وافق جميع الإجراءات الحيوان الفئران التي أجريت وفقا للمبادئ التوجيهية "مكتب الطب البيطري الفدرالي السويسري" والبروتوكولات الحيوان سلطات بيطري محلي.
1. الإنفلونزا العدوى من الفئران CD11c-يفب
- السلامة الأحيائية
ملاحظة: الماوس تكيف السلالة من الإنفلونزا H1N1 A/Puerto ريكو/8/34 (PR8) كان يزرع في البويضات المخصبة وتنقيته ومعاير كما هو موضح سابقا21. جميع الخطوات التي تنطوي على الحيوانات المصابة أو عينات بيولوجية كانت تجري بالسلامة الأحيائية مجلس الوزراء وفقا لمستوى السلامة الأحيائية (BSL) شروط 2.
- تنظيف مجلس الوزراء السلامة الأحيائية بمحلول إيثانول 70% قبل وبعد الإجراء العدوى.
- تجاهل جميع النفايات المنتجة خلال هذا الإجراء السليم الذي السلامة الأحيائية المبادئ التوجيهية التالية (http://www.who.int/csr/resources/publications/biosafety/Biosafety7.pdf). التخلص من النفايات الصلبة في صناديق أوتوكلافابل والسوائل الملوثة في أكياس بلاستيكية مملوءة بالمطهر الطبي أو حل إيثانول 70%.
- عدوى الإنفلونزا يعطي داخل الآنف
ملاحظة: B6. واستخدمت في هذه الدراسة cg-Tg(Itgax-Venus) 1Mnz/ي (CD11c-يفب)22 على خلفية C57BL/6J. وأبقى على الفئران في مرفق خالية من مسببات الأمراض خاصة في معهد للبحوث في الطب الحيوي.
- مكان كحد أقصى 5 العمر والجنس-المطابقة (ستة إلى ثمانية عاماً الأسبوع) CD11c-يفب الفئران في قفص. الانتظار لمدة يومين على الأقل للفئران التأقلم لظروف السكن قبل الإجراء العدوى.
- تذويب PR8 المخزون وإعداد تمييع المقابلة باستخدام x 1 الباردة المالحة العازلة فوسفات دولبيكو لتعديلها بدون كلوريد الكالسيوم وكلوريد المغنيسيوم (PBS) للحصول على تركيز نهائي 200 لوحة تشكيل وحدات (بفو) في 30 ميليلتر. إبقاء الفيروس تمييع على الجليد أثناء الإجراء بأكمله.
ملاحظة: ينصح المعايرة لكل دفعة من فيروس الإنفلونزا قبل استخدامه التأكد من جرعة إصابة بدقة.
- حقن جرعة من الكيتامين (100 مغ/كغ) وإكسيلازيني (10 مغ/كغ) إينترابيريتونيلي (القائمة) باستخدام حقنه 1 مل إبرة ز 26.
- الانتظار حتى يتم الماوس تماما تخديره (خسارة كاملة للاستقامة ودواسة منعكس سحب). التخدير العميق ضروري لعدوى أمثل، حيث سيتم ابتلاع الفئران تماما عدم تخديره أو طرد العدوى الفيروس، مما يؤدي إلى اختلافات في جرعة العدوى.
- ضع الماوس أنيسثيتيزيد في موقف ضعيف. جمع 15 ميليلتر من فيروس العدوى. ضع طرف ماصة قريبة من الآنف الأيمن الماوس والاستغناء عن العدوى الفيروسية قطره قطره. كما يجب أن يكون استنشاقه قطرات، لا "الماصة؛" لهم مباشرة داخل تجويف الآنف.
- الانتظار 2-5 دقائق ووضع طرف ماصة تحتوي على ميليلتر 15 الباقية من فيروس العدوى في منخر الحق.
ملاحظة: لتجنب الاختناق، الاستغناء عن قطرات صغيرة الحجم في حوالي 20 s الفواصل.
- تحقق من أن الماوس هو التنفس بشكل صحيح ووضعه في قفص في الأفقي استلقاء. رصد الماوس التنفس والتخدير الإنعاش (حوالي 60 دقيقة بعد التعريفي).
ملاحظة: من الممكن أن تصيب الماوس أكثر من 1 في نفس الوقت. في هذه الحالة، إدارة العدوى الفيروسية في الآنف الأيسر من جميع الفئران في تسلسل والانتظار لمدة 2-5 دقائق وثم إدارة الفيروس في الآنف الصحيح. لتجنب التباين بين الأفراد، تصيب الفئران لا يزيد عن 3 في نفس الوقت.
- مراقبة صحة الحيوان مركز وفقدان الوزن يوميا.
- Euthanize الفئران وفقا لنقطة النهاية إنسانية يحدد المبادئ التوجيهية للسلطة. يجب أن تكون معتمدة من قبل السلطات الحيوان التجريب أسلوب القتل الرحيم ويجب احترام القواعد الأخلاقية المحلية. وبعد تجارب اثنين-فوتون، euthanize الفئران الإدارة من جرعة زائدة من الكيتامين/xylazine متبوعاً بخلع عنق الرحم. في جميع التجارب الأخرى، استخدم استنشاق أول أكسيد الكربون2 كأسلوب للقتل الرحيم.
ملاحظة: يمكن إجراء المقايسة (RT-PCR) كما هو موضح سابقا23لقياس التتر الفيروسية من القصبة الهوائية المصابة أو المقايسة الجرعة المعدية (TCID50) زراعة الأنسجة 50% أو الوقت الحقيقي تفاعل البوليميراز المتسلسل.
- تقييم لتجنيد العَدلات في القصبة الهوائية بالتدفق الخلوي
ملاحظة: يكون هذا الجزء من البروتوكول الاختياري. ويهدف إلى تقييم تجنيد العَدلات في مخاطية الرغامى بعد الإصابة بالإنفلونزا.
- Euthanize الفئران المصابة وغير مصاب مراقبة في اليوم الثالث بعد الإصابة (بي) باستنشاق أول أكسيد الكربون2 .
ملاحظة: للحيلولة دون تلف الرغامى، تجنب استخدام التفكك عنق الرحم إلى euthanize الحيوانات. بالإضافة إلى ذلك، ينصح نضح euthanized الفئران لتفادي التلوث من العَدلات الدم.
- رش الرقبة الماوس مع الحل الإيثانول 70% وتنفيذ شق جلد باستخدام مقص جراحي من الصدر إلى الذقن.
- فصل في الغدد اللعابية استخدام الملقط وفضح القصبة الهوائية.
- تشريح العضلات حول القصبة الهوائية باستخدام الملقط، والمقص.
ملاحظة: هذه الخطوة يجب إجراء بعناية منذ القصبة الهوائية يمكن أن تتلف بسهولة أثناء الإجراء.
- عقد القصبة الهوائية بالملقط وفصل المريء بعناية بالتشريح.
- عقد الجزء الوعائي من القصبة الهوائية مع الملقط، جعل شق في بداية الشجرة الشعب الهوائية. ثم فصل القصبة الهوائية من الحنجرة وإزالة بعناية أي عضلات غادر.
- ضع الجهاز في أنبوب 1.5 مل تحتوي على RPMI 1640 + حبيس المتوسطة (ربمي) على الجليد.
- إعداد الخليط إنزيم الهضم القصبة الهوائية، التي تتضمن 0.26 وحدة/مل من كولاجيناز (الأول والثاني) و 0.2 مغ/مل من الدناز في ربمي.
- مكان تشريح القصبة الهوائية في صفيحة 6-البئر الذي يحتوي على 1 مل مزيج الإنزيم.
- قطع الجهاز إلى قطع صغيرة بالمساعدة ملقط ومقص. تبقى لوحة على الجليد أثناء هذه الخطوة.
- احتضان في 37 درجة مئوية لمدة 45 دقيقة. وخلال هذا الوقت، اهتز لوحة كل 15 دقيقة.
- وقف إنزيم الهضم عن طريق إضافة 1 مل من نظام مراقبة الأصول الميدانية الغسيل المخزن المؤقت (2 مم يدتا و 2% معطل الحرارة تصفية تعقيم الجنين البقري المصل (FBS)) في برنامج تلفزيوني.
- ريسوسبيند الحل مع ماصة 1 مل للمساعدة في أن تنأى بالقطع عسر الهضم جزئيا من الأنسجة.
- نقل الحل إلى بئر أخرى بتمرير المحتوى من خلال مصفاة 40 ميكرومتر. ثم، بلطف تحطيم القطع المتبقية للجهاز المحاصرين على رأس مصفاة استخدام المكبس حقنه 2 مل.
ملاحظة: تحطيم القطع عسر الهضم جزئيا من القصبة الهوائية عبر مصفاة خطوة حاسمة الحصول عدد أمثل من الخلايا أثناء تحليل تدفق سيتوميتريك.
- تغسل جيدا وفي المصفاة مع نظام مراقبة الأصول الميدانية الغسيل المخزن المؤقت ونقل التعليق في أنبوب 5 مل أبقى على الجليد.
- الطرد المركزي هذه الأنابيب في 166 س ز لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية. تجاهل المادة طافية وريسوسبيند الخلايا في 100 ميليلتر من نظام مراقبة الأصول الميدانية الغسيل المخزن المؤقت.
- المضي قدما في تلطيخ جسم السطحية للتدفق الخلوي. بإيجاز، كتلة مستقبلات Fc من الخلايا المعزولة باستخدام جسم مضاد ضد CD16/32، متبوعاً تلطيخ السطحية. لتحديد العَدلات بشكل صحيح، يجب أن تحتوي لوحة قياس التدفق الأضداد التالية: αLy6G، αCD11b، αCD45، فضلا عن بقاء صبغ لاستبعاد الخلايا الميتة.
- تشغيل المحتوى كله من العينات في سيتوميتير تدفق وتحليل البيانات.
- للحصول عدد أمثل من الخلايا المناعية، تشغيل تعليق خلية مفردة بسرعة لا تفوق 3,000 الأحداث/s. هذا سوف تقليل عدد الأحداث المستبعدة خلال اقتناء. باستخدام هذا البروتوكول، ينبغي أن يكون من الممكن الحصول على 1 إلى 2 مليون من الخلايا في القصبة الهوائية.
2-العزلة وحقن من العَدلات
ملاحظة: في هذا الإجراء، B6.129 (الممثل المدني)--تيراغرام (كاج-اكفب) CK6Nagy/ياء الفئران (CK6-اكفب) كانت تستخدم24. عن هذه الحيوانات الحراجية المعتمدة في جميع أنواع الخلايا تحت المروج البشرية β-أكتين. وبدلاً من ذلك، من الممكن أيضا استخدام الفئران C57BL/6J لعزل الخلايا ووصمة عار لهم وفقا للبروتوكول هو موضح في الخطوة 2، 6. تنقية والتلاعب في العَدلات قد يزيد وضعهم التنشيط، يحتمل أن تغيير خصائصها الوظيفية والكثيرة الارتحال.
- Euthanize الحيوان باستنشاق أول أكسيد الكربون2 .
- إزالة كل قصبة وتيبياس وتنظيفها برفق باستخدام الملقط.
- قطع epiphyses العظام وتدفق نخاع العظام باستخدام حقنه 1 مل مليئة ببرنامج تلفزيوني الباردة العقيمة، في أنبوب 50 مل أبقى على الجليد.
- ريسوسبيند الخلايا مع إبرة 18 جرام وتصفية تعليق خلية مع مصفاة 40 ميكرومتر. أغسل مرة واحدة مع برنامج تلفزيوني في 110 x ز لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية وريسوسبيند الخلايا في 2 مل من برنامج تلفزيوني الباردة.
-
تمييع 100 ٪ بركل 9:1 في برنامج تلفزيوني x 10 وإعداد الحلول المتدرجة من بركل 72%، 64% و 52% 1 x PBS باستخدام. الطبقة 2 مل لكل من التدرجات الثلاثة في أنبوب 15 مل بعناية، بدءاً من الأكثر تركيز واحد.
- أضف بعناية 2 مل تعليق خلية نخاع العظم على رأس التدرجات وأجهزة الطرد المركزي في س 1,100 ز لمدة 30 دقيقة في درجة حرارة الغرفة (RT) دون تسريع والفرامل.
- بعناية إزالة الفرقة في مجال التفاعل بين 64 في المائة و 72 في المائة وغسله مرة واحدة في 200 x غ لمدة 5 دقائق في 4 درجات مئوية مع برنامج تلفزيوني الباردة. ريسوسبيند الخلايا في حجم 100 ميكروليتر من برنامج تلفزيوني وإبقائهم على الجليد. نقاء العَدلات من المتوقع أن يكون أعلى من 90%.
- بشكل اختياري، تسمية العَدلات مع مجموعة انتشار خلايا باستخدام البروتوكول الخاص بالشركة المصنعة. إضافة الصبغة إلى تعليق خلية لتركيز نهائي 10 ميكرومترات في حجم 1 مل واحتضان في 37 درجة مئوية لمدة 30 دقيقة ويغسل (166 س ز، 5 دقيقة).
- تقدير تركيز الخلية باستخدام هيموسيتوميتير وحقن الوريد 5 × 106 خلايا في حجم الحد أقصى من 100 ميكروليتر في الفئران المصابة سابقا CD11c-يفب+ استخدام ز 26 إبرة 1 مل حقنه، ح 12 قبل التصوير.
3-إعداد الماوس للتصوير
-
التخدير
- تخدير الفئران CD11c-يفب+ المصابة في اليوم 3 بي وفقا للخطوة 1.2.3.
- حالما يتم تخديره عميق من الفئران، تعد قسطرة للتخدير إعادة الجرعات.
- إزالة إبرة 30 جرام من حقنه باستخدام الملقط.
- أدخل الإبرة لقطعة 20 سم من أنابيب السيليكون الطبي PE-10.
- إدراج 30 غ إبرة حقنه مليئة بخليط الكيتامين/إكسيلازيني على الجانب الآخر من الأنبوب.
- إزالة الهواء داخل الأنبوب.
- إعداد 20 غ قسطرة متصلة بأنبوب من جهاز إينسوفلاتينج أكسجين للمحافظة على التهوية الآلية (الشكل 1Aأنا). إعداده بنسبة التنفس من 130 نبضة في الدقيقة (b.p.m.) بحجم 0.2 مل استخدام إمدادات غاز أكسجين 100% من المد والجزر.
-
إعداد الماوس لجراحة
- الاحتفاظ بالماوس على لوحة العمليات جراحية مخصصة محددة (1A الشكلالثاني-الثالث) عبر صفيحة ساخنة أو مقعد جراحية ساخنة تعيين في 37 درجة مئوية لكل الوقت لعملية جراحية.
- حلاقة الشعر من رقبة الماوس باستخدام حلاقة الكهربائية وكريم مزيل الشعر (الشكل 1Bأنا)-
- ضع الماوس فوق الماوس البلاستيك الموضعية (الشكل 1Aالثاني-أ)، إبقاء رأسه الحيوان خارج الموضعية (1B الشكلالثاني) لإنشاء زاوية تسهل تنبيب القصبة الهوائية.
- إصلاح الأمامية والكفوف والذيل مع الشريط الجراحي وترطيب العينين الماوس مع هلام فيتامين (أ) إثراء وتطهير الرقبة الماوس (1B الشكلالثاني).
-
جراحة
- تحضير العناصر يعقم بشكل صحيح، إلا وهي المقص والمقص ميكروسورجيكال والملقط.
- إجراء شق صغير على محور وسطى طويل العنق، حوالي 1 سم طويل، في منطقة وسط بين أعلى الصدر وخط يمر عبر النقطة السفلي للفك السفلي (1B الشكلالثالث).
- التحرك أفقياً بقع الجلد والغدد اللعابية ووضع تصور للقصبة الهوائية، مشمولة بالعضلات. ثم تشريح عضلات القصبة الهوائية بعناية باستخدام الملقط (1B الشكلالثالث).
- التنبيب الماوس مع قسطرة وبدء التنفس الاصطناعي (1B الشكلالرابع).
ملاحظة: وتتألف من جزء البلاستيك الخارجي، الذي يحمي الغشاء المخاطي الرغامى، وابرة حديد داخلية القسطرة. ويمثل وجود الإبرة الحل المثالي لتوسيع وتحقيق الاستقرار في القصبة الهوائية وتنظيم المعرض لها. وسوف تضمن التهوية الاصطناعية عن طريق القسطرة التنفس السليم للماوس.
- البدء فورا في التهوية الاصطناعية للماوس جهاز التنفس.
- إصلاح القسطرة الارتفاع واتجاه استخدام خطاف جراحي (1B الشكلالخامس) متصل بقضيب معينة على لوحة العمليات الجراحية (1A الشكلالثاني-ب). كشف القصبة الهوائية في نفس الارتفاع من الذقن.
- تطويق القصبة الهوائية مع فازلين وتغطية ذلك مع بضع قطرات من برنامج تلفزيوني ساخن مسبقاً لضمان ترطيب مناسب للجهاز (1B الشكلالسادس).
- جبل ساترة على أعلى الإعداد. لهذه الخطوة، الصق ساترة على حامل معدني (الشكل 1Bالسابع)، الذي سوف يكون مشدود إلى المترجم XYZ (1A الشكلالثاني-جيم). ضبط المترجم XYZ لوضع ساترة على رأس إعداد العمليات الجراحية.
- مكان القسطرة لإدارة التخدير إينترابيريتونيلي (1B الشكلالثامن).
- حقن 50 في المائة الجرعة الأولى من الكيتامين/xylazine الخليط كل 30 دقيقة.
ملاحظة: إعادة الجرعات من 50% إلى 25% المخلوط الكيتامين/xylazine الأولية هو بديلة آمنة وصالحة25. بيد أن هذا البروتوكول المحطة الطرفية ومطلوب التثبيت دقيق للحيوان أثناء الإجراء بأكمله، استخدام جرعات أعلى للحفاظ على طائرة جراحية العميقة للتخدير.
4. في فيفو الوقت الفاصل بين التصوير
ملاحظة: الحصول على الصور وأجرى مع مجهر اثنين-فوتون تستقيم، مجهزة بأشعة الليزر Ti:Sa اثنين وغرفة حضانة درجة الحرارة التي تسيطر 25 X/1.1 غ الماء الغمر والهدف. وكانت فوتومولتيبليرس (PMT) المستخدمة للحصول على الصور كاشفات الهجين أو حساسية عالية جاسب.
- وضع المجلس الجراحية باستخدام الماوس أنيسثيتيزيد داخل غرفة الحضانة المجهر (قبل تسخينه عند 37-38 درجة مئوية) وإضافة قطره مياه على ساترة.
- تركيز المركز والعثور على أنسجة القصبة الهوائية.
-
ضبط تردد المسح الضوئي إلى 800 هرتز، مع 520 x 520 بكسل، مجال رؤية ميكرومترات 440 × 4402 وخط متوسط 1.
- لحن Ti:Sa الليزر إلى 830 نانومتر لإثارة الجيل الثاني متناسق (SHG) من الكولاجين، مع قوة يدل على مصدر 150 ميغاواط. لحن الليزر Ti:Sa الثاني في 920 نيوتن متر مع 94 ميجاوات في المصدر، تثير الحراجية المعتمدة ويفب.
- الهيكل الثلاثي الأبعاد وطريقة اكتساب timelapse مع الإثارة المتزامنة
ملاحظة: الاحتفاظ بصلاحيات الليزر منخفضة قدر الإمكان للتقليل من فوتوبليتشينج والضيائيه.
- سجل الفلورية استخدام قناتين في وضع غير ديسكانيد، مع مرآة مزدوج اللون رئيسي في 560 نانومتر. في التشكيل المستخدمة في هذا البروتوكول، تقسيم مرآة مزدوج اللون ثاني الإشارة في 495 نيوتن متر لفصل قناة 1 (تصفية الانبعاثات 475/50) من القناة 2 (تصفية الانبعاثات 525/50) (الشكل 2 أ). يجمع هذا التكوين SHG الخفيفة من الكولاجين في القناة الأولى، بينما يتم جمع الانبعاثات الحراجية المعتمدة في كلتا القناتين 1 و 2 ويتم جمعها يفب فقط في القناة الثانية.
- تعريف مجموعة ميكرومتر 50 على المحور Z، مع حجم خطوة 3 ميكرومتر (فوكسل الحجم 0.86 ميكرو x 3 ميكرومتر). سجل الصور كل 30 ثانية لمجموع مدة 30 دقيقة.
- إذا رغبت في ذلك، الحصول على مناطق متعددة. قبل تشغيل المزيد من المقتنيات، فحص العلامات الحيوية ونحثهما التخدير عن طريق القسطرة إذا لزم الأمر (راجع الخطوة 3.3.10).
- في نهاية عملية التصوير، euthanize الماوس عن طريق جرعة زائدة من الكيتامين/xylazine متبوعاً بخلع عنق الرحم.
5-صورة التحليل الكمي وتجهيز حركية العَدلات-العاصمة والتفاعل
ملاحظة: استخدمت برنامج تصوير متخصصة في هذا البروتوكول، لتحليل بيانات الفحص المجهري.
- بعد الانتهاء من الحصول على الصور د 4، نقل الملفات (البيانات والبيانات الوصفية) على محطة عمل مع الموارد الحسابية كافية (اقترح متطلبات النظام الحد الأدنى: 32 غيغابايت من ذاكرة الوصول العشوائي، وحدة المعالجة المركزية سرعة سوليد الدول محركات، مؤخرا، مكرسة الجرافيك على أساس واسع العمارة المتوازية).
- فتح الملفات في برامج التصوير.
- تشغيل الفيديو والتأكد من أن الخلايا التي تهم مرئية بوضوح وأن التحف التصوير غائبة.
ملاحظة: وتحقيقا لهذه الغاية، تحقق من أن كل حركة للعينة وتباين السطوع محصورة بما فيه الكفاية. وفي الواقع، تمثل هذه التحديات ل التحليل الآلي26. إذا كانت حركة عينة بين الإطارات المتجاورة المفرط، تطبيق أسلوب تصحيح الانحراف، على سبيل المثال باستخدام قناة SHG كمرجع ثابت. هذا يسمح لتدبير أفضل حركة الخلايا بدلاً من الحركة للعينة. بالإضافة إلى ذلك، وجود خلفية ساطعة أو الحطام، تقليم السطوح أعيد بناؤها باستخدام وحدة التخزين كمعلمة تحديد.
- إنشاء محدد قناة تعريب المشارك للخلايا الحراجية المعتمدة+ ، بغية فصل إشارة بين الحركة والكولاجين (SHG). وتحقيقا لهذه الغاية، الدلالة مضلع النابضة (الشكل 2Bأنا) الذي يحدد فقط فوكسيلس بعد كثافة إيجابية سواء في قناة الأخضر في القناة الزرقاء.
ملاحظة: هذا الإجراء قد تختلف وفقا لتصفية مجموعة من المجهر وتلطيخ الخلايا. يمكن أن يتحقق عن طريق تحديد فقط فوكسيلس بكثافة كافية في كل من الأخضر والأزرق القنوات. بين الأدوات المتاحة، يمكن استخدام وظيفة "كولوك" لحساب قناة كولوكاليزاتيون استناداً إلى مستوى العتبة كثافة تلقائياً. بالإضافة إلى ذلك، يمكن استخدام أساليب تستند إلى التعلم الآلي لهذه الخطوة بالإشراف الخبراء27.
- كشف وتعقب الخلايا الحراجية المعتمدة+ ، والتعمير السطح التلقائي باستخدام وتتبع (أداة السطحية) عبر قناة التعريب المشارك المناسب.
ملاحظة: curation اليدوية في نهاية المطاف تتبع الأخطاء والاستبعاد من المسارات لمدة أقصر من عتبة محددة (أي، 150 ق) قد تكون مطلوبة.
- إنشاء محدد قناة تعريب المشارك للخلايا CD11c-يفب+ ، بغية فصل الإشارات الحراجية المعتمدة ويفب. وتحقيقا لهذه الغاية، الدلالة مضلع النابضة (2B الشكلالثاني) الذي يحدد فقط فوكسيلس وجود كثافة إيجابية في قناة الأخضر ولكن كثافة منخفضة في القناة الزرقاء.
ملاحظة: ميكروجرافس الممثل تظهر الإشارات من القناة الأولى والقناة 2 والقناة التعريب المشارك للحركة، قناة التعريب المشارك يفب والمزيج من جميع القنوات ويمكن الاطلاع على في 2B الشكلالثالث.
- إعادة بناء سطح الخلايا CD11c-يفب+ وتتبع موقفهم على مر الزمن (أداة السطحية).
ملاحظة: غير مطلوب دليل تصحيح الأخطاء تتبع في نهاية المطاف لهذه الخطوة. والواقع أن سبب الديناميات المعقدة الزمانية للعاصمة، تعمير سطحها دقيقة من البيانات ف 2-ناقلات الأمراض هو مهمة صعبة لا يمكن أن تتحقق مع البرمجيات المتاحة تجزئة. بين الأسباب التي تجعل هذه المهمة الصعبة، نتوءات رقيقة وتغيرات سطوع لا تسمح باستخدام بعض تقنيات معالجة الصور، مثل تجانس مرشحات أو العتبة ثابتة. وعلاوة على ذلك، في شبكة العاصمة، من الصعب فصل الخلايا المفردة فقط استناداً إلى مظهرهم في البيانات ف 2-ناقلات الأمراض. لهذه الأسباب، بدلاً من محاولة تجزئة دقيقة بتوليف معلمات البرامج، نقترح إعادة بناء الأسطح غير دقيقة من العاصمة. ثم، معالجة الأخطاء المحتملة عن طريق قياسات قوية كما هو موضح في 5.8.
-
قياس الهجرة الخلية.
- تصدير تدابير الهجرة الكلاسيكي للحركة+ والخلايا CD11c-يفب+ . ويشير إلى "تعني سرعة المسار" بين هذه، متوسط سرعة الهجرة من الخلايا بينما "تعقب الاستقامة" يشير إلى الاتجاه للخلايا. يمكن تصدير هذه التدابير كملف جدول بيانات من برامج التصوير.
- في ملفات جدول بيانات تم تصديرها، بحساب "الاستقامة تصحيح المسار" (المشار إليها أيضا كنسبة الولادة المصوبة) الحراجية المعتمدة+ والخلايا CD11c-يفب+ ، الذي يعرف بأنه "الاستقامة المسار" مضروبة في الجذر التربيعي "تعقب مدة" مقسوماً على الجذر التربيعي لمدة الفيديو. وهذا التدبير أكثر قوة من "تعقب الاستقامة" حضور قصيرة المسارات28، التي تنشأ على سبيل المثال من تتبع الأخطاء.
ملاحظة: يمكن مقارنة أشرطة الفيديو فقط من نفس الطول بهذا التدبير.
-
قياس التفاعل الخلية.
- تحديد جهة اتصال بين خلية الحراجية المعتمدة+ وخلية CD11c-يفب+ إذا كانت المسافة التي تفصل بينهما (أقرب فوكسيلس) مساوية أو أقل من عتبة (أي 2 ميكرومتر).
ملاحظة: يجب أن تكون صارمة بما فيه الكفاية للكشف عن اتصال فقط عندما تكون الخلايا على مقربة من هذه العتبة. ومع ذلك، ونحن نشجع للحفاظ على هذه العتبة أكبر من 0, N مثالي مرات أكبر من دائرة نصف قطرها فوكسل (N > 2)، نظراً لتجانس الحدود يمكن أن تجعل إعادة إعمار خلايا أصغر من حجم الخلية الفعلية.
- عد العدد ومدة الاتصالات بين الحركة+ والخلايا CD11c-يفب+ . في برامج التصوير يمكن أن يتم ذلك على سبيل المثال بتنفيذ سد "قبله وتشغيل" في. يمكن تصدير هذه التدابير كملف جدول بيانات من علامة التبويب الإحصائيات.
- استيراد التدابير التي سبق حسابها في برامج إحصائية، وتوليد المؤامرات وإجراء الاختبارات الإحصائية.