ويتميز الغلوبولين المناعي G (مفتش) N-glycan باستخدام التفاعل هيدروفيلييك اللوني uplc. الاضافه إلى ذلك ، يتم فصل هيكل مفتش N-glycan بشكل واضح. يقدم هنا مقدمه لهذه الطريقة التجريبية بحيث يمكن استخدامها علي نطاق واسع في إعدادات البحث.
يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية
مقالة منهجية
* These authors contributed equally
ويتميز الغلوبولين المناعي G (مفتش) N-glycan باستخدام التفاعل هيدروفيلييك اللوني uplc. الاضافه إلى ذلك ، يتم فصل هيكل مفتش N-glycan بشكل واضح. يقدم هنا مقدمه لهذه الطريقة التجريبية بحيث يمكن استخدامها علي نطاق واسع في إعدادات البحث.
غليكوميكس هو تخصص فرعي جديد في البحوث نظام اوميكس التي توفر إمكانات كبيره في اكتشاف الجيل التالي من المؤشرات الحيوية للاصابه بالمرض ، واكتشاف هدف المخدرات ، والطب الدقيق. وقد تم الإبلاغ عن البديلة مفتش ن-غليكانز في العديد من الامراض المزمنة الشائعة ، واقترح ان يكون لها إمكانات كبيره في التطبيقات السريرية (اي ، المؤشرات الحيوية للتشخيص والتنبؤ بالامراض). وتتميز علي نطاق واسع مفتش ن-غليكانز باستخدام طريقه التفاعل هيدروفيلي اللوني (hilic) اللوني السائل فائقه الأداء (uplc). UPLC هو تكنولوجيا الكشف مستقره مع استنساخ جيده وعاليه الدقة الكمية النسبية. الاضافه إلى ذلك ، يتم فصل هيكل مفتش ن-glycan بشكل واضح ، وتتميز تكوين glycan ووفره نسبيه في البلازما.
N-glycosylation من البروتينات البشرية هو تعديل المشتركة والاساسيه بعد الانتقالية1 وقد تساعد علي التنبؤ بحدوث وتطور الامراض بشكل دقيق نسبيا. نظرا لتعقيد هيكلها ، فمن المتوقع ان هناك أكثر من 5,000 glycan الهياكل ، وتوفير إمكانات كبيره كما التشخيص والمؤشرات الحيوية التنبؤيه للامراض2. N-غليكانز تعلق علي الغلوبولين المناعي G (مفتش) وقد ثبت ان تكون ضرورية لوظيفة مفتش ، ومفتش ن-glycosylation يشارك في التوازن بين الموالية للانظمه والمضادة للالتهابات3. وتشارك التفاضلية مفتش ن-glycosylation في تطوير الامراض والتقدم ، والتي تمثل كل من الاستعداد واليه الوظيفية المشاركة في امراض المرض. وقد ارتبط الدور التهابي من مفتش ن-glycosylation مع الشيخوخة, الامراض التهابيه, امراض المناعة الذاتية, والسرطان4.
مع تطوير تكنولوجيا الكشف ، وتستخدم الطرق التالية علي نطاق واسع في غليكوميكس عاليه الانتاجيه: اللوني تفاعل هيدروفيلي (HILIC) اللوني السائل فائقه الأداء مع الكشف عن الفلورية (UPLC-FLR) ، متعدد الشعرية هلام الكهربائي مع الليزر التي يسببها الكشف عن الفلورية (Xgggg-ليف) ، مصفوفة بمساعده الليزر/تاين الوقت من الطيران الطيف الكتلي (MALDI-تسوف-MS) ، واللوني السائل الحراري الطيف الكتلي (LC-ESI-MS) . وقد تغلبت هذه الأساليب علي أوجه القصور السابقة للتدفق المنخفض ، والنتائج غير المستقرة ، وخصوصية الحساسية الضعيفة5،6.
ويستخدم علي نطاق واسع UPLC لاستكشاف العلاقة بين مفتش ن-glycosylation وبعض الامراض (اي ، الشيخوخة7، السمنة8، ديسسليبيدميا9، النوع الثاني السكري10، ارتفاع ضغط الدم11، السكتة الدماغية12، ومرض باركنسون13). بالمقارنة مع الطرق الثلاثة المذكورة أعلاه ، uplc لديه المزايا التالية5،14. أولا ، فانه يوفر طريقه التحليل الكمي النسبي ، وتحليل البيانات التي تنطوي علي تطبيع المنطقة الاجماليه يحسن قابليه للمقارنة لكل عينه. ثانيا ، تكلفه المعدات والخبرات المطلوبة منخفضه نسبيا ، مما يجعل من الأسهل لتنفيذ وتحويل العلامات الحيوية الغليكويليشن في التطبيقات السريرية. يقدم هنا مقدمه إلى UPLC بحيث يمكن استخدامها علي نطاق أوسع.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
وقد تمت الموافقة علي جميع المواضيع المدرجة في البروتوكول من قبل لجنه الأخلاق في جامعه العاصمة الطبية ، بكين ، الصين12. وتم الحصول علي موافقه خطيه مستنيرة من كل موضوع في بداية الدراسة.
1. مفتش العزلة
2. الإفراج عن غليكان
3. غليكان وسم وتنقيه
4. اللوني التفاعل هيدروفيلييك وتحليل غليكانز
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
كما هو مبين في الشكل 1، تم تحليلها مفتش N-غليكانز إلى 24 الاوليه مفتش القمم غليكان (GPs) علي أساس موقف الذروة والاحتفاظ بالوقت. وتتوفر هياكل N-glycan من خلال الكشف عن الطيف الكتلي وفقا لدراسة سابقه (الجدول 1)15. ولضمان ان تكون النتائج قابله للمقارنة ، تم تطبيق التطبيع الإجمالي للمناطق ، حيث تم التعبير عن كميه الغلجان في كل ذروه كنسبه مئوية من إجمالي المساحة المتكاملة.
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
Uplc بمثابه التحليل الكمي النسبي طريقه5،15. وتشير النتائج إلى ان UPLC هو تكنولوجيا الكشف مستقره مع استنساخ جيده والدقة الكمية النسبية. يتم التعبير عن كميه غليكانز في كل ذروه كنسبه مئوية من إجمالي المنطقة المتكاملة باستخدام UPLC ، وهي القيمة النسبية. ويؤدي القياس الكمي النسبي إلى تحسين قابليه عينات الاختبار للمقارنة. الاضافه إلى ذلك ، 96 البروتين جيدا وتستخدم لوحات G لتنقيه مفتش مع 96 عينات في وقت واحد للكشف عن الانتاجيه العالية. قدره البروتين ز لربط مفتش أكبر من ...
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
وليس لدي المؤلفين ما يفصحون عنه.
وقد دعم هذا العمل بمنح مقدمه من المؤسسة الوطنية للعلوم الطبيعية في الصين (81673247 & 81872682) والمنحة التعاونية الاستراليه الصينية (NH & APP1112767-NSFC 81561128020).
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| 2-أمينوبنزاميد ، 2-AB | سيجما ، الصين | ||
| 96 بئر لوحة | AXYGEN | ||
| 96 جيدا بول | 0.45 um GHP | ||
| 96 جيدا لوحة متجانسة | BIA Separations | ||
| 96 بئر لوحة الدوارة | Eppendorf Co.، Ltd ، ألمانيا | T_1087461900 | |
| حمض الخليك | Sigma، الصين | ||
| أسيتونيتريل | Huihai Keyi التكنولوجيا المحدودة ، الصين | ||
| بيكربونات الأمونيوم | Shenggong البيولوجية الهندسة المحدودة ، الصين | ||
| الأمونيوم فورمات | بكين مينرويدا التكنولوجيا المحدودة | ||
| حاضنة الاهتزاز المستمر / الروك | Zhicheng أداة التحليل التصنيع المحدودة ، الصين | ZWY-10313 | |
| سلم معايرة ديكستران / عمود جليكوببتيد | واط التكنولوجيا المحدودة ، الصين | BEH عمود | |
| ثنائي ميثيل سلفوكسيد (DMSO) | سيجما ، الصين | ||
| ثنائي فوسفات الصوديوم | Shenggong الهندسة البيولوجية المحدودة ، الصين | ||
| أفران كهربائية | اختبار الأدوات المحدودة | 202-2AB | |
| Empower 3.0 | Waters technology Co.، Ltd ، أمريكا | ||
| Ethanol | Huihai Keyi Technology Co.، Ltd ، الصين | ||
| حمض الفورميك | سيجما ، الصين | ||
| GlycoProfile 2-AB مجموعة وضع العلامات | سيجما ، الصين | ||
| حمض الهيدروكلوريك | Junrui Biotechnology Co.، Ltd ، الصين | ||
| أجهزة الطرد المركزي عالية السرعة | Eppendorf Co.، Ltd ، ألمانيا | 5430 | |
| Igepal | Sigma ، الصين | ||
| أجهزة الطرد المركزي ذات درجة الحرارة المنخفضة | Eppendorf Co.، Ltd ، ألمانيا | ||
| ثلاجة درجة حرارة منخفضة | Qingdao Haier Co.، Ltd | ||
| المنوع 96 بئر لوحة | واط التكنولوجيا المحدودة ، الصين | 186001831 | |
| الميثانول | Huihai Keyi التكنولوجيا المحدودة ، الصين | ||
| Milli-Q عداد المياه النقية | Millipore المحدودة ، أمريكا | ميزة A10 | |
| NaOH | Shenggong الهندسة البيولوجية المحدودة ، الصين | ||
| اختبار PH | Sartorius Co.، Ltd ، ألمانيا | PB-10 | |
| محلول ملحي مخزن الفوسفات ، PBS | Shenggong الهندسة البيولوجية المحدودة ، الصين | ||
| Pipette | Eppendorf المحدودة ، ألمانيا | 4672100 ، 0.5-10 & mu ؛ ل & أمبير 10-100 مو ؛ ل & أمبير 20-200 مو ؛ ل & أمبير 1000 مو ؛ ل | |
| PNGase F إنزيم | سيجما ، الصين | ||
| فوسفات ثنائي هيدروجين البوتاسيوم | Shenggong Biological Engineering Co.، Ltd ، الصين | ||
| Propan-2-ol | Huihai Keyi Technology Co.، Ltd ، الصين | ||
| SDS | Sigma ، الصين | ||
| كلوريد الصوديوم | Shenggong البيولوجية الهندسة المحدودة ، الصين | ||
| سيانوبوروهيدريد الصوديوم (NaBH3CN) | سيجما ، الصين | ||
| مقياس الطيف | الضوئي شنغهاي Yuanxi أداة المحدودة | B-500 | |
| نقل بندقية السائل | Smer Fell Science and Technology Co.، Ltd ، الصين | 4672100 | |
| تريس | أمريسكو ، ثلاجة | ||
| أمريكا ذات درجة حرارة منخفضة | Thermo Co.، Ltd ، أمريكا | MLT-1386-3-V ؛ MDF-382E | |
| فائقة الأداء الكروماتوغرافيا السائلة | واتس التكنولوجيا المحدودة ، الصين | Acquity MLtraPerformance LC | |
| مضخة فراغ | واتس التكنولوجيا المحدودة ، الصين | 725000604 | |
| آلة التطاير / مجفف | Eppendorf Co.، Ltd ، ألمانيا | T_1087461900 | |
| Vortex | Changzhou Enpei أداة المحدودة ، الصين | NP-30S | |
| حمام الماء | المحدودة | DK-98-IIA | |
| ميزان | وزن شنغهاي Jingke الصك العلمي المحدودة | MP200B |
الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.