$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1- إعداد وجمع الديدان القديمة لعزل الخلايا
ملاحظة: موضح أدناه هو عزل الخلايا العصبية الكولينية من سلالة الأمم المتحدة الكولينية المعدلة وراثيا-17:: GFP (OH13083) التي تم الحصول عليها من مركز علم الوراثة Caenorhabdititis (CGC) مستودع سلالة في جامعة مينيسوتا. لا بد من الحفاظ على ظروف معقمة لمنع التلوث من الفطريات أو البكتيريا.
- إعداد ومزامنة الديدان عن طريق طريقة التبييض كما هو موضح من قبل T. Stiernagle16. لتجارب الشيخوخة، الديدان لوحة على الديدان الخيطية المتوسطة (NGM) لوحات تحتوي على 25 ميكرومتر محلول المياه من الفلوريد يوريدين (FuDR) للحد من إنتاج البيض والقبض على الفقس البيض. فحص لوحات أجار بانتظام لمنع التلوث أو تفقيس البيض لأن هذا سوف يسبب نتائج غير موثوق بها.
ملاحظة: بالنسبة لـ unc-17::GFP الخلايا، عادة ما تستخدم ثلاث لوحات NGM 100 مم × 15 مم لعزل كمية كافية من الخلايا ذات الأهمية16.
- جمع الديدان وإعداد المخازن المؤقتة لعزل الخلية.
- جمع الديدان في أنبوب مخروطي 15 مل. غسل الديدان من لوحة مع 1.5 مل من M9العازلة (1 MM MgSO 4، 85 مل NaCl، 42 mM Na2HPO4·7H2O، 22 m KH2PO، درجة الحموضة 7.0) والطرد المركزي لمدة 5 دقائق في 1600 × ز. تجاهل الديدان الفائقة وغسل مع 1 مل من المخزن المؤقت M9. كرر الطرد المركزي وغسل ما مجموعه خمس مرات لإزالة أكبر قدر ممكن من التلوث القولونية.
ملاحظة: إضافة المضادات الحيوية (50 ميكروغرام / مل)، مثل أمبيسيلين، في هذه الخطوة يمكن أن تساعد في الحد من التلوث البكتيري.
- لعينتين، إعداد 2 مل من الصوديوم دوديسيل كبريتات-dithiothreitol (SDS-DTT) التحلل العازلة: 200 مل DTT، 0.25٪ (ث / الخامس) SDS، 20 MM HEPES (درجة الحموضة 8.0)، و 3٪ (ث / v) السكروز.
- إعداد 15 مل من العزلة العازلة (118 مل NaCl، 48 ملككل، 2 مليون متر CaCl 2، 2 M MMgCl2،25 MM HEPES [pH 7.3]) وتخزينها على الجليد.
ملاحظة: يجب إجراء كل من المخزن المؤقت sDS-DTT lysis والمخزن المؤقت العزل جديدة قبل كل تجربة.
- اضطراب بشرة وعزل خلية واحدة
- الحيوانات الطرد المركزي التي تم جمعها في الخطوة 1.2.1 لمدة 5 دقائق في 1600 × ز. إزالة جميع supernatant وتعليق الديدان في 1 مل من وسائل الإعلام M9 ونقل إلى 1.5 مل أنبوب الطرد المركزي الدقيق.
- الديدان بيليه مع الطرد المركزي في 1600 × ز لمدة 5 دقائق.
- إضافة 200 درجة مئوية من SDS-DTT lysis العازلة إلى الديدان والحضانة لمدة 5 دقائق في درجة حرارة الغرفة (RT). وينبغي أن يبدو أن الديدان "winkled" على طول الجسم إذا ينظر إليها تحت المجهر الخفيف.
ملاحظة: قد يؤدي التعرض لفترات طويلة إلى المخزن المؤقت للانداء SDS-DTT إلى موت الديدان التي يمكن رصدها عن طريق مراقبة الديدان. الديدان التي هي ميتة سوف elongate ولن حليقة.
- أضف 800 ميكرو لتر من عازلة العزلة الباردة ومزجها بواسطة أنبوب النقر بلطف.
- الديدان بيليه لمدة 1 دقيقة في 13،000 × ز في 4 درجة مئوية، وإزالة supernatant وغسل مع 1 مل من العزلة العازلة.
- كرر الخطوة 1.3.5 لما مجموعه خمس مرات إزالة المخزن المؤقت العزل بعناية في كل مرة.
- أضف 100 ميكرو لتر من خليط البروتياز من العقدية (15 ملغ/مل) (جدولالمواد)المذاب في عزلة إلى بيليه وحضانة لمدة 10-15 دقيقة في RT.
ملاحظة: كما هو الحال مع العازلة SDS-DTT lysis، قد يؤدي هضم البروتياز الموسعة إلى انقسام مفرط من البروتينات على طول غشاء البلازما، ومنع عزل السطح يتعرض GFP عبر الخرز المغناطيسي.
- أثناء الحضانة مع خليط البروتياز، ضع الإزعاج الميكانيكي عن طريق توجيه عينات من أعلى وأسفل إلى أسفل أنبوب الطرد المركزي الصغير 1.5 مل مع طرف ميكرومازيت 200 ميكروميكروسيت لمدة 60-70 مرة تقريبًا. الحفاظ على طرف ماصة ضد جدار أنبوب الطرد المركزي الصغير مع الضغط المستمر لخلايا فك الارتباط بشكل صحيح.
- لتحديد مرحلة الهضم، قم بإزالة حجم صغير (~1-5 درجة مئوية) من خليط الهضم، وأسقطه على شريحة زجاجية وفحصه باستخدام مجهر زراعة الأنسجة. بعد 5-7 دقائق من الحضانة، يجب أن تكون شظايا الديدان قد خفضت بشرة واضحة، وسوف تكون الطين من الخلايا مرئية بسهولة.
- وقف رد الفعل مع 900 درجة مئوية من L-15 الباردة المتاحة تجاريا L-15 المتوسطة مع 10٪ مصل البقر الجنيني (FBS) والبنسلين-ستربيميتوميتسين (التركيز النهائي في 50 U / مل البنسلين و 50 ميكروغرام / مل العقديات).
- بيليه معزولة شظايا وخلايا عن طريق الطرد المركزي لمدة 5 دقائق في 10،000 × ز في 4 درجة مئوية. اغسل الخلايا الكرياتة بـ 1 مل من الوسائط الباردة المكمّلة بـ L-15 مرتين لضمان إزالة الحطام الزائد والبشرة.
- إعادة تعليق الخلايا الكريات في 1 مل من وسائل الإعلام L-15 تكملوترك على الجليد لمدة 30 دقيقة. خذ الطبقة العليا، حوالي 700-800 درجة مئوية، إلى أنبوب الطرد المركزي الصغير. تحتوي هذه الطبقة على خلايا بدون حطام خلايا وسيتم استخدامها في العزلة اللاحقة للخلايا ذات الأهمية.
- باتباع تعليمات الشركة المصنعة، استخدم عداد خلايا آلي أو مقياس الهيموميتومتر لقياس كثافة الخلايا من 10-25 ميكرولتر من الخلايا المعزولة.
2. عزل الخلايا الإيجابية GFP عن طريق تدفق قياس الخلايا أو المضادة للحبات المغناطيسية GFP
ملاحظة: هناك طريقتين التي يمكن نشرها لعزل أنواع خلايا معينة. الطريقة الأولى هي استخدام فرز الخلايا المنشطة الفلورية (FACS)، في حين أن الطريقة الثانية تستخدم الخرز المغناطيسي المترافق بالأجسام المضادة لتجميع الخلايا التي تعبر عن بروتينات متميزة من غشاء البلازما المترجمة. الطريقة الأخيرة تتطلب توطين GFP إلى غشاء البلازما، وبالتالي تكون متاحة للتفاعل مع حبة المغناطيسية المقترنة بالأجسام المضادة.
- عزل الخلايا الإيجابية GFP عن طريق قياس التدفق
- من تعليق الخلايا المعزولة التي تم جمعها في الخطوة 1.3.12، خلايا الطرد المركزي لمدة 5 دقائق في 10،000 × ز في 4 درجة مئوية. تخلص من الخلايا الزائدة وتعليقها في المتوسط المكمّل بـ L-15 إلى كثافة خلايا لا تزيد عن 6 × 106 خلايا/مل لتجنب التحميل الزائد لمقياس التدفق الخلوي.
- فرز الخلايا حسب التعبير الإيجابي GFP باستخدام مقياس التدفق قادرة على فرز العينات. يمكن استخدام الخلايا السالبة GFP كعنصر تحكم لتحليل خاص بنوع غير الخلية.
ملاحظة: كما ذكر أعلاه، يمكن استخدام نهج بديل لعزل الخلايا الإيجابية GFP إذا تم ترجمة البروتين ذات العلامات GFP ذات الأهمية إلى غشاء البلازما للخلايا. وفي هذه الحالة، يمكن استخدام البروتوكول الوارد وصفه في الفرع 2-2.
- عزل الخلايا الإيجابية GFP عن طريق الخرز المغناطيسي المضادة لGFP
- من تعليق الخلايا المعزولة التي تم جمعها في الخطوة 1.3.12، خلايا الطرد المركزي لمدة 5 دقائق في 10،000 × ز في 4 درجة مئوية. تجاهل الخلايا الفائقة وتعليقها في 485 درجة مئوية من L-15-تكمل المتوسطة. إضافة 15 ميكرولتر من ddH2O قبل غسلها α-GFP المضادة للجسم المقترنة الخرز المغناطيسي إلى الحل.
- حضانة الخلايا مع الطين حبة المغناطيسي في 4 درجة مئوية لمدة 1 ساعة مع تحول لطيف جدا. تحول المفرط سوف تضر الخلايا.
- بعد الحضانة، عينة الطرد المركزي لمدة 5 دقائق في 10،000 × ز في 4 درجة مئوية، ثم غسل بيليه 2X مع 1 مل من L-15-تكمل المتوسطة لإزالة الخلايا السلبية GFP.
- زراعة الخلايا المعزولة
- لوحة خلايا معزولة في لوحة معقمة 6-جيدا متعددة جيدا.
ملاحظة: قد تكون مغلفة هذه اللوحات مع اللكتين الفول السوداني لزيادة مرفق الخلية. ومع ذلك، إذا كان سيتم استخدام الخلايا على الفور، قد يتم تجاهل هذه الخطوة.
- ضع اللوحة في حاوية بلاستيكية وخلايا الحضانة عند 20 درجة مئوية مع مسح رطب أو ورق ة من الأنسجة الرخوة (أضف 50 ميكروغرام/مل أمبيسيلين إلى ddH2O لضمان عدم وجود نمو بكتيري على المسح) لإضافة الرطوبة إلى الخلايا. لا تحتضن في حاضنة CO 2، كما ارتفاع مستويات ثاني أكسيد الكربون2 قد تضر الخلايا.
3. التصوير الفلورسنت من الخلايا الإيجابية GFP معزولة
- تشغيل لمبة الفلورسنت من المجهر المقلوب مع مرفق الفلورة والسماح لها بالاحماء لمدة 10 دقيقة.
- إزالة ثقافة الخلية من الحاضنة وتعيين على خشبة المسرح من المجهر المقلوب مع مرفق الإزهار. حرك مرشح GFP في الأخاديد تحت مرحلة المجهر.
- عرض الخلايا مع تكبير 50x. سوف تكون الخلايا الإيجابية GFP المعزولة بنجاح مرئية بسهولة. التقاط الصور باستخدام مرفق الكاميرا على المجهر.
4. استخراج الحمض النووي الريبي من الخلايا المعزولة
ملاحظة: يجب أن يتم استخراج الحمض النووي الريبي مباشرة بعد عزل الخلية لضمان جودة عالية من المواد. يمكن استخدام الحمض النووي الريبي المعزول لإنتاج cDNA والقياس اللاحق لمستويات النسخ بواسطة PCR الكمي (qPCR). يجب أن تكون جميع الأنابيب والنصائح والكواشف خالية من RNase، وينبغي أن تكون مساحة العمل غسلها الإيثانول قبل استخراج الحمض النووي الريبي.
- من الخلايا المعزولة التي تم جمعها في الخطوة 2.1.2، خلايا الطرد المركزي في 1.5 مل معقمة، RNase خالية من أنبوب الطرد المركزي الدقيقةلمدة 5 دقائق في 10،000 × ز في 4 درجة مئوية. إذا تم عزل الخلايا عن طريق الخرز المغناطيسي، اتبع جمع الخلايا كما ذكر أعلاه.
- باستخدام الميكرومازيت، قم بإزالة supernatant من أنبوب الطرد المركزي بالطرد المركزي وإضافة 100 ميكرولتر من M9 المتوسطة لغسل متوسط L-15 المكمّل. خلايا الطرد المركزي 5 دقائق في 10،000 × ز في 4 درجة مئوية وإزالة supernatant. لضمان إزالة جميع الوسائط، كرر ما مجموعه ثلاثة عمليات التنظيف بعناية إزالة supernatant في كل مرة.
- إضافة 1 مل من الفينول وguanidine isothiocyanate الحل (جدولالمواد)إلى الخلايا وماصة التعليق صعودا وهبوطا بعناية. احتضان الخليط في RT لمدة 5 دقائق.
- بعد الحضانة، إضافة 250 الفينول وguanidine حل إيزوثيوسينات
- الطرد المركزي الحل لمدة 5 دقائق في 10،000 × ز في 25 درجة مئوية.
- إزالة بعناية أكبر قدر من الطبقة المائية العليا مع micropipette ممكن، دون إزعاج الطبقات العضوية السفلية، ونقل الطبقة السفلى إلى أنبوب جديد 1.5 مل RNase خالية من microcentrifuge. إلى الأنبوب الجديد، إضافة 500 درجة مئوية من إيزوبروبانول ومزيج عن طريق عكس الأنبوب. احتضان هذا الحل في RT لمدة 5 دقائق.
- الطرد المركزي الأنبوب في 14،000 × ز لمدة 20 دقيقة في 25 درجة مئوية.
- مع الحفاظ على العينات على الجليد، وإزالة أكبر قدر ممكن من isopropanol مع micropipette، وإضافة بلطف 1 مل من 70٪ (V / V) الإيثانول في RNase خالية ddH2O إلى الأنبوب. تأكد من عدم إخراج الحل مباشرة على الجزء السفلي من الأنبوب. تطبيق خليط الإيثانول / الماء على جانب الأنبوب.
- الطرد المركزي في 10،000 × ز لمدة 5 دقائق في 25 درجة مئوية.
- قم بإزالة معظم الإيثانول والهواء الجاف على الجليد لمدة 3-5 دقائق.
ملاحظة: يجب إزالة الإيثانول بعد هذه الخطوة; ومع ذلك، فإن الفحص الدقيق للقاع من الأنبوب مهم لضمان عدم ترك الإيثانول.
- بعد أن يجف الهواء، أضف 15-20 درجة مئوية من DdH2O الخالي من RNase وقياس تركيز الحمض النووي الريبي ونقاءه باستخدام مقياس الطيف الضوئي عند الطول الموجي 260 نانومتر. وينبغي قياس نقاء العينة كنسبة قدرها 260 نانومتر/280 نانومتر. يجب أن تكون هذه النسبة حوالي >2.
ملاحظة: يمكن تجميد RNA المعزول وتخزينهعند -20 درجة مئوية. ومع ذلك، فمن الأفضل إلى حد كبير استخدام مجموعة توليف cDNA في أقرب وقت ممكن لضمان إنتاج الحمض النووي الريبي عالي الجودة. يمكن أن يتبع PCR الكمي باستخدام التعليمات التي تقدمها الشركة المصنعة للدراجة الحرارية المستخدمة في المختبر.