$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1-الكافيين الاستخراج في "تعليق خلية" من آرابيكا جيم- ل.
- استخدام تعليق خلية آرابيكا جيم- 9. المحافظة على أن الإيقاف بثقافات فرعية مرة كل أسبوعين في المتوسط موراشيجي وسكوغ في pH 4.3 مع ثابت 100 لفة في الدقيقة تهتز عند 25 درجة مئوية تحت ضوء مستمر (8.3 واط/م2).
- حصاد الخلايا تحت فراغ الترشيح باستخدام ورق الترشيح المسام ميكرومتر 11 وقمع بوخنر.
- تسجيل الوزن الطازج للخلايا التي تم جمعها باستخدام مقياس والتفاف عليها في رقائق الألومنيوم، وتجميدها في نيتروجين سائل وإبقائهم في-80 درجة مئوية حتى التحليل.
- ليوفيليزي مادة 72 ح الخلوية المجمدة.
- تسجيل وزن الخلايا المجففة بالتبريد من أجل تقدير العائد من الوزن الجاف.
- تخزين المواد مسحوق في أكياس البولي إيثيلين قابلة لإعادة الاستخدام (9 سم × 7.5 سم). مسرات المواد إلى مسحوق ناعم ومخزن في مجفف حتى الاستخدام.
- قياس 0.5 غرام المادة الجافة الخلوية بمقياس تحليلي وإضافته إلى قارورة زجاج (25 مل).
- أضف 10 مل الأسيتون في الخلايا المجففة بالتبريد وتخلط في خلاط دوامة لمدة 30 ثانية للتجانس. ثم ختم قارورة مع رقائق الألومنيوم.
- مزيج من 100 لفة في الدقيقة باستخدام المدورة في درجة حرارة الغرفة (25 درجة مئوية) ح 5.
- نقل جميع المواد إلى 15 مل الأنبوبة المخروطية وأجهزة الطرد المركزي في 13,000 س ز لأدنى 10 نقل السائل المرحلة إلى أنبوب جديد وتقلل بذلك جفاف في درجة حرارة الغرفة في غطاء الدخان.
- ريسوسبيند العينة مع 25 ميليلتر من الأسيتون.
2-شروط التقييم للكافيين برقيقة الطبقة اللوني (TLC)-قياس كثافة
- تطبيق 1 ميليلتر من استخراج الكافيين حراكه سابقا إلى مرحلة ثابتة.
ملاحظة: يتم استخدام لوحات هلام السليكا (F254) كمرحلة ثابتة. قبل تطبيق هذه العينات، ووضعت اللوحات مع 10 مل من كلوروفورم-الميثانول [9:1 v/v] في دائرة لوني (14 سم × 12 سم × 9.5 سم)، واللوحات تم تجفيفها في درجة حرارة الغرفة. خصائص لوحة الكروماتوغرافي التي تطبق فيها العينات مبينة في الشكل 1. وكان المشبعة الدائرة لمدة 30 دقيقة مع المذيب قبل وضع اللوحة. لوحات TLC ينبغي التعامل مع استخدام القفازات لتجنب التلوث.
- تطوير TLC في قاعة الفصل اللوني مع 10 مل من المرحلة المتنقلة الحلقي-الأسيتون [40:50 v/v].
ملاحظة: يسمح هذا الخليط فصل الكافيين في معامل استبقاء 0.34 (Rf).
- إزالة لوحة TLC من الدائرة وأتركها تجف تماما في درجة حرارة الغرفة.
- تصور الفرق الكافيين في الطول الموجي القصير الأشعة فوق البنفسجية (الأشعة فوق البنفسجية، 254 نانومتر). استخدام مصباح الأشعة فوق البنفسجية مدمجة. بالإضافة إلى ذلك، أن استخدام نظارات لهذه الخطوة، مع الحماية من الأشعة فوق البنفسجية.
- قياس مستويات الكافيين بقياس كثافة في 273 شمال البحر الأبيض المتوسط. يتم التحكم في الصك مع البرمجيات اللوني.
3-الحمض النووي الريبي (الرنا) العزل
- أن تعليق خلية من الخطوة 1، 1 والفراغ فيلتراتي مع ورق الترشيح (حجم المسام ميكرومتر 11).
- جمع المواد الخلوية من ورق الترشيح وتزن بها 0.5 غرام مواد الخلوية على توازن التحليلي وحزمة في رقائق الألومنيوم. تجميد العينة مع سائل ن2.
- ماسيراتي العينة الخلية في قذيفة هاون خزف مع النتروجين السائل وإضافة 1 مل كاشف عزل الحمض النووي الريبي حتى تجانس.
ملاحظة: تعقيم هاون الخزف في فرن دثر في 300 درجة مئوية لكاشف العزلة h. 6 الحمض النووي الريبي يحتوي على الفينول و isothiocyanate غوانيدين والمكونات الأخرى.
- نقل 500 ميليلتر من العينة إلى أنبوب ميكروسينتريفوجي عقيمة (1.5 مل). إضافة 300 ميليلتر من الكحول كلوروفورم-إيسواميل (24:1) و 300 ميكروليتر من الفينول متوازن (pH 8.0).
- خلط العينة مع خلاط دوامة وثم الطرد المركزي في 20,000 x ز لمدة 15 دقيقة في 4 درجات مئوية.
- نقل 300 ميكروليتر المرحلة العليا لأنبوب ميكروسينتريفوجي. إضافة 200 ميكروليتر من الايزوبروبانول. احتضان الأنبوب ح 1 في-20 درجة مئوية.
- الطرد المركزي الأنبوب في س 12,000 ز لمدة 10 دقائق عند 4 درجة مئوية، ومن ثم صب الطور السائل.
- أضف 1 مل إيثانول (70 في المائة) لتشكيل بيليه في الأنبوب. الطرد المركزي في س 12,000 ز لمدة 10 دقائق، وصب. كرر هذه الخطوة مرتين.
- الجاف للعينة 1.5 ح في درجة حرارة الغرفة (25 درجة مئوية). ريسوسبيند استخراج الحمض النووي الريبي مع 25 ميكروليتر من ثنائي إثيل بيروكاربوناتي (ديبك)-المياه المعالجة.
ملاحظة: لاستخراج الحمض النووي الريبي، استخدام المياه المعالجة مع 0.1% ديبك v/v.
4-الحضانة للحمض النووي الريبي نسخة مع ديوكسيريبونوكليسي (الدناز)
- في أنبوب ميكروسينتريفوجي عقيمة، إضافة استخراج 2 ميكروغرام من مجموع الجيش الملكي النيبالي. أضف 1 ميكروليتر من 10 س رد فعل المخزن المؤقت (100 مم تريس-HCl، 25 مم مجكل2، 1 مم كاكل2). إضافة ميكروليتر 1 من 1 يو/ميليلتر الدناز.
- تحقيق رد الفعل على وحدة تخزين نهائي من 10 ميكروليتر مع المياه المعالجة ديبك. مزيج عينة وأجهزة الطرد المركزي بإيجاز في 2,000 س ز لمدة 1 دقيقة.
- احتضان العينة في 37 درجة مئوية لمدة 30 دقيقة.
- وقف رد الفعل مع إضافة 1 ميكروليتر من 50 مم ثنائي اتهيلينيديامينيتيتراسيتاتي ثنائي هيدرات (نا2يدتا) واحتضان العينة عند 65 درجة مئوية لمدة 10 دقائق.
- تحليل سلامة الجيش الملكي النيبالي بالتفريد [اغروس] هلام.
- إعداد 1% [اغروس] هلام قياسية ووصمة عار مع 1 ميليلتر من 3 × إينتيركالاتينج الحل وصمة عار الحمض النووي.
- تطبيق 500 نانوغرام من الحمض النووي الريبي [اغروس] هلام وتشغيل الهلام.
- تصور تكامل الجيش الملكي النيبالي باستخدام نظام توثيق صور هلام.
- استخدام الحمض النووي الريبي كالقالب لتوليف كدنا قبل المنتسخة العكسية.
5-يكمل الحمض الخلوي الصبغي (كدنا) التوليف
- إضافة 2.5 ميكروغرام من مجموع الجيش الملكي النيبالي لأنبوب ميكروسينتريفوجي. أضف 1 ميكروليتر من التمهيدي اليغو-ديوكسيثيميني (dT) وملء الأنبوب إلى وحدة تخزين نهائي ميكروليتر 13 مع المياه خالية من نوكلاس. خلط العينة وثم الطرد المركزي س 2,000 ز لمدة 1 دقيقة.
- احتضان العينة على 65 درجة مئوية لمدة 5 دقائق ثم على 4 درجة مئوية لمدة 2 دقيقة.
- إضافة ميكروليتر 4 من 5 س رد فعل المخزن المؤقت المستخدم المنتسخة العكسية، 2 ميكروليتر من مزيج تريفوسفاتيس (دنتبس) ديوكسينوكليوتيدي (10 ملم لكل دنتب) وميكروليتر 1 لعكس المنتسخة (200 يو/ميليلتر). المزيج بلطف والطرد المركزي في س 2,000 ز لمدة 1 دقيقة.
- احتضان العينة عند 45 درجة مئوية لمدة 50 دقيقة ومن ثم على 70 درجة مئوية لمدة 10 دقائق.
- قياس تركيز كدنا استخدام جهاز المطياف الضوئي الأشعة فوق البنفسجية.
- استخدام كدنا كالقالب البلمرة المتسلسل (PCR).
ملاحظة: استخدمت رد فعل المخزن المؤقت 10 × (الخطوة 4.1.1) وتتركز 5 x مرات (الخطوة 5، 3)، على التوالي.
6-في الوقت الحقيقي PCR الكمي (qPCR) لتضخيم الجين CCS1
- إضافة ميكروليتر 7.5 من "بوليميراز الدنا" بوليميراز 2 × (0.1 U/mL) و 0.1 ميكرو من 5-كاربوكسي-س-والرودامين (روكس) إلى أنبوب ميكروسينتريفوجي بكر.
ملاحظة: بوليميراز "الدنا بوليميراز" بداية ساخنة 2 x استخدمت كحل 2 × مركزة.
- إضافة 5 ميكروليتر من المياه خالية من نوكلياسي.
- إضافة ميكروليتر 0.75 كل من 10 ميكرومترات إلى الأمام وعكس التمهيدي لتضخيم الجين CCS1 (AB086414) (إلى الأمام:-ككتجتاتككتجكجاتجاكا 5 '-3' وعكس:-آكاكتاتكاتاجاجككتتج 5 '-3'). استخدام كبسولة تفجير ل tubulin كالجين حفظ البيت في رد فعل منفصلة (إلى الأمام:-جتجكككاكتججتكا 5 '-3' وعكس: 5 '-ككتككتككاتاككتكاكك-3')9.
- إضافة 600 نانوغرام قالب كدنا.
- القيام برد فعل التضخيم عند 50 درجة مئوية لاحتضان 2 دقيقة و 95 درجة مئوية للحد الأدنى 5 رد فعل في نظام PCR الوقت الحقيقي لدورات 40 من 95 درجة مئوية لمدة 30 ثانية، 60 درجة مئوية لمدة 30 s و 72 درجة مئوية لمدة 30 ثانية.
- احتضان العينة عند 50 درجة مئوية عن 30 ثانية و 20 درجة مئوية لمدة 10 ق.
- تحليل البيانات مع البرنامج PCR.
- حساب التعبير النسبية من 2-وصف أسلوبΔΔCT ليفاك وشميتجين (2001)12.
ملاحظة: تحليل رد فعل على عنصر تحكم الذي يحتوي على كافة المكونات باستثناء القالب الحمض النووي (لا قالب التحكم، المجلس الوطني الانتقالي) الكواشف تجاهل الملوثة أو التضخيم مبلمر.
7-مجموع البروتين مقتطف من "تعليق خلية" من آرابيكا جيم- ل.
- تصفية تعليق خلية تحت الفراغ مع ورقة تصفية المسام المتوسطة.
- وزن 1 غرام مواد الخلوية وحزمة في رقائق الألومنيوم.
- تجميد العينة مع النتروجين السائل. ماسيراتي العينة في قذيفة هاون خزف معقمة للحصول على مسحوق ناعم.
- نقل العينة إلى قنينة زجاجية وإضافة 2.5 مل من استخراج المخزن المؤقت (400 مم تريس (هيدروكسيميثيل) أمينوميثاني هيدروكلوريد (تريس-HCl)، على درجة الحموضة 8.0، التي تحتوي على 10 مم β-ميركابتوثانول، 5 ملم Na2يدتا واسكوربات الصوديوم 0.5% (w/v).
- مزيج من العينة في دوامة خلاط لمدة 2 دقيقة.
ملاحظة: من المهم أن يتم الاحتفاظ العينة على الجليد لمنع تمسخ البروتين.
- نقل 500 ميليلتر مختبرين في قنينات المبردة (2 مل) والطرد المركزي العينة في 20,000 x ز لمدة 20 دقيقة في 4 درجات مئوية. تخزين العينات في-72 درجة مئوية حتى الاستخدام.
- قياس تركيز البروتين العينة في 562 نانومتر في جهاز المطياف الضوئي استخدام مقايسة حمض بيسينتشونينيك مع ألبومين المصل البقري كالمعيار.
8. التحليل الأنزيمي للكافيين سينثاز
- إعداد خليط رد فعل في أنبوب ميكروسينتريفوجي التي تحتوي على 200 ميكرومتر سام، 4.07 بيكيريل من الميثيل [ح]3[--سام، 200 ميكرومتر الثيوبرومين، 200 ميكرومتر مجكل2، والكافيين 5 ميكرومتر. زيادة الحجم إلى 200 ميليلتر مع 100 ملم تريس-HCl في الرقم الهيدروجيني 8.0.
- الاحتفاظ بالانبوب ميكروسينتريفوجي على الجليد وإضافة وحدة تخزين القابلة للذوبان الكسر التي تحتوي على 7-9 ملغ بروتين. ثم، مزيج من دوامة واحتضانها لمدة 30 دقيقة عند 30 درجة مئوية في حمام/مدوار ترموستاتي. لمجموعة من عدة عينات، احتضان كل عينة في التكرارات في فترات 1 دقيقة لإعطاء وقت كاف لوقف ردود الفعل لجميع العينات في فترة وقت المحدد من 30 دقيقة.
- أضف 1 مل كلوروفورم التوقف عن رد فعل وثم هزة العينة مع خلاط دوامة. هزة العينة باستخدام خلاط دوامة لمدة 3 دقائق لإزالة الكافيين المشعة في المذيب.
- الطرد المركزي العينات في س 11,000 ز لمدة 5 دقائق واسترداد وحدة تخزين ميليلتر 900 بعناية. ثم قم بنقل العينات إلى قارورة التﻷلؤ.
- تتبخر كلوروفورم لإتمام جفاف في غطاء محرك السيارة في درجة حرارة الغرفة 25 درجة مئوية. إضافة 5 مل سائل التﻷلؤ إلى القنينة وخلط العينة.
- تحليل النشاط الإشعاعي تدمج الكافيين في عداد التﻷلؤ.