سرطان الدم الليمفاوي المزمن (CLL) يمثل سرطان الدم الأكثر شيوعاً في البالغين في البلدان الغربية، نستعرض تراكم متميزة CD19 و CD23 CD5 معربا عن ب نضجاً الخلايا1. معظم المرضى يحمل بالطبع مرض كسول، الذي ليس بالضرورة معاملة محددة لسنوات عديدة. وفي المقابل، تظهر بعض المرضى التقدم السريع التي تتطلب التدخلات العلاجية الفورية مع العلاج الكيميائي المناعي أو غيرها العلاجات المستهدفة2،3. العامل النووي لتنشيط خلايا تي (نفات) عائلة من عوامل النسخ التحكم المختلفة الإنمائية وعمليات التنشيط في الخلية العديد أنواع4،،من56. مؤخرا أثبتنا overexpression وتفعيل NFAT2 في خلايا CLL الدستورية من المرضى الذين يعانون من المرض كسول7. هنا، وهو ينظم إقامة دولة لا تستجيب لتحفيز مستقبلات الخلية بتسمي استعطال7. لإثبات أن NFAT2 بربط البروتين الخاصة بالخلايا اللمفاوية تيروزين كيناز (لك) المروج وينظم لك التعبير في CLL الخلايا البشرية، الإنزيم إيمونوبريسيبيتيشن الكروماتين محددة (شريحة) والعاملين.
رقاقة واحد من عدة تقنيات للتحقيق في دور عوامل النسخ في التعبير الجيني8. أحكام مدبرة التعبير الجيني بطريقة معقدة جداً من المنظمين عدة مع عوامل النسخ أخذ جزءا لا يمكن الاستغناء عنه في هذه العملية9،10،،من1112. وتم تحديد عوامل النسخ تنظيم التعبير الجيني في إطار المكانية والزمانية في عديدة الأنواع (مثل التنمية والتمايز)13،،من1415، 17،،من 1618. الأخطاء في آليات التحكم المعقدة التي تنطوي على عوامل النسخ يمكن أن يؤدي إلى مجموعة متنوعة من العمليات باثولوجي بما في ذلك السرطان19،20. ومن ثم، تحديد عوامل النسخ وأهدافها الخاصة بكل منها قد توفر السبل العلاجية رواية21،22. تتوفر طرق عدة للتحقيق في هذا المجال مثيرة للاهتمام مثل رقاقة والتنقل الغرواني الكهربي التحول المقايسة (أمسا) ومختلف فحوصات الحمض النووي المنسدلة وفحوصات مراسل8،،من1112، 23 , 24.
لإثبات أن عامل نسخ يتفاعل مع مناطق محددة من الجينوم هو المجراة، رقاقة أسلوب مثالي25. لهذا الغرض، تصميمهما الحمض النووي والبروتينات المرتبطة بها في الخلايا الحية هي استخدام الإشعاعات فوق البنفسجية أو فورمالدهايد (رقاقة cross-linked، شكيب). تم حذف هذه الخطوة للحصول على أفضل الحمض النووي والبروتين الانتعاش في رقاقة (نكيب) أصلي ما يسمى26. هي المنفصمة مجمعات البروتين الحمض النووي في وقت لاحق من سونيكيشن إلى شظايا من حوالي 200-500 زوج قاعدي (bp) وإيمونوبريسيبيتاتيد من بين الأنقاض الخلية استخدام جسم معين ضد عامل النسخ للفائدة. أجزاء الحمض النووي المرتبطة بها ثم تنقيته وتتميز ببكر والاستنساخ الجزيئي وتسلسلها. استخدام تقنيات بديلة [ميكروارس] (رقاقة على رقاقة) أو تسلسل الجيل القادم (الرقائق-Seq) لتحليل إيمونوبريسيبيتاتيد الحمض النووي.
رقاقة قدم لأول مرة قبل جيلمور و Lis عام 1984 عندما كانت تستخدم الأشعة فوق البنفسجية ضوء تساهمي قياس الحمض النووي والالتزام البروتينات في المعيشة البكتيريا27. تحلل الخلايا وإيمونوبريسيبيتيشن من البكتيريا الحمض النووي الريبي بوليميراز، استخدمت تحقيقات محددة من الجينات المعروفة لخريطة توزيع في فيفو وكثافة من الحمض النووي الريبي بوليميراز. بعد ذلك استخدمت الأسلوب المحققون نفس لتحليل توزيع التوكسينات رنا بوليميراز الثاني على جينات بروتين الصدمة الحرارة في المورفولوجية28. وقد صقل المقايسة شكيب فارشافسكي وزملاء العمل الذين أول من استخدم فورمالدهايد العابرة للربط إلى دراسة رابطة هيستون H4 مع الحرارة صدمة البروتين الجينات29،30. النهج نكيب، الذي يحمل في الاستفادة من انتعاش الحمض النووي والبروتين أفضل نتيجة سليمة وبطبيعة الحال [ابيتوبس]، وذلك، أولاً وصف أكبر جسم خصوصية، حبيس والزملاء في عام 198831.
ميزة رقاقة بالمقارنة مع التقنيات الأخرى لتحليل التفاعلات البروتين الحمض النووي هو في الواقع، أن التفاعل الفعلي لعامل النسخ يمكن التحقيق في فيفو وعدم إجراء تحقيقات أو ظروف صناعية تم إنشاؤها بواسطة المخازن المؤقتة أو المواد الهلامية ويعمل11،،من812. عن طريق الجمع بين شرائح مع تسلسل الجيل القادم، يمكن تحديد أهداف متعددة في وقت واحد.
القيود الرئيسية لهذا الأسلوب يتم تطبيقه محدودا لفحوصات على نطاق واسع في الكائنات الحية سليمة25. كما يمكن تحليل أنماط التعبير الجيني التفاضلي الصعبة باستخدام تقنيات الرقائق إذا كان يعبر عن البروتينات منها فقط عند مستويات منخفضة أو خلال الإطارات الزمنية الضيقة. عامل يحتمل أن تحد آخر هو توافر جسم مناسبة ملائمة لرقاقة11.
البروتوكول رقاقة المعروضة هنا يمكن أن تستخدمها لتحديد الجينات المستهدفة عامل النسخ في فيفو الكمي PCR الوقت الحقيقي (قرة-PCR). على وجه التحديد، كان الهدف لتحديد الجينات المستهدفة رواية من NFAT2 في CLL. رقاقة اختير بسبب قدرتها على إظهار ربط NFAT2 إلى مناطق المروج الجينات المستهدفة المختلفة تحت الظروف الطبيعية في خلايا المريض CLL الإنسان مباشرة.