وافق جميع الإجراءات الحيوان بالعناية بالحيوان واستخدام اللجنة للدولة جامعة إنديانا، حرم المضيف من "كلية الطب بجامعة إنديانا" – تير هوت.
1. إعداد كونيديا دخناء (أ) للإصابة
- بينما كان يعمل في غطاء دخان جيد التهوية، إضافة ميليلتر 125 حل الأسهم دخناء أ 293 إلى 900 ميليلتر خلية ثقافة الصف المياه (ككجو). ثم نقل الحل للشعير استخراج أجار (طيران الشرق الأوسط) لوحة عن طريق ماصة، وتنتشر بشكل متساو مع حلقة إينوكولاتينج.
- تخزين اللوحة الفطرية في الظلام عند 24 درجة مئوية لمدة 14 يوما على الأقل ولا يزيد عن 28 يوما.
- حصاد كونيديا استخدام الزجاج الخرز كما هو موضح سابقا9.
- صب غ 1.5 من 0.5 مم الخرز الزجاج على اللوحة ولطف الميل ذهابا وإيابا حتى المغلفة الخرز من أجل استخراج كونيديا. جمع الخليط حبة/كونيديا في أنبوب مخروطي 15 مل. تعليق في 5 مل دولبيكو مخزنة الفوسفات المالحة (دببس) ودوامه.
- عد كونيديا في تمييع 50 x من المادة طافية في دببس باستخدام هيموسيتوميتير. حساب عدد كونيديا في المنطقة هو مبين في الشكل 1 ، واستخدام 1 معادلة لحساب التركيز.
عامل إضعاف × #Conidia × 104= كونيديا مليلتر (المعادلة 1)
ملاحظة: مناطق زاوية مربعة 4 × 4 إضافية قد تحسب، مع متوسط هذه المناطق المستخدمة ك #Conidia في المعادلة 1.

الشكل 1: هيموسيتوميتير الممثل المساحة المستخدمة في كونيديا العد (مربع والسهم).
- تمييع تعليق كونيديا مع عقيمة المالحة (دببس) للحصول على التركيز المطلوب، 1.0 × 108 كونيديا/مل للعدوى مع 5 × 106 كونيديا/50 ميليلتر. إعداد 50 ميليلتر من حل كونيديا الواحدة 'ن + 2' الفئران تصاب بحساب بيبيتينج خطأ.
ملاحظة: قد يكون الحصاد الفطريات القياسية وتصفية إعداد واستخدامها بدلاً من10. يستخدم الأسلوب حبة الزجاج أفضل لضمان أن يتم الحصول على عينات كونيديا مع الحد الأدنى من المستضدات أصله الصغيرة/القابلة للذوبان للطموح.
2-الكبت المناعي والعدوى من طراز مورين
- استخدام الفئران العمر 7-10 أسبوع.
ملاحظة: بالب/ج، C57BL/6 (B6)، تعاني من نقص اوسينوفيل (ΔdblGATA، خلفية بالب/ج)، وتفتقر إلى خلية T γδ (TCRδ--/--، خلفية B6) الفئران واستخدمت لهذه الدراسة. لكل تجربة، والسن والمطابقة بين الجنسين كانت تستخدم الفئران (الذكور والإناث) لكل مجموعة.
- تستنفد العَدلات عن طريق الحقن (الملكية الفكرية) داخل من 0.1 مليلتر (0.5 ملغ) مكافحة-موس-لي-6 ز جسم في المحلول الملحي العقيمة في 45° في الربع الأيمن السفلي الأفقي (لوضع جدول زمني تجريبية، انظر الشكل 2).
- 24 ساعة في وقت لاحق، تصيب الفئران بتطلع مع 5.0 × 10 كونيديادخناء ألف- 6تعليق في 50 ميليلتر عقيمة المالحة (انظر الخطوات 2.4-2.10) كما تم وصفه سابقا11. بعد الإصابة، حقن مجموعة فرعية حيوانات مع عامل مضاد فطري مثل اسيتات كاسبوفونجين 5 مغ/كغ في دببس المستخدمة في هذه الدراسة (يوميا، انظر الشكل 2).
- تخدير الفئران مع isoflurane 99.9% استخدام آلة تخدير البيطري.
- ضع منشفة ورقية على أرضية قاعة التعريفي للقبض على البراز والبول.
- ضع الماوس في قاعة توجيهي وتأمين الغطاء وتعيين في المبخر إلى إيسوفلوراني 5% ل 2 دقيقة و 30 ثانية.
ملاحظة: لا يتم استخدام مرهم البيطرية لإجمالي الوقت تحت التخدير أقل من 5 دقائق.
- تخفيض في المبخر إلى النصف من إعداد الحد الأقصى لمدة 30 ثانية.
- تأكد أن الماوس يتم تخديره بشكل صحيح عن طريق مراقبة إبطاء التنفس، وقلة الحركة، وعدم الاستجابة للتحفيز تو-قرصه.
- إزالة الماوس من الدائرة التعريفي ومكان على لوح مائل. ضع الماوس مع ظهرها ضد المجلس. تكفل لها القواطع العلوية هي مقيدة بلطف مع شريط المطاطي والقواطع السفلي هي مقيدة بلطف مع سلك معدني.
- عقد اللسان بعناية في ملحق كامل مع ملقط صغير وماصة 50 ميليلتر من تعليق كونيديا/برنامج تلفزيوني في قاعدة اللسان.
- عقد اللسان في ملحق كامل؛ الاستماع للتنفس السريع والضوضاء النقر متميزة من الطموح. عقد 20 ق أو حتى تعليق ويستنشق كاملا.
- إزالة الماوس من لوحة منحدر ولطف في قفص للمراقبة.
- عقب الشفط، الماوس ينبغي أن يستعيد وعيه داخل 1 دقيقة رصد الماوس حتى تدرك تماما وقادرة على المشي حول القفص. ينبغي أن يقع في 21 درجة مئوية الحيوانات ورصد مرتين يوميا حتى يتم حصادها الرئتين.
- كرر نضوب العَدلات (الخطوة 2، 2) 24 ساعة بعد الإصابة (الشكل 2).

رقم 2: الجدول الزمني التجريبي. تم تعديل هذا الرقم من منشور سابق8.
3-الحصاد والحفاظ على الرئتين الماوس للتحليل النسيجي
- وإذ يساورها بالغ تخدير الحيوان بجرعة قاتلة من 0.1 مل من الصوديوم بينتوباربيتال 390 ملغ/مل حل الملكية الفكرية.
- تأكيد القتل الرحيم ملاحظاً انعدام التنفس العفوي وعدم وجود استجابة للتحفيز أطرافهم بالملقط. عندما euthanized، رش الذبيحة مع الإيثانول 70% لتعقيم.
- ضع الذبيحة على متن رغوة مغطاة وسادة ماصة.
ملاحظة: يجب وضع الذبيحة على ظهرها مع دبابيس تأمين جميع أطرافه الأربعة للمجلس الرغوة.
- فتح تجويف الصدر العلوي باستخدام المقص بحذر. قص القفص الصدري بعيداً من أجل فضح الرئتين والقلب. قطع الأجوف فينا أدنى للسماح التروية. تجنب قطع الأوعية الدموية وثقب الأجهزة.
- نتخلل ببطء مع 5 مل دببس الباردة في البطين الأيمن من القلب بزاوية 45 درجة مع إبرة 25-ز. كرر التروية مع 5 مل من الفورمالين 10%.
- كشف القصبة الهوائية وفصل منصات الدهون المحيطة بعناية. يجب توخي الحذر وتجنب ثقب القصبة الهوائية. ضمان إزالة النسيج الضام الزائدة حتى تماما تصور القصبة الهوائية قبل المتابعة. حالما يتم كشفها في القصبة الهوائية، ضع الملقط تحت القصبة الهوائية للارتقاء بذلك.
- كزة ثقب صغير في القصبة الهوائية العليا باستخدام إبرة 25-ز.
ملاحظة: يجب أن ترحل الحفرة حيث يناسب قنية كامل في القصبة الهوائية. توخي الحذر لتجنب تمزيق القصبة الهوائية.
- إدراج قنية من خلال الثقب ونحو الرئتين. تأمين القنية بخيط جراحي مرتبطة فضفاضة حول القصبة الهوائية.
ملاحظة: إذا كان هو تمزق في القصبة الهوائية، قد تكون إدراج القنية في الماضي القصبة الهوائية قدر الإمكان في مجرى الهواء.
- استخدام المحاقن، تضخم الرئتين مع 1 مل 10% فورمالين المخزن المؤقت من خلال القنية. ضمان أن تضخم الرئتين بشكل مرئي. إذا لم يكن كذلك، ضبط القسطرة وتكرار. حالما يتم تضخم الرئتين، بسرعة إزالة قنية بحذر وتشديد مؤشر الترابط بشكل أمن غلق القصبة الهوائية.
ملاحظة: إذا هو تمزق في القصبة الهوائية والرئتين لا يمكن أن يكون مبالغا فيها، قد لا يزال يكون حصادها الرئتين ولكن هذا قد يمنع التثبيت الصحيح.
- بلطف إزالة القصبة الهوائية والرئتين من صدره بقطع النسيج الضام من القصبة الهوائية بعناية مع الملقط أثناء سحب مؤشر ترابط برفق. ضع الرئتين والقصبة الهوائية في أنبوب 50 مل مخروطية مع 15 مل من 10% فورمالين المخزن المؤقت. ضع نهاية واحد من مؤشر ترابط خارج الأنبوب وختم عملية النداءات الموحدة. عكس الأنبوب إلى غمر العينة في مثبت تماما.
- تخزين العينات في درجة حرارة الغرفة 24 ساعة على الأقل أو حتى إجراء مزيد من المعالجة.
تنبيه: الفورمالين الخطرة. ارتداء "معدات الحماية الشخصية" المناسبة بما فيها نظارات وقناع لوجه. تعمل تحت غطاء كيميائية عند تجهيز العينات.
4-الحصاد والحفاظ على الرئتين الماوس لعبء الفطرية الحمض النووي
- اتبع الخطوات من 3.1 إلى 3.5 كما هو موضح أعلاه في ماوس منفصلة.
- نتخلل ببطء مع 10 مل دببس الباردة في البطين الأيمن من القلب بزاوية 45 درجة مع إبرة 25-ز.
- المكوس الرئتين مع المقص ووضعه في أنابيب المسمى 1.5 مل.
- تخزين الرئتين في-80 درجة مئوية حتى مزيد من المعالجة.
- استخدام التقنيات القياسية كما هو موضح (التضمين وتمزيقها) ووفقا للبروتوكولات الشركة المصنعة (انظر الجدول للمواد).
5-الفحص المجهري والتصوير
- افتح برنامج التصوير الكمي (انظر الجدول للمواد).
- استخدام مجهر ضوء، الحصول على مالا يقل عن 4 حقول متميزة لمنطقة الميكونج الكبرى الملون الشرائح (10 X الهدف). التأكد من وجود الصور ممثل الخطوط الجوية المصابة داخل الرئة مع كثافة أنسجة مماثلة.
ملاحظة: إذا ظهرت كثافة وتوزيع البؤر أصله تختلف اختلافاً كبيرا بين السيطرة والمجموعات التجريبية، حقول إضافية يمكن اتخاذها، أو قد يكون تصويرها منطقة الميكونج قسم الرئة كاملة (4 X الهدف). الحصول على صور من نفس المناطق في الرئة (المعرفة بواسطة مورفولوجيا الأنسجة ما يعادلها) في مقطع الرئة مسلسل الملون والهيماتوكسيلين ويوزين، إذا رغبت في ذلك.
- إضافة أشرطة مقياس للصور عند الاقتضاء، وحفظ الصور كمياً. اختر تحرير > إضافة/تحرير "علامات المعايرة" > القائمة: اختر حجم شريط سمك ولون وحجم الخط > اضغط على الصورة ليوضع فيه شريط مقياس. إغلاق القائمة واختر تحرير > دمج > "دمج علامات المعايرة" > اختر "حفظ كملف" > اسم الملف ثم انقر فوق حفظ.
6. باستخدام أحد برامج معالجة صورة لحساب عبء الفطرية (الشكل 3)
- فتح برنامج معالجة صور. حدد ملف > مجلد مع العينات تحديد مقدار > صورة (الشكل 3A). اختر صورة > نوع > تحويل إلى "RGB المكدس" (الشكل 3).
- استخدم المفتاح سهم لليمين لتحديد الثاني من ثلاث صور معينة (الشكل 3B). ضرب "control + shift + T" لإحضار معاين إعدادات القائمة "عتبة" (الشكل 3). حدد موقع الصورة الأصلية.tiff أو.jpg كمرجع وفتح مع صورة عرض البرنامج (الشكل 3).
- اسحب مربع التمرير العلوي وصولاً إلى اليسار وضبط مربع التمرير أسفل حتى منطقة مختارة (باللون الأحمر) ممثل صورة مجهرية (عادة ما تتراوح بين 130-160 كما هو مبين على يمين شريط التمرير (الشكل 3).
- بمجرد تحديد، اضغط على "تعيين" > "OK" (3D الشكل). حدد "تحليل" > "تعيين قياسات" > التحقق من "المنطقة، منطقة الكسر، الحد الأقصى للعتبة، عرض التسمية" وترك الإعدادات أسفل (القائمة المنسدلة والعشرية) كافتراضي > "OK" (3D الشكل).
- قد يستبعد مساحات كبيرة من مساحة بيضاء أو تلوين الخلفية بتحديد الأنسجة مناسبة مع أداة المساحة أو مضلع.
- وأخيراً حدد، "تحليل" > "قياس" (يجب أن تظهر نافذة تحتوي على بيانات، أو سوف تظهر علامة تبويب على شريط مهام windows المسمى، "النتائج") (رقم 3E). نقل البيانات إلى برنامج تحليل بيانات للرسوم البيانية والتحليل الإحصائي.
- أدخل متوسط النسب المئوية المنطقة أربعة لكل عينة من الرئة. 5-8 عينات تكفي عادة للكشف عن اختلافات كبيرة بين المجموعات. إذا كانت المقارنة بين مجموعتين تجريبية، أداء الطالب مزاوج تي-اختبار لتحديد أهمية.

الشكل 3: لقطات من ممثل لكل خطوة من منطقة الميكونج الكبرى النسيجي الحقل الكمي. (أ) "حدد ملف" > مجلد مع العينات تحديد مقدار > حدد الصورة. (ب) "حدد الصورة" > نوع > تحويل إلى "RGB المكدس". استخدم المفتاح سهم لليمين لتحديد الثاني من ثلاث صور معينة. (ج) ضرب "control + shift + T" لإحضار معاين إعدادات القائمة "العتبة". حدد موقع الصورة الأصلية.tiff أو.jpg كمرجع وفتحه باستخدام برنامج عارض صور. اسحب مربع التمرير العلوي طول الطريق اليسار وضبط مربع التمرير أسفل حتى منطقة مختارة (باللون الأحمر) ممثل صورة مجهرية (عادة ما تتراوح بين 130-160 كما هو مبين على يمين مربع التمرير. (د) مجرد صحفية مختارة "تعيين" > "موافق". حدد "تحليل" > "تعيين قياسات" > التحقق من "المنطقة، منطقة الكسر، الحد الأقصى للعتبة، عرض التسمية" وترك الإعدادات أسفل (القائمة المنسدلة والعشرية) كافتراضي > "موافق". (ه) وأخيراً حدد "تحليل" > "قياس" (يجب أن تظهر نافذة تحتوي على بيانات، أو سوف تظهر علامة تبويب على شريط مهام windows المسمى "النتائج"). الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
7-الحمض النووي عبء الفطرية
- إزالة الرئتين من-80 درجة مئوية وليوفيليزي على الأقل 4 ح (وهو الأمثل بين عشية وضحاها) أو حتى جفت تماما بنظام تجميد جاف.
- في حين يتم تجفيف الرئتين، إعداد المخزن المؤقت لاستخراج الحمض النووي (كلوريد الصوديوم 0.1 M، 10 مم يدتا pH 8.0، 10 مم HCl تريس pH 8.0، والحزب الديمقراطي الصربي 0.5%).
- مكان استخراج الحمض النووي إعداد المخزن المؤقت في حمام مائي 60 درجة مئوية قبل الحارة. أيضا، ضع الفينول: كلوروفورم: الكحول إيسواميل (25:24:1) في أنبوب 50 مل مخروطية والسماح للانفصال.
- ضع الرئتين المجففة بالتبريد في أنبوب 2 مل ملولبة مع 0.2 مل حبات الزجاج. استخدام الخافق حبة، طحن أنسجة الرئة الجافة عن 15-30 ثانية حتى أنه يشكل مسحوق ناعم.
- إضافة المخزن المؤقت "استخراج الحمض النووي" 0.8 مل الحارة إلى كل أنبوب ودوامه جيدا. احتضان كل أنبوب لمدة 15 دقيقة في حمام حبة 65 درجة مئوية ثم دوامة قبل حضانة لمدة 15 دقيقة إضافية. بعد حضانة، أنابيب دوامة، ومن ثم الطرد المركزي في س 25,000 ز لمدة 10 دقائق.
- تسمية 3 مجموعات من أنابيب 1.5 مل لكل من العينات ونقل الطبقة العليا من المادة طافية في مجموعة واحدة من الأنابيب. توخي الحذر أثناء بيبيتينج خارج الطبقة العليا مائي لتفادي الإخلال بالطبقة الوسطى.
- إضافة إلى حجم متساوية من الكحول الفينول: كلوروفورم: إيسواميل ومزيج جيد. ثم الطرد المركزي في 25,000 ز س لمدة 15 دقيقة قبل بيبيتينج من الطبقة العليا في المجموعة الثانية من الأنابيب.
- إضافة إلى حجم متساوية من كلوروفورم كلوروفورم: إيسواميل ومزيج جيد والطرد المركزي في 25,000 ز x 10 كحد أدنى بعناية ماصة بالطبقة العليا في المجموعة الثالثة من الأنابيب.
- إضافة 500 ميليلتر الايزوبروبانول و 50 ميليلتر ناواك (pH 5.2)، مزيج جيد، والسماح لعينات لاحتضان في درجة حرارة الغرفة لمدة 10 دقائق. ثم الطرد المركزي في 25,000 ز س لمدة 30 دقيقة وصب المادة طافية.
- تغسل بيليه الحمض النووي مع ميليلتر 750 إيثانول 70% الباردة الجليد والطرد المركزي لمدة 5 دقائق في 25,000 س زاي صب الإيثانول وتسمح الكريات للهواء الجاف في الأنابيب في أغطية دخان لمدة 40 دقيقة.
- ريسوسبيند الكريات الجافة في 300 ميليلتر من المخزن المؤقت للشركة المصرية للاتصالات.
ملاحظة: قد تكون مخزنة في الحمض النووي في-20 درجة مئوية حتى كمياً.
- التحديد الكمي للحمض النووي باستخدام جهاز المطياف الضوئي وإعداد 100 ميليلتر من 0.2 ميكروغرام/ميليلتر لكل عينة من الحمض النووي لتحليل قبكر.
- أداء qPCR قياسية في ثلاث نسخ كما تم وصفه سابقا مع 1 ميكروغرام من عينات الحمض النووي، 18S الفطرية المتاشب التمهيدي، ويحدد التحقيق مع يحتوي مسبار معدلة (5 '--/56-الاتحاد الماليزي/AGC وظفته كاج/زن/مجلس التعاون الجمركي الائتلاف صرفة G/3IABkFQ-3')12،13.
- إعداد منحنى قياسي من الحمض النووي (أ) دخناء ، وحساب تركيز الحمض النووي الفطرية في جزء من الغرام في كل صبغ العينة باستخدام المراسل متوسط القيم المقطعية.
- ارسم بيكوغرام/ميكروغرام للحمض النووي الفطرية مع الخطأ المعياري للوسط. أداء الطالب t-اختبار تحليل لتحديد أهمية.
ملاحظة: كأقل سمية بديل لاستخراج الحمض النووي الفينول كلوروفورم المستخدمة هنا، العمود على أساس استخراج الحمض النووي يمكن استخدام مجموعات.