Erratum: Epithelial Cell Repopulation and Preparation of Rodent Extracellular Matrix Scaffolds for Renal Tissue Development

527 مشاهدة

مارس 3, 2017

في هذه المقالة

ملخص

An erratum was issued for Epithelial Cell Repopulation and Preparation of Rodent Extracellular Matrix Scaffolds for Renal Tissue Development.

The human RCTEC/RCTE cell stocks used here and in Caralt et al., 2015, Uzarski et al., 2015 were originally provided by Dr. Loghman-Adham (then at St. Louis University) to co-author Dr. Wandinger-Ness (University of New Mexico) through an MTA in 2001. The SV40 immortalized human RCTEC/RCTE cells were characterized as being of distal tubule cell line as detailed in Loghman-Adham et al., 2003. On the basis of recent short tandem repeat (STR) DNA sequencing (Performed by IDEXX BioResearch) of the earliest passages of the RCTEC/RCTE cell stocks it became evident the cells were of mixed lineage. Further analyses of PCR products using QIAxcel capillary electrophoresis demonstrated the presence of a canine product. The product was sequenced and established to be of canine origin. A set of canine specific STR markers were compared to the sample and showed that the sample had a genetic profile with 92% identity to the MDCK cell line.  Later cell stocks that were used in the present publication were STR profiled and showed drift to 100% MDCK lineage. Despite being of canine origin, rather than human as was previously thought, MDCK is similarly a distal tubule epithelial cell line. For this reason, previous interpretation and conclusions drawn using these cells here and in Caralt et al., 2015, Uzarski et al., 2015 remain sound, but for purposes of rigor, reproducibility and experimental validation by others we report on this misidentification. This information will also be reported for listing on the International Cell Line Authentication Committee (ICLAC) database (http://iclac.org).

الملخص

An erratum was issued for Epithelial Cell Repopulation and Preparation of Rodent Extracellular Matrix Scaffolds for Renal Tissue Development.

The human RCTEC/RCTE cell stocks used here and in Caralt et al., 2015, Uzarski et al., 2015 were originally provided by Dr. Loghman-Adham (then at St. Louis University) to co-author Dr. Wandinger-Ness (University of New Mexico) through an MTA in 2001. The SV40 immortalized human RCTEC/RCTE cells were characterized as being of distal tubule cell line as detailed in Loghman-Adham et al., 2003. On the basis of recent short tandem repeat (STR) DNA sequencing (Performed by IDEXX BioResearch) of the earliest passages of the RCTEC/RCTE cell stocks it became evident the cells were of mixed lineage. Further analyses of PCR products using QIAxcel capillary electrophoresis demonstrated the presence of a canine product. The product was sequenced and established to be of canine origin. A set of canine specific STR markers were compared to the sample and showed that the sample had a genetic profile with 92% identity to the MDCK cell line.  Later cell stocks that were used in the present publication were STR profiled and showed drift to 100% MDCK lineage. Despite being of canine origin, rather than human as was previously thought, MDCK is similarly a distal tubule epithelial cell line. For this reason, previous interpretation and conclusions drawn using these cells here and in Caralt et al., 2015, Uzarski et al., 2015 remain sound, but for purposes of rigor, reproducibility and experimental validation by others we report on this misidentification. This information will also be reported for listing on the International Cell Line Authentication Committee (ICLAC) database (http://iclac.org).

البروتوكول

تم إصدار تصويب لـ إعادة تعمير الخلايا الظهارية وتحضير سبيكة المصفوفة خارج الخلوية للقوارض لتطوير الأنسجة الكلوية.

إن مخزونات خلايا RCTEC/RCTE البشرية المستخدمة هنا وفي دراسة Caralt et al., 2015، ودراسة Uzarski et al., 2015 قد تم توفيرها في الأصل من قبل الدكتور Loghman-Adham (الذي كان يعمل حينها في جامعة سانت لويس) للمؤلف المشارك الدكتور Wandinger-Ness (جامعة نيو مكسيكو) من خلال اتفاقية نقل مواد (MTA) في عام 2001. وقد تم توصيف خلايا RCTEC/RCTE البشرية الخالدة بواسطة SV40 على أنها سلالة خلايا أنبوبية قصية كما هو مفصل في Loghman-Adham et al., 2003. وبناءً على تسلسل الحمض النووي للتكرارات الترادفية القصيرة (STR) الأخير (الذي أجراه مختبر IDEXX BioResearch) للممرات المبكرة من مخزونات خلايا RCTEC/RCTE، أصبح من الواضح أن الخلايا كانت ذات سلالة مختلطة. وأظهرت تحليلات إضافية لمنتجات PCR باستخدام الرحلان الكهربائي الشعري QIAxcel وجود منتج كلبي. تم تسلسل هذا المنتج وثبت أنه من أصل كلبي. وبمقارنة مجموعة من علامات STR الخاصة بالكلاب مع العينة، تبين أن العينة تمتلك ملفاً جينياً يتطابق بنسبة 92% مع سلالة خلايا MDCK.  أما مخزونات الخلايا اللاحقة التي استُخدمت في المنشور الحالي فقد خضعت لتوصيف STR وأظهرت انحرافاً ليصل إلى سلالة MDCK بنسبة 100%. وعلى الرغم من كونها من أصل كلبي، بدلاً من كونها بشرية كما كان يُعتقد سابقاً، فإن MDCK هي أيضاً سلالة خلايا ظهارية أنبوبية قصية. لهذا السبب، تظل التفسيرات والاستنتاجات السابقة المستخلصة باستخدام هذه الخلايا هنا وفي Caralt et al., 2015، و Uzarski et al., 2015 سليمة، ولكن لأغراض الدقة وقابلية التكرار والتحقق التجريبي من قبل الآخرين، فإننا نبلغ عن هذا الخطأ في التحديد. كما سيتم الإبلاغ عن هذه المعلومات لإدراجها في قاعدة بيانات اللجنة الدولية لمصادقة سلالات الخلايا (ICLAC) على الرابط (http://iclac.org).

الإفصاحات

No conflicts of interest declared.

إعادة الطباعة والأذونات

الوسوم

MDCK STR