نقدم هنا، بروتوكولا لعزل غشاء البلازما والسيتوبلازم والميتوكوندريا U937 الخلايا دون استخدام الطرد المركزي عالية السرعة. يمكن استخدام هذا الأسلوب لتنقية الكسور سوبسيلولار لدراسة لاحقة للتعريب البروتين عن طريق إيمونوبلوتينج.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
مقالة منهجية
نقدم هنا، بروتوكولا لعزل غشاء البلازما والسيتوبلازم والميتوكوندريا U937 الخلايا دون استخدام الطرد المركزي عالية السرعة. يمكن استخدام هذا الأسلوب لتنقية الكسور سوبسيلولار لدراسة لاحقة للتعريب البروتين عن طريق إيمونوبلوتينج.
في هذا البروتوكول أننا بالتفصيل طريقة الحصول على كسور سوبسيلولار U937 الخلايا دون استخدام تنبيذ فائق أو المنظفات عشوائية. ويستخدم هذا الأسلوب المخازن المؤقتة ناقص التوتر، ديجيتونين، وتحلل الميكانيكية والطرد المركزي التفاضلي لعزل السيتوبلازم، الميتوكوندريا وغشاء البلازما. العملية يمكن تحجيمها لاستيعاب احتياجات الباحثين، وهي غير مكلفة وبسيطة. سيسمح هذا الأسلوب الباحثين لتحديد التعريب البروتين في الخلايا دون المتخصصة أجهزة الطرد المركزي، ودون استخدام مجموعات تجارية، والتي يمكن أن تكون باهظة التكاليف. أننا استخدمت بنجاح هذا الأسلوب لفصل سيتوسوليك وغشاء البلازما والبروتينات المتقدرية في خط الخلية الوحيدات البشرية U937.
الهوية موثوقة للتعريب البروتين ضروري غالباً عند دراسة مسارات الجزيئية في الخلايا حقيقية النواة. وتستخدم أساليب الحصول على كسور سوبسيلولار من الباحثين بدراسة المكونات الخلوية من اهتمام أوثق.
معظم أساليب تجزئة الخلية الحالية عموما تندرج في فئتين عريضتين، تستند إلى المنظفات1،2 و على أساس تنبيذ فائق3،4،5، التي يمكن أن تكون متباينة بالسرعة والدقة والتكلفة. المنظفات البروتوكولات استناداً إلى الاعتماد على استخدام المخازن المؤقتة مع زيادة قوة المنظفات جعل العناصر المتميزة للخلية. وهذا هو طريقة سريعة وملائمة لتجهيز العينات، ويمكن أن تكون فعالة من حيث التكلفة إذا كان عدد وحجم العينات الصغيرة. يمكن شراء مجموعات تستند إلى مواد التنظيف لعزل هيولى والغشاء/عضية (الكسر مختلطة) والكسور النووي من الخلايا. ومع ذلك، تحد عيوباً عديدة ترتبط بهذه المجموعات فائدتها للباحثين. تهدف إلى عزل عناصر واحد أو اثنين من الخلية بسهولة ولكنهم غير قادرين على عزل جميع الكسور من عينة في نفس الوقت. استخدام المنظفات يعني أن الغشاء البلازمية والعضيات محاطة الغشاء سوف سولوبيليزيد على قدم المساواة، ومن ثم غير قادر على يمكن فصلها عن بعضها البعض. مضاعفات إضافية تنشأ عن مكونات الملكية في هذه المجموعات مما يمنع الباحثين من تغيير الظروف لتطبيقات محددة. وأخيراً، أنها محدودة في عدد من الاستخدامات وقد يكون باهظ التكلفة لإجراء التجارب على نطاق أكبر. توجد مجموعات استناداً إلى عدم-المنظفات لعزل الميتوكوندريا، بيد أنها لم تصمم لعزل غشاء البلازما وعينه العائد إلى حد كبير أقل من كثافة استخدام الطرد المركزي القائمة على عزل البروتوكولات6،7 .
الأساليب التي تستخدم تنبيذ فائق للحصول على الكسور هي أكثر وقتاً طويلاً، لكن كثيرا ما تؤدي الكسور أنقى من مجموعات تستند إلى مواد التنظيف. لعزل الأغشية البلازمية من الخلايا دون سولوبيليزينج الأولى لهم (الذي ينتج عنه تلوث بغشاء العضيات) يتطلب منها أن يكون تفكيك بأسلوب غير المنظفات متبوعاً بالفصل بين المكونات الخلوية عبر التفاضلية الطرد المركزي – مع غشاء البلازما العزلة التي تتطلب سرعة 100,000 × ز لإنجاز. في كثير من الحالات، يجب أن يتبعها الطرد المركزي التفاضلي إيسوبيكنيك الكثافة المتدرجة الطرد المركزي لمزيد من الانفصال كسور الخلوية أو إزالة الملوثات. في حين أن هذه الأساليب شاملة وقابلة للتعديل، تشمل عيوب التكلفة واستهلاك الوقت، والحاجة أولتراسينتريفوجي للفصل بين الكسور وكذلك تنقية عبر الكثافة المتدرجة الطرد المركزي. على معظم أجهزة الطرد المركزي عالية السرعة بتكلفة باهظة للمحققين الفردية، وهي غالباً ما يشارك، الأساسية للمعدات في المؤسسات الأكاديمية. وهكذا، يصبح توافر ultracentrifuge الباهظة في هذه الحالات.
في هذا البروتوكول تجزئة نظهر عزلة الكسور سوبسيلولار دون استخدام المنظفات سولوبيليزينج ودون استخدام الطرد المركزي عالية السرعة. سيسمح هذا الأسلوب الباحثون عزل غشاء البلازما والميتوكوندريا ومكونات هيولى الخلية حقيقية النواة مع الحد الأدنى من التلوث بين الكسور.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
1. إعداد المخازن المؤقتة والمواد الكاشفة
ملاحظة: انظر الجدول 1.
2-برنامج تلفزيوني الغسيل
3-عزل بروتين سيتوسوليك
4-خلية التجانس
5-التفاضلية الطرد المركزي
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
وأنجزت تجزئة ناجحة من خلايا غير متمايزة من8 U937 تزرع في تعليق استخدام بروتوكول المفصلة أعلاه، وهو موضح في الشكل 1. العينات التي تم الحصول عليها بهذه الطريقة قد تعرضوا لغربي النشاف9 استخدام أسلوب نقل رطب لغشاء الفينيليدن فلوريد (PVDF). الغشاء كان بحث في وقت لاحق مع الأجسام المضادة ضد هيولى، الميتوكوندريا والغشاء المترجمة علامات البروتين (الشكل 2، رقم 3،...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
وضع هذا البروتوكول قد نشأت من عدم قدرة على فصل mitochondrial وعينات الغشاء، باستخدام مجموعات المتاحة تجارياً، بتحليل للتعريب البروتين خلال نيكروبتوسيس14. القيود الأساسية لمجموعات premade هي قدرتها على أن تتكيف مع احتياجات الباحثين من الأفراد، التكلفة لكل عينة وعدد محدود من العينات قادراً على معالجتها. يمكن تنفيذ الطريقة المعروضة هنا دون استخدام الكواشف باهظة الثمن، ودون الحاجة إلى معدات مكلفة. هذا الأسلوب يمكن تحجيمها لاستيعاب أي عدد من الخلايا ويمكن أن يتم تعديلها لتناسب احتياجات الباحثين. يسمح ه...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
الكتاب يعلن عدم تضارب المصالح
وأيده عمل المعاهد الوطنية للصحة-1R15HL135675-01 إلى تيموثي ج. لاروككا
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| Digitonin | TCI Chemicals | D0540 | لاستخراج السيتوبلازم |
| D-Mannitol | Sigma-Aldrich | M4125 | للمخزن المؤقت للتحلل B |
| الخالط Dounce | VWR | 22877-282 | للتجانس |
| دوار نهاية إلى طرف | Barnstead | N / A | لاستخراج السيتوبلازم |
| الإيثيلين جلايكول مكرر (& بيتا ؛ أمينوإيثيل الأثير) -N ، N ، N ' ، N'-tetraacetic acid (EGTA) | Alfa Aesar | J61721 | للمحلول المؤقت B |
| حمض الإيثيلين ديامين تترا أسيتيك (EDTA) | Sigma-Aldrich | E7889 | للمحلول المؤقت للتحلل B |
| GAPDH (14C10) | تقنيات إشارات الخلية | 2118 | للكشف عن الكسور السيتوبلازمية على اللطخة الغربية ، التخفيف< / u>: 1: 10000 |
| HEPES | VWR | J848 | لمخازن التحلل A و B |
| KCl | Sigma-Aldrich | P9541 | للمخزن المؤقت للتحلل B |
| MgCl2< / sub> | Alfa Aesar | 12315 | للمخزن المؤقت للتحلل B |
| Na ، K-ATPase a1 (D4Y7E) | تقنيات إشارات الخلية | 23565 | للكشف عن كسور غشاء البلازما على اللطخة الغربية ، التخفيف < / u>: 1: 1000 |
| كلوريد الصوديوم | سيجما-ألدريتش | 793566 | للمخزن المؤقت للتحلل أ |
| فينيل ميثان سولفونيل فلوريد (PMSF<قوي>) < / strong> | VWR | M145 | لاستخراج السيتوبلازم والتجانس مسبار عازلة |
| صوتي | Qsonica | Q125-110 | للعينات النهائية |
| كوكتيل مثبط البروتياز ، الاستخدام العام | VWR | M221-1ML | لاستخراج السيتوبلازم |
| جهاز طرد مركزي مبرد | Beckman-Coulter | N / A | |
| كبريتات دوديسيل الصوديوم (SDS) | VWR | 227 | لعينة العازلة |
| لأورثوفانادات الصوديوم (SOV) | 450243 سيجما ألدريتش | لمخازن التحلل A و B | |
| السكروز | سيجما ألدريتش | S0389 | للمحلول الملحي للتحلل B |
| Tris-buffered Saline (TBS) | VWR | 788 | للعينة العازلة |
| VDAC (D73D12) | تقنيات | إشارات الخلية4661 | للكشف عن كسور الميتوكوندريا على اللطخة الغربية diltion< / u>: 1:1000 |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.