RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ar
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
يصف هذا البروتوكول طريقة فعالة لعدم ربط البلغم بتعليق خلية واحدة والتوصيف اللاحق للمجموعات الفرعية الخلوية على منصات قياس التدفق الخلوي القياسية.
يتم تحليل البلغم ، الذي يستخدم على نطاق واسع لدراسة المحتوى الخلوي والميزات الأخرى للبيئة الدقيقة لفهم صحة الرئة ، تقليديا باستخدام منهجيات قائمة على علم الخلايا. فائدته محدودة لأن قراءة الشرائح تستغرق وقتا طويلا وتتطلب موظفين متخصصين للغاية. وعلاوة على ذلك، فإن الحطام الواسع النطاق ووجود عدد كبير جدا من الخلايا الظهارية الحرشفية ، أو خلايا الخد ، غالبا ما يجعل العينة غير كافية للتشخيص. وعلى النقيض من ذلك، يسمح قياس التدفق الخلوي بطباعة الخلايا ذات الإنتاجية العالية مع استبعاد الحطام ومركبات الكربون المستدامة في نفس الوقت.
يصف البروتوكول المعروض هنا طريقة فعالة لتفكيك البلغم إلى تعليق خلية واحدة ، وصمة عار الأجسام المضادة وإصلاح المجموعات الخلوية ، والحصول على عينات على منصة قياس التدفق الخلوي. استراتيجية gating التي تصف استبعاد الحطام والخلايا الميتة (بما في ذلك الشركات الصغيرة والمتوسطة) ومزدوجات الخلية معروضة هنا. علاوة على ذلك ، يشرح هذا العمل أيضا كيفية تحليل خلايا البلغم الواحدة القابلة للتطبيق استنادا إلى مجموعة من التمايز (CD)45 مجموعات سكانية إيجابية وسلبية لتوصيف مجموعات فرعية من النسب الدموي والظهاري. كما يتم توفير مقياس لمراقبة الجودة من خلال تحديد الضامة الخاصة بالرئة كدليل على أن العينة مشتقة من الرئة وليست لعابا. وأخيرا، فقد ثبت أن هذه الطريقة يمكن تطبيقها على منصات مختلفة من خلال توفير ملامح البلغم من نفس المريض تحليلها على ثلاثة مقاييس تدفق الخلايا. نافيوس EX، LSR الثاني، ولريك. وعلاوة على ذلك، يمكن تعديل هذا البروتوكول ليشمل علامات خلوية إضافية ذات أهمية. يتم تقديم طريقة لتحليل عينة البلغم بأكملها على منصة قياس التدفق الخلوي هنا التي تجعل البلغم قابلا لتطوير تشخيص عالي الإنتاجية لمرض الرئة.
وقد أتاحت التطورات التقنية في أجهزة وبرامج مقاييس التدفق الخلوي تحديد العديد من مجموعات الخلايا المتميزة في وقت واحد1,2,3,4. على سبيل المثال، أدى استخدام مقياس التدفق الخلوي في أبحاث الخلايا الدموية إلى فهم أفضل بكثير للجهاز المناعي2 والتسلسل الهرمي الخلوي للنظام الدموي(5)، فضلا عن التمييز التشخيصي للعديد من أنواع سرطان الدم المختلفة6,7,8. على الرغم من أن معظم خلايا البلغم هي من أصل دموي9,10,11, لم يتم تطبيق قياس التدفق الخلوي على نطاق واسع لتحليل البلغم لأغراض التشخيص. ومع ذلك، تشير العديد من الدراسات إلى أن تقييم مجموعات الخلايا المناعية في البلغم (أهم مجموعة فرعية من الخلايا) قد يكون عونا كبيرا في تشخيص و/أو مراقبة أمراض مثل الربو ومرض الانسداد الرئوي المزمن (COPD)12,13,14,15. وعلاوة على ذلك، فإن وجود علامات خاصة بالظهارية التي يمكن استخدامها في قياس التدفق الخلوي يسمح باستجواب المجموعة الفرعية التالية الأكثر أهمية من الخلايا في البلغم، خلايا ظهارية الرئة.
بالإضافة إلى القدرة على تحليل العديد من مجموعات الخلايا المتميزة من أصول أنسجة مختلفة ، يمكن لقياس التدفق أن يقيم أعدادا كبيرة من الخلايا في فترة قصيرة نسبيا. وبالمقارنة، فإن أنواع التحليلات المستندة إلى الشرائح والسيكلوتية كثيرا ما تتطلب موظفين و/أو معدات عالية التخصص. يمكن أن تكون هذه التحليلات كثيفة العمالة ، مما يؤدي إلى تحليل نسبة فقط من عينة البلغم16.
تحد ثلاث قضايا حرجة من الاستخدام الواسع النطاق للسبيتوم في قياس التدفق الخلوي. تتعلق المشكلة الأولى بمجموعة البلغم. يتم جمع البلغم من خلال سعال النفخ الذي يطرد المخاط من الرئتين إلى تجويف الفم ، ويبصق لاحقا في كوب جمع. منذ المخاط يسافر من خلال تجويف الفم، وهناك فرصة كبيرة للتلوث SEC. هذا التلوث يعقد تحليل العينة ، ولكن يتم تصحيح المشكلة بسهولة على منصة قياس التدفق الخلوي ، كما هو موضح في هذه الدراسة.
ليس كل شخص يمكن أن تنتج البلغم تلقائيا; لذلك ، تم تطوير العديد من الأجهزة للمساعدة في جمع البلغم بطريقة غير الغازية17. البخاخات هو واحد من هذه الأجهزة، وقد ثبت لإنتاج عينات البلغم موثوق بها18,19,20. على الرغم من أن البخاخات هي وسيلة فعالة جدا لجمع البلغم غير الغازية ، إلا أن استخدامه لا يزال يتطلب إعدادا في منشأة طبية مع موظفين متخصصين21. في المقابل، يمكن استخدام الأجهزة المحمولة مثل الناي الرئة22,23,24 و acapella16,25 في المنزل لأنها سهلة الاستخدام للغاية. هذه الأجهزة مساعدة على حد سواء آمنة وفعالة من حيث التكلفة.
بالنسبة لنا، أعطى أكابيلا نتائج أفضل باستمرار من الناي الرئة16، وبالتالي، تم اختيار جهاز أكابيلا لمجموعات البلغم. تم تحديد عينة جمع لمدة 3 أيام لأن الغرض الأساسي لاستخدام البلغم هو تطوير اختبار الكشف عن سرطان الرئة16. وقد تبين أن عينة لمدة 3 أيام يزيد من احتمال الكشف عن سرطان الرئة مقارنة مع عينة 1-أو 2-يوم26,27,28. ومع ذلك، قد تكون أساليب أخرى لجمع البلغم الأفضل لأغراض مختلفة. إذا تم استخدام طريقة مختلفة لجمع البلغم من تلك الموصوفة هنا ، فمن المستحسن أن تثن بعناية كل الأجسام المضادة أو الصبغة المستخدمة لتحليل تدفق القياسات الخلوية ؛ تتوفر بيانات قليلة جدا حول كيفية تأثير طرق جمع البلغم المختلفة على البروتينات المستهدفة لقياس التدفق الخلوي.
القضية الثانية التي تقلل من الحماس لاستخدام البلغم للتشخيص ، تتعلق في المقام الأول بتدفق قياس الخلايا ، هو رقم الخلية. المشكلة هي جمع خلايا كافية قابلة للحياة لتحليل موثوق بها. أظهرت دراستان أن عينات البلغم التي تم جمعها بطرق غير جراحية ، بمساعدة جهاز مساعدة ، تحتوي على ما يكفي من الخلايا القابلة للحياة التي يمكن استخدامها في التشخيص السريري أو الدراسات البحثية16،24. ومع ذلك، لم تتناول أي من هاتين الدراستين مسألة أرقام الخلايا المتعلقة ب قياس التدفق الخلوي.
بالنسبة للدراسات التي تشكل الأساس لهذا البروتوكول، تم جمع عينات البلغم من المشاركين المعرضين لخطر كبير للإصابة بسرطان الرئة باتباع المبادئ التوجيهية المؤسسية المعتمدة لكل موقع دراسة. تم تعريف المشاركين المعرضين لخطر كبير على أنه بين 55-75 سنة ، بعد أن دخنوا 30 عاما ولم يقلعوا عن التدخين خلال السنوات ال 15 الماضية. وقد تبين للمرضى كيفية استخدام جهاز أكابيلا وفقا لتعليمات الشركة المصنعة29 وجمع البلغم لمدة ثلاثة أيام متتالية في المنزل. تم الاحتفاظ بالعينة في الثلاجة حتى المجموعة الأخيرة. وفي يوم الجمع الأخير، شحنت العينة إلى المختبر طوال الليل مع حزمة باردة مجمدة. وقد عولجت العينات لتصبح تعليقا لزنزانة واحدة في اليوم الذي وردت فيه. مع هذه الطريقة لجمع البلغم، يتم الحصول على أكثر من ما يكفي من الخلايا القابلة للحياة لتحليل التدفق الخلوي موثوق بها.
وأخيرا، والمتعلقة المشكلة رقم الخلية السابقة، هو السؤال عن كيفية تحرير خلايا البلغم من بيئتها mucinous. كيف يمكن الحفاظ على الخلايا قابلة للحياة وخلق تعليق خلية واحدة لا تسد مقياس التدفق الخلوي؟ استنادا إلى العمل الأولي من قبل Pizzichini et al.30 و Miller et al.31 ، يصف هذا البروتوكول طريقة سهلة وموثوقة لمعالجة البلغم في تعليق خلية واحدة مناسبة لتحليل التدفق الخلوي. وقد استخدمت هذه الطريقة مبادئ توجيهية راسخة في تدفق الخلايا32,33,34 لوضع استراتيجية فعالة لوضع العلامات على الأجسام المضادة لتحديد الخلايا الدموية والظهارية في البلغم وتوفير إعدادات الأداة، وتدابير مراقبة الجودة، والمبادئ التوجيهية للتحليل توحيد تحليل البلغم على منصة تدفق الخلايا.
يتم تنفيذ جميع خطوات معالجة البلغم في خزانة السلامة البيولوجية مع معدات الحماية الشخصية المناسبة.
1. إعداد الكاشف قبل البدء في تفكك البلغم
2. فصافر البلغم
3. الأجسام المضادة وصبغة حيوية تلطيخ
4. التثبيت مع 1٪ بارافورمالديهايد (PFA)
5. الحصول على البيانات على مقياس التدفق الخلوي
تم تطوير هذا البروتوكول مع وضع مختبر سريري في الاعتبار. وكان التركيز أثناء وضع البروتوكول على البساطة والكفاءة والقابلية للاستنساخ. ووجد أن الخطوة الأكثر استهلاكا للوقت في معالجة البلغم كانت عد الخلايا. لذلك، يتم إعداد البروتوكول بطريقة يمكن بها معالجة البلغم ووضع العلامات على الخلايا بشكل مستقل عن عد الخلايا دون فقدان الوقت. ويمكن بعد ذلك الحصول على عدد دقيق للخلايا، وهو أمر لا يزال ضروريا لتمييع العينة بشكل مناسب لتشغيل دون عائق، خلال فترة حضانة وضع العلامات على الأجسام المضادة.
يستخدم هذا البروتوكول مقياس وزن البلغم بدلا من تعداد الخلايا كمؤشر على مقدار الأجسام المضادة/الصبغة التي يجب استخدامها لوضع العلامات المثالية للخلايا. ومع ذلك ، هناك درجة كبيرة من الاختلاف في وزن عينات البلغم ؛ من العينات 126 التي تم تحليلها، تراوح الوزن من 0.57 غرام إلى 38.30 غرام الشكل 1A يظهر أن العلاقة بين وزن البلغم والخلية العائد ليست قوية. ولذلك، قسمت العينات إلى أربع فئات؛ وكان متوسط وزن العينات 2.1 غرام للعينات الصغيرة، و 5.0 غرام للعينات المتوسطة، و 11.2 غرام للعينات الكبيرة، و 22.0 غرام للعينات الكبيرة جدا (الشكل 1ب). ومع ذلك، لا تزال هناك عينات أسفرت عن خلايا أكثر بكثير مما كان متوقعا على أساس وزنها (الشكل 1C)، فإن غالبية العينات تتجمع بشكل جيد. وبالنسبة للعينات الصغيرة، كان متوسط إنتاج الخلية 8.0 × 106 خلايا، للعينات المتوسطة 13.0 × 106، للعينات الكبيرة 35.4 × 106، والعينات الكبيرة جدا 93.0 × 106.
كل الأجسام المضادة المستخدمة في هذا البروتوكول تم ثديها. وقد اختير تركيز على مرحلة الهضبة (الشكل 2A) الذي له أعلى مؤشر تلطيخ (الشكل 2B) لمنحنى المعايرة كمركز عامل. الاختلافات في أعداد الخلايا لن تغير بشكل كبير من كثافة تلطيخ. هذا المعايرة والفحص المضاد ضروري ويجب إعداده بعناية لكل الأجسام المضادة الجديدة أو الصبغة المستخدمة في هذا البروتوكول34,35. عندما يتم ثدي الجسم المضاد بعناية ، يجب أن يلطخ خلايا أكثر من 10 إلى 50 ضعفا من عدد الخلايا التي تم تثقيت الجسم المضاد عليها34،35. 10- وترد في الجدول 4 مثال على هذا المبدأ. تم ثدي الأجسام المضادة للانسان CD45-PE على 1 × 106 خلايا في حجم إجمالي قدره 400 ميكرولتر. إذا استقراء هذا الجسم المضاد لحجم التلطيخ على البروتوكول (انظر الجدول 2، الذي يظهر كمية CD45-PE وأحجام التلطيخ لكل حجم عينة)، لعينة صغيرة، سيتم تلوين 0.625 × 106 خلايا، وسيتم تلوين 1.25 × 106 خلايا لعينة متوسطة، و 2.5 × 106 خلايا لعينة كبيرة (العمود A في الجدول 4). يتم حساب زيادة 50 ضعفا في عدد الخلايا لكل فئة لتكون 31.25 × 106 و 62.5 × 106 و 125 × 106 خلايا على التوالي (العمود B). وكما هو مبين في العمودين جيم و د، فإن متوسط عدد الخلايا لكل فئة من فئات الحجم وأكبر عينة في كل فئة يقعان ضمن نطاق 50 ضعفا.
على الرغم من الاختلافات الواضحة في الحجم وغلة الخلية بين الأحجام المختلفة لعينات البلغم ، فإن متوسط تلوث SEC في كل فئة متشابه جدا. ويبين الشكل 3 ألف النسبة المئوية لمراكز النامية المستدامة الموجودة في عينات فردية، مصنفة حسب فئات وزنها البلغم. وكان الشاغل الرئيسي مع SECs لأن هذه الخلايا لا تمثل أنسجة الرئة ولكن من تجويف الفم. ومع ذلك، فإن متوسط التلوث SEC هو أقل من 20٪ لجميع الفئات. ويبين الشكل 3 باء النسبة المئوية للخلايا القابلة للحياة الموجودة في هذه العينات. وباستثناء الشركات الصغيرة والمتوسطة الحجم، كان متوسط الجدوى حوالي 72٪ لفئات حجم العينة الصغيرة والمتوسطة والكبيرة. وكان أعلى قليلا (79٪) بالنسبة للفئة خارج كبيرة.
ويبين الشكل 4 استراتيجية نموذجية لفصل خلايا البلغم ذات الأهمية عن الحطام والخلايا الميتة (التي تشمل أيضا مركبات الكربون الهيدروفلورية الملوثة36) وكتل الخلايا. ويبين الشكل 4 ألف استخدام حبات NIST لتعيين بوابات لإزالة الحطام الذي تقل مساحته عن 5 ميكرومتر أو أكبر من 30 ميكرومتر، في حين يطبق الشكل 4B هذه البوابة على خلايا البلغم. يظهر الشكل 4C ملف تعريف البلغم نموذجي عند عرضها كعرض مبعثر جانبي (SSC-W) مقابل عرض مبعثر أمامي (FSC-W)، بوابة العرض. يستخدم هذا الملف الشخصي لإزالة الحطام الصغير الذي يقدم نفسه على طول محاور SSC-W و FSC-W. ويظهر القضاء على الخلايا الميتة في الشكلين 4D والشكل 4E. يتم استخدام عنصر التحكم غير الملون (الشكل 4D) لتحديد قطع الإيجابية FVS510; تعتبر الخلايا التي تلطخ إيجابية لFVS510 فوق عنصر التحكم السلبي ميتة ولن تستخدم في تحليل خلايا البلغم (الشكل 4E). وأخيرا، يتم تطبيق بوابة مفردة لإزالة مزدوجات الخلية من التحليل، والتي تظهر في الشكل 4F. وهكذا، تمثل الخلايا التي تم إجراؤها من خلال بوابات الاختيار الموضحة في الشكل 4B والشكل 4C والشكل 4E والشكل 4F خلايا البلغم المفردة الحية الجاهزة للتحليل اللاحق مع الأجسام المضادة المستخدمة في هذا البروتوكول.
يسمح استخدام الأجسام المضادة للCD45 في بروتوكول وضع العلامات هذا بفصل خلايا البلغم الحية والفردية في مقصورة خلايا الدم (CD45+) ومقصورة الخلية غير الدموية (CD45-). وتشمل الفئة الأخيرة الخلايا الظهارية وغيرها من الخلايا غير الدموية. يظهر الملف الشخصي العلوي في الشكل 5A استخدام عينة البلغم غير الملون لتعيين القطع لإيجابية CD45 ، مما يجعل البوابات لالتقاط خلايا CD45 + وخلايا CD45. يظهر الملف السفلي للشخصية 5A تطبيق هاتين البوابتين على عينة البلغم الملطخة بالأجسام المضادة للCD45. ثم يتم استخدام تلطيخ مع أجسام مضادة إضافية لتحديد مجموعات خلايا الدم الخاصة داخل بوابة CD45 + (الشكل 5B) وغيرها من السكان غير خلايا الدم، بما في ذلك السكان الظهارية في CD45- بوابة (الشكل 5C). في كلا الشكلين، تظهر الملفات الشخصية العليا كيفية استخدام البلغم الملطخ بالنمط المتساوي لتعيين المجموعات السكانية السلبية المزدوجة، في حين تظهر الملفات الشخصية السفلية خلايا البلغم الملطخة بالأجسام المضادة. الشكل 5B (أسفل) يظهر ست مجموعات مختلفة من خلايا CD45 + التي تم إنشاؤها مع مزيج من الأجسام المضادة التي يمكن اكتشافها في قناة 1 مضان (FL) (مكافحة CD66b، CD3، CD19 الأجسام المضادة) ومكافحة CD206 يمكن الكشف عنها في قناة FL3. وقد كشفت تجارب الفرز أن الضامة الرئة محددة يقيمون في البوابات التي تم تحديدها مع M. وبالتالي فإن وجود خلايا في هذه البوابات يشير إلى أن عينة البلغم كانت مشتقة من الرئة ولم تكن لعابا (بيدركا وآخرون، مخطوطة قيد الإعداد). الشكل 5C (أسفل) يظهر رباعيات gating التي تم إنشاؤها باستخدام المضادة لعموم cytokeratin (بانك) يمكن الكشف عنها في قناة FL1 ومكافحة الالتصاق الخلايا الظهارية جزيء (EpCAM) الأجسام المضادة للكشف في قناة FL3 بين خلايا CD45- البلغم.
تم اختبار بروتوكول وضع العلامات هذا على نطاق واسع على Navios EX وLSR II. أجريت بعض التجارب الأولية على ليريك، ولكن من دون التحسين أداة واسعة النطاق التي تم القيام به للآلتين الأخريين. لذلك، يتم توفير إعدادات أداة مفصلة ل NAVIOS EX وLSR II في ورقة المواد، ولكن ليس لليريك. لفهم أوجه التشابه والاختلافات بين هذه المنصات الخلوية التدفق الثلاثة التي يمكن استخدامها لتحليل خلايا البلغم، يمكن مقارنة ملامح التي تم الحصول عليها من مختلف الآلات في الشكل 6 والشكل 7. تمت معالجة عينتين من البلغم الكبيرين وتجميعهما ووضع العلامات عليهما وفصلهما إلى ثلاثة أجزاء متساوية، وتم الحصول عليهما لاحقا على كل مقياس للخلايا المتدفقة المذكور أعلاه. يقارن الشكل 6، الذي يشبه الشكل 4، استراتيجية التخلص من الحطام والخلايا الميتة وكتل الخلايا. يقارن الشكل 7، الذي يتطابق مع الشكل 5، ملامح الدم وغير الدم من البيانات المكتسبة على مقاييس التدفق الخلوي المختلفة.
مقارنة مختلف ملامح التي تم الحصول عليها من ثلاثة مقاييس تدفق مختلفة تبين أن نفس ملامح الأساسية يمكن ملاحظتها مع كل صك. الاختلافات التي يجب الانتباه إليها هي مؤامرات SSC-W/FSC-W (بوابة العرض) (الشكل 6، الصف الثاني) والمقاييس الخطية للمؤامرات المتناثرة (الشكلان 6 و 7). تظهر مؤامرة عرض التشتت التي تم إنشاؤها على Navios EX بوابة تضمين (مربع أحمر) ، مما يعني أن جميع الخلايا المضمنة في البوابة يتم تحليلها بشكل أكبر؛ يتم استبعاد الأحداث على طول المحاور في الزاوية اليسرى السفلية. عرض المؤامرات مبعثر على LSR II، و Lyric لا تظهر إيداع مماثل للأحداث على طول هذه المحاور نفسها. ومن المرجح أن يكون هذا التباين راجعا إلى العتبة الحساسة جدا المستخدمة في نظام Navios EX، مما يؤدي إلى وجود بعض الحطام الصغير في بوابة استبعاد الحجم السابقة (الصف العلوي من الشكل 6). في بعض الأحيان ، وينظر إلى الحطام على طول المحاور في ملف تعريف عرض مبعثر ولدت على LSRII ، لكنه في الزاوية اليمنى السفلى. وفي هذه الحالات، تستخدم بوابة استبعاد (كما هو مبين في المربع الأحمر المتقطع في الملف الوسطي في الصف 2 من الشكل 6) للقضاء على هذه الأحداث من مزيد من التحليل.
في حين أن جداول السجل تبدو مختلفة قليلا على المؤامرات بين NAVIOS EX والمقاييس الخلوية ليريك وLSR الثاني، فإن Navios EX لديها خيار الحصول على البيانات باستخدام عقود أخرى. ويعتمد تنفيذ عقود أخرى على سياق التجربة والحساسية المطلوبة لتصور السكان الذين يهمهم الأمر.
وثمة فرق ملحوظ إضافي بين Navios EX وLSR II وcytometers ليريك هو ظهور الملف الشخصي للبوابة singlet. تم تجهيز مقياس الخلايا Navios EX مع خلية تدفق مستطيلة مع زاوية جمع مختلفة عن LSR II. يحتوي Navios EX على ثلاث زوايا تجميع يتم التحكم فيها بواسطة البرامج لتحسين تشتت ضوء الزاوية الأمامية لتحقيق الحساسية المناسبة لحجم الجسيمات لتحليلها. يجب تعديل بوابة المضلع لمقياس الخلايا Navios EX إلى زاوية أقل قليلا من بوابة المفرد ل LSRII. يمكن تحسين بوابة singlet ل Lyric للحصول على ملف تعريف مشابه لتلك التي شوهدت مع LSR II. باستخدام عينة البلغم، فإن عامل قياس المنطقة تحتاج إلى تحسين لكل ليزر على Lyric لتحقيق بوابة مفردة مماثلة ل LSR II.
تم تحليل جميع الملفات الشخصية المعروضة في الشكل 4 إلى الشكل 7 باستخدام برنامج FlowJo ، الإصدار 10.6. يمكن العثور على ملفات .fcs في FlowRepository (https://flowrepository.org) ، تحت معرفات FR-FCM-Z3LX، FR-FCM-Z3MJ، و FR-FCM-Z3MM ويمكن استخدامها لممارسة تحليل البلغم كما هو موضح في هذه الأرقام.

الشكل 1: أوزان البلغم وعائد الخلية. (أ) المصور هو العلاقة بين وزن البلغم، الذي يتم تحديده قبل المعالجة، وإجمالي إنتاج الخلية، الذي يتم تحديده بعد المعالجة باستخدام مقياس الدم. يمثل كل رمز رصاصة عينة فردية، 126 في المجموع. (ب) تم تقسيم عينات البلغم إلى أربع فئات على أساس وزنها: صغيرة للعينات التي يصل وزنها إلى 3 غرام، ومتوسطة للعينات التي يزيد وزنها عن 3 غرام حتى 8 غرام، وكبيرة للعينات التي يزيد وزنها عن 8 غرامات تصل إلى 16 غرام، وعينات كبيرة جدا لأولئك الذين يزيد وزنهم عن 16 غرام (C) مبين توزيع غلة الخلايا للعينات في كل فئة. تمثل الأشرطة الحمراء في (B) و (C) القيم الوسيطة في كل فئة. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 2: المعايرة المضادة للCD45-PE المضادة للإنسان. (أ) منحنى المعايرة CD45-PE (IgG1) مع متوسط كثافة الفلورسينس (MFI) للسكان الإيجابيين المرسومين مقابل تركيز هضاب الأجسام المضادة CD45-PE عند 1 ميكروغرام/مل. (ب) يظهر منحنى المعايرة الذي يصور مؤشر التلطيخ مقابل تركيز الأجسام المضادة أن أعلى مؤشر تلطيخ هو 1 ميكروغرام/مل. تم حساب مؤشر تلطيخ على النحو: [CD45 MFI السكان إيجابية - CD45 MFI السكان السلبية] / [2 * الانحراف المعياري]. واستنادا إلى الشكل 2 ألف والشكل 2B، اختير تركيز واحد ميكروغرام/مل كمركز أمثل للأجسام المضادة CD45-PE. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 3: نسبة مراكز إعادة الخلايا الجذعية والخلايا الميتة في عينات البلغم متسقة بين فئات الوزن الأربع. (أ) تصنف نسبة الشركات الصغيرة والمتوسطة في عينات البلغم وفقا لفئة وزنها. تم تحديد النسبة المئوية لتلوث لجنة الأوراق المالية والبورصة عن طريق مقياس الدم كجزء من إجمالي عدد الخلايا. (ب) صلاحية الخلية لعينات البلغم باستثناء SECS، التي يحددها مقياس الدم وطريقة استبعاد التريبان الأزرق. تمثل الخطوط الحمراء القيم الوسيطة لكل رسم بياني. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 4: استراتيجية غاتينغ لاستبعاد الحطام والخلايا الميتة والمزدوجات في عينة البلغم. (أ) استخدمت حبات NIST ذات أحجام 5 ميكرومتر و20 ميكرومتر و30 ميكرومتر لتعيين البوابة التي يشير إليها الصندوق الأحمر لاستبعاد الحطام الأصغر من 5 ميكرومتر والحطام الأكبر فوق 30 ميكرومتر وبالقرب من المحور. (ب) تم الحصول على عينة البلغم باستخدام نفس الفولتية للتشتت الأمامي والجانبي مثل حبات NIST. تم تطبيق البوابة التي تم إنشاؤها في (A) لاستبعاد الحطام. (ج) استبعدت حطام صغير قريب من المحور في هذه القطعة عرض مبعثر. (د) استخدمت عينة من البلغم غير الملطخ لتعيين قطع (الخط الأحمر) للسكان السلبية غير الملطخة لصبغة الجدوى. (ه) تم تطبيق القطع الذي تم إنشاؤه في D على عينة البلغم الملون لتشكيل بوابة (الصندوق الأحمر) لتشمل الخلايا الحية القابلة للحياة. (F) تستثني البوابة المفردة التي يشير إليها المضلع الأحمر الخلايا التي لا تقع على القطر، مما يزيل المزدوجات و/أو الكتل. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 5: تستخدم استراتيجية غاتينغ لخلايا البلغم في مقصورات الدم والخلايا غير الدموية. (أ) تستخدم خلايا البلغم غير الملطخة المشتقة من بوابة المفرد لتعيين القطع (الخط الأحمر) على السكان السلبيين لCD45 (أعلى). يتم تطبيق قطع من التشكيل الجانبي العلوي على عينة البلغم الملون (أسفل) للتمييز بين CD45 إيجابية (CD45 +) والسكان السلبية (CD45-). (ب) تستخدم خلايا البلغم CD45+ الملطخة بالأجسام المضادة متساوية النوع ل FITC/AF488 لتعيين البوابات على السكان السلبيين (الأعلى). يتم تطبيق نفس البوابات على خلايا البلغم CD45 + ملطخة بعلامات خلايا الدم CD3 و CD19 و CD66b و CD206 (أسفل). (ج) توضع بوابات رباعية على خلايا البلغم CD45- ملطخة بعناصر تحكم متساوية النمط (أعلى) وتطبيقها على الخلايا CD45- من عينة البلغم الملطخة بعلامات الظهارية عموم cytokeratin (بانك) وEpCAM (أسفل). يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 6: استراتيجية غاتينغ لاستبعاد الحطام، وكتل، والخلايا الميتة من خلايا البلغم الملون على ثلاث منصات تدفق القياسات الخلوية. تمت معالجة عينتين من البلغم الكبيرين وتجميعهما ووضع العلامات عليهما وتقسيمهما إلى ثلاثة أجزاء متساوية للاستحواذ عليها على Navios EX (A) وLSR II (B) ومقاييس تدفق التدفق Lyric (C). الصف العلوي: تم بوابات عينات البلغم (الصندوق الأحمر) لاستبعاد الحطام الصغير والكبير جدا. الصف الثاني: يمثل المربع الأحمر الكبير في مؤامرة Navios EX بوابة تضمين تتضمن الخلايا ولكنها تستبعد الحطام. ويمثل الصندوق الأحمر الصغير المتقطع الذي شوهد في قطعة الأرض LSR II بوابة استبعاد لإزالة الحطام من مزيد من التحليل. هناك حاجة إلى مزيد من التحسين مع Lyric لتحديد المكان الذي يلزم فيه استبعاد الحطام. لذلك، لا توجد بوابة في تلك المؤامرة. الصف الثالث: بوابات مستطيلة حمراء تشمل الخلايا الحية لمزيد من التحليل. الصف السفلي: بوابة المضلع يحتوي على خلايا مفردة عن طريق استبعاد doublets التي تقع خارج قطري من البوابة. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الشكل 7: استراتيجية غاتينج للبلغم الملون بالدم وعلامات الظهارية على ثلاث منصات تدفق القياسات الخلوية. 11 - يستمر التحليل المبين في الشكل 6 في الشكل 7؛ تم تقسيم جميع الخلايا القابلة للحياة والفردية (الصف السفلي ، الشكل 6) إلى مجموعات CD45 + و CD45 (الصف الأول ، الشكل 7) ، بحيث يمكن للعلامات الخاصة بخلايا الدم والعلامات الظهارية الخاصة بالخلايا أن تحدد هذه المجموعات السكانية. الصف الثاني: لمحة عن علامات خلايا الدم CD3/CD19/CD66b وCD206 من خلايا CD45+. الصف الثالث: علامات الخلايا الظهارية panCK وEpCAM من CD45-الخلايا. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
| الأجسام المضادة / وصمة عار | قصد |
| FVS510 | بقعة الجدوى |
| مكافحة الإنسان CD45 – PE | علامة عموم الكريات البيض; تعويض PE |
| مكافحة الإنسان CD66b – FITC | علامة الحبيبية |
| مكافحة الإنسان CD3 – Alexa488 | علامة الخلية T |
| مكافحة الإنسان CD19 – Alexa488 | علامة الخلية B; تعويض FITC/Alexa488 |
| CD206 المضادة للإنسان – PE-CF594 | علامة الضامة الرئة; PE-CF594 التعويض |
| المضادة للإنسان EpCAM – PE-CF594 | علامة الخلية الظهارية; PE-CF594 التعويض |
| المضادة للإنسان عموم السيتوكيراتين (بانك) – Alexa488 | علامة الخلية الظهارية |
| IgG1κ – أليكسا488 | CD3/CD19/panCK التحكم متساوية النوع |
| IgG1κ – فيتك | التحكم في نمط ISOTYPE CD66b |
| IgG1κ – PE-CF594 | التحكم في نمط CD206/EpCAM |
| مضادة للإنسان CD45 – BV510 | تعويض FVS510 |
الجدول 1: الأجسام المضادة وبقع البقاء المستخدمة. قائمة الأجسام المضادة وصبغة البقاء المستخدمة في هذا البروتوكول. يشار إلى المجموعات الفرعية الخلوية التي يحددها كل منها.
| أنبوب (تسمية) | حجم العينة* | HBSS (ميكرولتر) | FVS510 (ميكرولتر) | CD45 (ميكرولتر) | أجسام مضادة أخرى (ميكرولتر) | الخلايا § (ميكرولتر) | |||
| غير ملطخة | صغير | 80 | 20 | ||||||
| متوسط | 50 | 50 | |||||||
| كبير | 50 | 50 | |||||||
| IgG1κ - أليكسا488 | IgG1κ- فيتك | IgG1κ - PE-CF594 | |||||||
| عنصر تحكم Isotype | صغير | 60.65 | 0.6 | 10 | 2 | 6 | 0.75 | 20 | |
| متوسط | 30.65 | 0.6 | 10 | 2 | 6 | 0.75 | 50 | ||
| كبير | 30.25 | 1 | 10 | 2 | 6 | 0.75 | 50 | ||
| CD206 | CD3 | CD19 | CD66b | ||||||
| دم | صغير | 92.875 | 1.5 | 25 | 1.875 | 5 | 1.25 | 7.5 | 115 |
| متوسط | 65.75 | 3 | 50 | 3.75 | 10 | 2.5 | 15 | 350 | |
| كبير | 102.5 | 10 | 100 | 7.5 | 20 | 5 | 30 | 725 | |
| إبكام | بانك | ||||||||
| الظهاريه | صغير | 96.5 | 1.5 | 25 | 10 | 2 | 115 | ||
| متوسط | 73 | 3 | 50 | 20 | 4 | 350 | |||
| كبير | 117 | 10 | 100 | 40 | 8 | 725 | |||
| * تعتبر عينات صغيرة أو متوسطة أو كبيرة على أساس الوزن المحدد في الخطوة 1 من قسم فص البلغم من البروتوكول. | |||||||||
| § وينبغي إضافة الخلايا بعد توزيع جميع الكواشف، بما في ذلك الكواشف الموجودة في أنابيب التعويض (الجدول 3). |
الجدول 2: محتوى الأنابيب ذات خلايا البلغم. استخدم هذا الجدول كما هو مذكور في البروتوكول لإضافة وحدات التخزين المحددة من الأجسام المضادة ووصمة البقاء لحجم العينة المناسب.
| أنبوب (تسمية) | الكواشف المضافة (μL) | الكواشف المضافة (إسقاط) | ||||||
| HBSS | CD45-PE | CD206-PE-CF594 | EpCAM-PE-CF594 | CD19-اليكسا488 | CD45-BV510 | كومب ميد (+) | كومباك ميد * (-) | |
| شركات PE. | 76 | 4 | x | x | x | x | 1 | 1 |
| PE-CF594 شركات. | 72 | x | 4 | 4 | x | x | 1 | 1 |
| اليكسا488 / شركة فيتك. | 60 | x | x | x | 20 | x | 1 | 1 |
| BV510 شركات. | 60 | x | x | x | x | 20 | 1 | 1 |
| * ينبغي إضافة الخرز الإيجابي (+) والسلبي (-) بعد توزيع جميع الكواشف وإعداد الأنابيب في الجدول 2. | ||||||||
| شركات = التعويض |
الجدول 3: محتوى أنابيب التعويض. استخدم هذا الجدول كما هو مذكور في البروتوكول لإضافة وحدات التخزين المحددة من الأجسام المضادة إلى حبات التعويض.
| رقم الخلية (x 106) | ||||
| A | B | C | D | |
| حجم العينة | في حجم تلطيخ * | وصول 50 أضعاف ¶ | عينة وسيطة (وصول طية) # | أكبر عينة (وصول أضعاف) # |
| صغير | 0.625 | 31.25 | 8.0 (12.8) | 24.77 (39.6) |
| متوسط | 1.25 | 62.5 | 13.0 (10.4) | 48.87 (39.1) |
| كبير | 2.5 | 125 | 35.4 (14.2) | 113.5 (45.4) |
| * تلطيخ الأحجام المستخدمة في البروتوكول (الجدول 2). يتم استقراء رقم الخلية من كيفية تنفيذ منحنى المعايرة؛ 1 ميكروغرام/مل من CD45-PE و1 × 106 خلايا لكل 200 ميكرولتر. | ||||
| * وصول 50 ضعفا من أرقام الخلايا في العمود ألف. | ||||
| # أضعاف الوصول في الأعمدة C و D تحسب بقسمة عدد المقدمة في خلايا الأعمدة C أو D على الرقم في الخلية المقابلة في العمود A. |
الجدول 4: تركيز CD45-PE المضاد للإنسان لجميع العينات في كل فئة من فئات حجم العينة.
جميع المؤلفين هم من الموظفين السابقين أو الحاليين من تقنيات bioAffinity.
يصف هذا البروتوكول طريقة فعالة لعدم ربط البلغم بتعليق خلية واحدة والتوصيف اللاحق للمجموعات الفرعية الخلوية على منصات قياس التدفق الخلوي القياسية.
ونود أن نشكر ديفيد رودريغيز على مساعدته في إعداد الرقم. تم تشغيل عينات البلغم على BD LSR II في مرفق الموارد المشتركة لقياس الخلايا في UT Health San Antonio Flow ، بدعم من UT Health و NIH-NCI P30 CA054174-20 (CTRC at UT Health) وUL1 TR001120 (منحة CTSA).
| 1٪ بارافورمالدهايد فلو فيكس | بوليساينس | 25037 | |
| 100 & مايكرو ؛ مصافي خلايا النايلون M ، فالكون # 352360 | فيشر ساينتفيك | 08-771-19 | |
| 3 م هيدروكسيد الصوديوم | EMD | SX0593-1 | |
| 50 مل أنبوب الصقر المخروطي | فيشر Scientific | 14-432-22 | |
| Alexa488 مضاد للإنسان CD19 | BioLegend | 302219 | |
| Alexa488 مضاد للإنسان CD3 | BioLegend | 300415 | |
| Alexa488 السيتوكراتين المضاد للإنسان | BioLegend | 628608 | |
| Alexa488 PanCK و CD3 و CD19 Isotype | BioLegend | 400129 | |
| BV510 CD45 | BioLegend | 304036 | |
| CD66b FITC isotype | BD Biosciences | 555748 | |
| CompBead Plus تعويض الخرز | BD Biosciences | 560497 | |
| كورنينج زجاجة معقمة قابلة للتخلص من البوليسترين 250 مل | فيشر ساينتفيك | 09-761-4 | |
| زجاجة معقمة قابلة للتخلص من البوليسترين كورنينج 500 مل | فيشر ساينتفيك | 09-761-10 | |
| CS& حبات T | BDBiosciences | 655051 | |
| DTT | Fisher Scientific | BP172-5 | |
| FITC المضادة للإنسان CD66b | GeneTex | GTX75907 | |
| قابلية للإصلاح بقعة | BD Biosciences | 564406 | |
| FlowCheck | Beckman Coulter | A69183 | |
| FlowSet | Beckman Coulter | A69184 | |
| HBSS | فيشر العلمية | 14-175-095 | |
| NAC | سيجما ألدريتش | A9165 | |
| NIST الخرز, 05 & mu; M | Polysciences | 64080 | |
| NIST الخرز, 20 & mu; M | Polysciences | 64160 | |
| NIST الخرز, 30 & mu; M | Polysciences | 64170 | |
| PE مضاد للإنسان CD45 | BioLegend | 304039 | |
| PE-CF594 مضاد للإنسان EpCAM | BD Biosciences | 565399 | |
| PE-CF594 CD206 / EpCAM النمط المتماثل | BD Biosciences | 562292 | |
| PE-CR594 المضاد للإنسان CD206 | BD Biosciences | 564063 | |
| سترات الصوديوم ثنائي هيدرات | EMD | SX0445-1 | |
| محلول تريبان بلو ، 0.4٪ | فيشر 15250061 | العلمي |