وقد أنشئ هذا البروتوكول البحثي مباشرة على أساس المبادئ الواردة في إعلان هلسنكي وحصل على موافقة مجالس المراجعة المؤسسية لمركز الصحة بجامعة ماكغيل (RI-MUHC, #15-031), the Université du Québec à مونتريال (UQAM, #602) ومركز مركز مستشفى جامعة مونتريال (CR-CHUM, #15-180).
1. القصبات الفيجيلة
ملاحظة: يصف هذا القسم تنظير القصبات كما يقوم به أخصائي تنفس مرخص بمساعدة معالج تشخصي16و17 .
- إعداد قطع من الأجهزة اللازمة لهذا الإجراء، بما في ذلك منظار القصبات والمالحة. إعطاء رذاذ مخدر إلى الجزء الخلفي من حلق المريض. تجنب الاستخدام المفرط للتخدير الموضعي عندما يكون ذلك ممكناً. تطبيق القلب يؤدي إلى الصدر من أجل رصد معدل ضربات القلب والإيقاع ومسبار الأكسجين إلى الإصبع الأول من اليد من أجل رصد تشبع الأكسجين. إدراج قنية الأنف في الخياشيم لتوفير الأكسجين التكميلي.
- وضع المريض، ويفضل في موقف supine. إدارة التخدير على النحو التالي: ميدازولام 0.01-0.04 ملغ / كغ والفينتانيل 50-100 ميكروغرام (لتسهيل راحة المريض وتقليل رد الفعل السعال) عن طريق الوريد، في وجود طبيب التنفس أو التخدير.
- تقدم منظار القصبات المرنة حتى يتم وضعها في القصبات الفرعية الفرعية المطلوبة. غرس المالحة (50-60 مل في وقت واحد) مع الحقنة، ومن ثم تطبيق شفط لطيف (50-80 مم زئبق). سوف يتم جمع سائل الغسل في الحقنة ثم يتم نقله إلى حاوية تجميع.
- كرر تدفق إلى ما مجموعه 200-300 مل من الغسل. جمع ما لا يقل عن 100 مل من السائل BAL إذا كان ذلك ممكنا.
- ضع سائل BAL على الجليد.
2. عزل خلايا BAL
ملاحظة: يجب تنفيذ الإجراء التالي في ظروف معقمة في خزانة السلامة البيولوجية، الفئة الثانية (BSL2) أو أعلى.
-
الاحتفاظ عينات BAL على الجليد حتى تتم معالجتها.
- دوامة BAL في أنبوب جمع الأصلي ونقله إلى أنبوب 50 مل باستخدام ماصة المصلية. إذا كان السائل BAL يبدو عكر جدا أو ملوثة من قبل الأنسجة الخيطية، تصفية السائل من خلال مرشح شبكة النايلون 70 ميكرومتر في أنبوب جديد 50 مل.
- الطرد المركزي في 200 × ز لمدة 10 دقيقة في 4 درجة مئوية. نقل supernatant إلى أنبوب جديد 50 مل. تفريق بيليه بلطف مع طرف ماصة وإعادة تعليقها في 1 مل من RPMI 1640 المتوسطة.
- نقل 1 مل من supernatant إلى كل من 10X 1.5 مل أنابيب الطرد المركزي الدقيقة وsupernatant المتبقية إلى 15 مل أنابيب، 10 مل في كل. تخزين جميع أنابيب supernatant في -80 درجة مئوية.
-
معالجة بيليه الخلية BAL.
- إعادة تعليق بيليه في 10 مل من RPMI 1640 لكل 25 مل من العينة الأصلية. الطرد المركزي في 200 × ز لمدة 10 دقيقة في 4 درجة مئوية. نقل supernatant إلى أنبوب جديد 15 مل (تجاهل بعد التأكد من وجود ما يكفي من الخلايا في بيليه).
- إعادة تعليق بيليه في 1 مل من RPMI 1640 + 10٪ مصل البقر الجنيني (FBS) وحساب باستخدام الأزرق تريبان ومقياس الهيموتوميومتر.
ملاحظة: إذا لم يتم فصل السائل BAL عن طريق الالتزام الخلايا قبل الفرز، انتقل إلى القسم 4.
3. الالتزام بخلايا BAL (اختياري)
ملاحظة: يمكن تنفيذ هذا البروتوكول البديل قبل أو بدلاً من فرز الخلايا. يجب تنفيذ الإجراء التالي في ظروف معقمة في خزانة BSL2 (أو أعلى).
- نقل العدد المطلوب من خلايا BAL للفرز إلى أنبوب جديد 15 مل ويشكلون وحدة التخزين الصحيحة ل1.5 × 106 الضامة / مل. لوحة 2 مل من الخلايا لكل بئر في لوحات 6-جيدا وحضانة لمدة 2ساعة في 37 درجة مئوية مع 5٪ CO 2، لإتاحة الوقت للانضمام.
- بعد الحضانة، يستنشق بعناية وسائل الإعلام التي تحتوي على خلايا غير ملتصقة ونقلها إلى أنبوب 15 مل. الطرد المركزي في 300 × ز لمدة 10 دقائق في درجة حرارة الغرفة (RT). إزالة supernatant وإعادة تعليق في 1 × 107 خلايا / مل في الفوسفات المخزنة المالحة (PBS) + 2 ٪ FBS ونقل التعليق إلى أنبوب البوليسترين 5 مل جولة القاع. هذا الكسر اللمفاوي هو الآن على استعداد لوصمة عار لفرز الخلايا.
- إلى الخلايا الملتصقة المتبقية في اللوحة، أضف 1 مل لكل بئر من محلول فك الارتباط الخلوي (انظر جدولالمواد) وحضانة لمدة 15 دقيقة على الأقل عند 37 درجة مئوية مع 5٪ CO2،حتى تنفصل الخلايا بسهولة عن اللوحة مع طرف ماصة.
- بلطف ولكن بدقة كشط الخلايا الملتصقة من سطح البئر باستخدام طرف ماصة، واستخدام 1 مل من السائل في البئر للمساعدة في مفرزة. نقل الخلايا إلى أنبوب جديد 15 مل. غسل الآبار مع 1 مل من PBS وإضافة هذا إلى نفس الأنبوب. تشكل محتوى الأنبوب إلى 5 مل مع PBS.
- الطرد المركزي في 300 × ز لمدة 10 دقائق في RT. إزالة supernatant، إعادة تعليق في 1 × 107 خلايا / مل PBS + 2٪ FBS، ونقل التعليق إلى أنبوب البوليسترين 5 مل جولة القاع. هذا الكسر النخاعي هو الآن على استعداد لوصمة عار لفرز الخلايا.
4. عزل خلايا الدم الطرفية أحادية النونافية
ملاحظة: يجب تنفيذ الإجراء التالي في ظروف معقمة في خزانة BSL2 (أو أعلى).
- في نفس اليوم من تنظير القصبات (عموما مباشرة قبل جمع BAL)، والحصول على ستة أنابيب من الدم الوريدي من متبرع في أنابيب حمض اثيلين ديايمينتيترا (EDTA) (حوالي 10 مل لكل أنبوب).
- فصل الدم عن طريق الطرد المركزي أنابيب الدم في 300 × ز لمدة 15 دقيقة في RT. نقل البلازما إلى 1.5 مل أنابيب الطرد المركزي الدقيقة في aliquots 1 مل وتخزينها في -80 درجة مئوية.
-
تنفيذ فصل تدرج الكثافة.
- أضف 2 مل من RPMI 1640 إلى كل أنبوب دم واخلط جيدا باستخدام ماصة مصلية.
- نقل إلى أنابيب 3X 50 مل ويشكلون حجم في كل أنبوب إلى 25 مل مع RPMI 1640.
- إعداد دفعة أخرى من أنابيب 3X 50 مل، كل منها تحتوي على 20 مل من وسط فصل الخلايا الليمفاوية (LSM) (انظر جدولالمواد) في RT. ببطء وبلطف طبقة 25 مل من الدم المخفف على رأس LSM لكل من الأنابيب الثلاثة، وعقد الأنبوب في زاوية 45 درجة .
- الطرد المركزي في 600 × ز لمدة 25 دقيقة في RT مع تسارع منخفض وليس تباطؤ (الفرامل قبالة).
-
إجراء غسل للخلايا أحادية النووية في الدم المحيطي (PBMCs).
- نقل طبقة من الخلايا في واجهة المرحلتين السائلتين في الأنبوب إلى أنبوب 50 مل باستخدام ماصة مصلية؛ إذا كان هناك أكثر من 30 مل من الحجم، تقسيمه إلى أنبوبين. تشكل وحدة التخزين في كل أنبوب إلى 50 مل مع PBS.
- الطرد المركزي في 700 × ز لمدة 5 دقائق في RT وإزالة قدر supernatant ممكن.
- إعادة تعليق بيليه ويشكلون حجم إلى 25 مل مع PBS. الطرد المركزي في 350 × ز لمدة 10 دقائق في RT وإزالة قدر من supernatant ممكن.
- كرر خطوة الغسيل الموضحة في الخطوة 4.4.3.
- إعادة تعليق بيليه في 5 مل من PBS + 2٪ FBS وعد الخلايا.
5. فرز خلايا BAL كله وPBMCs
ملاحظة: يجب أن يتم الإجراء التالي في ظل ظروف معقمة في BSL2 (أو أعلى).
- إعداد المخزن المؤقت للفرز الذي يحتوي على PBS + 5% FBS + 25 mM HEPES (الرقم الهيدروجيني 7.4). إعداد 5 مل أنابيب البوليسترين جولة القاع مع 1 مل من FBS لجمع المجموعات الفرعية خلية فرزها.
-
أداء تلطيخ.
- إعداد أنابيب البوليستيرين المستديرة القاع بدرجة 3x 5 مل، لكل منها لـ BAL (الخلايا الكاملة أو الخلايا الليمفاوية والكسور النخاعية بعد الالتزام) وPBMCs (انظر القسم 4). لكل مجموعة فرعية، وإعداد أنبوب واحد مع الخلايا لفرز واثنين من أنابيب من 5 × 105 الخلايا لاستخدامها لضوابط التعويض وصمة عار غير ملطخة والبقاء.
- الطرد المركزي في 350 × ز لمدة 5 دقائق في 4 درجة مئوية. إزالة supernatants، إعادة تعليق الخلايا للعناصر التحكم في 100 μL من PBS، وتخزينها في 4 درجة مئوية حتى يمكن إعداد عناصر تحكم التعويض كما هو موضح في الخطوة 5.2.6.
- إعداد تخفيف 1:20 من مستقبلات Fc (FcR) حجب الكاشف في PBS + 5٪ FBS (انظر جدول المواد-لمنع الربط غير محدد من الأجسام المضادة لFcR على الخلايا التعبير عن FcR). إعادة تعليق الخلايا لفرزها في 1 × 107 الخلايا في 250 درجة مئوية من خليط FcR حجب. احتضانها لمدة 1 ساعة عند 4 درجة مئوية.
- بعد الحضانة، أضف كوكتيل الأجسام المضادة المناسب (انظر الجدول1) إلى الخلايا وحضانة لمدة 1 ساعة عند 4 درجة مئوية في الظلام.
- بعد 1 ساعة من تلطيخ، إضافة 1 مل من PBS إلى الخلايا والطرد المركزي في 350 × ز لمدة 5 دقائق في 4 درجة مئوية. إزالة supernatant وإعادة تعليق الخلايا في المخزن المؤقت الفرز أن يكون 1 × 107 الخلايا في 250 درجة مئوية.
- إعداد عناصر تحكم التعويض.
- إضافة ثلاث قطرات كل من المضادة للماوس Ig، والخرز التعويض السيطرة السلبية (انظر جدولالمواد) لكل 1 مل من PBS في أنبوب الطرد المركزي الصغير ونقل 100 ميكرولتر إلى كل 5 مل جولة القاع أنبوب البوليسترين لاستخدامها للتعويض. إعداد أنبوب واحد لكل فلوروكروم موجودة في الكوكتيل لاستخدامها.
- إضافة 1 ميكرولتر من كل جسم مضاد في الكوكتيل إلى أنبوب مختلف يحتوي على الخرز. إضافة 1 μL من وصمة عار الصلاحية إلى واحد من أنابيب 5 × 105 الخلايا المنصوص عليها في الخطوة 5.2.1. حضانة لمدة 20 دقيقة عند 4 درجة مئوية في الظلام.
- إضافة 1 مل من PBS إلى كل أنبوب والطرد المركزي في 350 × ز لمدة 5 دقائق في 4 درجة مئوية. إزالة supernatant وإعادة تعليق بيليه في 250 درجة مئوية من PBS. يُحفظ عند درجة حرارة 4 درجات مئوية في الظلام حتى يُلزم الأمر.
- فرز الخلايا عن طريق فرز الخلايا المنشطة الفلورية (FACS) في أنابيب جمع أعدت مع 1 مل من FBS ودوامة بلطف لمعطف الجانبين من الأنابيب مع المصل.
- فرز خلايا BAL في الضغط المنخفض. خلايا البوابة أولاً لاستبعاد الضوضاء وتشمل العيش، CD45+ الخلايا، وداخل هذه البوابة السكان خارج خلايا doublet (انظر الشكل 3). ضمن ال [ميلويد] كبيرة مجموعة فرز [كد206] و [كد169] مزدوجة إيجابيّة خلايا ك [يمس]; داخل أصغر الخلايا الليمفاوية عزل CD3+ الخلايا وفرز كل من CD4 و CD8 السكان إيجابية واحدة (انظر الشكل 3; استراتيجية gating مفصلة في قسم النتائج التمثيلية).
- عند فرز PBMCs، خلايا البوابة أولاً لاستبعاد الضوضاء وتشمل الخلايا الحية، CD45+ ، وداخل هذه البوابة السكانية خارج خلايا doublet. بعد ذلك، بوابة على خلايا CD3 وداخل CD3- السكان، بوابة أولا على CD14 وفرز الخلايا الأحادية إيجابية واحدة، ومن ثم داخل CD3+ بوابة السكان على CD4 و CD8 وفرز كل من السكان إيجابية واحدة (استراتيجية gating مفصلة في قسم النتائج التمثيلية.
6- النمط المناعي للأجهزة المضادة للأفراد وثنائي الفينيل متعدد البروم
ملاحظة: يجب تنفيذ الإجراء التالي في ظروف معقمة في خزانة BSL2 (أو أعلى).
- إضافة ما يصل إلى 1 مليون من AMs وPBMCs إلى اثنين منفصلة 5 مل جولة القاع أنابيب البوليسترين. الطرد المركزي في 300 × ز لمدة 5 دقائق في 4 درجة مئوية وإزالة supernatant.
- تنفيذ حظر FcR لتحسين خصوصية تلطيخ الأجسام المضادة. لهذا، إعادة تعليق الخلايا في 100 درجة مئوية من PBS + 2٪ FBS وإضافة 1.4 درجة مئوية من FcR حجب الكاشف. حضانة لمدة 20 دقيقة في 4 سC.
-
أداء تلطيخ خارج الخلية.
- بعد الحضانة مع كتلة FcR، إضافة الكوكتيل المطلوب خارج الخلية الأجسام المضادة، دوامة الأنابيب، وحضانة لمدة 1 ساعة في 4 درجة مئوية في الظلام.
- غسل 2X عن طريق إضافة 500 درجة مئوية من PBS والطرد المركزي في 350 × ز لمدة 5 دقائق في 4 درجة مئوية.
-
الاستعداد للتثبيت ونفاذية (انظر جدول المواد للحصول على الكواشف المحددة المستخدمة).
- إعداد حل نفاذية مع 1 جزء نفاذية العازلة و 3 أجزاء العازلة مخفف. إعادة تعليق بيليه في 1 مل من حل نفاذية وحضانة لمدة 40 دقيقة في 4 درجة مئوية في الظلام.
- إعداد محلول غسل باستخدام 1 جزء غسل العازلة و 4 أجزاء H2O. إضافة 2 مل من محلول الغسيل إلى الخلايا نفاذيبيليد والطرد المركزي في 350 × ز لمدة 5 دقائق في 4 درجة مئوية. إزالة supernatant.
-
أداء تلطيخ داخل الخلايا.
- إعادة تعليق الخلايا في 100 درجة مئوية من 1X حل الغسيل، إضافة الأجسام المضادة داخل الخلايا المطلوب، دوامة الأنابيب، وحضانة لمدة ساعة على الأقل في 4 درجة مئوية في الظلام.
- إضافة 2 مل من محلول الغسيل والطرد المركزي في 350 × ز لمدة 5 دقائق في RT. إزالة supernatant وإعادة تعليق بيليه في 200 درجة مئوية من PBS. تخزين الخلايا في 4 درجة مئوية في الظلام حتى الحاجة.
7. ما تبقى من خلايا BAL
ملاحظة: يجب تنفيذ الإجراء التالي في ظروف معقمة في خزانة BSL2 (أو أعلى).
- يسمح أرقام الخلايا، حفظ الخلايا الحية بالتبريد من بيليه الخلية BAL (من الخطوة 2.2.2).
- إعداد وسائل التجميد التي تحتوي على 90٪ FBS + 10٪ ثنائي ميثيل سولفوكسيد (DMSO).
- طرد مركزي الخلايا في 300 × ز لمدة 10 دقيقة في 4 درجة مئوية. إزالة supernatant وإعادة تعليق في 1.5 مل من وسائل الإعلام تجميد في قارورة المبردة. نقل قارورة المبردة إلى حاوية تجميد معدل تسيطر عليها (انظر جدولالمواد) ووضعها في -80 درجة مئوية. نقل الخلايا إلى النيتروجين السائل للتخزين على المدى الطويل بمجرد الوصول إلى درجة الحرارة.
-
الحفاظ على خلايا BAL ككريات جافة.
- نقل الخلايا المتبقية إلى أنبوب الطرد المركزي الصغير 1.5 مل. الطرد المركزي في جهاز طرد مركزي مضاد في 6000 × ز لمدة دقيقة واحدة. تخزين بيليه في -80 درجة مئوية.
8- الحمض النووي لفيروس نقص المناعة البشرية والتحديد الكمي للحمض النووي الريبي
ملاحظة: يجب تنفيذ الإجراء التالي في ظروف معقمة في خزانة BSL2 (أو أعلى).
- مجموع القياس الكمي للحمض النووي لفيروس نقص المناعة البشرية
- لتجنب تثبيط تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) مع الحطام بال lysate، استخدم مجموعة استخراج الحمض النووي (انظر جدولالمواد) لاستخراج الحمض النووي من عينة من خلايا BAL وفقا لتعليمات الشركة المصنعة. استخدام 15 ميكرولتر من هذا الحمض النووي جنبا إلى جنب مع مزيج رئيسي في خطوة preamplification الموضحة أدناه (الخطوة 8.1.3).
- إعداد تخفيف منحنى القياسية.
- كما هو موضح أعلاه، استخدم مجموعة استخراج الحمض النووي لاستخراج الحمض النووي من بيليه من 2 × 106 خلايا ACH-2 (انظر جدولالمواد).
- بعد إهليل الحمض النووي، قم بإجراء تخفيفات تسلسلية 10 أضعاف من الحمض النووي ACH-2 لتوليد ستة تخفيفات، تتراوح بين 3 × 105 خلايا إلى 3 خلايا لكل 15 ميكرولتر.
- تنفيذ خطوة preamplification.
- في غرفة منفصلة، قم بإعداد المزيج الرئيسي لـ n + 2 عينات تتألف من 1x عازل بوليميراز، 3 مم من MgCl 2، 300 μM dNTPs، و 2.5 U من بولميراز الحمض النووي Taq (انظر جدول المواد)و 300 nM من كل من المواد التمهيدية الأربعة (انظر الخطوة 8-1-3-2). تنفيذ جميع التدابير في الآبار الثلاثية.
- استخدم المواد التمهيدية hCD3OUT5'، hCD3OUT3'، ULF1، وUR1 لتوليد الحمض النووي المتضخم من كل من CD3 البشري وفيروس نقص المناعة البشرية (انظر التسلسلات في الجدول2). لاحظ أن كلا الجينات يتم تضخيمها مسبقا في نفس الأنبوب. يُمزج بلطف ويُدور أسفل الأنبوب لضمان الخلط الكامل.
- توزيع 35 ميكرولتر من المزيج الرئيسي لكل بئر في لوحة PCR 96-well وإضافة 15 ميكرولتر من الحمض النووي القياسية أو عينة. حجم التفاعل الكلي هو 50 درجة مئوية.
- أداء preamplification (denaturation في 95 درجة مئوية لمدة 8 دقائق، تليها 12 دورات من 95 درجة مئوية لمدة 1 دقيقة، 55 درجة مئوية لمدة 40 ق، 72 درجة مئوية لمدة 1 دقيقة، واستطالة في 72 درجة مئوية لمدة 15 دقيقة).
- تنفيذ PCR في الوقت الحقيقي.
- لتحديد كمية CD3 وفيروس نقص المناعة البشرية الحمض النووي، وإعداد اثنين من يمزج الرئيسية التي تحتوي على 1X PCR مزيج التفاعل الرئيسي (انظر جدولالمواد)، 1250 nM التمهيديات المناسبة، و 100 nM التحقيق. استخدام التمهيديات HCD3IN5 ' وHCD3IN3 ' ومسبار CD3 FamZen لتحديد CD3 الإنسان في رد فعل واحد، والتمهيديات UR2 و LambdaT والتحقيق UHIV FamZen لتحديد الحمض النووي فيروس نقص المناعة البشرية في رد فعل آخر (انظر التسلسل في الجدول 2). توزيع 13.6 ميكرولتر من كل مزيج في أنابيب قابلة للتكيف مع qPCR.
- تمييع المنتج PREAmplification PCR في 1:10 في الماء المعقم، DNase، RNase، والبروتياز مجانا. إضافة 6.4 ميكرولتر من كل عينة مخففة إلى 13.6 ميكرولتر من مزيج qPCR في أنابيب قابلة للتكيف مع qPCR لكمية التفاعل الإجمالية 20 ميكرولتر.
- تنفيذ PCR في الوقت الحقيقي باستخدام البرنامج التالي: denaturation في 95 درجة مئوية لمدة 4 دقائق و 40 دورات من 95 درجة مئوية لمدة 3 s و 60 درجة مئوية ل 10 s مع اكتساب واحد.
- استقراء عدد نسخ فيروس نقص المناعة البشرية ومكافئات الخلايا العددية في كل أنبوب رد فعل من المنحنيات القياسية. حساب عدد نسخ الحمض النووي لفيروس نقص المناعة البشرية/106 خلايا.
- قياس كمية الحمض النووي الريبي HIV
- استخراج الحمض النووي الريبي من عينة من خلايا BAL، وذلك باستخدام مجموعة استخراج RNA (انظر جدولالمواد) وفقا لتعليمات الشركة المصنعة. استخدم 17 ميكرولتر من هذا الحمض النووي الريبي في خطوة النسخ العكسي وpreamplification الموضحة أدناه (الخطوة 8.2.4).
- يستخدم LTR-هفوة RNA توليفها في المختبر وكميا بدقة كمعيار. هو ارتفعت في صحة متبرع استخراج الحمض النووي الريبي لتطبيع GUSB. إعداد ستة تخفيفات تسلسلية 10 أضعاف من هذا المعيار، المقابلة ل3 × 105 خلايا إلى ثلاث نسخ من الحمض النووي الريبي LTR-هفوة في 17 درجة مئوية.
- توزيع 17 ميكرولتر من كل تخفيف قياسي وكل عينة في لوحة PCR 96-well وعلاج العينات مع DNase (انظر جدولالمواد) لمدة 10 دقائق في 25 درجة مئوية لإزالة الحمض النووي الجيني الملوث. وقف رد الفعل عن طريق إضافة 2 درجة مئوية من 25 MM EDTA واحتضان العينات لمدة 10 دقيقة في 65 درجة مئوية.
- إجراء النسخ العكسي (RT) وPREAMPlification PCR.
- قم بتنفيذ هذه الخطوة باستخدام مجموعة RT-PCR من خطوة واحدة (راجع جدولالمواد) وفقًا لإرشادات الشركة المصنعة. استخدام التمهيديات GUSB إلى الأمام 1، GUSB عكس 1، UR1، وULF1 لتوليد cDNA تضخيم من كل من GUSB الإنسان كجين التدبير المنزلي وLTR-هفوة فيروس نقص المناعة البشرية RNA (انظر التسلسلفي الجدول 2). سيتم استخدام قيم GUSB لتطبيع قيم فيروس نقص المناعة البشرية.
- توزيع 31 درجة مئوية من المزيج الرئيسي لكل بئر في نفس لوحة PCR 96-well التي تحتوي على المعايير المعالجة DNase والعينات ومزيج جيدا. حجم التفاعل الكلي هو 50 درجة مئوية.
- تشغيل لوحة لمدة 16 دورات وفقا لتعليمات الشركة المصنعة، مع درجة حرارة الصلب من 55 درجة مئوية.
- تنفيذ PCR في الوقت الحقيقي.
- إعداد اثنين من يمزج الرئيسية التي تحتوي على 1X PCR مزيج رد الفعل الرئيسي (كما هو موضح أعلاه في الخطوة 8.1.4.1)، 1250 nM التمهيديات المناسبة، و 100 nM التحقيق. استخدام التمهيديات GUSB إلى الأمام 2، GUSB عكس 2، والتحقيق GUSB-HEX لتحديد CDNA GUSB في رد فعل واحد؛ استخدام التمهيديات UR2، LambdaT، والتحقيق UHIV FamZen لتحديد كمية فيروس نقص المناعة البشرية cDNA في رد فعل آخر (انظر التسلسل في الجدول 2).
- توزيع 13.6 ميكرولتر من كل مزيج رئيسي في أنابيب قابلة للتكيف مع qPCR. تخفيف RT preamplification PCR المنتجات 1:10 في الماء المعقم، DNase، RNase، والبروتياز مجانا، وإضافة 6.4 ميكرولتر من كل عينة مخففة أو معيار إلى مزيج PCR المناسبة. حجم التفاعل الكلي هو 20 درجة مئوية.
- تنفيذ PCR في الوقت الحقيقي باستخدام البرنامج التالي: denaturation في 95 درجة مئوية لمدة 4 دقائق و 40 دورات من 95 درجة مئوية لمدة 3 ق و 60 درجة مئوية لمدة 10 ق مع اقتناء واحد (حدد القناة الخضراء لFamZen والأصفر لHEX).