عن الكاميرا.
- صورة مجموعة أخرى من أوفاريوليس في المخزن المؤقت لتشريح نيجيريسين على درجة الحموضة 7.5 وضبط الإعدادات مثل كثافة بكسل الصور فلورين ومتشيري عالية، ولكن غير مشبعة.
- صورة المبيض في تشريح بيكربونات المخزن المؤقت، وضمان أن كثافة بكسل الصور فلورين ومشري غير المشبعة مع الإعدادات التي يتم اختيارها. إذا المشبعة بكسل، قم بضبط الإعدادات حسب الضرورة.
ملاحظة: مجهر معلمات الإعداد قد تختلف استناداً إلى الإعداد المجهر الدقيق ويجري استخدامها، ويجب أن يكون الأمثل لكل تجربة. بعد أن تم تعيين إعدادات المجهر، ليس تغييرها لما تبقى من هذه التجربة. ينبغي أن تكون إعدادات متسقة عبر التحكم والظروف التجريبية. في تجاربنا pHi الأولى، إنشاء منحنيات المعايرة نيجيريسين نقطة 2 و 3، والعثور على لا يوجد فرق كبير بين pHi المحسوبة باستخدام أي من الطريقتين. ومع ذلك، يتوقع إضافة المزيد من النقاط في منحنى المعايرة بشكل عام، لتحسين دقة. ولذلك، نوصي بإنشاء منحنيات مع أرقام مختلفة من النقاط تحديد كم هناك حاجة لمجموعة معينة من الظروف التجريبية.
- جمع البيانات:
- إجراء التشريح، المتصاعدة، والتصوير من العينات في ظروف المخزن المؤقت بيكربونات ونيجيريسين. بعد التشريح والتركيب، الحد الأقصى للوقت المستهلك التصوير مجموعة واحدة من عينات لا ينبغي أن تتجاوز 45 دقيقة لضمان أن قياسات كثافة fluorescence في الأنسجة الحية وصحية-
- لكل حالة، والحصول على صور لمالا يقل عن 5 جيرماريا-
3. بعد انتهاء المحاكمة: تحليل الصور
- تدبير الأسفار الكثافات في التابعة والهيدروكربون المشبع بالفلور، والخلايا جريب
- خلفية الطرح:
- فتح الصور في فيجي مع كل قناة في (نافذة منفصلة غير المجهزة الشكل 4)-
- استخدام الأداة مستطيل لرسم منطقة للفائدة (ROI) في إطار قناة فلورين في جزء من الصورة دون إشارة.
الخطوة - اختياري: تعيين الحد الأدنى للحد الأدنى بحيث تستبعد بكسل مع قيم الكثافة أدناه معلومات أساسية وتعيين الحد الأعلى من الحد الأدنى إلى الحد الأقصى. عندما يتم تعيين العتبة بهذه الطريقة، مجالات الصورة دون إشارة معظمهم من الأزرق وهو الإشارة واضحة للعيان ( الشكل 4A).
- قياس كثافة fluorescence يعني في العائد على الاستثمار. إذا تم تعيين العتبة في الخطوة 3، تأكد من تحقق من " الحد الأقصى لعتبة " في مربع الحوار "تعيين قياسات".
- طرح خلفية قياس الكثافة من كل قناة وشريحة من الصورة باستخدام الدالة استقطاع، وجدت في العملية → القائمة الرياضيات.
- كرر الخطوات 3.1.1.2-6 لنافذة القناة مشري فيما عدا ذلك، في خطوة 3.1.1.2، بدلاً من رسم مستطيل جديدة باستخدام أداة المستطيل، استخدم الدالة اختيار الاستعادة، وجدت في التحرير → اختيار القائمة، لإضافة مستطيل بنفس الأبعاد وموضع في الصورة-
- "تحديد التابعة" والهيدروكربون المشبع بالفلور، والخلايا جريب:
- تحديد التابعة، والهيدروكربونات المشبعة بالفلور، والخلايا جريب مورفولوجيا والموقع باستخدام تلطيخ كونكانافالين A للعثور على حدود الخلية ( الشكل 2).
- التابعة خلايا الثلاثي رقيقة تقع على حافة جيرماريوم على الحدود 2a/2b المنطقة. إذا كان يتم التعبير عن mCherry::pHluorin في استنساخ منتدى التعاون الأمني، يمكن أيضا تحديد منتدى التعاون الأمني كخلية معظم الأمامي للاستنساخ.
- الهيدروكربون المشبع بالفلور هي الخلايا على شكل غير النظامية في المنطقة 2b، فورا بجوار والمتلقين للمعلومات من التابعة.
- جريب الخلايا هي خلايا مربعة أو عمودية التي تحيط بالكيس الخلية الجرثومية في المنطقة 3.
- الحصول على الأسفار نسب كثافة
- اختر شريحة واحدة أو أكثر التي قد خلية الفائدة أعلى كثافة fluorescence في قناة مشري، وتأكد من أن تلطيخ كونكانافالين A، ينظر في قناة استعملنا، وفي لجنة مسؤولي المنتدى لنا داخل الشريحة المحددة.
- "دوروا رسم" حول كل منتدى التعاون الأمني وقياس كثافة fluorescence يعني فلورين ومشري في جميع شرائح المختار للقياسات-
- تقسيم شدة الأسفار يعني القناة فلورين بشدة الأسفار يعني القناة متشيري لحساب نسبة فلورين للأسفار متشيري.
- PHi استخلاص القيم وتوليد الصور بسيودوكولوريد
- استخلاص قيم pHi
- في جميع الحالات، يجب إنشاء منحنى الانحدار الخطي باستخدام المبيض من الذباب من نفس النمط الوراثي على حد سواء التجريبية والسيطرة على الأوضاع. إنشاء منحنى انحدار خطي لكل نوع من الخلايا باستخدام البيانات من شرطين المخزن المؤقت نيجيريسين ( الشكل 3). في Excel، يمكن ذلك برسم البيانات على الرسم بياني، وإضافة خط اتجاه خطي. بدلاً من ذلك، انظر:
- استخدام الميل والتقاطع y منحنى الانحدار الخطي محسوبة من شروط نيجيريسين ومعادلة خط (y = mx + b) لتحويل فلورين إلى مشري نسبة القيم المحسوبة من العينات في البيكربونات شرط لقيم الأس الهيدروجيني. في هذه المعادلة، تحل محل النموذج المنحدر (التقاطع y) ب ووضع قيمة نسبة في العاشر، وحل ليوسف
- توليد صورة بسيودوكولوريد التي تعكس قيم نسبة في فيجي.
- اتبع الإجراء أعلاه لخلفية الطرح (الخطوة 3.1-1 والشكل 4)-
- تقسيم القناة فلورين من قناة مشري استخدام وظيفة "الحاسبة الصورة"، وجدت في القائمة عملية. تأكد من " إنشاء نافذة جديدة " و " النتيجة 32-بت (عدد عشري) " خانات الاختيار يتم التحقق على حد سواء. تغيير جدول البحث (لوط)، وجدت ضمن القائمة صورة، الحرارية أو طرفية المستعملين المحليين من الاختيار. انظر الشكل 4 لخيارات أخرى مناسبة.
- في مربع الحوار ضبط السطوع والتباين (صورة → ضبط →/السطوع)، انقر فوق " تعيين " زر. عرض مجموعة الحد الأدنى القيمة إلى 0 والحد الأقصى لعرض القيمة بنسبة أفضل يلتقط البيانات، عادة 1.0 2.0 ( الشكل 5).