مقالة منهجية

تحليل النزوح من تشوه عضلة القلب الميكانيكية (DIAMOND) يكشف التغايرية القطعية لوظيفة القلب في حمار وحشي الجنيني

4.8K مشاهدات

⸱

DOI:

10.3791/60547

⸱

فبراير 6, 2020

 , 
1Division of Cardiology, Department of Medicine, David Geffen School of Medicine at University of California, Los Angeles, 2Ronald Reagan UCLA Medical Center, 3Veterans Affairs West Los Angeles Medical Center

في هذه المقالة

ملخص

الهدف من هذا البروتوكول هو تفصيل طريقة جديدة لتقييم وظيفة القلب القطاعية في سمك الحمار الوحشي الجنيني في ظل كل من الظروف الفسيولوجية والمرضية.

الملخص

وتستخدم بشكل متزايد حمار وحشي ككائن حي نموذجي لاعتلال عضلة القلب والتجدد. تفشل الأساليب الحالية التي تقيّم وظيفة القلب في الكشف عن الميكانيكا القطاعية بشكل موثوق وليست ممكنة بسهولة في سمك الحمار الوحشي. نقدم هنا طريقة شبه آلية مفتوحة المصدر للتقييم الكمي لوظيفة القلب القطعية رباعية الأبعاد: تحليل الإزاحة للتشوه الميكانيكي عضلة القلب (DIAMOND). تم تصوير سمك الحمار الوحشي الجنيني المعدل وراثيا في الجسم الحي باستخدام نظام المجهر الفلوري الفاتح مع تزامن حركة القلب 4D. تم إعادة بناء القلوب الرقمية ثلاثية الأبعاد المكتسبة في نهاية الانقباض ونهاية الانبساط ، وتم تقسيم البطين يدويًا إلى مجموعات بيانات ثنائية. ثم أعيد توجيه القلب وأعيد تعيناته على طول المحور القصير الحقيقي، وقسم البطين بالتساوي إلى ثمانية أجزاء (I-VIII) على طول المحور القصير. بسبب مختلف مستويات إعادة العينات والمصفوفات في نهاية systole ونهاية الانبساط ، تم تطبيق مصفوفة التحول لتسجيل الصور لاستعادة العلاقة المكانية الأصلية بين المصفوفات الصورة الانقباضي والانبساطي resampled. بعد تسجيل الصور، تم حساب متجه الإزاحة لكل جزء من نهاية الانقباض إلى النهاية على أساس إزاحة السنتاد الجماعية في ثلاثة أبعاد (ثلاثية الأبعاد). يظهر DIAMOND أن الأجزاء القلبية القاعدية المجاورة للقناة الأذينية البطينية تخضع لأعلى تشوه ميكانيكي وهي الأكثر عرضة لإصابة القلب الناجمة عن الدوكسوروبيسين. بشكل عام، توفر DIAMOND رؤى جديدة في ميكانيكا القلب القطاعية في أجنة حمار وحشي تتجاوز جزء القذف التقليدي (EF) في ظل كل من الظروف الفسيولوجية والمرضية.

المقدمة

السمية القلبية الناجمة عن العلاج الكيميائي وفشل القلب الذي يترتب على ذلك هي واحدة من الأسباب الرئيسية لوقف العلاج الكيميائي1. لذلك ، يلعب التقييم الوظيفي القلبي دورًا حاسمًا في تحديد سمية القلب ، والأهم من ذلك ، في التنبؤ بإصابات القلب المبكرة بعد العلاج الكيميائي2. ومع ذلك، فإن النُهج الحالية للتقييم الوظيفي القلبي تواجه قيودًا. طرق مثل كسر طرد البطين الأيسر (LVEF) توفر فقط ميكانيكا القلب العالمية والمؤجلة في كثير من الأحيان بعد الإصابة3،4. يوفر تصوير الأنسجة دوبلر معلومات تشوه عضلة القلب القطاعية ولكنه يعاني من تقلبات كبيرة داخل المراقب وبين المراقب ، ويرجع ذلك جزئيًا إلى تبعية زاوية شعاع الموجات فوق الصوتية5. يستخدم التتبع ذو الأبعاد الثنائية (2D) وضع B من تخطيط صدى القلب ، والذي يلغي نظريًا تبعية الزاوية ، ولكن دقته محدودة بالحركة خارج المستوى6. لذلك ، لا يوجد نهج صارم لقياس وظيفة القلب القطاعي في كل من الإعدادات البحثية والسريرية.

في هذا السياق، قمنا بتطوير طريقة قياس كمي 4D لتحليل وظيفة القلب القطاعية التي قمنا بتسمية تحليل الإزاحة للتشوه الميكانيكي عضلة القلب (DIAMOND)، لتحديد ناقلات الإزاحة من centroids الجماعية القلبية في الفضاء ثلاثي الأبعاد. طبقنا DIAMOND لتقييم في الجسم الحي لوظيفة القلب وسمية القلب الناجمة عن doxorubicin مع حمار وحشي(Danio rerio)كنموذج الحيوان ، الذي تم اختياره بسبب تجديد عضلة القلب والجينات التنموية المحفوظة للغاية7. كما قارنا إزاحة DIAMOND المجزأة مع تحديد كسر القذف العالمي (EF) والإجهاد 2D بعد علاج الدوكسوروبيسين. من خلال دمج إزاحة DIAMOND مع المجهر الفلوري 4D ورقة خفيفة (LSFM) المكتسبة تقديم قلوب حمار وحشي الجنينية، DIAMOND يظهر أن شرائح عضلة القلب القاعدية المجاورة للقناة الأذينية البطينية تخضع لأعلى تشوه ميكانيكي وهي الأكثر عرضة لإصابة القلب الدوكسوروبيسين الحادة8.

   

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

البروتوكول

تمت الموافقة على جميع الأساليب الموصوفة هنا من قبل لجنة رعاية الحيوانات المؤسسية واستخدامها في جامعة كاليفورنيا (IACUC) ، وتم إجراء التجارب وفقًا للبروتوكولات المعتمدة من قبل مكتب أبحاث الحيوانات في جامعة كاليفورنيا في لوس أنجلوس.

1. تربية Tg (cmlc2:mCherry) حمار وحشي وجمع الأجنة

  1. اتباع إجراءات السكن والتربية وجمع الأجنة كما هو موضح في ممارسات تربية وتربية المنشأ سابقاً. لمزيد من التفاصيل، انظر ميسيرشميدت وآخرون9.
  2. علاج الأجنة التي تم جمعها مع 0.003٪ 1-الفينيل-2-thiourea (PTU) في E3 المتوسطة 18 ح بعد الإخصاب للحفاظ على شفافية الأجنة لتصوير LSFM.

2. علاج دوكسوروبيسين للحث على إصابة القلب

  1. في 3 أيام بعد الإخصاب (dpf), علاج الأجنة مع دوكسوروبيسين بتركيز 10 ميكرومتر في E3 وسط مياه الأسماك. بعد علاج 24 ساعة إلى 4 dpf, استبدال متوسط دوكسوروبيسين مع E3 المتوسط الطازجة.
    تنبيه: دوكسوروبيسين هو دواء للعلاج الكيميائي. وثمة حاجة إلى معدات الحماية الشخصية المناسبة وينبغي التخلص من النفايات في حاويات نفايات المخاطر البيولوجية.

3. تشكيل مسار الشق

  1. علاج أجنة سمك الحمار الوحشي مع مثبط مسار نوتش (2S)-N-(3,5-difluorophenyl)acetyl]-L-alanyl-2-phenyl]glycine 1,1-dimethylethyl ester (DAPT) بتركيز 10 ميكرومتر في وسط مياه السمك E3 من 3-6 dpf.
  2. Microinject The Notch downstream effects Notch المجال داخل الخلايا (NICD) وNeuregulin-1 (Nrg-1) مرنا بتركيزات 10 pg/nL و 5 pg/nL، على التوالي، في الأجنة حمار وحشي مرحلة 1 خلية8،10.
    ملاحظة: يتم إجراء الحقن المجهري تحت المجهر بدعم من مضخة الهواء للتحكم بدقة في حجم الحقن. يتم الحقن المجهري للمرنا في الخلية عندما تكون البويضة المخصبة في مرحلة الخلية الأولى. للحصول على تفاصيل حول إعداد وتسلسل mRNAs، انظر تشنوآخرون. للحصول على تفاصيل حول الحقن المجهري وإعداد إبر الحقن، انظر روزين وآخرون10.

4. LSFM التصوير ومزامنة ما بعد التصوير

  1. للاطلاع على تقنيات التصوير LSFM وخوارزمية مزامنة ما بعد التصوير، راجع التفاصيل في المنشورات السابقة9و11.
    ملاحظة: لفترة وجيزة، يستخدم نظامنا ليزر الموجة المستمرة كمصدر الإضاءة لتصوير جميع خطوط حمار وحشي المعدلة وراثيا. وتتألف وحدة الكشف من كاميرتين علميتين متكاملتين لأشباه الموصلات المعدنية (sCMOS) ومجموعتين من المرشحات للتصوير بالقناة المزدوجة. يتم تثبيت وحدة الكشف عموديًا على مستوى الإضاءة. يتم الحصول على كل إطار LSFM في غضون 20 msec وقت التعرض، في حين أن قوة حل في المقطع العرضي هو ~ 0.65 ميكرون وحجم الخطوة بين الإطارات المتتالية هو ~ 2 ميكرون. تم استخدام ليزر 589 نانومتر لإثارة إشارات الفلورسنت mCherry.

5. إعادة بناء القلب الانقباضي والانبساطي ثلاثي الأبعاد

  1. افتح المجلد الذي تم إنشاؤه بواسطة خوارزمية مزامنة المشاركة، ثم افتح مجلد"الإخراج". حدد المستوى الأوسط للقلب وحمّل المجلد بأكمله إلى ImageJ. العثور على المرحلة الانبساطية الأولى والانقباضي وتسجيل رقم الإطار.
  2. افتح مجلد "الإخراج/حسب الحالة" وابحث عن المجلدات التي لها نفس أرقام الإطارات المسجلة للتو. تحويل الصور في المجلد إلى TIFF 3D (تنسيق ملف الصورة الموسومة) الملفات وتسميتها "diastole.tif" و "systole.tif".

6- تجزئة البطين

  1. افتح برنامج تحليل الصور (انظر جدول المواد). انقر فوق ملف | فتح البيانات، وتحميل "diastole.tif" و "systole.tif". أدخل حجم فوكسل وفقًا لإعدادات التصوير.
    ملاحظة: بالنسبة لنظام LSFM المستخدم، يبلغ حجم فوكسل النموذجي 0.65 ميكرومتر × 0.65 ميكرومتر × 2 ميكرومتر.
  2. انقر فوق"تجزئة"لوحة ويدويا تقسيم الجزء البطين يمن القلب. المدمج في"عتبة"أداة التي يمكن تحديد جميع المناطق فوق كثافة معينة يمكن أن تسهل هذه العملية. البطين هو غرفة أكثر سمكا مع الفلورسة أقوى.
    ملاحظة: تأكد من إزالة القناة الأذينية البطينية والقناة الخارجة في البطين المجزأ، لأن هذا يؤثر على تحليل الإزاحة.
  3. بعد الانتهاء من التجزئة، انقر فوق لوحة"المشروع". الحق انقر فوق"انبساط. Labels.tif" و"systole. Labels.tif" علامات التبويب في وحدة التحكم وانقر فوق"تصدير البيانات كما" لحفظ البيانات كملفات TIFF 3D.

7. إنشاء متوازيات مستطيلة لتسجيل الصور

  1. تشغيل "prepImage_1.m" في بيئة البرمجة (انظر جدول المواد). فتح "prepImage_1.m"،"ImPath" في سطر 5 بحيث يحتوي المجلد على ملفات TIFF الأصلية والمجزأة ، وتغيير "شريحة" في السطر 4 إلى عدد شرائح ملفات tif ثلاثية الأبعاد.
  2. بعد تشغيل التعليمات البرمجية، فإنه سيتم إنشاء خمسة ملفات TIFF 3D جديدة ("test.tif" و "diastole_200.tif" و "systole_200.tif" و "diaLabel.tif" و "sysLabel200.tif") بالإضافة إلى مجلدين جديدين ("resample_dia" و "resample_sys").

8. إعادة عينة قلوب 3D الانقباضي والانبساطي على طول مستوى المحور القصير

  1. استيراد جميع ملفات TIFF ثلاثية الأبعاد الخمسة في برنامج تحليل الصور (انظر جدول المواد).
    ملاحظة: حجم voxel لم يتغير.
  2. انتقل إلى لوحة MULTIPLANAR. اختر "diastole_200.tif" كبيانات أساسية. قم بمحاذاة المحور X (الخط الأخضر في المستوى XY) مع المحور الرأسي الطويل للبطين، ومحاذاة المحور Z (الخط الأحمر في مستوى YZ) مع المحور الأفقي الطويل للبطين.
    ملاحظة: يتم تحديد المحور الرأسي الطويل من خلال العثور على أطول محور يربط بين القمة ومسار التدفق الخارجي في مستوى XY، ويتم تحديد المحور الأفقي الطويل من خلال العثور على أطول محور يربط بين القمة ومسار التدفق في مستوى YZ. تدوير المحور عن طريق وضع المؤشر في نهاية المحور.
  3. اختر ثلاث نقاط عشوائية من مستوى YZ المائل (مستوى المحور القصير) بطريقة عكس عقارب الساعة وسجل إحداثيات موضعها ثلاثية الأبعاد.
    ملاحظة: تأكد من اختيار النقاط بطريقة عكس عقارب الساعة.
  4. كرر الخطوتين 8.2 و 8.3 لـ "systole_200.tif".
  5. انقر فوق لوحة"PROJECT". إنشاء"شريحة"كائن ل "diastole_200.tif" عن طريق النقر على اليمين على "diastole_200.tif" والبحث عن"شريحة"الكائن. انقر على اليسار على كائن الشريحة الذي تم إنشاؤه للتو، وفي لوحة الخصائص | خيارات، والتحقق من"تعيين الطائرة"واختيار ثلاث نقاط في"تعريف الطائرة". أدخل إحداثيات النقاط الثلاث من الخطوة 7.3.
  6. كرر الخطوة 8.5 لـ "systole_200.tif".
    ملاحظة: يجب أن يكون كائن الشريحة الذي تم إنشاؤه اسم"شريحة 2".
  7. انقر على اليمين "diastole_200.tif" والبحث عن"إعادة تشكيل صورة تحويلها"وإنشاء الكائن. في لوحة الخصائص، اختر"شريحة"كـ"مرجع"وانقر فوق تطبيق. يجب أن ينشئ هذا كائن يسمى"diastole_200.transformed".
  8. انقر على اليمين "diastole_200.transformed"والبحث عن"Resample"وإنشاء الكائن. اختر"حجم Voxel"كـ"وضع"وغيّر"حجم فوكسل"ليكون x = 1، y = 1، وz = 1 في لوحة الخصائص.
  9. انقر فوق"تطبيق". يجب أن ينشئ هذا كائن يسمى"diastole_200.resampled". انقر على اليمين "diastole_200.resampled" وحفظه كملف TIFF ثلاثي الأبعاد.
  10. كرر نفس الخطوة لـ "diaLabel.tif" و "test.tif". حفظ "diaLabel.resampled" و "test.resampled" كملفات TIFF 3D. كرر نفس الخطوة لـ "systole_200.tif" و "sysLabel.tif" و "test.tif" باستخدام"Slice 2"كمرجع وحفظ "systole_200.resampled" و "sysLable.resampled" و "test2.resampled" كملفات TIFF ثلاثية الأبعاد.
    ملاحظة: تأكد من وجود ما مجموعه ستة ملفات TIFF المحفوظة في هذه الخطوة.

9- تقسيم القلب الذي أعيد تعيناته

  1. استيراد كافة الملفات الستة التي تم إعادة تشكيلها من الخطوة 8 إلى ImageJ. حدد شريحة من "systole_200.resampled" التي يتم فيها تصور القناة الأذينية البطينية بوضوح. تسجيل رقم الشريحة.
    1. استخدام "صورة | تحويل | تدوير" وظيفة ImageJ بحيث تكون القناة الأذينية للفرن عمودي. تطبيق نفس التناوب على كافة الملفات. أغلق جميع النوافذ واحفظ جميع التغييرات.
    2. نقل "diastole_200.resampled" و "diaLabel.resampled" و "test.resampled" إلى مجلد "resample_dia" ونقل "systole_200.resampled" و "sysLable.resampled" و "test2.resampled" إلى مجلد "resample_sys".
  2. فتح "divider_2_8_pieces.m". تغيير "ImPath" في السطر 5 و"ImPath"في سطر 395 إلى دليل الصورة. تغيير المتغير"الأوسط"في السطر 22 والخط 411 إلى أرقام شريحة حيث يتم تصور القناة الأذينية بوضوح في "systole_200.resampled" و "diastole_200.resampled".
  3. تشغيل رمز، وفي ويندوز يطالب انقر مرة واحدة في وسط البطين وانقر مرة واحدة في وسط القناة الأذينية. هذا يحتاج إلى القيام به مرتين لكل من الصور systeal وانقباض.

10- تسجيل مصفوفات الصور الانقباضي والانبساطي

  1. فتح "register_3.m" وتغيير"ImPath"في السطر 4 إلى مسار مجلد الصورة. قد يستغرق 5-20 دقيقة لتشغيل هذا الرمز اعتماداً على قوة حساب النظام.
    ملاحظة: يتم استخدام التوازي المستطيل الذي تم إنشاؤه اصطناعيًا في الخطوة 7 للتسجيل ثلاثي الأبعاد الذي يحافظ على المسافة بين نقطتين والزوايا التي يتم الاشتراك فيها بثلاث نقاط. عندما يتم تسجيل نهاية diastole مستطيلة متوازية (أحمر) إلى نهاية systeal مستطيلة parallelepiped (الأخضر)، والموقع 3D discrepant التي تلت ذلك يسمح اشتقاق مصفوفة فريدة من التحول جامدة تتكون من التناوب والترجمة من مصفوفة نهاية الانبساط إلى مصفوفة نهاية systeal(الشكل 1H). نقوم بالتسجيل وتقنين تقليل الطاقة إلى تقليل الضوضاء في المصفوفة بعد التحويل باستخدام صندوق أدوات معالجة الصور (انظر جدول المواد). للحصول على وصف رياضي مفصل، يرجى الاطلاع على تشن وآخرون8.

11- ناتج ناقلات التشرد

  1. فتح "displacement_4.m" وتغيير"ImPath"في السطر 4 إلى مسار مجلد الصورة.
  2. تشغيل "displacement_4.m"، الذي ينشئ ملف "vector8.txt" في مجلد "المتجهات". بمجرد فتح ملف "vector8.txt" ، سيكون هناك مصفوفة 8 × 4. يحتوي كل صف من المصفوفة على أربعة أرقام، وهي مقادير مكون X، مكون Y، مكون Z، وحجم SUM لمتجه الإزاحة لجزء معين من البطين.
    ملاحظة: يتم الحصول على متجه الإزاحة عن طريق حساب إزاحة الكتلة المئوية لكل جزء في مساحة ثلاثية الأبعاد. نقوم بحساب الكتلة ثلاثية الأبعاد (PS figure-protocol-1 و PD)إحداثيات (حيث يشير k إلى إحداثيات X أو Y أو Z، على التوالي) لكل جزء (I-VI) في مجموعة بيانات التجزئة من الانقباض إلى الانبساط(الشكل 1J). نحن نحدد الكتلة figure-protocol-2 المئوية في الفضاء ثلاثي الأبعاد على النحو التالي:
    figure-protocol-3
    حيث Cx = X، Cy = Y، وCz = Z، Mi = كتلة كل قطعة (I ≤ i ≤ VI)، m = عدد voxels لكل جزء، وο = دالة الكثافة كمنطقة مجزأة هي 1 بينما الباقي هو 0. يتم حساب المعيار L2 لناقلات الإزاحة الفرعية على طول محاور X و Y و Z ومتجه الإزاحة الإجمالي خلال دورة القلب. هناك ما مجموعه ثمانية صفوف في المصفوفة. الصف الأول والصف الثامن تحتوي على قناة الأذينين وبالتالي يتم تجاهلها في تحليلنا. يتم تمثيل الأجزاء من الأول إلى السادس بالصف الثاني إلى الصف السابع.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

النتائج

يتم تقديم العملية التي تم تطوير هادلتقييم وظيفة القلب القطاعي 3D في الشكل 1. بعد الحصول على صورة LSFM وإعادة بنائها في قلب الحمار الوحشي الجنيني(الشكل 1A)، تم تحديد مستوى المحور القصير الحقيقي كطائرة عمودية على المحاور الطويلة الرأسية والأفقية ، وكلاهما يتم تحديده في عارض متعدد الطائرات(الشكل 1B). ثم تم إعادة تشكيل القلب على طول مستوى المحور القصير(الشكل 1C)

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المناقشة

استراتيجية صارمة للقياس الكمي لوظيفة عضلة القلب القطعية أمر بالغ الأهمية لتقييم ميكانيكا القلب خارج EF التقليدية، والمعروف أن يكون مؤشرا غير حساس وتأخر الإصابة عضلة القلب1،4،12. وبالتالي ، كان هناك اهتمام متزايد في علامات التغيرات المبكرة عضلة القلب ، ومجموعة متزايدة من الأدب يدعم معلمات تشوه عضلة القلب كمؤشر مبكر للتنبؤ بخلل البطين4،13. يوفر قياس صدى القلب لسلالة البطين...

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

وأعلن صاحبا البلاغ أنه لا يوجد تضارب في المصالح.

شكر وتقدير

تم تمويل العمل الحالي من قبل منح جمعية القلب الأمريكية 16SDG30910007 و 18CDA34110338 ، ومن قبل المعاهد الوطنية للمنح الصحية HL083015 ، HL1111437 ، HL118650 ، وHL129727.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة
الاسمالشركةرقم فهرسيالتعليقات
برنامج تحليل الصور Amira6FEI
DAPTMillipore SigmaD5942-5MG
Doxorubicin hydrochlorideMillipore SigmaD1515-10MG
Ethyl 3-aminobenzoate methanesulfonateMillipore SigmaE10521-10GTricaine
MATLABMathWorksبيئة البرمجة
MATLAB معالجة الصور ToolboxMathWorksأداة معالجة الصور

المراجع

  1. Ewer, M. S., Ewer, S. M. Cardiotoxicity of anticancer treatments. Nature Reviews Cardiology. 12 (9), 547-558 (2015).
  2. Thavendiranathan, P., Wintersperger Bernd, J., Scott, F. D., Thomas D, M. H. Cardiac MRI in the Assessment of Cardiac Injury and Toxicity From Cancer Chemotherapy. Circulation: Cardiovascular Imaging. 6 (6), 1080-1091 (2013).
  3. Mickoleit, M., et al. High-resolution reconstruction of the beating zebrafish heart. Nature Methods. 11 (9), 919-922 (2014).
  4. Thavendiranathan, P., et al. Use of Myocardial Strain Imaging by Echocardiography for the Early Detection of Cardiotoxicity in Patients During and After Cancer Chemotherapy. A Systematic Review. 63 (25), Part A 2751-2768 (2014).
  5. Collier, P., Phelan, D., Klein, A. A Test in Context: Myocardial Strain Measured by Speckle-Tracking Echocardiography. Journal of the American College of Cardiology. 69 (8), 1043-1056 (2017).
  6. Hanekom, L., Cho, G. Y., Leano, R., Jeffriess, L., Marwick, T. H. Comparison of two-dimensional speckle and tissue Doppler strain measurement during dobutamine stress echocardiography: an angiographic correlation. European Heart Journal. 28 (14), 1765-1772 (2007).
  7. Poss, K. D., Wilson, L. G., Keating, M. T. Heart regeneration in zebrafish. Science. 298 (5601), 2188-2190 (2002).
  8. Chen, J., et al. Displacement analysis of myocardial mechanical deformation (DIAMOND) reveals segmental susceptibility to doxorubicin-induced injury and regeneration. JCI Insight. 4 (8), e125362(2019).
  9. Messerschmidt, V., et al. Light-sheet Fluorescence Microscopy to Capture 4-Dimensional Images of the Effects of Modulating Shear Stress on the Developing Zebrafish Heart. Journal of Visualized Experiments. (138), e57763(2018).
  10. Rosen, J. N., Sweeney, M. F., Mably, J. D. Microinjection of Zebrafish Embryos to Analyze Gene Function. Journal of Visualized Experiments. (25), e1115(2009).
  11. Lee, J., et al. 4-Dimensional light-sheet microscopy to elucidate shear stress modulation of cardiac trabeculation. The Journal of Clinical Investigation. 126 (5), 1679-1690 (2016).
  12. Lenneman, C. G., Sawyer, D. B. Cardio-Oncology: An Update on Cardiotoxicity of Cancer-Related Treatment. Circulation Research. 118 (6), 1008-1020 (2016).
  13. Geyer, H., et al. Assessment of Myocardial Mechanics Using Speckle Tracking Echocardiography: Fundamentals and Clinical Applications. Journal of the American Society of Echocardiography. 23 (4), 351-369 (2010).
  14. Castro, P. L., Greenberg, N. L., Drinko, J., Garcia, M. J., Thomas, J. D. Potential pitfalls of strain rate imaging: angle dependency. Biomedical Sciences Instrumentation. 36, 197-202 (2000).
  15. Seo, Y., Ishizu, T., Aonuma, K. Current Status of 3Dimensional Speckle Tracking Echocardiography: A Review from Our Experiences. Journal of Cardiovascular Ultrasound. 22 (2), 49-57 (2014).
  16. Amzulescu, M. S., et al. Improvements of Myocardial Deformation Assessment by Three-Dimensional Speckle-Tracking versus Two-Dimensional Speckle-Tracking Revealed by Cardiac Magnetic Resonance Tagging. Journal of the American Society of Echocardiography. 31 (9), 1021-1033 (2018).
  17. Wolterink, J. M., Leiner, T., Viergever, M. A., Išgum, I. Reconstruction, Segmentation, and Analysis of Medical Images. Zuluaga, M. A., et al. , Springer International Publishing. 95-102 (2016).
  18. Avendi, M. R., Kheradvar, A., Jafarkhani, H. A combined deep-learning and deformable-model approach to fully automatic segmentation of the left ventricle in cardiac MRI. Medical Image Analysis. 30, 108-119 (2016).
  19. Packard, R. R. S., et al. Automated Segmentation of Light-Sheet Fluorescent Imaging to Characterize Experimental Doxorubicin-Induced Cardiac Injury and Repair. Scientific Reports. 7 (1), 8603(2017).
  20. Jay Kuo, C. C., Chen, Y. On data-driven Saak transform. Journal of Visual Communication and Image Representation. 50, 237-246 (2018).
  21. Natarajan, N., et al. Complement Receptor C5aR1 Plays an Evolutionarily Conserved Role in Successful Cardiac Regeneration. Circulation. 137 (20), 2152-2165 (2018).
  22. Zhukov, L., Barr, A. H. IEEE Visualization VIS 2003. , 597-602 (2003).
  23. Nielles-Vallespin, S., et al. In vivo diffusion tensor MRI of the human heart: Reproducibility of breath-hold and navigator-based approaches. Magnetic Resonance in Medicine. 70 (2), 454-465 (2013).

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

إعادة الطباعة والأذونات

طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه

طلب إذن

الوسوم

مقالات ذات صلة