RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ar
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
تصور وقياس الجذر النمو في الموقع صعبة للغاية. نحن نقدم طريقة رهيزوبوكس لتخصيص لتتبع جذور التنمية وانتشارها على مر الزمن استجابة للمغذيات. يتم استخدام هذا الأسلوب لتحليل الاختلافات قد الذرة في جذر اللدونة ردا على مصدر نيتروجين العضوي.
الجذور، يصعب دراسة. التربة حاجز البصرية والميكانيكية، مما يجعل من الصعب تتبع جذور في الموقع دون حصاد المدمرة أو معدات باهظة الثمن. نقدم أسلوب رهيزوبوكس بأسعار معقولة وقابلة للتخصيص الذي يسمح التصور غير المدمرة لنمو الجذر على مر الزمن، وخاصة مناسبة تماما لدراسة اللدونة الجذر ردا على بقع الموارد المترجمة. تم التحقق من صحة الأسلوب بتقييم التباين أوضح الذرة في الردود اللدونة للبقع التي تحتوي على بقايا البقوليات المسمى ن 15. أساليب موصوفة للحصول على القياسات التنموية الممثل مع مرور الوقت وقياس كثافة طول الجذر في البقع التي تحتوي على الموارد والتحكم وحساب معدلات النمو الجذري وتحديد 15ن الانتعاش بجذور النباتات ويطلق النار. وتناقش أيضا المزايا والمحاذير والتطبيقات المستقبلية المحتملة للأسلوب. على الرغم من أن يجب الحرص على التأكد من أن الظروف التجريبية لا تحيز البيانات النمو الجذري، غلة البروتوكول رهيزوبوكس المقدمة هنا نتائج موثوقة إذا ما نفذت بالاهتمام الكافي بالتفاصيل.
على الرغم من أن كثيرا ما يغفل عنها مقارنة بنظرائهم سطحي، الجذور تلعب دوراً حاسما في اكتساب المغذيات النباتية. نظراً لتكلفة الكربون كبيرة جذر البناء والصيانة، تطورت النباتات آليات لتطوير الجذور فقط حيث تستخدم علفاً يستحق الاستثمار. نظم جذور يمكن وبذلك كفاءة وحيوي الألغام بقع الموارد التي تنتشر في المناطق الساخنة، upregulating معدلات الإقبال والمغذيات ترانسلوكاتينج سريعاً إلى لحاء لمواصلة النقل1. يمكن أن تختلف الاستجابات اللدونة على نطاق واسع بين النباتات من الأنواع أو الأنماط الجينية2،3 ، وتبعاً لشكل المواد الكيميائية المعنية المغذيات4،5. التباين في جذر اللدونة وينبغي استكشاف المزيد، فهم استجابات الجذرية المعقدة لموارد التربة غير المتجانسة يمكن إبلاغ استراتيجيات إدارة لزيادة كفاءة استخدام المغذيات في الزراعة وتربية.
وبالرغم من ضرورة وأهمية لفهم النظم النباتية تصور وتحديد مقدار اللدونة الجذر في الجداول ذات الصلة تحديات التقنية. حفر التاج الجذر من التربة (6من "شوفيلوميكس") أسلوب شائع، لكن استغلال جذور غرامة المسام الصغيرة بين المجاميع التربة، وحفر يؤدي لا محالة إلى درجة ما من فقدان هذه الجذور الهشة. وعلاوة على ذلك، الحصاد المدمرة يجعل من المستحيل على تتبع التغييرات في نظام جذر واحد على مر الزمن. في الموقع من أساليب التصوير مثل التصوير المقطعي بالأشعة السينية المحسوبة السماح التصور مباشرة من الجذور وموارد التربة في عالية الدقة المكانية7، لكن غالية الثمن ويتطلب معدات متخصصة. تجارب تربة تجنب القيود المرتبطة باستخراج الجذور من التربة، ولكن تختلف مورفولوجيا الجذر والهندسة المعمارية في الوسط المائي مقارنة بالقيود الميكانيكية وتعقيد الفيزيائية للتربة8،9. أخيرا، لا يمكن دمجها rhizosphere العمليات والوظائف مع اللدونة التنموية في هذه الوسائط المصطنعة.
نقدم بروتوكول لبناء واستخدام رهيزوبوكسيس (حاويات مستطيلة ضيقة، وواضحة من جانب) كوسيلة منخفضة التكلفة وقابلة للتخصيص لوصف النمو الجذري في التربة مع مرور الوقت. إطارات مصممة خصيصا تشجيع الجذور تنمو بشكل تفضيلي ضد الفريق مرة أخرى بسبب جرافيتروبيسم، زيادة دقة قياسات طول الجذر. رهيزوبوكسيس تستخدم عادة لدراسة النمو الجذري و rhizosphere التفاعلات10،،من1112، ولكن الأسلوب الذي قدم هنا يوفر ميزة في البساطة مع تصميم حجرة واحدة وغير مكلفة المواد، وهو مصمم لدراسة الردود الجذر على المغذيات المترجمة. ومع ذلك، الأسلوب يمكن أيضا تكييف لدراسة مجموعة من عمليات الجذر ورهيزوسفيري أخرى مثل المنافسة داخل/إينتيرسبيسيس، والتوزيع المكاني للمركبات الكيميائية أو الميكروبات، أو نشاط إنزيم. هنا، نحن التحقيق أوضح الاختلافات بين هجن الذرة ردا على بقع من 15البقول المسمى ن بقايا وتسليط الضوء على الممثل النتائج للتحقق من صحة الأسلوب رهيزوبوكس.
1-إعداد الجبهة ولوحات الخلفي، والفواصل

رقم 1: التخطيط لحفر ثقوب. هي ثقوب حفر 1.3 سم من الحواف الجانبية 2.5، 19، 38، و 53.3 سم من الأعلى و 1.3 سم من الحافة السفلية في 2.5 و 20.3 سم 38 من الهامش الأيمن. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
2-تركيب شريط من البوليستر الضرب في الجزء السفلي من مربع
ملاحظة: هذا سوف يمنع التربة والمياه من تسرب من خلال المفاصل بين الفواصل.

رقم 2: تجميع رهيزوبوكس مع الضرب- يمنع قطاع ضيق من الضرب في الجزء السفلي من رهيزوبوكس التربة والرمال من تسرب. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
3-الجمعية رهيزوبوكسيس

الشكل 3: التصحيح الفواصل. مسامير إدراجها عن طريق شرائط مركز الكثافة منعهم من الوقوع في المربع. رهيزوبوكس مليئة بالتربة المحيطة الفواصل وترطب التربة وتتم إزالة الفواصل كي يترك بقع فارغة في العلاج والسيطرة على. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
4-بناء PVC إطارات لدعم رهيزوبوكسيس في زاوية
ملاحظة: عندما يتم وضع المربع في زاوية، ستشجع جرافيتروبيسم الجذور تنمو ضد اللوحة الخلفية بحيث تكون مرئية لتتبع جذور جميع. كلوريد البوليفينيل (PVC) أبعاد في النتيجة الرقم 4 في إطار الذي يحافظ رهيزوبوكس في حوالي 55 ° زاوية على مقاعد البدلاء.

الشكل 4: الإطار لدعم رهيزوبوكسيس. هي التي شيدت من PVC قطع بأطوال محددة ومتصلة باستخدام أنواع المشترك أشار إلى الإطار خفيفة الوزن. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
5-الخياطة الحالات الواقية تعكس الضوء والحرارة
ملاحظة: جذور تجنب الضوء، حتى استبعاد هذه الحالات الخفيفة من أجل التأكد من أن لاحظت الردود اللدونة الجذر مدفوعة حسب مصدر المغذيات في البقع وليس عن طريق تجنب الضوء. النسيج الحرمان الخفيفة يقلل أيضا من درجة الحرارة داخل رهيزوبوكسيس، المساعدة على تفادي الإجهاد الحراري.
6-إعداد التربة 1:1 (V/V): الرمال الركيزة لملء في رهيزوبوكسيس
7-إعداد الركيزة للعلاج ومراقبة بقع
8-تحميل رهيزوبوكس مع الركازة، وتحديد العلاج ومراقبة بقع
9-وحتى الري إلى 60% القدرة على الاحتفاظ بالمياه
ملاحظة: تم العثور على هذه الكمية من رطوبة التربة للحيلولة دون حصول النباتات التي تعاني من إجهاد الجفاف بينما منع تطور ظروف وصول أو نمو الطحالب.
10-البذور الإنبات، وزرع الأعضاء
11-النباتات النمو
12-حصاد يطلق النار، والحصول على الجذر وعينات من التربة لتحليلها
13-التحقق من وسم وتقدير معدلات نمو الجذر النسبي

14-تحليل 15ن التقسيم بين عينات التربة الجذر وتبادل لإطلاق النار، والعلاج




نمت جذور تفضيلي ضد الجزء الخلفي المربع، كما كان متوقعا. تتبع مجموع طول الجذر على الجزء الخلفي مربع تتراوح من 400 إلى سم 1,956، مقارنة ب 93-758 سم على الجزء الأمامي المربع. وحسبت معاملات الارتباط بيرسون اقتران بين طول الجذر الممسوحة ضوئياً وطول تتبع الجذر على الجزء الأمامي المربع، ظهر المربع، والمجموع من الأمام والخلف واستخدمت لتحديد ما إذا كانت تتبع بدقة تعكس طول المجموع الجذري (n = 23، كما المصنع في مربع واحد توفي أثناء التجربة.) طول الجذر مجموع الممسوحة ضوئياً كان يرتبط إلى حد كبير مع طول تتبع الجذر على الجزء الخلفي المربع (الشكل 5A، ف = 0.0059)، والجبهة في مربع (الشكل 5B، ف = 0.022)، ومجموع النسخ والجبهة (الشكل 5، ف = 0.0036)-تتبع فقط الجزء الخلفي المربع تم التحقق من صحته وهكذا كإعطاء مقياس ممثل لنمو الجذر مع خفض الوقت المطلوب لتتبع جذور. ومع ذلك، تجدر الإشارة إلى أن تتبع يلتقط 21.6 54.6 في المائة فقط من طول المجموع الجذري. بينما تنمو جذور تفضيلي ضد سطح رهيزوبوكس، غرامة الجذور الجانبية خاصة قد لا تكون مرئية للتتبع. تتبع مناسبة تماما للمقارنات النسبية لطول الجذر على مر الزمن، خصوصا في المراحل الأولى في التنمية، لكن الحصاد وفحص نظم الجذر الأفضل إذا كان الهدف دقة قياس طول المجموع الجذري.

الرقم 5: العلاقات المتبادلة بين تتبع وتفحص بيانات طول الجذر. A) إلى حد كبير يرتبط ارتباطاً طول الجذر تراسيد بطول الجذر الممسوحة ضوئياً عندما تم تتبعه فقط الجزء الأمامي المربع. ب) تتبع جذور على الجزء الخلفي المربع، حيث كانت غالبية الجذور مرئية، تحسنا تتبع الجزء الأمامي المربع؛ قيمة2 R لخط الانحدار على طول الجذر الممسوحة ضوئياً وكان الترابط مرة أخرى كبيرة. ج) الأسلوب الأكثر دقة تتبع جذور على كلا الجانبين من المربع، كما هو موضح بقيمة2 R أعلى من الطرق الثلاث، وتفحص علاقة كبيرة بطول الجذر. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
معدلات النمو الجذري على مر الزمن كانت متشابهة بين المربعات، كما يتضح من منحدرات متسقة عند التآمر في سجل الطبيعية لطول المجموع الجذري ضد الزمن (الشكل 6). بينما التغير الطفيف المتوقع، معدلات نمو متسقة تشير إلى أن الظروف التجريبية الموحدة لكافة مربعات. وتشير منحدرات مختلفة إلى حد كبير إلى أن النباتات كانت تنمو بمعدلات مختلفة، مما يشير إلى الحاجة إلى التحقق من وجود الاختلافات في المتغيرات مثل درجة الحرارة أو الرطوبة.

رقم 6: الجذر معدلات النمو مع مرور الوقت- المنحدرات مماثلة لطول الجذر مقابل الوقت بين رهيزوبوكسيس تشير إلى أن جذور نمت بنسب متساوية. منحدرات عدم موحدة يمكن أن تشير إلى أن الظروف التجريبية تختلف فيما بين رهيزوبوكسيس. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
انتشرت جذور جميع الأنماط الجينية الذرة في البقع التي تحتوي على بقايا المحاصيل الغطاء المسمى ن 15. ثابت ANOVA ثنائي الاتجاه مع نوع التصحيح والنمط الوراثي كالعوامل (n = 23) كشف عن أن جذر طول كثافة أعلى في العلاج من بقع مراقبة استخدام البيانات الممسوحة ضوئياً الجذر (الشكل 7 أ، ف = 0.013) فضلا عن بيانات تتبع الجذر (الشكل 7، ف = 0.005). ولم تختلف اختلافاً كبيرا بين الأنماط الجينية في كلتا الحالتين RLD.

رقم 7: الجذر كثافة طول بالنمط الوراثي وجذر البيانات نوع.) وأظهرت البيانات الجذر الممسوحة ضوئياً أن جميع الأنماط الجينية (واو) انتشرت في التصحيح العلاج (T)، وأوضح الاختلافات ليست كبيرة. ب) المقطوع وأكدت البيانات الممسوحة ضوئياً الجذر تأثير كبير من بقايا البقوليات، ولكن ليس الوراثي (A-F)، الجذر طول كثافة في بقع. رسائل واو تمثل الأنماط الجينية المختلفة الستة وأشرطة الخطأ تمثل الخطأ القياسي. ج: مراقبة؛ T: العلاج. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
يمكن استخدام القطر الجذر لجعل استنتاجات حول دالة الجذر ودوران. جذور غرامة من المرجح أن تكون الجذور الجانبية التي سرعة تطوير وتتكاثر في الاستجابة للنقاط الساخنة، والموارد بينما الجذور الخشنة أكبر من المرجح أن تكون جذور المحوري المعمرة، بطيئة في الاستجابة. تم تحليل نظم جذور الممسوحة ضوئياً لنسبة الجذور في كل فئة القطر: < 0.2 مم، 0.2-0.4 مم، 0.4-0.8 ملم، 0.8-1.6 ملم، و > 1.6 ملم، وكل فئة حجم تم اختبارها للخلافات قد. قد يشير إلى الأنماط الوراثية مع الجذور غرامة أكثر في علاج بقع استجابة انتشار أكثر فعالية. أحادي الاتجاه ANOVA مع النمط الوراثي كعامل ثابت (n = 23) كشفت عن أن الأنماط الجينية لا تختلف في طول الجذر في كل فئة حجم لجذر النظام العام (الشكل 8 أ)، علاج بقع (8b الشكل)، أو السيطرة على بقع (الشكل 8 ج). كانت أغلبية من الجذور جذور غرامة (< 0.2 مم).

الشكل 8: نسب جذور في فئات مختلفة من القطر حسب النمط الوراثي والموقع. ) في كل رهيزوبوكس (باستثناء بقع العلاج والتحكم)، وكانت غالبية جذور غرامة (< 0.2 مم في القطر). لم تختلف الأنماط الجينية في نسب الجذور في كل فئة القطر. ب) في علاج بقع، طول الجذر كل فئة حجم المثل انخفضت مع زيادة القطر عبر الأنماط الجينية. ج) مراقبة بقع اتسمت بنفس الأنماط. رسائل واو تمثل الأنماط الجينية المختلفة الستة وأشرطة الخطأ تمثل الخطأ القياسي. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
التسمية N كان أعلى في تبادل لإطلاق النار من عينات الجذر عبر الأنماط الجينية وفقا ANOVA ثنائي الاتجاه مع نوع العينة والنمط الوراثي كالعوامل الثابتة (n = 23، رقم 9)، تبين أن 77-81 في المائة N من التصحيح العلاج كان ذوبانها من الجذور ليطلق النار خلال هذه التجربة. ANOVA أحادي الاتجاه (n = 23) أظهرت أن δ15ن من الجذر ولم تختلف العينات تبادل لإطلاق النار بالنمط الوراثي.

الشكل 9: الحصول على النيتروجين من بقايا البقول في الجذور ويطلق النار في الحصاد. وكانت جميع الأنماط الجينية نفس القدر من الفعالية في تناول N من التصحيح الذي يحتوي على بقايا البقوليات المسمى ن 15. غالبية N من التصحيح كان ذوبانها من الجذور ليطلق النار. رسائل واو تمثل الأنماط الجينية المختلفة الستة وأشرطة الخطأ تمثل الخطأ القياسي. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
الكتاب ليس لها علاقة بالكشف عن.
تصور وقياس الجذر النمو في الموقع صعبة للغاية. نحن نقدم طريقة رهيزوبوكس لتخصيص لتتبع جذور التنمية وانتشارها على مر الزمن استجابة للمغذيات. يتم استخدام هذا الأسلوب لتحليل الاختلافات قد الذرة في جذر اللدونة ردا على مصدر نيتروجين العضوي.
المؤلف يود أن ينوه المراجعين المجهول للتغذية المرتدة، فضلا عن كاهيل كيركراده وتأن باو للتوجيه الأولى بشأن وضع بروتوكول رهيزوبوكس. تم توفير التمويل بالأساس للأغذية والزراعة البحوث، لنا وزارة للزراعة (وزارة الزراعة) المعهد الوطني للأغذية والزراعة، زراعية تجربة محطة كاليفورنيا المشروع-د-الثابتة والمتنقلة-2332-ح، إلى جي وإدارة جامعة كاليفورنيا ديفيس من المصنع العلوم من خلال زمالة إلى ج. س.
| 1.27 سم قطر أنابيب PVC | JM Eagle | 530048 | 305 سم لكل صندوق ، مقطعة إلى أطوال كما هو محدد في بروتوكول |
| المرفقين الجانبيين PVC | Lasco | 315498 | 2 لكل صندوق |
| أكواع PVC 90 درجة | شارلوت | PVC 02300 0600 | 4 لكل صندوق |
| مفاصل PVC T | شارلوت | PVC 02402 0600 | 4 لكل صندوق |
| ألواح أكريليك مقذوفة | TAP بلاستيك | N / A | 2 لكل صندوق ، سمك 0.64 سم × عرض 40.5 سم × طول 61 سم |
| فواصل HDPE (جوانب) | بلاستيك TAP | N | / A 2 لكل صندوق ، سمك 0.64 سم × عرض 2.5 سم × طول 57 سم |
| فواصل HDPE (أسفل) | بلاستيك | TAP N / A | 1 لكل صندوق ، سمك 0.64 سم × عرض 2.5 سم × طول 40.5 سم |
| فواصل HDPE (رقعة) بلاستيك | TAP | N / A | 2 لكل صندوق ، 0.64 سم سمك × 3.8 سم عرض × 28 سم طول |
| بوليستر الضرب | فيرفيلد | #A-X90 | 2.5 سم × 40.5 سم شريط لكل صندوق |
| مسامير 20 خيطا | N / A | N / A | 3.2 سم ، قطر 0.64 سم |
| غسالات | N / A | N / A | 0.64 سم القطر |
| المكسرات السداسية | N / A | N / A | بحجم ليناسب البراغي نسيج |
| الحرمان الخفيف | Americover ، شركه. | غامق 8WB26.5 | قطعة واحدة بعرض 95 سم وطول 69 سم لكل صندوق |
| رمل | Quikrete | رقم 1113 | |
| تربة الحقل | N / A | N / A | |
| الورق الشفاف لتتبع | FXN | FXNT1319100S | واحد لكل جانب من الصندوق المراد تتبعه |