المدعومة من الصلبة، خالية من البروتين، وضعف فسفوليبيد بلير الأغشية (دلبم) يمكن أن تتحول إلى شبكات أنابيب نانوية معقدة ودينامية في الدهون ويمكن أن تكون بمثابة 2D نماذج ينطلق من هيولى.
مقالة منهجية
المدعومة من الصلبة، خالية من البروتين، وضعف فسفوليبيد بلير الأغشية (دلبم) يمكن أن تتحول إلى شبكات أنابيب نانوية معقدة ودينامية في الدهون ويمكن أن تكون بمثابة 2D نماذج ينطلق من هيولى.
نحن نقدم طريقة ملائمة لتشكيل نموذج عضية هيكلية التصاعدي هيولى (ER). النموذج يتكون من الأنابيب النانوية ليبيديك العالية الكثافة التي، من حيث التشكل وديناميات، تذكرنا ER. الشبكات مستمدة من بلير مزدوجة فسفوليبيد غشاء بقع التمسك شفافة Al2O3 الركازة. هو وساطة الالتصاق من Ca2 + في المخزن المؤقت المحيطة. يتسبب نضوب اللاحقة من Ca2 + عن طريق باتا/يدتا انكماش الغشاء، أسفر عن تشكيل شبكة أنابيب نانوية الدهن عفوية. الأسلوب فقط تضم فوسفوليبيدات والأسطح ميكروفابريكاتيد لتشكيل نموذج ER بسيطة ولا تتطلب إضافة البروتينات أو الطاقة الكيميائية (مثلاً، أنشئ أو ATP). على النقيض من مورفولوجية 3D هيولى الخلوية، هذا النموذج ثنائي الأبعاد (وأن كان يتم الاحتفاظ بإبعاد أنبوب نانوي، والهندسة، وهيكل، وديناميات). هذا نموذج فريد من نوعه في المختبر ER تتكون من عدد قليل من العناصر، من السهل بناء، ويمكن أن يلاحظ تحت مجهر خفيفة. يمكن أن يكون هيكل الناتج زينت المزيد للحصول على وظائف إضافية, مثل إضافة البروتينات المرتبطة ER أو الجسيمات دراسة الظواهر النقل بين الأنابيب. الشبكات الاصطناعية الموصوفة هنا هي النماذج الهيكلية المناسبة للخلوي ER، مورفولوجيا المميزة الفريدة التي أثبتت أن تكون متصلة بوظيفتها البيولوجية، بينما التفاصيل المتعلقة بتشكيل المجال أنبوبي و ترتيبات جديدة داخل ما زالت لا تماما مفهومة. ونلاحظ أن هذا الأسلوب يستخدم ال2س3 مجهرية رقيقة الفيلم المغلفة كوفيرسليبس، التي هي متوفرة تجارياً وإنما تتطلب الأوامر الخاصة. ولذلك، فمن المستحسن أن يكون الوصول إلى مرفق ميكروفابريكيشن لإعداد.
لائحة يضطلع بمهام حاسمة في الخلية البيولوجية بما في ذلك طي البروتين والدهون التوليف والكالسيوم اللائحة1،2. مورفولوجيا ER متأصل للمهام التي يؤديها. فهو يجمع بين رصات مستو والمجالات أنبوبي كثيفة الدينامية، التي تتفاعل مع سيتوسكيليتون باستمرار والخضوع لحركة مستمرة وإعادة ترتيب. وتشمل بعض يعيد البناء أن الخضوع لهياكل ER التحول المستمر بين أوراق مستو وأنابيب، وتكوين حويصلة من أو الانصهار التجويف ER، واستطالة الأنابيب الموجودة من قبل وسحب الأنبوب، والانصهار، والكسر3. هيكل غريب من شبكات أنبوبي نشاط غير المواتية. المسارات والآليات التي لائحة ينشئ ويحافظ على هذه المنظمة، وكذلك كيفية هذا يتعلق بوظيفتها ليست يفهم تماما4،5.
ومن المعروف أن لائحة الأعطال عند فإنه يفقد حالته التماثل الساكن، أسفر عن الإجهاد ER، شرط الناجمة عن زيادة في البروتين، وتراكم البروتينات تجمعات، أو التغيرات في توازن الأكسدة و Ca2 + . ER الإجهاد بدوره يسبب تشوه مورفولوجيا الطبيعية من عضية، على وجه التحديد مزعجة على شبكة المنظمة6،7. واستجابة، ينشط الخلية إليه إصلاح العودة إلى حالة التماثل الساكن. يمكن أن يؤدي الفشل في إصلاح إلى الخلية التي يسببها ER المبرمج، مما يسهم في العديد من الأمراض الأيضية والتنكسية مثل مرض الزهايمر ومرض السكري من النوع 2 ومرض باركنسون، والتصلب العضلي الجانبي وآخرون7، 8. البحث الحالي يستهدف تنظيم شبكات ER أنبوبي، وتركز العديد من الدراسات على تشكيل لائحة في المختبر2. القائمة بضعة نماذج2،،من910 تتطلب البروتينات الشروع والحفاظ على غشاء انحناء3،11 ومساعدة عضية التوصل إلى شكله. ومن الواضح أن النظم النموذجية التي تعكس بعض السمات الهيكلية والتنظيمية الرئيسية للائحة، وتوفير الوصول إلى الدراسات التجريبية المتقدمة كبيرة في الطلب.
نحن الحاضرين هنا الإجراءات لإعداد سهلة، خالية من الطاقة والحيوية في المختبر البروتين/الكيميائية نموذجا للائحة، توفير منصة أساسية لدراسة مورفولوجيا ER والمهام المرتبطة بها4. في هذا الأسلوب، يتم ملفقة نموذج ER مع اتباع نهج تصاعدي باستخدام عدد قليل من العناصر، التي يمكن أن تكون متكاملة الجزيئات ذات الاهتمام لإضافة تعقيد. وتمثل الشبكة ER بنية وديناميات. وعلاوة على ذلك، عكسها التحويل بين الغشاء مستو والأنابيب، تكوين حويصلة من أنابيب والانصهار الأنبوبة، انزلاق وتراجع يمكن كل ملاحظة. بالإضافة إلى العمل كنموذج التصاعدي للائحة الخلوية مفهومة، يمكن أن يكون الطريق دهني إلى شبكات أنابيب نانوية الموصوفة في هذا البروتوكول المنطبقة للباحثين دراسة التجميع الذاتي، نانوفلويديكس، وجزيء واحد والغروانيه الظواهر النقل وتدفق Marangoni، وسائر الميادين ذات الصلة. اللبنات فقط الجزيئية المستخدمة في أسلوبنا فوسفوليبيدات. البروتوكول يتطلب العمل المخبري القليل والمعدات الأساسية والوصول لإدراج العناصر الإضافية.
1-إعداد تعليق حويصلة فسفوليبيد
ملاحظة: لجميع المواد المشار إليها ك "النظيفة" في هذا البروتوكول، دقة غسلها بالكحول تليها المياه. وتسريحه لهم مع النيتروجين. لاحظ أنه لا يمكن إجراء أج ركائز الزجاج مع المؤكسدة بشدة وكلاء الحمضية (حل البيرانا)، التي تطبق عادة في إعداد بروتوكولات للأفلام الدهن معتمدة على ركائز متينة، على ال2س3-المغلفة الناقلين.
2-إعداد ركائز
ملاحظة: يتم تنفيذ البروتوكول التالية في تنظيم تصنف 8 إيزو في المواصفة القياسية ISO 14644-1. ترسيب طبقة الذرية (المدة) يستخدم لاختلاق Al2O3 ركائز. معلمات العملية المحددة تعتمد على الصك وقد تختلف بين نماذج مختلفة من المعدات. يمكن استخدامها كمعلمات الأولية لتطوير هذه العملية.
3-تحويل الأفلام فسفوليبيد الجزيئية لشبكات أنبوبي
4-الملاحظة الفحص المجهري
تعليق المادة الدهنية التي تم الحصول عليها في الخطوة 1 من البروتوكول والمستخدمة في التجارب التي تحتوي على نوعين رئيسيين من حويصلات: ملفس وجوفس. الشكل 1 أ-1F يظهر ليزر المسح ميكروجرافس [كنفوكل] من الحويصلات في العينة الأولى التي شيدت في 3D. الشكل 1 ويبين A-1_C ملف (إيداع الدهنية) في xyz و xz yz الطائرات، على التوالي. الشكل 1 د-1F يوضح آراء مماثلة حويصلة أونيلاميلار العملاقة (جيوف). الجزء الداخلي من جوفس، التي تفتقر إلى مولتيلاميلاريتي، أجوف؛ ومن ثم فالمواد الدهنية لنشر محدودة إلى حد كبير. ولذلك، الخزانات الدهون مفيدة فقط لهذا الأسلوب هي ملفس.
عندما يتم نقل تعليق المادة الدهنية إلى دائرة المراقبة تتضمن Ca2 +-هيبيس المخزن المؤقت (الشكل 1ز)، بدء ملفس (الشكل 1A-1_C) ليستقر على السطح3 2س ال. عند الاتصال، الحويصلات تنضم إلى السطح، ويبدأ غشاء بلير دهن شقة مزدوجة دائرية (دلبم) لنشر من كل ملف على دعم الصلبة (الشكل 1ح-1J). ملف يعمل كخزان ينص الدهون دلبم الآخذة في الاتساع باستمرار. الغشاء القاصي بلير (العلوي)، وفيما يتعلق بدعم متين، متصل بالغشاء بلير الدانية (السفلي) على طول محيط الحافة الدائرية، تنفيذ اقتراح متداول (الشكل 1أنا). يتم وضع بليرس اثنين رفضا قاطعا فوق بعضها البعض، وجود سوى طبقة رقيقة سائلة مغلفة بينهما. أثناء نشر، تتمسك الغشاء الدانية باستمرار إلى السطح التأييد تحتها، بينما يتم سحبها الغشاء القاصي أفقياً عند الحواف على حافة الغشاء الدانية الآخذة في التوسع. نشر دلبم هو وساطة من Ca2 +، الذي يعمل بمثابة عامل فوسوجينيك بين المجموعات دهن الرأس من الغشاء الدانية والركيزة الصلبة4.
وإذا استمر انتشار لفترات طويلة، التوتر الغشاء الزيادات، مما أدى إلى تمزق (الشكل 2ألف و 2 باء). بعد هذه النقطة، يمكن لم يعد الناجمة عن انكماش الغشاء، هو أمر ضروري لخلق مورفولوجية أنبوبي ER. ولذلك، من المهم أن نعترف تمزق الأغشية. حيث يتم فلوريسسينتلي المسمى الدهون في تجاربنا، يمزق يمكن مباشرة ملاحظة. مؤشر رئيسي لتمزيق هو الانخفاض الكبير في كثافة fluorescence في تمزق المنطقة (الشكل 2ألف و 2 باء)14. يمزق نتيجة لزيادة التوتر وتشكيل المسام اللاحقة في غشاء البعيدة. المناطق التي تمزق تحت مجهر فلوري، ولذلك يحمل نصف كثافة الانبعاثات (بلير الدانية واحد) من مناطق المستقرات (بلير مزدوجة)14 (الشكل 2ب). أثناء تشكيل المسام، ترحيل مواد الغشاء، الذي كان في البداية المتمركزة في المناطق التي تمزق، إلى حواف نشر التصحيح. يؤدي هذا بدوره نمو منطقة التصحيح الشامل. ولذلك، يمكن أيضا ملاحظة توسع سريع في كفاف التصحيح دائرية أثناء يمزق.
لتجنب نمو واسع النطاق مما أدى إلى تمزق البقع، فورا بعد منطقة التصحيح دائرية تصل إلى 100-200 ميكرون، تتم إزالة Ca2 +-حبيس المخزن المؤقت بلطف مع ماصة تلقائي حتى طبقة رقيقة من بقايا السائل على السطح. ثم يتم إضافة المخزن المؤقت تشيلاتور-حبيس بلطف إلى الدائرة الشروع في سحب (الشكل 1ك). جفاف كامل للعينة (الشكل 2ج) أو التبادل السريع للمخازن المؤقتة (الشكل 2د و 2E) يسبب اضطرابات أو تمزيق أو تشوه بقع. إضافة chelators تدريجيا يزيل Ca2 + من المسافة بين المياه السطحية والغشاء. المخزن المؤقت تشيلاتور-هيبيس يصل تدريجيا إلى الفضاء فيما بعد الركيزة bilayer، بدءاً من محيط التصحيح الغشاء الدهني. ولذلك، يبدأ من حواف دائرية التصحيح إزالة مواقع التثبيت وتنتشر إلى الداخل (الشكل 1ك-1Q). نتيجة ديبينينج، يبدأ الغشاء الدهني في فصل وسحب من الداخل الحواف، تتقدم نحو ملف في المركز. تؤدي عملية سحب إلى واجهة جديدة لتطوير شبكات أنبوبي lipidic4 (الشكل 1لتر-1Y) بشكل حيوي. المناطق المستمرة للتثبيت، التي لا تسمح للغشاء لفصل تماما، تبقى على جدولة السطحية ونوكليتي، مما يؤدي إلى شبكة متفرعة طويلة من الأنابيب النانوية. (الشكل 1لتر-1Y). ولوحظت تعلق الرفع المستمر، وكذلك سحب الأنابيب النانوية الدهن مع مرور الزمن نتيجة عملية تدريجية الخلبية. هذا كوارسينينج وإعادة ترتيب فروع الشبكة دوراً رئيسيا في السلوك الديناميكي للشبكات أنبوبي، التي تشبه لائحة السلس.
الشكل 1 لام-1Y يظهر ميكروجرافس من أنبوب نانوي الشبكات التي تم الحصول عليها في البروتوكول. الشكل 1 L ملحوظ عن قرب المنطقة في الشكل 1م في إطار أبيض. المناطق مشرق الأحمر مستمرة في الشكل 1لتر و 1 م هي الكسر التراجع من دلبم (ملحوظ مع خط متقطع أزرق في الشكل 1م). صورة مجهرية لشبكة أنبوبية الشكل 1ن و 1O هو مقلوب لزيادة التباين. الشكل 1 P و 1Q يصور الحد كثافة أنبوبي في منطقة غشاء على مدى 3 ساعات و 20 دقيقة. انخفاض كثافة أنبوبي يحدث بسبب ديبينينج تدريجي يتبعه تراجع دلبم من على سطح الأرض خلال الفترة التجريبية. مع مرور الوقت، العدد من النقاط التي تحررت من تعلق الزيادات، مما يؤدي إلى ترتيبات جديدة وتخفيض المساحة المشمولة بأنابيب (الشكل 1ف و 1Q). يرجع سببها ترتيبات جديدة أنبوبي تدنية الطاقة الحرة السطحية أنبوب نانوي الدهن علقت بين اثنين من النقاط الثابتة. أنها راسخة أن الطريقة الأكثر فعالية لتقليل الطاقة السطحية من أنبوب نانوي الحد طول15. ولذلك، عند إزالة المثبتة منطقتي فوسوجينيك، الذي عقد في البداية الأنابيب النانوية على السطح،، الأنابيب النانوية الشريحة وترتيب نفسها عفويا، اعتماد على طول الحد أدنى. تتسبب هذه ترتيبات جديدة على تغطية انخفاض تدريجيا من السطح من الأنابيب النانوية (الشكل 1ف و 1Q).
ونحن لا يمكن تصور Ca2 +-بوساطة نقاط التثبيت، ولكن علينا إنشاء مواقعها كالنقاط التي يكون فيها أنابيب يتحول المحطة الطرفية أو حادة. المنعطفات الحادة يشار إلى الخامس-تقاطعات15 أو نقاط التحول بسبب التحول المفاجئ في اتجاه المحاذاة أنبوب (الأسهم الخضراء في الشكل 1R و 1 X). ويمثل نقطة النهاية محطة الأنبوب، مما يحول دون التراجع (الأسهم البرتقالي في الشكل 1X) الأنبوب. وخلال عملية إعادة تنظيم، التصرف نشاط مواتي من الأنابيب التي اعتبرت "Y-تقاطعات" أو "3-طريقة تقاطعات"، تظهر. Y-التقاطع يربط ثلاثة أنابيب مع حوالي 120° الزوايا بين كل أنبوبة، حيث يمكن تأمين طول أنبوب مجموع أقصر. ذ-الوصلات، التي لا تملك نقطة نهاية، وبدلاً من ذلك يتم وضعه بين الأنابيب النانوية متعددة، هي غير مثبت. هذا هو نوع Y-مفرق الوحيدة التي يمكن أن تؤدي إلى انزلاق (الأسهم الزرقاء، الشكل 1R). كما هو مبين في الشكل 1R و 1S، ينحدر من Y-تقاطع على طول نتائج تقاطع غير مستقرة جداً في تشكيل الفردية اثنان تقاطعات Y (الأسهم الزرقاء في الشكل 1S). يمثل خط أبيض متقطع فرضه على الشكل 1S كفاف الجزء شبكة أنبوبية في الشكل 1R. جزء صغير من Y-الوصلات تمتلك محطات نهاية (السهم الأصفر في الشكل 1تي) الذي، على مر الزمن، في نهاية المطاف سحب (الشكل 1يو). تحويل الخامس-تقاطع إلى واحد، يمكن ملاحظة أنبوب مستقيم ديبينينج من نقطة التقاطع لأجزاء الخط اثنين، وسحب أحد أنابيب تشكيل الشكل الخامس في الشكل 1V و 1 وات و الشكل 1X و 1Y، على التوالي.

الشكل 1 : تحويل الدهون الودائع للشبكات مثل ER أنبوبي. (واو) ليزر المسح ميكروجرافس [كنفوكل] من الحويصلات في العينة الأولى، التي شيدت في 3D. (أ-ج) دهن مولتيلاميلار حويصلة (ملف، إيداع الدهنية) في xyz و xz yz طائرات، على التوالي. (د-و) آراء مماثلة لحويصلة أونيلاميلار العملاقة (جيوف). الجزء الداخلي من جوفس جوفاء، مما يجعل المواد الدهنية لنشر محدودة إلى حد كبير. خزانات الدهون مفيدة لهذا الأسلوب هي بالتالي ملفس-(ز) شكل توضيحي لدائرة المراقبة التي شنت على مجهر مقلوب التي تودع في المخزن المؤقت والدهون. تتألف الدائرة من PDMS الإطار انضمت إلى ساترة3 المغلفة2س ال، توفير أعلى المجلد مفتوح. (ح-ي) رسم توضيحي لظاهرة انتشار ملف حضور Ca2 +. (ح) عند الاتصال مع Al2O3، ينتشر ملف تلقائياً في شكل تعميما، الدهن بلير غشاء مزدوج (دلبم). (ط) عرض الجانب التخطيطي دلبم في الطائرة xz، حيث تؤدي أطراف الاقتراح المتداول. ملف (د = 5-15 ميكرون) ودلبم (سمك = 10 نيوتن متر) لا يتم رسمها بمقياس. (ي) صورة مجهرية [كنفوكل] من دلبم نشر من عرض أعلى. (ك) يصف الخطوة الرئيسية لهذا البروتوكول، حيث يتم تبادل المخزن المؤقت إلى واحدة تحتوي على Ca2 + خالب وكلاء ويحول دون انتشار، مما تسبب في تراجع دلبم لملف ويؤدي إلى تشكيل الأنابيب النانوية الدهن. (ل-Y) ميكروجرافس من أنبوب نانوي الشبكات التي تم الحصول عليها باستخدام الأسلوب هو موضح. (ل) عن قرب المنطقة في (م) علامة في إطار. وتمثل المناطق مشرق الأحمر مستمرة في (لام وميم) دلبم (ملحوظ مع خط متقطع أزرق أيضا في م). هو عكس صورة مجهرية من شبكة أنبوبية في (N و O) زيادة التباين. (P و Q) تصوير للحد كثافة أنبوبي في منطقة غشاء على مدى 3 ح و 20 دقيقة (ص ص) الممثل ترتيبات إعادة أنبوبي. (R و S) انزلاق (T و U) الانتقال من Y-تقاطع إلى الخامس-تقاطع طريق سحب واحد نقطة النهاية، و (V و W) إزالة التثبيت من نقطة تحول، وأسفر عن القضاء على مفترق الخامس. (س وص) سحب نقطة النهاية. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-

الشكل 2 : نتائج سلبية محتملة. (أ وب) يمزق الغشاء البعيدة نظراً لفترة طويلة وقت الانتظار قبل الصرف من المخازن المؤقتة. مجالات تمزق، حيث يصبح الغشاء الدانية مرئية، تظهر كمناطق مظلمة بالمقارنة مع مناطق الغشاء المتمزق البعيدة. الداخلي للفريق ب يبين شدة الضوء على طول السهم الأزرق على صورة مجهرية. كثافة المناطق تمزق الغشاء (بلير الدانية مفرد يصبح مرئياً) تناظر نصف كثافة الغشاء المتمزق (بلير القاصي مزدوجة). (ج) مظهر تصحيحًا الدهن جافة تشكلت نتيجة لإزالة جميع السائل من دائرة المراقبة. (دال وهاء) اضطراب الغشاء بالتبادل السريع للمخازن المؤقتة عبر ماصة التلقائي. في (د)، قد انقسم ملف ملفس 2، مما يؤدي إلى تصحيح دهن غير دائرية، ومشوه. (ﻫ)، ينعكس نمط التدفق (الأسهم)، تم إنشاؤها بواسطة حقن قوية من المخزن المؤقت تشيلاتور-هيبيس، على هيكل غشاء توبولاتيد. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم-
في المناقشة التالية، يتم وصف الخطوات الحاسمة والتعديلات المحتملة، والقيود المفروضة على البروتوكول. الخطوة الحاسمة الأولى هو الجمعية العامة المناسبة لدائرة المراقبة، نظراً إلى أن التصاق الإطار PDMS إلى السطح3 2س بن ضعيف أصلاً. في الحالة حيث الإطار لا يتقيد بالركيزة بشكل صحيح، سوف تسرب المحتوى من دائرة المراقبة والتجربة سوف يأتي إلى توقف. العوامل الرئيسية التي تعيق مناسبة ختم سطح والإطار 1) الافتقار إلى تنظيف شامل للإطار PDMS (إعادة استخدامها) و 2) الهواء فقاعات أحياناً الحصول على شرك بين الإطار والركيزة. وينبغي استخدام إطار PDMS أعدت حديثا أو تنظيفها جيدا. يجب أن تشطف الإطار قبل وبعد كل استعمال مع الكحول، تليها الشطف بماء دي وبلوودريينج مع النيتروجين. لا تتطلب أسطح3 2س ال أي التنظيف السابقة، نظراً لأنها ملفقة في بيئة تنظيم وتحفظ في حاويات مختومة حتى الاستخدام. نظراً لطبيعة مذبذب Al2O3، فإنه ينبغي أن لا تكون عرضه للحلول بقوة الحمضية أو الأساسية. ويمكن استخدام تصاميم أخرى لدائرة المراقبة، اعتماداً على إمكانية الحصول على الإعداد الفردية. الميزات الهامة لهذه الدائرة هي حرية الوصول إلى عينة السائل من أعلى مفتوحة ويفرط المواد الإطار فيما يتعلق بالحلول المستخدمة والعينات. أبعاد الدائرة أيضا عامل هام، كما أنها ينبغي أن تستوعب كمية من 0.5 إلى 1 مل. منذ السطوح المستخدمة عادة الحجم العادي كوفيرسليبس (24 × 60 مم)، معظمها يتحدد حجم الدائرة بسمك الإطار. على حد علمنا، الفواصل مع حجم وعمق يمكن أن تستوعب أحجام العينة عادة التعامل معها في هذا البروتوكول غير متوفرة تجارياً. ولذلك خصصنا فرعا في البروتوكول للتفاصيل من تلفيق والجمعية في إطار الدائرة عينة.
أن الخطوة الحاسمة الأخرى في هذا البروتوكول هو تبادل المخزن المؤقت. تحديا في هذه الخطوة هو التوقيت اللازم لإجراء هذا التبادل. نشر ملف عند الاتصال مع Al2O3 الركيزة الفورية، والتوسع المستمر دلبم يؤدي إلى تمزيق، تنتهي التجربة (الشكل 2أ، ب). ولذلك، انتشار ينبغي أن ترصد باستمرار، وتبادل المخزن المؤقت يجب أن يتم في الوقت مناسب. لا يمكن إجراء التبادل بعد التهيئة لنشر، بغية السماح للبقع غشاء الوصول حجم أمثل (100-200 ميكرومتر في القطر) بسرعة كبيرة جداً. من ناحية أخرى، تسبب التصاق مستمر على السطح الغشاء عالية التوتر، الأمر الذي يؤدي إلى تمزيق. وهكذا، غشاء جميع بقع في نهاية المطاف تمزق إذا نشر لا تنقطع. توقيت يمزق يختلف بالنسبة لكل تصحيح، نظراً لأنها تعتمد على الحجم والهيكل الداخلي لملف وإمكانية الحصول عليها الدهون فيه. ومن ثم، ينبغي أن يرتب لحظة التبادل إلى تيميبوينت فيه بقع تمزق الأمم المتحدة مع أحجام الأمثل تمثل أغلبية السكان. تحد آخر في الخطوة exchange المخزن المؤقت هو معدل الإزالة والإضافة للمخازن المؤقتة. وقد يؤدون هذا الاستبدال السريع جداً لها تأثير ضار على هياكل غشاء النهائية (الشكل 2ج-ه). نتائج الاستخراج المفرط من Ca2 +-حبيس المخزن المؤقت دون ترك طبقة رقيقة سائلة على الركازة، في غشاء المجففة ومشوهة لا رجعة فيه بقع (الشكل 2-ج). حتى إذا كان يتم الاحتفاظ كمية مناسبة من السائل على السطح، إضافة المفاجئ من المخزن المؤقت تشيلاتور-حبيس أيضا يسبب اضطراب الهياكل الغشاء. الشكل 2 د،ه يظهر مظهر نموذجي لغشاء هيدروديناميكالي تعطل بقع. تعطيل الخصائص المورفولوجية العامة لا تؤثر بالضرورة خصائص ديناميكية الهياكل النهائية (أي ترتيبات جديدة أنبوبي في المناطق المتبقية لا تزال تحدث). بيد أنه سوف يصبح من الصعب على مراقبة التحول المادي على هياكل مشوهة. على سبيل المثال، أنه في الشكل 2د، سيكون من الصعب على تحديد الاتجاه نحو الذي يسحب ملف دلبم.
واحد إمكانية إدخال تعديل على البروتوكول هو تكوين المادة الدهنية المستخدمة. انصب التركيز الرئيسي على فوسفوليبيدات التي تهيمن على التشكيل لائحة في الثدييات والخميرة16 (ﻫ. ز.، فوسفاتيديلتشوليني (PC)، فوسفاتيديليثانولاميني (PE)، وفوسفاتيديلينوسيتول (PI). أجريت التجارب الأصلي باستخدام الكمبيوتر و PI الخلائط4. في النتائج المقدمة، تم استخدام خليط من أجهزة الكمبيوتر ومخدر وهو مشتق من PE. ومع ذلك، وجدت ليست كل الدهون التعسفي التراكيب لإنشاء هياكل أنبوبية التي تم الحصول عليها من خلال هذا البروتوكول. عدد قليل من الدهن التحقيق تجريبيا الخلائط الأخرى تشمل استخراج قلب مجموع وفول الصويا استخراج القطبية واستخراج كولاي القطبية، وخلائط من جهاز كمبيوتر مع stearoyl-2-hydroxy-sn-glycero-3-phosphoinositol (Lyso-PI) بنسب متفاوتة والخلائط من سيرين PC-بي-بي-بوسفاتيديل (PS) بنسب متفاوتة. منذ هياكل أنبوبية غشاء تمتلك الانحناءات عالية وتحتاج إلى ترتيب خاص لجزيئات الدهن الفردية، فمن المتوقع أن ظاهرة لوحظت هي المادة الدهنية الخاصة بالتكوين.
آخر تعديل تطبيق هذا البروتوكول هو الأسلوب لتلفيق السطحية. هنا، استخدمت المدة اختﻻق كوفيرسليبس3 المغلفة2س ال. وهذا يختلف عن الأسلوب ترسب عنها أصلاً، رد الفعل اﻷخرق4. في حين يشير هذا إلى أن أسلوب تصنيع سطحي بديل لا يزال يمكن أن يؤدي إلى توبوليشن مثل ER، يبدو قيد هام واحد خصوصية المواد السطحية. طريقة نشر وقوة الالتصاق يعتمد اعتماداً كبيرا على خصائص المواد السطحية، التي تؤثر على عوامل مثل التفاعل الالكتروستاتيكي، ويتابيليتي، هيدروفوبيسيتي، وخشونة السطح. Al2O3 الأسطح توفر قوة الالتصاق الأمثل، والأفلام الدهن سواء إرفاق بشدة بما فيه الكفاية تنتشر كغشاء بلير دهن مزدوجة وفصل لشبكات أنبوبي الشكل عند إزالة أيونات Ca2 + . اختبرنا سابقا نفس التجربة مع SiO2، التي الحويصلات مولتيلاميلار انتشرت كغشاء bilayer دهن مزدوجة، ولكن لوحظ لا تشكيل شبكة أنبوبية عند إضافة تشيلاتورس17. إزالة المرفقات وتشكيل الأنبوبة يلاحظ فقط في ال2س3 أو محفوراً البلازما ال18. كشفت تحقيقاتنا أن المعلمة المساهمة مما يؤدي إلى هذه ظاهرة زيتا المحتملة من السطوح، لل وال التي كانت2س3 قريبة من الصفر (mV) و SiO2 سلبية إلى حد كبير. إمكانات زيتا البورسليكات يشبه SiO219؛ ولذلك، التصاق الدهن أفلام عن البورسليكات نفس القدر قوية ولا رجعة فيها. في الواقع، دهن مولتيلاميلار الخزان الاتصال مع الأسطح البورسليكات عادة ما يؤدي إلى تمزق الفوري وتشكيل واحد دهن بليرس20. Al2O3 السطوح المطلوبة لهذا البروتوكول لا تتوفر سهولة أو تجارياً. ومع ذلك، يمكن أمر مخصص من مصنعي الزجاج والركيزة التخصص. ينصح بشدة إمكانية الوصول إلى مرافق تنظيم مع معدات تصنيع الأغشية الرقيقة.
الأساليب القائمة الأخرى المنطلقة اختﻻق ER-مثل شبكات أنبوبي2،10 إشراك البروتينات، فضلا عن مدخلات الطاقة الكيميائية (على سبيل المثال-، أنشئ و ATP). ذكرت رابوبورت والزملاء2 تشكيل شبكات ER على الزجاج كوفيرسليبس في المختبر بخلط البروتينات الغشاء الانحناء موجودة في أوروبا، مع فوسفوليبيدات وأنشئ. العمل الذي يقوم به باتشاند et al. 10 يبين كيف يمكن إنشاء مثل هذه الشبكات أنبوبي ديناميكية باستخدام المحركات الجزيئية و ATP كمصدر للطاقة. لا يتطلب هذا البروتوكول قدم بروتينات الغشاء أو التحلل المائي للمركبات العضوية للطاقة. المكونات الأساسية فقط هي الركيزة الصلبة وشكلها. تنقية واستخلاص البروتينات غير مطلوبة. يوفر هذا البروتوكول، فيما يتعلق ببساطة جزيئات التأسيسي، أن أبسط نموذج ER.
مع هذا الأساسية، على أساس المادة الدهنية ER نموذج المنشأة، بناء التعقيد بإضافة المكونات المرتبطة بلائحة من الاهتمام، نظراً لأنها تمكن تحقيق آثار الفردية في النظام. مشابهة لشبكات ER الفعلية، أنابيب في النموذج دينامية. التصريف إلى والهجرة من البروتينات الغشاء المسمى، أو الجسيمات الفلورية في جميع أنحاء الشبكة أنبوبي، قد تعطي معلومات عن اتجاه حركة غشاء. تغليف ورصد السوائل داخل دلبم وأنابيب الفلورسنت أثناء التحول ووضع خرائط ممكنة لنقل المحتوى إينتراتوبولار قد تخدم كنقطة تركيز أخرى. أخيرا، قد اعتمد انتقال من نموذج ER 2D الناتجة من هذا البروتوكول نحو نموذج ER سلس ثلاثي الأبعاد من خلال تغليف الشبكات في أبنية المائية.
الكتاب ليس لها علاقة بالكشف عن.
ونحن نشكر الأستاذ الدكتور الدو جيسوركا من "جامعة تشالمرز للتكنولوجيا" في السويد لتعليقاته لا تقدر بثمن في المخطوطة. وقد أمكن هذا العمل من خلال الدعم المالي التي تم الحصول عليها من منحة مشروع "مجلس البحوث في النرويج" (Forskningsrådet) 274433، الارجان: علوم الحياة تقارب البيئة، 2015 منحة مشروع المجلس السويدي للبحوث (Vetenskapsrådet)-04561، فضلا عن بدء التمويل المقدمة من مركز "الطب الجزيئي" النرويج وكلية الرياضيات والعلوم الطبيعية في جامعة أوسلو.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| قارورة على شكل كمثرى 10 مل | Lenz Laborglasinstrumente | 3.0314.13 | حيث يتم تحضير خليط الدهون |
| حقنة زجاجية من هاميلتون 5 مل (P / N) | هاميلتون | P / N81520 | لنقل الكلوروفورم إلى الدورق |
| إبرة محور كبير مخصص مقياس 22 S | هاميلتون | 7748-18 | إبرة قابلة للإزالة للحقنة المحددة في الصف 3 |
| هاميلتون 250 ومايكرو ؛ L حقنة زجاجية | هاميلتون | 7639-01 | تستخدم لنقل الدهون في الكلوروفورم إلى القارورة |
| محور كبير مقياس 22 S | هاميلتون | 7780-03 | إبرة قابلة للإزالة للحقنة المحددة في الصف 5 |
| هاميلتون 50 & مايكرو; حقنة زجاجية L | هاميلتون | 7637-01 | تستخدم لنقل الدهون المترافقة بالفلوروفور إلى القارورة |
| المحور الصغير المقياس 22 S | Hamilton | 7770-01 | إبرة قابلة للإزالة للحقنة المحددة في الصف 7 |
| الكلوروفورم اللامائي (> 99٪) | Sigma-Aldrich | 288306 | يستخدم لإكمال خليط الدهون إلى ما مجموعه 300 & ميكرو; L |
| فول الصويا L- & ألفا; الدهون الفوسفاتيديل الكولين (فول الصويا PC) | Avanti Polar Lipids Inc | 441601 | أنواع الفوسفوليبيد التي تساهم في 69٪ من إجمالي التكوين / الخليط |
| 1،2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine (DOPE) | Avanti Polar Lipids Inc | 850725 | أنواع الفوسفوليبيد التي تساهم في 30٪ من تكوين / خليط الدهون |
| L- & ألفا ؛ فوسفاتيديل إينوزيتول ليبيد (فول الصويا PI) | Avanti Polar Lipids Inc | 840044 | أنواع الفوسفوليبيد البديلة التي تساهم في 30٪ من تكوين / خليط الدهون (من المقالة الأصلية Bilal and G & ouml; زن ، علوم المواد الحيوية ، 2017) |
| تكساس ريد 1،2-ثنائي هيكساديكانويل-sn-glycero-3-phosphoethanolamine ، ملح ثلاثي إيثيل أمونيوم (Texas Red DHPE) | Invitrogen (Thermo Fisher Scientific) | T1395MP | مترافق الدهون الفلورية ، 1٪ من تركيبة / خليط |
| الحمامات الجافة الرقمية / سخانات الكتلة | Thermo Fischer | 88870006 | لتسخين الجلسرين من أجل تقليل لزوجته |
| الجلسرين للبيولوجيا الجزيئية ( & جي ؛ 99٪) | Sigma Life Science | G5516 | لإعداد الدهون |
| < قوي > PBS buffer ؛ (الرقم الهيدروجيني = 7.8) ؛ المكونات أدناه في الصفوف 17-21< / قوي> | تستخدم لتحضير تعليق الدهون ؛ | ||
| قاعدة TRIZMA ، المعيار الأساسي والمخزن المؤقت (> 99٪) | Sigma Life Science | T1503 | تستخدم لإعداد PBS عازلة |
| فوسفات البوتاسيوم ثلاثي القاعدة ، درجة الكاشف (& ge ؛ 98٪) (K3PO4) | Sigma-Aldrich | P5629 | PBS المكون العازل |
| كبريتات المغنيسيوم سباعي الهيدرات ، BioUltra (& ge; 99,5٪) KT (MgSO4< / sub>7H2< / sub>O) | Sigma Life Science | 63138 | PBS مكون عازل |
| فوسفات البوتاسيوم أحادي القاعدة ، لا مائي ، حر التدفق ، Redi-Dri ، ACS (KH2< / sub>PO4< / sub>) | Sigma-Aldrich | 795488 | مكون عازل PBS |
| الصوديوم ، 99.0-101.0٪ (Na 2< / sub >EDTA) | Sigma-Aldrich | E4884 | PBS و Chelator-HEPES المكون العازلة |
| منظف بالموجات فوق الصوتية USC-TH | VWR | 142-0084 | الموجات فوق الصوتية للدهون المعاد ترطيبها |
| المبخر الدوار - ب ü المبخر الدوار تشي موديل R-200 & nbsp ؛ | سيجما | Z626797 | لتبخر الكلوروفورم |
| مقياس الضغط - منظم الفراغ IRV-100 | SMC | IRV10 / 20 | للتحكم في قيمة الضغط أثناء الجفاف الدهني |
| < قوي > HEPES-buffer (درجة الحموضة = 7.8) ؛ المكونات أدناه في الصفوف 26-27 < / قوي > | تستخدم لترطيب الدهون. المحتوى: 10 ملي مولار HEPES مع 100 م كلوريد الصوديوم المخفف في ماء منزوع الأيونات فائق | ||
| النقاء ؛ هيبس & جي ؛ 99.5٪ (معايرة بالتحليل الحجمي) | Sigma Life Science | H3375 | مكون HEPES-buffer |
| كلوريد الصوديوم للبيولوجيا الجزيئية ، DNase ، RNase ، والبروتياز ، لم يتم الكشف عن أي شيء ، & ge ؛ 98٪ (المعايرة) (كلوريد الصوديوم) | Sigma Life Science | S3014 | مكون عازلة HEPES |
| <قوي > عازلة الكالسيوم HEPES (درجة الحموضة = 7.8) ؛ مكون فعال أدناه في الصف 29< / قوي > | يستخدم لنشر الدهون. المحتوى: 10 ملي مولار HEPES ، 100 ملي كلوريد الصوديوم ، 4 ملي كاسترويد < > 2 < / فرعي > مخفف في ماء منزوع الأيونات | ||
| كلوريد الكالسيوم اللامائي ، الكاشف الحيوي ، مناسب لزراعة خلايا الحشرات ، مناسب لزراعة الخلايا النباتية ، & ge ؛ 96.0٪ (CaCl 2< / sub>) | Sigma Life Science | C5670 | لتحضير عازلة الكالسيوم HEPES |
| < قوية > Chelator-HEPES (درجة الحموضة = 7.8) ؛ المكون الفعال أدناه في الصف 31< / قوي > | يستخدم لتعزيز تكوين الشبكات الأنبوبية. المحتوى: 10 ملي هيبس ، 100 ملي كلوريد الصوديوم ، 10 ملي EDTA و 7 ملي بابتا مخفف في ماء منزوع الأيونات فائق | ||
| ؛ 1،2-مكرر (2-أمينوفينوكسي) إيثان-N ، N ، N & رئيس ؛ N & رئيس ؛ - ملح رباعي الصوديوم حمض رباعي الأسيتيك &ge ؛ 95٪ (HPLC) (BAPTA-Na4) | Sigma Life Science | 14513 | Chelator-HEPES المكون العازلة |
| هيدروكسيد الصوديوم ؛ | Sigma | 30620 | الحل الأساسي المستخدم لضبط الرقم الهيدروجيني للمخازن المؤقتة لمقياس |
| الأس الهيدروجيني المتراكم & التجارة ؛ AE150 درجة الحموضة | فيشر Scientific | 1544693 | تستخدم لقياس الأس الهيدروجيني لجميع المخازن المؤقتة طبق |
| بتري زجاجي | VWR | HECH41042012 | 6 سم ، تستخدم لصنع ورقة PDMS |
| كاشف هيدروكسيد البوتاسيوم ACS ، & ge ؛ 85٪ ، الكريات (KOH) | Sigma-Aldrich | 221473 | لصنع محلول KOH لتنظيف طبق بتري الزجاجي لتصنيع ورقة PDMS |
| Isopropanol prima ren 99.5٪ | Antibac AS | 600079 | KOH مكون |
| التدفئة والتجفيف - venticell | MMM Medcenter Einrichtungen GmbH & nbsp ؛ | MC000714 | لتجفيف طبق بتري الزجاجي بعد السيلانة ولعلاج PDMS |
| Dichlorodimethylsilane &ge ؛ 99.5٪ | Sigma-Aldrich | 440272 | تستخدم لسيلان طبق بتري الزجاجي الذي يتم فيه تحضير ورقة PDMS |
| مضخة فراغ | Cole-Parmer | EW-79202-05 | متصلة بالمجفف ؛ |
| Sylgard 184 عامل علاج المطاط الصناعي السيليكون | Dow corning | 24236-10 | Kit لصنع حل PDMS |
| Sylgard 184 قاعدة | |||
| مشرط يمكن التخلص | منه Swann-Morton | 11798343 | يستخدم لقطع زلات غطاء PDMS |
| Menzel -Gl & auml ؛ ser | MEZ102460 | 24 × 60 مم. تستخدم لإيداع غشاء رقيق من Al2< / sub>O3< / sub> | |
| نظام ترسيب الطبقة الذرية | Beneq | TFS200 (رقم الطراز) | نظام ترسيب الطبقة الذرية المستخدم لإيداع غشاء رقيق من Al2< / sub>O3< / sub> في مقياس القطع الناقص الزجاجي |
| لغطاء المجهر ؛ | شركة جيه إيه وولان. | Alpha-SE (اسم الطراز) | نظام يستخدم لتفويض سمك الفيلم المودع على سطح الزجاج |
| المسح الضوئي بالليزر confocal المجهر | Leica Microsystems | Leica TCS SP8 X | Microscope المستخدم لتصور التجربة |
| الهدف 40x ، 1.3 NA | Leica Microsystems | 1550635 | يستخدم لتصور التجربة |
| مصدر ليزر الضوء الأبيض | Leica Microsystems | Leica TCS SP8 X | لإثارة الفلوروفور الغشائي |