نقدم هنا، على بروتوكول للكشف والتحديد الكمي المنجلية في المصابين خلايا الدم الحمراء مائي استخدام الانعكاس الكلي الموهنة مطياف الأشعة تحت الحمراء وتحليل بيانات متعددة المتغيرات.
مقالة منهجية
نقدم هنا، على بروتوكول للكشف والتحديد الكمي المنجلية في المصابين خلايا الدم الحمراء مائي استخدام الانعكاس الكلي الموهنة مطياف الأشعة تحت الحمراء وتحليل بيانات متعددة المتغيرات.
نظهر أسلوب القياس الكمي والكشف عن الطفيليات في مائي خلايا الدم الحمراء (كرات الدم الحمراء) باستخدام benchtop بسيطة مطياف "يخفف مجموع انعكاس فورييه تحويل الأشعة تحت الحمراء" (أية تي آر-فتير) بالاشتراك مع (تحليل البيانات متعددة مفدا). 7 3 المنجلية مثقف للطفيليات مرحلة خاتم تطفلن 10% ويستخدم لارتفاع كرات الدم الحمراء المانحة جديدة معزولة لإنشاء إضعاف سلسلة بين 0 – 1%. ووضعت 10 ميليلتر لكل عينة في وسط النافذة الماس ATR للحصول على الطيف. وعولج نموذج البيانات لتحسين إشارة إلى نسبة الضوضاء وإزالة مساهمة المياه، وثم طبق المشتقة الثانية لحل الخصائص الطيفية. ثم حللت البيانات باستخدام نوعين من مفدا: الأولى الرئيسية مكون تحليل (PCA) لتحديد أي القيم المتطرفة ومن ثم "انحدار المربعات الجزئية" (الثابتة والمتنقلة-R) بناء نموذج القياس الكمي.
الملاريا من بين الأمراض الأكثر تدميرا في عصرنا؛ ويعيش أكثر من نصف السكان المعرضين للخطر في المناطق الموبوءة، وأنها تشكل عبئا غير متناسب الفقراء1،2،،من34. جزء كبير من هذه المسألة هو أعراض الناقلين وأوائل المرحلة المرضى التي تعمل كخزانات للبعوضة الناقلة5، تسبب طفرات عدوى خلال مواسم الرطب ويسمح لها بالاستمرار في المجتمعات المحلية. بسبب الملاريا خمسة المتصورة الطفيليات، وهي الأكثر دموية التي المنجلية التي تسبب أشد أشكال المرض2.
تقنيات لتشخيص الملاريا حاليا أقل من الكمال. يمكن كشف بصرية مجهرية، معيار الذهب الحالي، فقط 62-88/ميليلتر الطفيليات اعتماداً على الطريقة المستخدمة6. وعلاوة على ذلك، نظراً لكثافة والمهارة العالية المطلوبة، في العديد من مناطق الفحص المجهري ميسدياجنوسيس > 50% حالات، لا سيما المصابين بالطفيليات تدني المستويات2، التي يمكن أن تعزى مباشرة إلى الافتقار إلى الموارد في المنطقة والنتائج في إساءة استخدام العقاقير المضادة للملاريا. 2 الرئيسية التشخيص أساليب أخرى هي "الاختبارات التشخيصية السريعة" (اختبارات)، التي تستخدم الأجسام المضادة للكشف، وفحوصات Polymerase سلسلة من ردود الفعل (الاسترداد)، التي تنطوي على تمييز وتحديد كمية الطفيليات من الحمض النووي. اختبارات حاليا فقط قادراً على الكشف عن المنجلية و النشيطة P. للطفيليات على الأقل 100/ميليلتر من الدم أدى إلى أشكال أكثر ندرة هذا المرض دون علاج. 7 , 8 وفي المقابل، تميز فحوصات بكر والتحديد الكمي للأنواع المختلفة من المتصورة في حساسية 0.0004-5 الطفيليات/ميليلتر دم. ومع ذلك، يتطلب الكواشف باهظة الثمن، والمعدات والمهارات التقنية، وهكذا ليست مناسبة للتطبيق الميداني.
تقنية بالغة الحساسية، ويمكن الاعتماد عليها ومعقولة أمر أساسي لتحسين تشخيص مرات، وبالتالي تحسين نتائج المرضى ومما يجعل من الممكن القضاء على المرض. مجموع انعكاس فورييه الموهنة التحويل (أية تي آر-فتير) التحليل الطيفي يقدم حل محتملة لهذه المشكلة. العمل السابقة قد أظهرت أنه من الممكن لكشف وتحديد المنجلية في الميثانول الثابتة الأفلام الدم تحقيق حدود الكشف < 1 الطفيلي/ميليلتر من الدم (< تطفلن 0.0002 ٪)9، وشبيهة بطرق PCR. وقد أظهرت الدراسات الأخيرة أن من الممكن للكشف والتحديد الكمي للطفيليات في عينات مائي وبالتالي القضاء على خطوة التثبيت. ومع ذلك، عوامل مثل بخار الماء والضوضاء الطيفية ومعالجة البيانات بحاجة إلى أن تؤخذ في الاعتبار لتحقيق أفضل النتائج10.
هذا البروتوكول يهدف إلى إظهار المستخدمين الجدد كيفية اكتساب الأطياف ATR-فتير وإعداد نموذج انحدار للكشف عن المنجلية من العينات المائية في "خلايا الدم الحمراء" (RBC)10.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
الرجاء استشارة مناسبة صحائف بيانات سلامة المواد (MSDS) والتماس السلامة الأحيائية المستوى 2 (BSL-2) توفير التدريب المناسب. يجب القيام بجميع الخطوات تثقيف في خزانة BSL-2 استخدام تقنية العقيم، بمعنى أن هناك خطر تعرض للأشعة فوق البنفسجية الضارة من خطوات إزالة التلوث والإصابة بإبرة عصا الإصابات، والتعرض البيولوجي المحتمل إذا ثقافة الطفيلي يدخل أي إصابات. وعلاوة على ذلك، مخزون الدم من بنوك الدم فقط فحص لبعض الأمراض وإمكانية انتشار الأمراض المنقولة بالدم خطر محتمل. التماس المساعدة الطبية الفورية في حدوث الإصابة.
1-إعداد وقياس 7 3 "سلسلة إضعاف الطفيلي" المنجلية
ملاحظة: الثقافة sp. المتصورة حساسة للغاية. استخدام كواشف طازجة/السارية وتغذية الطفيليات بانتظام عن طريق تغيير وسائط الإعلام. تغذية الثقافات أدناه تطفلن 5% كل يوم الثاني؛ تغذية الثقافات بين 6-10% تطفلن مرة واحدة أو مرتين في يوم؛ وتغذية الثقافات بين 11-20 ٪ لتصل إلى 4 مرات في يوم. سوف تفقد شكلها الطفيليات التي هي بداية لتجويع والبدء في العقد. وفي هذه حالة، تغذية وتمييع فورا بتغيير وسائل الإعلام وإضافة الأسهم كرات الدم الحمراء-جمع التبرع بالدم في أنابيب جمع الدم التي تحتوي على الهيبارين تخثر الدم والتدبير ضمن ح 6 الأولى.
2-تحليل البيانات المتغيرات (مفدا)
ملاحظة: معالجة البيانات يجب أن يتم عبر مجموعة البيانات كلها تجنبا للضوضاء وإضافة قمم أصل غير البيولوجية. وفي المقابل، تحليل أكثر المناطق البيولوجية ذات الصلة: 2980-2800/سم و 1750-850/سم.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
ارسم المربعات الجزئية (الثابتة والمتنقلة-R) ولها متجه الانحدار المرتبطة بها، و الشكل 1a و 1b على التوالي، تبين أن الإشارة من الطفيليات متميزة ما يكفي من كرات الدم الحمراء التي يمكن استخدامها للنموذج نموذج انحدار خطي لاستخدامها التنبؤ بالطفيليات في مجموعات البيانات مستقبلا.
تم إنشاء نموذج الثابتة والمتنقلة-R قوية، خطي ذات قيمة التربيعي 0.87 ويعني جذر التربيع خطأ التحقق من الصحة عبر (...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
نموذج الثابتة والمتنقلة-R هو أسلوب متعدد المتغيرات تحت إشراف يرى وجود علاقة خطية، Y = bX + ه، بين المتغيرات التنبؤية X (هنا، امتصاص في كل وافينومبير) ومستمر متغير Y (هنا، ومستوى تطفلن). وباختصار، النموذج يجمع بين المتغيرات في العاشر لإنشاء مجموعة جديدة من المتغيرات الكامنة (LVs) أن القبض على الفرق في العاشر يرتبط مع Y، ويحسب متجه انحدار (ب) أن مضروباً نتائج طيف جديد في تقدير قيمة y. قوة النموذج الذي يمكن أن تؤخذ من قيمتين: قيمة2 R وقيمة جذر متوسط مربع الخطأ للصليب التحقق من الصحة (رمسيكف). السابق يصف الخطي للن...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
الكتاب ليس لها علاقة بالكشف عن.
تم توفير التمويل للمؤلفين من قبل "مجلس البحوث الأسترالية" (مستقبل الزمالة FT120100926 إلى برو)، الوطنية الصحية والطبية البحوث مجلس أستراليا (برنامج المنح و "زمالة للبحث أقدم" للبنوك؛ أوائل الوظيفي زمالات جسر؛ البنية التحتية للبحوث معاهد دعم نظام المنح للمعهد برنيت)، ودعم البنية التحتية التشغيلية حكومة الدولة الفيكتوري منحة لمعهد برنيت. ونسلم السيد فينلي شانكس لدعم دور فعال.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| دم المتبرع | - | يجب جمعه بواسطة ممارس طبي مدرب | |
| مخزون الدم | الصليب الأحمر الأسترالي " | - | |
| 3D7 المتصورة المنجلية | معهد بيرنت | - | مختبر سلالة مكافئة من النوع البري |
| RPMI-1640 مع L-hepes بدون بيكربونات الصوديوم | Sigma Aldrich | R6504 | |
| Albumax (Gibco) | Thermofisher | Aliquot في أنابيب صقر سعة 50 مل وتخزينها في الفريزر | |
| بيكربونات الصوديوم | Sigma Aldrich | S5761 | |
| Giemsa Stain | Sigma Aldrich | 48900 | |
| Sorbitol | Sigma Aldrich | S1876 | يجب تصفيته قبل الاستخدام في الثقافة |
| أنابيب جمع الدم (Vacutainers) | Becton و Dickonson and Company | 367671 | |
| زيت الغمر | Thermofisher | M3004 | |
| 50 مل أطباق ثقافة | Falcon | 353025 | |
| 25 مل أطراف ماصة | Falcon | 357515 | |
| 10 مل أطراف ماصة | Falcon | 357530 | |
| شرائح مجهر | Sigma Aldrich | S8902 | |
| أنابيب الطرد المركزي 50 مل | Sigma Aldrich | T2318 | |
| وحدة تحكم الماصة الآلية | Integra-biosciences | 155 015 | |
| Sorvall Legend X1R الطرد المركزي | Thermofisher | 75004260 | |
| Forma&trade ؛ 310 حاضنات CO2 للحرارة | المباشرة Thermofisher | 310TS | |
| نيكون كسوف E-100 مجهر | مجهر نيكون | E100_2CE-MRTK-1 | عند الشراء تأكد من أن العدسة 100x عبارة عن زيت عدسة الغاطسة |
| Bruker Alpha Ft-IR Spectrometer مع ATR Quick Snap | Attachment Bruker | 9308-3700 | تأكد من طلب مرفق "Eco-ATR" عند شراء |
| برنامج تحليل البيانات | متعدد المتغيرات Matlab | Mathworks Inc | |
| Unscrambler X | CAMO | متعدد المتغيرات | |
| PLS-Toolbox | Mathworks، Inc. | واجهة المستخدم الرسومية ل Matlab |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن