$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1-العامة بروتوكول لتوليف وبالاخذ
- حساب المقياس لتوليف (عادة مليمول). بهذا الحجم يستند إلى كتلة المبلغ المستهدف PPA. نضع في اعتبارنا أن فعالية رد فعل الكائنة يتناقص بالتدريج مع زيادة في تسلسل الأحماض الأمينية. ولذلك، من الصعب كفاءة الرد الدقيق لحساب.
- حساب وزن الراتنج المستخدم وفقا لتحميل الراتنج. التحميل العثور على الحاوية أو بروتوكول تحليل الراتنج والمعرب عنها في mmol/غرام. يمكن استخدام الصيغة التالية لحساب وزن الراتنج:
- تزن بعناية من راتينج كلوريد 2-تشلوروتريتيل (في حالتنا التحميل ملمول ~0.85)
- ضع الراتنج في سفينة فريتيد توليف مع المواصفات التالية: القدرة – 50 مل، "فريتيد قرص" – 25 ملم، المسامية – المتوسطة.
- إضافة 15 مل الميثان (DCM) إلى الراتنج.
- إلصاق السفينة التوليف إلى شاكر متغيرة سرعة ميكانيكية (قارورة شاكر/محرض)، وتشغيل السفن بزاوية 45 درجة (أفقي أو عمودي) لتحقيق أقصى قدر من الإثارة.
- تسمح الخرز راتنج الإنتفاخ عن 15 دقيقة تورم يعزز الغلة من رد فعل لأنه يسهل نشر الجزيئية، وإمكانية الوصول إلى موقع نشط، وتعزيز كفاءة اقتران.
- إضافة 8 مكافئات (2 ملمول لمقياس ميللي مول 0.25) من بولياميني المطلوب (سبيرميني، سبيرمدين، ديثيلينيترياميني، ديامينوبروباني 1، 3، إلخ) إلى الراتنج والسماح له بالرد على ح 5.
ملاحظة: فترة رد فعل أقل سيقلل العائد.
- القيام باختبار كايزر (انظر الجدول للمواد) لتأكيد اقتران ناجحة من بولياميني إلى الراتنج. اقتران ناجح من الأمينات الأولية غلة بلون البنفسجي/الزرقاء، والذي يتوافق مع أمين مجاناً.
- حماية المجموعة أمين الأولية باستخدام معادلات 4 من 1-(4,4-dimethyl-2,6-dioxocyclohex-1-ylidene)ethyl (Dde)، حلت في الميثانول اللامائى (15 مل)، من الرج ال رد فعل خليط بين عشية وضحاها11.
ملاحظة: وقت رد الفعل أقل يقلل المحصول.
- إجراء اختبار كايزر. ويؤكد عدم وجود اللون الأزرق من حبة راتنج الحماية الناجحة. في حالة فشل حماية أمين الابتدائي، كرر الخطوة السابقة.
- واستنزاف DCM غسل الراتنجات مرتين مع خليط من DCM و DMF (مل 2:1، 15).
- حل معادلات 20 (5 مليمول) دي-ثالثي بوتيل دي-كربونات (بنك) في DCM (20 مل) والسماح برد فعل على المضي قدما في ح 3.
- هل من الفينيل والكلورانيل اختبار (انظر الجدول للمواد) لتأكيد حماية كاملة من أمين الثانوية. اختبار إيجابية (الحماية) تعطي لون أصفر عديم اللون أو الضوء. تعطي الأمينات الثانوية مجانية لون أخضر/أزرق داكن، بينما تعطي الأمينات الأولية لون أحمر.
- يصفي الخليط المذيبات ويغسل مرتين بخليط من DCM و DMF (مل 2:1، 15).
- إضافة حل 2% من الهيدرازين في DMF (10 مل) ويهز ح 1.
- القيام باختبار كايزر لتأكيد deprotection ناجحة من أمين الأولية.
-
إضافة الأحماض الأمينية المطلوب بالتسلسل العكسي الذي يمكنك أن الكتابة/رسم لهم. الببتيدات مستمدة من تيرميني N إلى تيرميني ج ولكن يتم تصنيعه في الاتجاه المعاكس، (ج) أ. على سبيل المثال، ل PPA اشتراط الببتيد التالي الأساسية--جلفد--، إضافة حمض الأسبارتيك (د)، تليها فينيلألانين (F)، لوسين (L)، وأخيراً جليكاين (ز).
ملاحظة: لمعظم الأحماض الأمينية، كوكتيل اقتران التالية المناسب للمرفق إلى راتنجات بولياميني تحميل.
- مزيج مكافئات 4 (1 ملمول) من الأحماض الأمينية المحمية معتدلاً ومكافئات 3.95 من hexafluorophosphate 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-1,1,3,3-tetramethyluronium (هبتو) ومكافئات 15 من دييسوبروبيليثيل أمين (ديبا).
- حل لهم في خليط من DCM و DMF (1:1، 15 مل) و sonicate الكوكتيل ل 2 دقيقة (حتى الحل الكامل).
- انتظر مين 3 – 5 إضافية لضمان تفعيل حمض الكربوكسيلية في الحمض الأميني.
- إضافة خليط رد فعل إلى السفينة. القيام برد فعل ح 2-4 في درجة حرارة الغرفة.
ملاحظة: لقد وجدنا ما يلي كبدائل فعالة هبتو (عادة ما تتطلب كميات أقل من الأحماض الأمينية وعامل اقتران): كومو، بيبوب، حتو، DIC/أوكسيما.
- القيام باختبار كايزر لتأكيد نجاح اقتران.
- إزالة حماية معتدلاً-المجموعة من الأحماض الأمينية بإضافة إلى حل 20% من 4-ميثيل بيبيريديني (10 مل) في DMF. القيام بذلك مرتين، في كل مرة تهتز الخليط رد فعل لمدة 15 دقيقة.
ملاحظة: هو بديل فعال لإزالة معتدلاً الدنمركي الببرازين/12.
- أداء يغسل DCM (15 مل) بين الإضافات.
- القيام باختبار كايزر لتأكيد حماية دي ناجحة من الأحماض الأمينية.
- أغسل الراتنج جيدا لإزالة جميع آثار 4-ميثيل. أغسل الراتنج مرتين مع DMF (10 مل)، كل غسل دائم لمدة 5 دقائق، وأخيراً مع DCM (10 مل) لمدة 10 دقائق.
- إضافة جميع الأحماض الأمينية المتبقية بتكرار الاقتران تباعا وإزالة حماية الخطوات.
-
وأخيراً، بعد اقتران جميع الأحماض الأمينية المطلوبة، متزاوجة ذيل مسعور للحمض الأميني الأخير بناء بولياميني-الببتيد:
- إضافة معادلات 10 وظائف حمض الكربوكسيلية المرجوة إلى مكافئات 9.5 من هبتو ومكافئات 12 من ديبيا حله في خليط DCM و DMF (1:1، 20 مل).
ملاحظة: نضع نصب أعيننا مما قد تحتاج بعض ذيول نسبة مختلفة من المذيبات (عادة نسبة مئوية أكبر من DCM) أو الإضافة أو مذيب آخر مثل ن-ميثيلبيروليدوني (NMP).
- Sonicate كوكتيل لمدة 5 – 10 دقائق حتى انحلال (شهدنا أنه يستغرق وقتاً أطول للذيل تماما حل) وإضافة إلى السفينة.
ملاحظة: للمخلفات التي تحتوي على العديد من مواقع تفاعلية، سيحتاجون لتكون محمية من قبل اقتران لهم.
- القيام برد الفعل هذا (اقتران ذيل مسعور) على الأقل 5 ح، رغم أنه من الأفضل الاضطلاع بها بين عشية وضحاها لعائد أعلى.
2. PPA الانقسام من دعم قوي
والغرض من هذه الخطوة هو الانقسام PPA من الراتنج، وقم بإزالة مجموعات حماية بنك الصين من الأحماض الأمينية وبقايا بولياميني.
- أغسل الراتنج مع DMF (8 مل لمدة 2 دقيقة) ومرتين مع DCM (8 مل، في كل مرة لمدة 5 دقائق). قبل كل إضافة، استنزاف المذيب من السفينة. بمجرد يتم إجراء الغسيل الأخير، جاف الراتنج تحت الفراغ لمدة 15 دقيقة.
- إعداد الحل الانقسام باستخدام نسبة الخليط التالي: حامض trifluoroacetic 28:1:1 (تفا): ح2س: ترييسوبروبيل silane (نصائح). جعل 15 مل الانقسام كوكتيل إضافة 14 مل تفا، إلى 0.5 مل ح2س و 0.5 مل من نصائح.
- إضافة هذا الحل الانقسام إلى الراتنج ويهز ح 2 – 4 في درجة حرارة الغرفة.
- جمع الحل في 25 أو 50 مل جولة قارورة السفلي.
- التركيز تفا في الخلاء إلى 1 – 2 مل باستخدام مبخر دوراني في الحد من الضغط أثناء تدفئة الخليط عند 40 درجة مئوية (لا يتجاوز 55 درجة مئوية لتجنب التحلل PPA).
- بعد التبخر، إضافة حل تفا التي تم الحصول عليها (دروبويسي) إلى قارورة قاع جولة التي تتضمن الاثير الباردة اللامائى (15 مل). وهذا سوف يعجل فورا في PPA.
- وباﻹضافة إلى ذلك، إضافة الاثير الباردة اللامائى (5 مل) إلى قارورة الأصلية التي يتركز فيها تفا.
- Sonicate هذا قارورة لاستعادة المواد الصلبة إضافية والجمع بين الحل خماسي البروم ثنائي الفينيل من الخطوة 2، 6.
ملاحظة: يمكن غسلها ماصة نقل مع كمية صغيرة من DCM. تجنب إدخال DMF أثناء العملية لأنه يميل إلى تشكيل مادة هلام الشبيهة.
- ضع قارورة (المغطاة) داخل الثلاجة والسماح لها الوقوف بين عشية وضحاها زيادة هطول الأمطار.
- جمع المواد سرع بفراغ الترشيح باستخدام قمع تصفية قرص متكلس. أحجام المسام المثالي غرامة أو متوسطة.
- أغسل متسرعا مرتين مع الباردة البروم ثنائي الفينيل (5 – 10 مل) لإزالة أي المواد العضوية المتبقية.
3-تحديد من النفط الخام المنتج باستخدام طريقة استخدام قطره المجففة
-
إعداد مصفوفة للتحليل بطريقة إيجابية:
- لبدء تشغيل تحليل الوزن الجزيئي باستخدام مصفوفة بمساعدة الليزر الامتزاز/التأين (استخدام) الكتلي، إضافة 10 إلى 20 ملغ حمض α-سيانو-4-هيدروكسيسيناميك إلى أنبوب ميكروسينتريفوجي.
- إضافة حل للمياه/الاسيتو الانيتريل (1:1، 1، 0 مل) مع حامض Trifluoroacetic 0.1% (تفا). مزيج دقيق من فورتيكسينج.
ملاحظة: يجب استخدام هذه المصفوفة على الببتيدات مشحونة بشكل إيجابي. استخدام وضع سلبي مماثل ولكن يتطلب مصفوفة تحتوي على 9-أمينواكريديني مع الأمونيا 0.1% كمذيب المضافة.
- أضف 1 – 2 ميليلتر من العينة إلى لوحة الهدف الفولاذ المقاوم للصدأ لاستخدام والجاف للعينة في الهواء. أضف 1 – 2 ميليلتر من المصفوفة والجافة مرة أخرى.
ملاحظة: لديك اللوحات العلامات الدائرية الموزعة على طول لوحة الهدف المساعدة في تحديد موقع بقعة معينة.
- تحليل العينات باستخدام أداة التحقق من هويتهم. اليكتروسبراي التأين (ESI) بديلاً صالحاً لتأكيد هوية وبالاخذ.
4-تنقية وبالاخذ باستخدام تنقية عالية الأداء عكس المرحلة التحضيرية اللوني السائل ([هبلك])
-
حل متسرعا PPA في الحد أدنى من الاسيتو الانيتريل والمياه.
- وكقاعدة عامة، حل 100 مغ PPA الخام الجاف في أقل من 5 مل الاسيتو الانيتريل والمياه. قد تتطلب نسبة مئوية أكبر من الاسيتو الانيتريل حل وبالاخذ مسعور أكثر وقد يتطلب أيضا حجم أكبر من المذيبات بشكل عام، استناداً إلى المسؤول عن صافي وبالاخذ (الجدول 1).
- إذا حل كاملة لم تحدث، إضافة 1% تفا (تزاول أو ح2س). من الممكن أيضا إضافة كميات ضئيلة من المذيبات متوافقة أخرى بما في ذلك ديميثيلسولفوكسيدي أو الميثانول، أو الأيسوبروبانول (الحد من مضمونها إلى 5%).
| المذيبات | وبالاخذ مشحونة بشكل إيجابي | اتهم وبالاخذ سلبا |
| 0.1 تفا % في الماء | 0.1 NH %3 في المياه |
| 0.1% تفا في ACN | 0.1 NH %3 في تزاول |
الجدول 1: نظم المذيبات. نظام المذيبات للمقترح إيجابيا وسلبيا على المتهمين وبالاخذ.
- Sonicate PPA استخدام سونيكاتور القرن 20 دقيقة في 10 نبضات s مع Amp1 48% أو ح 2-3 في حمام الموجات فوق الصوتية.
-
بعد ذلك، عامل التصفية باستخدام عامل تصفية حقنه 0.45 ميكرومتر متبوعاً بالترشيح باستخدام عامل تصفية حقنه تترافلوروايثيلين (PTFE) ميكرومترات 0.20. ينبغي أن يكون الحل PPA واضحة وخالية من جميع المواد الجسيمية.
- إذا كان الترشيح من الصعب جداً، sonicate لفترة ممتدة من الوقت. وينصح بشدة أن الحل PPA المنقي فورا بعد الترشيح المحاقن، كمخزن لفترات طويلة قد يسبب ذلك لتجميع أو جيلاتي، مما سيستلزم إعادة سونيكاتيون، وربما إعادة الترشيح.
- أثناء وبعد تنقية، استخدام المذيبات الصف [هبلك] أو تلك التي يتم تصفيتها عن طريق غشاء 0.25 ميكرومتر المحاقن/عامل تصفية.
ملاحظة: تتكون الظروف المذيبات الأكثر شيوعاً لتنقية وبالاخذ في تدرج من ح2س وتزاول.
- استخدام أداة [هبلك] عكس مرحلة النموذجية لهذا البروتوكول. ينبغي أن يشمل شطف مبرمج تدرج، نظام توصيل المذيبات ثنائية، جهاز كشف الأشعة فوق البنفسجية قادرة على اكتشاف 220 و 254 نانومتر، وجامع كسر القابلة لبرمجة. ينبغي أن يكون معدل التدفق الأقصى 50 مل/دقيقة.
- استخدام C-18 عكس المرحلة العمود للانفصال. يمكن استخدام أعمدة الأبعاد التالية اعتماداً على كتلة صلبة يتم تنقيتها والصافي المسؤول من PPA (الجدول 2).
| رسوم PPA | حجم الجسيمات | حجم العمود | كتلة من النفط الخام PPA |
| + ve المشحونة | 5 ميكرومترات | 150 x 30 ملم | 170 ملغ |
| -ve المشحونة | 5 ميكرومترات | 150 x 30 ملم | 170 ملغ |
| + ve المشحونة | 5 ميكرومترات | 150 × 21.2 مم | 90 ملغ |
| -ve المشحونة | 5 ميكرومترات | 150 × 21.2 مم | 90 ملغ |
الجدول 2: اقترح الأعمدة: أبعاد العمود وأحجام الجسيمات وقدرة الحمولة القصوى للحقنة ل C18 عكس المرحلة [هبلك] الأعمدة
- حقن PPA وحدة يحدد كلا قدرة العمود وحجم الحلقة الحقن [هبلك]. تشغيل أسلوب التدرج [هبلك] وفقا للإعدادات في الجدول 3 (الوقت شطف من 40 دقيقة).
| الوقت | المذيب (الاسيتو الانيتريل) | ب المذيبات (المياه) | معدل التدفق (مل/دقيقة) |
| 0 | 5% | 95 في المائة | معدل التدفق يعتمد على عمود التعبئة وحجمه. |
| 2 | 5% | 95 في المائة |
| 35 | 95 في المائة | 5% |
| 38 | 100 ٪ | 0% |
| 40 | 5% | 95 في المائة |
الجدول 3: التدرج المقترح: واقترح المرحلة عكس التدرج عرض التكوين النسبي للمياه مقابل الاسيتو الانيتريل على مدى فترة من الزمن. معدل تدفق سيتوقف على مواصفات العمود.
-
تحليل الكسور التي جمعت في أنابيب الاختبار المختلفة باستخدام استخدام وتحديد أنبوب (أو أنابيب) التي تحتوي على PPA. هذا هو تقييم دراسة الوزن الجزيئي وجدت في كل أنبوبة.
- تحقق نقاء الكسور في التحليل [هبلك]. استخدام نظام تدرج [هبلك] مزودة بجهاز لكشف الأشعة فوق البنفسجية بتعيين 220 نانومتر.
- إذا كان هناك من الشوائب، القيام دورة إضافية لتنقية قبل [هبلك]. يمكن تقليص التدرج أعلاه المستخدم محضرة [هبلك] للاستخدام مع [هبلك] تحليلية باستخدام البرمجيات على شبكة الإنترنت تحويل العمود. يكون كل جزء كثير % إيه ناين فايف محض لتحديد الخصائص الفيزيائية أو البيولوجية التقييم.
- جمع الكسور في قارورة كبيرة مستديرة القاع أو قارورة التبخر وإزالة جميع الاسيتو الانيتريل والأهم من ذلك الماء. ينبغي أن يكون الحل النهائي PPA ليس أكثر من 10 مل.
- تحويل هذا التركيز إلى أنبوب الطرد مركزي 50 مل. نصح أن وبالاخذ مواد شبيهة بمواد التنظيف؛ وهكذا، سيتم إنشاء فقاعات أثناء تبخر المذيب. وقد وجدنا أن إضافة الكحول الاثيلي يقلل تكوين فقاعة.
- مركزات الركاز من فراغ. أثناء تبخر فراغ، قد كمية كبيرة من PPA التمسك بجدران الحاوية. استرداد هذا بدهن الجدار قارورة ماء [هبلك] مرارا وتكرارا. يجب أن يكون حجم مجتمعة PPA مركزة ورينساتي لا يزيد عن 30 مل.
- ضع محلول مائي داخل أنبوب 50 مل.
-
فلاش تجميد هذا الحل PPA في النيتروجين السائل:
ملاحظة: فلاش نتائج تجميد في بلورات الثلج الصغيرة التي سوف سامية أسرع في ليوفيليزير. وعلاوة على ذلك، قد تسمح تجميد أبطأ تشكيل هياكل supramolecular الذاتي تجميعها. وثمة بديل آخر (ولكن أقل من المرغوب فيه) هو تجميد تدريجيا في ثلاجة-80 درجة مئوية، أو تجميد استخدام الثلج الجاف + خليط الأسيتون
- قبل وضع أنبوب الطرد المركزي في ليوفيليزير، التسلخات أو تخفيف الغطاء للأنبوب للسماح للرطوبة للهروب العينة والحصول على جمعها في وحدة التبريد. تعيين وحدة ليوفيليزيشن تعيين إلى-54 درجة مئوية و 0.016 [مبر].
ملاحظة: خيار آخر هو إزالة الغطاء ووضع مسح (مع شريط المطاطي) على رأس فتح. أيضا، وقد وجدنا أن تجميد عينات بزاوية أو كسر الجليد إلى أجزاء صغيرة يسمح ليوفيليزيشن أسرع وأفضل بسبب زيادة مساحة سطح.
- إذا كان يبدأ الصلبة تذوب، قد يشير هذا إلى آثار مذيب عضوي (عادة الاسيتو الانيتريل) موجودة. كرر الخطوة التجميد وتقييم حالة ليوفيليزيشن.
- في حالة استمرار ذوبان، هناك اثنين من الحلول المحتملة:
- تقسيم العينة في جزأين (توضع في أنابيب)، تخفف بالماء، وتجميد مرة أخرى. لا تستخدم هذا الحل غالباً لكميات كبيرة من المذيبات العضوية قد تلحق الضرر المعدات.
- وبدلاً من ذلك، وضع العينة في قارورة وكذلك تتبخر المذيبات العضوية تحت الفراغ. ليوفيليزينج عينة الذي على شكل سائل وعادة ما يؤدي إلى الاهتزاز وفقدان لمجمع PPA.
5-تخزين وبالاخذ
- شددت مخزن وبالاخذ في-20 درجة مئوية مع القبعات ومختومة مع بارافيلم على أنبوب مع تسمية الصحيحة.
- قبل الاستخدام، تجلب PPA العودة إلى درجة الحرارة المحيطة في فراغ غرفة لتجنب التكثيف لبخار الماء في وبالاخذ.