ملاحظة: ارجع إلى الجدول 1 للاطلاع على وصفات الوسائط المستخدمة في هذا البروتوكول.
ملاحظة: تم العثور على hNECS المزروعة على 12 بئرا ترانسويل تنمو لتصبح سماكة أكثر مثالية للعوامل القابلة للذوبان للوصول إلى الغرفة القاعدية بسهولة عند الإصابة بفيروس الأنفلونزا. ومن ثم يوصى باستخدام 12 بئرا من الترانسويل للثقافة المشتركة.
1. إنشاء طبقة التغذية 3T3
- الإنشاء من المخزونات المجمدة
- إذابة بالتبريد من الخلايا الليفية NIH / 3T3 من المخزونات المجمدة. أضف محتويات التجميد إلى 2 مل من الوسائط الأساسية الدنيا الكاملة من Dulbecco (DMEM) وأعد تعليق الخلايا.
- جهاز طرد مركزي لمدة 5 دقائق عند 300 × جم ودرجة حرارة / ضغط الغرفة (rtp) ، وقم بإزالة supernatant. أعد تعليق الخلايا في DMEM كامل.
- عد الخلايا باستخدام تلطيخ أزرق تريبان. أضف 10 ميكرولتر من التربان الأزرق إلى 10 ميكرولتر من تعليق الخلية المعاد تعليقه. اخلطي جيدا ، وأضيفي 10 ميكرولتر من التعليق إلى مقياس الدم لحساب الخلايا.
- خلايا البذور بكثافة 1 × 104 خلايا / سم2 في طبق استزراع مناسب (على سبيل المثال ، قارورة T75). احتضان قارورة الثقافة الناتجة لمدة 3 أيام عند 37 درجة مئوية في جو 5٪ CO2 .
- علاج ميتوميسين سي
- في 3 أيام ، تأكد من أن الالتقاء هو 60٪ -80٪ ، وإزالة الوسط ، وغسل الخلايا مع 1x محلول ملحي مخزن بالفوسفات (PBS).
ملاحظة: من المهم ألا تصل طبقة التغذية 3T3 إلى الالتقاء الكامل ؛ خلاف ذلك ، فإن علاج الميتومايسين C لن يكون فعالا.
- أضف DMEM الكامل المكمل ب mitomycin C إلى القارورة ، واحتضنه لمدة 3.5 ساعة عند 37 درجة مئوية في جو 5٪ CO2 . قم بإزالة الوسط المحتوي على الميتوميسين C ، واغسل الخلايا 2x باستخدام 1x PBS.
- بذر خلايا 3T3 في لوحات 6 آبار
- أضف 3 مل من 1x trypsin-EDTA إلى القارورة لمدة 3-5 دقائق لفصل الخلايا. اجمع الخلايا المنفصلة في أنبوب جديد سعة 15 مل. جهاز طرد مركزي أنبوب 15 مل لمدة 5 دقائق عند 300 × جم ، rtp ؛ تخلص من السوبرناتانت. أعد تعليق الخلايا في DMEM كامل.
- عد الخلايا باستخدام تلطيخ أزرق تريبان. زرع الخلايا في صفيحة من 6 آبار في 7.5 × 10 5-2.5 × 106 خلايا / بئر. احتضن اللوحة بين عشية وضحاها عند 37 درجة مئوية في جو 5٪ CO2.
ملاحظة: تعتبر طبقة التغذية 3T3 جاهزة إذا كانت الخلايا سليمة. عند هذه النقطة، زرع الخلايا الجذعية/السلفية الظهارية الأنفية البشرية (hNESPCs) في طبقة التغذية للتوسع.
- أضف DMEM الكامل إلى القارورة واحتضنه عند 37 درجة مئوية ، 5٪ CO2 بين عشية وضحاها لخلايا 3T3 للتعافي من علاج الميتومايسين C.
2. إنشاء مزرعة الخلايا الظهارية الأنفية البشرية (hNEC)
ملاحظة: يجب الحصول على عينات سريرية من المرضى الذين يخلون من أعراض عدوى الجهاز التنفسي العلوي.
- معالجة أنسجة الأنف في تعليق أحادي الخلية
- اغسل أنسجة الأنف في 1x Dulbecco's PBS (dPBS) (PBS بدون Mg 2+ و Ca2+) التي تحتوي على 100 ميكرولتر / مل من خليط مضاد حيوي مضاد للفطريات. قطع الأنسجة إلى شظايا صغيرة ، وعالج العينة في 10 ملغ / مل من البروتياز المحايد بين عشية وضحاها عند 4 درجات مئوية مع الاهتزاز.
- جهاز طرد مركزي لمدة 5 دقائق عند 200 × جم ، وإزالة السوبرنات بعد الطرد المركزي. احتضن الكريات في 1-2 مل من 1x trypsin-EDTA (37 درجة مئوية ، 15 دقيقة) ، وقم بإخمادها عن طريق إضافة حجم من مصل البقر الجنيني يساوي 10٪ من الحجم في الأنبوب.
- قم بفصل الأنسجة المهضومة ميكانيكيا إلى مجاميع أحادية الخلية عن طريق السحب ، ثم مرر التعليق الناتج من خلال مصفاة خلية 70 ميكرومتر. أعد تعليق الخلايا في DMEM كامل.
ملاحظة: بعد هذه الخطوة، يكون تعليق الخلية عبارة عن مزيج من الخلايا المتمايزة نهائيا والخلايا الجذعية التي يشار إليها باسم الخلايا الجذعية/السلفية الظهارية الأنفية البشرية (hNESPCs). الهدف من الخطوات اللاحقة هو اختيار وإثراء سكان hNESPC من خليط من مجموعات الخلايا المختلفة.
- بذر تعليق أحادي الخلية على طبقة التغذية 3T3 لاختيار hNESPCs
- قم بالطرد المركزي لتعليق الخلية من الخطوة 2.1.3 (300 × جم ، 5 دقائق ، rtp) ، وقم بإزالة السوبرنات. أعد تعليق الخلايا في 3-5 مل من 3 متوسطة.
ملاحظة: تمت صياغة Medium 3 لتعزيز النمو الانتقائي ل hNESPCs.
- عد الخلايا عن طريق تلطيخ أزرق تريبان. البذور 1 × 10 6 خلايا في 2 مل متوسطة 3 لكل بئر على لوحة 6 بئر تحتوي على طبقة تغذية 3T3 محضرة بعد إزالة الوسائط في لوحة البئر6 . احتضان الزراعة المشتركة الناتجة عند 37 درجة مئوية في جو 5٪ CO2 .
ملاحظة: بعد البذر ، احرص على عدم تحريك اللوحة لأنها ستؤثر على مرفق hNESPCs.
- تغيير الوسط 3 (2 مل) كل 2-4 أيام عن طريق إزالة الوسط القديم بالكامل واستبداله بوسط طازج 3.
ملاحظة: يتم تغيير الوسط لتجديد العناصر الغذائية ومنع الظروف الحمضية المفرطة من التأثير سلبا على نمو hNESPCs. يعتمد الفاصل الزمني بين كل تغيير في الوسط على مدى حمضية (صفراء) الوسط. يجب تقصير الفواصل الزمنية إذا تحول الوسط إلى حمضي بسرعة.
- بعد 7-10 أيام ، لاحظ أن hNESPCs في التقاء مناسب لنقلها إلى إدخالات الغشاء. انظر الشكل 1 للاطلاع على المورفولوجيا التمثيلية ل hNESPCs في 3 نقاط زمنية مختلفة (2 أيام و 5 أيام و 10 أيام).
- نقل hNESPCs إلى إدخالات الغشاء
ملاحظة: بسبب علاج الميتومايسين C ، ستتحلل طبقة التغذية 3T3 ببطء خلال فترة توسع hNESPC. سيؤدي ذلك إلى ضعف الالتصاق بسطح البئر ، مما يسمح بإزاحتها عن طريق التنظيف باستخدام ماصة ، تاركة وراءها فقط hNESPCs الصحية.
- قم بإزالة الوسط ، وأضف 500 ميكرولتر من 1x dPBS إلى كل بئر. اغسل الخلايا 3x باستخدام ماصة دقيقة لإزاحة خلايا 3T3 ، وتخلص من 1x dPBS. لاحظ تحت المجهر أن hNESPCs المستديرة تبقى بينما يتم إزاحة طبقة التغذية 3T3 على شكل مغزل.
- أضف 500 ميكرولتر من كاشف فصل الخلايا لكل بئر ، واحتضنه عند 37 درجة مئوية في جو 5٪ CO2 لمدة 5-10 دقائق ، أو حتى تنفصل hNESPCs عن سطح البئر.
- اجمع تعليق hNESPC ، جهاز طرد مركزي (300 × جم ، 5 دقائق ، rtp) ، وقم بإزالة السوبرناتان.
- أعد تعليق الكريات في الوسط 3. عد الخلايا عن طريق تلطيخ أزرق تريبان. البذور 3 × 104 خلايا في 150 ميكرولتر من المتوسط 3 لكل غشاء إدراج (لوحة 24 بئر) أو 1 × 105 خلايا في 300 ميكرولتر من المتوسط 3 لكل غشاء إدراج (لوحة 12 بئر) (الشكل 2). احتضان الخلايا عند 37 درجة مئوية في جو 5٪ CO2 .
- تغيير الوسط (المتوسط 3) من الغرف القمية والقاعدية كل 2 أيام. تنقل طرف ماصة بين الأذرع الداعمة لإدراج الغشاء للوصول إلى الغرفة القاعدية ، وإزالة الوسط القديم ، ثم إعادة إدخال الوسط الطازج بنفس الطريقة. على الرغم من أن الغرفة القمية يمكن الوصول إليها بسهولة ، احرص على عدم إزعاج طبقة hNESPC المتنامية.
ملاحظة: لا تزعج الوسط في الغرفة القمية لمدة 2 أيام على الأقل بعد البذر لأن الخلايا تحتاج إلى وقت للالتصاق بالغشاء.
- تمايز hNESPCs إلى hNECs
- عندما تصل hNESPCs إلى التقاء بنسبة 100٪ (حوالي 3-7 أيام من البذر على إدراج الغشاء) ، ابدأ ثقافة ALI. قم بتغيير الوسط القاعدي إلى وسط التمايز ، وقم بإزالة الوسط من الغرفة القمي. أضف فقط الوسط إلى الغرفة القاعدية دون إضافته إلى الغرفة القمية عند تغيير الوسط كل 2-3 أيام ، كما هو موضح في الشكل 3 والخطوة 2.3.5 .
ملاحظة: يتم تغيير الوسط إلى وسيط التمايز لتعزيز تمايز hNESPCs إلى hNECs في ALI. تستغرق hNESPCs حوالي 3-4 أسابيع للوصول إلى مرحلة النضج الكامل لتصبح hNECs في ALI ، وعند هذه النقطة تكون الخلايا قد نمت لتصبح متعددة الطبقات مع مجموعات مختلفة من الخلايا في كل طبقة. يجب أيضا ملاحظة الأهداب عند تكبير 400x (يمكن تحديد الأهداب من خلال حركة ضربها ، مما يتسبب في ظهور حقل المجهر وكأنه يهتز). في هذه المرحلة ، تكون الخلايا جاهزة للاستخدام في تجارب الزراعة المشتركة. ارجع إلى الشكل 4 للاطلاع على المقطع العرضي لطبقة hNEC متباينة تماما.
- بعد الحصول على hNECs ناضجة ، اغسل الخلايا في الغرفة القمية 3x مع 1x dPBS على فترات 2-3 أيام لمدة أسبوع واحد قبل تجربة الزراعة المشتركة. قم بتآزر خطوة الغسيل مع التغييرات المتوسطة القاعدية ، وقم بإجراء عمليات الغسيل على النحو التالي.
- أضف 50 ميكرولتر (24 بئرا) / 150 ميكرولتر (12 بئرا) من 1x dPBS إلى الغرفة القمية لإدراج الغشاء ، واحتضن الخلايا عند 37 درجة مئوية لمدة 10 دقائق. قم بإزالة dPBS بعد 10 دقائق من الحضانة لإزالة المخاط المتراكم والخلايا الميتة على مدار التمايز.
ملاحظة: اعتمادا على طبيعة التجربة ، يمكن استخدام محلول بيكربونات الصوديوم لغسل طبقة المخاط بالكامل. ومع ذلك ، بالنسبة للعدوى الفيروسية في تجارب الزراعة المشتركة ، يتم الاحتفاظ بطبقة المخاط ، ويتم إزالة المخاط الزائد فقط باستخدام غسل dPBS. هذا الاحتفاظ هو محاكاة طبقة المخاط الفسيولوجية الموجودة على ظهارة الأنف التي ستتفاعل مع العدوى الفيروسية الواردة.
3. قياس المقاومة الكهربائية عبر الظهارية (TEER)
ملاحظة: تأكيد السلامة الظهارية مهم لضمان الحصول على طبقة ظهارية سليمة وصحية. يتم تحديد الطبقة الظهارية السليمة من خلال قياس TEER الذي يتم إجراؤه على 4 آبار عشوائية باستخدام مقياس الفولتوهمتر.
- شطف القطب الكهربائي بنسبة 70٪ من الإيثانول ، وتعقيمه بالأشعة فوق البنفسجية لمدة 15 دقيقة قبل الاستخدام لضمان العقم. شطف مع 1x dPBS بعد التعقيم.
- أضف 100 ميكرولتر (ل 24 بئرا) أو 300 ميكرولتر (ل 12 بئرا) من 1x dPBS إلى الغرفة القمية لإدراج الغشاء. احتضان اللوحة عند 37 درجة مئوية لمدة 10 دقائق ؛ ثم قم بإزالة dPBS.
- لكل بئر يتم قياسه ، قم بإعداد بئر غير مستخدم مع 1 مل (ل 24 بئرا) أو 3 مل (ل 12 بئرا) من وسط التمايز المسخن مسبقا (إلى 37 درجة مئوية). ضع إدراج الغشاء في البئر المحضر ، وأضف 200 ميكرولتر (ل 24 بئرا) أو 600 ميكرولتر (ل 12 بئرا) من وسط التمايز المسخن مسبقا إلى الغرفة القمي. التوازن عند 37 درجة مئوية (رهنا بدرجة حرارة حضانة نوع الفيروس المضاف ، على سبيل المثال ، 35 درجة مئوية للإنفلونزا) لمدة 15 دقيقة.
ملاحظة: قم بإعداد فارغ (إدراج غشاء فارغ) بنفس الطريقة لحساب TEER.
- قم بموازنة أنبوب سعة 15 مل من وسط التمايز المسخن مسبقا في نفس درجة الحرارة لمدة 15 دقيقة أيضا. ضع الأقطاب الكهربائية في أنبوب 15 مل ، وقم بتشغيل voltohmmeter.
ملاحظة: في هذه المرحلة ، يجب أن تكون القراءة مقاومة 0 ، لأن الأقطاب الكهربائية في نفس الوسط. إذا تم الحصول على أي قراءة أخرى ، فقم بموازنة القطب الكهربائي في أنبوب 15 مل حتى تصبح القراءة 0.
- بدءا من الفراغ ، ضع الأقطاب الكهربائية في كل بئر بحيث يتم غمر قطب كهربائي واحد في وسط الغرفة القمية والآخر في وسط الغرفة القاعدية. سجل القراءة فقط عند الحصول على قراءة ثابتة لمدة 5 دقائق على الأقل.
- بعد كل قياس ، اغسل القطب باستخدام PBS قبل القياس التالي. لكل بئر تم اختباره ، خذ قياسات لثلاث عينات في مواقع مختلفة من الغشاء. لحساب صافي TEER لكل عينة، اطرح مقاومة الخلفية، التي يعطيها الغشاء الفارغ، من كل قياس.
- احسب إجمالي قراءة TEER لبئر باستخدام المعادلة التالية:
السلامة الظهارية (Ωcm 2) = صافي TEER (أوم) × مساحة الغشاء (سم2)
ملاحظة: يجب أن تكون قيم TEER ل hNECs لتجارب العدوى الفيروسية >1000 Ωcm213,15,16.
4. عزل وحيدات الدم المحيطية وخلايا NK
ملاحظة: يجب الحصول على عينات الدم من المتطوعين الأصحاء واستخدامها في نفس يوم العزل.
- جمع 30-40 مل من الدم الكامل من كل متبرع في أنابيب جمع الدم 10 مل.
- عزل PBMCs باستخدام الطرد المركزي المتدرج للكثافة ، والحصول على PBMCs من معطف buffy بعد الخطوات التالية (انظر أيضا جدول المواد).
- امزج جيدا ~ 10 مل من الدم من أنبوب جمع الدم في فراغ قبل تخفيفه بحجم متساو من محلول الملح المتوازن (PBS).
- أضف 15 مل من وسط تدرج الكثافة إلى قاعدة أنبوب 50 مل.
ملاحظة: يجب أن تكون نسبة تدرج الكثافة المتوسطة إلى الدم المخفف 2:3-3.5.
- طبقة 35 مل من الدم المخفف على وسط تدرج الكثافة باستخدام مسدس ماصة (مع ضبط إعداد التوزيع على أدنى مستوى ممكن) عن طريق إمالة الأنبوب بمقدار 45 درجة والسماح للدم المخفف بالسقوط قطرة على الجدار الداخلي للأنبوب بحيث لا يتم إزعاج طبقة وسط تدرج الكثافة.
- محلل أجهزة الطرد المركزي عند 500 × جم ، 18-20 درجة مئوية لمدة 30 دقيقة (الفرامل: إيقاف). قم بإزالة طبقة البلازما العليا بعناية والتخلص منها دون إزعاج الطبقة السفلية.
- انقل المعطف الرقيق إلى أنبوب جديد دون خلط طبقة خلايا الدم الحمراء أو الطبقة المتوسطة ذات الكثافة المتدرجة أو المعطف الناعم. بمجرد جمع المعطف الرقيق في أنبوب جديد سعة 50 مل ، قم بزيادة الحجم إلى 50 مل باستخدام 1x PBS.
- محلل أجهزة الطرد المركزي عند 800 × جم ، 18-20 درجة مئوية ، 8 دقائق (الفرامل: إيقاف) ، وإزالة supernatant باستخدام مسدس ماصة. أعد تعليق بيليه الخلية مع 50 مل من 1x PBS ، وأجهزة الطرد المركزي عند 120 × جم ، 18-20 درجة مئوية ، 10 دقائق لإزالة الصفائح الدموية.
- تخلص من السوبرناتانت عن طريق السحب ، دون إزعاج بيليه الخلية.
ملاحظة: نظرا لأن حبيبات الخلايا قد تكون فضفاضة ، فمن غير المستحسن التخلص من السوبرناتانت عن طريق الصب.
- أعد تعليق بيليه الخلية باستخدام وسيط RPMI (معهد روزويل بارك التذكاري) الكامل. قم بإجراء عدد الخلايا عن طريق إضافة 10 ميكرولتر من حمض الخليك بنسبة 3٪ مع أزرق الميثيلين إلى 10 ميكرولتر من تعليق الخلية المعاد تعليقه. اخلطي جيدا ، وأضيفي 10 ميكرولتر من الخليط إلى مقياس الدم لحساب الخلايا.
- تمييع PBMCs مع RPMI كاملة متوسطة إلى كثافة 2 × 10 6 / مل (ل 24 بئر) أو 4 × 106 / مل (ل 12 بئر).
5. العدوى الفيروسية hNEC والانتقال إلى hNEC: PBMC الثقافة المشتركة
ملاحظة: يستخدم الفيروس H3N2 (A/Aichi/2/1968) كسلالة تمثيلية للعدوى في هذا البروتوكول. يستخدم تعدد العدوى (MOI) من 0.1 كممثل لوزارة الداخلية في هذا البروتوكول.
- اليوم 0 (عدوى hNECs)
ملاحظة: يتم استخدام بئر واحد من hNECs المزروعة من نفس المتبرع للحصول على عدد خلايا تمثيلي لكل بئر يستخدم في التجربة.
- في البئر التمثيلية ، أضف 150 ميكرولتر من 1x trypsin-EDTA إلى الغرفة القمية لإدراج الغشاء و 350 ميكرولتر من 1x trypsin-EDTA إلى الغرفة القاعدية ، واحتضنها عند 37 درجة مئوية لمدة 10 دقائق ، أو حتى تنفصل الخلايا عن الغشاء.
- اغسل الخلايا على الغشاء عن طريق السحب لأعلى ولأسفل ، وجمع التعليق في أنبوب طرد مركزي 1.5 مل. أضف 200 ميكرولتر من DMEM الكامل لإخماد نشاط التربسين. عد الخلايا عن طريق تلطيخ التربان الأزرق للحصول على عدد الخلايا لكل بئر.
- احسب MOI المطلوب للفيروس بناء على عدد الخلايا لكل بئر ، وقم بتخفيف مخزون الفيروس وفقا لذلك مع RPMI الكامل على الجليد.
ملاحظة: MOI 0.1 من 1.26 × 106 hNECs لكل بئر = 1.26 × 105 جسيمات فيروسية H3N2 لكل بئر في 30 ميكرولتر (ل 24 بئر) / 100 ميكرولتر (ل 12 بئر)
- بالنسبة للآبار المتبقية لتجربة العدوى ، أضف 50 ميكرولتر (ل 24 بئرا) / 150 ميكرولتر (ل 12 بئرا) من 1x dPBS إلى الغرف القمية لإدراج الغشاء ، واحتضان عند 37 درجة مئوية لمدة 10 دقائق ، وإزالة 1x dPBS.
- قم بتغيير الوسط القاعدي في إدراج الغشاء لإكمال وسط RPMI عن طريق نقل الإدخالات إلى لوحة جديدة مع إضافة RPMI كاملة إلى الآبار (350 ميكرولتر (ل 24 بئرا) / 700 ميكرولتر (ل 12 بئرا)).
ملاحظة: عندما تكون hNESPCs قد تميزت تماما عن hNECs ، فإنها تكون متسامحة / متساهلة مع وسائط مختلفة لمدة تصل إلى 72 ساعة ، دون أي تغييرات في المورفولوجيا أو التنظيم عند تبديل الوسيط إلى RPMI12. يستخدم RPMI لدعم نمو وصيانة سكان PBMC.
- أضف 30 ميكرولتر المحضر (ل 24 بئرا) / 100 ميكرولتر (ل 12 بئرا) من لقاح الفيروس إلى الغرفة القمية لإدراج الغشاء ، واحتضان عند 35 درجة مئوية في جو 5٪ CO2 لمدة 1 ساعة ، وإزالة التلقيح الفيروسي من الغرفة القمي.
- قم بتغيير الوسط القاعدي لإدراج الغشاء إلى وسط RPMI كامل طازج واحتضنه عند 35 درجة مئوية في جو 5٪ CO2 لمدة 24 ساعة.
- اليوم 1 (إنشاء مراكز وطنية للكهرباء والنباتات ومراكز بناء القدرات في مجال الثقافة المشتركة)
- زرع العدد المطلوب من PBMCs في 150 ميكرولتر (ل 24 بئرا) / 300 ميكرولتر (ل 12 بئرا) من وسط RPMI الكامل عن طريق إضافة تعليق PBMC مباشرة إلى الغرفة القاعدية لكل بئر من hNECs غير المصابة أو المصابة من اليوم 0 (1.5 × 10 6 للوحات 24 بئرا و 3 × 106 للوحات 12 بئرا). تحضن عند 37 درجة مئوية لمدة 24/48 ساعة.
ملاحظة: الحجم النهائي في الغرفة القاعدية بعد إنشاء الاستزراع المشترك هو 500 ميكرولتر (ل 24 بئرا) / 1000 ميكرولتر (ل 12 بئرا).
- الأيام 2-3 (حصاد PBMCs 48/72 ساعة بعد العدوى الفيروسية)
- جمع المواد الخارقة القمية (48/72 ساعة بعد العدوى الفيروسية)
- أضف 50 ميكرولتر (ل 24 بئرا) / 150 ميكرولتر (ل 12 بئرا) من 1x dPBS إلى كل غرفة قمية ، واحتضنها عند 37 درجة مئوية لمدة 10 دقائق. اجمع 1x dPBS في أنابيب 1.5 مل. Aliquot 25 ميكرولتر (ل 24 بئرا) / 50 ميكرولتر (ل 12 بئرا) من supernatant لفحص البلاك في أنبوب جديد 1.5 مل ، وتجميد كل من المخزون و aliquots على الفور عند -80 درجة مئوية.
- جمع الحمض النووي الريبي الخلوي من hNECs (48/72 ساعة بعد العدوى الفيروسية)
- انقل إدراج الغشاء إلى بئر نظيف ، وأضف 300 ميكرولتر (ل 24 بئرا) / 600 ميكرولتر (ل 12 بئرا) من المخزن المؤقت لتحلل الحمض النووي الريبي إلى الغرفة القمية ، واحتضنه في rtp لمدة 5 دقائق. جمع supernatant في أنبوب الطرد المركزي 1.5 مل ، وتخزينها في -80 درجة مئوية حتى استخراج الحمض النووي الريبي للتحليل الجزيئي.
- حصاد PBMCs (48/72 ساعة بعد العدوى الفيروسية)
- باستخدام القاعدة العريضة لطرف ماصة معقم ، قم بكشط سطح البئر بلطف لإزاحة PBMCs المنشطة التي قد تكون ملتصقة بسطح البئر. جمع الوسط القاعدي الذي يحتوي على PBMCs في أنبوب طرد مركزي 2 مل.
- اغسل الآبار 2x ب 300 ميكرولتر من 1x dPBS ، واجمع الغسيل في نفس الأنبوب 2 مل. الطرد المركزي أنبوب 2 مل (500 × غرام، 5 دقائق، rtp)، وجمع supernatant في أنبوب جديد 2 مل دون إزعاج بيليه الخلية. تخزين supernatant في -80 درجة مئوية لتحليل السيتوكين والكيموكين ؛ إعادة تعليق بيليه الخلية في 200 ميكرولتر من 1x dPBS.
6. قياس التدفق الخلوي
ملاحظة: يستمر هذا القسم من البروتوكول مباشرة من القسم السابق باستخدام تعليق خلية PBMC من الخطوة 5.3.3.2. تأكد من الحد الأدنى من التعرض للضوء خلال الخطوات التالية في هذا القسم. يمكن العثور على لوحة عينة من علامات تلطيخ السطح في الجدول 2.
- تلطيخ السطح
- انقل حبيبة خلية PBMC المعاد تعليقها إلى صفيحة بئر سفلية 96-V. تحلل أجهزة الطرد المركزي في 800 × غرام لمدة 3 دقائق ، وإزالة supernatant.
- احتضان جميع PBMCs (باستثناء "غير ملطخة") مع 100 ميكرولتر من بقعة قابلة للحياة لمدة 15 دقيقة في rtp. قم بتعبئة ما يصل إلى 200 ميكرولتر باستخدام 150 ميكرولتر من المخزن المؤقت لفرز الخلايا المنشط مغناطيسيا (MACS). تحلل أجهزة الطرد المركزي عند 800 × غرام لمدة 3 دقائق ، وتخلص من السوبرناتانت.
- قم بإعداد لوحة من الأجسام المضادة الملطخة السطحية ذات الأهمية مع نسب تخفيف مناسبة وحجم نهائي قدره 50 ميكرولتر لكل تفاعل (قم بتعبئة المخزن المؤقت MACS للحصول على الحجم النهائي). قم بإجراء تلطيخ السطح عن طريق إضافة 50 ميكرولتر من مزيج الأجسام المضادة المحضر إلى الخلايا باستخدام ماصة متعددة القنوات. تحضن في 4 درجات مئوية لمدة 15 دقيقة في الظلام.
- اغسل بإضافة 150 ميكرولتر من مخزن MACS المؤقت. محلل جهاز الطرد المركزي في 800 × غرام لمدة 3 دقائق ، والتخلص من supernatant. إذا لم تكن هناك حاجة إلى تلطيخ داخل الخلايا ، فانتقل مباشرة إلى حضانة 15 دقيقة في الخطوة 6.3.
- تلطيخ داخل الخلايا (إذا لزم الأمر)
- أضف 100 ميكرولتر من محلول التثبيت والنفاذية لكل بئر. تحضن في 4 درجات مئوية لمدة 20 دقيقة في الظلام. قم بتعبئة الآبار ب 100 ميكرولتر من 1x MACS العازل.
- جهاز طرد مركزي (800 × جم ، 3 دقائق ، 25 درجة مئوية) ، وإزالة supernatant. كرر الغسيل بإضافة 200 ميكرولتر من 1x المخزن المؤقت لغسيل النفاذية. جهاز طرد مركزي (500 × جم ، 3 دقائق ، 25 درجة مئوية) ، وإزالة supernatant.
- قم بإعداد التخفيفات للوحة الأجسام المضادة ذات الأهمية لتحقيق حجم نهائي قدره 50 ميكرولتر باستخدام 1x Permeabilization Wash buffer. احتضان على الجليد لمدة 30 دقيقة في الظلام. أضف 200 ميكرولتر من المخزن المؤقت لغسل النفاذية 1x.
- الطرد المركزي للخلايا (800 × جم ، 3 دقائق ، 4 درجات مئوية) ، وإزالة supernatant. أعد تعليق الخلايا في 100 ميكرولتر من المخزن المؤقت لفرز الخلايا المنشط بالفلور.
- ماصة 200 ميكرولتر من محلول التحلل في كل بئر. احتضان لمدة 15 دقيقة في rtp. محلل جهاز الطرد المركزي في 800 × غرام لمدة 3 دقائق والتخلص من supernatant.
- أعد تعليق كريات الخلايا في 200 ميكرولتر من المخزن المؤقت لنظام التشغيل MACS. قم بإجراء قياس التدفق الخلوي وفقا للإعدادات الموضحة سابقا13 ، أو قم بتخزينها عند 4 درجات مئوية في الظلام.
7. تحديد مستويات السيتوكين والكيموكين
- معالجة 25 ميكرولتر من supernatant الغرفة القاعدية باستخدام فحص متعدد الإرسال المناعي وفقا لبروتوكول الشركة المصنعة18.
- احسب تركيز كل تحليل باستخدام برنامج مدير متعدد الإرسال باستخدام خوارزمية ملائمة للمنحنى (5 معلمات) للمنحنى القياسي.
8. تقييم التلوث الفيروسي
- استخراج الحمض النووي الريبي الفيروسي باستخدام مجموعة استخراج على 4 مجموعات من الحلول: محلول H3N2 المخزون، وتخفيف MOI 0.1 للعدوى، والتخفيفات التسلسلية 10x من MOI 0.1، والوسط القاعدي من العينات (كل من 48 و 72 ساعة بعد العدوى الفيروسية)12.
- حدد الجين غير الهيكلي (NS1) والمصفوفة (M1) كأهداف لتفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) (انظر جدول المواد للاشعال المستخدمة في التجربة التمثيلية).
- قم بإجراء النسخ العكسي-PCR (RT-PCR) (42 درجة مئوية ، 60 دقيقة) لتحويل الحمض النووي الريبي الفيروسي إلى cDNA قبل إجراء PCR الكمي (QPCR) لقياس مستويات NS1 و M1 كوكيل للوجود الفيروسي ، وربط المستويات بالمنحنى القياسي الذي تم الحصول عليه من RT-qPCR الذي تم إجراؤه على التخفيف التسلسلي 10x ل MOI 0.1 aliquot. ارجع إلى الجدول 3 لمعرفة تكوين خلطات التفاعل ، واستخدم الشروط التالية: ما قبل الحضانة عند 95 درجة مئوية لمدة 10 دقائق ، يليها تضخيم من 3 خطوات لمدة 40 دورة: 95 درجة مئوية لمدة 10 ثوان ، 60 درجة مئوية لمدة 10 ثوان ، 72 درجة مئوية لمدة 30 ثانية ؛ منحنى الذوبان: 95 درجة مئوية لمدة 10 ثوان ، و 65 درجة مئوية ل 60 ثانية ، و 97 درجة مئوية لمدة 1 ثانية.
9. فحص البلاك
- اليوم 0: البذر MDCK (كلية الكلاب في مدين داربي) في 24 بئرا
- قم بإزالة الوسط من قارورة T75 من خلايا MDCK المتقاربة. اغسل 2x مع 1x PBS لإزالة جميع آثار المصل. التربسين خلايا MDCK عن طريق إضافة 10 مل من التربسين واحتضان في 37 درجة مئوية في جو 5٪ CO2 لمدة 20-30 دقيقة حتى تنفصل الخلايا.
ملاحظة: لا تنقر على القارورة لأن ذلك قد يؤدي إلى التكتل.
- ماصة تعليق الخلية في أنبوب 15 مل يحتوي على 2 مل من الوسط الأساسي الأدنى الكامل من النسر (EMEM). جهاز طرد مركزي (300 × جم ، 5 دقائق ، rtp) ، وإزالة supernatant.
- أعد تعليق الخلايا في 6 مل من EMEM الكامل. عد الخلايا عن طريق تلطيخ التربان الأزرق.
- قم بتخفيف تعليق خلية MDCK إلى تركيز 1 × 105 خلايا / مل ، وبذور 1 مل من التعليق المخفف في كل بئر من صفيحة معقمة من 24 بئرا. احتضان في 37 درجة مئوية في جو 5٪ CO2 لمدة 24 ساعة للحصول على طبقة أحادية التقاء من خلايا MDCK في كل بئر.
- اليوم 1: عدوى خلايا MDCK
- تحضير وسط العدوى. قم بإزالة الوسط من الطبقة الأحادية MDCK في اللوحة المكونة من 24 بئرا ، واغسل 2x باستخدام 1x dPBS. بالنسبة للغسيل الثاني ، اترك PBS في الآبار أثناء إعداد التخفيفات التسلسلية للفيروس.
- قم بإذابة عينات الفيروس على الجليد ، وتخفيفها بشكل متسلسل في صفيحة من 24 بئرا لتحقيق تخفيفات تسلسلية من 10-1 إلى 10-6.
ملاحظة: على سبيل المثال ، املأ كل بئر في صفيحة من 24 بئرا ب 270 ميكرولتر من وسط العدوى.
- أضف 30 ميكرولتر من عينة الفيروس إلى البئر الأول في الصف. باستخدام طرف ماصة جديد ، اخلطه جيدا وانقله إلى البئر التالي في الصف لتخفيف العينة بمقدار 10 أضعاف. المضي قدما حتى يتم تحقيق تخفيف 10-6 ؛ تنفيذ الخطوات 9.2.1-9.2.3 لكافة عينات الفيروسات.
- قم بإزالة PBS من لوحة MDCK ، وأصاب في نسختين مع 100 ميكرولتر من التخفيفات الفيروسية المحضرة. لآبار التحكم ، أضف 100 ميكرولتر من وسط العدوى (بدون العينة الفيروسية). احتضان في 35 درجة مئوية في جو 5٪ CO2 لمدة 1 ساعة ، وهز اللوحة للقضاء على البقع الجافة كل 15 دقيقة.
- إزالة التلقيح الفيروسي ، وإضافة 1 مل من تراكب السائل لكل بئر. احتضان في 35 درجة مئوية في جو 5٪ CO2 لمدة 72 ساعة.
- اليوم 4 (72 ساعة بعد الإصابة): تصور البلاك
- قم بإزالة تراكب السائل ، وقم بإصلاح الخلايا بنسبة 4٪ من الفورمالديهايد في 1x PBS لمدة 1 ساعة. قم بإزالة محلول الفورمالديهايد ، واغسله مرة واحدة باستخدام 1x PBS أو الماء المقطر.
- قم بتلطيخ الخلايا الثابتة بإضافة محلول بنفسجي كريستالي بنسبة 1٪ لمدة 15 دقيقة. قم بإزالة صبغة البنفسج الكريستالية ، واغسل الخلايا بالماء الجاري. جفف اللوحة في rtp.
- بمجرد أن تجف ، عد اللويحات ، واحسب العيار الفيروسي وفقا للصيغة التالية:
عدد اللويحات × عامل التخفيف = عدد اللويحات - وحدات التشكيل في 100 ميكرولتر